1E51A

Crystal structure of native human erythrocyte 5-aminolaevulinic acid dehydratase
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
328
structure length
326
Chain Sequence
MQPQSVLHSGYFHPLLRAWQTATTTLNASNLIYPIFVTDVPDDIQPITSLPGVARYGVKRLEEMLRPLVEEGLRCVLIFGVPSRVPKDERGSAADSEESPAIEAIHLLRKTFPNLLVACDVCLCPYTSHGHCGLLSGAFRAEESRQRLAEVALAYAKAGCQVVAPSDMMDGRVEAIKEALMAHGLGNRVSVMSYSAKFASCFYGPFRDAAKSSPAFGDRRCYQLPPGARGLALRAVDRDVREGADMLMVKPGMPYLDIVREVKDKHPDLPLAVYHVSGEFAMLWHGAQAGAFDLKAAVLEAMTAFRRAGADIIITYYTPQLLQWLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Crystal Structure of Human Ala-Dehydratase
rcsb
molecule keywords DELTA-AMINOLEVULINIC ACID DEHYDRATASE
molecule tags Lyase
total genus 96
structure length 326
sequence length 328
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.24: Porphobilinogen synthase.
pdb deposition date 2000-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00490 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1e51A00
3NOEA 3FLUA 3FKKA 4DO4A 3ZR4A 5CKSA 3P81A 2VC6A 1YTKA 2FPYA 1F2JA 3W7JA 4O14A 2Y6ZA 2YXGA 4DXVA 3BG9A 3CWNA 1QCWA 3QSTA 4XUGA 1ZALA 3PBUA 2G97A 3LHTA 3BG3A 4ADUA 4WZHA 3G1HA 1TPB1 3W7GA 3LTSA 3ZS4A 2QUVA 1QWGA 5D32A 4DPQA 3SFKA 2VEKA 4CCCA 5CG7A 1H1YA 2F84A 3MHFA 3UD6A 5I3KA 3TXVA 1OHLA 3S1UA 3W7HA 3BGGA 2ZFAA 4UFJA 1OX6A 3G1YA 5AC8A 2CZ5A 2Y63A 4N2YA 4JN6A 1PCKA 4ICNA 4DO6A 1TV8A 1PE1A 1V5XA 4O1CA 3LI1A 1TRDA 1QPRA 1H7WA 3IVSA 4N9DA 3G18A 3GDRA 1GVOA 4YCOA 2E09A 5ABTA 4DBEA 1XBYA 4CCDA 2VELA 4GJ1A 2CLEA 3P8JA 2WKJA 2V30A 3IIXA 3HGJA 5IBXC 1IIHA 3F4WA 4MYAA 5G4WA 3UPBA 1F76A 3HF3A 3SZ8A 2YCEA 3UWVA 1Q6OA 1VCFA 3TC6A 2VKZG 3W2NA 5AN7A 3IIPA 2GVGA 5KSWA 3LB0A 4NUWA 3MP4A 3LHYA 4OE7A 4ZMGA 4O15A 4DF1A 3NA8A 1S5TA 4XBSA 2ZRWA 1OK4A 4UTUA 3MO7A 2OMAA 5HWMA 4JIPA 2Y7GA 4J9JA 1B57A 2E6DA 1J2WA 3EXSA 5C6MA 3PB2A 2A4AA 3L67A 3I65A 4IX0A 2QCDB 1FCBA 1JCYA 1JRBA 1S5VA 3ABOA 1RQEA 3RF9A 2DZTA 4HNNA 1KLZA 1IF2A 4WOQA 2CU0A 1EIXA 2YW4A 2C6QA 4WD0A 3S1XA 3EX6A 4DF0A 4BWLC 3ZWTA 4LVDA 3KX6A 1KW1A 2FPTA 1TPWA 1VCVA 1ONRA 3NO5A 3W70A 2ABBA 1F5ZA 3A22A 5KITA 3HQ1A 2OZ0A 1PHQA 1ZAIA 2JBMA 4CCEA 1VYSX 3TC7A 4NZFA 4O13A 4RZ6A 1EPXA 1LBLA 3W7PA 1OYBA 3IIVA 1W3IA 3O6YX 1KA9F 5AHIA 2CLLA 2HTMA 3G0XA 1SO5A 3O63A 3M41A 3LCXA 1XC4A 1XDMA 4A3UA 2AAMA 4NXSA 1OF6A 3KOFA 5IM51 1G7UA 3EB2A 2ZA3A 5F2IA 4ADSA 3W7OA 2NWSA 2XFWA 1NF0A 3P61A 2JKPA 1VR6A 3LTPA 2VFIA 4R7JA 5DBUA 1JUKA 2LLEA 4HT3A 5AC6A 3MP5A 3GR7A 3TW7A 2P1FA 2X1UA 3L65A 2EGZA 4UTIA 2NV2A 1I2NA 3L5AA 4ZQNA 3MYPA 1OFPA 2W6RA 3N2XA 4GUJA 5HULA 1EWEA 2CZDA 3P67A 1PIIA 3SJ3A 1SU5A 2QKFA 4UR8A 3C4UA 3NQVA 3GYEA 3QPYA 2ZZ3A 5D37A 3W07A 1KTNA 3E02A 3MHUA 1Q6LA 3ELFA 3HMJG 2ZRZA 4GRSA 1O5KA 1CW2A 1LYXA 1SZGA 3C3NA 5D30A 3NG3A 3GB6A 4DO5A 4DELA 1KM4A 3DZ1A 4AWSA 1IXQA 3GXTA 4UTHA 1YXDA 5CGQA 1H51A 3PR2A 3GDTA 4TO8A 4GNJA 1FDYA 3THQA 1H61A 4IXXA 3N2MA 3HB9A 4CLMA 3GX9A 2H90A 4NJKA 3OEXA 2V2HA 3WFAA 4M7SA 2E5BA 1A5CA 1VLIA 4O4WA 4GC4A 1QPOA 1X7FA 4WY0B 1F6KA 4IX2A 3BLEA 3P7YA 4LTSA 4O50A 4AHPA 5K2ZA 4HHPA 3H55A 4O1AA 4UTTA 3NQMA 1YLVA 3NZRA 1NVMA 1JUBA 2ZZ2A 2QDHA 1WOBA 4ZQCA 2B7NA 1L6SA 2GQAA 1GT8A 1YXCA 1F6PA 2P0OA 1SO3A 3EWUA 1GWJA 1LLWA 4NT0A 1FWWA 2B7PA 2V5BA 4JTFA 3GK0A 1MSSA 4O0ZA 4UMCA 3CWOX 3A5VA 1TPFA 2Y70A 4PEKA 3UNDA 5A8GA 1X1OA 2V82A 3VE7A 4C1LA 4UUIA 3TV8A 3VKJA 2ISVA 4NJJA 3W75A 1WBHA 2GJNA 3B06A 4WJEA 3PVFA 1TTPA 1K8YA 2PC4A 1UASA 4RLIA 4JTGA 3TX9A 5GVJA 4BI7A 1RZMA 4LW7A 1H7PA 1NAL1 1XUZA 3T40A 2WSQA 1XI3A 1MXSA 2ZBTA 4MLRA 3UWYA 5HINA 1WQ5A 1T0OA 2RHGA 1L2UA 3GNNA 5F4XA 1LBMA 1FBAA 4UFKA 3ABRA 3OBKA 4HIBA 1VQTA 4RK8A 3FYOA 1W8SA 1H50A 2QAFA 2VEPA 3W1XA 3E0IA 4JICA 2ZQ0A 3UXAA 1LZOA 4EVZA 1EEPA 5FF7A 1QAPA 3UWWA 2RFGA 2V2CA 5AOUA 3CLMA 3PUOA 4AHOA 1DJQA 2NUYA 1GVQA 4YWIA 5EY5A 1C8VA 5CPLA 3DFOA 1ZJIA 4JY9A 3SSJA 3EXTA 2J9ZA 3HJZA 1KM3A 1SR9A 3M9YA 4YCPA 5C5YA 3HG5A 3L68A 1GVFA 5KMYA 2EPHA 2GPTA 3G1DA 3LGEA 3UWZA 3UWUA 5G2IA 5DELA 3BV4A 3EEGA 1LM1A 3O15A 1BWKA 3S6DA 3L5MA 4M6PA 1BEUA 4QSHA 5DBTA 1ZFJA 1SW7A 1SZFA 3GKFA 4HKPA 2DU2A 1W5PA 2OT0A 3A23A 4Z1BA 1IIGA 1FXQA 2CFFA 1MEWA 1SW0A 4UFHA 1S3HA 4XKYA 2VOMA 4BI5A 1QOPA 1VJIA 2QCFA 2JKAA 5I3HA 3L0GA 4X2RA 3MI3A 4OGZA 3GKAA 2FQIA 2A2IA 3LBMA 1TPH1 4QQ3A 3M43A 1QOQA 1LRNA 2FFCA 4BFAA 5DCBA 1KTBA 2Z6JA 3Q2DA 3G1FA 4GBUA 3KVJA 4LV9A 2ZRXA 4O4VA 4DBDA 5AB3A 5KTLA 3TH6A 3MI6A 1TPEA 3IRDA 2D73A 2TYSA 3DH7A 4ZZ9A 5HUPA 1TCDA 1Q6QA 3TFXA 3LLFA 3KFTA 2FLIA 3BARA 1IXNA 3ZWSA 3QW4B 2CWNA 3WJSA 1GQNA 3M5XA 4NVTA 4ORMA 3TQKA 1H7NA 1AK5A 4I7VA 3S5YA 1R2TA 3WK0A 2QDGA 1WAUA 3QF0A 1R46A 1GEQA 3MMTA 3E49A 3EX3A 3TMQA 4FEZA 3KXQA 4KFPA 4IMGA 3L9CA 2Y62A 2ZTJA 1KTCA 5D2VA 3GR8A 3FFSA 1KFLA 1VCGA 3IVTA 3NPXA 3LHUA 5FF3A 4JX6A 2ZRVA 5I3GA 2RDWA 2FTPA 5IBXA 1OFBA 2HS8A 5KZDA 2KZHA 5BRBA 1LOQA 2C3ZA 2DZVA 3OVQA 1C29A 2ZCGA 3QFEA 1F05A 1M7OA 3OA3A 5AHEA 1DVJA 4QIUA 2DZPA 3TUUA 3N73A 4Y96A 1ICQA 1FQ0A 3MP3A 4K7YA 4H3DA 1IXOA 2W0UA 1RVGA 1QO5A 4UTKA 4BK9A 4QJ1A 3CIXA 4XTDA 2ISWA 5EPDA 1F73A 1QFEA 3PUEA 4TIMA 2DJXA 3LM7A 4EIVA 4JTKA 4JIQA 3FKRA 3JR2A 2BWGA 4I9AA 3W71A 3CM4A 3DFTA 1TTJA 3KRZA 4ONVA 4RX0A 4IPIA 3BK0A 2QCEA 2P10A 1ME8A 3C0JA 1FCUA 4JXCA 1KV8A 3NL5A 4BWLA 4OWGA 4M19A 4GUGA 4HNTA 5K4XA 1D9EA 4M6QA 3HGOA 5U7SA 1ZCOA 3QM3A 1XBXA 4H6KA 3W9ZA 3C52A 4IXHA 1D3HA 3LCGA 5F1UA 3P82A 2O7QA 1WV2A 3LOTA 5K9CA 3N3MA 1HUVA 4NX5A 3EWXA 4AH7A 1G69A 4Z1AA 3RU6A 1SZEA 3EWYA 5EYWA 4HPXA 3O6DA 3FS2A 3TCEA 1QPNA 3R5EA 4LWWA 3W2JA 2NX9A 3DFSA 2H8ZA 4FNQA 1GYLA 4PODA 3QQ0A 4AB4A 1W5MA 1YPIA 3W2MA 1XCFA 3CHVA 4NNAA 3TJLA 3VE9A 5K9DA 4NQ1A 2WPBA 2GQ9A 4FB7A 4JTLA 3OIXA 3PG8A 3H53A 4PTNA 4FX7A 1G67A 1RR2A 3A24A 4JGDA 3L0NA 3UQNA 3O06A 3LRKA 5LHEA 4UFMA 3W7LA 1OYCA 4JTIA 1SSDA 4RJEA 1KBJA 4YL2A 2B0MA 1XDLA 2WOQA 4QNEA 1V7YA 2X30A 1OFAA 2F7FA 1E51A 3C2OA 5DCDA 1TPDA 4AVFA 1FWSA 1JCMP 1GVRA 3S1VA 3KVKA 5LKYA 2JKEA 4I7UA 4WOZA 3VNDA 1TTQA 5DLCA 2CLMA 1Z44A 4IGHA 4Y90A 1P0NA 1X1ZA 2AGKA 4UR7A 2QAPA 5K3VA 1JVNA 3QMTA 4TMBA 4MFDA 4EOUA 3PAJA 4E2DA 2NXHA 3RLUA 3G24A 3DAQA 4P61A 1O4UA 2ZRUA 3G0SA 2A5HA 4KKXA 4FIQA 2GUUA 4N4QA 1EB3A 1KFEA 4OHQA 1Z42A 3C2FA 3E96A 5HWJA 3G22A 1FY6A 4NJHA 1T8XA 4FF7A 3NXFA 4FHAA 1WOAA 3M1ZA 3B0UX 4FIRA 2R91A 1TV5A 3O6CA 5LNRA 5EMUA 3QJAA 4QAIA 2QJIA 5HJLA 1LDCA 3IEBA 2YSWA 1GPWA 2PRHA 3NPUA 3S0CA 4MIMA 1TREA 4UMBA 3QZEA 1FDZA 3BLFA 2C1HA 1I2PA 4WXZA 2X1TA 1ZAJA 4LS2A 2QCNA 1EA0A 4FXSA 1QMLA 5C54A 2DZXA 1YTEA 4ZQRA 3PC0A 2GVJA 1HL2A 2GOUA 4MLJA 4M6VA 3DHDA 4TU1A 3HO8A 2E5CA 3DXIA 3O05A 4UMAA 1DQWA 5TQLA 2NXGA 3MW7A 4LS1A 4MJZA 4LVBA 1TJRA 3DFQA 3DFNA 3HGSA 1DL3A 4A21A 5HWNA 1JQVA 4O11A 4TX9A 2A0NA 1SSGA 4DQWA 1W5NA 4WY0F 3NL6A 3RLVA 3W1MA 1X8FA 1UBSA 4O12A 3NQ2A 1RPXA 1LROA 3S5OA 4PL2A 1ICSA 3PSVA 1VHCA 1RQHA 3Q94A 3SR7A 2O7SA 2Z6IA 4Q33A 3R12A 3TNOA 4GUIA 5DXXA 3TE9A 2E6AA 2C0AA 2JK2A 3EWBX 3DENA 1I4NA 4BF9A 5G1TA 3ZFHA 4N6FA 4LRSA 2ZA2A 2Y85A 5CZSA 1T96A 1W54A 5L6UA 5H2ZA 4Z0SA 1R30A 4FX6M 3C2EA 3QEZA 3W2UA 5BMWA 3USBA 3R89A 2QJGA 1W37A 2FIQA 2XN2A 4WUIA 1M6JA 3L5LA 5D33A 1KM0A 3LBCA 1D3GA 4MZ1A 5G5IA 2Q3RA 4JNMA 2TSYA 3NAVA 3M7WA 3PG9A 3UY7A 4Z1DA 1LOSA 1P1XA 3N19B 4E38A 1YTDA 1KM6A 4RXFA 4DEFA 3NL2A 3DHFA 2PRMA 5FI8A 4JX4A 5CZ0A 3T4CA 3RFAA 3HG2A 2H3DA 1WX0A 4JD4A 2ABAA 5MHBA 2C13A 3BO9A 3CQ0A 2R94A 2QUTA 4UTWC 3W1TA 2YW3A 3NR0A 3RMJA 3NZ1A 3W7EA 4S2CA 2ATSA 2YZRA 4K6AA 3R13A 1I8JA 5T26A 3P5YA 5DCEA 4AMAA 2A21A 2ZZ5A 1JRCA 3DI1A 3P80A 4Z0JA 2BSLA 2E1DA 3HIJA 4A29A 3C8FA 5FESA 3W1UA 4ML9A 3W7CA 1L9WA 3TJXA 3M5YA 3NQ7A 2WSRA 4MKNA 4MZ8A 1U83A 1P0KA 3U8GA 2Y7FA 2GQ8A 5AC7A 1Z41A 4N9EA 4IMCA 1PV8A 5EL1A 1VH7A 4OV4A 3G3DA 1DJNA 1WBJA 4KFNA 1FWRA 1HO1A 1W3TA 3FJLA 3F4NA 4OT7A 3PB0A 1YDOA 4P2VA 1O5XA 5U4NA 3W7IA 2YYUA 1N55A 2QCHA 1YPFA 2FDSA 4JYFA 4JTSA 3N9RA 4K7VA 5E93A 3S1WA 3YPIA 1A53A 3FOKA 4UTMA 4NNCA 3CU2A 2ZTKA 4A2RA 3THAA 5CSSA 1JUEA 3G0UA 3LHWA 4MY8A 3G8RA 1TO3A 2PE4A 3LRMA 3MBFA 3NQAA 1YADA 2C15A 4LU0A 4N6EA 3QMSA 3JS3A 2ATMA 3UZJA 3W85A 4LT9A 4X22A 3L0KA 2NUWA 3P74A 1H7XA 3K30A 1A5AA 3W6YA 1FWNA 4FNTA 1W1ZA 2EAWA 3TDFA 4XWUA 3PS7A 4ADTA 2E68A 2EHHA 2RH9A 2TPSA 3LX9A 3QC3A 3W72A 1ALDA 3IIZA 4FO4A 3LI0A 5AHMA 3BGJA 1RQBA 1O60A 1LLZA 3W1NA 4C1KA 6ALDA 3NQ8A 5F2MA 3W83A 4IMEA 1AL8A 3HOJA 1OFQA 3FYPA 3NQDA 3LCLA 4FNUA 1DBTA 4QM1A 3CEPA 2CLIA 2J24A 3FEMA 2WNQA 1K8ZA 4TR9A 2DZWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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