1EP2A

Crystal structure of lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase b complexed with orotate
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
309
structure length
305
Chain Sequence
ENNRLSVKLPGLDLKNPIIPASGCFGFGEEYAKYYDLNKLGSIMVKATTLHPRFGNPTPRVAETASGMLNAIGLQNPGLEVIMTEKLPWLNENFPELPIIANVAGSEEADYVAVCAKIGDAANVKAIELNISCPNGQAFGTDPEVAAALVKACKAVSKVPLYVKLSPNVTDIVPIAKAVEAAGADGLTMINTLMGVRFDLKTRQPILANITGGLSGPAIKPVALKLIHQVAQDVDIPIIGMGGVANAQDVLEMYMAGASAVAVGTANFADPFVCPKIIDKLPELMDQYRIESLESLIQEVKEGKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lactococcus lactis
publication title Structure of dihydroorotate dehydrogenase B: electron transfer between two flavin groups bridged by an iron-sulphur cluster.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE B (PYRD SUBUNIT)
total genus 93
structure length 305
sequence length 309
ec nomenclature ec 1.3.1.14: Dihydroorotate dehydrogenase (NAD(+)).
pdb deposition date 2000-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1ep2A00
1SO4A 1P4CA 5LNRA 5EL1A 3TMLA 1FDZA 5AYXA 4Y8FA 1QWGA 2RDWA 5H2ZA 3W1MA 3S6DA 1GG0A 4IMEA 4N4PA 1B3OA 1VLWA 3TC6A 3P67A 4Z08A 3I7SA 5BMXA 3O07A 3NQAA 2AAMA 1KFBA 2YDAA 3GAKA 4DXVA 4TMCA 4O11A 1TV5A 6ALDA 1ZNNA 1LZOA 3GAYA 1JCXA 3UPBA 4WY0B 4UTHA 3QRHA 4K36A 3MYOA 1KLZA 2Y62A 3OVRA 2PCQA 3TCEA 1I45A 5MHBA 1LOLA 1Y0EA 4BK9A 4LV4A 3QF0A 1SZNA 4CCCA 2ZZ5A 4LC8A 4MKNA 4WD0A 1OX4B 1MXSA 2JKAA 3PY2A 3W1AA 3MP4A 5BRBA 4M19A 4BFAA 2B7PA 1DVJA 3NQGA 1VCFA 3PR2A 4RZ5A 3DH7A 3LOTA 5DCBA 1EWEA 1NAL1 3PG8A 2J88A 3UXAA 1RD5A 4XWUA 4RXFA 1W56A 1QCWA 4YXGA 3IIOA 4DO5A 3CEUA 2E5DA 2WSYA 3V1PA 1E51A 5HWNA 3UWYA 4WY0A 4MY1A 2WSRA 1W37A 2VKZG 4MYXA 4LS0A 4TIMA 2A6NA 2ZA2A 4IXHA 3PM6A 3M16A 1SU5A 3QPZA 5AOUA 3W7CA 1OX4A 1QPNA 1ZCOA 1PCKA 4NZJA 1WOAA 4BF9A 5HWJA 3LBCA 3NPUA 4XBKA 3QSRA 5G1TA 2EF9A 5HULA 4NNCA 1MEWA 1TV7A 3S1WA 3LRLA 2WQPA 3DFNA 3BLFA 3W74A 1EP3A 3BVJA 4EVZA 3UY8A 2CWNA 3PUOA 4MUZA 3BW3A 3P8JA 4NZFA 4MZ1A 4JN6A 3FIGA 3A9IA 3ATZA 4UFHA 1VYSX 5I3GA 2DJLA 5I3IA 1H1ZA 3G1AA 4Y6GA 5KINA 1CX9A 4O16A 2J9ZA 2DZUA 2NLIA 2DZXA 3SR7A 4AEOA 4UCGA 4O13A 4EF8A 4JTGA 5AC6A 2Y85A 1OFDA 4ORMA 3PSVA 3MHGA 4LS1A 2FJKA 4A22A 2A85A 3UY7A 1H7WA 4JS3A 4NXKA 2QUUA 4DPPA 4KWVA 4FNTA 1GG1A 4MYAA 1VS1A 3BV4A 2ZA1A 4IXXA 2YX0A 1SFJA 2V5BA 1VRDA 4M6VA 3I7RA 3B03A 2C14A 4AH7A 4O1AA 4ZZ9A 3JS3A 5C5YA 3RU6A 1X8FA 5L9FA 3YPIA 3NL5A 1JCJA 1ADOA 1J2WA 2QKFA 3QFEA 1SO5A 5D37A 5CPLA 5TBOA 4TO8A 5FEWA 3NO5A 3GDMA 1WDWA 5AB3A 1PL9A 4WOZA 3NQ7A 3TMQA 4BR1A 2LLEA 2GJNA 4TMBA 4XKYB 1P0NA 3DENA 1DHPA 2ZZ1A 3EWXA 2NV2A 4N9BA 2B4GA 1H7RA 4IQLA 3F4NA 2B7OA 4H4IA 3GDKA 2Q3OA 2QCEA 3O6CA 1SSGA 3EXTA 4QSHA 3CB8A 4Z0JA 4UMCA 3AJXA 2QR6A 3HGOA 3T55A 5G4WA 1XBYA 1OFAA 4O50A 1DL3A 1GPWA 1TSIA 1YPIA 5D2TA 5BMWA 3O15A 5KZMA 1IXPA 1ME7A 1JCMP 2HS6A 2A4AA 1NSJA 3BG3A 4JY8A 1M7PA 4CNPA 5FF0A 2DZWA 1OG0A 3VKJA 1JUBA 2ISVA 3G1HA 3I65A 3NQEA 3B06A 3W7OA 1I2RA 2ZDRA 2H3BA 1L2UA 4XKYA 3TJXA 4DBDA 5IBXC 2TYSA 4YLWA 1SZGA 2GJLA 5LZLA 2E5BA 3SIZA 3BW4A 3FKRA 4XBSA 3WK1A 4YMZA 2ALDA 3Q94A 3W6YA 3FOKA 4RKAA 5HUOA 3GZ3A 1XFBA 2UV8G 5F2LA 3CTLA 3P62A 5LNUA 4LUIA 4CNNA 1S3HA 3L0KA 2F7FA 3KRUA 2OZ0A 1TCDA 1QPRA 3LXBA 3B04A 5TIMA 1SUXA 3HOJA 1YDOA 5BOOA 3NQVA 1FWNA 4LUJA 5D02A 3CWOX 4E0CA 5K2ZA 4HN4A 3T44A 3K30A 3W7DA 3NM3A 2BX7A 1A5BA 2QJGA 5FEXA 1TTIA 3GYEA 3HGSA 2VFGA 3CEPA 1A53A 1NEYA 4FXSA 1Q6QA 3O6DA 1KM4A 3R8RA 1YXYA 3E9AA 4LWWA 4PA8A 3T7VA 4CQAA 4NJGA 3T40A 3TV8A 3LXCA 1QR7A 3BARA 2A7PA 3LI1A 4ZL1A 2V81A 4ZQMA 3WK2A 4UTIA 2CZDA 2J27A 1WBJA 1QMLA 3HPZA 1AL8A 1VCVA 2OT1A 3LGEA 1KW1A 4HIBA 2JGQA 2NWRA 3KVLA 3NZRA 3P5YA 3OVPA 1WQ5A 4OWGA 5BW6A 1EUNA 3MWAA 4OGZA 3FJLA 1DBTA 4DEFA 1VGAA 3PVFA 4GJ1A 3W23A 4RX0A 3TXZA 4RV8A 1I2NA 4ZQRA 3W2MA 5HUPA 2CLEA 3ZFHA 1BKSA 3U8GA 3LCFA 1H62A 5FF7A 4NQ1A 1TPEA 4UTKA 1A50A 3M47A 1SQ7A 3NQFA 2P1FA 3KVMA 3DU0A 3KRSA 5K7JA 3FYPA 3OHIA 3NG3A 1HL2A 2YCEA 4JTHA 2ZZ2A 5DY2A 3DZ1A 2RKXA 3G18A 2FIQA 1TTPA 2QDHA 3BW2A 1SW0A 4MY8A 3PG9A 3HPSA 5A5WA 1PHQA 2ZTJA 4IX0A 4QAIA 5K9DA 4S1FA 3CM4A 4QNWA 4LVAA 3HPXA 2JBMA 1OABA 2ZCGA 2ZBTA 3N2MA 2Y7FA 1YTEA 1TJPA 4MLRA 2ZZ6A 5EBUA 4O12A 3O06A 5F4XA 4FXRA 2BZNA 2E77A 2ZA3A 5C54A 2X2GA 4O52A 2H6RA 2V2DA 2E5CA 3OG3A 3E12A 4GUHA 3LLDA 3UWWA 2JGYA 4N9DA 1IXNA 3MYPA 3LTSA 1Q6RA 5DLCA 2QJIA 4WXYA 1FWWA 2C3ZA 3LV5A 1K8XA 1BWKA 3MUXA 1GYNA 4UR8A 1TB3A 4JTTA 3W1RA 1SFLA 4U28A 3MW7A 2A6LA 2CLHA 3S5NA 3KVJA 3L66A 5AC7A 2OJPA 4IGHA 1EPXA 1YADA 4HHPA 3VNDA 2Q8LA 4HSOA 1V5XA 1FDJA 3UYCA 2NV1A 2H3DA 3LX9A 3TX9A 5LHFA 3GKAA 2ZRZA 2R91A 4Q4KA 3ZR4A 3C52A 3QC3A 4N6EA 4PH6A 3TW7A 2JK2A 2V82A 1DJNA 4NXSA 3R13A 2X1RA 4ZQCA 1G7UA 3DXIA 1A5SA 5F2IA 1PCWA 3WJXA 1KTCA 4AB4A 2NX9A 2NZLA 2VEPA 3W7IA 2VFDA 3W84A 3KFTA 3W22A 1O94A 1KFCA 1SO6A 1H7PA 3MP5A 2W0UA 3LCLA 3G1VA 1XDMA 3WJSA 4TX9A 5F1VA 4UTWC 1F73A 4AAJA 3EB2A 5HQEA 1TV8A 4QM1A 5FF2A 4Z1DA 1C29A 4N6FA 4AVFA 2E68A 1G7VA 5DXXA 2F84A 4AWSA 4LS2A 4JY9A 4K8EA 4RXGA 5LGXA 5AHMA 1JQVA 1ALDA 1RV8A 1MEHA 4JIPA 1R2RA 1H7NA 2QF7A 3L2IA 4TU1A 3OBKA 1I2QA 3O6YX 3B0VC 4ONVA 4FX6M 5C55A 2DJXA 3M5VA 2ZTKA 1KV5A 3U2OA 1RQBA 3RF9A 1RR2A 3B05A 2HTMA 4AMAA 1AK5A 4LRTA 4UMBA 3W1PA 1WXJA 1H7XA 1XKYA 1TTJA 4QISA 3W7HA 4LVDA 3O1NA 3L0NA 4LVGA 4LC6A 3MP3A 2Y6ZA 1LYXA 5D09A 2QUVA 3HB9A 1OFBA 1SO3A 2QCCA 4YWIA 2CU0A 2ZRYA 2Z6IA 3PULA 3W86A 1YTKA 3M9YA 4WOQA 4FNSA 1PV8A 5L6UA 2Y70A 4UTMA 4GXMA 1G4SA 2O7QA 1GWJA 2FPYA 3W1QA 3QM3A 4Z1BA 2Z0IA 4K7VA 3P61A 2V0TA 3TJLA 1PVNA 1NF7A 1KBJA 3N3MA 3TAOA 4UFMA 3RMJA 1UUMA 4D2JA 5KTLA 3QYQA 2A7NA 2FDSA 3OVQA 2NXGA 4NX0A 4WZHA 4MFDA 1L6WA 5DBTA 1WOBA 2C19A 1L6YA 5DY3A 1RQHA 1H7OA 3PBYA 4PODA 3TKFA 3IIXA 5AFDA 2WNNA 4FB7A 2V2CA 1SR9A 1HO4A 1K02A 2I9EA 1O5XA 2YW4A 3C8FA 3S1UA 1YPFA 3GIYA 4L4MA 5DCEA 1RQEA 2GVJA 5FEPA 3GNNA 3N2XA 4QQ3A 3T78A 4RZ4A 1KTBA 2VEKA 3DFQA 2A5HA 2I14A 2C18A 4A2SA 3NA8A 4BWLA 2VFFA 3G1FA 1XXXA 1W3IA 4OU1A 4O19A 3I68A 4O0ZA 1EIXA 4NJIA 3SJ3A 4M6PA 4MVAA 2D73A 4ZQOA 2VFIA 1QPQA 4R34A 3TNOA 2P10A 2J9XA 4K8HA 2VENA 4HKPA 3GVGA 1GQNA 1W5NA 2NXHA 3S8HA 3R5EA 4O53A 1LTDA 4EF9A 1OK6A 2WNZA 1GZGA 1XM3A 1ME8A 5D38A 1ME9A 3L65A 2ZQ0A 1L9WA 4I7VA 4A21A 4DF2A 3BPWA 3M6YA 1XUZA 4GUIA 3N34A 3ANYA 3JRKA 2GQ8A 2P0OA 3HG4A 2PURA 3HG2A 1GT8A 4Q32A 3WFAA 1OFRA 1X1ZA 3ABRA 4UFJA 5K9CA 3W7GA 1VJIA 1W31A 4R53A 2J9YA 1LLZA 3CC1A 4NJHA 1N8FA 1TREA 1YDVA 1F76A 3LDVA 1ZY9A 1KFEA 4UMAA 4UFLA 3A5VA 5LNVA 3EWZA 3RLVA 3QH2A 3HMJG 1G4PA 1IF2A 4K7YA 3SFKA 3TC7A 3STFA 1LOSA 2TSYA 3NAVA 1UBSA 2G95A 3DFSA 2ISSA 2WNQA 4AWUA 4FNPA 4B5NA 5AHIA 4UR7A 2Z2UA 1J4EA 3GDRA 4UFIA 5AHEA 1ICQA 4RZ6A 1FWTA 1AW5A 3NNTA 2EAWA 4WQ6A 4E2BA 1VCGA 2NX3A 1QOPA 2RDUA 5D2WA 5CZ0A 3FLUA 2WV8A 5KZEA 2FQIA 3M5ZA 1H51A 3W7LA 1VHNA 3INPA 1QO2A 1SW3A 1VYPX 4GRSA 3TU9A 3RFAA 1J5TA 1L6SA 1AL7A 3GR8A 3EX1A 3IIZA 5CZSA 2ABBA 2EGZA 3Q37A 1R47A 3L9CA 2BTMA 2WKJA 4M7TA 4MZ8A 4N9CA 2KZHA 1TRIA 4RJEA 4C1KA 2JKPA 4OBTA 3H54A 2EPHA 1JVNA 2O7SA 1GVRA 1G67A 5CPNA 4MOZA 3S9YA 1I4NA 4ADSA 1WX0A 4MFEA 3STEA 1DJQA 4FNRA 2C6QA 1F6PA 5LHEA 2Y61A 2E6YA 1M5WA 5CKSA 1C9DA 4L4LA 3MBDA 3RLUA 3W7EA 3TQKA 4UTTA 4IMDA 3W2LA 1LBMA 3W88A 1ZAHA 2VOMA 3W9ZA 3N9SA 3FS2A 3RNDA 1ZENA 1UUOA 3PBVA 1JRBA 3IIVA 5DBUA 4YCOA 4CCEA 4QNEA 4FHAA 4O10A 2ZZ4A 2QAFA 1LRTA 4O15A 3U6WA 1Z42A 2RH9A 4JTSA 1TQXA 4I7WA 3WK3A 1TTQA 1EX5A 2ZRVA 2DU2A 1R2TA 3S5YA 1SPQA 3LHWA 1RPXA 3N19B 2QJHA 4JTKA 3ABQA 3BGJA 5LNWA 2GQAA 2J6XA 1AG1O 3T4CA 1KM5A 1OX6A 1W5OA 3SI9A 3GXNA 1YYAA 2E6DA 4BI6A 1FDYA 1XBVA 3LB0A 4AF0B 3IGSA 3O16A 1TPVA 3W1TA 4ALDA 3M41A 3SECA 3GXTA 3M5YA 1TQJA 2QCDB 1H63A 3QJAA 3GNDA 1IIHA 4DO4A 1D9EA 3G8RA 1G6CA 1HTIA 3W75A 1XCFA 3R89A 4NX5A 4JDYA 2DORA 3NQ6A 4NU7A 3L68A 3B0PA 2BSLA 1B4EA 3W1LA 5F4WA 4JTJA 3QW3A 2C0AA 5G1YA 2YW3A 4Z1CA 2TMDA 4JX6A 3QEZA 4FIQA 5HR7A 4NVTA 5CZTA 4HNTA 5HMSA 3LRKA 3FFSA 5K4XA 4J9JA 1FWRA 4GUJA 3F03K 2NUWA 3WK0A 4GBUA 4GUGA 3P8IA 2XN2A 4FNQA 4Y90A 5G2HA 1GVOA 3C6CA 5D30A 5C2XA 1KTNA 1W3NA 1LCOA 3BG9A 1KM3A 4FIRA 1YDNA 3C0JA 1TIMA 4X9SA 4I9AA 4AF0A 1TPB1 1FX6A 1O4UA 3O63A 1R30A 2QCDA 2WJZA 3DAQA 3I7QA 3N14A 2QCGA 5F1UA 2V9DA 1MO0A 1FQ0A 4K37A 3A24A 3TR2A 3KRZA 3R2GA 3W7JA 4XTIA 4NT0A 3DFOA 1MZHA 1M7OA 3KVKA 5G2IA 4WX2A 3A22A 2YZRA 1LOQA 3GXPA 3NOEA 3TW6A 1P0KA 1T99A 1A5CA 1BTMA 4I7UA 1TJRA 2EKCA 1OVDA 4KKXA 1EP1A 3G22A 3NYZA 3LTYA 3UQNA 3UXDA 2NUXA 3LCHA 4IWWA 3W7QA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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