1C90A

Endo-beta-n-acetylglucosaminidase h, e132q mutant
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
265
structure length
265
Chain Sequence
KQGPTSVAYVEVNNNSMLNVGKYTLADGGGNAFDVAVIFAANINYDTGTKTAYLHFNENVQRVLDNAVTQIRPLQQQGIKVLLSVLGNHQGAGFANFPSQQAASAFAKQLSDAVAKYGLDGVDFDDQYAEYGNNGTAQPNDSSFVHLVTALRANMPDKIISLYNIGPAASRLSYGGVDVSDKFDYAWNPYYGTWQVPGIALPKAQLSPAAVEIGRTSRSTVADLARRTVDEGYGVYLTYNLDGGDRTADVSAFTRELYGSEAVRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mutations of endo-beta-N-acetylglucosaminidase H active site residues Assp130 and Glu132: activities and conformations.
pubmed rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces plicatus
molecule keywords ENDO-BETA-N-ACETYLGLUCOSAMINIDASE H
total genus 95
structure length 265
sequence length 265
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.96: Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase.
pdb deposition date 1999-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1c90A00
3VGHA 2Z1KA 2XVNA 3WNOA 4MB1A 6A3HA 4ZE5A 2Z1SA 1F4AA 1E43A 4WKHA 1J9YA 3KEHA 4W87A 1TCMA 4UFHA 2D2OA 2ZXAA 4RE3A 3RO8A 3SCQA 3N17A 3NJ3A 4TTUA 1OIMA 3ARRA 1QNSA 2VX4A 3AROA 3O2LA 4CU6A 5GNZA 1VBRA 1KXHA 4GKLA 1FP8A 2PWEA 3WF4A 2EJ1A 1CYGA 2YKKA 1IV8A 4MDPA 5BRPA 1XCWA 2F8QA 3MS8A 8CGTA 2DH3A 5JIWA 3TTQA 3BLPX 1DWFM 4UQDA 2J7HA 4ML4A 3WNMA 3WFZA 3AICA 2D22A 3WF0A 1D7FA 1R86A 5M03A 3BAIA 1SR0A 2Y4SA 3AMDA 3PZUA 3VUPA 3W82A 2VUYA 2CBIA 1OINA 1W32A 2VRKA 2OYKA 3CZJA 4S3KA 2OWCA 2CITA 3HN3A 1E6RA 4PSPA 3EBVA 5CGTA 4PMQA 3W37A 1W91A 1BYDA 1G1YA 1VIWA 3AMGA 3PZMA 4W7WA 1XSJA 4AMCA 5HXMA 1HKJA 5M5DA 4D1IA 5ABFA 4MNMA 1K9DA 3WD3A 4H7VA 1GVIA 1MQPA 4BQ2A 2E40A 4MDOA 2CCRA 1BVZA 1TFVA 4YN5A 2JIWA 4A3YA 1NOUA 2CPUA 2QPUA 1XSKA 1LL7A 3OA5A 2VJXA 4OZOA 4HA3A 3K4AA 3CPUA 4UZSA 3U7BA 1OWQA 1FH7A 4DWSA 1UD5A 5I77A 4XB3A 1BG4A 1WB0A 3JUGA 5E0CA 2CETA 3SCTA 2E3ZA 4FLQA 1NP0A 4AZBA 3F5LA 3VNYA 1UA7A 4LYQA 3OLEA 1GCYA 1GOOA 5BXTA 3VIJA 3IK2A 5BYWA 1V6WA 2J7EA 4N42A 1VF8A 5AC4A 2WZHA 3CMJA 3VM5A 4M24A 1JF6A 5E0FA 1C8QA 5CPQA 3W0KA 3VD9A 3AOFA 3VIHA 1JDDA 4LXFA 1UR2A 1PX4A 1E72M 2UY2A 4PMDA 2ZXQA 3T2PA 3A4AA 4DWSD 3ARUA 3GXDA 4FK9A 3QHOA 3RJXA 3CZGA 3POCA 3GBDA 2D0FA 2A3HA 3WUBA 4AZ6A 3VVGA 1JNEA 1VFOA 2Y5EA 3OGSA 1VFMA 1UWRA 2GK1B 2E4TA 3DYPA 4PTMA 3WNNA 1HVQA 1W2VA 4D6JA 3F5JA 3WDPP 3KWXA 3VO0A 1ZJAA 1E4LA 1EOKA 5DMYA 5KZ6A 4JFWA 1VEOA 1XC6A 2WC4A 3AIWA 4P7OA 1LWJA 1PZ3A 3G6MA 2E9LA 1FHDA 3W4RA 1JD7A 4Q7NA 1J0ZA 4EKJA 1DWHM 1JZ3A 4M29A 1W1PA 3T0AA 4AIOA 1UOKA 4KRUA 3WQ5A 1E55A 5DF0A 4GQQA 3G6LA 3BCDA 1CENA 3GXFA 3CMGA 3DC0A 1VEMA 4HU0A 3CH9A 4JIEA 3M7SA 4M8UA 4CUCA 1U33A 1HKIA 3T2OA 2WHMA 1SMAA 1Y7VA 2V3GA 3OLDA 3CHCA 3AHTA 5E6ZA 4C7DA 2VZVA 2ZUMA 1C7SA 4UOQA 5A8NA 1GUVA 4J7RA 1ODZA 3BSGA 2CERA 3FHQA 4QLLA 2YA2A 2AOSA 4ATDA 3M46A 4QP0A 3WF3A 1UR9A 2C0HA 2BXYA 1EDQA 4XX6A 2OSWA 2JF7A 4BQ5A 4PMVA 4QLKA 3VIFA 4UQBA 1DWJM 1GJUA 2XG9A 3WNKA 1MQQA 1V6XA 1I75A 2XJ7A 1QI4A 4Z2LA 1JG9A 1BGGA 2V38A 1GW1A 2EBNA 1OB0A 5BXPA 4K68A 1G01A 2ZUUA 1PIGA 3AIRA 3O6AA 3EDEA 2G4FA 3W81A 1GQKA 4CVUA 4P8UA 3K46A 3U5UA 5HPCA 4YHGA 1OGSA 4UFLA 3ARYA 1MW2A 3BC9A 2D20A 4PYSA 4NSBA 1AVAA 3I3DA 2NT1A 3WMSA 4AW7A 4PMOA 2XHYA 4IISA 3UEQA 4MNLA 1EH9A 4CD8A 2XFYA 3ARZA 4JKMA 1JI2A 3UG5A 3GH5A 3GTNA 4Z2IA 4MB4A 1V3MA 1AQ0A 2VX5A 1OGBA 3GZAA 4PRWA 4PMZA 3UESA 3CO4A 4PUEA 1A47A 4QCFA 4BS0A 4CD5A 5HOSA 3W6LA 1VRXA 3WF1A 1JZ5A 1HXJA 1J12A 1E56A 1UKTA 3ZIZA 2JEPA 3CUGA 4GI8A 1W9PA 1ISZA 1ODUA 3WL1A 4D6HA 8A3HA 4P8VA 2PWDA 5D4YA 1H11A 1FP9A 1B31A 4AC1X 3HJEA 4PTXA 2EO7A 3T0BA 3TTYA 3LPPA 2OWWA 3MUIA 5CZKA 3VIMA 1R7AA 5IFTA 2UY5A 4ZXLA 3GNRA 1B3WA 1W3HA 3AI0A 1V6YA 2GJPA 1BYBA 1E1EA 3PBGA 2J77A 2UWFA 4PCSA 4AZCB 3KL5A 3RM9A 1CGXA 1UHVA 3U7VA 3IAQA 5I6SA 1V03A 4QAWA 4W5UA 5A94A 1XRVA 3AS1A 2XUCA 1JD9A 1V6UA 1G94A 4MB5A 5AYBA 4EE9A 1OM0A 2XWEA 2VOTA 2D3LA 3W27A 2QLYA 2YDSA 1PEZA 3LPOA 4P7LA 1Q6EA 1KGXA 1LF1A 4F8XA 3RPMA 2W61A 5D8ZA 1N82A 1GOMA 1F4HA 1UA3A 4GQRA 1VFUA 1ZB5A 1FFRA 1MW1A 2Y8VA 5GQBA 4JAWA 2BV9A 2EPNA 3F4VA 2Y8KA 5I2UA 1OD0A 1C93A 1V0NA 2ZWZA 3ZMRA 3ZOAA 2BVTA 3E1F1 3GH4A 5I79A 3SCPA 4TOQA 1V6VA 3K4DA 2FGZA 1V3KA 2QPSA 3VOCA 1UH4A 5AC5A 4U31A 1QBBA 2J25A 4NRRA 3RCNA 1MW3A 4W5ZA 1HJXA 3VU2A 2VVSA 1MFVA 4Y7EA 2DPEA 2WPGA 4FLOA 3AFBA 1QW8A 4AEFA 1V0KA 2VT0A 1H0GA 2YL5A 4W85A 6CGTA 1PZ2A 3RDKA 1H49A 3WD2A 1XD1A 1BAGA 1KWKA 2JF6A 3AXHA 1O6IA 5E6YA 2WK2A 1C8XA 5I24A 3RILA 5BXRA 3FNDA 1GOQA 3AIUA 1BYCA 3THCA 5EFDA 5FL0A 1ISXA 2OSYA 1UH2A 5LA1A 2OWXA 1EGZA 3RM4A 3L4XA 1CPUA 3SURA 3MSGA 1WZAA 4QCEA 5HPOA 1J0JA 1BQCA 3VGFA 3AYRA 3EMZA 1KCLA 1U2YA 1V3HA 3BAXA 3AMLA 1E3XA 1XYZA 5FD0A 5GNYA 1AMYA 5DFAA 3VIKA 1P6WA 4M80A 2V3EA 3PZ9A 2DT1A 2WLZA 1OD8A 2ZUVA 4BF7A 3W28A 5M3WA 2WVTA 1E0WA 3OIHA 4A3HA 3VD7A 1LG1A 4J3XA 4OIFA 3W26A 2WZIA 3ARSA 4AZ5A 4JKKA 4UQ9A 3VIGA 2XPKA 4LYPA 1KXVA 2CXGA 5LA0A 1K6AA 3W38A 1MXGA 4GO8A 4H41A 2ZOXA 2A3CA 3WQWA 3U5YA 1CXKA 5A6KA 1OBAA 1PJ9A 3W53A 1G0CA 2YL6A 4J3UA 1XGZA 2ZUSA 3T2QA 5CLWA 2ZUTA 3UG4A 4E4PA 1WCGA 1ISYA 3GNPA 1LG2A 1E6ZA 2PI6A 4ACZA 4OUEA 1XSIA 2FH8A 4PMNA 1OCQA 1G5AA 1CNVA 3IANA 2VX7A 1UKSA 5ABGA 3ZJ7A 5CPTA 3VIPA 5IHRA 1HVXA 1I1WA 2ZXBA 1NWUA 2E8ZA 7TAAA 1TVNA 2IXUA 1GNXA 2YBTA 1JAKA 1OT2A 2VTFA 1KCKA 2XVPA 4MNKA 1HNYA 2WXDM 2FH6A 5I23A 4ATLA 2VL4A 5I5RA 3OBAA 1WDQA 1D2KA 3ZR6A 2G3NA 4CN6A 1HF6A 4KMQA 3VMOA 3BCFA 2W91A 3N1AA 4HMDA 1IZKA 2WCGA 1B3XA 2V5DA 1MFUA 2WC3A 3BAWA 3WMCA 3WDIA 1V02A 3PZQA 2J4GA 3NSMA 3EDFA 2WMJA 2G3MA 3ZT5A 2JIEA 3EDJA 1YHTA 2XVGA 3AJ7A 6TAAA 1QNPA 1E5NA 2GJXA 1JYWA 1W2PA 1J0HA 3CLWA 4UQEA 2VRQA 5BROA 1H1NA 3QHNA 1UH3A 1NARA 2YLAA 3AS0A 3WBAA 4E2OA 1OSEA 1FFQA 1XH0A 2O9PA 2VVNA 3L4UA 3PN8A 5A8QA 3HU7A 3SCRA 2FHCA 4OKDA 3SCUA 2WLYA 3N12A 4CKQA 3W29A 2J47A 3WUGA 2X09A 4Z2GA 1WAWA 4CD4A 4U2YA 2VX6A 1JAEA 3AIBA 3MUAA 4V2XA 4B9ZA 1BHGA 3DYOA 2BHYA 3N04A 3WH7A 3M6DA 2YIHA 1EDTA 4J3WA 4N0RA 4FLSA 3BLKA 1HKMA 1ZJBA 2ESCA 5I3DA 2J7GA 3WIJA 1NWTA 1JDAA 2PC8A 2PBOA 1CEOA 1W3JA 2DT3A 5JBEA 1EQPA 4AD0A 4UNIA 2YDQA 1D3CA 3GNOA 2VI0A 4P7QA 2XIIA 5M17A 1QW9A 2YA1A 4X9YA 3VGGA 2ZUNA 2WMKA 3WDJA 1ZU8A 2X0HA 1CXFA 3PZVA 3UR8A 4UQCA 1UQYA 3L4VA 1JL8A 1GONA 3PHAA 4P7NA 1TA3B 1US3A 2A3EA 3ZO9A 4ACYA 1QVBA 4MJ4A 3F5KA 1NP2A 5GPRA 5A6SA 2XM2A 4HZ7A 3WH9A 3K8LA 4D6DA 3AYSA 2WVVB 1B30A 3NIYA 3BSHA 2C7FA 4H04A 3VILA 2GDVA 3L4ZA 2O92A 4R5EA 1H09A 1E0XA 1CXLA 2YLLA 3WQ6A 4U5KA 2OLHA 1J0KA 3EMQA 4MADA 5A6JA 2WYSA 4TTGA 4R27A 1V3JA 3PTKA 2EXOA 4UOZA 1E6QM 1E0VA 4HOZA 2DSWA 1JYXA 3MSDA 2J7DA 1CGUA 4WIWA 3I3BA 4ZFMA 3MANA 1UKQA 4X0VA 3NCOA 1MXDA 3GM8A 1C7TA 3WFLA 4OBSA 1CDGA 1ZBCA 1E6XM 2IXVA 4DUWA 4MJ2A 4AY1A 1Q6DA 2A3AA 2TAAA 1J0IA 4E8CA 3LPFA 1UD3A 3AXIA 2PWHA 3AQUA 4PEEA 5DEZA 5C70A 3VDBA 1UWIA 1W1VA 2EPKX 3WD4A 1LL4A 3PZNA 3KL3A 2PWFA 4UFIA 4GPNA 4DUXA 5A6AA 5BCAA 2G3JA 2OSXA 1K9EA 5CG0A 4E8DA 3PZIA 1UD2A 2D23A 4HZ6A 3SCVA 3ZJ8A 2BY3A 3QOKA 4UCFA 2CBJA 2D0HA 3VIIA 4CN4A 1IZJA 1JNDA 2WVUA 4Q22A 3ZSSA 3WD0A 5BRQA 5FL1A 4PMUA 4BA0A 3WY1A 2J62A 3UR7A 1BF2A 3WDRA 3WBEA 3L4TA 3WF2A 3ARTA 5D9PA 3VD3A 4CCDA 2J74A 1MVYA 1V02E 2BVDA 3VGEA 1KXQA 3CUIA 1E6SM 1C92A 4HP5A 1JGIA 1S46A 2CBUA 4PTVA 4PUDA 1C3FA 4UOJA 3VINA 4P8XA 3FAWA 5ABFB 1CXEA 5D8WA 3W6MA 3OB8A 4AEEA 1KB3A 1KQYA 4IPLA 2J7BA 2EPMX 2JE8A 1Q6CA 3SCSA 3LMYA 1DWIM 1QOXA 3ZR5A 1KGUA 2FDMA 2J7FA 4HZ8A 3DECA 3T08A 1V0MA 4WSJA 3SCNA 1QPKA 3TP4A 1QHPA 1C8YA 1KFWA 3ARQA 1XCXA 3VD4A 1ISWA 1C91A 4KH2A 1W9DM 1H5VA 3VMPA 2X8RA 5I78A 1QI0A 3DYMA 4TVCA 1CLVA 2ZX5A 1HL9A 1GZJA 2ZUWA 2X2YA 1RP9A 1HJSA 4BZYA 5ABHA 4TX6A 1CECA 4H8VA 1PPIA 3WNLA 5KEZA 4A4AA 4CCCA 3WMBA 3NSXA 4RL3A 5GNXA 1E6NA 2UY3A 4WLCA 1J01A 4U33A 3NDZA 1OGGA 3AIQA 4HPGA 2ZX8A 1NOFA 4AIUA 5C71A 2X1IA 2OYLA 3TONA 5AYIA 2BHUA 1TUXA 3N9KA 5C8BB 2J7CA 4JFTA 5A8MA 3BH4A 1PX3A 1GHSA 2DDXA 1JXKA 2FGLA 2ZX9A 1JFXA 1LWHA 1UR4A 4F66A 1H41A 5CXPA 2O9OA 4GI6A 1SFSA 2WAGA 3SCWA 1TVPA 3J7HA 3ZT7A 3BXWA 1ITCA 2C8NA 3W24A 2VZOA 1E15A 1ZBVA 3S2CA 4NRSA 3VDCA 4PSRA 2GVYA 4TVUA 2YBUA 1SMDA 2W92A 2X0YA 3AMKA 3VMNA 3FHAA 3CHDA 4ZEPA 1E73M 3WENA 3AZTA 4LPCA 1BLIA 1ESWA 4HA4A 4TXEA 4KWUA 1PAMA 4UFMA 1CXHA 2QV4A 4WKFA 3II1A 2W5FA 2BNJA 3A4WA 1TG7A 4Z2KA 1XV8A 4W89A 4D6EA 1M03A 5EBAA 3ARPA 4GINA 1WDRA 3MV11 3KE0A 3GDBA 1GOWA 4WF7A 1WNOA 1E4MM 1NWSA 3N13A 4P7RA 3OGRA 1JIBA 4QDMA 3WH5A 4AISA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3VGH A;  2Z1K A;  2XVN A;  3WNO A;  4MB1 A;  6A3H A;  4ZE5 A;  2Z1S A;  1F4A A;  1E43 A;  4WKH A;  1J9Y A;  3KEH A;  4W87 A;  1TCM A;  4UFH A;  2D2O A;  2ZXA A;  4RE3 A;  3RO8 A;  3SCQ A;  3N17 A;  3NJ3 A;  4TTU A;  1OIM A;  3ARR A;  1QNS A;  2VX4 A;  3ARO A;  3O2L A;  4CU6 A;  5GNZ A;  1VBR A;  1KXH A;  4GKL A;  1FP8 A;  2PWE A;  3WF4 A;  2EJ1 A;  1CYG A;  2YKK A;  1IV8 A;  4MDP A;  5BRP A;  1XCW A;  2F8Q A;  3MS8 A;  8CGT A;  2DH3 A;  5JIW A;  3TTQ A;  3BLP X;  1DWF M;  4UQD A;  2J7H A;  4ML4 A;  3WNM A;  3WFZ A;  3AIC A;  2D22 A;  3WF0 A;  1D7F A;  1R86 A;  5M03 A;  3BAI A;  1SR0 A;  2Y4S A;  3AMD A;  3PZU A;  3VUP A;  3W82 A;  2VUY A;  2CBI A;  1OIN A;  1W32 A;  2VRK A;  2OYK A;  3CZJ A;  4S3K A;  2OWC A;  2CIT A;  3HN3 A;  1E6R A;  4PSP A;  3EBV A;  5CGT A;  4PMQ A;  3W37 A;  1W91 A;  1BYD A;  1G1Y A;  1VIW A;  3AMG A;  3PZM A;  4W7W A;  1XSJ A;  4AMC A;  5HXM A;  1HKJ A;  5M5D A;  4D1I A;  5ABF A;  4MNM A;  1K9D A;  3WD3 A;  4H7V A;  1GVI A;  1MQP A;  4BQ2 A;  2E40 A;  4MDO A;  2CCR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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