1CECA

A common protein fold and similar active site in two distinct families of beta-glycanases
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
339
structure length
331
Chain Sequence
VSFKAGINLGGWISQYQVFSKEHFDTFITEKDIETIAEAGFDHVRLPFDYPIIESDDNVGEYKEDGLSYIDRCLEWCKKYNLGLVLDMHHAPGSTLFEDPNQQKRFVDIWRFLAKRYINEREHIAFELLNEVVEPDSTRWNKLMLECIKAIREIDSTMWLYIGGNNYNSPDELKNLADIDDDYIVYNFHFYNPFFFTHQKAHWSESAMAYNRTVKYPGQYEGIEEFVKNNPKYSFMMELNNLKLNKELLRKDLKPAIEFREKKKCKLYCGEFGVIAIADLESRIKWHEDYISLLEEYDIGGAVWNYKKMDFEIYNEDRKPVSQELVNILAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A common protein fold and similar active site in two distinct families of beta-glycanases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE CELC
molecule tags Hydrolase (glycosyl)
source organism Clostridium thermocellum
total genus 127
structure length 331
sequence length 339
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 1995-06-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1cecA00
2OYLA 1XYZA 3CZGA 1C7SA 4MTVA 3CMJA 3DC0A 2YLAA 1C7TA 3WNNA 3D3AA 2QV4A 4P8WA 2ZXBA 3ZJ6A 5C70A 3ARVA 3VIMA 3OG2A 3SURA 3ZT6A 4JFVA 4K68A 1VAHA 5LA0A 4TX6A 1JZ5A 2DEPA 4CD6A 1UOKA 1SMAA 3KL3A 4M80A 4HPHA 1K9TA 3ALFA 4M81A 2WBKA 1YHTA 1NARA 1E1EA 1UH4A 1EO5A 2PWEA 4U3CA 1GONA 1W3JA 4MB3A 2EPOA 1L8NA 4UFIA 3CHEA 5E09A 5I23A 2ZICA 4OZOA 1BF2A 1KXQA 5D9MA 4U5IA 4BZYA 1EA9C 3WD3A 3VGHA 3SUVA 2RGLA 3WH6A 1DP0A 7A3HA 2D24A 5BXSA 4YHGA 1PPIA 3CUIA 4MNMA 4W5UA 4JFWA 3VGBA 2GSJA 2ESCA 2WKLA 1E1FA 4B15A 1YQ2A 1ODUA 5A8NA 1A3HA 2X0YA 3GH7A 4CN4A 1M04A 2VVSA 2XGIA 5EBAA 1BGGA 3WUFA 1GNXA 2Q8XA 3EDEA 2A3CA 1A47A 3MUIA 3QR3A 1QHPA 5D9NA 3W27A 1DWGM 4ZENA 5DEZA 1V6XA 3D5HA 2E9MA 1OWQA 1ITCA 2XYLA 3VO0A 2JF7A 1HP4A 1UQZA 3BAIA 4M1RA 4Z2LA 1QNOA 1C3FA 2CIPA 1V3HA 4R27A 3F4VA 1KGUA 4BQ5A 3N17A 1CLXA 3VX0A 5A94A 1QI4A 3WH7A 2VX7A 2XVGA 4AY1A 3JUGA 1CDGA 3NSNA 3WDHA 3EMQA 1E55A 1TE1A 5A69A 5ABFB 4HA3A 1HJWA 3FXYA 3II1A 1DWJM 3NUKA 5F7UA 3VGFA 5BWFA 4N0RA 3WEZA 2PWHA 2WC4A 1H2JA 4GZEA 3ZIZA 3AIRA 3WD2A 3SCSA 2J62A 4MDPA 1HJUA 5HPOA 1JZ3A 4N42A 1JYXA 1PX3A 3IJ8A 2VVNA 1HJQA 1V02E 2CBVA 2X05A 1QW9A 2NSXA 2VQUA 4HTYA 4D71A 2DGAA 1HP5A 3BAJA 1JDDA 1E5NA 2WMIB 2DH3A 1OSEA 4HOZA 2YDSA 3PZVA 1EIBA 4W84A 3PN8A 1VEMA 2PBGA 3S6TA 1B3YA 4HP5A 1TG7A 2E0PA 4DUWA 4W8AA 1FHDA 3AXIA 3I3BA 1KB3A 1HKIA 4AW7A 1J9YA 1GVYA 3VD9A 1NWSA 2X09A 2WM0A 1PJ9A 2F61A 3WBAA 4GZJA 1C91A 3SUWA 3WMSA 2AOSA 1M01A 3WNPA 5CGMA 1QI0A 4W93A 2XVNA 3WKZA 1CGUA 3OGSA 3VNZA 3WL1A 2BY0A 5ABFA 5AC5A 4CN6A 2ZWYA 1BVNP 8CGTA 3W38A 3MSDA 3AXXA 3BMVA 1K9EA 2VL4A 1UA7A 3CHDA 4AZCB 4Z2HA 2FH8A 1MQQA 4DUVA 3APGA 2GUYA 4UOQA 5A1AA 1CYGA 3WNKA 3A6OA 4MNLA 1W9BM 1AQ0A 3TOPA 3BAWA 2WANA 3VOCA 2JALA 4AC1X 1IZKA 2WSKA 4AWEA 4DWSD 4CVWA 5D8ZA 2ZUMA 1BG4A 4NZCA 3CH9A 1KR1A 3WNLA 1UD8A 3AROA 4OOUA 2VZSA 1JDCA 2DIJA 4UTFA 4MDOA 5FL0A 2EBNA 1H0IA 1R8LA 1HJSA 3RM9A 5C8BB 2VOTA 3WD0A 3GXMA 4NI3A 1EHNA 1XHGA 1DEDA 4J28A 5I0DA 4R5EA 2ZXQA 3T0AA 4ACZB 1B2YA 3O2LA 3ECQA 4UFKA 1I1WA 4IISA 2WVSA 1PX4A 3BAKA 5I2UA 2G8ZA 4GO9A 3CGTA 5JUVA 1UWTA 1OD8A 5E0FA 3UG3A 1JF6A 2FDMA 3AICA 3AMLA 4CUCA 3BLPX 1JNDA 5CSUA 4YHEA 2VX6A 1D7FA 1QI5A 4AZBA 5KZ6A 1W9XA 4WK9A 3WQWA 5JBEA 1GW1A 1TCMA 4ZE5A 1W1TA 4KRTA 3ZM8A 2E9LA 2W67A 2XVKA 3L4YA 4MB1A 1HJVA 2ZX7A 2YBTA 4D6EA 1FH7A 4FLRA 2JF6A 4M82A 2XHYA 3GXDA 2XJ7A 2UY4A 1ISWA 5JBFA 3F5LA 4PRWA 4V27A 1SFSA 2CBIA 3NSXA 2W66A 3OZPA 3WH5A 2BHYA 2BY1A 3FN9A 3VINA 5A6BA 4DUXA 1J0JA 1V3LA 4F8XA 3N9KA 4AD3A 4J3TA 5FKYA 3BLKA 3GTNA 1QNRA 1NWTA 2J7DA 2J7HA 3L4TA 3AYSA 1W9DM 3E1F1 3UR7A 4F66A 1VJSA 2W61A 2D1ZA 4JCLA 4PTMA 1PAMA 4OBRA 4BQ4A 5A6AA 3W6LA 2PWGA 2FGZA 4JFTA 1QNPA 4HZ8A 5DT7A 3HJEA 3AYRA 1W91A 4RE4A 1C8QA 1D3CA 4AISA 1J0HA 4PCSA 1X1NA 2Y5EA 9CGTA 5FCZA 7TAAA 4ZXOA 1OGBA 2VNCA 3U5YA 1TR1A 3THDA 2O9OA 2WYSA 3VUPA 1XH1A 5BXTA 1KBKA 2BFGA 2WMGA 1OCQA 5A8PA 2DSKA 1QPKA 1LL6A 1TA3B 1H11A 3CMGA 2V3DA 3OBAA 3MANA 3SCQA 4LXFA 3GYCA 2OWXA 2XWEA 3K8MA 5ECUA 3ZJ7A 1WDQA 2XTKA 1RPKA 1CLVA 3GH5A 4D6DA 3CHCA 5CG0A 2IXVA 4M24A 1OIMA 2W91A 2GFTA 3W53A 3UERA 3EBVA 2DSWA 2EO7A 1HNYA 6A3HA 3VMPA 1H3GA 1ZL1A 1L0PA 3M46A 1JI2A 4PMQA 2CERA 1N82A 1H49A 1WB0A 4UQDA 1UH3A 2WCGA 3SCOA 1V03A 4TXEA 2EPNA 2QLYA 4AZGA 3BGAA 5CZKA 4ZXLA 2J78A 5A8QA 1CGWA 2YLLA 1EHAA 2BY3A 1US3A 2J47A 1ZBWA 4XB3A 4D6IA 3FY1A 5D4YA 2W5FA 2VX4A 3VIOA 3MUZ1 4U3AA 4J3SA 3T0DA 3ARSA 1V0KA 1I1XA 1DWHM 3AHZA 1KXTA 5IDIA 3VIKA 2CNCA 1O7AA 3EMZA 1R85A 1EH9A 1I75A 4CGTA 2VURA 2CYGA 5KEZA 3WQ8A 4J7RA 2A3BA 3VKKA 2XSAA 3F5KA 3KL0A 1B30A 8A3HA 1UZ1A 4C7FA 2X1IA 3WH9A 4PMNA 4PUEA 3PZ9A 3TA9A 3PZGA 5M3WA 2ZWZA 2DT1A 3UETA 4GKLA 1CGYA 5BROA 1FOBA 4GQRA 3WF4A 3WNMA 1LWHA 1XH2A 1XCWA 3LPOA 3F5JA 1GHRA 3EDKA 4D6FA 3ZSSA 1E4MM 2OSYA 2YDQA 2ZX6A 4P8UA 1XV8A 3L4ZA 2XGBA 4UQEA 4U2YA 3WL0A 5D9PA 1SMDA 3WDRA 3TTQA 1UH2A 3WF0A 1W3LA 3W81A 5A6MA 1CBGA 2HISA 2WMFA 3WFLA 4FLQA 4HZ7A 2VRJA 3A4XA 1M03A 3UESA 1D2KA 2FGLA 3RM8A 1W2VA 4HMEA 4CN1A 2PI6A 5E9AA 2ZUSA 3OA5A 4F9JA 1WDSA 2GK1B 2ZOXA 4GZIA 2X8RA 3OLGA 3ZO9A 3UR8A 1XSJA 3ZR6A 3MV01 1VF8A 1E6NA 3CO4A 5I24A 4RE3A 1NOWA 1OBAA 1PX8A 4V28A 1V02A 1KQZA 3CPUA 3U7VA 1Q6EA 3VIHA 4ATLA 3SIMA 2WXDM 2VR4A 2UY3A 2E8ZA 4HA1A 5I5RA 4S3JA 1UD4A 2ZX9A 4C7DA 2CKSA 1HL9A 3ARZA 2BXZA 2HVMA 4CU7A 3DYMA 2Y8KA 2Z1KA 4JFUA 5A2BA 2BHZA 1G0CA 2WLZA 3PZUA 4H8UA 1GJWA 2BVTA 4EAMA 2ZUWA 3ARPA 2PF0A 2VMFA 2V3FA 1JD9A 1HXJA 1UUQA 1HT6A 1FFRA 1NP2A 1NP0A 4AXNA 1E3XA 4XX6A 1OIFA 4PTXA 1CPUA 2WMKA 5I3DA 3OLIA 1S46A 3NJ3A 4AD4A 2CPUA 3AHXA 5BRPA 4IPNB 1Q6DA 1GQLA 3L4VA 1KR0A 1ESWA 2C7FA 1PIGA 5AY7A 3HN3A 2G3MA 1WCGA 1AQMA 2O9PA 5GNYA 3W6MA 4P8VA 3CHFA 4IM4A 4P8XA 4AD1A 2GJXB 5JIPA 1F4HA 4UFHA 1RD6A 3AXHA 1ISYA 1KQYA 3N18A 1V3JA 2OLHA 4AIOA 1J12A 3FHQA 3NSMA 3WFZA 5HXMA 5CLTA 3EMCA 1IZJA 3LPGA 4Q22A 2YL8A 2BNJA 3L4XA 3WMCA 4FF5A 1ITXA 5CQ1A 1FH9A 1ZBCA 3SCVA 3KL5A 2V3EA 4QLKA 1IT0A 3K1DA 3EDDA 2WC3A 1UHVA 3OB8A 3B8SA 4P7RA 1GOIA 3VDBA 1LJYA 1VRXA 2VR5A 4GQQA 3ARRA 1B31A 1E6ZA 4PMVA 3DYPA 4X0VA 5IXEA 4PN2A 1E72M 5A2CA 2J8GA 2D0HA 4C7GA 2EJ1A 1E56A 3L2MA 3VMNA 3T0BA 3AZTA 3RPMA 1E5JA 2AMGA 2XSBA 3QOMA 3VD3A 3GXIA 3IK2A 2GJRA 3FAWA 4V2XA 4HPGA 5I77A 3ARWA 1UR1A 2E3ZA 4CD5A 5A6BD 1JXJA 1VB9A 4HOXA 1WE5A 4CCDA 4BS0A 1BGAA 4W88A 3T2OA 4XUYA 2WCSA 1EGZA 1W9PA 1EXPA 3ZR5A 5BCAA 2J75A 3IAQA 3TP4A 1W1VA 4J3XA 5A6KA 1JFXA 4A4AA 3WBEA 4MADA 2GDUA 4UZUA 3WF2A 3VX1A 3VM7A 1C8YA 5A6LA 2W4XA 5GQBA 4JIEA 3VIFA 3VU2A 3MMWA 1Y7VA 1WZMA 1UWUA 4KGLA 3WIJA 2DQXA 3WEMA 4XZWA 1J11A 2O9TA 3AMKA 1ZBVA 3AHYA 3GBDA 4UNIA 3GDBA 3L4UA 1E6XM 2YDRA 1UWIA 4MNKA 4JKKA 4F79A 1HKKA 6TAAA 1E4LA 1H09A 3VNYA 3RCNA 5JIWA 3OIHA 2OYKA 1RP8A 3EYPA 4PMYA 4A3HA 2WHKA 2XIBA 4LYPA 1G94A 1JI1A 3PZQA 5C71A 5ABGA 1W2PA 3FAXA 2D20A 5BXRA 2PWDA 3PTMA 3S2CA 2WVTA 1UKPA 4EKJA 1Q6FA 4WSJA 4W7WA 3ZJ8A 1E3ZA 1UR2A 1B3ZA 3KE0A 4AD0A 1OGSA 2DT2A 1CEOA 1HX0A 3GNOA 4U2ZA 3CIVA 2WMIA 4JAWA 1J18A 3BCDA 1UYQA 4JFSA 4BCEA 2G4FA 1B3WA 4J3WA 4J3UA 3DHPA 3VD4A 1XH0A 2Z1SA 2FH6A 4AIEA 3VGGA 1WDRA 1E0VA 3N11A 4FMVA 5A8OA 2XM1A 2YKKA 1Q4NX 2C8NA 3LMYA 3PTKA 3GBEA 4P7LA 3LPFA 1VFMA 3WQ4A 1W9UA 1MVYA 1GZJA 1E0XA 5CXPA 4W8LA 1XCXA 2ZXAA 3MV11 5CLWA 2J7GA 4NRSA 1U33A 1OINA 1GORA 1LL7A 2WSPA 3FW6A 4AZ5A 2OWCA 1JIBA 1BHGA 1VFFA 2E40A 3MUAA 3WNOA 3LPPA 4AZCA 2DH2A 2WHJA 4UOJA 3PBGA 1QNQA 5IFPA 1P6WA 2PC8A 1X6NA 2D23A 3KWXA 2DSVA 5BYWA 4WF7A 1SR0A 3CLWA 4U33A 2UY2A 5JBDA 1CGTA 1JYNA 2DIEA 5I79A 2JEQA 4QFUA 2ZXDA 3AMDA 4PTWA 1JZ7A 2WC7A 3MMUA 4P7OA 2G3JA 3M07A 3FHAA 4BQ3A 4UQCA 2FHFA 2VRQA 4LQ1A 3SCWA 1F4AA 1B3XA 1BG9A 3MU7A 3VIGA 1BTCA 2YL6A 3BMWA 4ML4A 2DPEA 4E8CA 2DT3A 5BRQA 3CTTA 1WNOA 1UWSA 2VRKA 4PSPA 1US2A 1KWKA 4W5ZA 3MSGA 1J0YA 4Z2IA 3CUHA 3BH4A 4NSBA 3SEPA 3VPLA 3ZJKA 5D9OA 2WWCA 3BAXA 3RMEA 3OGVA 3PZNA 1OT2A 5DFAA 3N15A 4DWSB 3VDCA 4ACZA 5FIPA 3SCNA 3CBWA 3A3HA 1MFUA 1MW0A 3SCPA 7CGTA 1LG1A 2J7CA 1PZ3A 4GI8A 4QP0A 4WKFA 4CKQA 3M7SA 5DT5A 3WENA 5TD4A 1JD7A 3AOFA 1R7OA 1KXVA 4TVCA 2IXUA 5AYBA 5DMYA 1XSIA 1UWQA 4PTVA 4H2CA 2CESA 1JZ8A 1FA2A 1ZBKA 2WVUA 3WMBA 3WUEA 3VVGA 1MFVA 3VM5A 1QHOA 2YA0A 4WSKA 2G3IA 2VZOA 1R86A 2E8YA 4JCMA 4MB5A 4H8HA 2BXYA 2ZX8A 3ZQ9A 4AYSA 1OD0A 4JL2A 2VQTA 4XZBA 1UD2A 3T2PA 4PMXA 2OSXA 1KGXA 3AIQA 1B0IA 5LYRA 2Y8VA 2OWWA 4KGJA 5A3HA 1MW2A 2V5DA 2J4GA 1WZLA 3NDYA 1GOMA 1WDPA 2WHMA 3W24A 1E40A 2VUYA 3G6LA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2OYL A;  1XYZ A;  3CZG A;  1C7S A;  4MTV A;  3CMJ A;  3DC0 A;  2YLA A;  1C7T A;  3WNN A;  3D3A A;  2QV4 A;  4P8W A;  2ZXB A;  3ZJ6 A;  5C70 A;  3ARV A;  3VIM A;  3OG2 A;  3SUR A;  3ZT6 A;  4JFV A;  4K68 A;  1VAH A;  5LA0 A;  4TX6 A;  1JZ5 A;  2DEP A;  4CD6 A;  1UOK A;  1SMA A;  3KL3 A;  4M80 A;  4HPH A;  1K9T A;  3ALF A;  4M81 A;  2WBK A;  1YHT A;  1NAR A;  1E1E A;  1UH4 A;  1EO5 A;  2PWE A;  4U3C A;  1GON A;  1W3J A;  4MB3 A;  2EPO A;  1L8N A;  4UFI A;  3CHE A;  5E09 A;  5I23 A;  2ZIC A;  4OZO A;  1BF2 A;  1KXQ A;  5D9M A;  4U5I A;  4BZY A;  1EA9 C;  3WD3 A;  3VGH A;  3SUV A;  2RGL A;  3WH6 A;  1DP0 A;  7A3H A;  2D24 A;  5BXS A;  4YHG A;  1PPI A;  3CUI A;  4MNM A;  4W5U A;  4JFW A;  3VGB A;  2GSJ A;  2ESC A;  2WKL A;  1E1F A;  4B15 A;  1YQ2 A;  1ODU A;  5A8N A;  1A3H A;  2X0Y A;  3GH7 A;  4CN4 A;  1M04 A;  2VVS A;  2XGI A;  5EBA A;  1BGG A;  3WUF A;  1GNX A;  2Q8X A;  3EDE A;  2A3C A;  1A47 A;  3MUI A;  3QR3 A;  1QHP A;  5D9N A;  3W27 A;  1DWG M;  4ZEN A;  5DEZ A;  1V6X A;  3D5H A;  2E9M A;  1OWQ A;  1ITC A;  2XYL A;  3VO0 A;  2JF7 A;  1HP4 A;  1UQZ A;  3BAI A;  4M1R A;  4Z2L A;  1QNO A;  1C3F A;  2CIP A;  1V3H A;  4R27 A;  3F4V A;  1KGU A;  4BQ5 A;  3N17 A;  1CLX A;  3VX0 A;  5A94 A;  1QI4 A;  3WH7 A;  2VX7 A;  2XVG A;  4AY1 A;  3JUG A;  1CDG A;  3NSN A;  3WDH A;  3EMQ A;  1E55 A;  1TE1 A;  5A69 A;  5ABF B;  4HA3 A;  1HJW A;  3FXY A;  3II1 A;  1DWJ M;  3NUK A;  5F7U A;  3VGF A;  5BWF A;  4N0R A;  3WEZ A;  2PWH A;  2WC4 A;  1H2J A;  4GZE A;  3ZIZ A;  3AIR A;  3WD2 A;  3SCS A;  2J62 A;  4MDP A;  1HJU A;  5HPO A;  1JZ3 A;  4N42 A;  1JYX A;  1PX3 A;  3IJ8 A;  2VVN A;  1HJQ A;  1V02 E;  2CBV A;  2X05 A;  1QW9 A;  2NSX A;  2VQU A;  4HTY A;  4D71 A;  2DGA A;  1HP5 A;  3BAJ A;  1JDD A;  1E5N A;  2WMI B;  2DH3 A;  1OSE A;  4HOZ A;  2YDS A;  3PZV A;  1EIB A;  4W84 A;  3PN8 A;  1VEM A;  2PBG A;  3S6T A;  1B3Y A;  4HP5 A;  1TG7 A;  2E0P A;  4DUW A;  4W8A A;  1FHD A;  3AXI A;  3I3B A;  1KB3 A;  1HKI A;  4AW7 A;  1J9Y A;  1GVY A;  3VD9 A;  1NWS A;  2X09 A;  2WM0 A;  1PJ9 A;  2F61 A;  3WBA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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