1E70M

2-f-glucosylated myrosinase from sinapis alba
Total Genus 195
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
195
sequence length
499
structure length
499
Chain Sequence
EITCQENLPFTCGNTDALNSSSFSSDFIFGVASSAYQIEGTIGRGLNIWDGFTHRYPNKSGPDHGNGDTTCDSFSYWQKDIDVLDELNATGYRFSIAWSRIIPRGKRSRGVNEKGIDYYHGLISGLIKKGITPFVTLFHWDLPQTLQDEYEGFLDPQIIDDFKDYADLCFEEFGDSVKYWLTINQLYSVPTRGYGSALDAPGRCSPTVDPSCYAGNSSTEPYIVAHHQLLAHAKVVDLYRKNYTHQGGKIGPTMITRWFLPYNDTDRHSIAATERMKEFFLGWFMGPLTNGTYPQIMIDTVGERLPSFSPEESNLVKGSYDFLGLNYYFTQYAQPSPNPVNSTNHTAMMDAGAKLTYINASGHYIGPLFEKDKADSTDNIYYYPKGIYSVMDYFKNKYYNPLIYVTENGISTPGDENRNQSMLDYTRIDYLCSHLCFLNKVIKEKDVNVKGYLAWALGDNYEFNKGFTVRFGLSYIDWNNVTDRDLKKSGQWYQSFISP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title High Resolution X-Ray Crystallography Shows that Ascorbate is a Cofactor for Myrosinase and Substitutes for the Function of the Catalytic Base
pubmed doi rcsb
molecule keywords MYROSINASE MA1
molecule tags Hydrolase
total genus 195
structure length 499
sequence length 499
ec nomenclature ec 3.2.1.147: Thioglucosidase.
pdb deposition date 2000-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
M PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e70M00
4QDMA 4X0NA 3WF0A 4M82A 2YL8A 1Q6CA 2A3HA 2NT0A 1HKMA 2DDXA 2VUYA 2GJXA 4LYRA 1WB0A 3VD7A 6TAAA 1QVBA 1JG9A 4D6IA 1FHLA 3LPGA 2E3ZA 3WH6A 3W4RA 5LA1A 3T09A 3WKZA 2W61A 1GORA 4FLQA 4MNJA 4UCFA 2CHNA 4N0RA 4YPJA 2WBKA 3I3BA 1V6UA 3SCVA 1PX4A 2WZHA 3VGBA 4D6JA 2VX5A 1KQZA 3NIYA 4MTVA 3KEHA 2UY2A 2WK2A 2X8RA 1AVAA 4WLCA 2WMIA 5ABFB 1GQJA 1MW3A 5D9MA 2WLYA 2CETA 1ISWA 4JL2A 4JZ5A 2VRJA 4C7FA 2DH3A 2X09A 2CEQA 1M04A 3LPPA 2OSYA 1TUXA 3HJEA 2CHOA 3WMBA 2G3NA 1ZBCA 1HJXA 2GJPA 2VZVA 3EDKA 2E0PA 2JF7A 1GOIA 1UH3A 2CNCA 3GXDA 5E0CA 2FH6A 5AYIA 1OM0A 1ZL1A 1NWRA 1JF6A 2DEPA 1CYGA 4EE9A 1TG7A 1JAEA 3WUBA 1NWSA 4DWSA 4MDPA 3IANA 3MMDA 2VI0A 3DC0A 2Y2WA 3ZSTA 5I23A 4CVWA 1BG4A 4H8VA 5A94A 3VIHA 3IJ9A 5FCZA 3BMVA 3WMSA 2VR4A 1JGIA 1GUVA 2J7FA 1EOKA 3AHYA 3EDJA 1DWAM 5IXEA 2VQTA 1WDSA 2QPSA 3WNOA 5IHRA 4QP0A 2QLYA 3W82A 5EB8A 3AXHA 5DFAA 1E15A 1XGZA 5I79A 4J3UA 2YL6A 1UKTA 4MJ4A 2ZIDA 1C8XA 1C90A 5BXTA 2BV9A 1IZJA 4PMZA 2O9PA 3SCRA 3VIOA 2Y4SA 1W1YA 1ZJAA 1CNVA 3AZSA 3WD2A 4JFVA 1ZB5A 2ZWYA 3WSUA 4AD2A 4MB5A 4X0VA 3OZPA 2XTKA 1HKKA 4XV0A 4D6HA 1LLOA 4NSBA 4PBGA 4MB1A 2WAGA 1OGBA 3N9KA 3ARSA 2RGMA 3W26A 3SUWA 3THDA 1E4IA 3LPOA 4ATLA 2WCGA 1JZ5A 2WHLA 1W1VA 1UZ1A 5BXSA 2XIBA 1Q6DA 5D8ZA 3VGEA 5E6ZA 1TR1A 2GK1B 4CN1A 2VCBA 1V03A 4P7LA 3N12A 3ZT7A 2EJ1A 2V5DA 5FOOA 3LPFA 2G3IA 2EPNA 2UWFA 1JD7A 5GNZA 4TTUA 3A4XA 2YL9A 1B3XA 1XH1A 3U7BA 3ARZA 2YA1A 3FW6A 1JZ2A 2PB1A 5BWFA 4PN2A 2XIIA 3NYDA 3AS1A 3T2QA 1NM9A 1V02A 5HDRA 1Y7VA 1Q6GA 3PZIA 2PWGA 1QW8A 1KXVA 1H41A 1J0YA 1K9EA 2DSWA 4WF7A 1W9BM 4KGJA 5JUVA 5BYWA 3VIFA 2FHFA 3ZR5A 1WZKA 1UR2A 4TVCA 1JNEA 4AZ5A 3NCOA 5CLTA 5GPRA 3NUKA 4CD7A 3WNMA 3SCUA 1VFMA 1E6ZA 1V6XA 2E9BA 1JIBA 2Y24A 3RJYA 3ARYA 3UG4A 1C93A 5A6JA 3BCFA 4A4AA 3MUY1 1FH7A 2DSZA 3BXWA 3U57A 1W3JA 4UTFA 1CGYA 2J4GA 3I3EA 2YJQA 4CU6A 2IXVA 4AISA 1XHGA 2D0FA 5A6AA 3IK2A 1VRXA 1LL7A 1JYWA 3M46A 3ARWA 3CGTA 3W81A 2J8FA 2VO5A 1O6IA 5EMYA 3NSNA 1V3LA 4DUVA 4M80A 3ALFA 2EBNA 1V3IA 2QMKA 3WUFA 3WQ8A 2QV4A 1GHSA 3OIHA 1EHNA 5AYBA 5M17A 3ARUA 2GJXB 4D6GA 1F4HA 4F9DA 4MB4A 3CHDA 2C0HA 1EQCA 3MU7A 1ZS2A 5AC4A 4MNKA 1CGUA 2EQDA 1CTNA 1JFHA 1B3VA 1KGXA 2VCAA 1WO2A 1PJ9A 1J0HA 2OWXA 3OGSA 1E1EA 3ARPA 1DEDA 2EPMX 3SCQA 4L4PA 2VURA 4CVUA 4NRRA 1J0ZA 1RPKA 1UD6A 4CCEA 3AIVA 2WVVB 1WNOA 3EBVA 3HN3A 2WPGA 4NRSA 1R86A 1KWGA 2J78A 4Z2GA 4HA1A 4TVDA 3N17A 4U5IA 3ZT5A 3W6LA 4D72A 4JAWA 1KGUA 4J3XA 2XFFA 3VIJA 3MSGA 1BGGA 1R7OA 3WY1A 1LWHA 3AXIA 4TXEA 3L4XA 4H04A 4BQ3A 3VMPA 3TONA 3WEMA 1CGXA 1MQRA 2GJRA 1E6PA 4XZWA 7A3HA 2CBJA 4J27A 1MVYA 3WFLA 3CHFA 1MWOA 4OKDA 5KZ6A 3AMDA 1PX8A 4BF7A 3W0KA 5EFFA 3F5LA 1E0VA 2W67A 3WDJA 4HMCA 2WYSA 3ECQA 4W7UA 1E55A 5CSYA 1XCWA 1CGVA 4PUDA 1WDQA 2VQUA 4AD5A 2W91A 2WNWA 1VFUA 2CESA 3GM8A 3D3AA 2WZIA 2NSXA 4DUWA 3NDZA 1DWHM 3EDDA 2C8NA 4AZCA 1UH2A 2VTFA 1JYXA 4FLSA 1EDTA 1H4PA 1I75A 1VAHA 4U2YA 1UG6A 1JYVA 1H09A 2J74A 5A8QA 1V3KA 3AMKA 1IZKA 1B0IA 1H5VA 1DTUA 3AYSA 3UCQA 1QBAA 3MO4A 4UFHA 5HBFA 5BCAA 2XVGA 2PBOA 3K8KA 1O7AA 3VGFA 3VUPA 4Q7NA 1OIFA 1NOFA 3F4VA 3ZJ8A 5CGTA 2XWDA 1HNYA 2BY2A 4P8UA 4DWSD 3BAYA 3UETA 5IFPA 3FAXA 4IISA 1UWUA 4A3HA 3FNDA 3FAWA 2CYGA 3ARTA 4W86A 3THCA 2ZXAA 4M81A 4JFUA 4UQAA 4UQBA 4HU0A 3PZNA 1CDGA 3T2PA 3KE0A 4M56A 1KQYA 1C91A 3GXFA 2A3CA 1HP4A 2WVSA 3ZR6A 4MAZA 3UESA 3VNYA 2IUZA 2G3MA 4H8UA 4ACYA 1OBAA 3TTYA 2BXYA 3EDEA 3VDBA 2DIEA 2OYMA 5D4YA 2E40A 3RDKA 3WEOA 2NT1A 4ACZB 2XGIA 3FN9A 1HVXA 2XHYA 3VGHA 2W5FA 3DYOA 4CUCA 2WB5A 4JFTA 3ZIZA 3MMUA 4UFKA 1FH9A 2CKRA 2QMJA 4WIWA 2WSPA 3WBAA 5C70A 4PSPA 2CKSA 4WSKA 1WCGA 3BAWA 3U7VA 3VIMA 4V28A 4W84A 4UQ9A 2ZUWA 3WQ6A 1P6WA 5CZKA 2BVYA 3TTQA 2CITA 3TOPA 4HMEA 1NP0A 2VNCA 1J01A 1SR0A 2JEPA 5I77A 2D20A 3DYPA 1RD6A 5DO8A 3M7SA 4S3JA 3PBGA 1CBGA 4P7NA 2Y8VA 3RILA 4PCTA 3WDIA 5FL0A 4PRWA 3GXMA 4AWEA 1CLXA 4EANA 3ZO9A 1GOWA 3CZEA 3PZMA 1GNXA 1XYZA 2ZX9A 3WNKA 2YDSA 3AFBA 3EMCA 3J7HA 4HMDA 4TTGA 5CPSA 2UY4A 3VD9A 3UERA 1V6YA 1OD0A 2OLHA 3BLPX 5CQ1A 5A6LA 1HXJA 3AROA 2HVMA 1X1NA 2RGLA 4BQ2A 5A1AA 5CXPA 3RO8A 1XRVA 5ABGA 1QPKA 2WXDM 5I78A 4HZ8A 5DF0A 1TA3A 3DYMA 3SEPA 3W25A 3VVGA 3ARXA 3EDFA 3W28A 1IV8A 4A3YA 1GCYA 2D3LA 3NDYA 1OCQA 2OYKA 1EOMA 1XCXA 1G1YA 4D1JA 4OZOA 4NI3A 4GPNA 3SUTA 1KXTA 3WELA 1C7SA 4RE4A 2GVYA 2WHKA 3ZJ6A 2ZUSA 5HPOA 4V2XA 2DT2A 2XSBA 1UR4A 3WNPA 3M07A 4OIFA 3DECA 5A3HA 5JBDA 1JDCA 5A2AA 5CG0A 4KWUA 1BTCA 4P7OA 1BSIA 4AEEA 1FOBA 1G01A 5DEZA 1BVZA 4UFMA 1BAGA 4D1IA 3OA5A 2WMHA 8CGTA 5BXPA 2J25A 3SCWA 2YDQA 2YL5A 3PZQA 3BC9A 1PIGA 3MV11 1FP8A 2ZE0A 1NOUA 2ZX7A 4MB3A 5FD0A 3RM9A 3WF4A 3K4AA 2XSAA 3VDCA 4UQCA 3QOMA 1EHAA 3T08A 4W5ZA 1B3WA 2WC7A 1E71M 4AZ7A 1D2KA 4P7QA 3CUJA 1W9VA 1WDPA 2E8YA 1GJWA 3CZLA 2VCCA 1MFUA 3WD0A 3DHPA 2CERA 2VJXA 3SCNA 1QBBA 4HP5A 3F5JA 1LF1A 3WQWA 4R5EA 1PBGA 1UD3A 5A8NA 1GOMA 3VO0A 4JCMA 1K6AA 1RP9A 3W6MA 4HPHA 1B9ZA 4CU7A 5CJ5A 1PZ2A 4BCEA 4HOZA 2BFGA 4LYPA 5E09A 1BLIA 1NARA 1KR1A 4EKJA 5DMYA 2BS9A 5FIPA 1A3HA 1AMYA 3KL3A 5A8MA 3CH9A 1KXQA 1KCLA 1TE1A 3CPUA 3MS8A 1BPLB 1XC6A 1GQKA 3OLDA 1UKSA 5DT7A 4UFJA 1A47A 4AZCB 1CENA 5FL1A 1HKIA 3AS3A 1EA9C 3IAQA 1ZU8A 1J0IA 2WZEA 1C92A 4URIA 1UKPA 4WKFA 4ML4A 3JUGA 2FGZA 2CXGA 3AZRA 4ZENA 3CHEA 1N82A 1VF8A 1NWTA 4XZBA 1W2PA 3VD5A 1D3CA 3B8SA 4FMVA 1SYTA 1NWUA 1FFQA 2IXUA 2X0YA 4KRTA 2ZUTA 2MANA 4UFIA 4Y7EA 2ZX5A 4GIAA 1VJZA 1J18A 1WE5A 3MANA 1J10A 1GOQA 2VVSA 3ZQ9A 1E6XM 1Q4NX 1JZ6A 5F7UA 2GSJA 1W91A 1J0JA 1HVQA 4BQ5A 1YHTA 4IUGA 5A6SA 3VTRA 1UD4A 1QI2A 3WH8A 4Z2HA 2GDUA 2WWCA 2J7DA 4OOUA 2G8ZA 3AHTA 3VMNA 3TTSA 1EDGA 4LQ1A 4LXFA 1BGAA 4F66A 1LG1A 3B9EA 2Z1KA 2AMGA 2XGBA 3WL0A 4F79A 3OLEA 1AQMA 1TMQA 5E9AA 4WSJA 4MAVA 1CPUA 1L0PA 3AICA 4Q22A 1V3JA 3L4ZA 3AHVA 1FHDA 4B3LA 3A47A 5FKYA 4N42A 1JFXA 2DGAA 1AQ0A 2ZUMA 2JEQA 4D6DA 1UD2A 4P8VA 3HMCA 1W3KA 2ZXBA 5EFDA 2QHAA 1VB9A 3GBEA 1TCMA 4DUXA 3GDBA 4OBSA 4U2ZA 4WJXA 2V38A 2Y5EA 1UR9A 5A95A 2DT0A 3PZTA 4PEEA 3ZJ7A 5AC5A 2ZOXA 1E70M 3VD3A 4J28A 5HPCA 2JALA 1SMDA 3AIEA 2W92A 1HJVA 4CN4A 3VU2A 1DHKA 1J0KA 4RE2A 3A6OA 2D24A 4J3VA 2WMFA 4GQQA 3OGVA 3W37A 3BAIA 2CCRA 4AMCA 3RCNA 2WCAA 1HP5A 4GINA 1U33A 4CD6A 2V3FA 1HJQA 2CIPA 5GNXA 2G3JA 2VX6A 4Z2IA 1EQPA 3AIQA 4GO8A 5HXMA 4WKHA 1GW1A 4PMDA 4MADA 4AD4A 4W89A 1JZ8A 3IAPA 3SUUA 1JDDA 1UD5A 4AC1X 1UQYA 2YDRA 4TX8A 1EH9A 1XH0A 4UOQA 4UOJA 2JIEA 3WH5A 2NW0A 1UWIA 1TVPA 3RJXA 4L4OA 4PTWA 5HNNA 1CGTA 5M3WA 4DM1A 2DH2A 3AIUA 3ARVA 4XUYA 3WH9A 4C7DA 1VEOA 1UR8A 2WMIB 1JD9A 1UWQA 1G0CA 1PEZA 2VT0A 3O2LA 2D22A 1PZ3A 4JHOA 3UEQA 2DT1A 1BHGA 4TX6A 3AHXA 2J75A 1HJWA 1NOWA 1QHPA 5BRPA 6A3HA 2G41A 2X0HA 4AY1A 1J9YA 3K4DA 1UR1A 5LA2A 4AEFA 4AIUA 4LX4A 1X6LA 4AW7A 3PZ9A 3WL1A 4ZFMA 1QI5A 1RP8A 1UWTA 3WD3A 4S3KA 2WC4A 4BZYA 2JIWA 5A6BA 3KL5A 4LYQA 1V3MA 5C71A 3AIWA 1BYAA 2XVKA 4M24A 4HU8A 3L4WA 1XSIA 2XVNA 3AXXA 5A6MA 1MYRA 3UG5A 4ATWA 1ITCA 4DWSB 3BSHA 2ZUVA 2FGLA 4BQ4A 4NF7A 2J62A 1JI2A 3ALGA 1HX0A 4HTYA 2J77A 2G4FA 3AS2A 5JBEA 1MW2A 4P7RA 3VIKA 1PAMA 4W87A 1VBRA 1KBKA 2BY1A 1V0NA 3ZSSA 5JBFA 1W9PA 2DQXA 4OJYA 3WD4A 2BVDA 3VD4A 1CGWA 2YKKA 2FHCA 2GDVA 4P8WA 2A3AA 1QHZA 2PBGA 4IPLA 4HA3A 3QHNA 2DSUA 2EO7A 1OIMA 1SMAA 1B3YA 1OB0A 1TVNA 3VX0A 1U30A 1XD1A 4J3SA 5E6YA 4E2OA 2WMGA 1WZMA 1GHRA 2XFRA 3L4TA 3K1DA 4UOZA 3W53A 1KWKA 4PMYA 1IT0A 2WBGA 1F4AA 1G9HA 4UR9A 1DWFM 2WMJA 5E70A 2BNJA 1E4NA 2DIJA 2YOCA 4V27A 4YN5A 1XSJA 1CWYA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4QDM A;  4X0N A;  3WF0 A;  4M82 A;  2YL8 A;  1Q6C A;  2A3H A;  2NT0 A;  1HKM A;  2DDX A;  2VUY A;  2GJX A;  4LYR A;  1WB0 A;  3VD7 A;  6TAA A;  1QVB A;  1JG9 A;  4D6I A;  1FHL A;  3LPG A;  2E3Z A;  3WH6 A;  3W4R A;  5LA1 A;  3T09 A;  3WKZ A;  2W61 A;  1GOR A;  4FLQ A;  4MNJ A;  4UCF A;  2CHN A;  4N0R A;  4YPJ A;  2WBK A;  3I3B A;  1V6U A;  3SCV A;  1PX4 A;  2WZH A;  3VGB A;  4D6J A;  2VX5 A;  1KQZ A;  3NIY A;  4MTV A;  3KEH A;  2UY2 A;  2WK2 A;  2X8R A;  1AVA A;  4WLC A;  2WMI A;  5ABF B;  1GQJ A;  1MW3 A;  5D9M A;  2WLY A;  2CET A;  1ISW A;  4JL2 A;  4JZ5 A;  2VRJ A;  4C7F A;  2DH3 A;  2X09 A;  2CEQ A;  1M04 A;  3LPP A;  2OSY A;  1TUX A;  3HJE A;  2CHO A;  3WMB A;  2G3N A;  1ZBC A;  1HJX A;  2GJP A;  2VZV A;  3EDK A;  2E0P A;  2JF7 A;  1GOI A;  1UH3 A;  2CNC A;  3GXD A;  5E0C A;  2FH6 A;  5AYI A;  1OM0 A;  1ZL1 A;  1NWR A;  1JF6 A;  2DEP A;  1CYG A;  4EE9 A;  1TG7 A;  1JAE A;  3WUB A;  1NWS A;  4DWS A;  4MDP A;  3IAN A;  3MMD A;  2VI0 A;  3DC0 A;  2Y2W A;  3ZST A;  5I23 A;  4CVW A;  1BG4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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