1E0X | Genus

Total Genus 128

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	128
sequence length	309
structure length	309
Chain Sequence	AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGRLSDSTYTSIAGREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSSADRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSALRQAMIDHINGVMAHYKGKIVQWDVVNEAFADGSSGARRDSNLQRSGNDWIEVAFRTARAADPSAKLCYNDYNVENWTWAKTQAMYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGAPASTYANVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDSDSWRSEQTPLLFNNDGSKKAAYTAVLDALNGGDSSEPP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
source organism	Streptomyces lividans
publication title	Substrate Specificity in Glycoside Hydrolase Family 10. Structural and Kinetic Analysis of the Streptomyces Lividans Xylanase 10A pubmed doi rcsb
molecule keywords	ENDO-1,4-BETA-XYLANASE A
total genus	128
structure length	309
sequence length	309
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date	2000-04-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00331	Glyco_hydro_10	Glycosyl hydrolase family 10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1e0xA00

4GO8A 1AQ0A 2G4FA 2XVKA 4H8UA 2FHFA 1FA2A 5LA1A 2EPNA 2WNWA 3HU7A 3AHTA 4QDMA 1KXHA 1V03A 2WK2A 3UEQA 2AOSA 1V6WA 3AXXA 1DWHM 1AQMA 1QNSA 4D72A 1V3JA 5D4YA 1Q6CA 2EPOA 3CO4A 2J7BA 2WBKA 2Z1SA 1UA7A 3EDKA 3ZIZA 1GQLA 5GNZA 1Q4NX 2VR5A 2VQTA 3UERA 2ZIDA 3WDQA 2GUYA 4UR9A 1MXGA 3WN6A 2G8ZA 1J0IA 1GNXA 1W1PA 4M80A 2CIPA 2ZE0A 1E71M 1UD4A 2G3IA 2VNCA 2QLYA 1JNEA 5A8PA 4MJ4A 2WCGA 1KBKA 3VMOA 2D3LA 5FL1A 3A3HA 3U5UA 2DEPA 2Z1KA 1W9VA 4JKKA 3WD4A 2UY4A 1J18A 4TOQA 2E4TA 1ZJAA 1QHPA 1HVXA 4PCTA 3CHCA 2O9PA 2EPLX 1IZKA 1KXTA 1E55A 2XYLA 2XHYA 1VJZA 2OWXA 4MJ2A 5LA2A 1V6XA 2DSWA 3MO4A 4YN5A 1JAKA 3WD0A 2C8NA 3K4AA 4UZSA 1HJUA 1JZ6A 1I1XA 3VNYA 3SUVA 3L4TA 1VRXA 3VD7A 1B3XA 3PZTA 5CZKA 1E73M 3AQUA 4JIEA 4AZ6A 3NDZA 3UESA 2D0FA 1Y7VA 3QOKA 3VGFA 2YLLA 1NH6A 3CIVA 4NRRA 3TP4A 4LQ1A 1JYVA 1FFQA 2J79A 4HA4A 3HMCA 1US2A 1WB0A 1MFVA 4EE9A 3WMCA 1UZ1A 3TONA 3IJ8A 1M01A 2YL9A 3GNOA 1SYTA 4CU8A 3WSUA 2E0PA 4CKQA 1KXVA 1NWRA 1MW3A 1JXJA 2AMGA 3RM8A 4PMNA 1E72M 3VD9A 1HJSA 2DSVA 1E40A 3G6MA 5E6YA 3VIMA 2ZXAA 3MS8A 4ZXOA 3WQ4A 2BHUA 3VGHA 1LL7A 2J47A 4LX4A 4KGJA 1XGZA 3PZUA 1KB3A 5CXPA 1MXDA 4OBRA 1C91A 1XRVA 3APGA 2WYSA 2ZUMA 3K8LA 5BROA 1B2YA 3RJXA 2VRJA 3AROA 4CGTA 4MPKA 2O92A 3IAQA 2VCAA 2IXUA 4JHOA 1GHSA 1DWGM 2BY2A 2F61A 2CEQA 3AIWA 3RCNA 4OUEA 1JYXA 4PTWA 2JFEX 1XYFA 5FD0A 3SUTA 3L2LA 4D6JA 3WQ5A 3FXYA 1W9BM 1UUQA 5CGMA 2VX4A 1UH4A 4PBGA 5CSYA 1XH2A 4J3SA 2XUCA 1BYAA 1VFOA 3SEPA 4JFWA 2D24A 1OD0A 1CXEA 3DYMA 1E6QM 3K8KA 3VGGA 3K4DA 4B3KA 1HP5A 2BHZA 4ATDA 1QI5A 3FW6A 4M29A 2V38A 2D1ZA 3BLKA 3AS3A 1IV8A 2WHMA 3BSGA 4W89A 2ZOXA 1VEOA 1H5VA 5BXSA 3F5KA 1E4IA 1ISYA 2JF7A 5IFPA 1M03A 1VFUA 3WIJA 3W37A 1QNQA 3NSNA 3B8SA 3O2LA 5ABGA 4UOJA 5I23A 4GO9A 1J0JA 5IHRA 5IHSA 1X6LA 3FN9A 3KEHA 2DT1A 3QGVA 3QR3A 1M53A 4TVDA 4CVUA 1VENA 4MB3A 1XH1A 2PBGA 1UH2A 3WH7A 1BF2A 1CZ1A 3WF1A 2WKGA 3WEZA 4U33A 3WDRA 2PBOA 4Q7NA 2BHYA 4W7WA 3BMWA 6TAAA 5I77A 4AD1A 5ABFA 2HVMA 3TOPA 4H8VA 3GNPA 4H7VA 3CZKA 3B9AA 3EBVA 1XSIA 4PN2A 4UQAA 3CUGA 2UY5A 2WHJA 1EDTA 1V3LA 1FH9A 1ZBWA 3WDHA 2VQUA 1CYGA 1VB9A 4QCFA 1XCXA 3ARPA 3ZMRA 2X05A 3OA5A 1AMYA 2UY3A 3CZLA 4AD2A 1CXHA 1UWUA 3N13A 2WM0A 3ZM8A 1U2YA 3VPLA 5AC4A 3WUFA 5CQ1A 1B3YA 1TA3B 1CEOA 3DYPA 1JF6A 4GZEA 2W67A 4PMDA 3ALGA 1ZL1A 3RILA 2OYLA 5A6AA 3VIHA 5EB8A 3I3EA 1JI2A 3VIIA 1NOWA 4YHEA 3M6DA 5HPCA 1ISWA 5I24A 1QW9A 1HKJA 1H1NA 4U3AA 4AW7A 4J3TA 3LMYA 3AIUA 3W4RA 2YA2A 3IJ7A 2FHCA 4HA3A 2WVTA 2TAAA 3VIGA 3CZGA 3GTNA 4PMOA 2XWEA 1WDPA 4Q22A 1HJVA 5ECUA 1TVNA 1GJWA 2EPMX 4FLSA 3LPPA 1H09A 2E8ZA 4CU6A 1C90A 2ZX8A 1H2JA 1LG1A 4W88A 2BFGA 3GYCA 3VVGA 3VMPA 2DQXA 4BF7A 1HJXA 3I3BA 3K1DA 4QP0A 1GOWA 3ARXA 1TUXA 1HX0A 3OLIA 1CNVA 5CPTA 1MWOA 3EDEA 4V27A 3RIKA 1HF6A 5HXMA 5CPQA 4CCDA 2J78A 1J12A 1FFRA 3IANA 4W87A 3A47A 3AZTA 5BRPA 2WMIB 3AHYA 1C8XA 2XSBA 2DIEA 3WKZA 1C8YA 1CGXA 4JKMA 1KBBA 1E4MM 3ARVA 1D7FA 3AHZA 2XFFA 4QLLA 2VCBA 4AZBA 3GH4A 3VD5A 2Q8XA 4A3HA 1C8QA 5KZ6A 1JZ8A 1NOUA 2FGLA 1W2VA 1UYQA 3PZVA 2BY1A 1GOKA 4AEFA 4U2YA 1CLVA 4HZ6A 3SCVA 2WVVA 1OBAA 4OZOA 4XX6A 1B3ZA 1E3ZA 4K68A 1V02A 4FF5A 3FHQA 4PMYA 4ATWA 1EDQA 4KGLA 2YL5A 1QHOA 5HOSA 3ZQ9A 3AJ7A 4DUVA 2VURA 1V0NA 1M7XA 2CESA 2QMJA 3UG5A 3SUWA 1B90A 3PN8A 2BS9A 2J7DA 4JKLA 3EMCA 1RH9A 2GK1A 1GOQA 2IXVA 1QI4A 2XJ7A 1LLOA 4HMDA 4JFUA 4IUGA 4WIWA 3RM9A 2X0YA 3ARSA 4JL1A 4HZ8A 3VU2A 2VUYA 5EBAA 3A4XA 3N11A 1NARA 1GQIA 4UFLA 2QF8A 2GJPA 2G3JA 2ZUWA 1KWGA 1ZJBA 5A8OA 4KRTA 2G41A 2GVYA 4OOZA 1K6AA 3N18A 1UD5A 3VM5A 3VGEA 1MVYA 1GJUA 4W8LA 1XSKA 3WD1A 2CYGA 4OKDA 1XV8A 1CLXA 3N9KA 1UR9A 5D9OA 1ZS2A 4QCEA 1FP8A 5FL0A 3SCRA 5A6SA 5CPSA 4F79A 2XVNA 2WVVB 3VDAA 4JCMA 1WZKA 1RP9A 4MTVA 4L4OA 1C93A 5IDIA 4PMXA 2D2OA 3GBDA 3D3AA 3VKKA 3PTMA 2FH6A 2WMFA 1EQCA 2CBUA 4WJXA 4UFJA 1HT6A 2O9TA 2CKRA 1F4HA 2Y5EA 4HMCA 3AYSA 4J3WA 1UWIA 4JL2A 5GNXA 3VX1A 5A6LA 4ZXLA 4DWSB 5E6ZA 3N04A 3UG4A 8A3HA 3UCQA 1TZ7A 2AAAA 3ZSSA 1GPFA 5ABEA 4UQBA 5GQBA 3EMQA 2X0HA 1OCQA 5E0FA 8CGTA 1MW2A 2VZOA 4D6DA 5I78A 4MNLA 5FCZA 1JZ4A 1EOKA 3WL0A 1AQHA 3AHVA 1GONA 3SCNA 4NF7A 4MB1A 3ZSTA 1E0VA 1UWRA 4W8BA 2G3MA 4BQ3A 4UFMA 1JAEA 4IPLA 4HPGA 4OBSA 4CVWA 4GI8A 4UFHA 1JL8A 1UD8A 4RE4A 4D6EA 1WDQA 1WDSA 3WQ6A 3T08A 2EPKX 2ZX6A 1J0ZA 1QBBA 4GPNA 2YIHA 1DTUA 2WKLA 3T0DA 2D23A 5A8QA 4F8XA 3VIKA 1V6UA 1K9TA 3W28A 3AMLA 3GH7A 3CPUA 3M07A 2XVGA 2CNCA 3UR7A 3U5YA 4V28A 4UFKA 2JEQA 1MQPA 3F5LA 4J27A 1E6SM 3MKKA 1BTCA 3WBAA 2CBJA 1CTNA 4HZ7A 3WMSA 3WD2A 2PF0A 4MADA 4ML4A 1P6WA 3CMGA 2XVPA 4M81A 2E9MA 2WCAA 1C92A 1JF5A 2BVYA 4PTVA 5ABHA 1GOMA 2PC8A 1CGUA 4PTMA 4W8AA 3WMBA 2WW5A 4TX8A 4P7NA 3ZJ8A 2NSXA 4JFTA 2GJXB 5JBFA 4LYPA 2CCRA 1E6RA 4B9YA 1QNRA 4AIOA 3QHOA 1B31A 3SUUA 1U30A 4GQQA 1E5NA 5AY7A 4IPNB 5AYIA 3DYOA 3VINA 5D8WA 4CD5A 3WQVA 3QOMA 4C7DA 1BPLB 1W2PA 2WMJA 2X1IA 3IK2A 1UA3A 1W32A 4PRWA 3A4AA 1VIWA 1QI3A 1UHVA 5DO8A 3B9DA 2VR4A 1V3HA 1ZBCA 4F9JA 1XD0A 4A3YA 4M82A 4ZFMA 2J4GA 4JCLA 2CETA 2VL4A 1UKQA 4W84A 2Y8KA 1VFMA 1DHKA 4MAZA 4LXFA 2XGIA 3AZSA 1DWFM 3OG2A 3AICA 2X09A 3W81A 4XB3A 4OJYA 4L4PA 3PZIA 1L0PA 4CD7A 4AD0A 1LL6A 4CCCA 3MUZ1 1GHRA 1WE5A 3PZGA 1H49A 4BA0A 1Z32X 2ZUSA 1W3JA 3WQ8A 1RD6A 1UR1A 1KQYA 4HU0A 2Y4SA 1XD1A 3BCDA 3HJEA 4AZ5A 3WDJA 1J0HA 1JFHA 3LPGA 2FDMA 3BLPX 2YJQA 2VX5A 4B16A 1OM0A 2XSAA 3MSGA 4D6FA 2A3BA 3MMWA 3BC9A 3PZMA 1KR1A 2WSKA 3T0AA 3CUFA 1JDCA 1NQ6A 3EDJA 2BXZA 2YOCA 4AC1X 4C7FA 4HU8A 1OT2A 2DH2A 1TR1A 4PMZA 1WZMA 2V3EA 5JIPA 2W61A 3GBEA 3K46A 1EHAA 1D2KA 3AI0A 3B9EA 4BQ4A 2PB1A 1B1YA 3WENA 4YPJA 3THCA 2JIWA 1NOFA 3WEOA 3MV11 1OGSA 4BQ2A 2EBNA 1HL8A 3AXHA 1TVPA 3VDCA 3N15A 4B3LA 1GW1A 4UCFA 3N1AA 1NWUA 5M3WA 4AIUA 2UY2A 4B9ZA 3SCPA 3W25A 2YL6A 4PSPA 1E6PA 4PUEA 1CECA 4U5IA 2VRQA 4W93A 1SR0A 1BYBA 4CN6A 1SFSA 2WLYA 5DF0A 4UTFA 4MDOA 4EK7A 2PWGA 2CXGA 1E3XA 2ZWYA 1TA3A 1UQYA 2VZTA 2VO5A 2F2HA 1EGZA 1VEPA 4GXPA 1KGXA 1LQ0A 3U7VA 5C8BB 1V08A 1BYDA 3POHA 1R7AA 4LYQA 2WWDA 2A3HA 1G0CA 3GXMA 1QPKA 3CZ8A 4H8HA 5FOOA 1OIFA 3S2CA 1GOOA 4AEEA 1HN1A 2DGAA 3AISA 4GKLA 1PEZA 2QPSA 5JBEA 1ITXA 1E6ZA 5TD4A 5I6SA 1QW8A 2DPEA 4PTXA 5LA0A 4WKAA 1NP2A 3CBWA 4YHGA 1VFFA 2WB5A 3M7SA 1OGGA 4ZENA 2W62A 3CZJA 1R85A 1WKYA 1MW1A 4W5UA 1AVAA 3VOCA 1JXKA 2A3AA 1UWSA 2E40A 5D8ZA 2WZHA 4CN4A 1GUVA 2XGBA 3MUAA 2JE8A 1QOXA 3MANA 1HKMA 1J0YA 4M24A 2WZEA 1HNYA 5FKYA 1W9UA 2C0HA 3VMNA 1JZ5A 1E6NA 4AZIA 1DWIM 4AZCB 1E0XA 4PYSA 1JDAA 4URIA 3U7BA 4PMUA 5I3DA 3CH9A 5EFDA 3MU7A 1W3HA 2ZUTA 1OSEA 1UOKA 3CUJA 4XZBA 1X1NA 2RGMA 3NDYA 2YA1A 4P7QA 1EHNA 2WMIA 4UFIA 2CBVA 4E8DA 2XIIA 3PTQA 3SUSA 3GXDA 1E4LA 1UQZA 1DWAM 2HISA 4M8UA 5JUVA 5E09A 4N42A 5A8MA 3AYRA 5D9PA 4W7UA 4J3VA 5M03A 2ZX5A 2ZUUA 1UG6A 1CGTA 1B30A 1LWJA 1MFUA 4P8WA 1UR2A 4HP5A 1B0IA 1JYWA 2OSYA 3I3DA 3U57A 2WXDM 3WFLA 3WQWA 4UQEA 1W1TA 2J7GA 3T2OA 1IZJA 3WH6A 2V5DA 1WDRA 2PWEA 5DFAA 1JDDA 5KEZA 1RPKA 1JD7A 1KFWA 3GNRA 2E9BA 3UETA 1ISXA 1EO7A 4WSKA 4H04A 2ZX9A 3N12A 3WUEA 2J77A 1US3A 4FLQA 4W85A 2J7FA 5CLTA 3UG3A 1ITCA 2X2YA 1FOBA 3PBGA 2VJXA 3KL0A 4F9DA 2FGZA 3ARQA 2VZSA 3ARUA 1V3IA 3O6AA 4GZJA 2DDXA 1EXPA 5JBDA 2IUZA 2V5CA 2CHNA 1E43A 3FY1A 1UKPA 2PWHA 1FHLA 1A47A 2A3EA 2CHOA 3ZOAA 2ZWZA 1SMAA 2EO7A 2EQDA 3MUY1 2E9LA 3QHMA 1HP4A 3WH5A 1UWQA 2FH8A 2DH3A 2PWDA 5A3HA 5BWFA 4X9YA 1JZ3A 3VGBA 4RE2A 2BVDA 2CITA 4GQRA 3VX0A 3ALFA 4J28A 1ESWA 2WC7A 5I2UA 1J11A 4OOUA 1NM9A 1UKOA 1KQZA 4UQCA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1E0XA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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