1E4N | Genus

Total Genus 187

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	187
sequence length	489
structure length	489
Chain Sequence	LSPSEIPQRDWFPSDFTFGAATSAYQIEGAWNEDGKGESNWDHFCHNHPERILDGSNSDIGANSYHMYKTDVRLLKEMGMDAYRFSISWPRILPKGTKEGGINPDGIKYYRNLINLLLENGIEPYVTIFHWDVPQALEEKYGGFLDKSHKSIVEDYTYFAKVCFDNFGDKVKNWLTFNDPQTFTSFSYGTGVFAPGRCSPGLDCAYPTGNSLVEPYTAGHNILLAHAEAVDLYNKHYKRDDTRIGLAFDVMGRVPYGTSFLDKQAEERSWDINLGWFLEPVVRGDYPFSMRSLARERLPFFKDEQKEKLAGSYNMLGLNYYTSRFSKNIDISPNYSPVLNTDDAYASQEVNGPDGKPIGPPMGNPWIYMYPEGLKDLLMIMKNKYGNPPIYITENGIGDVDTKETPLPMEAALNDYKRLDYIQRHIATLKESIDLGSNVQGYFAWSLLDNFEWFAGFTERYGIVYVDRNNNCTRYMKESAKWLKEFNTA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	The Mechanism of Substrate (Aglycone) Specificity in Beta -Glucosidases is Revealed by Crystal Structures of Mutant Maize Beta -Glucosidase-Dimboa, -Dimboaglc, and -Dhurrin Complexes pubmed doi rcsb
molecule keywords	BETA-GLUCOSIDASE
molecule tags	Hydrolase
source organism	Zea mays
total genus	187
structure length	489
sequence length	489
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date	2000-07-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00232	Glyco_hydro_1	Glycosyl hydrolase family 1

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1e4nA00

4N0RA 8A3HA 4AZBA 1J10A 3OZOA 3AMLA 4BQ2A 1E0WA 3VU2A 4PUDA 2WHLA 4DWSD 3ZJ7A 4J28A 2IXUA 5A6BD 3VOCA 4KMQA 1H11A 1E0XA 1BVZA 1VJZA 2NSXA 3VD4A 5M03A 4AZHA 3WNPA 2WHMA 1KFWA 3RJXA 4UOZA 3BAWA 1AQHA 1W3LA 1SMDA 5A2AA 1UR8A 4P8WA 3VGEA 5IDIA 3ZO9A 4U3CA 4UZUA 3AHZA 1KB3A 3VINA 3QHOA 1ZS2A 5ABFB 4KRUA 3J7HA 3PZUA 1QI2A 3WH6A 4B3KA 2G41A 4GZJA 3AMGA 5CLWA 3SCQA 5HOSA 3NDYA 1HKIA 4CD6A 3OLEA 1MXDA 2VO5A 3BAXA 3WF1A 4QLJA 1C91A 4PSPA 7CGTA 3PZ9A 5CLTA 3BAKA 2UY3A 1WE5A 2G3IA 2J8FA 5HDRA 1FOBA 3CZKA 3WUFA 4M8UA 3CGTA 3U5UA 1BTCA 1QNRA 3AMKA 3RM8A 3AIEA 2J62A 4L4OA 2AMGA 5IHSA 2XVLA 3WDPP 2X2YA 2W92A 3I3BA 1TR1A 2CBVA 1M01A 3L2LA 4J27A 3W4RA 2ZX5A 1E4LA 3IJ8A 4HP5A 4R5EA 2AAAA 3N12A 2WCSA 1C8QA 2FGZA 1XRVA 3K46A 2J7FA 1GCYA 2OWWA 4HU0A 2PWEA 4LYPA 4HOZA 3KWXA 5A6SA 3A4AA 3WN6A 4GZEA 1UA7A 3F5LA 5DF0A 4PMOA 1B3ZA 2J7DA 3CZJA 5I5RA 4TX8A 3TA9A 4FLQA 2VX7A 4TVCA 1BFNA 3K4DA 5BWFA 2YBTA 3AICA 3VUPA 2XGIA 4ATDA 4AD5A 5AC5A 1QPKA 3DYMA 3AISA 2CKSA 4LYQA 1UZ4A 2EO7A 2JE8A 2VTFA 3HU7A 2DT3A 1U2YA 5JBDA 2VX4A 1UKQA 1UD2A 3VPLA 3TTSA 1SR0A 1CGXA 3WBEA 2O92A 4AISA 3MMWA 2QMKA 4CU6A 2J78A 3BSHA 4Z2IA 5BROA 2DPEA 5AYBA 4PMXA 3POHA 3ZIZA 1CLXA 1ZJAA 2E40A 1WZLA 2GSJA 4W5ZA 1W1TA 1PBGA 3GXDA 3CUGA 5JBFA 5EB8A 1JXKA 3FAXA 3VD5A 4AEEA 3L2MA 5A6LA 5GPRA 1HKMA 2VMFA 1OB0A 2V5CA 1E4IA 3VM7A 3VGBA 3AMCA 4HMEA 3W38A 3A4WA 5M3WA 3GH5A 1ISXA 1UD3A 4L4PA 2W5FA 1G9HA 3ARSA 1UH3A 4NF7A 3CIVA 3FHAA 5LA0A 2WC7A 3WMSA 3K1DA 3F5JA 4MTVA 2YA0A 3EDKA 4AD1A 4M1RA 2ZUNA 1ZU8A 4Y7EA 1NARA 1KWGA 4YHEA 3EMCA 1OT1A 2ZX7A 4FF5A 2J75A 3RJYA 4D71A 1ITXA 1NWUA 2XGBA 4YPJA 3L4WA 4D6CA 5A6MA 1W2VA 2QPSA 5GNZA 3WDHA 2VNCA 1CYGA 2WVUA 4U2ZA 2J79A 3PN8A 4PMQA 3N18A 5E9AA 1K9TA 3VTRA 3QGVA 4DUWA 3O2LA 1EDQA 3WDJA 4W7WA 1EOMA 2OYMA 5D8ZA 2WXDM 3WNKA 2A3EA 2VL4A 1JZ4A 5BCAA 3T2PA 3E1F1 4J3WA 4CCEA 1RH9A 2VQTA 1KXHA 3SCOA 3MUIA 1BYBA 1JF5A 2BVTA 2Q8XA 4M24A 2YLLA 5BXRA 3AYRA 4W89A 4D1IA 4AZGA 2XIIA 3PZGA 3SCTA 1Q6DA 2DSUA 3D3AA 3M6DA 3IAPA 3ZT7A 4UTFA 1KBKA 1KR0A 1C7SA 4UQ9A 2O9TA 5EFDA 1V08A 4MNMA 1OINA 4H7VA 4UQEA 4MAVA 1XYZA 4PMUA 1FHDA 1E3ZA 2EPLX 1FFRA 4AZ7A 1JIBA 1QI5A 1GQIA 3SCPA 3WIJA 4U2YA 3ARPA 2FDMA 9CGTA 1NP0A 2VRKA 4FLSA 2W91A 4QLLA 2PWFA 4HA4A 4JCLA 1U33A 4HOWA 6A3HA 4AYSA 3JUGA 1BYDA 1OIFA 5DFAA 2XFYA 5GNXA 1XSIA 2XYLA 5IHRA 3OLDA 1WAWA 4PMVA 7TAAA 2VX6A 1E71M 3W82A 1R87A 4AWEA 2WZIA 2WWCA 3O6AA 1OIMA 2ZX9A 1GHRA 3W25A 3CHFA 3AHTA 4CCCA 3N13A 2QF8A 3ARYA 3GH4A 5CPSA 2ZX6A 3AYSA 1UKSA 3K8LA 5CGTA 3KL5A 1QW9A 1A47A 4JL2A 1CGVA 1CDGA 1TZ7A 4AD0A 3WQ5A 3WMBA 1NWSA 4WSJA 2C0HA 3TP4A 4B9ZA 4UQCA 2WMFA 4OKDA 1E5JA 4TTUA 4H41A 2J8GA 1NWTA 1UG6A 2WVVA 1CXLA 2VR5A 3PZMA 4HA1A 3MU7A 1J0KA 4AIOA 5GNYA 1H09A 1ISWA 2NW0A 1OGGA 2CIPA 2E9LA 3VMOA 4GO9A 5LA1A 3RIKA 4W87A 2YA1A 3N15A 4PCSA 3WFZA 5F7UA 2BY3A 2VZVA 5CQ1A 1V6YA 1WNOA 1LL6A 2O9OA 1CGUA 1HL8A 1F4AA 1BAGA 1UD8A 3CH9A 2O9RA 2V3DA 1NOFA 2GDUA 1GOMA 2G3NA 1Q6GA 1V0LA 5KEZA 2V5DA 2X05A 3PTQA 3WH9A 2GJXB 5D9NA 3K4AA 3WUGA 2JIEA 2DSVA 4F9DA 2UY5A 3AHVA 4DUXA 2WCGA 5CGMA 4B15A 4PYSA 2G3MA 3THCA 4FLOA 5I2UA 1SFSA 2NT1A 1UOKA 1W9XA 4OOZA 5CZKA 1GONA 5M5DA 3FN9A 1I1WA 3OG2A 2YL9A 1JNDA 1PPIA 1OGBA 3AZTA 4CU7A 1CZ1A 3W6MA 1JAEA 1VF8A 3M07A 1QOXA 1XSKA 1H1NA 2CBIA 1E6PA 2V3EA 3N04A 4UR9A 4AC1X 1ZBCA 2WANA 1HJQA 4Q22A 3OLIA 4KWUA 1KQZA 2JFEX 3ARWA 3TONA 2JF7A 1X6LA 1LL7A 4Q7NA 1MW2A 4JKKA 4P7RA 4S3KA 4LGXA 1VENA 2XVNA 1HJWA 2W63A 4M80A 1MQQA 1QNSA 5DEZA 4AD4A 2YDRA 3ARVA 4UQAA 4UQBA 1NP2A 3BH4A 2GK1B 3MUZ1 4F9JA 4J3UA 2A3CA 3EDJA 2CYGA 3A47A 2Z1KA 2UWFA 4JZ5A 4TXEA 4CD8A 1AVAA 5CSUA 2OSXA 4ACZB 3WNOA 5TD4A 3BCDA 2X8RA 4GI6A 1CNVA 1UUQA 1XGZA 3I3DA 3CZLA 4U5KA 1HN1A 2WZEA 1N82A 3AOFA 1TA3B 3L4YA 4ML4A 2J25A 4W7UA 3QOKA 5ABFA 4JFUA 4P7OA 2JEPA 1G0CA 1QHPA 1US3A 3OGSA 1L8NA 1O6IA 3WNMA 3K8KA 3ZT6A 4A4AA 4WIWA 1DWIM 2CETA 1GW1A 1ECEA 4BA0A 3OZPA 2ZUMA 3SCRA 2V3FA 4GQQA 3CHCA 4M81A 1Z32X 1UWUA 1IZKA 4WJXA 3WNNA 4DWSB 1FP9A 1ZBKA 3GZAA 1JDCA 2QLYA 4RE4A 1QI4A 2D2OA 1UR4A 2B31A 3VIOA 1W9PA 2A3AA 2JIWA 3M7SA 2WM0A 2WHKA 1H49A 1QNOA 1VFFA 4JFTA 1QVBA 1LWJA 1XCWA 3WELA 2XSBA 1W3HA 2CHOA 1YQ2A 2J4GA 5A94A 1CBGA 3KE0A 2VZSA 4J3SA 1RPKA 1QW8A 4MB3A 4HZ7A 3AROA 3OBAA 3VMPA 1GQLA 2A3HA 4A3YA 4PMZA 1KGWA 3A3HA 3AIVA 1UR2A 3APGA 4OBSA 3L4XA 4XUYA 3MSGA 3UG3A 3OA5A 2YKKA 3VDBA 5FL0A 1QBAA 3KL0A 2BS9A 2DEPA 3F4VA 1PJ9A 3WF2A 1UD5A 4D6JA 1E1EA 3O9NA 1E15A 2RGMA 4HMDA 1UH4A 4E8DA 4DM2A 1E55A 4JFWA 3TOPA 2J7CA 1AQ0A 1KXVA 2D1ZA 4QP0A 3NSMA 1VBRA 3UR8A 1XD0A 3ARRA 3ZR6A 1ODUA 2EPMX 4TOQA 1BYAA 1AQMA 1E6ZA 3W37A 4V2XA 1V02E 4CCDA 5JIWA 2VURA 2V38A 2WC3A 4UNIA 2W66A 2D22A 3NJ3A 1WKYA 3VX0A 3PZOA 4V28A 3UG5A 4HU8A 4E8CA 3GM8A 1W9BM 1JZ7A 2VI0A 1VFOA 1K9DA 1NQ6A 3DECA 3VIFA 5D9MA 3WDIA 4IM4A 1B3XA 2WMKA 4X9YA 5IXEA 1R85A 4LXFA 4EAMA 2WLYA 4QLKA 1M53A 4W8BA 1B3VA 1GQKA 1E5NA 5I79A 4QCFA 2CNCA 1E3XA 3L4VA 1TG7A 3FAWA 1EDGA 3WD2A 4OJYA 2VX5A 3WH7A 1U30A 1GOKA 3QHMA 4OUEA 4W7VA 1QNQA 4GZIA 3WEOA 1CENA 3BAIA 1XV8A 4M29A 3ALGA 4PCTA 1EXPA 2PF0A 5EBAA 3MV01 4Z2GA 2W67A 3UETA 2ZWZA 3B9AA 3N17A 4CD7A 4E4PA 2ZXQA 2WMIB 4JL1A 4PSRA 5HPOA 2X0HA 2DH3A 3VNZA 4HPGA 3SIMA 1JZ8A 3MSDA 3SCVA 1W1VA 2ZWYA 1B31A 1E56A 1GVYA 2YDSA 4TX6A 1BQCA 3VIHA 4TVDA 2E8YA 5DO8A 2GDVA 3G6MA 1VJSA 3FY1A 1LG2A 4U33A 1QNPA 1W2PA 2W61A 2WKGA 2EQDA 3SUVA 2PC8A 5JIPA 1E43A 5LA2A 3W24A 3ZSTA 1G1YA 1HVQA 1LJYA 1W3KA 4FMVA 2XWDA 2J7HA 1CEOA 4MADA 2EPOA 1VB9A 5D9PA 4H8VA 2VRJA 2Y8VA 1PIFA 2XSAA 2ESCA 2E8ZA 4BQ4A 1K9FA 3WENA 1UWQA 1I75A 4MNLA 3BSGA 5HNNA 3WUEA 3AJ7A 3WFLA 4ZFMA 1C3FA 1K6AA 1XD1A 3SURA 2VR4A 3ARTA 1OBAA 4AZ6A 1UQYA 2J77A 1JL8A 4AZCB 1US2A 5HPCA 1JYXA 5I23A 3VO0A 1CXKA 4ZE4A 4P8UA 4JAWA 4PRWA 4CVWA 1XSJA 3BLKA 2OWCA 3T2QA 3NUKA 3IJ7A 1DWAM 2CERA 2ZIDA 3GBDA 3AFBA 3GXMA 3PZTA 5CJ5A 1HXJA 2JALA 2EXOA 1UWTA 3AIBA 1E6XM 4JHZA 1C7TA 1GQJA 2VCBA 3W26A 1WDPA 2VUYA 3WKZA 2CEQA 3VILA 1G5AA 3T08A 2GFTA 1XH2A 1E4MM 1WZMA 1JYVA 4XX6A 3MS8A 1I1XA 1UWIA 1A3HA 3VIJA 1ISZA 1V0KA 2XPKA 4N42A 3EDDA 1EQCA 1BLIA 5I6SA 1JDDA 3SCSA 2A3BA 5HBFA 4JFSA 1ZBVA 2DT0A 1FH8A 3ARUA 3II1A 3GNPA 2IUZA 4M56A 3QHNA 3OGRA 2CPUA 1UHVA 1BSIA 1VIWA 3VD7A 1UD6A 4AEFA 1RD6A 1KBBA 2QHAA 3VKKA 3WQ4A 3TTQA 1J11A 2GJPA 1O7AA 4Z2JA 3CMGA 4W93A 3AS1A 5M17A 4HZ6A 1PAMA 4IPLA 4P7QA 4CN6A 1CECA 1WP6A 2XFRA 2NT0A 4W5UA 1WO2A 5A1AA 4FLRA 3W53A 3CMJA 2AOSA 2XWEA 4QAWA 2GJXA 1PZ3A 2GJRA 2PWHA 5BXTA 3IK2A 3OLGA 5A95A 4LPCA 1W1YA 4LQ1A 1DWGM 2EEXA 4HPHA 2X09A 4B16A 3CUFA 4BZYA 1PEZA 4AIEA 2DT2A 5D9OA 4KRTA 4E2OA 4KGJA 3ARZA 3QR3A 1CGWA 4UFIA 5CPQA 2HISA 4MB1A 3CZGA 2E9MA 4OZOA 1JFHA 2PBOA 4W8AA 3AIRA 1R86A 4H8HA 1HVXA 1F4HA 3MUY1 1V3LA 2ZXDA 3NIYA 4ZEPA 2WBKA 2OYLA 5C8BB 2J74A 4CKQA 3LPFA 1GOOA 3BC9A 3T0AA 1GOIA 4J3VA 1TMQA 2CBJA 1FHLA 1UD4A 2EPNA 3VIIA 3T2OA 5BXPA 1TVNA 1UH2A 1CLVA 4GQRA 1L0PA 3EDEA 3BAJA 4H8UA 4JIEA 5AYIA 4P7NA 1BVNP 1HJSA 2BXZA 4NRSA 2DQXA 5E09A 4NSBA 2F2HA 5E0CA 2ZX8A 2ZUSA 4PMDA 2EPKX 2VVNA 2XVGA 3DYOA 5CSYA 3TTYA 1D2KA 4UFLA 3NDZA 4D1JA 2PWGA 2ZUWA 3DHUA 5CPTA 3SUWA 4BQ3A 3A4XA 1TFVA 2BY2A 2GK1A 5IFPA 3EDFA 1HT6A 4WKHA 3AQUA 1YHTA 2F8QA 2YIHA 4DM1A 4W86A 4ZXOA 3AIUA 2WK2A 3BAYA 2W62A 5EMYA 3SCWA 4NI3A 4EE9A 1NOWA 2ZUTA 3MUAA 4ACZA 2WPGA 2PWDA 1X1NA 1LF1A 3T09A 1MFUA 3SUSA 1XCXA 3WY1A 1TA3A 4WKAA 1BGGA 2CITA 3WD3A 1EHAA 4W8LA 1JZ5A 5I77A 1V3MA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1MVY A;  1KQY A;  3WD0 A;  4MDP A;  1UWR A;  1KCL A;  3ZR5 A;  1WDS A;  4MPK A;  5AC4 A;  3ECQ A;  3GYC A;  2BVY A;  4MAZ A;  5JUV A;  2ZE0 A;  1C92 A;  2BV9 A;  2WKL A;  3ZT5 A;  2D3L A;  2J7E A;  1MQP A;  5IFT A;  4DUV A;  4IIS A;  1W32 A;  1E40 A;  1TE1 A;  1DP0 A;  3VNY A;  1JI2 A;  3SCN A;  3U5Y A;  4HMC A;  1HL9 A;  1HKK A;  1LLO A;  1NH6 A;  2WVV B;  3SUU A;  4F66 A;  3CHD A;  3AXX A;  3VX1 A;  1DWJ M;  4AZI A;  4BQ5 A;  4UFJ A;  1UKP A;  3ARQ A;  3AI0 A;  3RM9 A;  2VC9 A;  3HN3 A;  3GTN A;  1GJW A;  3UCQ A;  2FHB A;  4B3L A;  5EFF A;  2MAN A;  1DED A;  3W27 A;  3VIM A;  3L4T A;  2WSP A;  3RO8 A;  5FD0 A;  3EMZ A;  1HNY A;  2D3N A;  1NWR A;  4UFM A;  5BRP A;  3WH8 A;  2DDX A;  2VOT A;  1Q6F A;  1ZBW A;  2DIE A;  1FH9 A;  1JYW A;  4NRR A;  5DT5 A;  2WNW A;  1G01 A;  4JCM A;  1PX3 A;  1EO7 A;  3VDH A;  1Y7V A;  1H2J A;  1UZ1 A;  3WBA A;  3KL3 A;  3S6T A;  1NM9 A;  1H4P A;  1DTU A;  2CBU A;  1EOK A;  1ESW A;  1SYT A;  3NYD A;  3VDC A;  1VAH A;  3N1A A;  4A3H A;  1UR0 A;  1CWY A;  5I24 A;  5C70 A;  3MKK A;  1UR9 A;  1MYR A;  1MW0 A;  3T0D A;  2CXG A;  3UER A;  3CHE A;  3KZS A;  4K68 A;  1OGS A;  1C90 A;  1OWQ A;  2WHJ A;  1VRX A;  4P8X A;  1ZJB A;  3PZI A;  1HJV A;  2WB5 A;  1H3G A;  1XC6 A;  4C7D A;  2E0P A;  2VQU A;  1QI0 A;  1GOQ A;  3G6L A;  2F61 A;  4GIA A;  1B3W A;  4PMY A;  4BF7 A;  4M82 A;  3LMY A;  1GPF A;  5ECU A;  4AZ5 A;  3U7V A;  5LYR A;  4D72 A;  2VJX A;  2GVY A;  1E70 M;  1E6S M;  3HJE A;  3U7B A;  3WQV A;  5FOO A;  5KZ6 A;  1J0J A;  3VVG A;  1H41 A;  1RP9 A;  2WBG A;  1JAK A;  3BGA A;  1UKT A;  3AS0 A;  5I78 A;  3CBW A;  4CD5 A;  1JG9 A;  4YHG A;  1V03 A;  1D7F A;  1CGY A;  2J47 A;  4P8V A;  4X0N A;  3WMC A;  3AZS A;  3UES A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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1E4NA

Total Genus

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