1C91A

Endo-beta-n-acetylglucosaminidase h, e132d
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
265
structure length
265
Chain Sequence
KQGPTSVAYVEVNNNSMLNVGKYTLADGGGNAFDVAVIFAANINYDTGTKTAYLHFNENVQRVLDNAVTQIRPLQQQGIKVLLSVLGNHQGAGFANFPSQQAASAFAKQLSDAVAKYGLDGVDFDDDYAEYGNNGTAQPNDSSFVHLVTALRANMPDKIISLYNIGPAASRLSYGGVDVSDKFDYAWNPYYGTWQVPGIALPKAQLSPAAVEIGRTSRSTVADLARRTVDEGYGVYLTYNLDGGDRTADVSAFTRELYGSEAVRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mutations of endo-beta-N-acetylglucosaminidase H active site residues Asp130 and Glu132: activities and conformations.
pubmed rcsb
molecule keywords ENDO-BETA-N-ACETYLGLUCOSAMINIDASE H
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces plicatus
total genus 96
structure length 265
sequence length 265
ec nomenclature ec 3.2.1.96: Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase.
pdb deposition date 1999-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1c91A00
3KWXA 4OOUA 5M3WA 1V0NA 1E6NA 2G8ZA 4JFTA 1E1FA 2BHZA 2V5DA 1BYBA 2VUYA 3U5YA 2CNCA 3UG5A 5KZ6A 1N82A 1C7TA 2CITA 2FH6A 1E4IA 4QP0A 4RE2A 4FLSA 1JFHA 1HF6A 3TA9A 5JUVA 2WHLA 2WWCA 3TTQA 3BLKA 2D0HA 3S2CA 3WF0A 5GNXA 2Z1KA 5CGTA 2WSPA 1W91A 1E6ZA 5FD0A 1VBRA 1F4AA 4UFHA 3OB8A 1KXQA 1ZB5A 3LMYA 3VGGA 4FMVA 4MAVA 2VZTA 5LA1A 4EAMA 2XM1A 5E9AA 1B2YA 3BAXA 4UOZA 3WNPA 1HJWA 2BV9A 4LYRA 2RGMA 3VD7A 2WVVA 4XX6A 2E8ZA 4BQ3A 4TTUA 2CBJA 1KB3A 3PZ9A 2DSVA 1YQ2A 2BXYA 1NH6A 5I77A 3FHQA 3G6LA 1PJ9A 1JF5A 4YN5A 1NWTA 1PPIA 4HU8A 3ARYA 1UR4A 1VEMA 2Y8VA 2CIPA 3NDZA 3NJ3A 3ZJ7A 3PHAA 3AIWA 1R8LA 2J8FA 3WEZA 3GTNA 2WMKA 1GQIA 2VVSA 1U30A 3WEOA 2NT0A 2WBGA 5GPRA 2ZUSA 3VGFA 4J27A 3MMUA 4ATWA 2D23A 2W66A 4D6IA 1CECA 4GI9A 1EOKA 1GQKA 2DH2A 1AVAA 3VX0A 2XTKA 3J7HA 4UOQA 4UZUA 4K68A 2WPGA 1C93A 1WZKA 1EDQA 1UD6A 3MUAA 4W7VA 4ACZA 3NSXA 4AIUA 3SCVA 3SCOA 2G3IA 4Z2KA 4LPCA 1VIWA 4AD4A 3WMBA 1JF6A 3CLWA 3K8KA 3ZSTA 2W4XA 5AY7A 1SMDA 3WKZA 1UR8A 4AZGA 2PWHA 3AYSA 1V3MA 5E0CA 1Q6FA 1JZ2A 4HA4A 1GONA 3RCNA 1CYGA 4D6GA 2TAAA 4TUFA 1ITCA 1Q4NX 3THDA 3WMCA 3BXWA 1JFXA 3N17A 1ISXA 1GZJA 3WH7A 3L4TA 4B3KA 4HOZA 5KEZA 3VUPA 2DT3A 4CN1A 3CUHA 2ZX9A 1HVXA 3ARSA 4AISA 2J7DA 4J7RA 5AYIA 2CETA 2YL5A 3LPFA 1OBAA 3K4DA 2X05A 5FKYA 2VX7A 1HXJA 4EK7A 1FP8A 2E9LA 1VFFA 2JF7A 5A6MA 1CGTA 2WMGA 4UQBA 1Q6EA 3VIGA 3VIMA 1WZAA 3HMCA 1CGVA 3GXIA 1JL8A 1JYXA 4P7OA 3VINA 1JXKA 2XJ7A 1HP4A 2NW0A 4AD0A 1FH7A 5CPTA 5IFPA 4B9YA 2VC9A 3W38A 3BSGA 1NWUA 4UTFA 1JZ5A 1WDPA 1PX4A 3AIEA 4UR9A 1W1PA 4V27A 1DEDA 1CGXA 1MVYA 3MUIA 4P8UA 3IK2A 4WIWA 3D3AA 4UFJA 3EBVA 2VURA 2ZXBA 5CPSA 5A6KA 4FLQA 3VIOA 4DWSC 1GVYA 2FH8A 2DDXA 2WZEA 4C7FA 2WZIA 1UHVA 2WMIA 1DWGM 1HN1A 1E6XM 1V3LA 1W1TA 4AD5A 4AIEA 1R85A 4A3YA 4U5KA 3B9EA 3BLPX 1H5VA 5A6BA 3WDRA 1E70M 1QNPA 3WF4A 4C7GA 4AZBA 4W93A 4UQ9A 3UR8A 4GZIA 2XGIA 1QI3A 4GQQA 3AZTA 2OLHA 1O7AA 4P8VA 3SCWA 4PTVA 1HP5A 1GUVA 1EXPA 1HNYA 1H11A 2JE8A 4PYSA 4MNJA 1CGYA 4LX4A 4PEEA 4AZHA 3QGVA 3T0BA 3QHNA 3FNDA 5AC4A 3UG3A 1UKOA 4CD6A 1V02E 1V0LA 1U33A 3N18A 5EB8A 1W9XA 1XHGA 2YBUA 3VU2A 2DEPA 4XV0A 3FY1A 4UQCA 1EH9A 4JHOA 3EMCA 2WVSA 3RPMA 4DWSD 2QLYA 4D6FA 2Q8XA 3IJ9A 4PTXA 4UCFA 1CPUA 2J7HA 2YBTA 2QF8A 4OJYA 5CG0A 1US2A 4CKQA 1W3LA 3SUUA 3VDBA 5A6SA 4W84A 4F9JA 3AHVA 3AYRA 1J0JA 4D6HA 4CN4A 1UH3A 4DUXA 1WAWA 1M53A 4PMRA 3WF1A 5LA2A 3DYOA 3WF2A 2WHJA 4MNMA 2WBKA 1PX3A 4GI8A 1E73M 5A1AA 1QNOA 1V3IA 1MFUA 1LL7A 1JD7A 2WYSA 4BZYA 4DUVA 3DC0A 3CZKA 1E0WA 1TMQA 4Z2LA 2HISA 3UG4A 2ZIDA 1BLIA 3AS2A 5IFTA 2W67A 5D9NA 3W25A 4MNKA 1UR1A 2ESCA 1JNDA 3ARPA 2FHFA 3CZLA 4CD5A 3SCRA 1QNRA 1GPFA 5I24A 5IHRA 4J3WA 1JDAA 3ZR5A 4Z2GA 5A8PA 3PZQA 5E0FA 5E6YA 5HPOA 4H7VA 4UOJA 1JYNA 1HX0A 3SCSA 4JCLA 4F79A 2QHAA 2D22A 4WKAA 1M01A 4PMZA 2W62A 1GOQA 1LL4A 2D20A 2Y4SA 4HZ6A 2O9TA 3AMDA 3W81A 2OWCA 1VBUA 1VJZA 3KL0A 5IHSA 3EYPA 1H49A 3WH5A 3POCA 4GZEA 5HNNA 4EE9A 2A3EA 4AZ6A 2DQXA 2J7GA 3T08A 2NSXA 1LWJA 4M82A 5A2CA 1MQRA 1UZ1A 1JAKA 3T2OA 4KWUA 1JZ7A 2EPLX 4D72A 1EDGA 1JDCA 3ZQ9A 1NWRA 4GKLA 2Y24A 3PTQA 4R27A 2PWEA 1IZJA 4M8UA 2BVYA 2OYMA 3NSMA 3WNKA 3SUWA 5A2AA 1GORA 1AQMA 1UA7A 4OKDA 4EKJA 4CCDA 1XD1A 1C8QA 1PBGA 1CXFA 1O6IA 3UETA 3A4WA 4PSRA 1EQCA 4TXEA 3NCOA 3ZJ6A 3VD3A 3WDHA 4HU0A 2YDQA 1JNEA 2ZXQA 4OUEA 1ZBKA 4ZE5A 5F7UA 1BVZA 3AQUA 1B3VA 4H8HA 3BMWA 4W87A 4D6DA 1XCXA 2DH3A 1BAGA 4AD1A 2VX4A 1JIBA 2PWGA 1WE5A 2VX5A 1X6LA 1VFUA 1VF8A 1CXEA 4D1IA 4UFKA 1BFNA 1CWYA 4W5ZA 2IUZA 2PWDA 2YL8A 2XGBA 5I2UA 1NP0A 2QV4A 2OYKA 4MB4A 1UG6A 2VR5A 3L4XA 1EA9C 3LPPA 5I3DA 2FGLA 1TVPA 3O9NA 4P8WA 4IPNB 1VJSA 2VOTA 1VRXA 1QHZA 4PMUA 5C8BB 4PRWA 3BAKA 4P7NA 2XM2A 2VJXA 4FLRA 3N04A 3MMWA 4DWSB 1FFQA 4H8VA 3W4RA 1FA2A 1D3CA 3B8SA 3CUIA 3AMCA 1V3HA 1QI0A 4PBGA 3VTRA 3CMGA 5E70A 3L4UA 4AYSA 4AWEA 3BCDA 3B9DA 3MKKA 1H1NA 3SIMA 4D6EA 4Q22A 4ZXOA 3CBWA 3WD2A 4Z2HA 2ZE0A 3VIKA 1CIUA 4N42A 2XFYA 1OIFA 5IXEA 2XWEA 2X0YA 2Z1SA 5A94A 3AS0A 1V6YA 1DWFM 2CHNA 3VD5A 3WQ4A 3MU7A 1KCLA 2A3CA 1I75A 2UY5A 4TVUA 4GO8A 4NF7A 3W53A 7TAAA 3ZJKA 3AJ7A 5CLTA 3N15A 3AMKA 3O6AA 4PTWA 4XZWA 3IAPA 4M1RA 4BQ5A 2QMKA 5AC5A 2ZICA 7A3HA 1WB0A 3WD1A 1V0MA 4CU7A 1J11A 5DT5A 1VEPA 1C8XA 1UKPA 1BTCA 1GOWA 3AHYA 4D71A 1TCMA 4BCEA 3OLDA 2BHYA 4B3LA 1UWRA 4CU6A 3WDJA 4NRSA 1CEOA 3WNNA 1QBBA 2G41A 3WDIA 1KR1A 4AD3A 5A8NA 4HMDA 3CZ8A 2GFTA 4CCEA 1US3A 2J7CA 4JHZA 4MDOA 2J4GA 2JEQA 2EBNA 3WN6A 4RE3A 1WCGA 4HMEA 1H0IA 3POHA 1GJUA 1RPKA 3PZVA 5A69A 3VMPA 5CSYA 3U7BA 2XUCA 1TA3A 1CENA 2J7BA 2UY4A 1G0CA 3SUSA 3AXHA 2GUYA 2VTFA 3CZJA 1KBKA 1GCYA 4P7RA 1KXVA 2OWXA 1XSIA 1E55A 1JXJA 1ZJAA 3DYPA 2DGAA 4CD7A 5EFFA 2CKSA 3GXFA 5ABFB 4OBRA 2W63A 4WJXA 1Q6CA 2DT0A 3DHUA 2WCAA 1H4PA 3AHTA 1QI4A 1RP8A 4U5IA 2CBVA 4AZCA 4DM2A 4X9YA 5I79A 3VIIA 1QPKA 3EDKA 2E9MA 1B90A 3VDCA 1ODUA 1XV8A 3K46A 1MQPA 2E4TA 2J25A 1BHGA 2WCGA 4QDMA 4B15A 1CDGA 3MSDA 1EIBA 5LA0A 1CGUA 3OLGA 2DT1A 2GK1B 2WMJA 2G4FA 4MDPA 3ARVA 3SCUA 2D0FA 4QCEA 3II1A 2XVGA 3WD0A 1JZ8A 3W37A 3PZMA 1V3KA 3AXXA 2XHYA 2OSXA 2XVKA 5CXPA 2UWFA 3GXMA 3EDDA 2VCCA 2XIBA 1QW9A 3GDBA 1I1WA 2XPKA 3CHFA 1V02A 5CLWA 1CZ1A 4ZE4A 1K9FA 5EBAA 4MB1A 5A6AA 3WBEA 3W0KA 4B16A 1BG9A 4JKMA 1EO5A 1J01A 2ZX6A 3N1AA 4NRRA 3WMSA 3GYCA 2D24A 3K8MA 2NT1A 2WKLA 2XG9A 3AMGA 3IJ7A 1GNXA 2GJXA 3VMNA 5I5RA 1SYTA 1EHNA 3T0DA 1FHLA 1QNSA 8CGTA 2DIJA 2E0PA 2VRJA 2ZUNA 3OZOA 1J9YA 2XVNA 3I3DA 3EDEA 2J77A 1GOOA 3I3EA 1OT2A 1XC6A 2J74A 3BSHA 2OWWA 1V0KA 1E6QM 4GQRA 3PTMA 2V38A 2ZWZA 3OZPA 4LXFA 4C7DA 3IANA 1KGUA 4JFWA 2PWFA 1UD5A 4HMCA 4JAWA 5IDIA 1E6RA 2WCSA 1OB0A 5JBEA 4H2CA 5BRQA 2WM0A 3QOKA 2AOSA 2YA0A 3RJXA 3ZIZA 9CGTA 1AQ0A 1J0YA 4Q7NA 3GNRA 2YL9A 1HVQA 3AMLA 3RO8A 1B3WA 5HXMA 4A4AA 2IXUA 2Y8KA 4IPLA 3MMDA 3WL0A 3ARZA 1PX8A 2VZOA 3SEPA 3APGA 1NQ6A 3GNOA 5A95A 3SUVA 1TE1A 1NOWA 3VO0A 2E9BA 3BC9A 4D6CA 3W26A 4NSBA 2WZHA 4HPHA 4HOXA 1VFOA 4J3TA 3ARXA 2J8GA 5A6BD 1ODZA 3NDYA 2WC3A 2A3BA 3EMZA 1CGWA 1E0VA 4CVWA 1V6WA 1BYDA 1QHPA 1P6WA 3FAWA 1UYQA 4W8LA 5DEZA 3SCQA 3T2QA 3M46A 3WFLA 4HTYA 4N0RA 2WVVB 3N11A 1IV8A 2ZX7A 5ABHA 4XB3A 1MYRA 3CHDA 1KQZA 3A4XA 3M7SA 1JYWA 2RGLA 1R86A 3CZEA 2VCBA 3F4VA 4RL3A 2AAAA 4UQAA 2WNWA 1LG1A 4W88A 3RMEA 2WWDA 2JFEX 2D3NA 4PTMA 1GQLA 4AZIA 2X2YA 4RE4A 3L4VA 4AD2A 4GI6A 1UOKA 4YPJA 2DSUA 1FFRA 4WK9A 3DYMA 3WH8A 1LF1A 1G9HA 2X0HA 3AIBA 5GNYA 3ZT5A 3OLEA 5I23A 1ZU8A 1NM9A 3AROA 1OINA 2J47A 2O9PA 1ECEA 3KE0A 3WFZA 4H41A 5HOSA 4S3KA 4J3SA 1DWJM 3WENA 4DM1A 5FIPA 3WUFA 1LQ0A 1J0KA 1KQYA 1OD8A 1Q6GA 2WVTA 3I3BA 4S3JA 4MADA 1B0IA 4J28A 1HL9A 4ACZB 2GVYA 4MB3A 3AI0A 4NZCA 5D8WA 4LQ1A 2XIIA 4CVUA 1FHDA 2WMHA 1UD4A 3N12A 4V28A 1KGXA 5CPQA 2BY2A 2ZWYA 3CZGA 6A3HA 1CTNA 3D5HA 1HT6A 3AZRA 3F5KA 2FHBA 5E09A 1ESWA 2ZX8A 1K9DA 1PZ2A 2WC4A 5HPCA 1UH2A 2E3ZA 2DIEA 3M07A 1GHRA 1QOXA 3PTKA 3WQ6A 3NUKA 1TUXA 4GPNA 3VGDA 3M6DA 1E15A 2YL6A 3WL1A 1L0PA 1OD0A 3LPGA 4P7LA 5CJ5A 5AYBA 5BWFA 3VM5A 3L4ZA 5CZKA 3VILA 3SCPA 1HJXA 3BAYA 2W92A 3KL5A 3GBDA 1BYAA 3BAJA 3F5LA 2YOCA 5EMYA 1M7XA 3N13A 1DWAM 4PCSA 3VIFA 1J0ZA 2WMFA 4GZJA 4JFVA 1JD9A 1W32A 2GDUA 4E8DA 4U3CA 3VVGA 1XSKA 1UWTA 5A6JA 2WAGA 3U7VA 1PIFA 3NIYA 3A47A 1JDDA 1WZLA 3VKKA 1G1YA 3U57A 4U31A 5M5DA 2VCAA 1H3GA 2FHCA 3ECQA 5ABEA 1KCKA 2W91A 5DMYA 3F5JA 1U2YA 1DWHM 2G3MA 1KXHA 1CXHA 3L2MA 5I0DA 1TFVA 3OG2A 1V6XA 1WKYA 4J3VA 1SFSA 2O92A 3T0AA 3ZO9A 4AY1A 1ISZA 3E1F1 1UA3A 3UEQA 1UKSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3KWX A;  4OOU A;  5M3W A;  1V0N A;  1E6N A;  2G8Z A;  4JFT A;  1E1F A;  2BHZ A;  2V5D A;  1BYB A;  2VUY A;  3U5Y A;  2CNC A;  3UG5 A;  5KZ6 A;  1N82 A;  1C7T A;  2CIT A;  2FH6 A;  1E4I A;  4QP0 A;  4RE2 A;  4FLS A;  1JFH A;  1HF6 A;  3TA9 A;  5JUV A;  2WHL A;  2WWC A;  3TTQ A;  3BLK A;  2D0H A;  3S2C A;  3WF0 A;  5GNX A;  2Z1K A;  5CGT A;  2WSP A;  1W91 A;  1E6Z A;  5FD0 A;  1VBR A;  1F4A A;  4UFH A;  3OB8 A;  1KXQ A;  1ZB5 A;  3LMY A;  3VGG A;  4FMV A;  4MAV A;  2VZT A;  5LA1 A;  4EAM A;  2XM1 A;  5E9A A;  1B2Y A;  3BAX A;  4UOZ A;  3WNP A;  1HJW A;  2BV9 A;  4LYR A;  2RGM A;  3VD7 A;  2WVV A;  4XX6 A;  2E8Z A;  4BQ3 A;  4TTU A;  2CBJ A;  1KB3 A;  3PZ9 A;  2DSV A;  1YQ2 A;  2BXY A;  1NH6 A;  5I77 A;  3FHQ A;  3G6L A;  1PJ9 A;  1JF5 A;  4YN5 A;  1NWT A;  1PPI A;  4HU8 A;  3ARY A;  1UR4 A;  1VEM A;  2Y8V A;  2CIP A;  3NDZ A;  3NJ3 A;  3ZJ7 A;  3PHA A;  3AIW A;  1R8L A;  2J8F A;  3WEZ A;  3GTN A;  2WMK A;  1GQI A;  2VVS A;  1U30 A;  3WEO A;  2NT0 A;  2WBG A;  5GPR A;  2ZUS A;  3VGF A;  4J27 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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