1E4N | Genus

Total Genus 187

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	187
sequence length	489
structure length	489
Chain Sequence	LSPSEIPQRDWFPSDFTFGAATSAYQIEGAWNEDGKGESNWDHFCHNHPERILDGSNSDIGANSYHMYKTDVRLLKEMGMDAYRFSISWPRILPKGTKEGGINPDGIKYYRNLINLLLENGIEPYVTIFHWDVPQALEEKYGGFLDKSHKSIVEDYTYFAKVCFDNFGDKVKNWLTFNDPQTFTSFSYGTGVFAPGRCSPGLDCAYPTGNSLVEPYTAGHNILLAHAEAVDLYNKHYKRDDTRIGLAFDVMGRVPYGTSFLDKQAEERSWDINLGWFLEPVVRGDYPFSMRSLARERLPFFKDEQKEKLAGSYNMLGLNYYTSRFSKNIDISPNYSPVLNTDDAYASQEVNGPDGKPIGPPMGNPWIYMYPEGLKDLLMIMKNKYGNPPIYITENGIGDVDTKETPLPMEAALNDYKRLDYIQRHIATLKESIDLGSNVQGYFAWSLLDNFEWFAGFTERYGIVYVDRNNNCTRYMKESAKWLKEFNTA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	The Mechanism of Substrate (Aglycone) Specificity in Beta -Glucosidases is Revealed by Crystal Structures of Mutant Maize Beta -Glucosidase-Dimboa, -Dimboaglc, and -Dhurrin Complexes pubmed doi rcsb
molecule keywords	BETA-GLUCOSIDASE
molecule tags	Hydrolase
source organism	Zea mays
total genus	187
structure length	489
sequence length	489
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date	2000-07-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00232	Glyco_hydro_1	Glycosyl hydrolase family 1

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1e4nA00

4H41A 5AC5A 1DWHM 4D6HA 4XV0A 1J01A 1FP8A 2G3JA 3WF1A 4AC1X 1XV8A 3W6LA 4X0VA 3AXXA 2J47A 1FHLA 3WY1A 1KCLA 4W7UA 3LMYA 3WD0A 1CXEA 2UY2A 1K9FA 3SCSA 5ABGA 4OKDA 3AIRA 4KGJA 3BAYA 1H49A 4DWSB 1XC6A 5D9OA 1I1WA 4CD6A 1M53A 1K6AA 3WKZA 1UR9A 3VGGA 1VFMA 4EE9A 1QHOA 4D72A 4ML4A 4KGLA 4YN5A 2EPNA 3ZT5A 3ARYA 3DYPA 1E40A 3U5YA 3DECA 4M81A 3UR8A 1GQKA 5ABFA 4DWSD 2XVPA 1C8XA 3OGVA 4B3KA 1HP4A 4LX4A 5E6YA 3N15A 3L4YA 2GJPA 4CD5A 3SUTA 3SCPA 1TVPA 2NSXA 2VCBA 1E73M 1G0CA 1SFSA 3AHVA 2DEPA 4IISA 4H8VA 4GI9A 2XM2A 3GXMA 4LGXA 3TOPA 4PMDA 1FH8A 3AIQA 3T0DA 3AQUA 2WLYA 3SCWA 3F5KA 1CXIA 1E0VA 3BAIA 4AZCA 1HX0A 5FL1A 4AW7A 4D6GA 2PI6A 2AOSA 2UWFA 2E9MA 3W38A 3IANA 4F66A 5ABFB 2J4GA 1NARA 3MMDA 3E1F1 2OSXA 1CTNA 2AMGA 4AIUA 4UQDA 5HPOA 1D7FA 2WVUA 1E5JA 1QHZA 1UZ4A 2ZUSA 1XGZA 3WBEA 3WDJA 2BNJA 5FOOA 2XVGA 2XIBA 4IM4A 2DQXA 2WHLA 3WMCA 2EPKX 5KEZA 3ARWA 3N04A 3WMSA 4W87A 4H8UA 1JIBA 3ECQA 1E9LA 3AIUA 5JBEA 3A6OA 2FHFA 1QW9A 3WIJA 1DWFM 2C7FA 1PX8A 4AZCB 4A3HA 1HKKA 1WDPA 5IXEA 4DUVA 4WK9A 1ISWA 2JIEA 4GI6A 2ZX6A 3F5LA 4OJYA 2Y24A 3LPFA 2PWEA 3IJ7A 2BVTA 1QNSA 1GQJA 3TTYA 3AZSA 3QHMA 5E09A 1AQHA 1V6UA 4AXNA 3UG4A 4D71A 1XRVA 1V0MA 1JYXA 1W32A 1MW2A 4MAVA 4D1IA 3WDHA 3UESA 1UKOA 5HXMA 1WDSA 4D1JA 4BS0A 3WQ5A 4UQEA 4E8CA 3AS0A 3MU7A 5A6BD 4E4PA 3ZQ9A 2FH6A 3EDFA 1B0IA 2VVNA 1UQZA 1S46A 2VRJA 3WDIA 3PZ9A 4P7QA 3WQ4A 1WAWA 1PX3A 2CHOA 2O9OA 3I3DA 2X8RA 4D6FA 1ESWA 1V3HA 5I77A 4ZFMA 2WHMA 4UFHA 1OBAA 1ECEA 4JL2A 1E55A 4JKMA 4EK7A 5I5RA 1F4HA 1VJSA 1R7AA 3ZJKA 3AZRA 3VGBA 2BVDA 5BCAA 1PX4A 1QBAA 4HZ7A 4UFLA 5CG0A 2IXUA 2ZX7A 4MTVA 5IFTA 4CN4A 3T0AA 1VBUA 1UHVA 2VX7A 3VGEA 1E6NA 3RM9A 4WKFA 2ZXBA 3CH9A 2VZOA 3VDCA 2DSZA 1W9DM 1UWRA 1UWQA 4WKHA 1V02E 1JZ2A 4FF5A 3FAWA 2WC7A 2BV9A 1DTUA 2ZUTA 2ZX9A 1UD8A 1HKIA 1EGZA 1GOOA 4HZ6A 1OB0A 5JBFA 3AS2A 2OSYA 1BYCA 3WDPP 3SCUA 4PTVA 4UFIA 3W27A 2Y8KA 3K8KA 3FY1A 3OLIA 3IAPA 1CECA 4CD4A 4OOZA 3B9DA 5A8OA 1MVYA 2VMFA 1BLIA 3WFLA 2BVYA 2YLLA 1QI5A 1BAGA 3EMCA 3VOCA 4BA0A 2PF0A 1V6YA 1E71M 4DUWA 1CEOA 4WF7A 1BVZA 2WM0A 4V27A 4B3LA 5A6JA 1WPCA 1QNQA 3PTKA 4AD0A 1CXFA 1UKSA 4PRWA 1H0GA 3WH8A 4Z2IA 1KQYA 2Y2WA 1UR4A 4Q22A 1JZ5A 1DWIM 4WSJA 3WNMA 1B90A 4KRUA 3BSHA 4MNMA 2D3LA 1O7AA 4FLRA 1ISVA 3WQ6A 3EMZA 3OLDA 5DO8A 4QFUA 3A47A 1W9UA 3DC0A 3POCA 4PUDA 3OB8A 3PBGA 1FH9A 4TUFA 2VVSA 1CGUA 3RM8A 2ZXQA 1JDDA 2WZIA 2GDVA 1HNYA 1BG4A 3VIFA 2O92A 3M46A 5CPQA 1EDQA 4F9JA 2XJ7A 2YL6A 4HPGA 1HT6A 1PAMA 2QPSA 3WL0A 1UD4A 2YJQA 2V5DA 3APGA 6TAAA 4AY1A 3WSUA 3CZLA 5D9MA 4GZEA 5CPSA 4HPHA 5AC4A 3PZTA 3CBWA 1GHSA 3JUGA 4FLSA 2VUYA 4L4OA 3RJYA 5AYBA 1D3CA 3VU2A 4D6EA 1JDAA 4AZBA 2GVYA 4L4PA 1JD7A 3AHZA 3VTRA 2XM1A 4N42A 2XSAA 1CGXA 1EIBA 2J7CA 3CZEA 2BHYA 2E4TA 5BROA 1UYQA 1W1PA 2XVNA 3EDEA 1JNEA 4F9DA 1CGTA 5DMYA 2VZSA 3A4AA 1BYBA 1JD9A 2BY3A 1HXJA 2YLAA 3W25A 3VX0A 2JALA 1UD3A 2D0FA 3MUZ1 5BXPA 1MWOA 4TTGA 2CBUA 1XCXA 3ZIZA 3PHAA 1BSIA 1E1EA 3OLGA 3TONA 4BQ5A 5FKYA 1EA9C 2VC9A 3CUGA 4C7DA 3SCTA 5F7UA 3GXFA 1LJYA 1XCWA 3FHQA 2VO5A 5CJ5A 1EO5A 3VIPA 2CNCA 3WNKA 2CBIA 5FIPA 1C92A 5E6ZA 4QP0A 2DPEA 1H41A 1KXTA 1CXHA 3A4WA 4MNJA 1E0WA 3FAXA 5HNNA 1Q6EA 3KZSA 3NSNA 4UNIA 1TA3A 2A3AA 3CZKA 2E8ZA 4GI8A 1HIZA 4GZJA 5D9NA 2WWDA 3KWXA 1JYWA 1V0LA 3CUIA 3WNPA 4P7NA 3VD9A 1C7TA 2E9LA 4AD5A 4PCTA 5BRQA 1I75A 5HPCA 2W67A 3FHAA 3GXDA 1TUXA 4P7RA 1NWUA 4ATLA 4U2ZA 1EQCA 2WNWA 2ZIDA 4BQ4A 1KGXA 2WSPA 5IFPA 5A1AA 5CGTA 2VTFA 3VIIA 1BGAA 1VF8A 4JFTA 1R86A 5BWFA 4X0NA 3CHDA 1PBGA 4M56A 3ARQA 3GH4A 4GZIA 1TA3B 3ARZA 1XD0A 4B9ZA 1CZ1A 3GZAA 5C71A 4QDMA 1VAHA 2NW0A 5FCZA 2EJ1A 2G3MA 3WEOA 4D6DA 3AZTA 4J28A 2CIPA 3PZOA 5I79A 2WMIA 1GPFA 2QV4A 1UH2A 4R27A 5CLTA 4KH2A 4S3KA 3QOMA 1V6VA 4RL3A 1MQQA 3W37A 1YQ2A 5I3DA 3AIVA 5LA1A 3PZQA 4N0RA 2WPGA 2G3NA 3GDBA 1ZBVA 4KRTA 2WCSA 4JL1A 3UG3A 2XIIA 4V28A 3S2CA 3CHFA 1E6XM 2EO7A 1XSKA 3BCFA 4AZIA 1NM9A 4JFUA 5CSYA 2JIWA 3VM7A 1W9VA 2CERA 5EBAA 1M01A 3WQWA 2F8QA 3ZT6A 3RCNA 3O2LA 2ZWYA 3GNPA 4U33A 6CGTA 2WMIB 5LYRA 4A3YA 1J0YA 2YBTA 1LG1A 4LYRA 3S6TA 4KWUA 2WB5A 2A3CA 3RIKA 4UZUA 4UFMA 4HMEA 2PC8A 2CPUA 5ABEA 3VM5A 3F5JA 5C70A 4CD8A 4UFJA 3VINA 2W66A 3ARUA 2XGBA 3GBDA 2W63A 1E4MM 1JNDA 2BXYA 4C7GA 2WMJA 3M07A 5LA2A 4JIEA 1J0JA 2EPMX 1KXHA 1HJQA 1L0PA 4HOXA 1JZ3A 1KFWA 4GINA 1JFXA 1K9TA 4BF7A 3VPLA 3OLEA 1Q6DA 2D22A 3MUIA 1VFFA 4Y7EA 3VIMA 1H5VA 4MNLA 2DH3A 2PBOA 2EPLX 4GO8A 1B1YA 4WJXA 2YL9A 4AZGA 1EDTA 1H1NA 4UZSA 3M7SA 4RE4A 1UR8A 3OG2A 2YDRA 1UUQA 1U2YA 2XFRA 3SUVA 2C0HA 5BRPA 4Z2LA 2WMFA 1SR0A 4YHEA 1JF6A 4HA4A 1E6RA 1E70M 1R85A 2YBUA 4UR9A 1JAEA 4ZE4A 3AIBA 4AZ7A 1UR1A 1DWJM 3FN9A 2ZXDA 1LL6A 2DT1A 1XD1A 2O9PA 4YPJA 3WF0A 1QNPA 1H11A 4HP5A 4AEFA 1E56A 3QGVA 1E3XA 1DWGM 1LWHA 5I24A 1J11A 2VX6A 4X9YA 2VI0A 2J7EA 3K8MA 4OBRA 2XWDA 5A6BA 1UKPA 2J77A 1R8LA 5EMYA 1SYTA 1J0KA 1G9HA 1HJWA 1LL7A 1JZ4A 3AROA 1MW1A 4W5UA 2OWXA 1ODZA 3N13A 5I23A 2VZVA 1CBGA 4U5IA 2WHKA 1B3YA 4YHGA 5CPTA 1LQ0A 1TFVA 5ABHA 2UY3A 1U30A 4IPLA 1NWTA 4HA3A 2YA1A 4UOJA 3IK2A 4UFKA 3THDA 1OCQA 4DWSC 4NI3A 1ITCA 3D3AA 1MXGA 5GPRA 3OZPA 4UQAA 3SEPA 9CGTA 1ZBKA 3AMGA 4CCDA 3A4XA 3HMCA 2WZEA 2EEXA 1UWSA 1C93A 4TVUA 4WLCA 2Z1SA 3CGTA 2WBGA 3PZGA 1EH9A 1HJSA 4M1RA 2WAGA 2BY2A 3GBEA 1KGWA 2J62A 3W6MA 1GONA 1MYRA 4QLLA 3AS3A 1EOMA 2DT0A 1HVXA 2O9TA 3CO4A 4CU8A 1J0HA 4UQCA 4NSBA 1GCYA 1M7XA 5C8BB 2NT0A 3AISA 1ISZA 4AEEA 1SMDA 2GK1A 3K8LA 1UA7A 4OZOA 3WH9A 4U3CA 4J3VA 5TD4A 1Q6GA 2BY0A 4EKJA 4CU6A 1QI2A 4DUXA 5A94A 2G8ZA 4JFSA 2ZUVA 3GH7A 4ACZA 2YDSA 4GQQA 3ZJ6A 5E9AA 4JCLA 4CN6A 4ZENA 3W24A 3W0KA 6A3HA 2GJRA 3VKKA 1OGSA 1QNOA 2OYLA 3THCA 5DFAA 3MV11 4PSPA 1GQLA 1JYVA 1K9EA 2DSUA 1VIWA 4AZ5A 1HJVA 4WSKA 1NOUA 3D5HA 3WN6A 5IHRA 1X1NA 3NIYA 4UTFA 3SCOA 2GK1B 4W89A 4BQ2A 2V5CA 3NYDA 3PTQA 3II1A 2VL4A 4FLQA 4QCEA 1KR1A 1CGYA 2DSKA 4ACZB 2WVVA 3L4TA 3BH4A 1VRXA 1C91A 5BXRA 4E8DA 1R87A 1KBKA 3CHEA 1UA3A 1PEZA 3WENA 2WMGA 3OGRA 1PIGA 2OLHA 2Y5EA 3W53A 1UKQA 4OBSA 3VMNA 1O6IA 2WWCA 3L4ZA 1LLOA 1ODUA 2WHJA 2IUZA 4QLJA 1MFUA 1CDGA 1E43A 4RE3A 3BAXA 4CVUA 4U3AA 2J78A 1CENA 1BHGA 2CEQA 5LA0A 3PZMA 1MQRA 2B31A 2EXOA 3WF3A 4P8WA 4XUYA 8A3HA 2XSBA 3LPPA 2Y4SA 1GUVA 2YL5A 1HF6A 2YDQA 1NP2A 2HISA 1CLXA 1NOFA 2WVVB 2WK2A 1W2VA 1H4PA 5M17A 2PBGA 2XG9A 2QHAA 2VURA 3N17A 3IJ8A 4JFVA 5EFFA 1XH2A 4Z2KA 1E1FA 2F2HA 1RD6A 2DSVA 4ACYA 3G6LA 1OIFA 4D6JA 5A6AA 5DT7A 3GTNA 4JCMA 1QHPA 4W85A 1FFQA 1HP5A 2CESA 2V3FA 1LWJA 1E0XA 4DM1A 1UG6A 3ARXA 1W1TA 4HOWA 2BHUA 2WSKA 1LF1A 2PWFA 1DWAM 3BMVA 3A3HA 1NH6A 2DGAA 2WW5A 4NRRA 1Q6FA 3WH7A 2VQUA 2Z1KA 1P6WA 3AYRA 1CLVA 4IPNB 2VRKA 3CZ8A 3IJ9A 4XZWA 4AZHA 4PMVA 3WQ8A 1KCKA 1UZ1A 3BCDA 1ZL1A 3QR3A 1RPKA 3RPMA 5A69A 1E6QM 5DT5A 1MW0A 2J7HA 2UY4A 3ZM8A 1QW8A 1CGVA 1MFVA 1CYGA 2MANA 3CUHA 2X05A 3WUBA 1V0KA 1FFRA 3N12A 1E72M 3AXIA 3G6MA 5JIWA 4AD2A 3AI0A 2PB1A 1RH9A 3VD4A 2D3NA 2XPKA 2J8FA 4MNKA 1FOBA 4HU0A 3O9NA 1WDQA 1IZKA 1VEMA 3QHNA 2VCCA 4MB4A 3SCQA 3I3EA 4MDOA 1B31A 3MUAA 3RMEA 1FHDA 4GQRA 1BGGA 3L4VA 4OUEA 2W92A 3GXIA 2WC3A 3SIMA 4NZCA 2UY5A 2QMKA 4ZEPA 4PSRA 3L4XA 4AIOA 1KR0A 4W8AA 4RE2A 1ZBCA 2YL8A 3PZVA 5D8WA 2OSWA 4AD1A 1V02A 1OINA 3T2OA 2PWDA 3TA9A 4CVWA 2D1ZA 1TZ7A 3MMWA 4LQ1A 1J18A 4JZ5A 5CGMA 1BQCA 5M3WA 1QVBA 3AFBA 1EOKA 1BYAA 3FXYA 1GW1A 3AXHA 8CGTA 4TOQA 3SUSA 1XYZA 4LXFA 5A6MA 2JEPA 4W88A 1EO7A 2GDUA 1G1YA 2BY1A 3MUY1 2PWHA 3MMUA 4XB3A 3MANA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1E4NA

Total Genus

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