1E73M

2-f-glucosylated myrosinase from sinapis alba with bound l-ascorbate
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
499
structure length
499
Chain Sequence
EITCQENLPFTCGNTDALNSSSFSSDFIFGVASSAYQIEGTIGRGLNIWDGFTHRYPNKSGPDHGNGDTTCDSFSYWQKDIDVLDELNATGYRFSIAWSRIIPRGKRSRGVNEKGIDYYHGLISGLIKKGITPFVTLFHWDLPQTLQDEYEGFLDPQIIDDFKDYADLCFEEFGDSVKYWLTINQLYSVPTRGYGSALDAPGRCSPTVDPSCYAGNSSTEPYIVAHHQLLAHAKVVDLYRKNYTHQGGKIGPTMITRWFLPYNDTDRHSIAATERMKEFFLGWFMGPLTNGTYPQIMIDTVGERLPSFSPEESNLVKGSYDFLGLNYYFTQYAQPSPNPVNSTNHTAMMDAGAKLTYINASGHYIGPLFEKDKADSTDNIYYYPKGIYSVMDYFKNKYYNPLIYVTENGISTPGDENRNQSMLDYTRIDYLCSHLCFLNKVIKEKDVNVKGYLAWALGDNYEFNKGFTVRFGLSYIDWNNVTDRDLKKSGQWYQSFISP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
publication title High Resolution X-Ray Crystallography Shows that Ascorbate is a Cofactor for Myrosinase and Substitutes for the Function of the Catalytic Base
pubmed doi rcsb
molecule keywords MYROSINASE MA1
total genus 196
structure length 499
sequence length 499
ec nomenclature ec 3.2.1.147: Thioglucosidase.
pdb deposition date 2000-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
M PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e73M00
2Y24A 3IJ7A 1W2VA 2GSJA 5I23A 3AMLA 1NOUA 3AIQA 3AMGA 1UWIA 4MPKA 4CCCA 2JFEX 4AZHA 1M01A 2EXOA 4UFIA 3F5JA 4AEEA 1KWKA 1Y7VA 3GZAA 1E4MM 2WNWA 1CIUA 1HKKA 4UFLA 2VJXA 1U30A 2ZICA 5LA0A 3K4DA 1W1VA 5A6BD 3WBAA 2WLZA 3BAJA 1HJVA 1HX0A 3AMKA 1FH7A 1BG4A 2WHKA 1U2YA 1UD4A 4CN6A 4ACZA 5ABFA 3WQ4A 3N18A 1WDSA 3ARTA 3NYDA 4DWSD 1OCQA 3CUGA 1VFOA 2XFYA 1B3ZA 5LA1A 2CERA 1C92A 1W9DM 1MQPA 2J7CA 3IAQA 3CUFA 4J3WA 4PMOA 4Z2HA 1SMDA 1HP5A 3EDEA 3UG3A 4AY1A 3GBEA 1W91A 4NRSA 3WL1A 1ZL1A 1B30A 4JFUA 3AIVA 1W3JA 4W7VA 3QHNA 4EKJA 3TP4A 1MFVA 1W2PA 2JF6A 1KQYA 5D8ZA 4S3JA 4H7VA 2QMKA 4LYPA 3WDRA 3N11A 1CXFA 2WBGA 3ZOAA 2EPOA 1VBUA 2PWFA 1VF8A 2XYLA 2F2HA 5C70A 4ATDA 1WZMA 2YDRA 3WEMA 1XV8A 4AZGA 1US3A 1FH8A 2PWEA 3CGTA 4D6EA 5IDIA 3K8LA 4YHGA 4OOUA 1UD5A 1GVYA 4C7GA 2V3DA 3W27A 3BLKA 2J8GA 4AD3A 3W0KA 3U7VA 3CZ8A 5CSYA 2WCGA 4WKHA 1HVXA 3BLPX 1CGXA 1UOKA 3DECA 2CPUA 2J79A 5AYIA 7A3HA 2J4GA 2QPUA 3WQ8A 4E8DA 3VOCA 1JF6A 2YIHA 2DSWA 1BPLB 3WH6A 3ZM8A 2MANA 3VDAA 4LYRA 3RJYA 3W24A 2FGLA 1HVQA 1JFHA 1UH4A 5FOOA 1BVNP 1SMAA 3UESA 3TONA 4HMCA 2EEXA 4UFHA 4AZ5A 1VEOA 2ZX6A 4QFUA 4RE3A 5BXTA 2GJXB 1GW1A 1E6NA 1FFRA 1UG6A 3CBWA 1EO5A 1UR2A 3AS0A 3WD4A 3II1A 2PBOA 2XM1A 1JYXA 1KR0A 2C7FA 4KH2A 1R7AA 3ARWA 4W7WA 2GFTA 2GJRA 5I24A 4KGLA 3F4VA 2J62A 1TFVA 3G6LA 2VZOA 1C8XA 4DUXA 3IK2A 4NZCA 4OOZA 5BROA 4WKAA 3EBVA 1DWHM 4HZ6A 4WSKA 2W63A 4URIA 1OGBA 3L4XA 4OBRA 3B8SA 4U2YA 1TE1A 3M07A 1L0PA 3WF0A 2OYKA 4WK9A 5A8NA 3ARPA 4UQEA 2FGZA 3NSNA 3ZJKA 3LMYA 3WMBA 5I3DA 2EBNA 4LXFA 3AOFA 4TX8A 4LX4A 2GK1A 2DPEA 3RM8A 4TVDA 4CVWA 1EA9C 1RH9A 4MNMA 1JZ5A 5FCZA 2YA2A 2D3LA 4AZCA 1ISXA 3MMUA 4HU0A 2EO7A 3W6MA 1JNDA 5D9NA 2VVSA 2UY2A 3NJ3A 4WKFA 1HF6A 1B3YA 3DYOA 4JFTA 4CD5A 1J9YA 1GOQA 3GBDA 1EDQA 3N04A 5D4YA 4KRUA 4JL1A 4UOQA 4Z2KA 3AHTA 1MXGA 1N82A 1GVIA 1WAWA 2VT0A 5TD4A 4HOXA 2WZEA 4P7QA 2WVUA 1DWJM 2QMJA 4JHZA 2OWWA 2Q8XA 4E4PA 3WNKA 3N13A 1GZJA 2WANA 4GQRA 1Q6DA 2VZVA 3VNYA 2Z1SA 2XGBA 1QI5A 2D1ZA 2E8ZA 3UR8A 5JBFA 2Y2WA 1JXJA 1P6WA 4D6GA 1HT6A 2G41A 3HN3A 3UG4A 1E6RA 3NSXA 4CN4A 3PN8A 3ZO9A 3RDKA 3VD7A 5D9MA 4PRWA 1NWSA 4JL2A 3AHVA 4AZ7A 1Q6EA 2XG9A 2CIPA 4CD7A 1GNXA 2WXDM 2D0FA 2ZXDA 1UKOA 2D2OA 4P7NA 4PMRA 1X6LA 3S2CA 4D72A 3OZPA 4R27A 1NQ6A 1SYTA 1UKPA 1JD7A 2W67A 3AS1A 3D5HA 2VURA 3ZSSA 3BMVA 1UYQA 3VO0A 5DO8A 1BYDA 3BH4A 4GIAA 2WMIB 1B0IA 4AIOA 3WNMA 3APGA 4ATWA 1JZ7A 3K1DA 2GVYA 5A6SA 1ZJBA 2X0YA 2WW5A 1EH9A 4ZENA 1NP0A 3QHOA 1A3HA 1OGGA 1U33A 2OYMA 4U3AA 3NDYA 2EPKX 1VEMA 2JEPA 4Q22A 1M03A 7CGTA 4GZIA 2AOSA 3CO4A 3OB8A 1WNOA 2YLAA 2UY4A 5FIPA 2X09A 2E9LA 3WL0A 2EPLX 5A94A 2F61A 1E3XA 3VM7A 3DC0A 1IT0A 1J01A 2DT3A 1EQCA 3QOKA 4AEFA 5ABEA 3GXMA 4Z2GA 5HNNA 5E0FA 2YBTA 2CETA 5CZKA 4WIWA 2WMJA 4L4PA 2ZUMA 4WF7A 1B1YA 2G3NA 1EO7A 2WC4A 1ZBWA 3VIOA 4ZXLA 4UFJA 4PUDA 1H0GA 2IUZA 1BF2A 2FHBA 2EPMX 3MMWA 4M1RA 2J7DA 3ZT5A 1HXJA 2CYGA 3K8KA 3SUTA 3T08A 2BHUA 5FD0A 5A6JA 5DT7A 2DSUA 3N9KA 3AYRA 3OLGA 2O9TA 4D6HA 1XSJA 1CBGA 4CCDA 1WE5A 2HISA 2E40A 3VMPA 1CGVA 1M7XA 3KL0A 3W4RA 1F4HA 3VX1A 3I3BA 1QW9A 1UHVA 2XIIA 1BGAA 4JKMA 3CPUA 2BS9A 1OT2A 2BFGA 4BS0A 1GHSA 1BQCA 4QDMA 1KXVA 5AC4A 4D1IA 4NRRA 2V5CA 2DDXA 3SCNA 2PWGA 1E9LA 3PZIA 3GXFA 3GH4A 3O2LA 4FLSA 4CU8A 4HA1A 1DWIM 5FL0A 4J3TA 4FF5A 2OYLA 4BQ2A 3A47A 4AYSA 3WIJA 1GOKA 2XJ7A 2YDQA 2JIWA 3A6OA 2WCSA 3W28A 4MB3A 3NDZA 4JAWA 5EFDA 2V38A 1JAEA 4FLRA 3GXDA 3WDPP 4V28A 3I3DA 1SFSA 1WZKA 3ALGA 4R5EA 2VO5A 4CU7A 4MB1A 1J10A 4Z2JA 2PC8A 2ZUSA 5JIPA 1KGXA 8CGTA 3L2LA 2WSPA 4DM1A 1QVBA 1US2A 3OG2A 1UZ1A 3RJXA 3WDQA 2WMGA 1XD0A 4PCSA 1QNPA 3VNZA 4W5ZA 1ODZA 3AXHA 5CGMA 3DYMA 2PWHA 3RMEA 4PUEA 4KWUA 3WKZA 2D22A 3THDA 1HKIA 1G1YA 1GOIA 1GONA 4P8VA 2GJPA 3UG5A 1PX3A 1IV8A 2WVVB 3AIWA 3VPLA 4EANA 4PMQA 1JZ3A 4PEEA 1XYZA 1JI1A 3AIBA 2BY3A 4HMDA 3BAIA 1LL7A 1H0IA 1E0VA 2PBGA 1LLOA 1O6IA 5BRPA 1JDDA 1JZ2A 2XSAA 4XV0A 5JBDA 3AYSA 4AIEA 2WKGA 3AQUA 1JNEA 3CLWA 5HPCA 1WZAA 4P8WA 2CXGA 1UKSA 1FA2A 1WKYA 3SURA 1B3VA 1OWQA 1CEOA 3VGDA 2QHAA 4TUFA 3WENA 1E72M 2AAAA 1RD6A 2B31A 3PZUA 4PMZA 2YJQA 3RCNA 1J0IA 4BZYA 1JIBA 4D6IA 1V3IA 1OD0A 1G94A 1XH1A 1H2JA 2J25A 1B3WA 5A6MA 4MDOA 2BXYA 4QLKA 3WQVA 2O9RA 1UA3A 3WUBA 3WNNA 1GOOA 1E40A 1B2YA 2G8ZA 2XGIA 1G5AA 4X9YA 1JDAA 2WMFA 7TAAA 4RE2A 4GZJA 1E55A 4EE9A 1GOWA 1GQJA 2X05A 2VX5A 1ECEA 3VUPA 1FHDA 5EB8A 1IZKA 3W38A 2G3IA 1UQYA 3PTKA 3WN6A 1GJWA 1V0NA 4XX6A 1QI4A 5BXSA 3N1AA 2Z1KA 3EMQA 2XM2A 1JI2A 5I77A 5M17A 1VENA 3GTNA 4H8VA 4PMNA 4DUVA 2HVMA 4EK7A 4GI6A 3W29A 4U5IA 2WBKA 6CGTA 3MO4A 5GQBA 1TVNA 1C93A 4TVUA 1ISVA 1RPKA 4JZ5A 1E1FA 4FLQA 1K9EA 1GQKA 4PTXA 1OBAA 2WWDA 2BVTA 3T2OA 3WQWA 1ISYA 3B9EA 2C0HA 4IUGA 4M24A 3WSUA 1CECA 5A2AA 2D20A 4ML4A 3VIJA 3WNOA 1CGTA 4PMVA 2BVDA 1JZ6A 2DIJA 1W9UA 4JFWA 1EHAA 3RM4A 1X1NA 4CD8A 3M46A 2DQXA 2GDUA 2XIBA 4B16A 1H49A 4FLOA 4N0RA 1E0WA 1QI3A 3VX0A 4LPCA 2VZUA 4AD5A 4LQ1A 4W85A 1BGGA 2J7EA 1FP8A 3L2MA 4W7UA 3WUEA 1C8QA 1L8NA 2XTKA 3SEPA 3ECQA 2ZUWA 3MANA 5IHRA 3AXIA 3VVGA 3HJEA 2YL5A 3BAKA 5HXMA 5LA2A 4M8UA 3WD2A 5A3HA 1I1WA 1PJ9A 1MW0A 3WF3A 5A8QA 1B3XA 4ZE4A 4AISA 2WKLA 1PZ3A 4BA0A 3CUJA 3TTSA 1OIMA 1GUVA 2PWDA 3L4YA 4ACZB 5ABFB 5JIWA 1EDGA 2BXZA 3HU7A 1HP4A 1RP8A 3B9AA 2G4FA 5A6BA 4YHEA 2QV4A 4U31A 5EFFA 3CUHA 2V3FA 1FHLA 1E71M 1TVPA 2VRJA 1JYNA 2EJ1A 1JZ4A 1W3HA 4P8UA 4PMYA 4UZUA 4ZXOA 1C91A 1ZBVA 4D1JA 5HPOA 2CCRA 2YKKA 4DWSA 1UR0A 2E8YA 4UOJA 1QW8A 4PSRA 2WAGA 1E70M 3VIIA 2XVLA 5D9PA 2VQTA 1BVZA 1ODUA 5I5RA 1CLXA 3QGVA 4MAVA 2QLYA 2DGAA 1UH3A 1TZ7A 1UD6A 1UR9A 4B3LA 2OSXA 4QLJA 2V3GA 1TUXA 3VU2A 3MUAA 3MUIA 1CTNA 2ZWZA 3BXWA 1KQZA 1BFNA 2WCAA 1J18A 1CGYA 4MB4A 1UD2A 2UWFA 3KL5A 3OGSA 3IJ8A 1XGZA 1EQPA 3WBEA 3PHAA 4CKQA 4JKLA 4KGJA 2XVKA 1KCLA 4AD0A 1XYFA 3L4UA 1UD8A 4J3UA 1UH2A 3VGGA 2AMGA 1BSIA 3BAXA 1WDPA 1GQLA 1MXDA 2VI0A 4B15A 1W9VA 3OGRA 2WM0A 3POHA 2JF7A 3VGEA 4D71A 4QCEA 4FMVA 1F4AA 1EIBA 1TMQA 2WSKA 3RO8A 3AHXA 1V03A 2W66A 2WWCA 3CUIA 2NT1A 1XH0A 2ZX9A 3WF2A 1J12A 2VR4A 3PZQA 3CHEA 2D0HA 3CMGA 3VIMA 1Q6GA 5IXEA 4Q7NA 1UKQA 4P7RA 4CGTA 1G01A 3VD5A 4H04A 1DEDA 3MU7A 3W37A 1HJXA 2ZOXA 2OLHA 1CYGA 2VQUA 4S3KA 1MVYA 3OLIA 4GI8A 2OWCA 1R85A 1JG9A 3UR7A 3WDIA 1V6YA 1HNYA 2QF8A 3DHPA 4U3CA 1ZBKA 2VCBA 4MDPA 4HMEA 4ATLA 3CZEA 1XSKA 3WF4A 5GNYA 3CHCA 3VMOA 3M6DA 1G9HA 3WUGA 2W92A 4TTUA 1JXKA 1GORA 3VIPA 4X0VA 3SCPA 1JAKA 1UA7A 2VRKA 3FW6A 4WLCA 4AD1A 1DWGM 5KEZA 1NOFA 4TVCA 3ARZA 3RIKA 1R87A 4HA4A 3PZOA 4CD4A 4PTVA 4E2OA 4JFVA 3SCWA 1UR8A 3WD1A 1W9PA 4GI9A 5ABGA 1IZJA 1LWHA 4XZWA 1ISWA 1QNOA 3AZSA 4M81A 4HZ7A 3VIFA 2GK1B 5E6YA 3TTQA 5CPTA 3BSGA 5JUVA 4PBGA 4TX6A 4V27A 4CD6A 4L4OA 1E73M 3MS8A 4MADA 3PZ9A 1UWRA 1E5NA 4AZCB 1BG9A 3WH8A 4AZ6A 3AIRA 4HU8A 2DH2A 1V6VA 4UFMA 1HKMA 5C8BB 4CU6A 3FXYA 4UCFA 3U5YA 1VJZA 2CBVA 4KRTA 4J27A 4D6JA 5BXRA 3VIKA 1AMYA 3VINA 1QHZA 2J8FA 3EDJA 3WH9A 3W81A 3ARSA 3MKKA 3KEHA 2DSVA 2XFRA 5BCAA 4MNJA 4JKKA 2NW0A 2WZIA 1MW3A 1UWUA 1UR1A 2VX6A 5EMYA 3ZR6A 4A3HA 4TTGA 4UQAA 1UWTA 3D3AA 2CNCA 2PI6A 3T2PA 1HN1A 4H2CA 1XRVA 3ZMRA 3WQ5A 1E4NA 2A3EA 3I3EA 2O92A 2VX7A 1HIZA 1QNSA 2J7GA 4XB3A 4BF7A 5FL1A 1KCKA 3TTYA 4JHOA 2DSKA 3DHUA 1KR1A 2ZUNA 2WVVA 1VB9A 1PX8A 1CLVA 1LG2A 2VMFA 1UD3A 1ZBCA 1R8LA 4BQ3A 1W9XA 3IANA 2VC9A 4UQ9A 3EDFA 4OUEA 1DWFM 3BAYA 2CBUA 2J7BA 1QBBA 1JL8A 3SUWA 1KBKA 1XC6A 2UY5A 2J74A 1W3LA 1D3CA 4OIFA 3SCSA 2VX4A 2C8NA 5E0CA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2Y24 A;  3IJ7 A;  1W2V A;  2GSJ A;  5I23 A;  3AML A;  1NOU A;  3AIQ A;  3AMG A;  1UWI A;  4MPK A;  4CCC A;  2JFE X;  4AZH A;  1M01 A;  2EXO A;  4UFI A;  3F5J A;  4AEE A;  1KWK A;  1Y7V A;  3GZA A;  1E4M M;  2WNW A;  1CIU A;  1HKK A;  4UFL A;  2VJX A;  1U30 A;  2ZIC A;  5LA0 A;  3K4D A;  1W1V A;  5A6B D;  3WBA A;  2WLZ A;  3BAJ A;  1HJV A;  1HX0 A;  3AMK A;  1FH7 A;  1BG4 A;  2WHK A;  1U2Y A;  1UD4 A;  4CN6 A;  4ACZ A;  5ABF A;  3WQ4 A;  3N18 A;  1WDS A;  3ART A;  3NYD A;  4DWS D;  1OCQ A;  3CUG A;  1VFO A;  2XFY A;  1B3Z A;  5LA1 A;  2CER A;  1C92 A;  1W9D M;  1MQP A;  2J7C A;  3IAQ A;  3CUF A;  4J3W A;  4PMO A;  4Z2H A;  1SMD A;  1HP5 A;  3EDE A;  3UG3 A;  4AY1 A;  3GBE A;  1W91 A;  4NRS A;  3WL1 A;  1ZL1 A;  1B30 A;  4JFU A;  3AIV A;  1W3J A;  4W7V A;  3QHN A;  4EKJ A;  3TP4 A;  1MFV A;  1W2P A;  2JF6 A;  1KQY A;  5D8Z A;  4S3J A;  4H7V A;  2QMK A;  4LYP A;  3WDR A;  3N11 A;  1CXF A;  2WBG A;  3ZOA A;  2EPO A;  1VBU A;  2PWF A;  1VF8 A;  2XYL A;  2F2H A;  5C70 A;  4ATD A;  1WZM A;  2YDR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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