1CBGA

The crystal structure of a cyanogenic beta-glucosidase from white clover (trifolium repens l.), a family 1 glycosyl-hydrolase
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
490
structure length
490
Chain Sequence
FKPLPISFDDFSDLNRSCFAPGFVFGTASSAFQYEGAAFEDGKGPSIWDTFTHKYPEKIKDRTNGDVAIDEYHRYKEDIGIMKDMNLDAYRFSISWPRVLPKGKLSGGVNREGINYYNNLINEVLANGMQPYVTLFHWDVPQALEDEYRGFLGRNIVDDFRDYAELCFKEFGDRVKHWITLNEPWGVSMNAYAYGTFAPGRCSDWLKLNCTGGDSGREPYLAAHYQLLAHAAAARLYKTKYQASQNGIIGITLVSHWFEPASKEKADVDAAKRGLDFMLGWFMHPLTKGRYPESMRYLVRKRLPKFSTEESKELTGSFDFLGLNYYSSYYAAKAPRIPNARPAIQTDSLINATFEHNGKPLGPMAASSWLCIYPQGIRKLLLYVKNHYNNPVIYITENGRNEFNDPTLSLQESLLDTPRIDYYYRHLYYVLTAIGDGVNVKGYFAWSLFDNMEWDSGYTVRFGLVFVDFKNNLKRHPKLSAHWFKSFLKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
publication title The crystal structure of a cyanogenic beta-glucosidase from white clover, a family 1 glycosyl hydrolase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CYANOGENIC BETA-GLUCOSIDASE
total genus 184
structure length 490
sequence length 490
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 1995-07-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1cbgA00
3MS8A 2XYLA 3WUBA 2E3ZA 1KBBA 2W4XA 4FLSA 1VBRA 2WC4A 3O6AA 4UFMA 5JIPA 4P7LA 1J18A 2DSZA 2X09A 2NSXA 5CPQA 1W9VA 4U3CA 1JFXA 1G0CA 2ZUMA 1K6AA 3WUFA 1WPCA 2CHNA 3KL3A 5BRPA 3SCUA 1ESWA 2VTFA 3W28A 3MUIA 3SIMA 5A2BA 5BYWA 1KXQA 4PMZA 1JF6A 3ZMRA 1C93A 1QBAA 2G3NA 3VDAA 2AOSA 4MNJA 4LQ1A 2D0HA 5AY7A 3WBAA 4NSBA 1NQ6A 1R7OA 3MUAA 3VILA 1XD0A 2FHFA 1E55A 1JDCA 1E9LA 3KL0A 3GXDA 3ZSSA 3O2LA 2WC3A 2UWFA 2WZIA 4PRWA 4MADA 3KL5A 1GW1A 4UOQA 1PBGA 2GDUA 4UFHA 1UWQA 3BAXA 1SYTA 1E6XM 1FFRA 2BY0A 1EO5A 3WH8A 1XSJA 3VIFA 2VRJA 1DWFM 4PMQA 1E0WA 3WH6A 2GJXB 1SMDA 1H3GA 4PCTA 4M8UA 1J12A 4D1IA 4W86A 4W7VA 3WDPP 2PF0A 2CPUA 2JF7A 3QHNA 2D22A 3ARWA 3WD3A 5E6ZA 4QFUA 4OOZA 3VKKA 2VVSA 4E4PA 3QGVA 1MQQA 1CIUA 1LL7A 1H1NA 1BGAA 1HVQA 3EDDA 1BSIA 1ZB5A 1HNYA 1C91A 1UHVA 1CGYA 4OKDA 2OSYA 4ML4A 2VZTA 2YDQA 1BG4A 3LPOA 3KE0A 4HU8A 3WMSA 2G8ZA 4AD5A 3MKKA 2Y4SA 4U2ZA 1KGXA 1HL9A 1CGXA 4P8UA 2ZX5A 8CGTA 2G3JA 5GQBA 3WH7A 1E70M 2DPEA 4UQ9A 1C8QA 2UY5A 3WMCA 3S6TA 4D6DA 3SCVA 1HX0A 1E4MM 3VX1A 1FH7A 4MB4A 1FA2A 4EKJA 2ESCA 2Y5EA 1VEOA 2X0HA 1VAHA 1H5VA 5E0FA 1O6IA 3FHAA 2HISA 1V6YA 4CVUA 3IAPA 5A8MA 2WVSA 3T0BA 1V3MA 3CH9A 1KWKA 2DSKA 4J3TA 1M01A 1HXJA 3GBDA 2BY1A 5IHSA 2WW5A 4B15A 3WSUA 1BFNA 4W5ZA 2OWWA 4UR9A 3NJ3A 1Y7VA 2ZWYA 1KGUA 3ARSA 4W85A 1EGZA 4HMDA 3G6LA 4ATDA 1F4HA 5DO8A 4OOUA 3IJ7A 1JDAA 5FL0A 2GVYA 4GI9A 2WM0A 4YHEA 3N04A 4LXFA 2YBTA 1H09A 1GJUA 1TA3A 1NM9A 3FXYA 4CUCA 4PTVA 1BYBA 1Q4NX 2ZXAA 1ISYA 1BPLB 1WZMA 1DWJM 3LPFA 2J7BA 3FAWA 4ZE5A 4PMUA 4HP5A 5TD4A 4AD0A 4F9JA 4TTUA 1V3LA 1DTUA 1UKPA 2BVTA 1AQMA 3WD4A 2CNCA 5A8NA 1BYDA 4W88A 1VEPA 1UOKA 3RIKA 2XGBA 4BQ5A 4D6EA 1JIBA 4PTXA 1A3HA 1QI3A 4GQRA 2BHUA 3AIUA 3BH4A 4PTWA 4OIFA 4WSJA 2EPMX 3OLDA 2XGIA 1UQZA 1G94A 4JHZA 4CCDA 3L4XA 1UWUA 4GI6A 3N1AA 2WPGA 1UQYA 4Z2GA 2AAAA 2YDSA 4BQ3A 4ATWA 3BLPX 1QI5A 2DT1A 1JI1A 3HMCA 2EPLX 1NARA 1W32A 2DH3A 2W63A 4M24A 3BAKA 3UG4A 5ABEA 2XIBA 3RILA 2ZX6A 2V3EA 1WDPA 3W26A 3M7SA 4F66A 5I79A 2XIIA 3VGEA 4J3UA 2CCRA 2FGZA 1B3WA 1TZ7A 1WDRA 2D24A 3VINA 3BC9A 1JAEA 1B2YA 1E3ZA 4J3WA 5M3WA 2CKSA 1QI4A 4QCFA 5E0CA 3VGGA 4IM4A 4LYRA 3WNPA 1ITCA 4U33A 3AMCA 4MB1A 1E5JA 1VB9A 3DECA 1JF5A 3OG2A 3AIWA 5CPTA 3VNYA 1JD7A 2WHJA 2YL9A 1M03A 4JIEA 3BAJA 3VO0A 3EMCA 4V27A 2VR4A 1X6NA 2D0FA 2JEPA 3GH7A 5A8OA 2E9BA 3AMGA 4GZIA 2J25A 3UR8A 1CWYA 2E0PA 2EO7A 4D1JA 3EBVA 2CIPA 1CXLA 2E8YA 2QLYA 1JGIA 2WZHA 1MW0A 2OSXA 1KR1A 2J78A 1CZ1A 2E9MA 3T0AA 1C8XA 1E72M 3U7BA 4UQDA 1WAWA 1GOKA 5D8WA 1HL8A 3PZNA 1W91A 1XHGA 4C7GA 2QV4A 1EDGA 3CZJA 2DQXA 3FN9A 5GNYA 2VL4A 3AHZA 5HPCA 1JYVA 4TUFA 3WMBA 1ISWA 1QNPA 1WKYA 4LX4A 3RO8A 4A3HA 1TA3B 1VJSA 1J11A 2TAAA 4EK7A 1BQCA 3GZAA 3WFZA 4GO9A 1FP9A 3UR7A 8A3HA 2VOTA 4X0NA 3L2LA 2EPOA 4AYSA 2VZUA 1EOKA 1CXFA 2ZICA 2XSAA 1KGWA 1JZ6A 5M5DA 4U31A 4AZHA 4W87A 2D20A 3LPPA 2WAGA 2VQUA 4WJXA 4Q22A 3WENA 3L2MA 1H49A 2PWGA 2WMKA 3JUGA 3D3AA 4HZ6A 2BFGA 2JALA 4CVWA 1SMAA 1XD1A 4AZ6A 2VURA 1E56A 1GORA 5CPSA 1B3XA 3VMNA 3PTMA 1UG6A 3VDHA 4UFLA 4P7OA 3KEHA 2ZUVA 2V3GA 2VC9A 3ZR6A 2WVVA 1CDGA 1HP4A 1K9TA 5C71A 1GJWA 3A3HA 1V3KA 5HDRA 3FHQA 4ZXOA 1M53A 1TUXA 4GIAA 3QOKA 3ARTA 3W53A 1HKMA 1XYZA 3SCQA 1V3IA 5A94A 3VGDA 5CSUA 1KFWA 3OB8A 1JYWA 4HZ8A 3WNNA 1Q6GA 3GTNA 4X0VA 4PMDA 4CD7A 1DEDA 2VMFA 1QW9A 1MW2A 1W9XA 3WQWA 3PZOA 5CXPA 3VPLA 4NI3A 3KWXA 1PX3A 2JF6A 1JNDA 4UFKA 4J3VA 5GNXA 2X1IA 2O9TA 3ARXA 4Z2JA 3RM8A 3VNZA 2W5FA 4RE2A 1J0JA 2O9RA 4TXEA 5M17A 3L4UA 4AISA 4HMEA 2OWXA 3TA9A 1DP0A 2BNJA 2O9PA 3NYDA 3MV01 2EBNA 1D3CA 2QMKA 5BROA 4AY1A 4D6HA 4AC1X 5FD0A 1UKTA 5IXEA 3PBGA 2YL6A 3PZIA 1S46A 3WBEA 2XFYA 5DF0A 1A47A 1Z32X 3AYRA 4W84A 2X05A 2XFFA 2ZX9A 5I24A 1VF8A 1B30A 1W1TA 3EMZA 4M1RA 4UOJA 1GVIA 2JEQA 1UD5A 5HBFA 3ZIZA 3VIKA 1ISZA 4CU8A 4HA4A 1E40A 3WDQA 1CXEA 1GQKA 2C0HA 1OT1A 4GZJA 3AHXA 2V3DA 2BXZA 1R7AA 1MQPA 5FKYA 2CEQA 1CLXA 3WQ4A 5D4YA 5EFFA 2VZSA 4WLCA 3T2PA 1JZ3A 1OIFA 4H8HA 5IDIA 1E6ZA 2BVDA 1UD2A 4GINA 1B9ZA 1CBGA 4MNKA 3J7HA 3SUVA 3BAWA 1W9UA 1JZ8A 4ACYA 1UA3A 4P8XA 3MO4A 1RP8A 2VUYA 1H41A 2O92A 3ZJ8A 5FCZA 2BY2A 3WY1A 3VD4A 4IPNB 3F5LA 2YDRA 3VVGA 4PUDA 5A95A 1KXVA 4AW7A 4WF7A 5D9PA 3CTTA 1R86A 1JL8A 1UKOA 1XCXA 4UZSA 1WZAA 3AHVA 5DT5A 2J7GA 2WCGA 5CQ1A 2BY3A 1GNXA 1JXKA 3SCPA 4AIUA 2WVVB 3POCA 5A6BD 5E09A 2J7FA 4NRRA 3MMWA 2V38A 5JBFA 1X1NA 3A4WA 3PHAA 1LG1A 1V0MA 2ZE0A 4CGTA 4MPKA 2CBIA 4DWSD 4KH2A 4Y7EA 5E70A 4CU7A 5JBDA 2EEXA 3A4AA 1UWRA 5HPOA 4W93A 2WMFA 4AZBA 1AVAA 1E5NA 4CD5A 1H0IA 4PSPA 3SCOA 1G5AA 2CHOA 1KXTA 5A8PA 3WDIA 1EDTA 5JIWA 5AYIA 5E9AA 1AQ0A 4TTGA 1B3VA 3SUSA 4L4OA 2VX4A 2J7EA 4M29A 1HP5A 1MVYA 5A6AA 1HKKA 1EQPA 2FDMA 4XX6A 4PSRA 2WMHA 2Y8VA 4LGXA 2QMJA 5A6MA 1NOFA 5A69A 5LA0A 5CGMA 5BXSA 4LYQA 1BHGA 4TOQA 3AS2A 3GXIA 3VDCA 1G9HA 3WF2A 4GZEA 3E1F1 4W8LA 4HA1A 3UEQA 1CNVA 1ZU8A 4JFVA 1CXHA 1QVBA 7TAAA 3PN8A 3AXXA 3ARRA 1W1YA 2ZUSA 3FNDA 1E6PA 4AIEA 2OWCA 1E6RA 3NUKA 1E4IA 4AZIA 3L4WA 1DWIM 3B9AA 1QPKA 1HT6A 1XH0A 4MDPA 3N18A 3DHUA 1UZ1A 2WKGA 3BCFA 3PZQA 4DM1A 3AMKA 3K4DA 4QLLA 3WEMA 3CUGA 1EHAA 1UWTA 4KRUA 1QNSA 1PAMA 2YLLA 4H04A 4CKQA 2IUZA 4K68A 5A6JA 1C92A 3WQVA 5A6KA 5HNNA 4LYPA 1XYFA 1B3YA 3TTQA 1L8NA 3GM8A 3NDZA 3VDBA 3CHCA 4CCEA 7A3HA 2XVNA 1U33A 1V6XA 1HJSA 3IANA 4DWSA 2NT0A 1EH9A 2ZXBA 5I2UA 4J3XA 4JKMA 4A4AA 4KMQA 4TVDA 4MB5A 1V02A 2F2HA 3CBWA 1UH3A 5LA2A 2MANA 5A1AA 3ARVA 2GJRA 1JYNA 2J79A 4HOWA 3AIEA 1JG9A 1HIZA 1US2A 1NWSA 4Z2KA 3AIRA 2OYLA 2VT0A 4KGJA 3VIHA 1HKIA 1XRVA 1CXKA 1DWHM 1WDSA 4EAMA 1CYGA 5EB8A 2J47A 1CENA 1J0IA 4MDOA 1HVXA 3AROA 3WELA 3W37A 1OGBA 2D0GA 3OBAA 1GOOA 3W82A 4Z2HA 4MAVA 2OYKA 4PMXA 5CSYA 3ZT6A 2DEPA 4AZ5A 2XM1A 3AHYA 2WSKA 4D6JA 5AYBA 2VX7A 2EPNA 4KGLA 1ZJAA 4OZOA 4OJYA 1UR0A 4HA3A 3BAYA 1UR4A 4U2YA 3AS3A 3ZOAA 3GXMA 3ARPA 2CKRA 4R27A 2PWDA 3A47A 4J7RA 1DWGM 1UKQA 2WMJA 4PMOA 4PMVA 2OYMA 6TAAA 4DUXA 1QHOA 4ATLA 3ALFA 1BLIA 4ZENA 2QPSA 3AIVA 5BXPA 3MMUA 4CU6A 1JZ5A 1R87A 3EDFA 3D5HA 1CPUA 1V02E 5A6LA 3WDRA 2J75A 2VCBA 5CGTA 2XFRA 5HOSA 1E73M 4PCSA 4D6IA 5I3DA 1V0KA 3WFLA 4AWEA 3W29A 3TONA 1GOMA 1PX8A 5JUVA 1VENA 2FH8A 3GH5A 4IISA 2XPKA 2V5CA 1GPFA 1I75A 2YBUA 1GHRA 3N15A 1YQ2A 5ABHA 5DFAA 2VRQA 2ZX8A 1JFHA 4H8VA 3RM9A 1K9EA 3ZT7A 1ZJBA 4ZXLA 3M07A 3IAQA 1JXJA 3ZR5A 1E15A 3WQ8A 2CBVA 3VM7A 1GVYA 1HJVA 4YHGA 1JNEA 2PB1A 4W8AA 3GNRA 1NWUA 4BA0A 2J74A 3VX0A 3NSNA 4DWSB 1CECA 1UWSA 4TX6A 4M80A 5KEZA 1E4NA 3BMVA 3OZOA 4S3JA 3VTRA 1RH9A 3DHPA 5AC4A 3EYPA 1XH1A 3BAIA 2WZEA 3VIMA 2A3AA 4J28A 4JFTA 1ZBWA 2WANA 4A3YA 4DUWA 4S3KA 2G4FA 2PWEA 2YOCA 1CGUA 3RDKA 2GUYA 1B3ZA 3A6OA 1W9DM 3IJ9A 4AEFA 5BCAA 2J7DA 5CJ5A 2A3BA 3CIVA 1R85A 4HTYA 3VMPA 3WF1A 1X6LA 2GJPA 1OSEA 4OUEA 1PIFA 3WF4A 1FOBA 1V3JA 1ODUA 2D3LA 3AMDA 1GQJA 2WHMA 3RM4A 3ZM8A 2NT1A 2ZOXA 3WQ6A 4D6GA 5A8QA 2ZIDA 4QLKA 2RGLA 5CZKA 2G41A 2YA2A 1KBKA 3BGAA 1PIGA 4WK9A 2WVTA 3I3BA 2X0YA 4UQBA 5GNZA 1J01A 3II1A 1TE1A 1QBBA 2WHLA 1WCGA 5LYRA 2YLAA 3AS0A 2GSJA 2XSBA 2EQDA 4UFJA 4KWUA 5AC5A 1LL6A 4J3SA 3CLWA 4DWSC 4AEEA 1HKJA 5F7UA 2WHKA 2WMIA 2C7FA 2WLYA 2WLZA 1HN1A 1EDQA 3WF0A 4N0RA 1PZ2A 2CERA 3W6LA 3BSHA 1KQYA 3AXHA 2DSWA 2A3EA 4IPLA 3K8MA 4PBGA 2XJ7A 4HPHA 1VFUA 3MANA 4W89A 3WUGA 1JD9A 4BCEA 1VIWA 2A3CA 2DIJA 2XVPA 3NSXA 3RMEA 5DMYA 1JZ4A 1UD8A 2UY4A 2YJQA 4MNLA 2ZUTA 3I3DA 3T09A 1NH6A 3ZJ7A 3CZEA 1V0LA 4M81A 1XCWA 3ARUA 3OGRA 3K1DA 4QAWA 1MW3A 3SUUA 1C90A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3MS8 A;  2XYL A;  3WUB A;  2E3Z A;  1KBB A;  2W4X A;  4FLS A;  1VBR A;  2WC4 A;  3O6A A;  4UFM A;  5JIP A;  4P7L A;  1J18 A;  2DSZ A;  2X09 A;  2NSX A;  5CPQ A;  1W9V A;  4U3C A;  1JFX A;  1G0C A;  2ZUM A;  1K6A A;  3WUF A;  1WPC A;  2CHN A;  3KL3 A;  5BRP A;  3SCU A;  1ESW A;  2VTF A;  3W28 A;  3MUI A;  3SIM A;  5A2B A;  5BYW A;  1KXQ A;  4PMZ A;  1JF6 A;  3ZMR A;  1C93 A;  1QBA A;  2G3N A;  3VDA A;  2AOS A;  4MNJ A;  4LQ1 A;  2D0H A;  5AY7 A;  3WBA A;  4NSB A;  1NQ6 A;  1R7O A;  3MUA A;  3VIL A;  1XD0 A;  2FHF A;  1E55 A;  1JDC A;  1E9L A;  3KL0 A;  3GXD A;  3ZSS A;  3O2L A;  2WC3 A;  2UWF A;  2WZI A;  4PRW A;  4MAD A;  3KL5 A;  1GW1 A;  4UOQ A;  1PBG A;  2GDU A;  4UFH A;  1UWQ A;  3BAX A;  1SYT A;  1E6X M;  1FFR A;  2BY0 A;  1EO5 A;  3WH8 A;  1XSJ A;  3VIF A;  2VRJ A;  1DWF M;  4PMQ A;  1E0W A;  3WH6 A;  2GJX B;  1SMD A;  1H3G A;  4PCT A;  4M8U A;  1J12 A;  4D1I A;  4W86 A;  4W7V A;  3WDP P;  2PF0 A;  2CPU A;  2JF7 A;  3QHN A;  2D22 A;  3ARW A;  3WD3 A;  5E6Z A;  4QFU A;  4OOZ A;  3VKK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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