1EP2 | Genus

Total Genus 93

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	93
sequence length	309
structure length	305
Chain Sequence	ENNRLSVKLPGLDLKNPIIPASGCFGFGEEYAKYYDLNKLGSIMVKATTLHPRFGNPTPRVAETASGMLNAIGLQNPGLEVIMTEKLPWLNENFPELPIIANVAGSEEADYVAVCAKIGDAANVKAIELNISCPNGQAFGTDPEVAAALVKACKAVSKVPLYVKLSPNVTDIVPIAKAVEAAGADGLTMINTLMGVRFDLKTRQPILANITGGLSGPAIKPVALKLIHQVAQDVDIPIIGMGGVANAQDVLEMYMAGASAVAVGTANFADPFVCPKIIDKLPELMDQYRIESLESLIQEVKEGKK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of dihydroorotate dehydrogenase B: electron transfer between two flavin groups bridged by an iron-sulphur cluster. pubmed doi rcsb
molecule keywords	DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE B (PYRD SUBUNIT)
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Lactococcus lactis
total genus	93
structure length	305
sequence length	309
ec nomenclature	ec 1.3.1.14: Dihydroorotate dehydrogenase (NAD(+)).
pdb deposition date	2000-03-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1ep2A00

4LVBA 3P60A 3W75A 4HN4A 1KFJA 3W88A 5C5YA 1B9BA 3L9CA 1P4CA 3L5AA 5K9XA 2O7QA 1EUAA 5HJLA 4YWIA 1RPXA 1WX0A 1G4PA 1O60A 4HT3A 3GXPA 1TPH1 3EWYA 4S2CA 1QCWA 3G3DA 1GEQA 1Y0EA 1LRNA 3QM3A 4FB7A 1MSSA 1H7WA 3W7CA 1KM6A 3PUEA 1G7UA 4HNTA 4YMZA 3MHGA 4Y9AA 2A1YA 2B7OA 3W22A 5H2ZA 3S8HA 3PG8A 1GYNA 5CPNA 1VYRA 1RD5A 3FKRA 1A50A 5KINA 3W7LA 4UMCA 1H5YA 1F74A 3E49A 3B8DA 2B7PA 3C2OA 4K8EA 3KAOA 1NEYA 1QR7A 3NL3A 1A5BA 3TA6A 2W79A 3WK3A 3IIZA 1OX5A 1DOSA 2DORA 1XL9A 2Z1BA 3CIXA 5LHFA 3O6YX 1IF2A 3O8AA 4AHQA 4N2YA 4UFKA 1TPEA 3KVKA 3W7QA 3L21A 3OVQA 2P1FA 3CIWA 4WOQA 3TXZA 3W1AA 3LV5A 3TH6A 3THQA 3NQ6A 4ZQPA 3OBKA 5D32A 1J4EA 4IXXA 5F2IA 1EUNA 1XI3A 2JGQA 4Z0JA 3B05A 1KM2A 7TIMA 3GX9A 4MJZA 4ALDA 1YTKA 3M41A 4NXSA 4B5NA 4WXZA 5KTLA 3MP3A 4TX9A 3L65A 3IIOA 3SGZA 3EKLA 4O19A 2QCLA 1ICPA 4U4MA 2B7QA 2Z0IA 3LCXA 4LVDA 4GUIA 5CPMA 1EX5A 2VC6A 3PY2A 3TC6A 3TQKA 1SW3A 1Z48A 3LHUA 3MI6A 1KFEA 3STEA 1KBJA 1FCVA 3W1MA 2CZDA 4JTHA 3NM1A 3SI9A 3W85A 3CQ0A 5DCDA 2Y7EA 4N6FA 4WOZA 3VFLA 5D2XA 1W54A 1XDLA 3WJSA 2WPBA 1JR1A 5DN1A 1YXDA 4FIRA 1FQ0A 4NT0A 2YW4A 5HQEA 2NUYA 3W7MA 4ZMGA 1GQNA 1KM3A 3PVFA 3GDMA 3G1DA 3O6CA 1LRQA 3UPBA 4LS2A 3PG9A 4LRSA 1EP1A 1DHPA 2TRSA 4O50A 1QWGA 3L0GA 4MVAA 4ORMA 5AYZA 4CCEA 3ATZA 3GKFA 3TX9A 3N2XA 4O0ZA 3TAOA 5H91A 1QNVA 5I3IA 1OX4B 1SPQA 4GUJA 3GB6A 2DJLA 4ZQCA 1TV8A 5U4NA 2X1RA 4GRSA 8TIMA 1TV5A 3RLVA 2YPIA 3UQNA 4UFJA 2CLEA 3DI0A 4IXHA 4Y90A 2NXHA 3LXCA 3JRKA 3LRLA 4UTWA 3EX4A 1OVDA 5KSWA 2BSLA 5D2WA 3PR2A 4OE7A 1QPNA 4JNMA 1R47A 2QCNA 1I2RA 3L5MA 2VFIA 3A5VA 3P84A 2PRLA 4TO8A 5CSRA 1P0KA 1LOLA 1N55A 1OK6A 2Q8LA 5EYWA 1VYSX 1ZAJA 2XN1A 3MUXA 4ZVJA 4XKYB 1E51A 1IXOA 3TFCA 4K7VA 1LBMA 1GOXA 1ONRA 3UWUA 3TUUA 2H3BA 3P8JA 2Y89A 3HPSA 4NJIA 4QIUA 1NFBA 4PTNA 2X16A 2EGZA 3C2RA 3W7DA 4JDBA 5G5IA 1UBSA 2ZA1A 2Y62A 3TMQA 3W7PA 1QOQA 3TW6A 4JN6A 1TJPA 3NR0A 1TREA 1T0OA 2NV1A 5DBTA 2V2DA 3HG2A 2QCGA 2QCFA 2NX1A 4C1KA 4FNUA 3QFEA 4JTTA 3NQDA 3P5ZA 1TPVA 1WOBA 4MYXA 1SW0A 4NJHA 4RCXA 3ZR4A 4JTIA 4FX8A 3TCEA 2QJHA 3I7SA 4PEKA 4WZHA 5D03A 1WYIA 1OYAA 2C0AA 1SSGA 3R13A 3E02A 1O5KA 4XUGA 3M0ZA 3QYQA 5DLCA 4R7JA 2V5BA 3BPWA 4MJMA 1RZMA 5CSSA 4HNNA 2PCQA 3S1WA 3NL6A 1XUUA 3UWYA 4E2BA 4E2DA 5D2YA 3JS3A 3NA8A 1IXQA 1EA0A 4LUIA 4IJBA 4M6QA 5D2VA 2ZTKA 4RK8A 4NNBA 3QW3A 3WJXA 4POCA 4FNPA 1EP3A 4LV4A 4D2JA 5L6UA 3PAJA 2WSRA 2XN0A 2C15A 1F5ZA 2ZRXA 4A3UA 4PODA 2V2CA 4LOCA 4N4QA 3LRMA 1LM1A 3IGSA 3QJAA 3LTSA 3QPZA 5F4SA 1KV5A 4UR8A 4BI6A 3GAKA 5HMSA 1B4KA 3GNNA 3QQ1A 2UV8G 2YSWA 4OHQA 4RJEA 3GR8A 1G69A 4IX2A 3SY5A 4MPQA 1WXJA 1TYGA 5HUOA 4JTEA 4GXMA 5I3HA 2E77A 2P0OA 1G7VA 4XZ9A 5C6MA 3QW4B 5F4WA 4WY0B 2QDHA 1QAPA 2ZRVA 1AG1O 3LTYA 4PFMA 4QITA 3O15A 3LB0A 4S1FA 3QMTA 3BARA 3C0JA 2J6XA 1JVNA 1PIIA 4ZQNA 1DORA 1JQVA 4OV4A 4DELA 3NQ8A 4LRTA 1MEIA 3H55A 3TFXA 1GG0A 3LHTA 4JTFA 1PS9A 1AMKA 2PRHA 1OFAA 2ZZ4A 4UFIA 3SGUA 5AHEA 3PB0A 2V5LA 5E1QA 2JKAA 3NQCA 4YCOA 3OEXA 2NLIA 3EWZA 2ZQ0A 4R34A 5F2MA 3UWQA 1XFBA 4IPIA 3IGXA 4YXGA 4DO4A 4O14A 3GVGA 3V75A 4IPJA 3PWAA 5SWUA 3OIXA 1P5BA 4IMGA 4TU1A 1FX6A 4XKYA 4Q32A 3P8IA 4P61A 4ADUA 2V30A 3DFSA 2HMCA 4CQ8A 1PVNA 1W31A 3IIPA 3F1QA 3DKLA 4IMDA 3U2OA 1VRDA 4CQ9A 5KMYA 1AW2A 4R33A 4N02A 4AF0B 2GJLA 3W74A 1MXSA 1C29A 1H7PA 5G1YA 3TNOA 4O1BA 4N9DA 3TJLA 4A2SA 1KV8A 4N4PA 4WJEA 3LDVA 4DO6A 3WK0A 1M6JA 1YXCA 2FLIA 3FFSA 3TV8A 3N14A 4BWLA 4ONVA 4UCGA 1LLZA 1W3NA 3QPYA 1FCQA 2ZZ6A 4BI5A 3R5EA 1OFRA 1N8FA 3EX3A 5HR7A 5F1UA 2A85A 3YPIA 3FLUA 3T44A 1X6UA 3MJYA 4MZ1A 3T4CA 4M19A 4LC6A 2C16A 2Y7DA 3PBUA 4JYFA 1F05A 4ADTA 3EWWA 4JTUA 1A53A 3LCFA 1R2TA 3NQ7A 3O63A 3PF3A 4MIMA 3QEZA 5LZLA 1IGSA 1YTDA 4OT7A 1TPUA 4GUFA 4LU0A 4WX2A 1TMHA 1XBVA 2V82A 4Y8FA 4JTKA 2IQTA 3WFAA 2OMAA 2ZBTA 4AXKA 5G2HA 3WJYA 3W1QA 2FJKA 3I6RA 1I45A 3ANYA 5F4XA 3PSWA 1BWLA 3UD6A 4AH7A 5E93A 3S5YA 2A6LA 3LBMA 5KZDA 2RH9A 4UTTC 5LNRA 1G4SA 1ZFJA 4UTIA 3LGEA 3IV3A 3W2NA 3TC7A 1VCGA 5E0KA 4WY0A 3MI3A 4JR5A 5HINA 2W6RA 4S2BA 3DHFA 3AJXA 3R2GA 4H6KA 4NU7A 4JS3A 3W72A 3NQ2A 1AK5A 2WSQA 1YTEA 1TTQA 2Q8ZA 3DI1A 3AO0A 4MKNA 3OA3A 2VFGA 3FYPA 3O6DA 4M7SA 3QF0A 3NYZA 4O17A 2NWSA 5HWNA 3SR7A 2E6YA 4NZFA 3FOKA 2ZRYA 1O94A 3NPWA 2DZUA 3TU9A 1TPFA 3B06A 3SSJA 3VE9A 1TPDA 4J9JA 3RFAA 1X7FA 3BW3A 3C3NA 2A21A 2QCCA 3NQVA 1OFDA 2WJZA 3S5ZA 3NQAA 3PBYA 1FUYA 1TCDA 5LNSA 4X22A 2Y85A 4WXYA 2E6AA 4PC8A 2DU2A 3TSMA 1KFKA 1H7OA 2A6NA 3DH7A 1LDCA 3Q94A 2NV2A 1Q45A 3INPA 3TQVA 3IVSA 4XQ6A 1G4TA 4IMCA 3W1UA 3W2MA 3W7HA 3VE7A 1R46A 4OQVA 4GUGA 3GZ3A 3W7KA 2QR6A 3LHYA 4QQ3A 1ZAHA 3W3OA 4AF0A 2A4AA 1O95A 2WQPA 3G3MA 2CLKA 2XN2A 3DFNA 1U5JA 3W23A 5LGZA 1OX6A 1M5WA 3B03A 4QAIA 3DGRA 2J27A 5D02A 3OVPA 4DF1A 3DFQA 4DF2A 3CU2A 4JD4A 1ME8A 4UTMA 2QCEA 1RQBA 3T78A 3LHWA 1JULA 3C2EA 1LTDA 3S9YA 2B0MA 3JR2A 1S5WA 2A0NA 2C18A 5FEPA 3DAQA 3W7NA 4JEQA 3BO9A 3N34A 3NDOA 2DZSA 3M5YA 3HO8A 4ML9A 2ZFAA 1UB3A 3STGA 2NUXA 3DU0A 3RLUA 3CEUA 2FB3A 3BLIA 4MFDA 2E1DA 3LERA 6ALDA 2Z2UA 3NPXA 1TJRA 1EEPA 4RLIA 4AMAA 4CCCA 3N9SA 3LHZA 1YLVA 1H7NA 1OG0A 3P80A 1JCLA 3QSRA 1CW2A 4RZ6A 5LKYA 1X1OA 3BLEA 3QZEA 3EKZA 1A5SA 4LS0A 4MY8A 1PHWA 1QO5A 2V9DA 1F76A 5G4EA 5U7SA 4A22A 1P1XA 1S5VA 2NXIA 1LBLA 1GPWA 2E68A 4XTIA 4LY8A 4LVGA 2AAMA 3HJZA 2PURA 4QSHA 4W9TA 3PSVA 3P62A 2EAWA 1XBZA 1QOPA 1FCUA 2G5WA 4RKAA 2FTPA 3RK8A 2Y70A 3M7WA 4N9CA 1W56A 3G1AA 3G1HA 4MLRA 1CX9A 5EPDA 1VGAA 4PL2A 3BW4A 1GVQA 3KVMA 4KKXA 1HO4A 4JTJA 1OJXA 4JIQA 5I3JA 4RX0A 3HMJG 4JXCA 1SZGA 2H8XA 4JYDA 1N7KA 2QUUA 2DZWA 3B04A 4LWWA 3HG5A 2RFGA 3E0IA 1EWDA 3FIGA 5C55A 4IMEA 2OJPA 5LGXA 4LTSA 4HSOA 3R12A 2PRMA 3TSDA 2E6FA 1JUEA 3OG3A 3G8EA 4Y96A 3LV6A 2QCDB 1KA9F 1QPRA 1VR6A 1VH7A 3PBVA 4FO4A 4CCDA 1LP6A 2QF7A 4IUOA 3W1LA 1K02A 3KRZA 2CW6A 3LM7A 3MHUA 4ZZ9A 2YFOA 2ZRUA 4HIBA 4M6PA 2PC4A 4KFPA 4X9SA 1OYCA 3P81A 3HGOA 4EVZA 1SFJA 3P82A 1ZALA 5DCBA 1JCXA 2VFHA 5FF3A 3W1TA 1ML1A 3M1ZA 3W7EA 3HPXA 1Q6OA 2CWNA 2I1OA 2VEMA 1QDSA 5AC8A 2E09A 3NZ1A 4IOTA 3EWBX 4JYEA 4AWTA 3WK1A 5D09A 5AFDA 3BK0A 5AHNA 2O7SA 1J5TA 4X3ZA 4UTWC 4K6AA 2DZXA 4K38A 2Z6IA 4BF9A 3LLDA 3GXNA 4DBDA 5LSMA 3C4UA 3I7QA 5FI8A 1PV8A 3GDRA 5DY2A 1JCMP 1T99A 2QDGA 3QH2A 3P5YA 4ZQRA 2V8ZA 4JTSA 1OFQA 1TO3A 3EX2A 4JY8A 3HIJA 1IXNA 4O18A 1KFLA 1LYXA 1L6WA 3LLFA 3S5NA 3USBA 1I2PA 5AHLA 4PL1A 1HG3A 2QCHA 4JX5A 2Y88A 4DQWA 2LLEA 4DEFA 1JCJA 4CNPA 4O12A 3IEBA 2C3ZA 2BTMA 3VKJA 5F1VA 3G1YA 3IVTA 2QCMA 1FCBA 3HF3A 1K8YA 1K7EA 3RU6A 1VCFA 1V5XA 4IWWA 3NOEA 3W70A 4UNLA 4YCPA 1MZHA 2P10A 3SJ3A 2Y6ZA 2H8ZA 1J2WA 3LRKA 2JK2A 3KVJA 1VQTA 3CHVA 1I2NA 1TV7A 1OFOA 4PH6A 1W5PA 4AAJA 1M7PA 1XBXA 2C19A 3A21A 4RZ4A 4RV8A 1SZEA 3CLMA 2CLFA 3MO7A 2HS6A 3M5VA 1FXQA 4PCFA 1GVFA 5EA9A 4YLWA 2VEPA 3IVUA 5D33A 1GVOA 4HPXA 1ME7A 3G1VA 1H1YA 4MUZA 5DCEA 2Y63A 3C52A 5HULA 5D38A 1H62A 3NVTA 4HHPA 4NUWA 1OABA 4JICA 1RVGA 1L9WA 4K39A 3SW6A 1RV8A 2CLIA 1NVMA 2VFEA 4CNNA 1L6YA 1HL2A 1X1ZA 2VEIA 4KWWA 3TXVA 1VS1A 1MO0A 4DBEA 5I3GA 1WBHA 2X1TA 3MW7A 4NVTA 3E96A 3GNDA 2GQ9A 6TIMA 3NM3A 3P67A 4ZL1A 2ZZ2A 1HTIA 3HG3A 1EPXA 3IIVA 2QKFA 5IBXA 3VCRA 1FDJA 5DELA 4DO5A 2C14A 4AB4A 1OYBA 2YGYA 1IIGA 1TPB1 3MBDA 2DJXA 1LOSA 1OX4A 1XXXA 5K9DA 3CPRA 1ZENA 4UXDA 1VLIA 3G0UA 3VNDA 1FWTA 2C13A 1T8XA 5A5WA 3C8FA 1S5TA 2HSAA 1GTEA 3B0PA 4NXKA 3O1NA 4UIOA 2X30A 5D37A 4L4LA 1JRCA 3FS2A 1XKYA 2F84A 2WNNA 3LI0A 4LV9A 1B4EA 1SO6A 5LNUA 4FX6M 4O15A 1VHNA 1SO5A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1EP2A

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