1AL7A

Three-dimensional structures of glycolate oxidase with bound active-site inhibitors
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
359
structure length
350
Chain Sequence
MEITNVNEYEAIAKQKLPKMVYDYYASGAEDQWTLAENRNAFSRILFRPRILIDVTNIDMTTTILGFKISMPIMIAPTAMQKMAHPEGEYATARAASAAGTIMTLSSWATSSVEEVASTGPGIRFFQLYVYKDRNVVAQLVRRAERAGFKAIALTVDTPRLGRREADIKNRFVLPPFLTLKNFEGIDLGLSSYVAGQIDRSLSWKDVAWLQTITSLPILVKGVITAEDARLAVQHGAAGIIVSNHGARQLDYVPATIMALEEVVKAAQGRIPVFLDGGVRRGTDVFKALALGAAGVFIGRPVVFSLAAEGEAGVKKVLQMMRDEFELTMALSGCRSLKEISRSHIAADWD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Flavoprotein
source organism Spinacia oleracea
publication title Three-dimensional structures of glycolate oxidase with bound active-site inhibitors.
pubmed rcsb
molecule keywords GLYCOLATE OXIDASE
total genus 125
structure length 350
sequence length 359
ec nomenclature ec 1.1.3.15: (S)-2-hydroxy-acid oxidase.
pdb deposition date 1997-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01070 FMN_dh FMN-dependent dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1al7A00
4WQ6A 4Z08A 4MY8A 3L0NA 4JX5A 4ORMA 1Y0EA 1W3IA 3DKJA 5C5YA 3W70A 4AWTA 1NF7A 5HUOA 2HS8A 5AYXA 1ZJIA 3W75A 5FF4A 5LKYA 1W5QA 1K3UA 3MI6A 1GVOA 4JX4A 4PA8A 4PL1A 1GZGA 1RR2A 4I7VA 1VH7A 5AC7A 3T55A 3LCLA 3O6DA 3LRLA 1F05A 4RKAA 2Y88A 4AB4A 3MHFA 2V9DA 3I7RA 2NWSA 3W1XA 5J5DA 1PHQA 3GAKA 1SR9A 2DZVA 4TIMA 1L6YA 4RZ4A 1QO2A 3O15A 2O7SA 2XN2A 2QCDB 2BXVA 4WOQA 2JKAA 1TQJA 1NAL1 3KVLA 4N9BA 4FNUA 3ABOA 1IXQA 3E0IA 2NUXA 3WJWA 3PB0A 3V1PA 3UPBA 3NQDA 4UXDA 3ZWTA 1TSIA 2ZZ1A 4O28A 1ME7A 3IGSA 3P8IA 3E12A 3TSDA 5K9XA 1FWSA 3DZ1A 3W1TA 3CT7A 2R94A 3TW6A 3PUDA 1KFEA 3BW4A 1L6SA 4DF1A 1P4CA 5F1UA 5F2MA 1TPB1 1W5NA 3GIYA 3WFAA 1FY6A 4LC6A 2C15A 4JTUA 1AMKA 5KTLA 3RLUA 1ICQA 4KFPA 4LVGA 4DEFA 2DZUA 3TQKA 4CNOA 1VR6A 3NL5A 2V2CA 3N19B 5EBUA 1GVSA 3DFQA 3IIXA 3MWAA 3BG5A 3GR8A 2VOMA 5FEXA 2X1RA 3UWVA 2EAWA 2G5WA 2V81A 4DO5A 3R5EA 5D38A 2PRHA 3G1VA 3JR2A 2BLEA 1XCFA 3LHUA 3R2GA 2Z6IA 2B7PA 4IGHA 4PTNA 5AHMA 2NXHA 3E02A 5LNRA 1WOAA 2NX9A 2NXGA 3L2IA 1NF0A 1SW7A 3DU0A 2YSWA 3FS2A 3QM3A 4K8EA 4O11A 4UTUA 2IQTA 4MPQA 2WSYA 5D04C 2QCNA 2NV1A 1C8VA 5KMYA 3A23A 4QSHA 5F4SA 4HN4A 3EWZA 3QPZA 2Z0IA 3W85A 3UWQA 1XM3A 5C2XA 4PH6A 1MEHA 3WJYA 5CGQA 3IRDA 2DU2A 1XUUA 4IQLA 2VC6A 3LV5A 1TRDA 2Y85A 4OQVA 1W5OA 1VCFA 2E77A 5LSMA 3SY5A 1NVMA 3C2RA 3NQVA 1TO3A 4RX0A 1XBXA 1XDLA 2QCCA 5G5IA 4ONVA 3GXPA 1UJPA 2QJHA 2YW3A 3L5LA 3MHGA 5L6UA 1W0MA 1OF8A 3LCIA 1U5JA 4MZYA 1T99A 4GNJA 4YLWA 4AHQA 3SGZA 4BWLA 3A22A 3IGXA 4E38A 1ME8A 1AW1A 2OX1A 3NXFA 5KINA 3P84A 4MIMA 1OFAA 1LROA 2GQAA 1KLZA 1TPC1 3CTLA 4K7VA 5AYZA 1TREA 5IBXA 1O4UA 4FIRA 4JTHA 5DXYA 1JR1A 3S5NA 1TV5A 4HNTA 3KRUA 5LHEA 1P5BA 3P80A 2QCEA 3JS3A 4Y8FA 3FFSA 5C6MA 3W2LA 1QPQA 5D33A 4GRSA 1XBVA 1T8XA 3HPXA 5U4NA 3TJXA 3FYOA 3I6RA 1OG0A 1NEYA 5FF2A 3CB8A 2Y7DA 3TROA 1YTKA 2ABBA 1TCDA 4IXHA 1O60A 3C56A 3QJAA 4I7WA 1JUEA 5G1TA 2OZ0A 1WBJA 2TRSA 3NQAA 1DJNA 1QR7A 3LHWA 4QQ3A 4HHPA 2P1FA 3ELFA 3A5VA 3NNTA 4TU1A 1RVGA 1QOPA 2J6XA 1T96A 3C61A 2A21A 2ZRVA 1L9WA 3QQ1A 1VGAA 5F2IA 4NVTA 3DFSA 3TH6A 3QSTA 1PHWA 4RK8A 4HPXA 4A22A 4JN6A 4O50A 3G0XA 2CLLA 3M44A 2E1DA 3P7YA 1TTQA 3W1LA 4TMBA 1KFLA 5BMWA 1O5KA 2JK2A 2A7NA 3Q58A 3ABSA 4A2RA 4FXRA 3DI0A 2NUWA 1EUAA 3O6YX 1VC4A 4XTIA 3ZS4A 3LRMA 4UMAA 3UY8A 4Z1AA 5DCEA 4O14A 4ZZ9A 1FQ0A 3TW7A 4MY1A 2QEZA 4DPQA 1WA3A 1FCQA 1GOXA 2C18A 3EWWA 4O1CA 3RMJA 2A7PA 2Y89A 1TMHA 2ZZ3A 1WX0A 3G1YA 4JS3A 2E6YA 2RDWA 1D9EA 1Z44A 3IIOA 1K7XA 3B04A 4ZMGA 4HKPA 2H8XA 4MZ8A 3M9YA 2W0UA 1N8FA 4JY9A 1QNVA 4JTGA 1X6UA 4O17A 1RQBA 3L67A 4N9DA 1PS9A 2NX3A 4JYFA 3M16A 1WOBA 3IIZA 2QR6A 5C54A 3Q94A 2VFHA 4DQWA 4AHOA 1I8JA 2ALDA 1TIMA 3NPXA 4N9EA 1VCGA 3B03A 4AXKA 4UCGA 1TTPA 1LP6A 1NSJA 4RXGA 1DHPA 8TIMA 3EXRA 2C1HA 2WKJA 3V75A 2ZA1A 5HWMA 1LOSA 4K7YA 1TQXA 2H90A 2RDUA 1PE1A 4BWLC 3W1PA 3MI2A 4AF0B 4RV8A 4ML9A 1EP1A 1V7YA 1EP3A 2YFOA 3H54A 3NQMA 1SFLA 5BMXA 4UFIA 2ZA2A 2FPYA 2X1UA 3LCXA 3B05A 4PFMA 1RQEA 4JTJA 2CFFA 2P0OA 4DO4A 1O94A 3NQ7A 3O06A 3FJ6A 2YCEA 5LHFA 3W86A 2VFFA 5H2ZA 1EWEA 3PSWA 4A2SA 4FX6M 4FF7A 3M47A 2JGQA 4R33A 3W3OA 3DHFA 4X2RA 3KRZA 1A50A 4N6FA 3LV6A 4JTFA 4OE7A 2OJPA 4PC8A 2YYUA 4R34A 4OU1A 3M41A 4KWWA 2ATMA 2OMAA 3C2OA 4BR1A 2RFGA 4WXYA 2FB3A 3BLIA 2FIQA 3LXCA 4BK9A 3W84A 1S5WA 2EHHA 2Q8LA 1QO5A 3NQFA 3B0VC 3G3DA 4JIQA 4MY9A 3R12A 2CLKA 1HO1A 5LNUA 3SGUA 3HGSA 3W7CA 3HJZA 3TC6A 2ISWA 3QW3A 1H62A 2Y7FA 3NL6A 3IVTA 2CW6A 2HS6A 4JYDA 3EWXA 4QAIA 3PG9A 3BK0A 2DZXA 3S6DA 3TSBA 1OVDA 3T4CA 5CSSA 3HB9A 3QC3A 1FCBA 4R53A 3U6WA 5HULA 1YLVA 5DCBA 1K7FA 3UQNA 3UWWA 1HG3A 2HTMA 4FXSA 1SSGA 2VENA 2ZDRA 4XUGA 5LGXA 5A5WA 1DL3A 3NQ8A 2QCLA 3DKLA 1D3HA 2C16A 1JCJA 1TPDA 3OEXA 4UUIA 1W5MA 3M7WA 5D05A 1QMLA 4GJ1A 3VNDA 3GR7A 3KXQA 3HIJA 1FCVA 1FWWA 2Y7EA 3U8GA 2E5DA 3FLUA 2A4AA 2RH9A 4K36A 3W83A 1YXYA 1P1XA 4JTSA 4HPJA 5D2XA 4MYXA 2DP3A 1SO5A 1GPWA 4XKYB 4CQAA 1GG0A 1LBLA 1G4SA 1KFCA 5U7SA 3OIXA 1X7FA 4TO8A 2A6LA 1B3OA 2GVLA 1I2NA 3MYPA 4AH7A 1TTIA 1H7XA 4OHQA 3P8JA 4QM1A 3TFXA 3BLFA 4FNTA 5F4XA 2AGKA 2VFGA 2GQ9A 4O57A 3FOKA 3L5MA 1MEWA 2E68A 4FO4A 4ZL1A 3E9AA 1H7OA 1KM6A 2Y62A 1O5XA 2YX0A 1OF6A 5D2VA 2YYTA 3S9YA 2PRLA 2VEMA 1YPFA 3M6YA 3THAA 1KM5A 4LY8A 2Z6JA 7TIMA 1TJRA 2ZA3A 4OWGA 2A85A 3OA3A 4UFKA 3W7DA 2B7NA 5CZTA 4EF9A 4HSNA 3SIZA 1M5WA 4NU7A 1UCWA 4NZJA 4YMZA 3W73A 1EUNA 1MO0A 1ZFJA 5KSWA 2O7QA 1VLIA 3KAOA 2B0MA 4NNCA 4JXCA 2I14A 1GTHA 4GUFA 3W9ZA 4LVFA 5K3VA 1H7WA 4H3DA 5AHNA 4DXVA 3W7EA 4BI7A 1ZAJA 4O8RA 3NDOA 1FUYA 5DY2A 4O54A 3GXTA 1HFBA 3T78A 4BI5A 4Y9AA 1VYRA 2ISVA 3LX9A 1SW3A 1LM1A 4O0ZA 3VKJA 3DBPA 3TAOA 3CPRA 2ZBTA 1XBZA 3MHUA 3LCGA 4E2DA 1WDWA 3EX2A 1OX4B 1JRBA 5K4ZA 1ALDA 3W2MA 1BKSA 3RNDA 3S8HA 3LM7A 5J5RA 2ATSA 2YXGA 4WOZA 1F7BA 2QJIA 3FYPA 3UZJA 1L6WA 3MJYA 1F2JA 1PV8A 3BW2A 1LDCA 3C8FA 2RKXA 2BWGA 2QDGA 3GX9A 1T0OA 2CLMA 3G22A 2XN0A 2RDTA 1GVQA 4LV4A 2QCHA 2ZZ6A 3HO8A 3LI1A 5HNRA 1DOSA 1GWJA 1TPVA 1MXSA 3Q2DA 3GKAA 2WNZA 4JTIA 2ZZ2A 3UNDA 3HBLA 1K8ZA 3LLDA 2QF7A 3WK3A 1J5TA 2C3ZA 5HJLA 3NQCA 1W3TA 2YZRA 1LOQA 3OVRA 4UTWA 1B9BA 5EY5A 1JCYA 3TDFA 3NM3A 4RZ6A 1ME9A 1W5PA 1A53A 2EGZA 2ZRWA 1TB3A 3P82A 4NXKA 1N55A 3W1QA 4C1KA 2UV8G 4UIOA 3T7VA 3NPUA 5D37A 1AK5A 4RXFA 3UZ5A 2ZZ5A 4GE8A 4NQ1A 3W23A 4M6VA 1I2QA 3GKFA 4O12A 1N7KA 2V5LA 2TYSA 1LOLA 1ML1A 1YXDA 3NR0A 4Q4KA 2DJLA 2WV8A 4ALDA 2Y6ZA 4MKNA 1QOQA 4CNPA 3QRHA 2C6QA 1LCOA 3TFCA 3R13A 2C14A 5LNSA 3TCEA 2PCQA 1YPIA 5DCDA 3OHIA 2QAFA 4FNRA 4LT9A 1DKWA 5KITA 4EF8A 1JUKA 1LBMA 1O95A 1TTJA 4Y90A 3SFKA 3W74A 2JGYA 2X1SA 4ZQRA 3AO0A 1DV7A 5BNKA 1KBJA 3F4NA 1VLWA 4O1AA 4JTLA 3CWNA 1A5CA 3F1QA 1TPUA 5FEPA 5K9CA 4K6AA 3TIMA 3GLCA 5GVJA 4TR9A 2ISSA 2GOUA 2OCZA 4WY0A 1K8XA 3G18A 4LRSA 3CHVA 3JRKA 1S3HA 5G1YA 5FF7A 2CZDA 2Q8ZA 3EKLA 3MP5A 1I45A 1M7OA 3HGRA 3TUUA 1Q45A 4AEOA 1MZHA 4JX6A 3CEUA 3UY7A 3MP3A 1TV8A 2Y61A 3QSRA 1XUZA 5LGZA 5KZDA 4GUHA 3CWOX 3QFEA 4Y96A 1CW2A 4P2VA 3O63A 4FHAA 4FNPA 3L9CA 3DAQA 3EXTA 3KFTA 4Z1DA 3FKRA 5CSRA 3UWUA 3RK8A 3PUEA 3TSMA 2DZTA 3UWZA 3ABRA 4ICNA 1JCLA 1MEIA 3LTPA 4XBSA 4AMAA 1R2SA 1YTDA 4PCFA 1W56A 3NM1A 3QF0A 1XKYA 1SFJA 4O15A 3TXZA 3BG3A 3W7MA 1FWNA 3B0PA 3CC1A 3BLEA 2V2DA 2VFDA 3Q37A 3I7SA 1SZEA 2PURA 1DBTA 2VEKA 2CLFA 4O10A 1KLYA 2H3BA 2A6NA 1KTBA 1B57A 4AWUA 5I3GA 1K7EA 4GXMA 4S2BA 1WV2A 3KVMA 4OBTA 4HNNA 2H8ZA 1KW1A 3HQ1A 3O16A 3EEGA 3PR2A 2QCMA 1GVFA 1VZWA 1BWKA 1G4PA 1VHCA 5E93A 5AYYA 4BF9A 4JR5A 4N2YA 3DFTA 1VS1A 4R7JA 1AW2A 1ZALA 2A2IA 3N34A 3STCA 1EEPA 3N2MA 3LLFA 2TMDA 1XL9A 1L2UA 3G1SA 4Y6GA 1Q3NA 4ZQPA 3TU9A 3LTSA 5G2IA 1G67A 3M5XA 4NJHA 4NJJA 3O05A 1JULA 1RZMA 4M6QA 1TPH1 3W7NA 2V30A 4MJZA 3W7IA 2CLOA 1ZHAA 2TPSA 4O4VA 3W7OA 3MYOA 2W6RA 1W8SA 5D03A 1IGSA 4UTTA 2WPBA 2QDHA 3PF3A 1HO4A 2DJXA 1RPXA 3CIWA 4MOZA 1ZNNA 3WK1A 1SO3A 3EX6A 1FWTA 4MZ1A 4JYEA 3NQ6A 1K03A 3SSJA 3QEZA 4NXSA 3HG2A 1ZCOA 3PWAA 2V82A 3R89A 3G1AA 1LBFA 1VQTA 1ADOA 2CLIA 2WOQA 2TSYA 2QUVA 1ZY9A 2GQ8A 3GNNA 3NQEA 5HR6A 3KX6A 2DZPA 1H7NA 4UMBA 1R47A 3NVTA 3PS7A 2FQIA 4MJMA 3UPWA 3C2EA 5BOOA 1IF2A 3EWYA 2V2HA 3UXAA 1XBYA 1X1OA 3A21A 1Z42A 4HIBA 3HMJG 5CG7A 5LNWA 3G1HA 5AHFA 1S5TA 1RQHA 2NLIA 3CQ0A 3N3MA 4GUIA 4NJKA 1RV8A 1XI3A 3PBWA 5K7JA 3O1NA 2J88A 3UD6A 1P0NA 1HUVA 2WO5A 4DO6A 2FLIA 3W7GA 4OV9A 1JVNA 3GB6A 2Z2UA 2JBMA 4EOUA 5FEZA 1CI1A 1SW0A 3DXIA 3UYCA 4XTDA 3NQ2A 3RU6A 4XWUA 3TR2A 1TPFA 3G3MA 3M0ZA 4UMCA 4FX8A 2C13A 3KHJA 2BTMA 2X16A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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