1E4LA

Crystal structure of the inactive mutant monocot (maize zmglu1) beta-glucosidase zm glu191asp
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
490
structure length
490
Chain Sequence
MLSPSEIPQRDWFPSDFTFGAATSAYQIEGAWNEDGKGESNWDHFCHNHPERILDGSNSDIGANSYHMYKTDVRLLKEMGMDAYRFSISWPRILPKGTKEGGINPDGIKYYRNLINLLLENGIEPYVTIFHWDVPQALEEKYGGFLDKSHKSIVEDYTYFAKVCFDNFGDKVKNWLTFNDPQTFTSFSYGTGVFAPGRCSPGLDCAYPTGNSLVEPYTAGHNILLAHAEAVDLYNKHYKRDDTRIGLAFDVMGRVPYGTSFLDKQAEERSWDINLGWFLEPVVRGDYPFSMRSLARERLPFFKDEQKEKLAGSYNMLGLNYYTSRFSKNIDISPNYSPVLNTDDAYASQEVNGPDGKPIGPPMGNPWIYMYPEGLKDLLMIMKNKYGNPPIYITENGIGDVDTKETPLPMEAALNDYKRLDYIQRHIATLKESIDLGSNVQGYFAWSLLDNFEWFAGFTERYGIVYVDRNNNCTRYMKESAKWLKEFNTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The Mechanism of Substrate (Aglycone) Specificity in Beta -Glucosidases is Revealed by Crystal Structures of Mutant Maize Beta -Glucosidase-Dimboa, -Dimboaglc, and -Dhurrin Complexes
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE, CHLOROPLASTIC
molecule tags Hydrolase
source organism Zea mays
total genus 192
structure length 490
sequence length 490
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2000-07-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e4lA00
3MV01 4GXPA 1NWTA 2FHFA 5I0DA 3KEHA 1VEOA 4WSKA 4RL3A 1QHZA 4Z2KA 1TVPA 2WPGA 3OGRA 2WNWA 2WSKA 1Z32X 4KWUA 3W26A 4GI9A 1TA3B 1VAHA 3O6AA 1XC6A 1JZ2A 3N13A 5A8PA 1J10A 1E73M 3ZM8A 1TR1A 1U30A 2J77A 3B9DA 3UR8A 4DM2A 5CPTA 4ZFMA 4D6IA 1JZ6A 1UR1A 4EE9A 2JIEA 2TAAA 2O9RA 3AHYA 4UTFA 3WBEA 3N04A 2E9BA 2GJRA 2GJPA 2ZUSA 3SCNA 2BHUA 4M82A 1V3IA 2VO5A 4CN1A 4ZXOA 4J3TA 2J7EA 2ZXAA 5E09A 5M5DA 2ESCA 4MNLA 1E5NA 2XFFA 3POCA 4F66A 3PZTA 3T2PA 1QNPA 4CKQA 1XD1A 3QHMA 4JKKA 1G5AA 1C93A 3FXYA 2W67A 3D5HA 1W32A 2VX6A 2QPSA 4IM4A 4N42A 3RJYA 3GTNA 9CGTA 1JZ4A 2XYLA 1B3WA 3OBAA 2DH3A 2JFEX 3VDCA 4AXNA 3WNLA 5AYIA 2FGLA 3PZOA 1G0CA 4P8UA 1TE1A 1BVZA 2WWCA 1KR0A 5A6BA 1R8LA 3M6DA 4P8XA 4Y7EA 2J4GA 3QHNA 3RILA 2EPOA 2WCSA 2WMIA 5BXPA 1D3CA 5BXSA 2JALA 1HJQA 4W7WA 3WNPA 1U33A 1BTCA 3AFBA 1V3JA 2X09A 4U3CA 1TA3A 4D6FA 1M7XA 2XM2A 5C8BB 1C8XA 1VBRA 3GYCA 2GK1B 2V3EA 1QW9A 2D20A 1EDGA 1HL8A 3ARWA 3AIQA 2OYMA 3WBAA 3VX1A 5I6SA 1GZJA 4X9YA 2CHOA 5A8OA 2DIEA 3WD4A 4PMZA 2WLYA 3CH9A 4HOWA 3WDHA 4UFJA 4HU0A 4PRWA 3SCRA 2VCAA 3K1DA 1E0XA 1VFUA 3ALFA 4GPNA 3VGBA 4LYRA 3MUY1 4S3JA 4WJXA 1HP4A 2WC3A 1VFOA 3BMWA 3ZR5A 5JUVA 4TXEA 2D23A 5A1AA 1V08A 2X1IA 3U7VA 1OBAA 1ZJAA 5I79A 4CD4A 2YDQA 1H09A 4W89A 2D0GA 3WF1A 2XGBA 2XVKA 2FH8A 5CGTA 1MXGA 4AZCB 4FLSA 1Q6DA 4QAWA 2EJ1A 2CNCA 1GPFA 4PMXA 3GH4A 4ATDA 1J0KA 3DC0A 1MQRA 1JL8A 5DMYA 3WELA 3HU7A 4PMRA 1CGYA 1JNEA 4D71A 1QW8A 2XSAA 2VJXA 5I23A 3OLIA 5ABFB 2GK1A 2EPLX 1NH6A 3K4DA 1QI0A 1LWJA 2DSWA 1ZJBA 1BVNP 5EB8A 4DUVA 3VD3A 4WIWA 5A69A 1VF8A 3K8LA 3GXMA 3N17A 2EBNA 2GUYA 4HMCA 1KFWA 2V3DA 4OJYA 1GQLA 4PBGA 3F4VA 5FOOA 1AMYA 2XVGA 2D3NA 2DPEA 1HKIA 2NT1A 2PWHA 4TVCA 3UERA 4XZWA 1UR4A 4PCSA 2Z1KA 2CXGA 2ZICA 3CZGA 1K9TA 3KE0A 1K6AA 2WZEA 5JBDA 4TVUA 1JF6A 4FLRA 1CGXA 1JZ7A 3L4UA 2CKSA 1Q6FA 4AD4A 1EA9C 1PX4A 2IUZA 1E6ZA 1BG4A 3PTMA 2CBVA 4D72A 1LJYA 5GNXA 2ZWZA 3PBGA 4CU8A 1JIBA 2V3GA 4GINA 1V0NA 2E9MA 1CTNA 1DWAM 1C91A 4ZENA 1PJ9A 4Z2LA 4MJ4A 3SURA 5HBFA 1J12A 1XHGA 5TD4A 3T08A 5I3DA 1M01A 3ARZA 5HPOA 2CETA 1JYXA 1W1TA 3WL1A 3ZQ9A 1M03A 4YHEA 4JFSA 1AQHA 2YKKA 4HPGA 4D6GA 1B9ZA 3EMQA 4CVWA 3IJ8A 2YLLA 2VZUA 3WQ5A 1JFHA 1OD0A 1V3HA 4AISA 4C7GA 3PZVA 4AD1A 1P6WA 3M07A 4GQQA 2F8QA 2MANA 1JI1A 4HOXA 2FHBA 2JIWA 3VIIA 4KGJA 1EO7A 1JGIA 2E4TA 2YDSA 4V28A 4UFMA 4E2OA 1WE5A 1EHNA 3CUHA 3N12A 4AD3A 2ZX9A 4YN5A 4F9DA 2BV9A 1SMAA 3BSGA 1F4HA 2PBGA 5AC5A 1UH3A 4UQAA 1HJSA 1UG6A 1MQQA 1XSJA 2ZUUA 1PPIA 4D1JA 3ZJ6A 1JYWA 4X0VA 1TG7A 5CLWA 1WP6A 3QR3A 1KXVA 1BYCA 4QDMA 3SCVA 1G01A 4A4AA 5D4YA 3GBDA 1E55A 1I1XA 4P7NA 3VD5A 2D0HA 1NWUA 3WD2A 1C8QA 1HKJA 4NI3A 4PTMA 3IJ7A 2WVUA 4W85A 5AY7A 1HX0A 1JZ8A 1KR1A 1QI2A 1MW0A 1B3VA 4DWSA 1TZ7A 1HKMA 2XVNA 2XVPA 1QBAA 1EOMA 4MJ2A 3PZQA 1CXLA 2OWCA 3WDPP 3TTSA 2VTFA 4FMVA 1KBKA 5HOSA 3AZRA 1QNSA 1MW3A 3CMJA 1V6UA 4CD6A 3WY1A 1SYTA 3KL0A 2A3BA 2J8GA 3UR7A 1QPKA 1UWUA 2XPKA 2ZIDA 4NSBA 5F7UA 1JI2A 5IHRA 3ARRA 1MFVA 5IFPA 5GPRA 4ZE5A 2J47A 3CHEA 4A3YA 3CZJA 3B9EA 1H4PA 1KCLA 1MW1A 1EHAA 5IDIA 1TMQA 4U33A 4UQDA 1DWIM 2J7FA 4PSRA 3DYOA 3AIEA 2A3AA 1NP2A 2E8ZA 1XSKA 2DQXA 3ARUA 1JD9A 1MWOA 1GJUA 3AICA 1GONA 3HN3A 3M7SA 1WDSA 6TAAA 2WLZA 4CCDA 3ZO9A 5CGMA 3OLGA 8CGTA 1WDRA 1OIFA 4B9YA 5I2UA 1E1FA 2WVTA 4GKLA 2OWWA 3VX0A 3MV11 1H49A 1KQYA 3OZOA 4FF5A 1Q6EA 1OB0A 1XCWA 3GXFA 3ZSTA 3POHA 1BFNA 4Z2HA 3KL5A 2NW0A 2WMGA 3AIUA 3ZOAA 2WZIA 5EBAA 3SCPA 4W87A 3BLKA 4CU7A 4S3KA 4D6JA 3ZJ7A 1UKPA 3EYPA 3VDHA 1ZB5A 4W93A 2CEQA 3WFZA 1JDCA 2WC4A 1US2A 4XUYA 1XSIA 2GDVA 3L4ZA 5D8WA 5ABEA 1UKQA 4QP0A 2G4FA 4KMQA 3W81A 4TTUA 1HIZA 4PMDA 2G3MA 2G8ZA 1HVQA 3F5JA 3T2QA 1A3HA 4H8VA 3WD3A 4TOQA 1V03A 1B3YA 4CU6A 3WSUA 2XSBA 1UR0A 2VCCA 1V6VA 1V6WA 1V3LA 2OSXA 4JCMA 3AIBA 5D9NA 3SCUA 3TTYA 3W28A 2O9PA 4Q7NA 3PZGA 4JKLA 4PMVA 5A3HA 3NUKA 4D6EA 1GOKA 2YLAA 3NSNA 3U57A 1LL4A 2PB1A 3PZNA 2WSPA 4HA1A 4MB4A 3W24A 3A4XA 2W63A 1HJUA 1OT2A 3QGVA 5BROA 2WB5A 1KCKA 4J27A 1BGGA 5FIPA 2XWDA 3WDRA 2BS9A 4EKJA 4HU8A 4V27A 5CPQA 2BVTA 3CZEA 3I3DA 3WN6A 3WUEA 3WH7A 4CN6A 4ACZB 4W7UA 4MB5A 1KGWA 4PEEA 1JF5A 1ZBWA 5CZKA 2G3IA 5E0CA 4P8VA 3CGTA 4TVDA 5FKYA 1E72M 3WNMA 4NZCA 2GVYA 2YL6A 1B3ZA 4WKFA 1VEMA 4ZEPA 2VI0A 4OBSA 3WEMA 1UR2A 2PC8A 4UCFA 1CXKA 2PWFA 3VNZA 4W86A 4NRSA 1UH2A 4GO9A 1E15A 5BYWA 1JAKA 1EO5A 1IZJA 3ZT5A 2VR4A 1MVYA 2CIPA 1JYVA 5ABGA 5DT5A 1HT6A 3VIFA 3VKKA 1B0IA 5IXEA 3WMSA 3WMCA 4U2ZA 4QLLA 3BMVA 4Q22A 2FHCA 5JBFA 5A94A 2XVLA 4H41A 5CSUA 3MO4A 4UQBA 4W5UA 4KGLA 5A8MA 4DWSC 1KBBA 4CVUA 1TUXA 2XM1A 1E56A 2ZXDA 1LL7A 2PWGA 1WPCA 2W92A 1W9DM 2BVDA 3AZSA 4XX6A 4WKHA 2YL8A 1ISVA 2G41A 1VFMA 2EPNA 2VX5A 1W3LA 3AMKA 1LG2A 3WDQA 4M29A 1H11A 2D2OA 4D6CA 1HNYA 2X2YA 5BXTA 3M46A 5EFDA 1CLVA 4OZOA 2UY3A 2UWFA 3MMDA 1GQJA 3ZSSA 1HJVA 1EDQA 3TTQA 4OUEA 3GH5A 1V6XA 2WVSA 2Y24A 3MKKA 4WK9A 3W25A 5DO8A 2XFYA 5BXRA 1UQZA 1EH9A 2XJ7A 1G9HA 2W61A 1GJWA 3THCA 3AHXA 1WZAA 1FP8A 3II1A 5M3WA 4EK7A 2BXYA 1FH7A 1XD0A 1WZKA 2Y8VA 4J3XA 1XGZA 1UOKA 2Y8KA 4URIA 5E6ZA 2CKRA 1V02E 4CD5A 1FH8A 1L0PA 2VR5A 2Y2WA 1OGBA 3FY1A 4CCCA 1KWKA 4MTVA 4AIOA 1J11A 4D6DA 3ZT7A 3EDEA 3PZUA 2EXOA 4AZBA 2ZWYA 4P8WA 3DYPA 2V5DA 4MADA 3GXIA 4M56A 3WIJA 3N9KA 2ZUVA 4ATLA 5A6SA 5BCAA 1UR8A 4JAWA 1S46A 1QHOA 2W5FA 3RDKA 4BCEA 1L8NA 1JDDA 2GFTA 1NQ6A 4GZEA 4A3HA 3BAIA 3I3EA 1J0HA 3NYDA 3SCQA 3FW6A 4WSJA 3AZTA 1NOWA 4UFKA 3VMPA 3U5UA 1VBUA 1UWIA 1UD8A 1CZ1A 1NWSA 1CGWA 1BSIA 5A6AA 4BQ4A 2J79A 2WHKA 3BH4A 3ARYA 1R7AA 2CCRA 2NSXA 3CHDA 2X0YA 5CXPA 3EDFA 1GOOA 4XB3A 4JHOA 3SEPA 2J8FA 2HVMA 4LYQA 3VIPA 1GOMA 1HP5A 2RGMA 3WF3A 4LXFA 4E4PA 2F2HA 2WXDM 3BAYA 3SCSA 1J0IA 3WL0A 1KWGA 4MB1A 5KEZA 7TAAA 4JKMA 2CPUA 1B31A 1WNOA 5A2CA 2A3CA 4BA0A 4CD7A 3CZLA 3BAWA 1H41A 4CCEA 1UA3A 3CPUA 1UH4A 4P7RA 5DFAA 1UZ4A 4DUXA 2OLHA 3I3BA 1HKKA 4U2YA 2WM0A 4AYSA 4J3UA 1UD4A 5LA2A 1EOKA 4W8LA 3VIGA 3AI0A 5BWFA 4J28A 4HTYA 2PWDA 1C7SA 2V3FA 1UZ1A 4PMQA 3AMGA 4AD0A 3UG4A 1R7OA 1O7AA 3WEOA 5BRPA 2WK2A 2A3EA 4AZCA 4BQ2A 3F5KA 3VGDA 2PWEA 2F61A 3WENA 3RO8A 2DT0A 1PZ2A 4J3WA 4ZE4A 4EANA 1VRXA 1PEZA 4JIEA 5A2AA 3SUUA 1E6PA 4H2CA 5ABFA 2J62A 3VGGA 2QV4A 1AQMA 2VVSA 4HMEA 4XZBA 1E6SM 3VVGA 5I24A 2VQTA 3BSHA 2B31A 1VIWA 4QLKA 5E6YA 5I77A 1WDQA 5JBEA 3LPGA 2WMJA 4GI6A 3BAKA 2OSWA 2Y4SA 3SCWA 5A6MA 5FL0A 4AZIA 2WMKA 3OZPA 1UWQA 1N82A 2VZTA 3VNYA 4UQEA 2C7FA 3W37A 1W91A 1CWYA 3PTKA 4W88A 2DIJA 1OD8A 1PX3A 1E0VA 3AISA 3SIMA 1E40A 4QFUA 3VMOA 2DSKA 5D8ZA 5HDRA 1EDTA 3FAXA 3MUIA 1UKOA 1MFUA 1TVNA 3VILA 1QI3A 4CUCA 4PMYA 3N1AA 2DEPA 1YQ2A 3AMLA 3CZKA 4FLOA 2PF0A 1UQYA 1C92A 1V0LA 1Y7VA 4ZXLA 3BXWA 2UY4A 3BCFA 4H04A 1ESWA 3VM5A 1QHPA 2WHJA 3RM4A 1UHVA 1PX8A 1US3A 1WCGA 3DHPA 3MU7A 1HJXA 1HXJA 2C8NA 4H8HA 3WUGA 3ZJ8A 1W1PA 4AZGA 4U5IA 3E1F1 1WO2A 3N18A 3N11A 4PTWA 4X0NA 1UYQA 5FCZA 3J7HA 1ZBCA 1B2YA 2EPKX 4CN4A 3PTQA 2CHNA 1CXEA 2ZXQA 1WAWA 2FDMA 2WC7A 1E6XM 3VIJA 1KGUA 4M80A 3WD0A 4J3SA 4JL1A 1JZ3A 1MQPA 1LG1A 5GQBA 3NDYA 4M1RA 6CGTA 2C0HA 1XCXA 3MMWA 3SUSA 1GORA 1UD3A 3FNDA 1NOFA 4QCEA 4R27A 1A47A 3CUGA 3W4RA 1JYNA 3AMCA 3VM7A 1CEOA 4WF7A 5A6KA 1CENA 1H5VA 2JEQA 2VL4A 3OB8A 3PZ9A 4KH2A 1ODUA 4TX8A 3MUZ1 2HISA 2JEPA 5M03A 1GQIA 1E4LA 1XYZA 1H1NA 1FHDA 4DWSD 3QOMA 3A6OA 1EXPA 3WQ6A 4LQ1A 5AYBA 2CBIA 3THDA 4B15A 1O6IA 1E9LA 4GO8A 1CIUA 2NT0A 4D6HA 3HJEA 4KRTA 1GCYA 2ZOXA 3AIVA 1Q6CA 3IK2A 4D1IA 4PN2A 4MNKA 1QI4A 2DT3A 4PMNA 1H3GA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3MV0 1;  4GXP A;  1NWT A;  2FHF A;  5I0D A;  3KEH A;  1VEO A;  4WSK A;  4RL3 A;  1QHZ A;  4Z2K A;  1TVP A;  2WPG A;  3OGR A;  2WNW A;  2WSK A;  1Z32 X;  4KWU A;  3W26 A;  4GI9 A;  1TA3 B;  1VAH A;  3O6A A;  1XC6 A;  1JZ2 A;  3N13 A;  5A8P A;  1J10 A;  1E73 M;  3ZM8 A;  1TR1 A;  1U30 A;  2J77 A;  3B9D A;  3UR8 A;  4DM2 A;  5CPT A;  4ZFM A;  4D6I A;  1JZ6 A;  1UR1 A;  4EE9 A;  2JIE A;  2TAA A;  2O9R A;  3AHY A;  4UTF A;  3WBE A;  3N04 A;  2E9B A;  2GJR A;  2GJP A;  2ZUS A;  3SCN A;  2BHU A;  4M82 A;  1V3I A;  2VO5 A;  4CN1 A;  4ZXO A;  4J3T A;  2J7E A;  2ZXA A;  5E09 A;  5M5D A;  2ESC A;  4MNL A;  1E5N A;  2XFF A;  3POC A;  4F66 A;  3PZT A;  3T2P A;  1QNP A;  4CKQ A;  1XD1 A;  3QHM A;  4JKK A;  1G5A A;  1C93 A;  3FXY A;  2W67 A;  3D5H A;  1W32 A;  2VX6 A;  2QPS A;  4IM4 A;  4N42 A;  3RJY A;  3GTN A;  9CGT A;  1JZ4 A;  2XYL A;  1B3W A;  3OBA A;  2DH3 A;  2JFE X;  3VDC A;  4AXN A;  3WNL A;  5AYI A;  2FGL A;  3PZO A;  1G0C A;  4P8U A;  1TE1 A;  1BVZ A;  2WWC A;  1KR0 A;  5A6B A;  1R8L A;  3M6D A; 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 1JNE A;  4D71 A;  1QW8 A;  2XSA A;  2VJX A;  5I23 A;  3OLI A;  5ABF B;  2GK1 A;  2EPL X;  1NH6 A;  3K4D A;  1QI0 A;  1LWJ A;  2DSW A;  1ZJB A;  1BVN P;  5EB8 A;  4DUV A;  3VD3 A;  4WIW A;  5A69 A;  1VF8 A;  3K8L A;  3GXM A;  3N17 A;  2EBN A;  2GUY A;  4HMC A;  1KFW A;  2V3D A;  4OJY A;  1GQL A;  4PBG A;  3F4V A;  5FOO A;  1AMY A;  2XVG A;  2D3N A;  2DPE A;  1HKI A;  2NT1 A;  2PWH A;  4TVC A;  3UER A;  4XZW A;  1UR4 A;  4PCS A;  2Z1K A;  2CXG A;  2ZIC A;  3CZG A;  1K9T A;  3KE0 A;  1K6A A;  2WZE A;  5JBD A;  4TVU A;  1JF6 A;  4FLR A;  1CGX A;  1JZ7 A;  3L4U A;  2CKS A;  1Q6F A;  4AD4 A;  1EA9 C;  1PX4 A;  2IUZ A;  1E6Z A;  1BG4 A;  3PTM A;  2CBV A;  4D72 A;  1LJY A;  5GNX A;  2ZWZ A;  3PBG A;  4CU8 A;  1JIB A;  2V3G A;  4GIN A;  1V0N A;  2E9M A;  1CTN A;  1DWA M;  1C91 A;  4ZEN A;  1PJ9 A;  4Z2L A;  4MJ4 A;  3SUR A;  5HBF A;  1J12 A;  1XHG A;  5TD4 A;  3T08 A;  5I3D A;  1M01 A;  3ARZ A;  5HPO A;  2CET A;  1JYX A;  1W1T A;  3WL1 A;  3ZQ9 A;  1M03 A;  4YHE A;  4JFS A;  1AQH A;  2YKK A;  4HPG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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