1E0VA

Xylanase 10a from sreptomyces lividans. cellobiosyl-enzyme intermediate at 1.7 a
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGRLSDSTYTSIAGREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSSADRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSALRQAMIDHINGVMAHYKGKIVQWDVVNEAFADGSSGARRDSNLQRSGNDWIEVAFRTARAADPSAKLCYNDYNVENWTWAKTQAMYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGAPASTYANVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDSDSWRSEQTPLLFNNDGSKKAAYTAVLDALNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces lividans
publication title Substrate Specificity in Glycoside Hydrolase Family 10. Structural and Kinetic Analysis of the Streptomyces Lividans Xylanase 10A
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-XYLANASE A
total genus 123
structure length 302
sequence length 302
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2000-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e0vA00
4D6IA 4ATLA 2YL8A 2YJQA 4TX8A 2WAGA 4F79A 3VINA 1E6RA 5A95A 3NJ3A 4MPKA 5IHSA 1D3CA 3GNOA 3MO4A 4W7UA 5CJ5A 3CUGA 3THCA 3UR8A 1FFQA 1VJZA 1BVNP 2XJ7A 2WZHA 1W9XA 4OJYA 1KR1A 4HPHA 5AYIA 4OIFA 1EIBA 1UWIA 4UOJA 2V3DA 2ZX9A 4QCEA 1E4NA 4GZJA 2D23A 3QHMA 3WMBA 4JAWA 1XD1A 3A4XA 1V3JA 1H41A 1HJVA 3U57A 2CITA 2ZUWA 2DIJA 4JKKA 1WE5A 3BAYA 1E15A 3CH9A 1UWUA 1I1WA 5GPRA 2Y5EA 4OZOA 4W84A 3VMPA 1VBUA 1H2JA 2WHLA 1CEOA 3VIKA 4Z2JA 1C8XA 1M01A 1JYNA 5GNXA 3ZQ9A 2WHMA 2FGLA 5EB8A 2DSZA 5CSYA 1FA2A 1HJUA 3BH4A 4U5KA 2CBJA 2XSBA 1E55A 2VZOA 4GI9A 3VM5A 1CXHA 4J3XA 3CHEA 3W25A 1JG9A 2WMFA 1V3LA 4XB3A 2OWWA 2QMKA 3SURA 1B31A 3ZR6A 3RJYA 1VFOA 4RE4A 1BFNA 5DO8A 1RH9A 4HA3A 4ACYA 3LPOA 4AZHA 2W92A 1P6WA 1W2VA 1MYRA 3VMNA 5CXPA 1W3HA 2ZX7A 3VGDA 4LGXA 3CBWA 4AZBA 4IPNB 1AQHA 3FY1A 2WM0A 1O7AA 2E9LA 3EDDA 5ABEA 2WNWA 2ZWYA 1GUVA 1TFVA 2VL4A 4DUWA 2X09A 1JDDA 1XD0A 3ARZA 4RL3A 2ZUVA 1V3KA 3L4TA 3ZMRA 3L2LA 3CZKA 3PZUA 2F8QA 1V0MA 2DSWA 1NWUA 1UZ1A 1E6QM 1SMAA 1Z32X 3T0BA 1G94A 2DDXA 3K4AA 1W9VA 2YIHA 3WIJA 1WKYA 2V3EA 1HX0A 1QI3A 1ECEA 3GNRA 1V3IA 3W29A 5AY7A 1EA9C 1NOFA 2W4XA 1DTUA 1WAWA 4PTWA 1CLXA 3GZAA 5CG0A 1J0IA 2GJXB 2Z1KA 3VGEA 2JIEA 1TR1A 3W24A 5KEZA 2XUCA 1O6IA 5HDRA 3AHVA 2BVDA 5BRQA 5ABGA 1E0XA 1LL6A 2IUZA 3D3AA 3BCFA 1UYQA 3M46A 3VIMA 3I3BA 4D6DA 3WBEA 4WKAA 4OUEA 1MXDA 2X05A 2WWDA 1WZLA 1UZ4A 1G01A 3JUGA 3EMZA 3OA5A 5D8ZA 1VRXA 2A3HA 3CZ8A 1GCYA 3NDZA 2CHNA 4M82A 4H04A 4A4AA 2PI6A 4LYPA 1GOIA 4J28A 1UD8A 4QAWA 1PX3A 2GDUA 2WW5A 1JZ4A 2ZWZA 4QCFA 3FNDA 2G3MA 4C7GA 3AOFA 5FCZA 1QNOA 1H3GA 2YL5A 1H1NA 2VZUA 1WO2A 2PBOA 1J0ZA 4ZENA 3ARTA 4Z2HA 4W5UA 1LWJA 4E8DA 1GQKA 1JNEA 3LPFA 5M03A 3DC0A 1CZ1A 2DSVA 2W67A 2VX4A 3W53A 4CCCA 3N04A 4JFVA 4HA1A 3VD5A 4UTFA 3WQVA 1QVBA 1H5VA 3WEOA 1R86A 1EO7A 4DWSC 2V3GA 4C7DA 3K1DA 1KBBA 3TOPA 3BC9A 3BAJA 4MJ2A 3WNOA 1BYCA 3QR3A 3K46A 4WIWA 4M24A 3ZM8A 1C91A 1V08A 4E8CA 1IV8A 3RILA 2ZE0A 1GJWA 1DWFM 2UY3A 3WQ6A 3T0AA 4D1JA 1DHKA 2E8ZA 1HP4A 1WZAA 4B16A 1NARA 3T08A 1OWQA 2D24A 1B2YA 2OYKA 2XFRA 1JXJA 5I78A 2WZEA 2WANA 2O9PA 4CU7A 2CKRA 1XGZA 1C92A 3KEHA 3D5HA 4PMDA 3WBAA 4BQ5A 3VMOA 4P7NA 1ISYA 2EPKX 3WDRA 2G3NA 3OGVA 4IISA 1E3XA 4M81A 1HP5A 4YHGA 4AD3A 5EFDA 4PTXA 2NW0A 1GVIA 2YA2A 1JYWA 3DECA 2DT0A 4W93A 3LPGA 2YDRA 2V5DA 4FLOA 3F5JA 1EXPA 1E6PA 4MDOA 1GZJA 1HIZA 1QHZA 2CNCA 3EMCA 3WF0A 2WLYA 2WBKA 1EHNA 3W82A 2ZUMA 3T09A 5EFFA 2XTKA 1TVNA 2WMHA 3SUVA 3SCUA 3VIHA 2BV9A 3HJEA 2EO7A 4BQ2A 3CHDA 1B3YA 1MW0A 4P7QA 2AAAA 2DPEA 3WENA 7TAAA 1GORA 3RIKA 3VU2A 1OINA 3WSUA 4TXEA 4XZWA 4Z2LA 4YPJA 3AIQA 4PMUA 1XCWA 1W1PA 4HZ8A 2GSJA 2ZUNA 3MV11 2IXUA 3WH8A 4D6FA 2VTFA 1WPCA 2GVYA 1ITCA 2ZXDA 4URIA 1V0NA 1J01A 3PHAA 2VOTA 1TMQA 1U2YA 5LYRA 1XC6A 3GH4A 4ZEPA 3MV01 1U30A 5E0CA 4CU6A 3L4UA 1E72M 2D0FA 5GQBA 3ZT5A 2D22A 5D9NA 5CGMA 3II1A 4GQRA 4AD5A 3PZTA 1W9PA 4PBGA 5E09A 5BXTA 4Q22A 2XPKA 3VX1A 3AMDA 1NWSA 2XIBA 3DYMA 3K4DA 2WLZA 1EQPA 4PMQA 1KR0A 4DUVA 3OZOA 4ZFMA 4AMCA 4JFUA 5IHRA 2FHCA 4BZYA 3MUZ1 5JIWA 3VIPA 3TP4A 1K9DA 2D0GA 5A2AA 3VD3A 3ZJ8A 4PSPA 1XH1A 1CLVA 3BMWA 2ZX5A 4KRTA 3W6MA 1GOWA 3PZOA 1W9BM 1BF2A 3PZIA 3WF2A 4B9YA 2V38A 3CZGA 3RPMA 1GHRA 5GNZA 3ECQA 2GUYA 5CZKA 3TTYA 4AZ6A 1U33A 1HJXA 5ECUA 2Y4SA 2W62A 3CUIA 4JKMA 1UKQA 1V6WA 4PSRA 1JAKA 1DP0A 4TTUA 3BAWA 4MB3A 4MB4A 3GBEA 1G5AA 3BAXA 2JEPA 2BY2A 3AYSA 1WZKA 2ZOXA 3DYOA 2J7GA 3WELA 2CIPA 1GOOA 1C8QA 1E5JA 1W32A 3VNYA 3W0KA 1Q6EA 4CCDA 4NRRA 3OGRA 3WDHA 5A6BD 2VZTA 4UFKA 1JZ5A 3AIBA 1Q6CA 1DWHM 2GJXA 4N42A 3KWXA 4WKHA 2X8RA 3QOMA 3WH9A 5M3WA 5DF0A 1GOQA 1JYVA 2C0HA 1L0PA 2EJ1A 2GJPA 3UG5A 1A3HA 3HN3A 1MVYA 4CUCA 2JE8A 1V0KA 1SFSA 4D72A 2RGMA 3WH7A 4FMVA 1V6XA 2PC8A 3KL5A 2J25A 4P8WA 4K68A 1EOKA 3LMYA 3T2PA 2VC9A 1CYGA 3IAQA 2D20A 2WK2A 3ARXA 2GDVA 3GXDA 4HMCA 1XCXA 3ARVA 2J7DA 2BY1A 4DUXA 2GK1B 2BY0A 9CGTA 5I2UA 5HPOA 7A3HA 1QI2A 3NSXA 3VX0A 2BXYA 1N82A 3CMJA 4AW7A 3CZJA 3AZTA 4GO8A 4CN1A 1W3LA 5I5RA 5CLTA 3MUY1 1EO5A 1ISVA 3O9NA 4GI8A 1UKTA 3WNMA 4GIAA 2CHOA 4CN6A 4HOXA 1TZ7A 2PWEA 1UKPA 4HOZA 3WDJA 1H11A 1D2KA 1UR8A 4UFIA 3ZSTA 1CENA 5FL1A 2J7HA 1GVYA 4Z2IA 1MXGA 4PTVA 1BG4A 5BXPA 4J3WA 2YA1A 1X1NA 1OT1A 1UH2A 2PB1A 2XM1A 1H0GA 5CPQA 1DWJM 4DWSA 1W1YA 2J7CA 5IFPA 1OD0A 1E9LA 1MQPA 4ATDA 3SUSA 1GQJA 3UERA 3VIOA 2YLLA 4GZIA 4B3LA 1MW1A 1Q6GA 3FW6A 3ZT6A 2C8NA 1GHSA 3VILA 2YA0A 5DT5A 2E9BA 1KQYA 2XG9A 3DYPA 5LA2A 1PZ2A 1XV8A 3MUIA 1OIMA 3L2MA 2YDQA 1ZBWA 4AYSA 4J3TA 3W81A 2EEXA 4GI6A 3WFZA 1C8YA 3SCTA 4MNJA 2J8FA 3CZEA 5CSUA 3SUTA 4JHOA 1VF8A 1OM0A 1S46A 1G9HA 1UG6A 3G6LA 1BHGA 4B9ZA 2AMGA 3CZLA 1NH6A 4HU0A 2XWDA 1KGXA 4BCEA 3N17A 2BXZA 2OWCA 4HA4A 3OLDA 4W8AA 2OYMA 1W91A 4H8UA 3WD1A 3WD3A 4RE2A 4F9JA 1UQYA 4C7FA 1W2PA 2FH8A 1H09A 2UY2A 2DSKA 3EDJA 4JZ5A 2HISA 1BQCA 3BLPX 3B9EA 4W89A 1M03A 5BWFA 2J78A 2D0HA 2YL6A 2WKGA 4OBRA 1HVQA 1BTCA 5BCAA 1AMYA 3VGGA 1OBAA 1D7FA 3T2QA 2J4GA 3U5UA 4WK9A 3W26A 3WY1A 4YN5A 4CVWA 1R7AA 4Q7NA 4W8BA 1JI1A 3A3HA 3MKKA 1KFWA 3EMQA 3N12A 1EDGA 3GNPA 1VFFA 4P7RA 1HJWA 5GNYA 2JF7A 4QFUA 3NUKA 3N9KA 2VRQA 2ESCA 3BCDA 1I1XA 5IXEA 1W3JA 1E6XM 1OGSA 4QDMA 1F4AA 2PBGA 1VFMA 3WKZA 1JD9A 1HVXA 1GOMA 1K9FA 2EPNA 1E0VA 4LXFA 1R87A 2XM2A 3I3EA 2EPOA 3WL1A 2FDMA 3BAIA 3PZ9A 4PEEA 3OG2A 1VIWA 3OLIA 3HU7A 4UFMA 2WZIA 2DEPA 2ZXQA 2Y8VA 3EYPA 1WNOA 4Z2KA 3DHUA 3AIVA 2WC3A 4UZSA 1OIFA 1CIUA 1TA3B 3CIVA 3A47A 1B3VA 1QPKA 1J0JA 3RJXA 2W5FA 4UOZA 1UWRA 4LPCA 3AXIA 2Y2WA 1UR0A 4NSBA 1M04A 1V02E 1WCGA 2ZX6A 5A8QA 2YLAA 1Q6DA 4UQCA 4CD4A 2V5CA 2OSYA 1XHGA 2JF6A 1XSKA 4HTYA 4AZ7A 4X0VA 4J3VA 1JFHA 1ZS2A 2F61A 4AD4A 2O9OA 2QF8A 1B30A 4DWSD 3AISA 1E70M 5E0FA 3W4RA 3WFLA 4PCTA 1B9ZA 2CBVA 3AXHA 4PN2A 1MQQA 2AOSA 4ZE4A 5HOSA 5I0DA 2DH3A 4UQAA 1OGBA 1QW9A 5HBFA 2DSUA 4CGTA 1CPUA 3AZRA 4NI3A 2XVKA 1WZMA 4FLQA 4PMOA 2VQUA 4GINA 3OBAA 4F8XA 1EH9A 1UHVA 4PYSA 1M7XA 1E71M 1G0CA 4J3UA 1XH0A 2XVNA 1KQZA 2FHBA 1CNVA 1E4LA 5A8PA 2ZUUA 2VRKA 1HJSA 1ESWA 2YBTA 3NSNA 3WUFA 4XUYA 3EBVA 2F2HA 2GK1A 4HP5A 4AIOA 2ZUSA 2WYSA 3L4VA 4PMNA 1ITXA 4W5ZA 1UWSA 4PMRA 1LF1A 4MNLA 1IT0A 3VPLA 4WJXA 4EK7A 1C90A 3EDKA 3AHXA 1ODUA 4LX4A 4EANA 3SCWA 1WDSA 3GM8A 2J75A 4H7VA 2OSWA 1R7OA 4UFJA 1BLIA 1DWAM 1EGZA 3UEQA 4MJ4A 1Y7VA 4MDPA 2WMGA 1M53A 4CKQA 3L4ZA 4MAZA 3NSMA 3WMSA 4KGLA 1E6NA 3WD2A 1HKKA 1MFUA 2IXVA 5A3HA 1IZKA 1EDQA 2VMFA 1E73M 4R5EA 2WVVB 3ARQA 4F66A 3O6AA 1B3WA 1WDRA 5E6YA 4EE9A 5FD0A 4U3AA 4H2CA 5E6ZA 1FH7A 5JUVA 3U7BA 2ZIDA 1WDPA 4KRUA 5A8OA 1BYDA 5I23A 3K8LA 3KE0A 2ZX8A 7CGTA 3APGA 3S6TA 1JFXA 1RPKA 1JZ6A 3MMDA 1HT6A 1UOKA 2EPLX 3AHTA 4MB1A 1PZ3A 1J10A 3WNPA 5DT7A 3ZOAA 1VAHA 3MMWA 2BFGA 1JL8A 1UKSA 4AZCB 4V28A 1CGUA 1UA3A 1HL8A 1KXVA 3RM8A 3M6DA 2BHUA 3ZJ7A 5I24A 2V3FA 4V27A 2E9MA 2XGBA 3PN8A 4M8UA 5I77A 1K9EA 1E5NA 2XIIA 2PF0A 3UG4A 5A6JA 3GTNA 1SR0A 1YQ2A 5FL0A 3VIIA 5D9PA 2PWFA 1E3ZA 5AC5A 1QNSA 3VO0A 1PX4A 3VGFA 3W27A 3IJ9A 3WL0A 2WKLA 3BSHA 1CGTA 2ZUTA 2PWHA 2VCAA 3GXFA 5CLWA 4CCEA 1GPFA 4ACZB 2CETA 4JCLA 2WCAA 1FP8A 3G6MA 1E0WA 3K8KA 1QBAA 1V3MA 5I6SA 4V2XA 3SCPA 3WEMA 4PMZA 3AIUA 1J11A 1B90A 1KXQA 2XVPA 1OT2A 3W37A 1ISWA 3MS8A 2Z1SA 3AMGA 1KCLA 2EQDA 1QI5A 1QHPA 3PTQA 2D3NA 4WSJA 3SCNA 4ZXOA 3GH5A 1BYBA 1CXLA 2BVTA 4MNKA 4HZ6A 1ZBVA 3VKKA 4UZUA 4P8VA 4WKFA 1J18A 3SUWA 1LJYA 1OD8A 4W7WA 2J7EA 3ZO9A 5LA0A 4CN4A 4MADA 3QHOA 1C7SA 1UD3A 3FAXA 3ARUA 1X6NA 1CGYA 1NM9A 2OWXA 1EHAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4D6I A;  4ATL A;  2YL8 A;  2YJQ A;  4TX8 A;  2WAG A;  4F79 A;  3VIN A;  1E6R A;  5A95 A;  3NJ3 A;  4MPK A;  5IHS A;  1D3C A;  3GNO A;  3MO4 A;  4W7U A;  5CJ5 A;  3CUG A;  3THC A;  3UR8 A;  1FFQ A;  1VJZ A;  1BVN P;  2XJ7 A;  2WZH A;  1W9X A;  4OJY A;  1KR1 A;  4HPH A;  5AYI A;  4OIF A;  1EIB A;  1UWI A;  4UOJ A;  2V3D A;  2ZX9 A;  4QCE A;  1E4N A;  4GZJ A;  2D23 A;  3QHM A;  3WMB A;  4JAW A;  1XD1 A;  3A4X A;  1V3J A;  1H41 A;  1HJV A;  3U57 A;  2CIT A;  2ZUW A;  2DIJ A;  4JKK A;  1WE5 A;  3BAY A;  1E15 A;  3CH9 A;  1UWU A;  1I1W A;  5GPR A;  2Y5E A;  4OZO A;  4W84 A;  3VMP A;  1VBU A;  1H2J A;  2WHL A;  1CEO A;  3VIK A;  4Z2J A;  1C8X A;  1M01 A;  1JYN A;  5GNX A;  3ZQ9 A;  2WHM A;  2FGL A;  5EB8 A;  2DSZ A;  5CSY A;  1FA2 A;  1HJU A;  3BH4 A;  4U5K A;  2CBJ A;  2XSB A;  1E55 A;  2VZO A;  4GI9 A;  3VM5 A;  1CXH A;  4J3X A;  3CHE A;  3W25 A;  1JG9 A;  2WMF A;  1V3L A;  4XB3 A;  2OWW A;  2QMK A;  3SUR A;  1B31 A;  3ZR6 A;  3RJY A;  1VFO A;  4RE4 A;  1BFN A;  5DO8 A;  1RH9 A;  4HA3 A;  4ACY A; 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