1E6S | Genus

Total Genus 195

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	195
sequence length	499
structure length	499
Chain Sequence	EITCQENLPFTCGNTDALNSSSFSSDFIFGVASSAYQIEGTIGRGLNIWDGFTHRYPNKSGPDHGNGDTTCDSFSYWQKDIDVLDELNATGYRFSIAWSRIIPRGKRSRGVNEKGIDYYHGLISGLIKKGITPFVTLFHWDLPQTLQDEYEGFLDPQIIDDFKDYADLCFEEFGDSVKYWLTINQLYSVPTRGYGSALDAPGRCSPTVDPSCYAGNSSTEPYIVAHHQLLAHAKVVDLYRKNYTHQGGKIGPTMITRWFLPYNDTDRHSIAATERMKEFFLGWFMGPLTNGTYPQIMIDTVGERLPSFSPEESNLVKGSYDFLGLNYYFTQYAQPSPNPVNSTNHTAMMDAGAKLTYINASGHYIGPLFEKDKADSTDNIYYYPKGIYSVMDYFKNKYYNPLIYVTENGISTPGDENRNQSMLDYTRIDYLCSHLCFLNKVIKEKDVNVKGYLAWALGDNYEFNKGFTVRFGLSYIDWNNVTDRDLKKSGQWYQSFISP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase
publication title	High Resolution X-Ray Crystallography Shows that Ascorbate is a Cofactor for Myrosinase and Substitutes for the Function of the Catalytic Base pubmed doi rcsb
molecule keywords	MYROSINASE MA1
total genus	195
structure length	499
sequence length	499
ec nomenclature	ec 3.2.1.147: Thioglucosidase.
pdb deposition date	2000-08-23

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
M	PF00232	Glyco_hydro_1	Glycosyl hydrolase family 1

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1e6sM00

3AIWA 5EBAA 1J0HA 3OLGA 2YLAA 1JDDA 2YKKA 1EQPA 2WSKA 3AZTA 4EE9A 2ZICA 4AXNA 1W9XA 1E1FA 2V3DA 1KBBA 2WKLA 1QI4A 3OIHA 1XYFA 3UG4A 1MWOA 3GZAA 1QNPA 3MS8A 4WF7A 1H5VA 3QGVA 5GNZA 2WM0A 3F4VA 1B9ZA 1X6LA 3WNKA 3IK2A 1BG4A 3W27A 2XM1A 3WH7A 3ALGA 2Y2WA 5A8NA 1EA9C 1GVIA 2CBIA 3KL3A 4S3KA 5A2BA 3T2PA 3VDBA 1UZ4A 3KZSA 1TZ7A 4P7OA 2G3MA 5CGMA 1WZKA 2ZOXA 2WMFA 3N15A 1E70M 2D22A 1TUXA 4AZGA 1UZ1A 2V5CA 1V6XA 2J4GA 1UA7A 3WKZA 4D71A 1NOFA 2X2YA 4D6IA 5GNXA 1OT1A 1CNVA 4W5UA 1ZB5A 4UFLA 5CSUA 4CGTA 1BVNP 1QI2A 4FMVA 4MNKA 3VDCA 3WD2A 3KE0A 3VU2A 5ABFB 4QLJA 4ACYA 5ABFA 2XPKA 1WE5A 1W1TA 3O9NA 5A6BA 2Q8XA 4W84A 4BF7A 1HKKA 4AMCA 3MMWA 2VMFA 3WMCA 4TTGA 3AZSA 1JF6A 3T2QA 1CXKA 1HIZA 5IDIA 2YDRA 1H2JA 3GTNA 3O6AA 1ECEA 1QHOA 4BZYA 4HOWA 1AQMA 1Q6EA 5A94A 4TVUA 3MANA 4CD5A 4AIEA 5A6SA 1O6IA 1MXDA 2WZHA 4LPCA 4AEFA 2XWEA 3MMDA 1O7AA 2OLHA 2WMKA 2WAGA 5M03A 2EO7A 4R27A 2CKSA 1BTCA 2ZE0A 3RCNA 2G4FA 3WL1A 2GUYA 4M1RA 2WHMA 4BQ2A 4AD2A 3M46A 4DWSC 1UKTA 1IZKA 3FAXA 1G01A 4LGXA 3BSHA 2VQUA 1J11A 2OYMA 3UETA 1V3KA 4WK9A 4M8UA 1NH6A 2QV4A 4D6FA 4LXFA 1PX3A 2VUYA 3OLDA 1DTUA 2XVGA 4PBGA 6A3HA 1NP0A 2E4TA 2CPUA 1KB3A 1XH2A 2FGZA 4GINA 1R8LA 1VRXA 3AIBA 3WL0A 5LA1A 5D9PA 2BXYA 4MTVA 4MJ4A 2TAAA 3I3EA 3GNPA 2B31A 1CIUA 2WMJA 1NM9A 3QHNA 5M17A 2ZWZA 2VCCA 4JL2A 3TOPA 4OOZA 4WIWA 4H41A 4PRWA 1FA2A 2ZX9A 3VO0A 1UH2A 2PWHA 3EYPA 1LL7A 2ZX6A 1SR0A 3BC9A 4JL1A 4TOQA 2WYSA 3BAKA 2VR4A 5AYIA 4C7GA 1FOBA 1UQYA 4OJYA 3A4WA 3CMGA 1ISWA 2D20A 4GO9A 1PX4A 2VZSA 2EPKX 4AD4A 4U3AA 4CD6A 1EHAA 3MUIA 1Z32X 1JD9A 3WNMA 1UUQA 2XFRA 4KMQA 3AMGA 3WDRA 3CUGA 1BG9A 4E8CA 3AOFA 3ARRA 1BLIA 1D2KA 1HF6A 3LMYA 2CNCA 3EDEA 3U7BA 2A3CA 2ZXBA 3CHEA 5A95A 1HJUA 2AOSA 1UWRA 3AFBA 4OBRA 2VURA 2JIWA 2ZXDA 2CXGA 4NI3A 4UTFA 4UFJA 2DH3A 2EPLX 1ITXA 1CYGA 3N11A 2X8RA 1HN1A 4H2CA 2VCBA 4XB3A 1JXJA 1MW1A 2BHYA 1HKJA 3KEHA 4A3HA 3ARVA 4Z2LA 4HTYA 2CBVA 3AMLA 4B3LA 4UOJA 4MB4A 2PI6A 3UEQA 1LF1A 2XVKA 2WMHA 2DT0A 4UQDA 1IT0A 5BXSA 5D9OA 4W88A 1E1EA 3WNOA 1XD0A 3WD4A 2BNJA 4NZCA 2IXVA 3BCDA 2XHYA 2VX4A 2QMKA 4PTXA 1QI3A 3PTQA 3ARPA 4B3KA 3OGVA 4MPKA 2DDXA 4XX6A 4WSJA 2CESA 5A6BD 5I78A 1GPFA 3MO4A 3GH5A 1MVYA 4JCLA 3W25A 2WC7A 3DHPA 4PTWA 5EFDA 2WVVA 3AS1A 5CZKA 1DWGM 2C0HA 3WELA 4CUCA 1C3FA 1OD8A 1MW3A 3AHXA 1W3HA 2ZIDA 1XSJA 3NUKA 1UH3A 1VFFA 1EHNA 4J3WA 2X0YA 1AMYA 3SCVA 2W91A 4UQBA 4YHGA 5EMYA 4EANA 4F8XA 1QVBA 3BAIA 3ZJ6A 1TG7A 4PTMA 4AZCB 4MDOA 5GPRA 2J62A 4U5IA 1LG1A 4ATWA 4MNMA 5A2CA 1J18A 1BGGA 3MMUA 1NOUA 4AIUA 4W8BA 1HKIA 3L4WA 3T0BA 1M03A 3IJ9A 4LYRA 4P8XA 4DWSB 1B3VA 2J8GA 4DWSA 3TP4A 5ECUA 1CXLA 2YBUA 5E6YA 3AYRA 2WKGA 3AHZA 1R7AA 2OWXA 2YJQA 1WAWA 3AIRA 3PHAA 4W87A 1WCGA 1OIMA 2W92A 3B8SA 4PTVA 4PSRA 5AC5A 3AMDA 4WJXA 4BQ5A 2J7HA 2BVDA 3GM8A 1ZJBA 4JFSA 2WMGA 2VNCA 3NIYA 4QFUA 1VBUA 4RL3A 5A8OA 1GCYA 4TTUA 3FHAA 3VIMA 3UG5A 3W82A 1Q6GA 4GQQA 1BHGA 3VGDA 1MFVA 3BLPX 3RO8A 4AC1X 1UR1A 3BGAA 4D72A 5F7UA 4J27A 3WEMA 5I0DA 3ZIZA 1V6YA 1M01A 4AZBA 3NJ3A 1J0YA 3N9KA 1MW2A 1KQZA 3WH9A 1JYXA 2Y4SA 1DEDA 2WPGA 3MU7A 3ZJ7A 4GZIA 1QHPA 1C92A 1UKPA 2GJRA 2WVUA 4UFHA 5D9NA 4KWUA 3B9DA 1UH4A 4KRUA 5CGTA 5D8WA 1OGBA 1K9FA 3OA5A 4UCFA 3PTMA 1G0CA 5D8ZA 5I3DA 4D6CA 5M5DA 1GQLA 5A3HA 1WDSA 1KXTA 3W0KA 1EXPA 4MB5A 3QHOA 1G9HA 2NT0A 3AIUA 1WB0A 1K9EA 1W1YA 5KZ6A 2WLZA 4Q22A 1MFUA 2W5FA 3EBVA 2EEXA 1E4MM 2GDVA 1WNOA 4QLLA 2ZXQA 1HXJA 3E1F1 2J79A 3N12A 4UFMA 1TE1A 1HT6A 5ABHA 2VZVA 4A4AA 1H4PA 2ZXAA 1OT2A 1C8XA 7TAAA 4M29A 4GI9A 1W3LA 1GUVA 3HN3A 4PUEA 2BFGA 1ZBKA 2QF8A 2V3FA 3MKKA 1W2VA 4F79A 1V0LA 4FF5A 5ABEA 1KCLA 3SURA 3PZUA 3T09A 3VDAA 4PMOA 1UKOA 3PBGA 4AD5A 1EDGA 5AY7A 1J0IA 1X6NA 3WF4A 1BPLB 1B3WA 2WW5A 2XFYA 8CGTA 4ZXOA 3ZT6A 4R5EA 3OZPA 8A3HA 2VZUA 1US3A 2UY3A 3W26A 3DYOA 2F2HA 1V3IA 4GZJA 3AZRA 1XD1A 4TX8A 1J10A 2VZTA 4CD7A 2J7CA 3I3BA 4OBSA 1UR2A 1GOIA 3AMCA 1TVPA 3OBAA 4JIEA 3ZR6A 2OWCA 4LQ1A 4RE2A 4UQCA 3CZEA 1GORA 3VKKA 2XG9A 6CGTA 2V3GA 2WCGA 1C8YA 1JZ2A 1B2YA 3AXXA 3VTRA 1WZMA 5CSYA 4AZ7A 1JAKA 1NWRA 1DWHM 3PZTA 4HZ7A 3CH9A 2CEQA 1QNQA 1E5NA 2ZX8A 1VJZA 1V3HA 4QDMA 1GQIA 3K8LA 4UZUA 2DSZA 2WHJA 1E0XA 3SUVA 1V0KA 3RMEA 5CG0A 3BAWA 4YN5A 2XFFA 4D6JA 1BQCA 3CMJA 4DWSD 3S2CA 9CGTA 2OSXA 2JF6A 1KBKA 1B0IA 1JYVA 3LPOA 1OCQA 4H8VA 2F8QA 2DEPA 1YQ2A 1JAEA 4GZEA 4HMEA 5IHSA 1PIGA 5C8BB 1US2A 2WHLA 3RM4A 3T08A 2IXUA 2CCRA 4PMQA 3VIKA 3VIPA 3WDIA 2XUCA 3RJXA 4OUEA 2WBKA 2FH6A 2VVNA 1I1WA 3GXFA 5DFAA 3WUGA 2XM2A 2CBUA 4HMDA 3ARXA 3PZ9A 4ZFMA 4GKLA 1QNOA 1VFMA 4JAWA 3TTSA 4PUDA 2VQTA 4BCEA 1QBBA 3U7VA 4AD1A 3VIHA 5LA0A 5ABGA 1JI1A 4H7VA 2XVNA 3SCRA 3VIGA 1CZ1A 4U3CA 1Q6DA 4EK7A 1UD6A 2DIJA 1R85A 2EBNA 3BMWA 3GH7A 4M80A 3ARSA 3GNRA 1AQHA 4MB3A 1JNDA 4D6DA 5I77A 3WQ5A 4AZ6A 3GH4A 4PMDA 1V0NA 4M24A 3RM9A 1JYWA 5A8MA 1CGTA 3GXMA 2D0FA 1UWSA 2PWDA 3N04A 3GDBA 2WANA 2BY0A 4JHOA 1EO7A 3AHTA 2VT0A 1HJXA 4Y7EA 3ZOAA 3L2MA 4PCSA 2YA2A 4RE4A 3IJ8A 1BYCA 1U33A 1RD6A 3NSNA 2OWWA 2WB5A 2DSUA 2XYLA 1HJVA 7A3HA 1QI0A 1TA3B 1V08A 3QOMA 3VD5A 1BVZA 5A8QA 2BXZA 2C7FA 3NSMA 3AICA 1GOMA 3AMKA 2YL9A 1UR4A 4YHEA 3BAJA 1NOWA 3N1AA 4E4PA 3EDFA 3WF1A 1JYNA 1HJSA 4BS0A 4B9ZA 2ZUSA 1ZS2A 2F61A 3VPLA 2FHBA 3SCSA 1H41A 4AISA 5I24A 4UQAA 4A3YA 1OSEA 3AIVA 2BHZA 1RP9A 4QCFA 2XIIA 2D23A 3L4TA 5GQBA 4B16A 2WK2A 1KCKA 1OWQA 3K4AA 1W2PA 1KXVA 1KR1A 3RJYA 1ODUA 1WDPA 3NCOA 2PB1A 1C7SA 1GJUA 1UKQA 2XIBA 3SUWA 1CGXA 5CLWA 1JGIA 1JF5A 4C7FA 3U5YA 3UR7A 1FH8A 4CCCA 2DSWA 3L2LA 1XSKA 4JFTA 3WQVA 2PF0A 4D6GA 3SIMA 3RPMA 1C93A 1M7XA 4HA1A 3SCUA 1VBRA 3K8MA 4JFUA 1GNXA 5CPSA 1XH1A 1BFNA 1CENA 3CUJA 4L4PA 4N0RA 5JIPA 4W93A 1E6SM 1QOXA 4XZBA 1PZ2A 1QPKA 3WUEA 3FW6A 1R86A 5BRPA 2QPSA 4V28A 1OIFA 1E0VA 1OM0A 4CN4A 2J8FA 2QLYA 1PBGA 1DP0A 3W29A 3OG2A 1EOKA 1JNEA 2ZUMA 3WNPA 3CHDA 4HA4A 4L4OA 1XSIA 4HU0A 1HKMA 1WO2A 2BVYA 3F5JA 3S6TA 1J01A 4LYPA 3G6MA 3EMZA 2WSPA 2GDUA 1K6AA 1UHVA 2DSKA 3A4XA 4PMVA 3ARUA 3CPUA 1GOQA 3PN8A 3WUBA 3W38A 3WH8A 1LWHA 1PEZA 5BYWA 1QW8A 2E8YA 2VVSA 5BROA 3N13A 5CJ5A 1C7TA 5DT5A 3W37A 3MV01 2WWCA 3CO4A 1HP4A 2VI0A 4MB1A 1HNYA 3SCPA 1UWTA 1KWKA 1MW0A 3NYDA 1KGXA 5BRQA 1SMDA 1A3HA 3CZJA 3WEZA 5A6JA 2BHUA 1CGWA 3QR3A 3G6LA 4W8LA 1JZ6A 5LA2A 2J47A 1F4AA 3DHUA 3WUFA 5JBDA 1XGZA 3SCQA 2D0GA 1F4HA 3CZLA 1GOWA 3KL5A 2WC3A 2Z1SA 2MANA 4AZHA 1FP8A 1SYTA 4GI8A 1GOOA 2Y24A 1CPUA 2X0HA 5GNYA 2A3BA 2VX6A 5IHRA 1E5JA 3ALFA 4CU7A 2DT1A 5DF0A 3W53A 3WQWA 1LQ0A 4FLQA 2NW0A 3PZGA 2UY5A 1B1YA 1E73M 3WN6A 4FLRA 3II1A 4AW7A 1FFQA 1OBAA 2DT2A 2AMGA 1VB9A 1G1YA 3CGTA 2VOTA 5D4YA 2G3JA 2OSWA 2JFEX 3PZOA 2EXOA 2JF7A 4MDPA 1L0PA 3EMQA 1G5AA 3FXYA 3EDDA 3VDHA 4U33A 2YLLA 4H8HA 3ARWA 3WH6A 4U31A 1PX8A 1RPKA 4P8UA 3AIEA 3PZQA 5BWFA 4M56A 1Y7VA 2FH8A 5IFTA 5A6AA 4J3TA 4AZCA 3CTTA 5E09A 1VF8A 4ML4A 1UWQA 3J7HA 4QCEA 3MUAA 3WH5A 1JZ5A 1BGAA 1VJSA 4JFWA 1HL8A 5M3WA 2EPOA 5CLTA 2J7GA 4K68A 4X9YA 1AVAA 5DMYA 3CIVA 3LPGA 1W3JA 1JG9A 2ESCA 4W7VA 3THDA 1J9YA 3FNDA 1CLVA 3WMSA 2VO5A 1JXKA 3VGFA 1DHKA 1GW1A 3SUUA 1CLXA 1CXFA 2VJXA 4AD0A 2YDQA 3BAXA 3VMPA 4Z2GA 2BV9A 4V2XA 1EO5A 2X09A 5HPCA 3VILA 5FKYA 3NDZA 1BSIA 2VL4A 1IV8A 1E9LA 2E40A 2DH2A 4WKAA 2FHCA 4P7LA 4UQEA 5HXMA 1E6NA 2JE8A 1QNRA 4Z2HA 2UY4A 1B3ZA 1XCWA 4KGLA 3U5UA 4HZ8A 2FDMA 2W4XA 4CN6A 1ZU8A 3WQ6A 4KGJA 3KWXA 4P8VA 3B9EA 1LG2A 1MQPA 1V6UA 4LX4A 4BQ4A 1LWJA 4UNIA 2X1IA 4DUXA 1NP2A 2YL8A 2C8NA 4MAZA 1GOKA 3SCTA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1E6SM

Total Genus

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