1DORA

Dihydroorotate dehydrogenase a from lactococcus lactis
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
311
structure length
311
Chain Sequence
MLNTTFANAKFANPFMNASGVHCMTIEDLEELKASQAGAYITKSSTLEKREGNPLPRYVDLELGSINSMGLPNLGFDYYLDYVLKNQKENAQEGPIFFSIAGMSAAENIAMLKKIQESDFSGITELNLSCPNVPGKPQLAYDFEATEKLLKEVFTFFTKPLGVKLPPYFDLVHFDIMAEILNQFPLTYVNSVNSIGNGLFIDPEAESVVIKPKDGFGGIGGAYIKPTALANVRAFYTRLKPEIQIIGTGGIETGQDAFEHLLCGATMLQIGTALHKEGPAIFDRIIKELEEIMNQKGYQSIADFHGKLKSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of the flavin containing enzyme dihydroorotate dehydrogenase A from Lactococcus lactis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE A
molecule tags Oxidoreductase
total genus 113
structure length 311
sequence length 311
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 1997-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 1dorA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1dorA01
2VEMA 1R46A 3FKKA 1QDSA 1F6PA 1TIMA 4XTDA 1GG1A 3NPVA 1WOAA 2O7SA 1BEUA 1OF8A 5K9XA 1ICPA 2C1HA 2ZZ1A 4R33A 1YDVA 4E0CA 5AC8A 3FKRA 3TDFA 3NQ2A 3MHFA 3C4UA 3DHFA 1W8SA 4QIUA 1R30A 1VGAA 1O95A 4TIMA 3P84A 4NNCA 3PB2A 4JTJA 4AAJA 1RVGA 4RJEA 4JGDA 2VEPA 4BF9A 3L5MA 1YPIA 2VOMA 1GOXA 1K8ZA 3SR7A 2Y85A 3HPSA 2P1FA 2X1UA 5LNSA 4JX5A 5CSRA 2RDUA 5C54A 4DQWA 5K2ZA 4GNJA 4MKNA 1L6YA 1SO5A 2QCHA 1XDMA 3LXCA 1H63A 1OHLA 3I7QA 5A8GA 2C15A 4JEQA 2ABAA 3EKZA 5I3JA 2J27A 3MP3A 1UCWA 2WSYA 4H3DA 1XDLA 4FNTA 1AMKA 4JTIA 4U28A 3M5YA 3BG9A 3UPWA 2C0AA 3LX9A 5KZEA 3TXVA 2E6AA 4XBKA 4NZJA 4X22A 1VJIA 4AB4A 3W22A 3NQ8A 2VFIA 4LS2A 1IXNA 4UTKA 5KMYA 1OFAA 3NZ1A 2YDAA 3H55A 3GAYA 3QC3A 5FESA 4ONVA 5LNRA 1SZNA 2WNZA 3YPIA 2ZDRA 5EL1A 4IX0A 1FXPA 4FNSA 2AGKA 2VC6A 1K7EA 2DZXA 3LBMA 4WOZA 3W84A 2PURA 4HT3A 4X9SA 2QCDB 1TPFA 3TU9A 1SW0A 3TJXA 4QNEA 3W7GA 3OVQA 3R13A 5CZTA 4JYDA 1J2WA 3T44A 1OFDA 3A22A 4HSOA 3EX4A 4UNKA 4QISA 3ABRA 3PM6A 4O28A 3B0PA 3LLFA 4WOQA 3O06A 2E5BA 4U4MA 5C2XA 4LRSA 4NXSA 4O18A 2NV1A 3LRLA 2V2HA 2WNNA 3DFOA 1JUEA 1TPEA 2A7RA 4CCDA 4UFIA 1ICSA 4QSHA 3NL5A 5TIMA 1LLWA 5CGQA 1ONRA 1KBJA 4TR9A 3W1QA 4IWWA 2G5WA 3NGJA 3L66A 3NYZA 4FX7A 1UJPA 4EF9A 1KM3A 4ZQNA 3GKAA 2XN1A 3P80A 4OBTA 1B3OA 5LGXA 4HNNA 2OJPA 2QUVA 1XFBA 4NNAA 4AWSA 3PBYA 5HQEA 4BR1A 4JX6A 1FWTA 4JR5A 2ZRYA 4FF7A 1Q6OA 3EWWA 3NAVA 4XUGA 3G8EA 2TSYA 2Q3OA 4LVBA 4BWLA 3TCEA 1HL2A 2IQTA 3DFPA 4JY8A 4DBEA 3T7VA 4G1KA 3WK0A 3W86A 1WBHA 1X7FA 2H3BA 2B7OA 3JR2A 3IEBA 3KX6A 5LZLA 4NJJA 3B03A 3M47A 4E2DA 3W1MA 1TCDA 4BWLC 4C1KA 2CLIA 2PC4A 1TTJA 2DJLA 4FNQA 1XUUA 2DZWA 3GDMA 4FEZA 1XBVA 4X2RA 1I8JA 2QJIA 5HR6A 1HFBA 1SFLA 3WK2A 1PE1A 2BLEA 3N19B 3CT7A 1H7OA 3SI9A 3EX6A 1U83A 4GFSA 3Q37A 4AXKA 2PRMA 1PHQA 2TPSA 1H7XA 1KFJA 3C2RA 3DBPA 1C8VA 4BI7A 1NF0A 1XUZA 1UUMA 3GXTA 2WQPA 3GX9A 4NVTA 1X8FA 2YR1A 3PSWA 4UCGA 5EBUA 4FB7A 2V82A 3LBCA 3HIJA 1EX5A 3TX9A 3TNOA 2ISVA 4UR8A 1JVNA 2QAPA 4XKYA 1QPQA 4MUZA 1LOLA 4O4WA 5AB3A 3M1ZA 1GVSA 2CLOA 4RR4A 5EMUA 5F4XA 2J24A 5EKYA 5D03A 3LCWA 1I45A 3JRKA 2QJGA 1VPXA 4HKPA 4FX6M 1OG0A 3IGSA 4MOZA 2UV8G 3P67A 1JJKA 2RHGA 1H1ZA 5KINA 2Z0IA 3NQAA 1PS9A 2EPHA 3GDLA 3U2OA 3QJAA 4UFLA 4BK9A 3STEA 3M5VA 3EWZA 2CLHA 1MSSA 1F05A 1VH7A 4UFKA 4I7VA 3TC7A 3WK3A 4YL2A 5DY2A 5HUOA 4JTFA 3R8RA 1TRDA 3KRSA 3SSJA 5AYZA 4ZQOA 3EXRA 3TMQA 1YDOA 1DBTA 1K02A 1KM1A 4O11A 1EP2A 3W2MA 5DBUA 3QRHA 5LHEA 2A85A 5BW6A 1R2TA 4PCFA 1ICQA 1XM3A 1O94A 2CLEA 1YTEA 3L65A 5D37A 4UC5A 3BGGA 3MBFA 1N8FA 3GNDA 4HIBA 2RDWA 5G1TA 4O13A 3EX1A 4RZ4A 5MHBA 1M6JA 1ME9A 4K38A 5D38A 5K4ZA 4WQ6A 1Z48A 1GPWA 3RMJA 1GWJA 1QPNA 3IVUA 4JYEA 1KLZA 1OYAA 1OK4A 3P8IA 1S5WA 3PBVA 3BG3A 1Q6RA 3CLMA 4N9BA 3DENA 4S1FA 3L21A 1VYSX 4QAIA 5HWMA 2X1TA 1TV5A 2RFGA 1DV7A 1GJPA 3MUXA 3E9AA 3W7DA 3T55A 5A5WA 1ADOA 2ZTKA 2DJXA 1PVNA 1W5PA 2ZQ0A 5ABTA 3LTYA 3QQ0A 1FUYA 1H1YA 3FJ6A 2WPBA 4M6PA 1TV7A 2V8ZA 1FX6A 3TQ0A 3ELFA 3NM3A 5D2WA 2DP3A 2ZTJA 3U6WA 1P4CA 2R8WA 2GVLA 1Z42A 7TIMA 3STGA 1AK5A 2OX1A 3P60A 3DGRA 3KRUA 2C16A 2YGYA 3RLVA 3GXNA 1NVMA 5K9CA 1OX4A 3S6DA 1KTBA 2C14A 3KRZA 1SW7A 3DHDA 2NLIA 5D2VA 3A21A 5DY3A 1ZNNA 1J4EA 1W54A 2CLFA 4MJMA 1W1ZA 4Z1AA 1V5XA 5FEPA 4O4VA 3ATZA 4RX0A 1PCKA 2ALDA 1FY6A 1DJQA 4O8RA 5G2IA 1GVFA 3KAOA 3O15A 1W3NA 3SGUA 3MWAA 2NX9A 5FF2A 3N2XA 4IUOA 4W9TA 5HWJA 4JTUA 2Y7FA 1IXOA 1AL7A 3FLUA 1SW3A 4A2SA 4K7YA 1LROA 4OWGA 3HF3A 3N2MA 1SU5A 1VLIA 3M0ZA 2NUYA 2NWRA 4WY0A 3G1YA 4UFMA 5D2YA 2ZYFA 1YTDA 3QM3A 5H2ZA 3W7EA 3LOTA 3SJ3A 3O1NA 1F74A 2VFDA 4S2BA 1YXDA 2GVJA 1L2UA 2BZNA 3TSDA 3GDRA 2CZDA 4O52A 1MXSA 1O5XA 1XI3A 3LCGA 3M44A 3QF0A 3MI3A 2DU2A 2E77A 3MP4A 4N6FA 4M5PA 4BI5A 3FYPA 2J6XA 1K8YA 5AYYA 3JS3A 1IXQA 4ALDA 1KBIA 2VFGA 4RLIA 1JCYA 1X1OA 3G1SA 1J5TA 2YSWA 4Y90A 1DQXA 4XBSA 6TIMA 1A5SA 3GYEA 4UXDA 2ISWA 2BWGA 2EF9A 3F4NA 1K7FA 1OFRA 4WJEA 5U4NA 3EB2A 1KA9F 2ZA1A 1W56A 3NQMA 2V0TA 1SR9A 4MY1A 1TYGA 1EPXA 4UIOA 1W3TA 4O1CA 1AL8A 3TAKA 1TREA 4KFNA 1KTNA 3C2VA 3LM7A 1SSDA 2B7NA 1WX0A 1ZAJA 1GT8A 3S5OA 1OVDA 3V1PA 4ZQPA 4HSNA 1W5OA 3L2IA 3OEXA 1UASA 4K8EA 4NJIA 3S5YA 2JKPA 1OFBA 2ZRVA 4UTTA 5C5YA 1L6WA 4NX5A 4LTSA 3UPBA 5K7JA 2F84A 1FQ0A 1JUBA 4GRSA 3S9YA 3PBUA 3NQDA 3QH2A 1TSIA 2W0UA 4ADSA 5AC6A 2O7QA 1HTIA 2E09A 2OT0A 1HO1A 2ZZ5A 1DKWA 3DFTA 1VYRA 1T96A 3AJXA 4H6KA 1IIGA 1ZHAA 3T78A 2B7QA 3C6CA 3PWAA 5BMWA 1D3GA 4TMBA 4RXFA 3LXAA 3U8GA 2Y62A 1EUAA 4WZHA 1GYNA 3FEMA 4DO5A 4UNLA 4UTTC 3L0GA 4E38A 5J5DA 4UMBA 1D9EA 1R2RA 2Q3RA 3D0CA 3GZ3A 4JIQA 4OE7A 5F4SA 2OCZA 1M7OA 1YXYA 1QO5A 4QNWA 1LRNA 2QCMA 2V5LA 3W3OA 5I3HA 4IX2A 1GTEA 1GEQA 4LWWA 1LZOA 2H3DA 1XC4A 2DORA 3LHWA 4LV9A 4P61A 1G7UA 1FDZA 2W6RA 2QF7A 1MZHA 2RDTA 3B06A 4IQLA 3IVSA 1VHNA 3VFLA 4UTWA 4WY0B 4HPXA 3WJWA 3G0UA 1W5NA 3DXIA 3CTLA 2GOUA 1VZWA 3DKJA 4O57A 2Y61A 4O1AA 3O6YX 2GJNA 1EB3A 3UYCA 1FBAA 4UTLA 3CWNA 2ZRZA 1EIXA 3W74A 2NUWA 3CEUA 4WUIA 4UTWC 2AAMA 4K7VA 1B57A 2VEKA 1P5BA 4IPIA 2ZA3A 4ORMA 1I4NA 4NU7A 3MBDA 4I7WA 4P2VA 4XQ6A 4IMGA 4R53A 1EP3A 4GUJA 1ALDA 3W1XA 4GC4A 1OYCA 3S1UA 3OHIA 1LM1A 3IIZA 5G1YA 3AO0A 3NEVA 3HG5A 2V2DA 3DH7A 2E1DA 3SGZA 1GG0A 3W88A 1RZMA 3LHVA 3HGJA 1H7RA 3A23A 3ABOA 2E6FA 2JGYA 4JS3A 1LBLA 5GVJA 4CNPA 5I3KA 2ZZ6A 3HB9A 4DF1A 4UTHA 5HR7A 3CEPA 4NJGA 4HPJA 1MEWA 2YPIA 5DLCA 4RK8A 3W7QA 2QEZA 2YYTA 3TW6A 4XZ9A 5DELA 3W71A 5DXXA 3TH6A 3CQ0A 4Z1CA 5KITA 1QPOA 3TAOA 3KOFA 2DZUA 4HN4A 4MLRA 2NXGA 3OG3A 2QKFA 5BRBA 2VFEA 2NXHA 2GQAA 4LT9A 4XWUA 4AF0A 3C61A 1ME7A 2Y6ZA 5DCEA 1LOSA 4J9JA 5LKYA 1MEIA 3MJYA 3UD6A 4FXRA 1E51A 1I2QA 3N9SA 3S1XA 2VENA 2FJKA 4ZQMA 3F1QA 4ADTA 3E96A 3QFEA 3BW3A 2YX0A 1H7PA 2V2CA 4ZL1A 2KZHA 1F76A 1V7YA 2ISSA 3THAA 4WXYA 3N14A 1IF2A 3M5XA 1Y0EA 3NQ7A 4MY9A 5LGZA 3UZJA 2QCNA 2I14A 3UWQA 5CZSA 3N9RA 4Q32A 4AWUA 4AMAA 4B5NA 2FIQA 3R2GA 3TKFA 1BKSA 3KVMA 4HNTA 2EAWA 1JCMP 1H60A 4N02A 4TO8A 4N9EA 1T0OA 1TPDA 4PH6A 1GQNA 3NR0A 4ADUA 3OIXA 2YYUA 3FA5A 3MHGA 3WK1A 3GKFA 3NQGA 3RK8A 3T4CA 3OBKA 3ANYA 1A5CA 3S5NA 5CPOA 1FWNA 4YWIA 4QITA 3G24A 1H61A 4LV4A 1YDNA 4FX8A 3ZWSA 5D05A 3KVKA 5AHFA 2A6LA 3HG4A 1H51A 1YTKA 3LTPA 3S0CA 1WV2A 2OT1A 2QCFA 2DZTA 4EIVA 4O1BA 2FFCA 4KFOA 1TPWA 4LRTA 1X1ZA 2ZZ7A 4M6VA 1TB3A 4MVAA 3IVTA 4WY0F 1YPFA 3EKLA 1WOBA 3TIMA 1H50A 5LNVA 1H62A 2CU0A 2A2IA 3ABSA 2CZEA 4NXKA 2XFWA 2FPVA 1GVQA 1Q6LA 4PODA 3PS7A 5CZ0A 3UWUA 3BPWA 4GE8A 4AEOA 4NUWA 4OV9A 4AHPA 4DPQA 3BVJA 3UZ5A 2VFHA 5HWNA 1ML1A 3W83A 1A53A 4GUIA 1VS1A 4JXCA 5G5IA 1N7KA 4UMAA 4KWWA 1F5ZA 3OA3A 4AF0B 3IIXA 3NL6A 2EKCA 2P0OA 3S1VA 1N55A 1B4EA 3B8DA 3CU2A 4I9AA 5I3IA 4GUFA 2B0MA 1L9WA 3TMLA 3EWBX 4MY8A 1T99A 3DKLA 3IGXA 3LB0A 2GUUA 3G1FA 4TU1A 1WA3A 1H5YA 5I3GA 3O16A 4CLMA 3PBWA 1JULA 3W7NA 1TJRA 1QOQA 1PCWA 3DI0A 2FDSA 4PEKA 4FIRA 3G8RA 3LCHA 3ATYA 1KFEA 2CZ5A 3VCRA 4LVDA 4YLWA 1GYLA 1UBSA 1QR7A 5T26A 2BTMA 5AN7A 1HUVA 3B04A 3NQFA 3HO8A 4K6AA 1XXXA 4LC6A 3BLEA 4O50A 4OU1A 4O14A 1OFQA 2LLEA 3QPYA 5FEXA 4OV4A 3W23A 2DZVA 3TW7A 4Z1BA 4DF2A 3GR8A 2GJLA 4Q4KA 1LLZA 2CW6A 3V75A 4HNVA 3W1LA 4ICNA 3ZS4A 5L9FA 3IGUA 4X3ZA 4NNBA 1JCXA 4MLJA 1LRTA 3G1XA 2CFFA 3P81A 4TX9A 2NUXA 2W79A 5E0KA 2JKEA 3LHZA 1SUXA 2A7PA 3HJZA 3LGEA 2ABBA 3MYOA 3W1AA 2ZCGA 3NQVA 1K8XA 1NAL1 4BFAA 3P5YA 1ME8A 3NQCA 3O6CA 4IMEA 3GDTA 3UWYA 2BSLA 5F2MA 1P0NA 1KLYA 4XTIA 2CZFA 3W7LA 1IGSA 5IM51 4O0KA 2J9ZA 3UWVA 3PUDA 3G18A 2QDHA 5AHLA 1RPXA 1L6SA 1QFEA 2H8ZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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