1EIXA

Structure of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from e. coli, co-crystallised with the inhibitor bmp
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
VTNSPVVVALDYHNRDDALAFVDKIDPRDCRLKVGKEMFTLFGPQFVRELQQRGFDIFLDLKFHDIPNTAAHAVAAAADLGVWMVNVHASGGARMMTAAREALVPFGKDAPLLIAVTVLTSMEASDLVDLGMTLSPADYAERLAALTQKCGLDGVVCSAQEAVRFKQVFGQEFKLVTPGIRPQGSEAGDQRRIMTPEQALSAGVDYMVIGRPVTQSVDPAQTLKAINASLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the catalytic mechanism of a proficient enzyme: orotidine 5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords OROTIDINE 5'-MONOPHOSPHATE DECARBOXYLASE
molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
total genus 77
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2000-02-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1eixA00
3W7PA 4LVDA 3W1RA 3C0JA 4K38A 5G4WA 1T8XA 5DBTA 4NVTA 3O6DA 1ADOA 1KTBA 1GYNA 2B0MA 3U8GA 4R33A 3GDMA 1YDNA 3DXIA 3W83A 3GAKA 3B8DA 3CWOX 2FPYA 2WV8A 1TPWA 3B0VC 1SSDA 2Q3RA 5AFDA 1KFBA 4ZQOA 3WK2A 1KV5A 4MKNA 1TTPA 2VC6A 1DJNA 2A0NA 5BMXA 5AYXA 2FPTA 2FJKA 1A5BA 2WQPA 2DZUA 3SZ8A 2Y89A 2VEKA 3TC6A 4LS2A 4A29A 3CEUA 2HMCA 1WA3A 5AN7A 1H5YA 3LRMA 5F2LA 1G4EA 2J9XA 4LVBA 2QUTA 1F05A 1U5JA 4EWND 4GFSA 2QAFA 4O18A 3TQKA 4RKAA 3TC7A 5G5IA 1L9WA 1M5WA 3MMTA 1VCVA 4NU7A 5LKYA 1VRDA 2ZQ0A 4IUOA 1EB3A 1S5VA 3PB2A 3Q2DA 4UIOA 3C56A 1DV7A 4P2VA 4QNWA 1TTJA 4TMBA 4E2BA 4M19A 3GLCA 1SU5A 3W2UA 1GTHA 4G1KA 4KKXA 1YLVA 1QR7A 4PEKA 4JX5A 1FY6A 1GVOA 1W5NA 2NX9A 4E2DA 3QMTA 3SW6A 3CM4A 5AHIA 3NOEA 5HQEA 3UWUA 2WOQA 3W72A 4BWLC 4JX6A 1HO4A 3NM3A 2DZPA 1WQ5A 4J9JA 4JYDA 1OK6A 1J4EA 1P5BA 2YDAA 2C14A 1EEPA 2H3BA 1DHPA 4ZQRA 4K7YA 3DKJA 3P81A 3IV3A 3WJSA 4IMFA 4KFNA 1M7PA 4O16A 2TPSA 1VGAA 1WBHA 2ZRVA 4MYXA 2NZLA 4M7TA 5AHMA 1W5OA 4AF0B 3SSJA 3DFOA 3DFTA 2NWSA 3PULA 5IBXC 5KTLA 3R13A 1EUAA 1V7YA 3H53A 3HF3A 4PC8A 1H50A 1X7FA 3HG4A 3EX6A 3W7DA 1QPOA 4MFEA 2JGQA 3G8RA 4O17A 1YYAA 2QCFA 3S5YA 3TFXA 5K3VA 2C1HA 1OF8A 4LUIA 2CLKA 2QCMA 1DBTA 4IMCA 4MZ1A 3RFAA 3G0XA 1HG3A 3HGSA 4H6KA 2QKFA 3R89A 1L6YA 3HPSA 4LV4A 1B57A 3CWNA 3W75A 2E6AA 4GXMA 4ZQNA 3MYPA 3GB6A 5CPOA 3S5OA 4HN4A 3GXNA 5CZTA 3PSVA 3EKZA 3G24A 3NZ1A 3QRHA 1S3HA 1ONRA 3QW3A 3DAQA 3OEXA 1NVMA 1TQJA 2KZHA 4MY1A 3TV8A 3OA3A 1K7XA 1UUOA 1XUUA 4UCGA 3FIGA 1ZENA 1QPRA 2FB3A 3M44A 3BLFA 5FF0A 4H3DA 1XBZA 4LOCA 3MUXA 3P8JA 5AC7A 1K8YA 3PB0A 5G1YA 4AWSA 2BTMA 1MEHA 4UR7A 3LTYA 1X1OA 3LTSA 1ZAHA 4DEFA 1VYSX 1W3TA 5AOUA 3Q37A 5C2XA 2ZA3A 1TRDA 3MBFA 4FNQA 4GUJA 1W54A 1XBXA 4GUFA 1LM1A 5E93A 5LNUA 4JIPA 1W5QA 4M6QA 3HGOA 3BG5A 4AWUA 4OQVA 4R34A 1LRNA 3L66A 4JY9A 5L9FA 1MSSA 3EXRA 4X22A 1LZOA 4X3ZA 2CZDA 5KZDA 3P7YA 3NR0A 5FEXA 3HQ1A 3M9YA 1HTIA 3UPWA 1SFLA 1W5PA 3ATZA 1SZFA 3ATYA 3FYPA 1GYLA 3TJLA 3WJZA 3P60A 4FX8A 3QC3A 3GIYA 1QO5A 3W70A 1HO1A 1S5WA 2WO5A 5DXYA 3FA5A 4GRSA 2ZRXA 3I65A 1GPWA 3BW3A 3NQ6A 5EA9A 4FX7A 5AC6A 1EWEA 3WJXA 4ZQCA 3NPUA 3G8EA 1RVGA 2EF9A 3EKLA 3LXAA 5K7JA 4O0KA 1QDSA 1AK5A 4NX0A 1DOSA 2FTPA 3EWUA 4JTTA 3A23A 5TBOA 3Q58A 4DELA 2H3DA 5FF7A 2H6RA 2CLHA 3HB9A 2OZ0A 5AYZA 4K7VA 1SO4A 2Q8ZA 2C16A 4O13A 5HMSA 5F2GA 5LNWA 1PHWA 3CU2A 1JQXA 2ZZ7A 3KVJA 3P61A 4UMAA 3EX4A 5DCDA 3G0UA 3QQ0A 4MFDA 4CNNA 3LXBA 4MLRA 3BLEA 3NZRA 3L67A 3P62A 4NNCA 2A4AA 4DO4A 3G0SA 4MYAA 1KM5A 1B4EA 1VCFA 4RZ6A 3E02A 3G1DA 4IXHA 3TJXA 3PF3A 3QSTA 3HIJA 1FWTA 1G67A 3W7NA 3JS3A 3TUUA 4LT9A 1SZEA 1VLWA 1FXPA 3C2VA 3LCLA 1THFD 1TYGA 2Y7FA 3TROA 2VOMA 3B04A 3M5XA 4LC6A 3E0IA 3D0CA 2VELA 4FXSA 3LCXA 2NXHA 4NXSA 4EVZA 3S5ZA 2I9EA 2Y88A 1G7VA 4XWUA 2FPVA 4N9BA 4M6VA 2JGYA 5HJLA 1VC4A 3UXDA 3YPIA 1OYCA 3KRZA 4FX6M 1I2QA 1KV8A 3W1LA 3FS2A 3GDLA 2RDWA 1DKWA 1SO3A 4LWWA 2ZRWA 1LBMA 3USBA 3A21A 1GWJA 3NPWA 3V1PA 3OVQA 1TTIA 2ZYFA 2B4GA 1EX5A 4E0CA 3RNDA 3W88A 4NJKA 3OVPA 3UYCA 4GUHA 4BK9A 4FNUA 4H4IA 2BLEA 1UBSA 1LOLA 1NF0A 2DJLA 2QDHA 3V75A 4AAJA 4U4MA 4PA8A 4UNLA 1F7BA 1WBJA 3IVTA 4IGHA 3GNNA 1H7NA 3C2FA 2Y62A 1GVQA 4O12A 5D04C 3L9CA 5DCEA 4N02A 3PUDA 1TV7A 2J9ZA 1NFBA 2DU2A 2QCGA 4DO6A 3W7EA 3PG8A 3W2LA 5U7SA 3M7WA 2GOUA 4IPJA 1C8VA 1QAPA 3DHFA 1NEYA 1GG0A 5J5DA 1OYAA 1KW1A 1LLWA 5AC8A 3FOKA 2NXGA 3LOTA 1JQVA 3QW4B 4CQ8A 1OFEA 2QJGA 3PY2A 1QWGA 3B0UX 3L65A 3QM3A 2DZTA 2QAPA 3KX6A 3TIMA 1TREA 4HIBA 1C29A 3W74A 3NPVA 2AAMA 4JTLA 3SY5A 3DKLA 1IXNA 4YWIA 5CPLA 2A7PA 2ZA2A 4JTEA 1XUZA 4WY0A 3QEZA 4WUIA 4N2YA 3W7JA 3NQMA 4K6AA 3G22A 1IXQA 2VXNA 2R91A 1FWSA 1O95A 3PBWA 4JEQA 4BFAA 5SWUA 2WNNA 2WSQA 4IX2A 4ORMA 1F2JA 4HPXA 1A5SA 1R2TA 1R46A 4MOZA 4RZ5A 2Z1BA 2CU0A 1A50A 4OE7A 1AL7A 3CB8A 5CG7A 4O4WA 4IQLA 4IOTA 3TXZA 3W2MA 3ELFA 1Z42A 1SQ7A 3W7QA 2PURA 1LYXA 4NJJA 4PL2A 4WXYA 5EY5A 1SW0A 1T96A 2XN0A 4ADSA 4QISA 3S5NA 2CZFA 5FEZA 2JBMA 1UJPA 2DJXA 1A53A 1NAL1 1VCGA 1TPC1 1WV2A 2NLIA 4O1CA 1QFEA 5G1TA 2E5BA 1IF2A 2VFHA 4XBKA 4JGDA 5MHBA 3G3DA 2NV2A 3G1SA 4CNOA 3LB0A 5I3KA 1DVJA 3OHIA 1EP3A 3HGRA 3WK3A 3UD6A 3IIOA 3TR2A 5HR7A 3W1AA 4Y9AA 1TRIA 5C6MA 5KITA 4AB4A 3M5YA 4NJGA 4Y96A 4JY8A 1K8ZA 1FWNA 3P84A 4O10A 1ME7A 3LCFA 2ZA1A 1TPB1 1LRTA 3N19B 4M7SA 2E6DA 4C1KA 3M43A 1ZAJA 3I7QA 5FEPA 2OJPA 3SECA 2E5DA 4XKYA 2Y61A 1OYBA 2H90A 1DORA 5TIMA 1XDLA 1KTCA 2A7NA 4ONVA 3W22A 4QM1A 3LBCA 4JYEA 2NX1A 3LHTA 3S1UA 1H51A 2JKAA 1YXYA 1WDWA 5DELA 4ZZ9A 1WYIA 3P67A 4NX5A 2CLLA 3QZEA 4IWWA 3LHZA 3IEBA 4EF8A 1JR1A 4UFHA 3PBVA 3GXTA 2J27A 2LLEA 3NL2A 1XBVA 3NQFA 4LY8A 1SW7A 3C61A 3FJ6A 4UTTA 3THQA 2R94A 3W7OA 3N3MA 3HG5A 2ZCGA 3LI1A 4U28A 3VE7A 4NZJA 3RF9A 4YXGA 4EOUA 2YGYA 2QR6A 4WD0A 3M47A 2A85A 3I68A 1G4PA 3L0NA 3P5YA 4DQWA 5J5RA 1HL2A 3W71A 3C6CA 1EPXA 1KTNA 4O15A 1WOAA 2OX1A 3L5AA 5GVJA 5EL1A 2FIQA 3KXQA 1O5XA 5K9CA 1ZJIA 2TRSA 2VFIA 1QPNA 4NZFA 4FNSA 1YXCA 4JTIA 3BG3A 1VH7A 4JD4A 1F76A 1J5TA 2W79A 1H62A 4O4VA 5BNKA 3GXPA 3G1AA 1OX6A 2HS6A 1KFCA 3M0ZA 4K39A 1CX9A 4LVGA 4JTJA 4NUWA 3GR7A 5L6UA 1ICQA 1K8XA 3B06A 4PTNA 1PIIA 3PR2A 3CHVA 5HUPA 3G1VA 2UV8G 1X6UA 1YADA 4FXRA 3MBDA 1W0MA 1TJPA 3BV4A 1N7KA 2GJLA 1UB3A 1GOXA 4PH6A 3TU9A 3HGJA 1QPQA 4O14A 4RCXA 3F03K 5LGZA 1DL3A 4PL1A 3MP5A 5DN1A 2CWNA 4YLWA 3NQDA 1NF7A 3E49A 1B3OA 1MXSA 4UFLA 4WZHA 1SW3A 4MZYA 3FLUA 1FWWA 3IVSA 1QMLA 4N4PA 3MHFA 4JX4A 4I9AA 1IXOA 3VKJA 1VZWA 3EXTA 4GNJA 5H2ZA 3JRKA 3ZR4A 2YYUA 3QPZA 2X30A 5AHLA 1GVSA 4TMCA 1Z48A 4TU1A 3EX2A 3W1QA 4RV8A 4Z1DA 4K37A 2B7PA 2P0OA 1ZY9A 2FDSA 3NO5A 3GAYA 1P0NA 3UQNA 3QFEA 3S8HA 3MI3A 4O53A 1Q6OA 3N2XA 4S2CA 1G4TA 3GKAA 3LGEA 3W2NA 4IPIA 3GDKA 3GKFA 3W7CA 3TSDA 1VHNA 1JCJA 4JTSA 4RK8A 1EUNA 4K8HA 1W3IA 2V81A 3TE9A 5K9DA 2WJZA 4ICNA 2NUYA 1R2RA 3TMLA 4C1LA 3W7KA 3PBUA 5F2MA 2A7RA 3R12A 3PS7A 1A5CA 1TMHA 2NWRA 3IGSA 2V9DA 3BPWA 4TR9A 4DBDA 2OT1A 3IIZA 2OCZA 2YX0A 2ZZ1A 1I2RA 1WOBA 4GUGA 1OX4A 1JRCA 3TQVA 1I4NA 1Q3NA 3W7IA 4UTWC 1F6PA 3C2RA 3LHVA 2PCQA 2QCDA 3HMJG 3BW4A 4QITA 2JKEA 3GNDA 3CQ0A 1GG1A 3BLIA 4UC5A 3GVGA 3QYQA 1K02A 1TO3A 4JNMA 5KZEA 4LTSA 4XTIA 4HNTA 3LLFA 1ZHAA 3N34A 4QSHA 1L6WA 3W1PA 1LORA 2E1DA 3G3MA 2FLIA 1N8FA 4IXXA 1KFEA 3PUEA 1YDOA 1R2SA 3EEGA 3L5MA 3QH2A 4QQ3A 3RLVA 1FCQA 3W1XA 3O63A 3T78A 1W1ZA 1XC4A 2A6LA 4LVFA 2CFFA 5A8GA 4AH7A 4O11A 4JTUA 3STGA 2W0UA 3BGGA 5CPMA 3BG9A 4FHAA 3G1FA 2HTMA 5BRBA 1BKSA 1GEQA 3LHWA 3NQAA 3SJ3A 3T55A 2Y70A 3IRDA 1JCNA 1YXDA 5DY2A 3A5FA 3NVTA 1IIGA 4O0ZA 4AWTA 3DFPA 4JN6A 3TSMA 1AL8A 3M5ZA 4RZ4A 2GUUA 4HPJA 5BOOA 4CCDA 2CZ5A 1T0OA 1FDJA 3G1YA 4FNTA 4D2JA 4N6FA 1WAUA 4JIQA 5EBUA 4XQ6A 1B4KA 5BW6A 4HNVA 3KRUA 4JS3A 3M6YA 3C3NA 2J88A 5AHNA 3KFTA 5AHFA 3NQEA 3H54A 1G6CA 1GJPA 4RXGA 1QOQA 3L68A 4DXVA 2OMAA 4GC4A 3DI1A 3MO7A 1O5KA 3ABSA 4IX0A 2ZFAA 3KHJA 3RLUA 3PSWA 2BZNA 1TPFA 2QCCA 1Z41A 3TW7A 4Y8FA 3S42A 4P61A 3TDFA 2J6XA 2E77A 1ME8A 3W2JA 4WQ6A 1EP2A 3C52A 4HNNA 2DZXA 3ABRA 5D2XA 4XBSA 3P5ZA 1WX0A 3CEPA 1SFJA 4NT0A 4GE8A 3GK0A 3TH6A 4LVAA 4PCFA 4UXDA 4HT3A 2DZWA 3OBKA 4WX2A 5C55A 1OABA 1XL9A 3NG3A 4KWVA 5CSSA 1H7XA 3KVKA 1E51A 3FFSA 1JVNA 3FEMA 3PWAA 4WXZA 3N14A 1RPXA 1H60A 2QCNA 2VFGA 3G1HA 3LV5A 2F7FA 2X1TA 3ANYA 2R14A 1KLYA 3TAKA 4PFMA 1H7RA 3T40A 2Z6IA 3H55A 1BTMA 5HUOA 1KM4A 3P8IA 4UTLA 5I3HA 5D02A 4KFOA 4CCCA 4Z08A 3DZ1A 1FCBA 4A22A 3GYEA 4MY9A 5AB3A 5K9XA 1Z44A 3QSRA 1WXJA 1DQXA 1PV8A 3IIPA 3W3OA 3TW6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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