1ECE | Genus

Total Genus 136

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	136
sequence length	358
structure length	358
Chain Sequence	AGGGYWHTSGREILDANNVPVRIAGINWFGFETCNYVVHGLWSRDYRSMLDQIKSLGYNTIRLPYSDDILKPGTMPNSINFYQMNQDLQGLTSLQVMDKIVAYAGQIGLRIILDRHRPDCSGQSALWYTSSVSEATWISDLQALAQRYKGNPTVVGFDLHNEPHDPACWGCGDPSIDWRLAAERAGNAVLSVNPNLLIFVEGVQSYNGDSYWWGGNLQGAGQYPVVLNVPNRLVYSAHDYATSVYPQTWFSDPTFPNNMPGIWNKNWGYLFNQNIAPVWLGEFGTTLQSTTDQTWLKTLVQYLRPTAQYGADSFQWTFWSWNPDSGDTGGILKDDWQTVDTVKDGYLAPIKSSIFDPV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Crystal structure of thermostable family 5 endocellulase E1 from Acidothermus cellulolyticus in complex with cellotetraose. pubmed doi rcsb
molecule keywords	ENDOCELLULASE E1
molecule tags	Glycosyl hydrolase
source organism	Acidothermus cellulolyticus
total genus	136
structure length	358
sequence length	358
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	1996-04-04

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1eceA00

3WD1A 1ESWA 4GQRA 4P7QA 4W86A 3T0BA 1JYXA 1V6UA 5A6BA 1QBAA 3BAJA 1XSJA 3AZRA 3M46A 3CMGA 3FNDA 2VCAA 2WPGA 1R85A 3ZR6A 1BVNP 4A3YA 4CN4A 3VIKA 1A47A 3AMDA 1X1NA 5FL0A 1GORA 1HT6A 4HPHA 2QF8A 3GH4A 1JAEA 1HJXA 1J9YA 4D6IA 2WM0A 2ZWYA 2WCSA 1IT0A 3ARTA 2XHYA 3W24A 3N11A 1HVQA 3EDDA 1MQPA 2WMFA 5D9MA 5M3WA 3BAYA 1HL8A 1SYTA 1H4PA 2A3EA 1CEOA 3VDHA 4BA0A 4EK7A 8A3HA 2YKKA 2EBNA 5ABGA 4TX6A 1ZBCA 1E73M 2YBTA 1LLOA 2E8ZA 3UETA 1JI2A 2V5DA 3WD2A 3NUKA 3O6AA 1G0CA 1E0WA 1HJUA 3RM4A 2JF6A 1PX3A 2WK2A 2XUCA 1UKSA 3CPUA 4R27A 2DH3A 1ISWA 4KGJA 4NRSA 4D6CA 1EXPA 1EHAA 3U7BA 5CGTA 1I1XA 4N0RA 1HX0A 4GIAA 4NSBA 3ZM8A 3WD3A 4W7VA 4Z2KA 1XHGA 1HL9A 3SUVA 4JFVA 1Z32X 4HZ7A 3WEMA 4NI3A 2WVVA 3AS2A 5CPSA 2EQDA 3WFZA 1RH9A 1MQQA 2WMIA 1FA2A 1VJSA 3FN9A 3W6LA 4DUVA 3WUEA 2CNCA 4M8UA 1CGWA 4PYSA 1JGIA 2C0HA 2XFFA 5JBDA 4BZYA 1B1YA 4D71A 3I3DA 4JFSA 4QAWA 5EMYA 5I0DA 4ACZA 2ZIDA 1K9DA 3VKKA 3T0AA 2X09A 2XJ7A 1E1EA 6A3HA 5A8OA 1UH2A 1ODUA 3VGFA 3WKZA 1TR1A 2VQUA 1UWTA 3NSMA 1VF8A 4GKLA 2BY0A 3EMCA 1XSKA 3ECQA 1WZLA 1XYFA 3CZGA 3MU7A 4GZEA 4D6JA 3KE0A 1PPIA 2JF7A 4H7VA 4J3VA 4XB3A 3CUFA 2VZOA 4BF7A 1DWJM 3MS8A 3S2CA 4XUYA 1UD3A 4AISA 4MB1A 4JHOA 1BYCA 1DWIM 3VD5A 4ZENA 4B3LA 3EBVA 1FP8A 1OT2A 3WNLA 1D3CA 4V2XA 3THCA 1OIFA 3CBWA 1TA3A 4XZBA 3ARWA 3AS3A 3CZKA 4WSKA 4P8WA 5GNXA 4JFTA 1Q6FA 4NF7A 3CTTA 2IXUA 3WQ5A 2WZIA 3N12A 1MW0A 4MAVA 3VUPA 1BFNA 1R7OA 2ZOXA 3WH7A 1B3YA 2GJRA 2DT2A 2AMGA 4KMQA 3U7VA 2XVLA 4MJ2A 1HJSA 4CU6A 4ZE5A 2W61A 2O9PA 3WDHA 4IM4A 3ARPA 2WHKA 2VO5A 1XH0A 3CUHA 4LXFA 1V02A 4KRUA 2BFGA 4MJ4A 5E0CA 3PZNA 5A95A 3OB8A 4DUXA 1W9UA 4PEEA 3PZQA 5AC4A 3B9AA 1JYWA 4MDPA 2GK1B 4C7DA 3K4AA 1OCQA 1C90A 2EPMX 4LQ1A 3VMPA 4BCEA 4W5UA 3AI0A 1RP9A 1G94A 2CBVA 2WANA 4AW7A 2VRKA 1TVPA 4R5EA 1GJUA 4GO8A 5A6AA 4WIWA 3MKKA 9CGTA 1UZ1A 1BAGA 1TMQA 2WVTA 3CHEA 2RGLA 2D24A 1PEZA 2CXGA 1D7FA 1JZ8A 4GI8A 4S3KA 1SR0A 2VMFA 1JF6A 1H0IA 1KCKA 4PCTA 5HNNA 1DTUA 3AISA 2V3GA 2VX4A 1OM0A 1J18A 5E09A 1W1TA 1V08A 3WENA 2ZUVA 4J3WA 4M24A 2W67A 1R86A 3D3AA 3VD7A 4MB3A 1OGSA 1WDRA 4JHZA 3WIJA 2ZXQA 2WVUA 2BV9A 2GJPA 1US3A 2VX6A 3W0KA 1GNXA 4J3TA 4ATDA 1GOIA 2DPEA 4JIEA 3BH4A 1CGYA 2D2OA 1CXFA 2FGZA 3WQVA 1BYBA 5C8BB 4U5KA 1WKYA 3A4WA 2G8ZA 2MANA 4HOWA 5IDIA 3VM5A 2JIEA 1QI5A 1V0MA 4D6GA 3RILA 3RO8A 2VNCA 3TTYA 3VIJA 2WW5A 2VRQA 1CLXA 2J79A 1BG4A 3EDEA 4AZ7A 2PB1A 3L4ZA 5I77A 3VNYA 3G6MA 3THDA 1L0PA 1CGVA 2VRJA 2EXOA 3ZIZA 1MW3A 3S6TA 4P8VA 5TD4A 3ARXA 4GZIA 1CLVA 5A2AA 5GNYA 3CHFA 1NOUA 4GQQA 1BTCA 3WSUA 1JYVA 1WZAA 1EOKA 4UTFA 2QHAA 1Q6CA 2BY2A 1NH6A 3VVGA 3PZGA 3RM8A 2DT3A 4ATWA 2DGAA 3GBEA 3O9NA 5AC5A 4D6FA 1RP8A 1VENA 3AIVA 3K8LA 3VPLA 1B3VA 4B15A 3IJ9A 4RL3A 1WDQA 4BQ5A 2G3IA 1B30A 3MMWA 2DSUA 3KL3A 4AZCB 3DYMA 3GBDA 4GINA 1B2YA 1JNDA 4X0VA 1J0ZA 1GONA 1XH2A 3AZTA 2W62A 2WB5A 2XWEA 3SURA 4CD5A 2VZTA 1V3IA 1V3HA 4HPGA 3L2MA 3WMBA 4OIFA 3K8KA 3ALFA 2FHFA 3VIPA 1JNEA 4OKDA 2ZX6A 4YHGA 5ABFA 3AIWA 4JCMA 2WHJA 2E0PA 1CENA 3BSHA 4L4PA 3CZJA 1QNQA 4J3UA 4GO9A 4AD1A 3AS0A 3DYPA 4AWEA 2VZUA 3F4VA 2WVVB 1HJVA 1UH4A 5CGMA 5A8PA 4UFIA 5D9OA 1EOMA 1FH8A 4D6HA 2XG9A 1FP9A 3ZJ7A 1OD8A 2WMIB 1LF1A 1OB0A 2YA1A 4LYRA 2GJXA 3TTOA 4UR9A 1V03A 4W8AA 2XM1A 3GXDA 3OGSA 4U2YA 3DHPA 4ACZB 5A8QA 4DWSB 3VOCA 2WBGA 5BWFA 1BGGA 2J7DA 1VFFA 3UG4A 3LMYA 2BVDA 5FD0A 1X6NA 3CZ8A 1BPLB 1JZ3A 4U3CA 1CECA 1B3XA 2C8NA 1VIWA 3MMUA 3CZLA 1UR4A 4UFLA 5I3DA 3NYDA 3I3EA 1WDSA 5A2CA 3VGBA 3WQ6A 1W1PA 4TVDA 1JXJA 1NP2A 3BAXA 4F8XA 2Y24A 5CPTA 3E1F1 5GPRA 2WKGA 1DWFM 3VIMA 2WMJA 1KGWA 3WEOA 2BVYA 3WH8A 3GNRA 1NM9A 4PMUA 3ZOAA 5HOSA 3BLKA 2WSKA 2UY2A 1GQKA 3M7SA 4CCCA 2WMKA 5D9PA 2BXZA 1G5AA 5CQ1A 3T2QA 5C70A 1LL7A 4ZEPA 3VDCA 1ZBWA 1CXLA 1KXHA 2J7CA 1V6WA 3CO4A 3APGA 3UEQA 2E40A 1AVAA 4RE3A 3MSGA 1MQRA 2CHOA 2A3BA 3WDPP 2XSBA 3TTQA 2G3NA 1W9XA 3AOFA 3BMWA 4W7WA 2VR5A 2J25A 1KB3A 1E43A 1XSIA 4D1JA 1ISXA 2JE8A 3CZEA 1IZJA 4CCEA 1C8XA 3WDJA 3BAWA 4OUEA 3II1A 3VO0A 1QW8A 5CPQA 1HF6A 2D23A 3WY1A 2CKSA 4XX6A 1QNRA 1OGGA 3VDBA 4PMOA 3WDQA 2F8QA 1L8NA 2YL9A 4JZ5A 2UWFA 3VD9A 3QOKA 3VU2A 3NIYA 2CCRA 4YN5A 1ZB5A 1I1WA 5M17A 2JALA 3W29A 5EFFA 4FLOA 1B0IA 1KQZA 5IFPA 2D3LA 4OJYA 1QPKA 2J8GA 3DHUA 2PBGA 2WZHA 5GQBA 1LQ0A 1UQYA 2BHZA 1KXTA 2G41A 3PTMA 2V38A 3FHQA 1JZ6A 2EEXA 3VGGA 2PF0A 4KRTA 3WNKA 2ZXDA 2VL4A 1D2KA 3TOPA 2OYMA 1G01A 3M6DA 3GNOA 2OLHA 3VD3A 4P7NA 2W4XA 3SCNA 3ARYA 3GXFA 2E9MA 2WCGA 1OD0A 3SCRA 3WQ4A 1TZ7A 3TP4A 2CITA 1HKIA 1KGXA 1UG6A 2W92A 3MUY1 5JUVA 3OGRA 4UQAA 1F4AA 1UZ4A 4CD6A 3ALGA 3CUIA 3QHMA 3DC0A 1J0HA 2VURA 4W7UA 4W88A 2CEQA 4U31A 2GSJA 4TVUA 1ZU8A 3MSDA 2EPOA 3GZAA 3WD0A 2J78A 2C7FA 3W82A 3ZMRA 2YOCA 1V02E 1DWGM 4UZSA 4RE4A 4AIOA 1NP0A 1E40A 1NQ6A 2BHYA 2V3EA 5BXSA 1ZBVA 3I3BA 4TVCA 1V3MA 4QCEA 2B31A 5A1AA 3IANA 3EMQA 2FH6A 1M03A 3WNNA 1J0YA 2GFTA 3T2PA 4AD5A 2DSKA 2CETA 1C91A 1EDTA 1W9BM 2DSWA 5A2BA 1C3FA 3KZSA 3PZTA 2V5CA 3J7HA 2D1ZA 1LWHA 1TVNA 4JL1A 2X05A 3CUJA 1K9EA 3WN6A 3F5LA 4IPNB 2NT0A 4WK9A 3EDKA 3VGEA 3IK2A 4BQ4A 1MFVA 2E9LA 1BQCA 3EDFA 3BAIA 5D8WA 1UWQA 3AMGA 4Z2GA 4CD7A 1RPKA 1XGZA 2BXYA 1JZ4A 2D0GA 4UOQA 4UOJA 2DQXA 4DWSC 2YL6A 3WFLA 4LGXA 3SCWA 1F4HA 2ZX8A 1FFRA 2J62A 3BC9A 3OIHA 3N04A 4J3XA 4PMDA 4OOUA 1JZ7A 1H2JA 1XD0A 4JCLA 1W2VA 3AHTA 4CVUA 3ARRA 2Y8VA 3ZR5A 3N18A 4MB5A 5ABFB 3AYRA 3N1AA 2D20A 1V6VA 3B9EA 3FAWA 3OLIA 3POHA 4J28A 1ITXA 1PIFA 4HA3A 4WF7A 1W1YA 1U33A 2OWXA 3W25A 1KFWA 2DT1A 3FY1A 4W8LA 3WF2A 1US2A 1GOWA 4CUCA 5BYWA 1GOMA 1DWAM 2NSXA 1W3HA 2OYKA 1VJZA 1TE1A 1VBRA 5FCZA 4MB4A 3OZPA 5A69A 1QHOA 4RE2A 2GJXB 3UESA 1C92A 5FOOA 2J7BA 4D6EA 2X2YA 4LYPA 1M01A 5AY7A 1B90A 4CU8A 4CD8A 2XVGA 1KQYA 3WH5A 5A3HA 2YLAA 4M81A 2XVNA 3SCUA 1OWQA 1V0NA 2EPLX 3ZT7A 2O9RA 3GTNA 4AZGA 2FGLA 1E55A 5I23A 1E56A 1QI2A 1ZJAA 7TAAA 3PZVA 3PTQA 2UY3A 2JEPA 2ZX9A 1XCWA 2WLZA 2EPNA 5A6KA 1H49A 2CESA 5I2UA 3OA5A 4ZXLA 4UFMA 1JDAA 4ATLA 3ZJ8A 3U57A 1KWGA 4Y7EA 5A6LA 1RD6A 1E4IA 4WKAA 5I6SA 1GVIA 1KWKA 4M1RA 3PZIA 1KXVA 4PMZA 3AIEA 1NWUA 4HU0A 2V3FA 2IUZA 5A8NA 4WKFA 1E0XA 2VI0A 4C7FA 1HJWA 3IJ8A 4MDOA 1QW9A 2NT1A 1CGTA 3HJEA 1JYNA 2OSYA 3GH5A 3ZQ9A 4TOQA 4WSJA 1LG2A 3A4AA 1J10A 2VVNA 3AIBA 3AMCA 4E8CA 2A3CA 3EDJA 1KBKA 4PCSA 3UR7A 5DEZA 3W37A 1UD6A 3WF0A 4AIEA 2A3HA 1SMAA 3EMZA 3AHVA 3ARQA 1V3LA 3SCSA 2F2HA 1TCMA 4UQDA 3WMCA 4FLRA 3POCA 1HKKA 2CPUA 5D8ZA 2WCAA 3FAXA 1CZ1A 1NWSA 1R7AA 1HJQA 3WUGA 1CXKA 3MV11 4H8HA 3M07A 2ZUMA 3VX1A 3GNPA 4J7RA 5ABHA 1EA9C 4J3SA 1E71M 4M80A 2BS9A 2XSAA 3RJXA 2QMKA 4EE9A 1UA7A 4HMDA 2VR4A 5IFTA 1Y7VA 1K9TA 4GPNA 2TAAA 1XC6A 2ZUUA 1UR9A 4QCFA 1AQHA 2O92A 1YQ2A 1GOKA 1UHVA 4FLQA 4PTXA 2BY1A 3IJ7A 4HMEA 1HP5A 2PWDA 3SUSA 3MUZ1 5I79A 4H41A 1E6RA 2WKLA 3W53A 4DWSD 1AQ0A 4JL2A 2Y4SA 3RMEA 3L4VA 1KXQA 3L4WA 3BSGA 3DECA 3WEZA 2PWFA 2W66A 3LPFA 2PBOA 3BGAA 4UNIA 3HMCA 1C8QA 2WAGA 5DMYA 4P7RA 5I78A 4F79A 5BXPA 2V3DA 2DIEA 3K4DA 1VEPA 2VJXA 4JFUA 4PTMA 1GVYA 2XGBA 3WDIA 1W3JA 1CNVA 2J74A 3OLDA 3JUGA 2J47A 1UD2A 3KEHA 1MFUA 2AAAA 3U5YA 2XGIA 1C7TA 4UFKA 1QOXA 4W85A 1R87A 4AZBA 1JZ5A 2YDRA 3SIMA 4D1IA 4PMXA 7CGTA 1GQLA 4AEFA 4X0NA 1UQZA 3PZ9A 2X0HA 4MNLA 2YL5A 4S3JA 1GHSA 4HA4A 1FOBA 4KH2A 4U3AA 4ZXOA 5LYRA 1C7SA 2J7FA 4QP0A 3UERA 1E6XM 1ODZA 4CKQA 3K8MA 4WJXA 3PHAA 1E9LA 3MMDA 2Z1KA 1E1FA 4UOZA 1M7XA 1GOOA 1JAKA 1VFOA 2WHLA 4DM2A 3K1DA 1JDCA 4Q7NA 3AYSA 1QI4A 1OGBA 1ITCA 2ZE0A 3SUUA 4Z2JA 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4FMVA 4YHEA 1PJ9A 4H8UA 2A3AA 1LWJA 4OBRA 4Z2HA 3UG3A 1MXGA 4PUDA 1XH1A 3TONA 5M03A 2Y2WA 1B31A 4NZCA 2WSPA 3FHAA 4HA1A 1VFUA 1CGUA 2J7GA 1H41A 4MTVA 1Q4NX 2DH2A 2WC4A 1WP6A 2D0HA 4WLCA 4J27A 4HP5A 3BMVA 2VX5A 1V6XA 1E3ZA 3LPGA 1FFQA 1H11A 4URIA 4Q22A 1UR1A 3NDZA 1CGXA 3A3HA 3WNOA 3AHXA 4P7LA 5HDRA 4B16A 1V3JA 2CBJA 4GI9A 2E9BA 1WZMA 3IAPA 1WB0A 1G1YA 2XIBA 1JG9A 1NOFA 4AZCA 2J75A 3AROA 3VIOA 4K68A 1E15A 2VZVA 6TAAA 3RM9A 2BHUA 1V6YA 5IHRA 3RJYA 3FXYA 1AQMA 3GDBA 3L4YA 1HVXA 3F5JA 1O6IA 1A3HA 2ZXAA 1EGZA 5D9NA 1ZJBA 1Q6GA 3GXIA 3UG5A 4IISA 1LG1A 1EO5A 2VC9A 1UWRA 1UKTA 3WNPA 2ESCA 4PTWA 5BRQA 1NARA 4YPJA 2VTFA 2WVSA 1XCXA 1W9PA 1UR8A 3WMSA 1WZKA 4ZFMA 3UR8A 4BS0A 1HXJA 1E72M 3BLPX 3QHNA 4H8VA 4B3KA 2PWEA 5I5RA 1JI1A 1PBGA 3PTKA 3VIFA 1PZ3A 1WO2A 2VCCA 2Q8XA 1GUVA 2AOSA 1JFHA 3L2LA 1IV8A 1V3KA 2DEPA 2G3JA 3AMKA 3AXXA 4DWSA 5A94A 5A6JA 2J7HA 4BQ2A 1NOWA 4H2CA 3WL1A 1ECEA 3A6OA 3WUBA 2XM2A 3WH6A 1GCYA 4WKHA 1O7AA 2YA0A 5FL1A 1DP0A 5BROA 4E2OA 1UD8A 4PBGA 1FH9A 2BVTA 1OIMA 2EPKX 1NWRA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1ECEA

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