1ECE | Genus

Total Genus 136

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	136
sequence length	358
structure length	358
Chain Sequence	AGGGYWHTSGREILDANNVPVRIAGINWFGFETCNYVVHGLWSRDYRSMLDQIKSLGYNTIRLPYSDDILKPGTMPNSINFYQMNQDLQGLTSLQVMDKIVAYAGQIGLRIILDRHRPDCSGQSALWYTSSVSEATWISDLQALAQRYKGNPTVVGFDLHNEPHDPACWGCGDPSIDWRLAAERAGNAVLSVNPNLLIFVEGVQSYNGDSYWWGGNLQGAGQYPVVLNVPNRLVYSAHDYATSVYPQTWFSDPTFPNNMPGIWNKNWGYLFNQNIAPVWLGEFGTTLQSTTDQTWLKTLVQYLRPTAQYGADSFQWTFWSWNPDSGDTGGILKDDWQTVDTVKDGYLAPIKSSIFDPV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Glycosyl hydrolase
source organism	Acidothermus cellulolyticus
publication title	Crystal structure of thermostable family 5 endocellulase E1 from Acidothermus cellulolyticus in complex with cellotetraose. pubmed doi rcsb
molecule keywords	ENDOCELLULASE E1
total genus	136
structure length	358
sequence length	358
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	1996-04-04

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1eceA00

4KWUA 3OLGA 2PWGA 3GH4A 4DWSC 3WY1A 3WH5A 3FY1A 1NP0A 4ACYA 3D3AA 3VVGA 2PBGA 3EMCA 1YQ2A 2EPNA 4ZE5A 1U33A 3L4VA 2YOCA 2WCGA 1UD3A 3GXDA 3A47A 3WQ4A 4NI3A 3WUGA 3SCOA 4PMNA 4EANA 4LPCA 2ZWYA 3ZT7A 1ISXA 5BXRA 4AWEA 3AHTA 4D72A 3WQ8A 4A3YA 2ZX8A 1FH7A 2GVYA 1BGGA 8CGTA 3VO0A 1WKYA 4QLKA 3NIYA 2EO7A 1E73M 3IJ9A 4EKJA 1UA7A 1ITXA 4A3HA 4B9ZA 2DH2A 4E2OA 3WDRA 2BV9A 4LGXA 3B8SA 2WCSA 1QPKA 3TONA 3CTTA 4QLJA 2ZXDA 2O9PA 2Z1SA 2J7HA 5BYWA 1BYDA 1V6UA 4WJXA 5E0CA 5FKYA 2XVLA 3MS8A 1MQPA 3GNRA 1W3HA 1GHRA 3MUZ1 1C8XA 5BXPA 4U3AA 4WSJA 2DDXA 1CEOA 2VRJA 2CERA 3SIMA 2Y2WA 3VM5A 4AY1A 3WFLA 2XFFA 1B90A 2Y5EA 4D71A 3PZIA 5E6YA 3PZQA 3CZEA 3VGFA 1ZL1A 2BFGA 3CZLA 1W9PA 1HJVA 1OD8A 1BLIA 5ABEA 1H5VA 4P8XA 3VDAA 3AIBA 4UQCA 3N9KA 4TVCA 4YPJA 1PJ9A 2WHLA 4UNIA 2WC7A 5KEZA 5E09A 4H8UA 5EMYA 3CMGA 2G41A 3PZ9A 3UR8A 1CENA 5A2CA 3K1DA 3VX0A 3N12A 4AISA 3MSDA 4BQ2A 3SCSA 2WMJA 4OJYA 3ARSA 3VKKA 2DT1A 2ZUWA 3UG4A 5CQ1A 1PPIA 3WNLA 3NSNA 3U57A 2PBOA 1ODZA 1QHOA 3N15A 1JZ3A 3SCQA 1UD2A 1ISWA 2XUCA 2YJQA 2CEQA 1CPUA 3IAQA 5IXEA 2VZUA 2BY1A 2WPGA 3TP4A 4JHZA 1CGWA 4WF7A 1KB3A 4HU0A 4AD0A 2WW5A 9CGTA 5A6BD 1Q6EA 1V3HA 3CZKA 1KCLA 3EMZA 5A6BA 3WEZA 1XGZA 2WXDM 1W9DM 2PWHA 1OCQA 1BHGA 1KR1A 3UEQA 1J12A 2XFRA 1ZBWA 4HTYA 2X8RA 3VGEA 4UTFA 3D5HA 5JBFA 1CXHA 2HISA 3AOFA 1G0CA 2O9TA 2VZSA 4PMYA 5FL0A 2OLHA 1R86A 1W9XA 2EBNA 1JF6A 5JBEA 1UR9A 4AXNA 3MUIA 3WMCA 2FHFA 3WNOA 1H0GA 4LYQA 3WDIA 2E9MA 2BHZA 1V02A 4X0VA 3OBAA 1YHTA 1J0YA 2WMIB 4W8AA 1JDAA 3AICA 3MMUA 4J3UA 3MKKA 5I0DA 5D8ZA 2DT3A 2X1IA 4CN4A 1H11A 4AD1A 2XVPA 1W91A 1V0MA 1HJSA 5D8WA 1M7XA 3ARPA 2OSYA 2W62A 5LA2A 1LQ0A 4JFSA 1D2KA 1C7SA 3AZRA 3ZR5A 5CGTA 3VUPA 3K4AA 1J0KA 4PN2A 3CUIA 2ZOXA 1KXQA 4DWSB 1XH1A 2FGLA 4RL3A 3AMDA 4GINA 4PTMA 1V02E 3ALGA 1MW2A 4PTXA 1KWKA 1WZAA 2WSKA 4JFVA 4LYPA 3AYRA 3T2QA 4EK7A 1G5AA 2ZXBA 3WL0A 2TAAA 1V0KA 2UY5A 2XHYA 2C0HA 1EQPA 3RCNA 4UFMA 2XIIA 2YL9A 2JALA 2F2HA 5GNZA 5HNNA 1Y7VA 4PSRA 1C93A 2G4FA 4BQ4A 1B30A 1H49A 3WDPP 1WE5A 1J0IA 1UZ1A 1CGTA 2J7BA 3POCA 4KRTA 4QFUA 2E9BA 3EDEA 4MPKA 3OGVA 5BCAA 2VO5A 1F4AA 1FFQA 1PZ2A 2XJ7A 5ABFA 1UQZA 1MQQA 2DGAA 3VDBA 1JFXA 3ZJ8A 3BAYA 1HKKA 2YL8A 3LPPA 4TOQA 2VVSA 3CH9A 3VU2A 1J0HA 4MNMA 1G94A 3AZTA 2O9OA 3A3HA 1UH2A 2XGBA 3U7BA 2ZUMA 4PTWA 1SMAA 3SCPA 5ECUA 3BAKA 3GNOA 3WH7A 2G3MA 4PMDA 2WWDA 1H4PA 1E6RA 3N17A 4XUYA 4AIUA 2WMIA 1Q6DA 1E0WA 4HA1A 1FP8A 1NWSA 1LL6A 5I77A 2WZHA 5JIPA 2WKGA 3PN8A 1V6XA 2J74A 1GVYA 3DYOA 4URIA 1JYNA 1E6ZA 4FLOA 4ZENA 1E56A 3F4VA 4B16A 2E3ZA 8A3HA 2D0GA 4HPHA 3VGBA 4UFKA 1KQYA 4GI9A 2V5CA 2DIEA 3SUSA 1WDPA 1QBAA 1DWAM 1B3ZA 1PX4A 3CLWA 3CZ8A 4J3VA 4W88A 2GJRA 1E3ZA 3VIFA 4DWSD 4IPNB 1NWUA 4CD7A 2YA1A 3CHFA 4DWSA 4J3WA 3VIHA 1MYRA 2WHMA 5E9AA 3WQ5A 4UCFA 4QAWA 4JL1A 5A6KA 2Z1KA 3GBEA 1FHDA 4ACZB 4ATLA 4AZGA 4P7LA 3PTMA 3W53A 3ARYA 1HXJA 4J3TA 2X09A 2X0HA 3AI0A 3PZNA 1XYZA 1R7AA 1UR1A 1RH9A 2D0HA 1E6XM 1VFFA 1CLXA 1XD1A 2WHJA 3WF0A 1FFRA 3VGDA 1W3KA 2IXVA 3RM8A 4W7VA 1CTNA 1JYWA 3AYSA 1EDQA 2QPUA 5HBFA 2Q8XA 5DO8A 2VX6A 2VR5A 5I78A 1M04A 3WD1A 1EHAA 4D6IA 4TVUA 5CSUA 1HL9A 1W3JA 4A4AA 4M24A 1XC6A 1HN1A 4PUDA 5A2AA 4AZBA 4Z2KA 3NJ3A 4V28A 4TX8A 5JBDA 5EFDA 2EPLX 6TAAA 1WP6A 2WANA 3NCOA 1QBBA 1UZ4A 2VX5A 3AMLA 2J47A 1IV8A 3WSUA 1E71M 4PUEA 3W27A 3IK2A 4PMUA 1XV8A 2J8GA 3AZSA 1Q4NX 1XH0A 3BCDA 1M53A 1WZLA 4AD2A 1OB0A 4Z2HA 2BXYA 2J7CA 1VJSA 1EDTA 2YIHA 5IDIA 3ARXA 3T08A 3VDCA 5CXPA 2J7GA 3TTSA 3VINA 3EDFA 4ZEPA 3T2OA 1BYCA 3VX1A 1OT2A 1OBAA 3CHCA 1GOKA 2CHOA 1IZKA 2FH6A 1DWJM 2GJXB 2G3JA 2ZUNA 1NARA 1XSJA 1CDGA 2CBIA 4P8WA 3RDKA 4UZUA 4ACZA 1FH9A 4PEEA 1QW9A 3CUFA 3PZTA 4MB1A 1BQCA 3KE0A 1B3XA 3CPUA 4CD6A 5C8BB 1JL8A 3CIVA 3EYPA 3WNKA 4OZOA 3DYPA 2XVNA 2VVNA 2OYMA 2J8FA 2GJPA 1HJWA 1OD0A 4AMCA 1C8YA 3O9NA 3UCQA 4JL2A 3U7VA 3AJ7A 5KZ6A 5IHRA 1W1VA 1PBGA 4CD8A 5I5RA 3ARUA 3VMNA 3W6MA 2W61A 1JAEA 1B9ZA 4D6HA 4JFWA 1IZJA 2WAGA 1UH3A 2VRKA 1AQ0A 4CCCA 4OKDA 4D1IA 2EEXA 2GDUA 4AIOA 1EXPA 1E4NA 1NWRA 3AS2A 1JXKA 4KGLA 2CXGA 4ZXLA 2VI0A 1VRXA 1M01A 2E8ZA 1KR0A 4YHGA 4U3CA 4JAWA 1UH4A 1HNYA 1K9FA 4UOZA 4M29A 2BY0A 3FAXA 1R7OA 1X6LA 1VEPA 3CGTA 3L2MA 3AXIA 5CG0A 2PI6A 5DF0A 2BXZA 4UFHA 3I3EA 4XZWA 3SCTA 5ABHA 1AQHA 1WO2A 1JZ5A 1G9HA 4AC1X 1EA9C 3OG2A 1E5NA 1VBUA 2Y4SA 3OB8A 4W84A 1UKOA 4MJ4A 2VR4A 3SUUA 3MANA 1CECA 3II1A 1VBRA 4BS0A 3TTOA 4GI8A 2J79A 4IISA 4Z2IA 1CZ1A 3VIGA 1V6YA 3W38A 4MB3A 2GJXA 4J27A 4YN5A 3FHAA 1F4HA 1W1PA 1UQYA 1GHSA 1KXVA 1DWGM 2ZX6A 4TTGA 1FHLA 4OOUA 5DFAA 3MO4A 4HU8A 4TX6A 2VNCA 1KBKA 3OGSA 5HXMA 1CXKA 1E6SM 5A1AA 1SMDA 1H0IA 4WSKA 4PBGA 1WB0A 1TA3A 4CU7A 3WBAA 1BG4A 2XGIA 2VJXA 3WN6A 2WWCA 1JXJA 4DM1A 5CGMA 1HKMA 4B3KA 4C7GA 2RGLA 3K8MA 3KEHA 2JFEX 1KBBA 3MUY1 5M03A 5BRPA 4MTVA 3WF3A 2VL4A 3AIRA 3VNYA 5BXTA 1ZJBA 1WZKA 4W93A 1UOKA 4F8XA 1E5JA 4WKHA 2ESCA 3AMGA 1SR0A 3QGVA 4TXEA 1HJXA 5I3DA 3K46A 1NOWA 1JFHA 5BXSA 4WK9A 3LMYA 1BYBA 1LJYA 2CHNA 4D6DA 1EGZA 1J01A 1X1NA 3A4WA 4PTVA 4AD3A 5A94A 1EO5A 2CBUA 3A6OA 4JKMA 5A69A 1LWHA 2CYGA 5BRQA 4JKLA 3ZR6A 4CVWA 4CN6A 3RJXA 3KZSA 4BCEA 2YLLA 2VUYA 5M17A 1BSIA 4W85A 1GOMA 3N18A 1UD6A 2Y8VA 2PC8A 4CCDA 1B3YA 1V3MA 2NT1A 5AYIA 1B3WA 2AMGA 3KL3A 2YA2A 3FAWA 3WUEA 5I2UA 2BY3A 1ZU8A 4V2XA 3WEOA 5LA0A 1HT6A 5ABFB 4HA4A 3RIKA 3SCRA 4PCSA 1ESWA 2NT0A 1XCXA 4XB3A 2JEPA 2XG9A 3RJYA 2QMJA 5CLTA 4MB5A 2A3HA 4LQ1A 1PX8A 2UY4A 1VEMA 3B9AA 4Z2LA 4XZBA 1VENA 1V6WA 3DHPA 3BLKA 3OZPA 1MQRA 1CIUA 1Q6CA 2WMHA 3WDQA 2WSPA 1TE1A 5A8PA 1ISZA 2YLAA 4S3KA 3VD3A 5CJ5A 2WC3A 1QI2A 1OGGA 1V3KA 3VPLA 4WKFA 1HX0A 3WFZA 2XYLA 4V27A 2W4XA 5D9PA 3UG5A 1K9DA 1UKSA 4LX4A 3IAPA 1UKTA 3EMQA 4YHEA 1CWYA 3F5LA 3UESA 4AZCB 4CD4A 4CGTA 3DECA 1W1YA 2OYLA 4DM2A 3M6DA 5CSYA 5LYRA 2ZXAA 2ZUTA 1JD7A 4AZ5A 4K68A 3AQUA 4M80A 2QPSA 1JYVA 1E6NA 2ZE0A 5DMYA 5LA1A 2GSJA 2WKLA 2JIWA 3QOMA 1TZ7A 4OUEA 3WNNA 3AMKA 1GQJA 3VIIA 4C7DA 1A47A 2ZIDA 4RE3A 3EDJA 3I3DA 5E0FA 4QCEA 1V3LA 2CESA 1M03A 5HPOA 2XVKA 1UR8A 5EB8A 4DUVA 3TTYA 1DTUA 4PMVA 5A6JA 2WVSA 1GPFA 4W87A 3K4DA 2VOTA 1KCKA 4MNKA 3OLDA 4UQEA 2DPEA 4HOWA 4C7FA 3SUTA 1TMQA 1DEDA 2PWDA 1WAWA 1J11A 1UWSA 1GCYA 1CGXA 1R87A 1I75A 4U5IA 4FLSA 3UG3A 2PF0A 1VFOA 4XX6A 3L4WA 3MV11 2VCCA 1HJQA 4TVDA 3ARZA 2WNWA 3B9DA 3J7HA 4P7RA 1HKJA 1ISVA 1DWIM 1JD9A 3NSXA 4D6JA 4Z2JA 1KWGA 4CKQA 2A3CA 1RD6A 1ZBKA 2BY2A 3CZGA 4NRRA 1MFUA 6CGTA 3AIQA 1QNPA 1CXLA 4OOZA 4PCTA 1O6IA 1MXGA 3CHDA 3M7SA 4H2CA 1EDGA 1GOOA 2DEPA 5E6ZA 4AZ7A 3WH6A 4EE9A 1E72M 1MXDA 3BAIA 4KGJA 1E3XA 4JFUA 4CCEA 1PAMA 4S3JA 5A6SA 4UQDA 1Q6FA 1S46A 2XIBA 1OGSA 2J4GA 2VCAA 3DC0A 3ZT6A 4MB4A 5FCZA 5AYBA 1SFSA 1PIFA 3VGHA 1UWTA 1B2YA 3OGRA 5BWFA 2J78A 3FXYA 2J7DA 4RE2A 3AHXA 2V3DA 2ZUVA 4U2YA 4AZCA 1UUQA 1JNDA 4P8VA 1BVNP 4GO8A 4X0NA 1HJUA 1J0ZA 3WUBA 3CHEA 2GK1A 4FLQA 4MAZA 3AIEA 1UD8A 1WDSA 4M1RA 1GQKA 1XYFA 2CKSA 4KH2A 4PMRA 5GPRA 1WNOA 2YDSA 1SYTA 4HMDA 3ZO9A 4AW7A 1XD0A 2EPOA 4U2ZA 5A8MA 4IM4A 2WZIA 3AS3A 2J62A 3KL5A 3AXHA 3VD5A 1GZJA 5ABGA 4MADA 3ZT5A 2ZXQA 5M5DA 1PZ3A 3W6LA 2CIPA 3WH8A 1HP5A 4BA0A 3WMSA 3LPGA 4EAMA 1GQLA 2FH8A 2D3NA 3G6LA 3ZJ7A 1CNVA 3PTKA 1MW3A 1D7FA 4P7QA 2VZOA 3AFBA 3TTQA 1K6AA 2DT2A 3W26A 4CN1A 1A3HA 3ZMRA 4F9JA 1CBGA 1E0XA 3WUFA 1JDDA 2G8ZA 4TTUA 1J18A 1PIGA 1W9BM 6A3HA 2QV4A 1BAGA 4E8DA 4P7OA 2CETA 3VIMA 3L4ZA 4D6GA 4CU8A 1NQ6A 3SCVA 3VTRA 3K8KA 3HMCA 1UHVA 3DHUA 1ECEA 1BTCA 3QR3A 1Z32X 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2UWFA 4NRSA 4MAVA 3VDHA 3TA9A 1RP8A 1H3GA 2XSBA 7A3HA 2CKRA 1BGAA 1UR2A 2VT0A 1DP0A 2WLYA 2QLYA 4F9DA 3U5YA 4CD5A 1QW8A 4Q22A 3PTQA 1GNXA 2BHYA 3I3BA 3ZJKA 2VCBA 1W2VA 3GZAA 4UR9A 1IT0A 2VZVA 4P7NA 1C92A 5JUVA 2WZEA 1PX3A 2ZICA 1QOXA 1GVIA 1OM0A 3HJEA 2XTKA 1HIZA 3GH5A 2FHCA 3W28A 2DH3A 5HDRA 3N11A 1JG9A 3T0AA 3WEMA 2V5DA 3ZM8A 1H41A 4FF5A 3AROA 1TUXA 2G3NA 4D6FA 2QMKA 4OBRA 1E55A 1JDCA 2PWEA 1P6WA 2YBTA 4HZ7A 4W86A 2DSZA 4LYRA 2GUYA 1GJUA 3WF1A 1BPLB 1C7TA 4UQBA 2D23A 3ALFA 3THDA 5IFTA 1J9YA 4M81A 2DSKA 1E70M 4ZE4A 2OSXA 3WD0A 4Q7NA 1LG2A 5A8OA 4H8HA 3GNPA 2W92A 2W67A 2IXUA 2E8YA 2AOSA 2XWDA 2VC9A 3GTNA 5AY7A 1JIBA 2XSAA 1JZ4A 4JKKA 1UD5A 4D6CA 2YBUA 2GFTA 3GDBA 3KWXA 2PB1A 2J7EA 1KGWA 1TR1A 2XM2A 4L4OA 1QNOA 4AZIA 1AVAA 4UFLA 5C71A 2ZWZA 1UWUA 2E4TA 5DT5A 1OWQA 1GOWA 2WBKA 2X05A 2XWEA 5AC5A 1JF5A 1KQZA 5C70A 2D2OA 1K9TA 3T0BA 5A8NA 2W66A 1XSKA 3CUHA 4PMOA 3AMCA 2DSUA 2WHKA 1VJZA 4AIEA 5I24A 3VMOA 3FNDA 1CGVA 1HVQA 2CNCA 1K9EA 1XRVA 2X0YA 4W89A 4FLRA 3NYDA 1LWJA 3RILA 2D20A 3N13A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1ECEA

Total Genus

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