1BQCA

Beta-mannanase from thermomonospora fusca
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
ATGLHVKNGRLYEANGQEFIIRGVSHPHNWYPQHTQAFADIKSHGANTVRVVLSNGVRWSKNGPSDVANVISLCKQNRLICMLEVHDTTGYGEQSGASTLDQAVDYWIELKSVLQGEEDYVLINIGNEPYGNDSATVAAWATDTSAAIQRLRAAGFEHTLVVDAPNWGQDWTNTMRNNADQVYASDPTGNTVFSIHMYGVYSQASTITSYLEHFVNAGLPLIIGEFGHDHSDGNPDEDTIMAEAERLKLGYIGWSWSGNGGGVEYLDMVYNFDGDNLSPWGERIFYGPNGIASTAKEAVIFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-resolution native and complex structures of thermostable beta-mannanase from Thermomonospora fusca - substrate specificity in glycosyl hydrolase family 5.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (BETA-MANNANASE)
molecule tags Hydrolase
total genus 134
structure length 302
sequence length 302
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 1998-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1bqcA00
1W32A 3CH9A 1B3XA 3GXIA 1V03A 3TTYA 1MWOA 1G5AA 4OBSA 5A94A 2W62A 3ZJ8A 3UERA 2J8GA 1E4IA 3K4DA 3L4TA 2VQUA 2FDMA 3FAXA 2Z1SA 1QHZA 3A4WA 1K6AA 4OKDA 3WNKA 2YA1A 3WDHA 2E3ZA 2BHUA 3N04A 2BHYA 2PBGA 4AC1X 2J7HA 3AYRA 1NWTA 2VZOA 2Y8VA 4AZIA 2JIEA 2QV4A 2VCCA 3FY1A 3O2LA 4AIEA 2ZUNA 4HMDA 5I6SA 1EDGA 4Z2LA 3OGSA 1E5NA 1JXJA 4ATLA 1WO2A 1ITXA 1FFRA 2VX6A 3GXFA 2CKRA 3II1A 1I75A 5AC4A 3K1DA 1JF5A 1EDTA 3WMSA 2CESA 1KR1A 1JXKA 3NSMA 4K68A 1TA3A 5BWFA 3K46A 3RJYA 1TVNA 1L0PA 1QBBA 5A2AA 3EMQA 3BC9A 3W25A 2BY1A 5TD4A 1UH4A 2WCAA 4TTUA 1V0KA 1HJXA 4TX6A 4F9JA 4IISA 3VD4A 3WUBA 1PX4A 4AZGA 4D6FA 2X1IA 4HOXA 1UA7A 4W5ZA 3AI0A 4PCTA 3DHUA 2G3IA 2VX5A 2J25A 2J7CA 1NWUA 5HNNA 3OLGA 1V6WA 5BRPA 3ZM8A 3M07A 1S46A 5A8NA 1PJ9A 3ZT7A 4YHGA 4ACYA 2J7EA 1BHGA 1BLIA 4AD0A 1PX3A 1LJYA 2C0HA 2XGIA 3AS1A 5BXSA 2J62A 2VNCA 4CU6A 1CEOA 3BAXA 2ESCA 4C7FA 4M1RA 2VURA 1LL4A 2W61A 2TAAA 4PRWA 1Q4NX 1E6PA 1MFUA 2DH2A 3PTQA 3BLPX 1HKIA 3WF0A 1NWSA 2Y2WA 3AIVA 2OYLA 1K9TA 3AMGA 3AIWA 3AXHA 1CNVA 3KL0A 3VINA 2EEXA 3RDKA 3PTKA 1C3FA 4QP0A 2XFRA 2OSWA 1UD3A 1BSIA 1OD8A 1QPKA 4AZHA 4GKLA 3WN6A 4UOQA 3CZGA 2D0HA 1HKKA 3A6OA 3ZSTA 3THDA 3MV01 3BAWA 3UR8A 1TUXA 2XVLA 5FOOA 1ISXA 1W9UA 5I3DA 2XHYA 5E6ZA 3NSXA 4FLSA 1XCWA 1M03A 2WNWA 3VIIA 1UKOA 3CMJA 3OGRA 3AIQA 1I1XA 4ATDA 3D3AA 3VIJA 3VGBA 3VGFA 3A3HA 3W28A 2ZUUA 1DEDA 1KGWA 1GHRA 2WKLA 4JFWA 1GOKA 1ISZA 1IZJA 3CUFA 2EPNA 2CYGA 1H41A 4MJ2A 3AHXA 1IV8A 2BVTA 1NARA 2A3BA 3PZOA 2WSKA 1ZBVA 4KRUA 5LA1A 1K9DA 4P7RA 2FHFA 3HJEA 1GOOA 3AROA 3WDIA 1BG4A 1GOMA 4JZ5A 3F4VA 2NW0A 4H41A 3BXWA 4OIFA 1H0GA 4FF5A 1C8QA 4D6DA 2J4GA 3CZKA 2YLLA 5E9AA 4H8UA 1LQ0A 5IDIA 1BYCA 2YIHA 1CIUA 4TTGA 2Z1KA 1VJZA 3SEPA 1BG9A 2QHAA 2O92A 3ARVA 1YHTA 4KRTA 2IUZA 4X9YA 4BQ2A 2WLYA 4QAWA 1V3KA 1UQZA 4RE3A 1V3JA 4Z2JA 1R86A 4HA3A 1NP0A 2WVSA 2EJ1A 4GXPA 2GJPA 4W8LA 3I3DA 3K8LA 1V3IA 2X0HA 2VT0A 2XIBA 1MW1A 1GQJA 2DSKA 1JL8A 1XSKA 3W4RA 1W3JA 2J78A 1Z32X 3ZJ6A 1PBGA 4DUWA 5HOSA 2DSWA 1KXTA 5HDRA 2YA2A 1MW3A 2IXVA 2DSVA 3CHCA 3EDEA 2WMJA 1OBAA 4R27A 3WNMA 3VMNA 4HZ6A 3WQ8A 4X0NA 1PAMA 4CU8A 1J0HA 3VILA 3PZTA 5D9OA 3VM7A 5ABFB 3OLDA 3VGDA 1V3MA 2W4XA 4W84A 3QR3A 1JI2A 4UQBA 1UWQA 1MVYA 2OWXA 3WKZA 4UOJA 2MANA 1GQKA 3QHNA 3VVGA 1R8LA 1GORA 3NUKA 3VD7A 3BCDA 4UFKA 2G8ZA 3ARXA 4D6JA 2VMFA 4W5UA 3VGGA 1VFMA 5BRQA 3T2QA 4DUXA 4OOUA 2WXDM 1OGBA 1UD8A 1JDDA 1UD6A 4HOWA 4KH2A 4TOQA 4FLQA 1BTCA 3L4VA 4DM2A 5FIPA 1K9EA 2QMJA 5CJ5A 3CPUA 1TZ7A 2CBUA 2OYMA 5IXEA 2ZXAA 1ZBWA 3VDBA 1VFOA 5DT7A 3W29A 2HISA 1H2JA 3KL3A 1GQLA 2FH6A 1JZ2A 1BAGA 1M53A 1C7SA 4W8AA 1KWGA 4H7VA 3SIMA 1HVXA 3AS2A 3T0AA 2XVNA 2XSAA 2VZUA 4BA0A 2O9RA 3AMLA 5CPQA 4KGLA 3RJXA 2GJXA 4E8CA 3WBAA 4H04A 3WEOA 1EO5A 2G41A 1LF1A 5CXPA 3VMOA 2GJRA 1JFXA 4J28A 3WNOA 3PZ9A 4IM4A 4AZCA 4XB3A 4D72A 3GZAA 2EPMX 1BFNA 3ZO9A 3VD5A 4PMXA 1MQQA 2CKSA 4H2CA 2XYLA 1MQPA 1OM0A 2EQDA 4HP5A 1EHNA 1UQYA 3GH4A 2NSXA 3WNPA 4JL1A 4D6IA 1WZKA 4PTXA 2J7BA 3GNOA 1PIFA 3ARUA 2WYSA 1FHLA 1M04A 2VX7A 5A2BA 5GNXA 4GZEA 3CIVA 3BGAA 3AZSA 1MXGA 2D3LA 1E71M 1C91A 1JAEA 1ECEA 3M6DA 1W9XA 2BFGA 3OBAA 3CTTA 1V02A 1R87A 3UCQA 4URIA 3WDQA 3FHAA 1W2PA 3CMGA 1PZ2A 2D1ZA 2XGBA 1PIGA 1Q6DA 5IHRA 3RILA 1D7FA 4M80A 3D5HA 4DWSB 3W26A 3KE0A 4GQRA 3HU7A 3AMDA 4CD8A 2XG9A 3W82A 3WDRA 2VQTA 2BNJA 1W9BM 4U3AA 3SCVA 3A4XA 5CQ1A 5GQBA 2VO5A 4WF7A 4W87A 4ZEPA 2YL9A 4NF7A 1HT6A 1BYDA 3MS8A 4JFVA 4FLOA 1EXPA 3ARWA 4BZYA 3WUEA 3CLWA 4QLJA 3WELA 3ZR5A 1E55A 1US3A 3WEZA 5D9NA 4OJYA 5CLWA 3IANA 2DT2A 3QHOA 1I1WA 1EDQA 1VFUA 4P8VA 4UQEA 1GNXA 2WM0A 1JD9A 4B3LA 3FXYA 1EOKA 3VIOA 2W92A 1NOFA 2YLAA 5C70A 1BVNP 1J11A 1DWIM 1X6NA 1OGSA 1B3WA 2WHJA 5A6KA 3WMCA 3CHDA 4ML4A 2PB1A 5JIWA 2CBVA 3PZNA 1GW1A 4XZBA 3DC0A 4AD3A 4B9ZA 4P8WA 2G3MA 1GJUA 3WF4A 3T0BA 3KL5A 5AY7A 3SCUA 4AIUA 5DT5A 3VD9A 3J7HA 5A6SA 4ATWA 2Y24A 5A6JA 4PMQA 2VCAA 3VM5A 1VEPA 3CUJA 6CGTA 1JNEA 4HMEA 1B30A 1CXFA 2VZTA 2DEPA 4H8HA 4CN1A 3DECA 1TA3B 4D71A 4W7WA 1WP6A 1JD7A 4J3SA 3OA5A 4CD5A 1UWSA 2CPUA 2ZIDA 4HPGA 1EQCA 1JYXA 3MV11 5E09A 1TFVA 2ZUWA 1QNRA 1E0XA 2X05A 4DWSC 3OLIA 2V3EA 4AZBA 5I79A 4ZE5A 1JGIA 3ZMRA 3DYOA 2V3DA 4J3WA 5DFAA 5A6BA 3LPFA 3GDBA 3QHMA 1CLXA 2ZX9A 2VTFA 1EQPA 3U7VA 4GI9A 4LYPA 1E4MM 3G6LA 5ABEA 1HX0A 3IJ7A 4U3CA 5CGMA 2D0FA 1ZU8A 2XVGA 1V6XA 3PN8A 4GZIA 4UQ9A 4AY1A 1UWIA 4CVWA 3E1F1 3MMWA 3W0KA 6A3HA 4P7NA 5AYIA 4LPCA 5M3WA 2VZSA 3AIEA 1BGGA 4BS0A 2QPUA 4AWEA 1ZJAA 1GJWA 3SCWA 3SUUA 2D20A 7A3HA 3FN9A 3TTSA 3L4WA 3MUIA 5AC5A 2WVVA 1M7XA 1H0IA 5I0DA 3ZQ9A 4CD7A 4J7RA 1UR8A 1E6QM 2XJ7A 3VGHA 4TVCA 1UD2A 4J3UA 4XX6A 4UNIA 4MNLA 1QHPA 3VOCA 5D4YA 5EB8A 2NT0A 3SUTA 3OZOA 1UZ1A 2Y4SA 2ZXBA 1VAHA 1LL7A 4AISA 1OSEA 4U5KA 2E9MA 3CZLA 1R7AA 4QCEA 1E0WA 4LXFA 3OLEA 4U2YA 1QNQA 5AYBA 3MO4A 1N82A 1UKSA 4P7LA 3VDHA 1HJVA 1D2KA 2QF8A 2WZHA 2V3GA 3WH7A 1VJSA 3AICA 1XRVA 3M7SA 4AZ5A 5I24A 1UKQA 4WSJA 2WC4A 4PTWA 4MDPA 1VEOA 2D2OA 2D3NA 1VENA 4W8BA 1QW8A 2DT0A 3N15A 2WHLA 1AQHA 2WMIA 2CERA 1JYWA 3LMYA 4PMUA 2AMGA 3ZT6A 3AQUA 2QLYA 4C7GA 3EMCA 4UZUA 1CXLA 2VVSA 1JZ8A 4WIWA 2DPEA 2YJQA 4Z2GA 2J77A 3GH5A 5FKYA 1E3ZA 2WCGA 1KR0A 2FH8A 1HF6A 1NP2A 1E3XA 3AIUA 2DSZA 4NI3A 6TAAA 1UH2A 1DHKA 1OB0A 3EDDA 3GNPA 4ZE4A 3GYCA 4GZJA 2G3JA 1E73M 3VKKA 2JFEX 3CZJA 4NRSA 1F4HA 4GI8A 4JCLA 1B0IA 4TUFA 2WB5A 2WMGA 2PWFA 4L4OA 4MAVA 3BH4A 3POCA 3LPGA 3AOFA 3AHVA 3VPLA 4OZOA 3VMPA 1HNYA 4M81A 2JIWA 2JEQA 1XGZA 1J18A 2YDSA 3U57A 1WDSA 2EXOA 2BXYA 4CUCA 4E4PA 1W9PA 1W3HA 2VRKA 2NT1A 1W1VA 3ARYA 1JYVA 4AIOA 1UD4A 3LPOA 2ZICA 2GFTA 1OT2A 5A6MA 4KWUA 3ALFA 1UWRA 3SCTA 4A4AA 2XM1A 4KGJA 3BCFA 3M46A 3UR7A 3S2CA 5KZ6A 3KWXA 4JHOA 1M01A 5I23A 3AJ7A 1G94A 4AEEA 2ZX6A 5E0CA 4HZ8A 2ZX5A 4AD1A 1JAKA 2XVPA 2VRQA 1ZJBA 1GZJA 4JIEA 4D6CA 2PI6A 1CENA 1HXJA 1JDAA 3ALGA 2E4TA 3L2MA 3MMUA 1C92A 1O7AA 3W53A 3AIBA 5BROA 2ZWYA 2DGAA 2XIIA 4LYQA 2J7DA 3FW6A 3WQVA 4OOZA 2VL4A 2XFYA 5LA2A 2F8QA 1H09A 5C71A 2GDVA 2E40A 1UHVA 4JFSA 1HKJA 4MNMA 2EO7A 3NJ3A 2YL8A 1UA3A 3SCQA 3WQWA 3O9NA 1E40A 2VUYA 4CN6A 3AYSA 1HL8A 1FHDA 5LA0A 1QI3A 1CGWA 3VD3A 1OWQA 4UFMA 1J12A 2WZIA 4AD4A 3UESA 1JZ7A 4TXEA 3KEHA 3FNDA 1XC6A 1KGXA 3GXMA 1XYZA 1MYRA 3JUGA 1H4PA 1HVQA 1VFFA 4MB4A 1HP4A 1FP9A 2XPKA 3VGEA 3SCRA 2JALA 3B8SA 1XSJA 2WWCA 3KZSA 4CGTA 4U2ZA 3APGA 3MANA 3ARTA 1BQCA 1FFQA 2GJXB 3BSGA 4ZENA 3W6LA 3BAKA 1NM9A 5A8OA 1CXIA 4A3YA 1LLOA 1KBKA 1SMAA 3UETA 4PMNA 1WZAA 5A69A 2WAGA 1GOQA 5M03A 5A6BD 3WNLA 4AZCB 4XUYA 5A8QA 2J75A 1DWJM 3L4ZA 1PZ3A 2WC3A 1HKMA 3WH5A 1TCMA 3W38A 1B90A 4UR9A 3T0DA 3L4XA 5HXMA 1J01A 2WLZA 4HA1A 4HA4A 4WKHA 1CGUA 3T09A 2J8FA 1ZB5A 1ZBKA 3RM8A 4Z2IA 4AXNA 4MNKA 2D22A 4CD4A 1V3LA 1P6WA 3AXXA 4HMCA 4PMZA 5CZKA 1CXHA 1NQ6A 4QCFA 1ISYA 1B3YA 1AQMA 3GM8A 4F8XA 2X09A 1CGXA 2ZOXA 3WY1A 3EDFA 2EPLX 4UOZA 4PMRA 2OSYA 3ZT5A 4CKQA 3MUY1 3N11A 1LL6A 3U5UA 2RGMA 3IAPA 4J27A 1C93A 1KWKA 4F79A 3SCPA 1ESWA 2WBKA 4PBGA 8A3HA 2AAAA 4S3JA 4W85A 1MFVA 1FA2A 3PTMA 1US2A 5JIPA 4GO9A 3A4AA 2GK1A 3WF2A 3QOKA 1HJQA 4ACZA 2O9PA 3WEMA 2YDRA 5C8BB 4W86A 1QHOA 2E8YA 2VR5A 1DWHM 3QOMA 4V2XA 4U5IA 3TA9A 3WH6A 1JZ4A 5DF0A 2ZUVA 3BSHA 3L4YA 1J0ZA 2V5DA 2ZX8A 3QGVA 1QI0A 4D6HA 3VIPA 4PMDA 5CGTA 5A6LA 1EA9C 4BCEA 5ABFA 5D8ZA 1NOWA 1E4LA 1H11A 3SUWA 2YBTA 5E70A 2E8ZA 3VNYA 2B31A 5D9MA 1RPKA 1EGZA 3AISA 3EBVA 2YL6A 1W1YA 5IFPA 2O9OA 1QI2A 3BMVA 1KXVA 4OBRA 3AHZA 4HTYA 1QVBA 5CSUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1W32 A;  3CH9 A;  1B3X A;  3GXI A;  1V03 A;  3TTY A;  1MWO A;  1G5A A;  4OBS A;  5A94 A;  2W62 A;  3ZJ8 A;  3UER A;  2J8G A;  1E4I A;  3K4D A;  3L4T A;  2VQU A;  2FDM A;  3FAX A;  2Z1S A;  1QHZ A;  3A4W A;  1K6A A;  4OKD A;  3WNK A;  2YA1 A;  3WDH A;  2E3Z A;  2BHU A;  3N04 A;  2BHY A;  2PBG A;  4AC1 X;  2J7H A;  3AYR A;  1NWT A;  2VZO A;  2Y8V A;  4AZI A;  2JIE A;  2QV4 A;  2VCC A;  3FY1 A;  3O2L A;  4AIE A;  2ZUN A;  4HMD A;  5I6S A;  1EDG A;  4Z2L A;  3OGS A;  1E5N A;  1JXJ A;  4ATL A;  1WO2 A;  1ITX A;  1FFR A;  2VX6 A;  3GXF A;  2CKR A;  3II1 A;  1I75 A;  5AC4 A;  3K1D A;  1JF5 A;  1EDT A;  3WMS A;  2CES A;  1KR1 A;  1JXK A;  3NSM A;  4K68 A;  1TA3 A;  5BWF A;  3K46 A;  3RJY A;  1TVN A;  1L0P A;  1QBB A;  5A2A A;  3EMQ A;  3BC9 A;  3W25 A;  2BY1 A;  5TD4 A;  1UH4 A;  2WCA A;  4TTU A;  1V0K A;  1HJX A;  4TX6 A;  4F9J A;  4IIS A;  3VD4 A;  3WUB A;  1PX4 A;  4AZG A;  4D6F A;  2X1I A;  4HOX A;  1UA7 A;  4W5Z A;  3AI0 A;  4PCT A;  3DHU A;  2G3I A;  2VX5 A;  2J25 A;  2J7C A;  1NWU A;  5HNN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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