1E6Q | Genus

Total Genus 196

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	196
sequence length	499
structure length	499
Chain Sequence	EITCQENLPFTCGNTDALNSSSFSSDFIFGVASSAYQIEGTIGRGLNIWDGFTHRYPNKSGPDHGNGDTTCDSFSYWQKDIDVLDELNATGYRFSIAWSRIIPRGKRSRGVNEKGIDYYHGLISGLIKKGITPFVTLFHWDLPQTLQDEYEGFLDPQIIDDFKDYADLCFEEFGDSVKYWLTINQLYSVPTRGYGSALDAPGRCSPTVDPSCYAGNSSTEPYIVAHHQLLAHAKVVDLYRKNYTHQGGKIGPTMITRWFLPYNDTDRHSIAATERMKEFFLGWFMGPLTNGTYPQIMIDTVGERLPSFSPEESNLVKGSYDFLGLNYYFTQYAQPSPNPVNSTNHTAMMDAGAKLTYINASGHYIGPLFEKDKADSTDNIYYYPKGIYSVMDYFKNKYYNPLIYVTENGISTPGDENRNQSMLDYTRIDYLCSHLCFLNKVIKEKDVNVKGYLAWALGDNYEFNKGFTVRFGLSYIDWNNVTDRDLKKSGQWYQSFISP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	High Resolution X-Ray Crystallography Shows that Ascorbate is a Cofactor for Myrosinase and Substitutes for the Function of the Catalytic Base pubmed doi rcsb
molecule keywords	MYROSINASE MA1
molecule tags	Hydrolase
total genus	196
structure length	499
sequence length	499
ec nomenclature	ec 3.2.1.147: Thioglucosidase.
pdb deposition date	2000-08-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
M	PF00232	Glyco_hydro_1	Glycosyl hydrolase family 1

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1e6qM00

4ZE4A 1HP4A 1CGVA 3VDBA 3WDQA 1CZ1A 2J25A 3FXYA 3AISA 1PX4A 4PTMA 3VILA 4UOZA 3GM8A 1E6ZA 4PMRA 3CIVA 4TUFA 1HF6A 1M03A 4W85A 1JAKA 3GBEA 1J0IA 2ZX9A 1CENA 3FW6A 4DM2A 2WCSA 1GJWA 3MKKA 4NSBA 1D7FA 5AY7A 1NP0A 3WH7A 2VO5A 1MYRA 3WH9A 1UHVA 3BMVA 1H41A 4QLLA 2PBOA 2XM1A 1FH7A 1UR0A 3WD2A 2D24A 1UD6A 3CUJA 4GZEA 5D9OA 1VBRA 2YLAA 4M29A 3VMNA 2EPLX 3OZOA 1B1YA 2DSUA 3TONA 4AZ7A 4D6GA 4J3SA 1Q6EA 4W8LA 1VJSA 2YKKA 3WD3A 2W4XA 1R86A 2WHLA 5HNNA 3FNDA 1ISXA 3B9DA 1QHPA 2JE8A 1RD6A 4HA3A 1UD3A 1W2PA 4DM1A 4W7VA 3DHPA 2FHFA 3GDBA 1JYVA 1GOOA 2ZX5A 5AC5A 5FL1A 5LA0A 3N9KA 1HT6A 1JYNA 3VD9A 4D6CA 1QI0A 4F79A 5BROA 1WDPA 1KR1A 4EKJA 2VVSA 4P8WA 1OGGA 1E4MM 2J7BA 4GIAA 2YL9A 4BA0A 5I23A 4BQ3A 2D2OA 1W1VA 1NOUA 4H8VA 1V0MA 1ZJBA 1I1XA 2WVVA 1BF2A 3F5JA 4PCSA 1JDCA 5M17A 3AHVA 3HJEA 4MTVA 3ZJKA 1KGUA 2G8ZA 3W26A 2WMIB 1AMYA 3EBVA 1JZ2A 3SCVA 2GDUA 3W37A 3EMZA 3WNLA 1HKJA 1GVYA 3VIKA 1W3LA 3WDHA 3SUTA 1XH2A 1BVNP 3SIMA 4B16A 3K8KA 1GCYA 3W27A 3OGSA 1HJUA 3A3HA 2C0HA 1UKPA 2ZWZA 2E4TA 4HOZA 1JFHA 1PIFA 4KRTA 4DUVA 4P8UA 3WNKA 1KXTA 2D0GA 5DF0A 2X05A 1V3HA 3GXDA 1UOKA 3MUZ1 1FP9A 2X0YA 1OIFA 1OGBA 5A69A 2QF8A 2WSKA 5E9AA 4W7WA 1C93A 5JUVA 5A95A 5HBFA 2VQUA 2WMHA 1CLXA 4JFSA 1FA2A 5A6SA 3CZJA 2CCRA 1VF8A 4RL3A 5CXPA 1LL4A 3EYPA 3T0AA 1LG1A 2W5FA 4JZ5A 1CEOA 1JYWA 3ZM8A 3ZT6A 5D8ZA 2VX7A 1CGWA 1WKYA 3KL5A 4BF7A 4PMZA 4HPHA 1NWUA 1C92A 4W89A 4MDOA 3WKZA 2CHOA 1MW2A 3WELA 1PX3A 4U33A 5I3DA 4CVUA 4JAWA 4CU6A 4PMNA 3DYMA 3GTNA 2QV4A 5EBAA 4BQ2A 3K4DA 3PZTA 4B15A 1QNOA 4AYSA 1NM9A 2ZUVA 1LF1A 1DWAM 1V3JA 1W2VA 4LYPA 3AMLA 5LYRA 4IPNB 1CDGA 1EHNA 1E1FA 1W9DM 3I3EA 2GJRA 3VIPA 3ARRA 5I2UA 1ZB5A 2J75A 4GO9A 4JL2A 3AZSA 1JZ7A 1UA3A 3T09A 3WQ8A 4UOQA 2XIBA 1W9BM 2D3LA 5JBFA 2CXGA 2YL6A 5A1AA 1E6QM 3AYSA 4J3UA 4MJ2A 4XB3A 4ZXLA 3WMSA 3EMCA 4FF5A 4HOXA 2XG9A 3BLKA 1WCGA 2PI6A 2ZUTA 3AHTA 4HP5A 1TG7A 2W92A 4ATWA 1UKSA 5D9PA 5HXMA 4NI3A 2J78A 1Y7VA 1QW9A 4JFWA 1QI5A 2YBTA 5CPSA 4MB3A 9CGTA 3WF0A 4KMQA 3SEPA 3PZOA 1R7OA 2Q8XA 5BYWA 3QHNA 2OSWA 4AC1X 3RIKA 1JAEA 4UZUA 4J27A 1B2YA 1CGUA 3L4YA 3VX1A 3LMYA 4HA4A 1OT1A 3W82A 1GW1A 3LPFA 4P7QA 3BH4A 4LGXA 1MFVA 4PCTA 3TP4A 2V5CA 3B8SA 4PBGA 2OWWA 3II1A 2WKLA 1QNQA 1W9UA 1E72M 4OBRA 3W38A 1HJXA 3ZJ6A 1YHTA 5A8OA 4X0VA 5JBEA 1BTCA 4OIFA 2NSXA 4UQEA 1JG9A 2DT3A 2BVYA 3OB8A 2WHMA 4JIEA 2VX5A 1QNRA 1UZ4A 1XD1A 4PN2A 4WK9A 3IAPA 4TTGA 1OINA 3ECQA 3MUY1 1DHKA 3CZLA 1UWRA 3WL1A 2VC9A 1XH1A 1EH9A 1TE1A 2XWEA 1R87A 4Z2LA 1V02E 3WUFA 4H8HA 1H0IA 1XCXA 2G3MA 1UA7A 3MSDA 1B90A 5IFPA 4XUYA 1O7AA 1UKTA 2D20A 2E8ZA 2OSXA 3WMBA 1G9HA 3NSMA 1UR9A 8A3HA 4PSPA 3WDPP 3QR3A 1QI3A 4DWSB 3CBWA 1QPKA 4H7VA 3VIOA 1B9ZA 4MB1A 4P7LA 2G41A 4PMYA 2BNJA 3SUVA 3UETA 2DSZA 1CGYA 1J11A 2J62A 4JKMA 3LPGA 1GOWA 4C7GA 1FH8A 4UFMA 1WB0A 1R85A 1GOKA 4HMEA 2WM0A 3M46A 1GOQA 4D72A 3RM8A 3L4ZA 1BG4A 1I1WA 4D6EA 1VFUA 4GO8A 1RP9A 3KZSA 1Q4NX 1G1YA 2WB5A 2WCAA 3MSGA 2PB1A 3PHAA 2VUYA 4AIEA 2EEXA 5IFTA 1WE5A 3OLIA 2BFGA 3VD7A 3G6LA 1QHZA 1XSIA 2J7DA 2WMJA 5ECUA 1XV8A 2XFRA 2E9BA 4JHOA 2WVUA 4GZJA 3SUWA 2DQXA 1MW1A 1BQCA 4B3LA 1PJ9A 4CN4A 3AZRA 4DUWA 4UCFA 2QPSA 4AD4A 2WC3A 1ISWA 5F7UA 2X09A 2ZIDA 5IDIA 3IJ9A 1QBBA 1Q6GA 1C8YA 1KGXA 1HL8A 3CGTA 3F4VA 5CLTA 5EFDA 5GNXA 2YOCA 3WNNA 3VNZA 3ZT7A 2EBNA 1SFSA 1HP5A 3WQ6A 2O9OA 2OYLA 1P6WA 3QHMA 4NRSA 3F5KA 4KH2A 3ARVA 3MMWA 4J3TA 1J12A 1JZ6A 1E15A 5CSUA 1UD2A 4F8XA 1E40A 4TX8A 1NWTA 5D8WA 3ZSTA 1F4HA 3ZSSA 3T0BA 1FFQA 2Y2WA 1XGZA 1VFFA 1DEDA 4NF7A 2GJXB 5I79A 4AD0A 1V6WA 1NOWA 1W1TA 2X2YA 1UR8A 3AS1A 1KQZA 2FH6A 4TXEA 3SCSA 3W24A 3EDDA 2B31A 1G94A 1WAWA 5IHRA 1UH3A 1E71M 1C7SA 4YN5A 3UG4A 2GK1A 3OIHA 2D22A 4A4AA 1H5VA 4KGLA 1E6NA 3AXXA 3B9AA 3GXFA 4QLKA 3GYCA 5D9MA 2ZXAA 2OYMA 3BSHA 1VENA 2WMFA 2IXUA 1NP2A 2VCAA 4L4OA 4D1IA 1KR0A 1CXLA 3WDJA 1B3VA 1BYDA 2WANA 1C8XA 3HU7A 3F5LA 1QHOA 1BGAA 3GH7A 5A6AA 4J3XA 1TA3B 4AZBA 4S3JA 3CHEA 2Y24A 2XVKA 1UQZA 4K68A 4TVCA 1V0LA 4QDMA 4UFJA 1DWFM 1SMAA 2GUYA 4PEEA 3WQ4A 4D6DA 5DT7A 4HZ7A 1PPIA 4AZ5A 1HVXA 2D0FA 1C7TA 4OZOA 1B3ZA 1DWJM 5E6ZA 5CGTA 2Y4SA 3VOCA 2XSBA 5A6LA 4WJXA 2EJ1A 4AD2A 2EPNA 2PF0A 1DWGM 1J0JA 4JFUA 4QP0A 3AMGA 5M03A 2ZX8A 2BVDA 2VR4A 2HISA 3AROA 2VZUA 4QAWA 2DH3A 3PZQA 1PX8A 3SCPA 3AICA 5CPQA 1DP0A 3GZAA 2VURA 1E43A 3IK2A 1H09A 3O9NA 3CZ8A 2XGIA 3OA5A 3ZR6A 2WZIA 2C8NA 3APGA 5A3HA 1UYQA 1US3A 4AW7A 1MQRA 1XYZA 2J7GA 3L4WA 5GNZA 1EIBA 1ITCA 1UWQA 4OJYA 4FLSA 1BSIA 2DIJA 1V3KA 2IXVA 2XPKA 2YDSA 3W53A 1EO5A 2DT2A 1UD5A 3GBDA 3CZKA 4MAZA 4TX6A 1BPLB 1W3HA 2E3ZA 1UR1A 4CD4A 2J7HA 1IZJA 2WVTA 4UZSA 3POHA 1KBKA 1W9XA 2WSPA 1QI2A 1J0KA 3PTKA 3FHQA 2VRKA 2VR5A 3DYPA 4PTWA 1TFVA 1H2JA 2VZTA 3N15A 4MB5A 1KXQA 4W5ZA 1LLOA 2CEQA 4AZIA 4P8VA 3ARYA 1PBGA 1GOMA 1CXHA 2WWCA 1E0VA 1GHSA 1UG6A 1ODZA 4ACYA 5A8NA 1EQCA 3UERA 3VDCA 1KGWA 2CERA 4PRWA 4GKLA 5BXSA 2QMJA 1JXKA 1X6LA 1Q6FA 1ISZA 1J0YA 1V02A 3AIEA 2YJQA 4IUGA 4JCMA 1JZ5A 4MDPA 2JEQA 1LG2A 3AYRA 4HA1A 3N1AA 3T2PA 3UESA 3ZMRA 5I6SA 4W5UA 3AIQA 4OBSA 3A4WA 2BVTA 2J79A 2J7CA 4LYRA 3WUBA 1J10A 1Q6CA 4CVWA 3BLPX 7A3HA 3T2OA 2YDRA 1ZBVA 1GORA 2ZWYA 2D1ZA 5A8QA 4PUDA 3BXWA 3BC9A 2J77A 3PZIA 3UR8A 4AD3A 3IJ8A 3CHCA 1BYAA 1QVBA 1L0PA 3MU7A 4PTVA 2EXOA 2V3DA 1PZ2A 3RO8A 2VRQA 3EDJA 4H04A 1UUQA 4URIA 4MJ4A 4KGJA 3WUEA 2UY2A 4IPLA 4EK7A 1HKMA 3OLDA 2BV9A 2WK2A 1JZ3A 1XRVA 2PBGA 3BAYA 5HPCA 5EB8A 1GJUA 2BY0A 3A4AA 3MO4A 1J01A 3AIWA 3VGHA 1JZ8A 3TTOA 4AZCA 1K9TA 1YQ2A 2Y8KA 5C71A 2CESA 1I75A 4AEEA 2WKGA 3DC0A 4BQ5A 2UY5A 2OWCA 1LWHA 5I77A 4KRUA 4W84A 5IXEA 1BHGA 1W3KA 3FAWA 5DT5A 3A4XA 1JD7A 4HZ6A 2DIEA 1CGTA 3NSXA 2BHZA 4NRRA 1J9YA 4H2CA 2EPMX 1QW8A 3W25A 4GQQA 2E40A 1OWQA 1C3FA 1E4IA 3IJ7A 4YHEA 4ACZB 1IT0A 1OD0A 4F66A 1U2YA 1HN1A 3ALGA 4Q22A 1EA9C 3ARWA 2EPOA 1WP6A 1NWRA 3RMEA 1KB3A 1H3GA 1HKIA 3BAXA 4V28A 5LA2A 1E6XM 3QGVA 4ZENA 3WH5A 1A47A 2VOTA 3AXHA 1B0IA 4P7NA 1KBBA 2OWXA 4UOJA 2WNWA 1OIMA 2WZHA 5JIWA 3LPPA 4RE2A 4U3CA 3WD1A 3DYOA 1EHAA 2WC4A 2XGBA 4JHZA 3WF4A 1ODUA 4WSJA 5JBDA 1EDTA 2WMKA 2XFYA 4D6JA 2JALA 3ARUA 1KCKA 1UD4A 2DSWA 3NYDA 2EO7A 2O9TA 5AYBA 2OLHA 3FY1A 2XIIA 3WNMA 1HNYA 1FH9A 1GVIA 5I78A 1UZ1A 3RJYA 1CIUA 1ZJAA 1D2KA 2YIHA 2DEPA 2W63A 1UR4A 4AEFA 1WZMA 1E5NA 3ARPA 2XJ7A 1E1EA 2EPKX 4UFHA 1JZ4A 3S6TA 1ITXA 5D4YA 4CD8A 1ZBKA 1JNDA 4E2OA 4ZE5A 3AHYA 1DWHM 1V6VA 2JFEX 4WLCA 1M04A 3U7VA 1OBAA 2WXDM 4P7OA 1U33A 2XVGA 4P7RA 4CCEA 3I3DA 3VU2A 5CJ5A 1QNPA 4UQBA 1M01A 1XCWA 5M5DA 1W32A 2YBUA 1O6IA 4R5EA 5BXTA 3SCWA 4ZFMA 1ISYA 4TTUA 2Z1KA 6TAAA 1CXIA 3VGDA 2WMGA 2XHYA 1WDSA 1HX0A 1KWKA 2DSVA 2ESCA 3T2QA 3W6MA 3WN6A 1EQPA 4UFIA 2VTFA 5A6BD 3MV11 2A3BA 2DGAA 5TD4A 3AIVA 2VI0A 4EANA 3KL0A 3ALFA 5A94A 2XFFA 3WL0A 2WHKA 2AAAA 1V3IA 3WY1A 5KEZA 3AMCA 5ABFB 4X0NA 3WBAA 1VFOA 4AISA 5HOSA 3MUIA 4JFTA 1JI2A 3VINA 3CPUA 4AIUA 2F2HA 3SCQA 4CU8A 3SCOA 1OSEA 2G4FA 2E9LA 2CBVA 4B9ZA 1QI4A 2VZOA 2VCCA 3VVGA 4GI8A 3W81A 1HIZA 3ZQ9A 2GJPA 3MS8A 3UG3A 4A3YA 1HXJA 1V03A 1TCMA 3DECA 3SCNA 2BY3A 1E4LA 2MANA 3WNPA 5DO8A 4MNKA 3W4RA 1E4NA 2XSAA 1AQHA 2WMIA 2ZXQA 2W91A 1E6SM 3AI0A 2WZEA 3PBGA 1E70M 3QOMA 4D6HA 1OD8A 4Z2JA 3AIUA 3AMDA 3AQUA 4UFLA 3K46A 2D23A 4D6IA 4QFUA 2DSKA 1DTUA 3VIGA 2PWGA 1C90A 3OZPA 3VIMA 1E55A 4AZ6A 4UR9A 5I5RA 3ARZA 3NCOA 3VPLA 5BWFA 1UR2A 4XZWA 3BGAA 2VX6A 2VVNA 2YA2A 1W91A 1MQQA 3EDEA 4GINA 4CU7A 3WF1A 4LPCA 1LL7A 3THCA 3FAXA 2CETA 4AMCA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4ZE4 A;  1HP4 A;  1CGV A;  3VDB A;  3WDQ A;  1CZ1 A;  2J25 A;  3FXY A;  3AIS A;  1PX4 A;  4PTM A;  3VIL A;  4UOZ A;  3GM8 A;  1E6Z A;  4PMR A;  3CIV A;  4TUF A;  1HF6 A;  1M03 A;  4W85 A;  1JAK A;  3GBE A;  1J0I A;  2ZX9 A;  1CEN A;  3FW6 A;  4DM2 A;  2WCS A;  1GJW A;  3MKK A;  4NSB A;  1D7F A;  5AY7 A;  1NP0 A;  3WH7 A;  2VO5 A;  1MYR A;  3WH9 A;  1UHV A;  3BMV A;  1H41 A;  4QLL A;  2PBO A;  2XM1 A;  1FH7 A;  1UR0 A;  3WD2 A;  2D24 A;  1UD6 A;  3CUJ A;  4GZE A;  5D9O A;  1VBR A;  2YLA A;  4M29 A;  3VMN A;  2EPL X;  3OZO A;  1B1Y A;  2DSU A;  3TON A;  4AZ7 A;  4D6G A;  4J3S A;  1Q6E A;  4W8L A;  1VJS A;  2YKK A;  3WD3 A;  2W4X A;  1R86 A;  2WHL A;  5HNN A;  3FND A;  1ISX A;  3B9D A;  1QHP A;  2JE8 A;  1RD6 A;  4HA3 A;  1UD3 A;  1W2P A;  4DM1 A;  4W7V A;  3DHP A;  2FHF A;  3GDB A;  1JYV A;  1GOO A;  2ZX5 A;  5AC5 A;  5FL1 A;  5LA0 A;  3N9K A;  1HT6 A;  1JYN A;  3VD9 A;  4D6C A;  1QI0 A;  4F79 A;  5BRO A;  1WDP A;  1KR1 A;  4EKJ A;  2VVS A;  4P8W A;  1OGG A;  1E4M M;  2J7B A;  4GIA A;  2YL9 A; 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1E6QM

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