1E4LA

Crystal structure of the inactive mutant monocot (maize zmglu1) beta-glucosidase zm glu191asp
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
490
structure length
490
Chain Sequence
MLSPSEIPQRDWFPSDFTFGAATSAYQIEGAWNEDGKGESNWDHFCHNHPERILDGSNSDIGANSYHMYKTDVRLLKEMGMDAYRFSISWPRILPKGTKEGGINPDGIKYYRNLINLLLENGIEPYVTIFHWDVPQALEEKYGGFLDKSHKSIVEDYTYFAKVCFDNFGDKVKNWLTFNDPQTFTSFSYGTGVFAPGRCSPGLDCAYPTGNSLVEPYTAGHNILLAHAEAVDLYNKHYKRDDTRIGLAFDVMGRVPYGTSFLDKQAEERSWDINLGWFLEPVVRGDYPFSMRSLARERLPFFKDEQKEKLAGSYNMLGLNYYTSRFSKNIDISPNYSPVLNTDDAYASQEVNGPDGKPIGPPMGNPWIYMYPEGLKDLLMIMKNKYGNPPIYITENGIGDVDTKETPLPMEAALNDYKRLDYIQRHIATLKESIDLGSNVQGYFAWSLLDNFEWFAGFTERYGIVYVDRNNNCTRYMKESAKWLKEFNTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The Mechanism of Substrate (Aglycone) Specificity in Beta -Glucosidases is Revealed by Crystal Structures of Mutant Maize Beta -Glucosidase-Dimboa, -Dimboaglc, and -Dhurrin Complexes
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE, CHLOROPLASTIC
molecule tags Hydrolase
source organism Zea mays
total genus 192
structure length 490
sequence length 490
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2000-07-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e4lA00
5FD0A 2YL5A 2YLAA 2NW0A 2CESA 2CKRA 1MW3A 3T09A 2J74A 1LF1A 3BAWA 2WZEA 3UG3A 1GW1A 2ZXAA 2VZOA 1UR2A 3D5HA 4GPNA 1B1YA 4TVCA 3CZ8A 3VIJA 3RO8A 3CGTA 5FIPA 2X1IA 1UKSA 1XD1A 1E1EA 2G3NA 2DGAA 1J01A 3II1A 1R87A 3BAIA 2WHJA 4HZ6A 3DECA 1EGZA 1JAEA 4PMYA 1B31A 2ZX5A 1HX0A 1CDGA 3GH7A 1Q6EA 1TA3B 2OSYA 1JF5A 5A8QA 4E2OA 2XFYA 1TZ7A 3WELA 3TONA 1UOKA 2WYSA 2ZXBA 3MUAA 4AIUA 1SFSA 1R8LA 3PZVA 3W53A 1MQPA 4CD6A 1PX4A 3OLDA 3W38A 1DHKA 1ZS2A 4M1RA 4AD4A 4MJ4A 3IJ8A 2FHFA 2D23A 3GXFA 3WNKA 2J7BA 1LL7A 1TFVA 4W7VA 1J10A 4Q22A 2D3LA 3ARSA 4Q7NA 2V3DA 3VDHA 4RE2A 5I2UA 4DUWA 1XCXA 3GH4A 3SUUA 3WSUA 3CH9A 1H09A 3U7BA 5CSUA 5EB8A 1OD0A 3IAQA 1E0XA 1WP6A 4Z2LA 1Q6CA 4HZ8A 5CLWA 3AIVA 3ARXA 3WUFA 1HVXA 1OGSA 3VD3A 4PTMA 5D8ZA 2NT0A 1KXVA 1DWIM 2VL4A 1GPFA 1GOWA 4PMDA 1GQLA 3ARRA 3PZOA 2DSWA 5E09A 1EQPA 2CEQA 4JHZA 1VFMA 4HPHA 3EDJA 4XZBA 5BWFA 3N04A 2GJXA 3BAYA 1US3A 2V38A 1CXEA 2CXGA 3N13A 5I23A 1BVZA 4HMEA 1F4HA 3AMGA 1JZ4A 3MV01 2VCCA 1X6NA 1J18A 5I3DA 4ML4A 1QI5A 1VIWA 1VJSA 2DT0A 1CEOA 1HIZA 1E6ZA 4PSRA 2CETA 3EMZA 2WLZA 3JUGA 3VIPA 2VZSA 1E3XA 1K9TA 5A2AA 1JDAA 4WIWA 2ZUUA 1AQ0A 2ZOXA 3F5JA 1WKYA 4CUCA 2O92A 3WL0A 3HN3A 5A8MA 5HXMA 1E5NA 5A6BD 1W1YA 1DEDA 1E56A 2XM2A 4P7NA 1KXQA 3AOFA 4PBGA 4J3SA 1KCLA 4DUXA 2FH8A 1Z32X 2XVKA 3QR3A 4PRWA 3MS8A 1V03A 4OBRA 2BHZA 3MU7A 3U5UA 1FP8A 1V3MA 1B3VA 4AYSA 1ITXA 4TOQA 3DC0A 4PYSA 1W1VA 2J7CA 1C8XA 3O2LA 1UA3A 1TMQA 1TR1A 3VX0A 4UOQA 4MNKA 4D1IA 4MPKA 1CGWA 1O6IA 3W29A 4BQ3A 4HOXA 4OOUA 4NI3A 3VD7A 2VR4A 2XVLA 2W63A 2CPUA 4DM1A 1EIBA 3A3HA 4CN6A 3N15A 2CBJA 1RD6A 3MUY1 4TVDA 3B9AA 3I3BA 1HJSA 1KGUA 1ISZA 4AZ6A 1KCKA 2XM1A 4PEEA 1QNRA 2VX6A 2OSXA 3KL5A 4L4PA 3WQ6A 1ISVA 3AS2A 1OIMA 1GOOA 1GUVA 2JF7A 1K9DA 4UQEA 2BNJA 2IUZA 4P8WA 1EHAA 4HPGA 2CNCA 5D9OA 2VC9A 3E1F1 1V3JA 2JALA 4QLKA 3AMLA 1JDDA 3O6AA 3ARTA 2E9LA 4PN2A 4PSPA 3FHQA 4D1JA 5JIWA 3VD9A 1UD3A 3VM5A 3OLGA 2VVNA 2X0HA 1V3HA 4AZBA 4UQCA 3A4XA 4XB3A 2VQUA 3VIFA 1HP5A 1M04A 3WUBA 1PX8A 1UZ1A 2XPKA 1UH2A 3WDHA 3VD5A 3SCQA 1HKKA 2X0YA 3W37A 3GXIA 3MV11 1LL6A 2UWFA 4W89A 3GTNA 4M82A 4UOJA 2G4FA 2F2HA 1DTUA 4HTYA 4A3HA 3UESA 2WMIA 1FOBA 2XGBA 2ZUMA 4GO8A 1OGBA 3ARPA 3BCDA 1B90A 1KR1A 1B2YA 4OZOA 2EPKX 2YJQA 1UR8A 3WH9A 2VZVA 2YDQA 1VRXA 1C92A 3CMGA 2JEQA 4CN1A 5DMYA 3AXIA 5EFDA 3RILA 4J3UA 3W25A 4AW7A 4D6DA 4M80A 2CBVA 4ZE5A 4MB3A 1JG9A 1UR4A 2WXDM 4TX6A 2IXVA 2J8FA 2YL8A 3DYOA 3VMNA 4F9DA 3SCVA 4CN4A 4AMCA 4JAWA 1H0IA 1BLIA 1UD4A 3PHAA 1EDGA 2XFFA 2WVVA 4TTGA 1QBAA 2WBKA 1E70M 4OIFA 1E4IA 2GJRA 3RM4A 1Q6DA 1GOQA 1JZ8A 2YDRA 1QNOA 1TCMA 3B8SA 1JI2A 5E6ZA 4RL3A 3ZSSA 4JKMA 2XIIA 4P7OA 1OT1A 1J0ZA 5D9PA 2D24A 4IPNB 2GJXB 3VDBA 1HT6A 4C7GA 2EPOA 2WMFA 3KL0A 1H2JA 4IISA 2D1ZA 2CKSA 1H11A 3WNMA 1E40A 2VX5A 1E6RA 4WJXA 1OINA 1N82A 4JFSA 1QW8A 1UA7A 5CLTA 1VFFA 1QNQA 2GUYA 2QF8A 5BXRA 2XWEA 2CYGA 4UQAA 4J3TA 5FCZA 2OWCA 1GCYA 1HL8A 4EK7A 1WDRA 3VU2A 3AIQA 4JFWA 3T2OA 3AHYA 2D22A 3RM8A 3LMYA 4AXNA 1E4LA 5GNZA 5HNNA 2FDMA 2OYMA 5CGTA 1CENA 1DWHM 3BAXA 1B3XA 5IXEA 1PX3A 4KGJA 1IZJA 1QVBA 3VVGA 6CGTA 5C70A 1W9PA 5A1AA 5AYBA 3WNOA 3ZR5A 2JIEA 4JFUA 4H8UA 2DT2A 1V6UA 2XVGA 1EA9C 1NWSA 3AZSA 5HOSA 3OGSA 3GNRA 1HJUA 2PWFA 1JI1A 2ZUWA 5JUVA 5IHSA 4YHEA 2GDVA 4HZ7A 1HF6A 1PPIA 5D8WA 3AJ7A 2FGZA 2V3FA 1CYGA 3RDKA 5M17A 3WNNA 2Q8XA 3WH7A 4AZIA 1C7SA 5JBEA 1I75A 2FGLA 3FN9A 4JKKA 1BYAA 2CIPA 1WZMA 4BA0A 2DH3A 4WKHA 1Q6GA 4PCTA 5GPRA 5E0CA 1V0LA 1W32A 4ACZA 4CU7A 5BROA 1UQZA 3BLKA 1BG9A 4JHOA 5CJ5A 1G0CA 1HL9A 2ZX7A 2WHLA 4GI9A 1MQRA 1LL4A 2GDUA 4J3VA 2ZE0A 1JDCA 4GIAA 2A3HA 4E8CA 4YPJA 5M03A 4PMZA 4JFTA 1CIUA 1KR0A 2PBOA 2YOCA 4H7VA 2EO7A 1JFXA 2WZHA 5D9MA 3OA5A 4TVUA 1W3LA 1YQ2A 4LPCA 2Y2WA 1OCQA 3THCA 5I5RA 1LWHA 2WMGA 3CHFA 1NOFA 4J28A 1BHGA 1AMYA 3VNZA 1CBGA 1V08A 4L4OA 1H0GA 2GSJA 3N1AA 1G01A 3A47A 4NZCA 2DSKA 1LLOA 4W86A 5DO8A 1NARA 4F66A 1H4PA 4AIOA 3ZT5A 3W6MA 5DFAA 3GDBA 3KWXA 2BY3A 4LGXA 1UR1A 2Y5EA 4D71A 5E9AA 4OBSA 1JFHA 3PN8A 3BSHA 2CBIA 4PUDA 3WF4A 2WMIB 4V27A 2G41A 3BLPX 6A3HA 2XTKA 1SYTA 4AWEA 1WZLA 2DDXA 1UKOA 4S3JA 1R85A 3M7SA 1UWIA 1XGZA 1H49A 1GONA 2W91A 2VZUA 4CD7A 4C7FA 1Q4NX 5LA0A 1FFRA 1QI2A 3AIRA 5M3WA 3W26A 1XC6A 1XYZA 4FF5A 1S46A 1UR9A 1V02A 1FP9A 1UHVA 3L4UA 4H2CA 4RE4A 3BH4A 2VCAA 4UQDA 2JFEX 4WKFA 5C8BB 2W61A 3WFZA 3VIOA 1CXIA 3L4VA 4PTWA 1NP2A 3VIHA 1B3ZA 1JXKA 4CD8A 2G3IA 1OD8A 4FK9A 1BSIA 1MQQA 2HVMA 1R86A 5BXPA 1W9BM 2OYKA 1R7OA 1HKIA 4JCLA 4W8LA 4JFVA 1MW1A 3SCUA 2ZUSA 5FOOA 4W93A 1OBAA 5HDRA 5I77A 4DM2A 4W8AA 1RPKA 3G6MA 4UR9A 1CZ1A 3SCTA 3MUIA 4AISA 4XZWA 1JD7A 1X6LA 3CUGA 4FLSA 1JGIA 1V0MA 2QV4A 1ISYA 2XUCA 4QLLA 3AFBA 3VKKA 1AQHA 2ZX9A 4AZ5A 1VFUA 3EDFA 3OBAA 2GJPA 3WD1A 1US2A 3N9KA 3PTQA 4IUGA 1GOIA 1K9FA 3PZTA 3W24A 3WQ5A 1E6SM 3VTRA 4BZYA 3VMOA 1J0HA 1BGGA 5D4YA 1CXFA 2YA2A 4BQ2A 3SCRA 1GZJA 2J78A 2TAAA 3L4ZA 2D0GA 4B9ZA 5I24A 4U5KA 1VFOA 1I1WA 3O9NA 4PMRA 4A3YA 2YLLA 1MWOA 4WF7A 1HXJA 1QI3A 2AAAA 3WF3A 3GNPA 1B0IA 1OWQA 1B3WA 1PZ3A 3KL3A 1BPLB 5F7UA 4K68A 3WFLA 2GFTA 3NDZA 2PWGA 3VIGA 1ZL1A 2D3NA 1I1XA 1WZKA 3CBWA 3WIJA 4M29A 4PTXA 2G3MA 1WDSA 3POCA 4DWSA 2WC3A 3APGA 2ZIDA 5E70A 4M56A 2C0HA 3RJYA 3OZOA 1BGAA 3AS0A 4GO9A 2WB5A 2WKGA 3AYRA 1UQYA 2JEPA 5E6YA 2XVNA 1LJYA 1J0JA 1DP0A 3OZPA 1QI4A 4AEEA 1EDTA 3TTQA 1BFNA 1KQZA 2CHOA 4ZEPA 1Q6FA 1K9EA 1V6WA 1VB9A 2E9MA 4Z2HA 5JBFA 3SEPA 4GXPA 4HU8A 3AMKA 1EOMA 3T08A 1M7XA 3PZNA 4IM4A 2BY1A 4F9JA 5GNYA 3WQWA 4DWSD 1JZ6A 3SCPA 3MMDA 2X05A 3PTKA 2WK2A 1J9YA 1JIBA 1FH7A 1W1TA 5I79A 2WVTA 5HPCA 2WW5A 3CHCA 4XUYA 3VX1A 2BFGA 3B9DA 4GKLA 1KXTA 3T2PA 1BTCA 3FHAA 4AZCA 3W82A 3QHNA 1HKJA 3ZSTA 2J7DA 2FHCA 1WDQA 3UERA 3OLEA 3VNYA 3WD4A 3VGFA 4ZXLA 2XYLA 3AZRA 2VRQA 5DEZA 1C8YA 2JF6A 3T0DA 1TG7A 4D6JA 2YA0A 3ZJ6A 2WCGA 1XV8A 4B16A 1XSIA 2UY2A 2QMKA 2BV9A 2WAGA 4IPLA 1HJWA 1E55A 4GINA 3F4VA 1CXHA 4PMXA 3UG5A 4OUEA 2C8NA 5AYIA 1ITCA 2VVSA 4HA4A 2GK1A 2YL9A 3SCWA 3AROA 3AHXA 4W7UA 1V6YA 2EQDA 4CKQA 4AD1A 3VIMA 2WM0A 5IFTA 4ACYA 4N42A 1VBRA 1CXLA 2ZXQA 4B3KA 1PIFA 3FY1A 4AZ7A 3WF0A 2YBUA 2VOTA 3BGAA 2EPMX 1ZBKA 3W6LA 4EAMA 3POHA 1OT2A 1FH9A 2VURA 4S3KA 1ZBWA 5BXSA 1WAWA 3LPFA 1UWRA 2J7HA 1C93A 2J7FA 1NOUA 1HJXA 3CMJA 3ZMRA 2YDSA 5A8NA 3BAJA 1JNDA 3VO0A 1KFWA 3ZOAA 3WQ4A 3AI0A 3NJ3A 2A3BA 1NWTA 2OSWA 1M53A 3L4WA 1CLVA 3AXHA 2Y8VA 3K4DA 4JL2A 7TAAA 3I3DA 4TXEA 3WD0A 2ZX8A 4LYRA 1XH1A 1W9XA 1QNPA 3AHTA 3WD2A 1SMAA 4AEFA 1JNEA 1UKTA 3TTOA 3NSMA 1VEPA 2DSZA 4GI8A 2MANA 1XH2A 2VUYA 4FLOA 3WY1A 5A6LA 2WCSA 1CGXA 3MKKA 3B9EA 1MW0A 1JZ2A 1JAKA 4CU6A 3SURA 4W7WA 2Y4SA 1F4AA 2O9OA 1W9VA 2WLYA 1IZKA 1BG4A 1NOWA 1VAHA 3HJEA 3ARZA 1E3ZA 1KQYA 4M8UA 4HU0A 3UR7A 4W5UA 4QCFA 3L2LA 3RJXA 5A94A 2JIWA 1G9HA 2OLHA 2VZTA 3A6OA 3WNLA 4E8DA 1CECA 1W3JA 1XHGA 4WSKA 4M24A 1EHNA 2YL6A 4D6HA 3DHUA 1E43A 5ECUA 2DT1A 4FLRA 4QCEA 4U5IA 4TUFA 4NRRA 3RIKA 2J47A 4ZE4A 4KMQA 2EBNA 4AD5A 4J3WA 3GZAA 1K6AA 4DWSB 2VJXA 2W5FA 1OM0A 3TTYA 4LYQA 3AISA 5A8OA 1GQKA 1ECEA 2ZUNA 1OGGA 5A6KA 1M01A 1RP8A 4Y7EA 2VT0A 4QLJA 1TA3A 1FHLA 3NCOA 4WLCA 2WVSA 4UTFA 1ZBVA 2XGIA 4UFJA 1E6NA 3ARQA 5D9NA 4CVWA 3DYPA 1XSJA 1LQ0A 1W2VA 1W9DM 2D20A 1KWGA 2BY0A 4KH2A 1EO5A 2PBGA 1VBUA 1JYWA 4TTUA 1C8QA 3AHVA 3BSGA 1HJVA 1UH4A 4P7RA 4ATWA 4P8UA 2WVUA 4CU8A 1UWSA 4WKAA 1GHSA 4JKLA 5KZ6A 3EMCA 4MB4A 1JZ7A 4HP5A 2XSAA 1IV8A 3ALGA 4AZGA 2DEPA 4HMDA 1PJ9A 3BC9A 3ZR6A 5A95A 3T2QA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5FD0 A;  2YL5 A;  2YLA A;  2NW0 A;  2CES A;  2CKR A;  1MW3 A;  3T09 A;  2J74 A;  1LF1 A;  3BAW A;  2WZE A;  3UG3 A;  1GW1 A;  2ZXA A;  2VZO A;  1UR2 A;  3D5H A;  4GPN A;  1B1Y A;  4TVC A;  3CZ8 A;  3VIJ A;  3RO8 A;  3CGT A;  5FIP A;  2X1I A;  1UKS A;  1XD1 A;  1E1E A;  2G3N A;  2DGA A;  1J01 A;  3II1 A;  1R87 A;  3BAI A;  2WHJ A;  4HZ6 A;  3DEC A;  1EGZ A;  1JAE A;  4PMY A;  1B31 A;  2ZX5 A;  1HX0 A;  1CDG A;  3GH7 A;  1Q6E A;  1TA3 B;  2OSY A;  1JF5 A;  5A8Q A;  4E2O A;  2XFY A;  1TZ7 A;  3WEL A;  3TON A;  1UOK A;  2WYS A;  2ZXB A;  3MUA A;  4AIU A;  1SFS A;  1R8L A;  3PZV A;  3W53 A;  1MQP A;  4CD6 A;  1PX4 A;  3OLD A;  3W38 A;  1DHK A;  1ZS2 A;  4M1R A;  4AD4 A;  4MJ4 A;  3IJ8 A;  2FHF A;  2D23 A;  3GXF A;  3WNK A;  2J7B A;  1LL7 A;  1TFV A;  4W7V A;  1J10 A;  4Q22 A;  2D3L A;  3ARS A;  4Q7N A;  2V3D A;  3VDH A;  4RE2 A;  5I2U A;  4DUW A;  1XCX A;  3GH4 A;  3SUU A;  3WSU A;  3CH9 A;  1H09 A;  3U7B A;  5CSU A;  5EB8 A;  1OD0 A;  3IAQ A;  1E0X A;  1WP6 A;  4Z2L A;  1Q6C A;  4HZ8 A;  5CLW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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