1E6Q | Genus

Total Genus 196

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	196
sequence length	499
structure length	499
Chain Sequence	EITCQENLPFTCGNTDALNSSSFSSDFIFGVASSAYQIEGTIGRGLNIWDGFTHRYPNKSGPDHGNGDTTCDSFSYWQKDIDVLDELNATGYRFSIAWSRIIPRGKRSRGVNEKGIDYYHGLISGLIKKGITPFVTLFHWDLPQTLQDEYEGFLDPQIIDDFKDYADLCFEEFGDSVKYWLTINQLYSVPTRGYGSALDAPGRCSPTVDPSCYAGNSSTEPYIVAHHQLLAHAKVVDLYRKNYTHQGGKIGPTMITRWFLPYNDTDRHSIAATERMKEFFLGWFMGPLTNGTYPQIMIDTVGERLPSFSPEESNLVKGSYDFLGLNYYFTQYAQPSPNPVNSTNHTAMMDAGAKLTYINASGHYIGPLFEKDKADSTDNIYYYPKGIYSVMDYFKNKYYNPLIYVTENGISTPGDENRNQSMLDYTRIDYLCSHLCFLNKVIKEKDVNVKGYLAWALGDNYEFNKGFTVRFGLSYIDWNNVTDRDLKKSGQWYQSFISP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase
publication title	High Resolution X-Ray Crystallography Shows that Ascorbate is a Cofactor for Myrosinase and Substitutes for the Function of the Catalytic Base pubmed doi rcsb
molecule keywords	MYROSINASE MA1
total genus	196
structure length	499
sequence length	499
ec nomenclature	ec 3.2.1.147: Thioglucosidase.
pdb deposition date	2000-08-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
M	PF00232	Glyco_hydro_1	Glycosyl hydrolase family 1

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1e6qM00

5ABGA 3VD7A 5LYRA 1JZ8A 3WF4A 3RO8A 2W92A 4ZE5A 2J7CA 1UWTA 3F5JA 1H11A 4W85A 3W24A 3BSGA 1W9PA 1HJQA 1QW8A 4HMCA 2DIEA 4PRWA 4CD4A 3SCVA 3ARUA 3VKKA 1W3KA 3ARQA 4XZWA 5A6JA 2WNWA 2VOTA 5M3WA 1XV8A 2XPKA 1NOUA 2EO7A 3AHTA 2Y24A 4GZJA 2YL8A 3VM5A 3SUTA 4W93A 2TAAA 3AS1A 1OBAA 4PCSA 1HVQA 3VOCA 4HZ6A 2GJRA 4JCLA 4GQQA 1GHRA 4Q22A 1LL6A 1O7AA 3AIUA 4W7VA 5HNNA 3AIVA 3N18A 3SURA 1RD6A 2DDXA 5D4YA 2OWCA 3ZSSA 1UZ1A 4HA4A 2W66A 2ZWYA 4UQDA 4BQ5A 1WP6A 5DF0A 3W27A 2WVUA 4MB1A 4WKFA 2DIJA 4CGTA 4H8UA 2XSAA 4X0VA 1V0KA 2WMHA 3W25A 3RILA 4CCDA 3I3DA 3CMGA 1F4AA 1UKSA 1CGWA 3IJ7A 1WDPA 4CN1A 4GO8A 1WDQA 1UD2A 3NIYA 4AIEA 4BS0A 3LPGA 4CD5A 3K8KA 1UZ4A 4UFJA 1TG7A 4KRTA 3ZT7A 6TAAA 1MXGA 1OGBA 4MDOA 5FD0A 1OWQA 3GZAA 3U7VA 1NOFA 3WBEA 1J12A 1HVXA 2XSBA 4PYSA 4AZIA 4CN4A 1KQYA 3N1AA 1HX0A 3AIRA 4IM4A 3W29A 8A3HA 4DUWA 1FFRA 1VFFA 1CZ1A 3OGSA 1W1PA 4LPCA 3O9NA 4RE3A 4XX6A 3EYPA 3AXXA 2CKRA 1ZJAA 4J28A 1KCKA 5IFPA 4AD5A 1OGSA 4E4PA 3WIJA 5BRQA 1CBGA 4JAWA 3VGDA 1E71M 3CZJA 4TTUA 2QMJA 2BHZA 4P8XA 1X1NA 2DEPA 2ZUVA 1CXFA 1EDTA 3LPOA 3FAWA 1WZLA 1J0IA 2HISA 3NDYA 3IAPA 4W8LA 2W5FA 1WNOA 4BQ3A 3CMJA 3WMBA 1WO2A 1QOXA 4KGJA 2YLAA 3RMEA 2WBGA 5EFFA 3DHPA 3AHXA 5AC5A 3AHVA 2VJXA 3SCSA 3VMNA 3AISA 1D7FA 1GNXA 1CDGA 3WQ5A 2CNCA 4TVCA 3O6AA 3EDFA 2YA1A 3W0KA 4L4PA 2J47A 5ABFA 3VGFA 1GOIA 1H1NA 3CUHA 5GNXA 5LA1A 1S46A 3ARTA 1JZ4A 3UG4A 4LGXA 5FKYA 4UZUA 1CXLA 3AXHA 4F9DA 3RCNA 1WZMA 1NM9A 4F9JA 1B31A 3SUWA 1JFHA 2XGBA 3AYRA 2PC8A 2CETA 1OT2A 1E6PA 3GH7A 1R85A 3RDKA 3NUKA 1EOKA 2BVTA 3FW6A 5AC4A 3LPFA 1QBAA 3BC9A 3ARZA 3SCPA 1B3ZA 5DO8A 5A2AA 3ZJ7A 1MQQA 4YHGA 1ODZA 2XFRA 8CGTA 1UA7A 3WNOA 2VL4A 4WKHA 1MW3A 1C8QA 5CPSA 5JUVA 4WF7A 1XRVA 4WK9A 3WQ8A 3ARSA 1GZJA 3UEQA 4EKJA 3QHNA 3WNLA 1CYGA 2DH3A 1JI2A 2E9MA 3BCFA 3N15A 1JYWA 2J62A 2W4XA 1J11A 4RE4A 3B9EA 4U33A 5ECUA 5E0FA 3RJXA 3VIFA 3SCOA 3PZUA 1J0KA 1GW1A 1FH9A 3FHQA 2PBGA 4FLQA 3SIMA 3OBAA 3QOMA 4E8DA 3VTRA 1UUQA 4AZHA 2VRJA 3LPPA 4E2OA 1KGXA 3MMUA 1JDDA 3VX0A 3ALGA 3QHOA 1HJSA 4UZSA 4OOZA 2W63A 4D6DA 1EA9C 2A3CA 1EO5A 3ZJKA 5CQ1A 4GIAA 1UKPA 1KCLA 4D6HA 5D9NA 5HXMA 1ZBWA 3UESA 5JIWA 3WDRA 1XSJA 4LXFA 1JI1A 4DWSC 3VMOA 2ZUNA 3WN6A 3TOPA 2VMFA 4AIUA 2E9LA 5FOOA 5BCAA 3I3BA 3AS0A 3WNMA 1JZ5A 1H49A 3A4AA 1UOKA 2VVSA 3F5KA 1KR0A 1SMDA 1CEOA 2J75A 3N13A 2YL6A 5DEZA 1WB0A 3VDHA 1TUXA 1L8NA 2UY4A 3W4RA 1HJWA 3BAJA 3RJYA 3VM7A 1HL9A 1GQLA 4FK9A 4J3TA 1AMYA 1TCMA 3VGBA 4AZ6A 1E4IA 4AY1A 3L4ZA 3NSNA 4U31A 1W1TA 3WDPP 4F8XA 4HZ7A 1XCWA 4PMUA 1WZAA 2GK1B 3AZRA 4AMCA 3DHUA 1BVZA 2WWDA 2WPGA 3A4XA 2BVYA 1MWOA 3IK2A 3B9AA 4U2ZA 4GZIA 1KFWA 1UH3A 4V28A 1D2KA 1GOQA 2GVYA 4C7DA 2EXOA 3KWXA 4P8WA 3T0AA 3RM9A 1EQPA 1KQZA 1QHZA 2V3GA 2WCGA 2VQUA 1HKMA 2GFTA 3L2MA 3VIGA 4MJ2A 2RGLA 2IXVA 2AMGA 2D20A 3NJ3A 2VZUA 7TAAA 3N04A 3G6LA 3WNPA 1CGYA 2XTKA 2WXDM 4JKKA 3ECQA 1KWGA 3FXYA 1G1YA 3MU7A 1ZL1A 3N12A 2ZOXA 1XGZA 2O92A 3B8SA 1GPFA 2DGAA 1KWKA 1OIFA 4KGLA 1VFUA 1HXJA 4OBRA 2YDRA 3TONA 3ARRA 4GI6A 1B3YA 2BY2A 3E1F1 4HU0A 3EDJA 1KXVA 3WD4A 2X0HA 3HJEA 1UA3A 5M03A 2UY5A 3AHZA 1E3ZA 1TVPA 4KH2A 4JZ5A 2GK1A 5I6SA 2J78A 3T0DA 1V08A 1BGAA 3M07A 3WBAA 1BG9A 1CGTA 4AWEA 4B3KA 3AMCA 1US2A 3PZNA 3QGVA 5I79A 1UG6A 1VF8A 1AVAA 2VZVA 2CERA 1E6ZA 1E0XA 1FP8A 3EDEA 1CGUA 3AZTA 3GH4A 1W3LA 2WMIA 5HDRA 3ZO9A 2FH8A 2PB1A 1SMAA 4U3AA 5EB8A 1MW2A 1C7SA 3WQVA 2XWDA 3ARVA 2XM2A 1XYZA 2WYSA 3WH7A 2VUYA 1Q6GA 1GQKA 1KBBA 1KGWA 2G3JA 5HPCA 3CZGA 3OLGA 3BAIA 4UOQA 2VCCA 1DWAM 4ZEPA 2XYLA 5A3HA 4JKMA 1GQIA 1ZS2A 4RE2A 2WC3A 2EPOA 1DHKA 2PWFA 3EMCA 6CGTA 1BF2A 2YL5A 5CLWA 5E0CA 3L4UA 4PTMA 3VD5A 3WEMA 1LWJA 5A6SA 4P7RA 3TA9A 4DM2A 1XH0A 3BLKA 1DEDA 2DSVA 1H4PA 3II1A 4QLLA 1JG9A 1R87A 1FOBA 2FHFA 3GBEA 3BSHA 4WLCA 3M46A 2C7FA 1DWHM 1H41A 2DT3A 5JIPA 1PIGA 2GSJA 4M1RA 4AZ5A 3MKKA 3W6MA 1PEZA 4JL2A 4WSKA 4J3SA 4IUGA 2EEXA 4ZXLA 3AZSA 1G01A 4AIOA 2VC9A 5CXPA 3UERA 5A6BD 4P8VA 3ZQ9A 1V6UA 1J18A 2NT1A 1P6WA 3POCA 1KXHA 5DT7A 3EDKA 2BV9A 2DQXA 3AYSA 4CCEA 1LG2A 1CGXA 1E6QM 3PZOA 5LA2A 4L4OA 2X8RA 3DECA 5KEZA 3EMQA 5CPTA 3AMGA 4M82A 4GZEA 1JIBA 1LWHA 4QDMA 7A3HA 1B3VA 3W37A 3ZR6A 1JAKA 2J4GA 4AZ7A 3CGTA 4PTXA 2BHYA 4MADA 2XIIA 2GUYA 1WCGA 1DWJM 1DP0A 3GXMA 4W5UA 2WHKA 3CUIA 2WMKA 1UH4A 1E40A 1K9TA 2NSXA 4Q7NA 1W2PA 2PF0A 1E15A 4LYPA 2E3ZA 1HJUA 3GTNA 4H2CA 4NZCA 2J7GA 3WL1A 2W61A 1E6NA 4PMYA 1B2YA 3ARPA 4X9YA 5GNYA 2WHJA 1ISWA 5A69A 5I0DA 3DC0A 3WDHA 1HKJA 2J8FA 2XVPA 2HVMA 1UWIA 3VU2A 5C71A 5BYWA 1NWUA 5CPQA 5LA0A 2NT0A 3VNYA 1UR2A 2GDUA 2BNJA 4GXPA 4D6GA 3IJ8A 1M7XA 4PMZA 1KXTA 5M5DA 3OB8A 3EMZA 4JFVA 1N82A 2VI0A 4GQRA 1VFMA 2D0HA 2MANA 1BPLB 3ZJ8A 3UR7A 2D23A 2VZSA 3K8LA 3NCOA 4BCEA 3ZT6A 4M8UA 2OWXA 1B1YA 4HOZA 3L4TA 5ABFB 2D2OA 2YKKA 1XHGA 4AISA 2X0YA 1C90A 1I1XA 1MFVA 1VBRA 1EOMA 3PBGA 3IJ9A 1JYNA 1OT1A 3UG3A 1AQHA 2WB5A 3PZGA 1E1EA 4FLOA 5A8NA 3K4DA 1K9FA 2VR4A 2FGLA 3WUBA 1LL7A 3OLIA 1Q4NX 2VR5A 2VT0A 3WDIA 1EDQA 5E6ZA 3K4AA 2VCAA 5A2BA 5CGTA 3OLEA 2FHBA 1MW0A 1QI4A 4ACZA 2CHNA 4UFHA 4LX4A 1EDGA 1TZ7A 3WELA 1A47A 3PZQA 2NW0A 2V3FA 5D9MA 1JDAA 2VX5A 1ZBCA 3SCNA 3VGGA 4U5IA 1FH7A 1V3KA 1U33A 2WANA 5DT5A 3CH9A 2D24A 3T08A 4PSRA 4PUDA 1NP0A 2X1IA 1UYQA 4UFKA 4W8AA 2OYMA 2YDQA 3VPLA 2YA0A 2DH2A 5TD4A 2GJXB 1FH8A 2ZUWA 3GXIA 1JAEA 1CLVA 2WLYA 4AD3A 1HIZA 1V3LA 4AZCA 5E70A 2D0GA 4W89A 2VQTA 1BFNA 1E4MM 3RIKA 5A8OA 1FHLA 1C8XA 2WSPA 4JFSA 1E55A 2A3AA 2EPNA 1A3HA 1J01A 4CVWA 1NWRA 2WMFA 4M24A 1LL4A 3GH5A 4ML4A 5A94A 1XD0A 1QNOA 3W6LA 4HPHA 4M29A 3FN9A 3OA5A 3BAXA 1R86A 4PMVA 1E72M 3W53A 4FLRA 1ISZA 1JDCA 3F5LA 3M6DA 1HJXA 2BY3A 3CHDA 2Y8VA 3VILA 1VEPA 2E40A 3WH5A 1ZB5A 2ZX7A 3F4VA 4HMEA 1GHSA 4U2YA 3OLDA 1UQZA 5HBFA 1W32A 4DWSD 2WM0A 2J7EA 4MTVA 1UR1A 2FHCA 4OKDA 4ZXOA 4H04A 4FMVA 4P7LA 4A3HA 4B9YA 3PZIA 3M7SA 2EPKX 2ZXQA 1TFVA 4W86A 4S3KA 4Z2GA 3MS8A 2VCBA 2FDMA 3CUFA 1D3CA 1XYFA 3B9DA 1HJVA 1O6IA 1OSEA 1V0LA 2DSZA 4QFUA 1PBGA 2GJXA 3NYDA 4HU8A 1HP4A 4Z2IA 4D6FA 5A6AA 2OSWA 4F66A 1W9DM 1VAHA 3N9KA 2QPUA 4D72A 2UWFA 3EDDA 1BAGA 1B3WA 2DT1A 1B9ZA 4MB4A 3MMDA 4TTGA 1BTCA 4DUVA 5FCZA 1HKIA 3APGA 3DYPA 2J7HA 3WD0A 5BXRA 1RH9A 2XVKA 5A8MA 4P7QA 3G6MA 1GOKA 4H7VA 4WJXA 4V2XA 3CBWA 3WD3A 1GORA 4PMOA 3BAYA 1GUVA 3ZT5A 4Y7EA 4Z2JA 1WAWA 5A2CA 2ZX9A 4MJ4A 4ZFMA 5D8WA 2PWHA 1W3JA 4ZENA 3U7BA 3ZJ6A 4EE9A 5I2UA 3OZPA 1OINA 1H0IA 1X6LA 1E6SM 4JHZA 5A8PA 3KE0A 3CHCA 1HN1A 1VB9A 3T2PA 3A3HA 1CPUA 2CESA 1W91A 2G3IA 1CXIA 2PWEA 3ARXA 4CUCA 1Z32X 1Y7VA 1BYDA 3WF3A 1IZKA 1CNVA 1WE5A 4WIWA 5ABEA 1OB0A 1TVNA 1CGVA 4D6EA 3AMDA 3AS2A 4JFUA 3WKZA 4JL1A 3WUFA 4EANA 1VEMA 4H8HA 1V0MA 4AZBA 3MANA 2GJPA 4PMDA 4UTFA 4PTWA 1EO7A 3SUVA 4H8VA 5A6BA 1ISVA 2W91A 1HKKA 2WMJA 3BAKA 2PWDA 4J3WA 2DSWA 1LF1A 4RL3A 3VDBA 2VVNA 3CZ8A 2V5DA 1V6XA 1B3XA 2VX7A 5C8BB 3U5UA 1Q6EA 4UOJA 2WMIB 3T2QA 1UD6A 3MUZ1 2WHMA 4NF7A 1OCQA 1J9YA 3RM8A 1QI2A 2WBKA 5CSYA 3WY1A 3AIQA 4MDPA 4W7WA 3DYOA 3AMKA 3KL0A 2WVTA 6A3HA 2ESCA 1E4LA 3WUGA 1TA3B 4N42A 1E73M 2EBNA 2EJ1A 1M03A 3NDZA 1EXPA 2UY3A 2WVSA 1VJSA 2J7FA 2J77A 2JALA 1OD0A 4XZBA 1NWSA 1J10A 1GCYA 4ACYA 2J74A 1H3GA 1MW1A 3T09A 3K8MA 2A3BA 3SUUA 3VD9A 1PX8A 4B16A 4D6JA 4F79A 1UR9A 1JD9A 3TTSA 2VURA 4KRUA 2EPLX 3J7HA 2EQDA 3NSXA 4PEEA 1BHGA 3AMLA 1RP8A 2XGIA 1BGGA 4MAVA 1EHAA 4XB3A 1JXKA 2WCAA 1UD4A 3I3EA 4EAMA 3GXFA 1WDSA 2JFEX 4IPNB 2GDVA 2W62A 3W82A 2J25A 1C93A 2WCSA 1GOWA 1EQCA 2CCRA 5JBDA 1JNDA 4OOUA 4AD0A 5E09A 5JBFA 2E0PA 2VX6A 4HZ8A 3AS3A 1JXJA 1KGUA 4GINA 3WL0A 3VDCA 1QI0A 1XCXA 1AQ0A 1QNRA 1MQRA 3WENA 3L4XA 1H0GA 1UWUA 3OG2A 3ARYA 2X09A 4CD6A 1V3JA 4B3LA 1W1VA 4QAWA 3JUGA 2OYKA 1JYXA 3CUGA 1TA3A 2WZEA 4W88A 2VRQA 2OSYA 4D1IA 1QVBA 1C8YA 2QHAA 3SCRA 1I1WA 3QHMA 4OJYA 3VX1A 4AC1X 4KMQA 1E0WA 4DWSB 1EHNA 1JF5A 5BXTA 4PSPA 4DM1A 1R7OA 4HA1A 2XFFA 3FNDA 5A95A 1V02E 4ZE4A 4CU7A 3TP4A 1BLIA 2BVDA 4W7UA 1BVNP 3KL3A 1PZ2A 1SFSA 3PTMA 1VRXA 3W81A 2XM1A 2YJQA 2VTFA 4JKLA 1GQJA 3UG5A 4HPGA 5D9OA 5EMYA 5CLTA 4QCEA 1UH2A 4NRRA 1Q6DA 4KWUA 3CIVA 4WSJA 3L4YA 1G94A 2FGZA 2ZWZA 1UKQA 3ARWA 3WNNA 1UHVA 3VIIA 1M04A 2XG9A 4FLSA 4UR9A 1ZBKA 3MO4A 2QMKA 3GNOA 5HOSA 1VJZA 1E6RA 4TX8A 1ESWA 5I78A 3HMCA 5JBEA 3WH9A 4M80A 4K68A 2G4FA 1UR8A 2RGMA 5E9AA 1VBUA 1OGGA 3D5HA 1UKTA 1MVYA 1PX3A 3BXWA 1XD1A 4UQAA 5IDIA 2DSUA 1CTNA 3VMPA 1XH2A 2YBUA 1NARA 2O9RA 5DMYA 4PMXA 4DUXA 4UQEA 1ECEA 1OIMA 2G41A 2CITA 2E8YA 1CXKA 2XVLA 2IUZA 4DWSA 4YPJA 3LMYA 2BXZA 3WNKA 4MNMA 1J0JA 3SUSA 4OIFA 2G3NA 1W3HA 3BMWA 3SEPA 1GOMA 1E5JA 2DSKA 1B0IA 3KZSA 1HT6A 2F61A 1ZU8A 1JZ6A 4ACZB 3QOKA 2JIEA 3TTYA 4IISA 2BFGA 1UWSA 4W5ZA 2WKLA 1XSIA 3QR3A 3THCA 2WVVB 2WKGA 4UQCA 1JGIA 3VNZA 3VIHA 2XUCA 2WSKA 2YOCA 4BQ4A 1W9XA 3WH8A 3GYCA 1UR0A 4NSBA 3ZR5A 5I77A 3AROA 4QLKA 9CGTA 5IHRA 1GOOA 1CENA 4QP0A 4MNKA 3GDBA 2XFYA 2BXYA 2YDSA 1H09A 3MV01 2ZUTA 4N0RA 3MSGA 4AZCB 1E4NA 2O9TA 3VVGA 3N17A 2WK2A 1PPIA 4TUFA 1FFQA 2Z1KA 4QCFA 3IANA 5CGMA 3WMCA 1JNEA 5DFAA 7CGTA 1GVYA 5E6YA 3WH6A 4H41A 1HF6A 2Y8KA 3AIEA 5D8ZA 1AQMA 1IT0A 1W9VA 1F4HA 1GJUA 1HP5A 1UWRA 1K9EA 2VO5A 4M81A 3K1DA 1BQCA 4C7FA 5I24A 1FHDA 1DWFM 1ODUA 2JIWA 4XUYA 4PMQA 2V38A 3ZSTA 4S3JA 1QNQA 3IAQA 2CKSA 1M01A 2YBTA 1E0VA 4ATDA 4UFIA 1Q6CA 3NSMA 1M53A 5M17A 2ZIDA 5CSUA 3L4VA 1CLXA 3WD2A 1IV8A 1C92A 3CO4A 4UNIA 5IXEA 2WVVA 2YL9A 3CZEA 4LYQA 4CN6A 1FA2A 3WF0A 2D3LA 2CYGA 4U3CA 2VRKA 5I23A 3AIWA 5I5RA 1NWTA 2X05A 1K9DA 3PZVA 4UFMA 4AEEA 5FIPA 4OBSA 1MQPA 4AD4A 1OD8A 1PIFA 3TTQA 2XIBA 3GNPA 1QNPA 2XHYA 5FL1A 3AQUA 1MYRA 2A3EA 4HOWA 4LYRA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1E6QM

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