1C92A

Endo-beta-n-acetylglucosaminidase h, e132a mutant
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
265
structure length
265
Chain Sequence
KQGPTSVAYVEVNNNSMLNVGKYTLADGGGNAFDVAVIFAANINYDTGTKTAYLHFNENVQRVLDNAVTQIRPLQQQGIKVLLSVLGNHQGAGFANFPSQQAASAFAKQLSDAVAKYGLDGVDFDDAYAEYGNNGTAQPNDSSFVHLVTALRANMPDKIISLYNIGPAASRLSYGGVDVSDKFDYAWNPYYGTWQVPGIALPKAQLSPAAVEIGRTSRSTVADLARRTVDEGYGVYLTYNLDGGDRTADVSAFTRELYGSEAVRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mutations of endo-beta-N-acetylglucosaminidase H active site residues Asp130 and Glu132: activities and conformations.
pubmed rcsb
molecule keywords ENDO-BETA-N-ACETYLGLUCOSAMINIDASE H
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces plicatus
total genus 89
structure length 265
sequence length 265
ec nomenclature ec 3.2.1.96: Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase.
pdb deposition date 1999-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1c92A00
3N13A 1V6VA 2DIEA 2NT1A 4S3JA 2J75A 1UKTA 2WXDM 1GUVA 1AQ0A 1QI4A 2EPKX 2WK2A 1W1TA 1UWUA 1EA9C 1BVZA 1U30A 1CIUA 5CZKA 3ARTA 3MUY1 1KCKA 3VIIA 1MW2A 3II1A 3U5UA 2WZEA 1JDAA 1OGBA 4UCFA 4PSRA 4XB3A 3ZSSA 1HIZA 4F9DA 1E3XA 1JI1A 2FHBA 2YOCA 1E6QM 5IFPA 2D20A 2WNWA 1QNPA 4MNMA 3AFBA 4ATDA 1W32A 3OZPA 1GVIA 1NH6A 2CETA 4QP0A 4W7UA 4FF5A 3POCA 4LXFA 2G3MA 3UEQA 5D8ZA 3CZJA 4AZCA 1JGIA 5IXEA 1LL6A 2O9TA 1E40A 3AIQA 4JKKA 3AYRA 4PMRA 4OZOA 3UETA 2OWXA 3WD0A 1UR4A 2DT3A 2D24A 5JIPA 4MJ2A 5D9NA 3PZQA 1KFWA 3N04A 2XVKA 3PZ9A 2ZE0A 1G5AA 3KWXA 1I75A 3L4TA 4U5IA 1GPFA 1V08A 3MS8A 4W88A 2YBUA 3UG5A 1UD5A 1UWSA 3SEPA 1MWOA 1VEOA 4UOZA 3CZKA 4PMQA 4X0VA 4QLKA 1MQQA 3OLDA 3NSNA 4AD4A 1E6NA 1FH8A 4AZ7A 1W2VA 1CXLA 3ALGA 1DWHM 3SCPA 3WUEA 3S6TA 1CGUA 3WNLA 2MANA 3WQ6A 2J47A 2BVTA 2E9MA 2ZUWA 3GNOA 4UFIA 2DSWA 3MV01 1PIGA 1RP9A 1DWGM 3CMGA 1B3YA 5A8NA 1TA3A 4KWUA 4N0RA 5CXPA 3LMYA 1XV8A 3OLGA 1EOMA 3TP4A 4TOQA 1FP9A 2V38A 4MPKA 5GQBA 1NP2A 3GH5A 3AYSA 3PZMA 1LF1A 4IPLA 2CERA 1GOWA 3FY1A 3MSGA 3L4ZA 5I23A 4TTUA 2D2OA 4CKQA 1M53A 5EFDA 2Y4SA 4JIEA 3RM8A 4Y7EA 4LYRA 3VNZA 3CGTA 2QMJA 2VR4A 2IXUA 5FKYA 1B0IA 1DEDA 1EOKA 3WD1A 1E70M 1JXJA 3VM5A 3FHQA 5DT7A 5JBFA 4AZCB 1UR1A 4Q22A 3WF4A 3WD3A 4CCEA 5A6JA 5ABFA 3AS2A 1U2YA 4XZBA 5C71A 2WANA 2YL6A 3WH8A 3THDA 3W27A 4CU6A 3THCA 1K9EA 3CUFA 3U57A 2G3IA 5FIPA 4W5ZA 3U7VA 1WZKA 3VGBA 5EBAA 3PTKA 1RPKA 4AZGA 1J18A 2PBOA 4NRRA 4PMOA 4Z2IA 1K9FA 3BSGA 4QCEA 5BCAA 4ZXOA 5JBDA 3IAPA 2WBGA 4QDMA 3GNRA 2EXOA 3W37A 2OSXA 2XIIA 3S2CA 5DO8A 2XM2A 2VZVA 2J7EA 3WF0A 4D6JA 1XD0A 1ZU8A 3CHDA 3L4XA 3ARVA 2E4TA 5JBEA 2J74A 2CYGA 1DWIM 4HOZA 4W8LA 4FK9A 3BAKA 3QGVA 1J0JA 2BY1A 1MW3A 1PZ3A 1VJZA 1ISWA 3EBVA 1TA3B 1XGZA 2JE8A 2ZXDA 5FCZA 5IHRA 2WB5A 5HPCA 4MAZA 3WQ8A 4UFLA 3NSMA 1W9VA 1H1NA 2ZX7A 3T2QA 3WMSA 3VIJA 5GPRA 1HVXA 3G6MA 5IHSA 1JDDA 2GJRA 3KEHA 1KXQA 3N11A 4UFKA 2VZSA 3T2OA 1C7TA 1CYGA 2EPLX 3QHOA 1GJWA 3TTOA 5CGTA 1BYDA 5I2UA 1UQYA 3F5LA 2WYSA 3VOCA 2X2YA 3VO0A 1BGAA 4D6EA 4UQCA 4P7RA 3OLIA 2ZUVA 1V3MA 6A3HA 4TVUA 1UH4A 3AXIA 5ABFB 1UG6A 3W81A 4MNKA 3AIEA 2PBGA 1G9HA 1VFFA 4L4PA 3VIOA 3F5JA 3GBEA 3PZOA 4IUGA 1EO5A 4IISA 4AZHA 1KXHA 2W62A 4CN6A 4JFWA 3M46A 3GH4A 3MU7A 3I3BA 3EYPA 4QFUA 1EDGA 3WL0A 3BAWA 1M04A 3WSUA 3WMBA 2XSAA 2BXYA 5A8OA 2FHFA 3ECQA 4UQAA 2OSWA 4EAMA 2JF6A 1QBAA 4MTVA 5AC4A 1V6XA 2BXZA 2VUYA 3VDHA 4Z2JA 2V3FA 3LPPA 3EDDA 4V27A 4XZWA 2X09A 1WPCA 4W7VA 1LWJA 3PBGA 1JD9A 1UA7A 2JEPA 1WE5A 2ZICA 1BFNA 2J7GA 3RM4A 1E6RA 4UQEA 3VM7A 1OD8A 5I24A 1E6SM 4YHGA 2VI0A 2DH3A 1UD8A 1E72M 2VRKA 2CKRA 1ISZA 4M29A 2J7CA 4DWSA 1JYVA 2Y8KA 3BMVA 1UHVA 4XV0A 2WC4A 2BY2A 3AZSA 5ABHA 4MAVA 4AZ5A 4MNLA 3W24A 1SR0A 4M8UA 1J0ZA 1JAEA 5E6YA 3GXDA 5E0CA 1CBGA 2WVVA 3RJXA 1H2JA 1D7FA 4DUXA 4Q7NA 4FLOA 3CH9A 4AMCA 3SUTA 1MQRA 3VVGA 1E43A 2NSXA 4P8UA 1WB0A 4UQBA 1NOUA 3FW6A 1C8YA 4J3TA 4GQQA 1OT2A 3DYMA 4ML4A 3ZJKA 1W9UA 2DSUA 3RMEA 3WDRA 1PPIA 2J7DA 1GQJA 3VILA 1OINA 4JHZA 1XC6A 1UKQA 2EPMX 3ARUA 5I6SA 3NDZA 2BV9A 1CGWA 1LQ0A 1AMYA 3B9EA 1XH0A 4KRTA 4TVDA 2ZX5A 3T2PA 2YIHA 4EK7A 1FH7A 3AQUA 3WELA 2WMJA 1B3WA 1QNQA 2VT0A 3ZT7A 4QLLA 1X6LA 5EFFA 1R87A 4AISA 5ABGA 4CU8A 3CZEA 5A6BD 1GNXA 1UZ4A 1BTCA 4CN4A 2AAAA 3GNPA 3WDJA 3ZSTA 1V0LA 2VCAA 1ZS2A 3A47A 2VTFA 1HJUA 1JL8A 4V2XA 4TX8A 2BHZA 3SUSA 1U33A 2W61A 3AXXA 4KRUA 3WF2A 4D6IA 1LLOA 4XX6A 3NUKA 2V3EA 2OYKA 3WH9A 4DWSB 2D23A 1EDQA 3UESA 1UD6A 1UR0A 4J27A 4PUEA 3O6AA 3VIGA 1QHOA 3ARSA 1MXGA 1H0IA 3WUGA 1ISVA 1JYWA 1TMQA 3WH6A 2VZTA 4J28A 2VC9A 4PEEA 5I78A 4NZCA 4WLCA 5HPOA 3PTMA 2WVVB 1E1EA 1CZ1A 3ARPA 3F4VA 3VGDA 5CPSA 3I3DA 4J3VA 3LPOA 2ZWZA 3N15A 2EBNA 3WQ4A 3K46A 1FOBA 3WDQA 2XVGA 3AHTA 1CEOA 2CITA 1EH9A 1JZ5A 2IUZA 1TE1A 1JIBA 1FFQA 2A3EA 3M6DA 4PRWA 3RM9A 4H8HA 1OB0A 1W9DM 3W38A 3PZIA 3OGVA 2ESCA 4CD4A 1JAKA 2WLYA 3IJ7A 2BHYA 2WAGA 4P8VA 2XFRA 3HU7A 1V3LA 2X0YA 2YA0A 4J3XA 5A2BA 3ARRA 1FH9A 1WZLA 3G6LA 2E8ZA 2XGIA 1GQLA 4FLQA 1WO2A 4OIFA 2GFTA 3K8MA 3GXMA 3ALFA 4MB4A 3WN6A 4MJ4A 1C90A 2CIPA 4JAWA 1HVQA 1P6WA 4U2ZA 5I5RA 2QMKA 5A94A 4M80A 4W85A 3VGEA 3WDHA 2E9BA 4DM2A 1TUXA 3IANA 1VIWA 2XYLA 2NW0A 9CGTA 4JZ5A 4CU7A 3MMDA 3ZOAA 3VNYA 4H8UA 2XVPA 4HTYA 2PWEA 3SCQA 2OYMA 4CUCA 1NM9A 2D3LA 4JL1A 5C70A 4UFHA 2G4FA 2D0FA 1FHLA 1KGXA 3BCFA 2PWDA 2GUYA 1C8QA 2WM0A 2GK1A 1VAHA 5BRPA 4P7LA 5BXRA 1QI3A 1CWYA 1GONA 4WKFA 2O9PA 1VF8A 5HNNA 4ATWA 1E4LA 3K8KA 4BQ5A 2PF0A 2XFFA 3WMCA 3AS3A 2WKGA 1R86A 3WL1A 5TD4A 4GI9A 1BYBA 3VX0A 1QW8A 1G0CA 1TG7A 4E4PA 4AIOA 1H0GA 3QHMA 2W5FA 3AHZA 4P7QA 4HMCA 1WCGA 4WKHA 5BYWA 3SUWA 4E2OA 1XCWA 3AJ7A 3UR8A 3T0BA 1W3JA 3A3HA 2VVNA 2C7FA 3CUJA 5GNXA 1JXKA 2QHAA 3W6MA 1YQ2A 2OSYA 1WDQA 3EMCA 1CLVA 1E56A 1ZB5A 2YLLA 2Y8VA 1WDSA 4W8BA 2Z1SA 5A2CA 2J7HA 1V6YA 1BPLB 3PZNA 4YHEA 1MYRA 1MQPA 1UOKA 2BNJA 4C7FA 4EANA 3MUAA 3QOMA 1GHSA 2YDRA 3T08A 1PEZA 4ZEPA 2DT1A 2Q8XA 1EQPA 3PZTA 2FHCA 2XVLA 3GXFA 2YJQA 4P8XA 2DSKA 3ZMRA 4D6GA 4MB3A 5I77A 4TXEA 2YA2A 1UWRA 3FXYA 5GNZA 5CLWA 2GK1B 3KE0A 4HA4A 4DWSC 4D71A 1JYNA 4D6FA 5CLTA 3FHAA 3B8SA 3CPUA 2WVUA 3KZSA 1WAWA 2WHMA 3W82A 1O7AA 3AHVA 3SCOA 1W3KA 2J78A 1MW1A 3VPLA 2W67A 1SFSA 3AI0A 4ZFMA 1V3IA 3U5YA 1QI5A 2ZWYA 1L0PA 4WKAA 4OJYA 4YN5A 1JFXA 1PX3A 1K9DA 2VX6A 4H41A 4WIWA 4F9JA 5I0DA 4MB5A 2ZX9A 1E6XM 4MDPA 4XUYA 2XFYA 5BXTA 5M3WA 5CPTA 5CSYA 2WMHA 3MV11 3WD4A 1D2KA 3L4VA 3VDCA 2JIWA 2QPUA 3VIPA 2CKSA 1C93A 1QPKA 3SCSA 1OD0A 4PCSA 4JFVA 3WQ5A 3ZM8A 4GZJA 5E70A 4GZIA 3WNKA 3ARZA 3ZT5A 3W0KA 2VX5A 3DHUA 1EDTA 3SCVA 3VD5A 1ITCA 3L4YA 1OGGA 3MMUA 1TVNA 5CGMA 1F4HA 1HJXA 5D9MA 3I3EA 1BF2A 1W2PA 2F61A 2WC3A 1J0HA 2GDUA 2HISA 1CGTA 7CGTA 1JDCA 1ODUA 1XH1A 1J0YA 1W91A 3NYDA 1B3XA 2DT2A 2J25A 2VQUA 4RL3A 2XGBA 4BCEA 1XHGA 4A3YA 4F79A 1W1PA 4U3AA 3CZLA 1UKSA 3L4WA 4AZIA 3PHAA 2ZXAA 4NF7A 3L4UA 5D9OA 5IDIA 2ZUTA 1SMDA 2EPNA 2E9LA 1J11A 1LL7A 5FD0A 1UYQA 2WVTA 2CNCA 2X0HA 3EMZA 4AIEA 1KB3A 4EKJA 2A3AA 1H09A 4OKDA 1GZJA 1OGSA 4W89A 3MKKA 4LYPA 2NT0A 2QLYA 3DECA 1HT6A 4GZEA 4H7VA 4HZ7A 1J0KA 3WH7A 5A69A 3N18A 4AZ6A 1Q6DA 1CXEA 3BAXA 3CZ8A 4PCTA 2VRJA 5LA2A 2XWEA 3O9NA 1CGVA 4W93A 5DT5A 4CD8A 2E3ZA 1XYFA 2IXVA 1H5VA 4AC1X 2GJPA 2J8FA 6TAAA 1ECEA 3MMWA 1VEPA 4A3HA 3UG4A 4JCLA 3AMLA 3WBAA 4CCDA 1JD7A 1B90A 4UTFA 4P8WA 3WQWA 1B2YA 1OT1A 2W91A 3AISA 3AIWA 4PN2A 2AMGA 1E6PA 4E8DA 1QI0A 3AHYA 1KQYA 2VL4A 4C7GA 4JHOA 1ZJAA 2WMIA 1IV8A 4WJXA 7TAAA 2BFGA 2W66A 1W9PA 1UR2A 1TFVA 2WSKA 3WEOA 4V28A 2ZX8A 1PJ9A 2J7BA 4GXPA 4CD6A 2VMFA 1TVPA 1OIFA 4GI8A 2WSPA 1EHAA 4PSPA 2X05A 3ZO9A 2WWCA 3WF3A 5BRQA 2YLAA 1LJYA 3W26A 1JFHA 2DPEA 3TTSA 3W53A 1ZJBA 2O92A 1PIFA 1E0WA 2WCGA 4PYSA 4Z2HA 4NRSA 5BROA 1R7AA 3K4DA 3OB8A 3BLKA 4ZXLA 4HPHA 1IZKA 1CTNA 3TA9A 5A6MA 4HMEA 1GCYA 4AWEA 4PTMA 2A3HA 1CGYA 3VD7A 4NSBA 8A3HA 2WLZA 5KZ6A 5JIWA 3SCTA 4TVCA 6CGTA 4W8AA 2D22A 3EDJA 4H04A 1E71M 3AIRA 1E5JA 4P7NA 1GHRA 1GOKA 4IPNB 1ZBWA 3ARWA 2WKLA 3VD9A 4DWSD 1XRVA 2UY3A 3J7HA 1J12A 3VMNA 3W28A 1CECA 4Z2GA 2WCSA 2ZXBA 2CPUA 1HN1A 1KR1A 1V02A 4M56A 1GORA 4D72A 4U2YA 2VCCA 2A3BA 1C8XA 3N17A 4HU8A 3LPGA 2CHNA 4LGXA 3VMPA 1JF5A 1HNYA 1TCMA 4OOZA 2WBKA 1KBBA 1KGUA 4OUEA 1OSEA 3BC9A 1JYXA 3AXHA 2WMIB 4IM4A 2WW5A 1TZ7A 2UY5A 3TTYA 1IZJA 4W7WA 1XYZA 2QPSA 2OWWA 4HMDA 5AC5A 2XJ7A 3M7SA 1ZBCA 1PX4A 3D5HA 3KL5A 4B15A 1AVAA 1XSIA 3IJ9A 5BWFA 2VURA 3CHCA 3FAXA 1R8LA 4OBSA 1D3CA 3GYCA 3A4WA 2FGLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3N13 A;  1V6V A;  2DIE A;  2NT1 A;  4S3J A;  2J75 A;  1UKT A;  2WXD M;  1GUV A;  1AQ0 A;  1QI4 A;  2EPK X;  2WK2 A;  1W1T A;  1UWU A;  1EA9 C;  1BVZ A;  1U30 A;  1CIU A;  5CZK A;  3ART A;  3MUY 1;  1KCK A;  3VII A;  1MW2 A;  3II1 A;  3U5U A;  2WZE A;  1JDA A;  1OGB A;  4UCF A;  4PSR A;  4XB3 A;  3ZSS A;  1HIZ A;  4F9D A;  1E3X A;  1JI1 A;  2FHB A;  2YOC A;  1E6Q M;  5IFP A;  2D20 A;  2WNW A;  1QNP A;  4MNM A;  3AFB A;  4ATD A;  1W32 A;  3OZP A;  1GVI A;  1NH6 A;  2CET A;  4QP0 A;  4W7U A;  4FF5 A;  3POC A;  4LXF A;  2G3M A;  3UEQ A;  5D8Z A;  3CZJ A;  4AZC A;  1JGI A;  5IXE A;  1LL6 A;  2O9T A;  1E40 A;  3AIQ A;  4JKK A;  3AYR A;  4PMR A;  4OZO A;  3UET A;  2OWX A;  3WD0 A;  1UR4 A;  2DT3 A;  2D24 A;  5JIP A;  4MJ2 A;  5D9N A;  3PZQ A;  1KFW A;  3N04 A;  2XVK A;  3PZ9 A;  2ZE0 A;  1G5A A;  3KWX A;  1I75 A;  3L4T A;  4U5I A;  1GPF A;  1V08 A;  3MS8 A;  4W88 A;  2YBU A;  3UG5 A;  1UD5 A;  1UWS A;  3SEP A;  1MWO A;  1VEO A;  4UOZ A;  3CZK A;  4PMQ A;  4X0V A;  4QLK A;  1MQQ A;  3OLD A;  3NSN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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