1CI1A

Crystal structure of triosephosphate isomerase from trypanosoma cruzi in hexane
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
KPQPIAAANWKCNGSESLLVPLIETLNAATFDHDVQCVVAPTFLHIPMTKARLTNPKFQIAAQNAITRSGAFTGEVSLQILKDYGISWVVLGHSERRLYYGETNEIVAEKVAQACAAGFHVIVCVGETNEEREAGRTAAVVLTQLAAVAQKLSKEAWSRVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEVHELLRRWVRSKLGTDIAAQLRILYGGSVTAKNARTLYQMRDINGFLVGGASLKPEFVEIIEATK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of triosephosphate isomerase from Trypanosoma cruzi in hexane.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE)
molecule tags Triosephosphate isomerase
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 88
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 1999-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1ci1A00
5LHFA 5K7JA 2ZZ3A 3LBMA 3W6YA 2FQIA 3QH2A 1KFLA 3A5VA 3UD6A 1LBFA 1HL2A 1H7PA 3VKJA 4JX4A 1K8XA 2A6NA 4JIQA 3S5ZA 3N9SA 1KFKA 2X2GA 3F1QA 1VQTA 4POCA 2YW3A 3WFAA 3LHYA 3N2MA 3W71A 4OHQA 4W9TA 5F2MA 4MLJA 3Q58A 4HN4A 5KTLA 2V2CA 3W1PA 2E77A 1JCMP 2B7OA 3W7JA 5LNUA 4FHAA 3QYQA 2VFDA 4HT3A 4PH6A 5K2ZA 1HFBA 1VYRA 1VS1A 3B0VC 1H7XA 3DH7A 5AHNA 1QFEA 3W83A 1QPOA 2Y88A 3S6DA 3CU2A 3QM3A 4XWUA 5K9XA 2YSWA 2RDUA 4MUZA 4NUWA 1H60A 4Z1DA 3KXQA 3C2VA 4EVZA 3RNDA 4AF0B 2G5WA 4IXXA 5AB3A 1TPB1 4UFHA 1SZEA 3EWWA 5H91A 3TXZA 4G1KA 3EX3A 3W2MA 5HJLA 3HG4A 2ATSA 3NQFA 3M16A 3FA5A 3GB6A 3FFSA 3IVSA 1Z41A 4O10A 3ANYA 3W1QA 5CPMA 2FLIA 3QW3A 1EWDA 4MFDA 5L6UA 2VKZG 4R33A 2WNNA 3NAVA 2FDSA 1KM4A 1IXPA 3TFCA 1DL3A 4Z0SA 3Q94A 2NLIA 1H1YA 2X1RA 3G8EA 3BG5A 3LBCA 3P67A 1DHPA 3DFQA 3CEPA 3W22A 4I9AA 4QNWA 1W5NA 3M43A 4UIOA 3KVJA 3E96A 3S1VA 3HGOA 2Y85A 4KFPA 4HNUA 1T99A 4GRSA 1Q6LA 1GOXA 2FPVA 1BEUA 2R8WA 4RLIA 3S5OA 3WK0A 1L6YA 3S1XA 2YR1A 3W7OA 2WKJA 3NPVA 3U6WA 5DCDA 1QPQA 3PSVA 2QCFA 1VZWA 3RU6A 2ZZ5A 3OG3A 2FTPA 3TU9A 3IGSA 3N34A 3DZ1A 4JTEA 3DHDA 1W5OA 3W7CA 2X30A 3W7NA 4AH7A 3PG9A 5F2GA 1QOPA 4JY9A 1H61A 4UMCA 2V30A 1OVDA 1PS9A 4PTNA 1L2UA 3HO8A 4WOZA 3NQVA 4P2VA 5EY5A 2I9EA 4O1CA 3C4UA 3PSWA 4YLWA 2E68A 3LTSA 4A2SA 3P7YA 1T8XA 4IUOA 2C16A 2ALDA 3L5LA 2ZRUA 3E12A 5EA9A 3RMJA 1WOBA 2YCEA 3GDMA 3TW7A 1X7FA 3SJ3A 1VCVA 2J24A 4K8HA 5LNVA 1EEPA 1TTQA 4JEQA 3G1HA 1SW7A 2O7QA 4ZQMA 3SFKA 4IPJA 4FNRA 1D3HA 4UTWA 4OQVA 1VLIA 5D2TA 1SSGA 5G5IA 3GK0A 3NM3A 3LCWA 5G2HA 3AJXA 2TPSA 3PB2A 4KKXA 1FXQA 3GXTA 4FNTA 5AHMA 4AMAA 4LOCA 5FF4A 3TJLA 4GXMA 1GG1A 3DBPA 4NX5A 3RFAA 4NNAA 3QSRA 4NU7A 2BLEA 2QKFA 3HQ1A 2W0UA 3F4WA 4DF1A 4RJEA 3NL2A 4ZVJA 3GXNA 2YFNA 3W7GA 4MLRA 3BLFA 3W72A 2QJGA 3UQNA 1SQ7A 4Z0JA 5CGQA 3W70A 4Y6GA 1YTDA 4GUIA 3EKZA 2XN0A 2FPYA 5FF7A 4JYFA 4MJZA 4CCEA 4DXVA 1DVJA 3DI0A 1VYSX 5U4NA 1W5MA 2ZRVA 2NWRA 3ATYA 4DELA 1GVRA 3W7DA 1SUXA 1TSIA 4JN6A 4NJGA 4O4VA 3UNDA 1O95A 1MEWA 3O6DA 4JYEA 3LI1A 3DGRA 3NL6A 2NX3A 3PUEA 2GVLA 3O1NA 3V1PA 4FF7A 3PWAA 3NM1A 3B04A 5D2YA 3BK0A 1W3NA 1AL7A 2XN2A 2GPTA 2X1TA 4YMZA 4UFIA 1OYAA 1SU5A 2HTMA 2P0OA 5LNSA 1AL8A 4K36A 4XBSA 4OV9A 2ZRWA 4YL2A 1SZNA 3BW4A 4AEOA 1BWKA 1GJPA 4HNTA 1GG0A 4M7TA 5D33A 3TR2A 3W2JA 1J5TA 2OZ0A 2BXVA 2CLLA 2DZXA 3MHGA 3W7RA 2CLMA 5K9CA 2HS8A 1W3TA 1ZAHA 3FJLA 3PUDA 4QITA 1X1ZA 5HQEA 3R5EA 2JKAA 1SO6A 1HTIA 4IWWA 4WZHA 4XQ6A 1ALDA 3GXPA 1THFD 4JNMA 3TFXA 3A23A 2PRLA 5BMXA 4CLMA 5K4XA 5D37A 5BMWA 1OFAA 1TMHA 3LTPA 1TJRA 3EX2A 1FUYA 3LHVA 2A85A 4O53A 1LORA 1G67A 2ZCGA 2WSYA 5CPLA 1OJXA 3LB0A 3WJXA 4BF9A 1KTCA 2P10A 2DZPA 3O05A 2E6AA 1LOLA 5AC6A 3KAOA 4QM1A 1EP1A 3GKAA 3DAQA 4LVGA 5LNRA 1KFJA 1ML1A 1JR1A 4LS1A 3W3OA 2C14A 2ZRZA 3C2FA 4I7UA 5CG7A 4JR5A 4XKYA 1RQBA 3EEGA 3NPXA 4A22A 4MYXA 2CLIA 5J5RA 1MSSA 4EF9A 5CSRA 5HMSA 1LLWA 1R2RA 4EOUA 3W74A 3N2XA 5A5WA 1H7OA 2GUUA 2QUTA 4K37A 5DXXA 1M5WA 2J27A 4NZFA 1TPDA 4FIRA 1LROA 3UWYA 5I3GA 4TMBA 1RD5A 1LOQA 1JULA 3C61A 3G0SA 2QCMA 4CCCA 4Y90A 3PM6A 4UUIA 5CZ0A 1AG1O 1XDLA 4Q33A 5FEPA 4PA8A 3H55A 1W5QA 3QW4B 3ABOA 3PVFA 1EX5A 3DXIA 1ICQA 2V9DA 1XKYA 3EWXA 3M1ZA 3MP3A 3M41A 5F1UA 4Y96A 1ZENA 2ZRXA 2R14A 1JCLA 3TMLA 3QFEA 2ISSA 2DZVA 3LERA 2RKXA 1F6KA 4Z1CA 3R2GA 3W84A 5I3KA 3NO5A 1SO5A 3B4UA 4UXDA 5AC7A 5CPOA 3VE7A 1NF0A 1F73A 4K39A 1GQNA 2A5HA 4MY9A 3GYEA 3MHFA 4HSNA 4MY1A 2VFEA 1FDYA 5I3IA 4ZMGA 1MXSA 2CZFA 3EWUA 5E0KA 3P8JA 3NPWA 1KM6A 3M47A 3W85A 3MBDA 4MY8A 5I3HA 1ZAJA 2Y7FA 2V8ZA 1XI3A 4HKPA 1M7PA 3NQEA 4NVTA 3L67A 1JVNA 2A7PA 1UJPA 3TJXA 3OIXA 3EKLA 2Y7GA 2R91A 3QMRA 3I65A 3KVKA 3HGJA 3LM7A 4JDYA 2WSRA 1F7BA 2KZHA 2B0MA 3A21A 4D2JA 2AQWA 3LHUA 5EL1A 3TSDA 2NXHA 3NZ1A 4DPQA 5EMUA 3R89A 1V7YA 1B4KA 3KOFA 1B57A 2E09A 3TQ0A 3GNNA 4WOQA 3KVLA 2H6RA 2BSLA 4N2YA 3LCIA 1C8VA 4A2RA 3MUXA 4FXRA 5EYWA 3M5YA 2QJHA 4UMBA 1WAUA 5KMYA 4AWSA 4MZ8A 1F74A 5HUPA 4FNQA 1BWLA 3SIZA 2Y7EA 4LTSA 2YYUA 3N73A 2AAMA 1J4EA 3NGJA 3SGZA 3SGUA 1A50A 1QO2A 3T78A 3M44A 4NQ1A 4HNVA 3P61A 3DFTA 3UXDA 3HGSA 2WQPA 3GX9A 5DCEA 3S1WA 4N4PA 1FCBA 4IPIA 3ABQA 3E0IA 3O8AA 3TNOA 3SY5A 2I14A 1FWWA 4GJ1A 3ELFA 3C3NA 1SW0A 7TIMA 2J6XA 1OYBA 3CWOX 3P5ZA 3TE9A 2ZDRA 3RLVA 1PIIA 5F1VA 1KM5A 1JCJA 5AC8A 2VXNA 2E5BA 5G2IA 4GWEA 4NJHA 2R94A 1VGAA 4HHPA 3MHUA 5AYXA 1TPC1 5J5DA 1PHQA 1OK6A 2ZZ7A 4UFLA 4JX6A 1LRTA 3STEA 1DBTA 3W2UA 4O18A 3S0CA 4JX5A 2YDAA 3W87A 3HIJA 4I7WA 1W8SA 5AHIA 1JCNA 4N6FA 1G7UA 1OFRA 1EUNA 4A29A 4ZQRA 1H7WA 3V75A 2NWSA 2JGYA 2NXGA 5MHBA 2AGKA 3B0UX 4QNEA 5D2VA 4S1FA 5D03A 1TPH1 4DO4A 3GVGA 4PL2A 4O1BA 1CX9A 1KFEA 4HIBA 1W0MA 1X8FA 3WK2A 2GQ8A 2YZRA 2Y61A 1ZHAA 2Z2UA 4UTJA 2HSAA 3S5NA 1GVQA 1QNVA 5ABTA 1LM1A 2VOMA 1O94A 3E49A 2Z6IA 1YXCA 1TO3A 2CFFA 1I2RA 4XUGA 2PE4A 3W76A 3TH6A 5G2WA 5F4XA 1SFLA 3NXFA 3HG2A 3UZ5A 1PV8A 1XM3A 2QJIA 3FKRA 4JIPA 5F2LA 4BI6A 1KTBA 1BTMA 1OFDA 3G8RA 3NQDA 4GC4A 3W7EA 3TXVA 1UUOA 4O1AA 3FYOA 1BKSA 2B4GA 2VELA 4TR9A 3CIXA 4O14A 1HG3A 1SR9A 3CQ0A 3W2KA 3EXRA 3Q37A 4JTSA 3F03K 5D32A 5KINA 4PFMA 4UC5A 1WV2A 1C29A 1KM3A 1LCOA 2E5DA 2ZZ2A 1K8YA 5DBTA 5HULA 1FQ0A 3LCLA 1FWTA 3D0CA 1QWGA 1TTJA 3GLCA 5GVJA 4RCXA 4GBUA 4O11A 3T7VA 3B06A 1FWSA 3PF3A 1NF7A 3GDRA 3UYCA 1SSDA 3O06A 1NFBA 2A4AA 1KV5A 1KLYA 3R13A 4BI5A 2NUYA 1GWJA 3CLMA 2VFIA 5CZTA 3A5FA 1ZFJA 3B03A 1NAL1 4Q32A 3LXAA 3SSJA 2WO5A 2G95A 3KRSA 5AYZA 2YXGA 4FNUA 4AAJA 1FBAA 1JCYA 4LW7A 1TJPA 2H8ZA 4DO5A 1GVFA 4JTTA 1UB3A 1KM0A 5E1QA 4QAIA 3L5MA 4RXFA 3W75A 2W79A 4M6VA 3MJYA 3W86A 3LV6A 3DKLA 1H51A 2XN1A 6ALDA 4UTTA 5DELA 4CNPA 3MMTA 2X16A 3L2IA 4BI7A 1XXXA 2PRMA 3M5XA 2VEIA 2BWGA 4IMCA 1V5XA 2UV8G 1XUZA 4DO6A 1RV8A 1GTEA 3OA3A 4Z1AA 3DI1A 1SO4A 2EAWA 4H6KA 1N8FA 4UFJA 3N3MA 2C18A 4AHQA 1S5VA 4BK9A 3WK1A 5DN1A 3BPWA 4NJJA 3UY7A 3N14A 2JKEA 4N9CA 1I2QA 3BW3A 4P61A 1G4PA 2VFFA 4M5PA 4N6EA 4UTIA 3W7HA 4S2BA 3TCEA 1L6WA 3DFNA 1A5CA 4Z08A 1JUKA 3BLEA 1Q6QA 1H1ZA 2CLHA 4LVAA 4ORMA 1OX5A 3KX6A 3FJ6A 2RDTA 1FWRA 2H3DA 2ZRYA 4M6QA 4UR7A 2VEKA 2RFGA 1IGSA 3PAJA 1S5WA 3P74A 3O6CA 4M6PA 1JQVA 4MIMA 1O5KA 3M5VA 4JTHA 1TRDA 3MI6A 4XKYB 1YTEA 3IIZA 5EBUA 5AHEA 2Y62A 2NX9A 1ICPA 2V5LA 1OX6A 1YLVA 2GQ9A 4LT9A 3PUOA 1IXNA 1QOQA 3U2OA 3W2LA 5AN7A 1X6UA 2C6QA 3LCXA 3W2NA 2YFOA 3G1SA 3NNTA 1YDOA 2E1DA 2CLFA 1K7EA 5FEWA 1I2PA 1P0NA 3LHTA 2B7PA 3NQMA 4WQ6A 3G1AA 4FO4A 4IJBA 1JUBA 5CZJA 1U83A 1HUVA 3LXCA 5CKSA 1QPNA 4YXGA 1SW3A 3P80A 3HOJA 2DJLA 3I7QA 3TDFA 4IMDA 1ADOA 2QDHA 2DJXA 2ZYFA 5C6MA 3NQGA 4JXCA 4FX7A 2DZWA 3LRLA 1K7FA 3WK3A 4OGZA 1B3OA 3S5YA 3HG3A 2I1OA 2EPHA 1XBZA 1MEHA 1ZNNA 4UTUA 3ZWTA 2CZDA 1GTHA 3JS3A 5FF0A 1TPFA 2OX1A 1YXDA 2JKPA 3TROA 1J2WA 2J9YA 1XDMA 3FOKA 3L68A 3NVTA 1IXOA 3HPXA 4JYDA 1YADA 4OE7A 3O07A 4AVFA 1K3UA 2C19A 5E93A 3VNDA 5I3FA 3KFTA 5D02A 3CWNA 1XFBA 1F05A 4O4WA 3KVMA 4LVDA 4ZZ9A 2RHGA 5HWJA 3WJSA 4LS0A 3TIMA 2GJLA 3W73A 2J9ZA 3HB9A 3G1FA 2NV1A 2TMDA 4BR1A 4ZQCA 2V2HA 4UTTC 3O16A 1GEQA 4XZ9A 1QMLA 4ICNA 3FEMA 2JBMA 3EWYA 1RR2A 1DQWA 4ML9A 3WJYA 4CCDA 5T26A 1TV5A 4XBKA 4DPPA 2YX0A 1UASA 2V5BA 1VHNA 2A1YA 1D9EA 3GKFA 1KTNA 1VCGA 1L6SA 3IEBA 4MOZA 1Q45A 4Y9AA 4JDBA 2D73A 3BGJA 4NXSA 4MPQA 3SW6A 5D2WA 1YDVA 3M5ZA 3NPUA 1OFEA 3FS2A 5AHLA 5LSMA 5KITA 4NXKA 2Z1BA 3W7KA 4UTHA 4JICA 4KWVA 4IMGA 3C0JA 3NQAA 2Q3OA 1DV7A 1R46A 4GUFA 3TW6A 1IIHA 3W7PA 3QPZA 3BO9A 3N19B 5FEXA 3L0GA 2GVJA 1K03A 2QR6A 1EB3A 1FDZA 2ZQ0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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