1EP2 | Genus

Total Genus 93

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	93
sequence length	309
structure length	305
Chain Sequence	ENNRLSVKLPGLDLKNPIIPASGCFGFGEEYAKYYDLNKLGSIMVKATTLHPRFGNPTPRVAETASGMLNAIGLQNPGLEVIMTEKLPWLNENFPELPIIANVAGSEEADYVAVCAKIGDAANVKAIELNISCPNGQAFGTDPEVAAALVKACKAVSKVPLYVKLSPNVTDIVPIAKAVEAAGADGLTMINTLMGVRFDLKTRQPILANITGGLSGPAIKPVALKLIHQVAQDVDIPIIGMGGVANAQDVLEMYMAGASAVAVGTANFADPFVCPKIIDKLPELMDQYRIESLESLIQEVKEGKK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of dihydroorotate dehydrogenase B: electron transfer between two flavin groups bridged by an iron-sulphur cluster. pubmed doi rcsb
molecule keywords	DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE B (PYRD SUBUNIT)
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Lactococcus lactis
total genus	93
structure length	305
sequence length	309
ec nomenclature	ec 1.3.1.14: Dihydroorotate dehydrogenase (NAD(+)).
pdb deposition date	2000-03-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1ep2A00

4UR8A 4LS0A 2EPHA 1ZFJA 1PE1A 5D37A 4JYFA 3C8FA 4AF0A 5DCEA 1AG1O 1YPFA 1DKWA 2A1YA 1TPB1 3RLVA 3FYOA 4IMFA 3PG9A 2C18A 2NX3A 4E2DA 1X7FA 1ICSA 8TIMA 3UQNA 2ZRXA 2WSYA 3C61A 3ATZA 3QFEA 1B3OA 3P84A 4O4VA 1ONRA 4S1FA 4AHQA 1PVNA 4MY8A 4K38A 1QMLA 1XKYA 3PUDA 3B04A 4LTSA 3CEUA 4RXFA 3I7SA 5F4SA 1LBMA 1YTEA 1A5CA 1TQJA 4O18A 3DH7A 3PBVA 1ZJIA 1JULA 4DF0A 2QR6A 4PFMA 1FXPA 1W3IA 5HUOA 1JVNA 3GDLA 4Y90A 3PR2A 3R5EA 3M5ZA 2YPIA 4W9TA 5K2ZA 3G22A 4M7SA 4N4PA 3MP4A 4GRSA 4KWVA 4HNVA 2CLMA 4FEZA 1B9BA 1JCNA 4LVAA 5FF7A 4O28A 2Y7GA 1TREA 1KA9F 3EWUA 1WOAA 2C19A 1ZNNA 4LVBA 2PCQA 2H90A 5KSWA 2Y6ZA 3PSWA 4LY8A 1LP6A 5IBXC 2ZBTA 3QMSA 5HWMA 1KV8A 4IPJA 1VPXA 4UFIA 3O05A 5BNKA 1VHCA 1G4PA 3MMTA 1LZOA 3G18A 4IMCA 3M44A 4DBEA 2QDHA 3BGJA 3FKKA 1K8ZA 1JR1A 4WX2A 5K9DA 1WAUA 1X1OA 3NVTA 4LOCA 4M7TA 4ZQMA 5EL1A 3ATYA 4Q32A 5EY5A 3L21A 1S3HA 3I68A 1T0OA 1F05A 3P60A 3VE7A 1WDWA 3TSDA 4YMZA 1V7YA 2FPTA 2I14A 5IBXA 3EX3A 5CG7A 1FXQA 2E5DA 3O16A 4UC5A 3S5YA 3V1PA 3M7WA 5LKYA 3IIXA 5L9FA 1TQXA 2ATMA 5HMSA 2FJKA 1LYXA 4CQ9A 1CI1A 1WBHA 2ZRVA 4IXXA 3Q94A 4RCXA 3PY2A 4PODA 1LRNA 4XKYB 3UWYA 4AHPA 4OV4A 1GYNA 2VFFA 1IXOA 1PIIA 1GPWA 2Y88A 1OFDA 1OFQA 1V5XA 1TPUA 3LI1A 1R46A 4MFEA 3O06A 1QR7A 5AHLA 2DZTA 3LV5A 5D38A 2NXHA 4Z0JA 3KVJA 3S42A 3BLIA 4K8EA 2ZTJA 2BLEA 1G7VA 3LI0A 3IIVA 2VEKA 3NPWA 1OX4A 5HQEA 1GVRA 1O95A 1QPOA 3UZ5A 1TTJA 2WV8A 1Z44A 1LDCA 2H8XA 3B03A 4BI5A 3FIGA 4K7YA 1YPIA 3HG5A 4JX5A 4QAIA 2YDAA 1NFBA 5E0KA 4HSOA 3FYPA 5EYWA 3P82A 5AYYA 3CB8A 1EX5A 2DZVA 1TPDA 3HB9A 3WJYA 2NV1A 3TK7A 1H7OA 1TTQA 3B8DA 3MP3A 3R12A 4JX4A 3BPWA 4AHOA 3TU9A 3AJXA 2CLOA 3CQ0A 4GUIA 1JQXA 4LC8A 1H1YA 3M0ZA 3E0IA 2YW3A 3B0VC 2PE4A 1ICPA 4ICNA 2XN0A 1LROA 4PC8A 2VFIA 5G1YA 4DEFA 1L9WA 3ANYA 1QPQA 2DZPA 2EKCA 3M41A 2WOQA 1UUMA 4FNSA 1VLWA 1C8VA 2NUWA 4Z1BA 2VKZG 3STFA 1IXPA 1DJQA 2Y7EA 4YL2A 1O5KA 3LLDA 3CLMA 5TQLA 1DL3A 2E68A 3A24A 4TMCA 1GG1A 3LCXA 4WOQA 2X1UA 4M19A 1YXYA 3W7PA 1JCMP 1XBYA 4BK9A 1SUXA 4G1KA 4P61A 3BGGA 5D32A 3C2OA 3B05A 4Z1CA 4JEQA 2C16A 5AHNA 4FX7A 1Z48A 2BWGA 3NO5A 1OK4A 1LRTA 3MP5A 4MY9A 3W2JA 2X1RA 3DU0A 1GT8A 4DQWA 3QSRA 2RDWA 3R13A 5HR7A 3W2KA 2A7RA 4O14A 2Z1BA 3G24A 3L65A 3R89A 3U8GA 2ZRUA 2QKFA 1GYLA 5F1UA 5G1TA 1KTNA 5DXYA 3GXPA 1WBJA 4NU7A 1NEYA 4QQ3A 3NQCA 5BRBA 5FF0A 1KLZA 2J27A 4O12A 3Q2DA 1VLIA 2E6FA 2B0MA 3G0UA 3PF3A 1KM5A 1GVQA 1VCFA 1VZWA 2XFWA 3HJZA 3ZR4A 1PS9A 4LVDA 4CCCA 4AF0B 3G1XA 3G0SA 4IXHA 4JYEA 1I2QA 5KTLA 1W8SA 1YDVA 4TMBA 3P74A 5DY2A 1OF8A 3ZWSA 3TROA 4FHAA 2QJIA 1TYGA 2WKJA 3RLUA 1FWTA 2AQWA 2QCFA 1ZCOA 4JY9A 1OABA 4NT0A 1QCWA 2QAFA 3PUEA 3PUOA 3PG8A 5HINA 3S5NA 3KVLA 3HO8A 4ZVJA 3IIZA 3F1QA 1WV2A 2Y85A 3W2UA 3WJXA 2C3ZA 1YTDA 3Q37A 1OFEA 3FEMA 3GX9A 3OG3A 5EA9A 4NJHA 3O6CA 2FTPA 1SPQA 3WK0A 4WQ6A 3DKLA 3HGJA 4KFNA 3DBPA 4JTUA 4WXZA 1FDYA 3TUUA 2ZA3A 2CLEA 3NNTA 3NDOA 1G69A 3IRDA 4TX9A 2WO5A 4QNWA 1XUZA 1DV7A 3NQGA 3C6CA 4WUIA 1SZNA 3EEGA 2V9DA 3G1FA 1LOQA 3GDRA 2A7NA 1PCWA 1UASA 2Y63A 3GXTA 4NJJA 1J2WA 2QJGA 2D73A 4MJZA 1D3HA 4MJMA 5CZJA 2G95A 4UR7A 5K3VA 2PRLA 1SW0A 4FIQA 5FI8A 4NNCA 4LT9A 1GQNA 3R2GA 1EP3A 1HFBA 1PCKA 1KFKA 1TO3A 4O15A 3S5OA 1KLYA 3GB6A 3EXRA 2J9XA 1ZAHA 4IPIA 2ZRYA 3LCLA 3G1DA 3THQA 4RLIA 3L2IA 4NJIA 2AGKA 1DOSA 5KITA 2FFCA 4OT7A 4ZL1A 1S5TA 4O0KA 3STGA 2G5WA 4Z0SA 1SW7A 1A53A 3WFAA 3RF9A 4EWND 1VQTA 1DVJA 3C2EA 2DZXA 2HS6A 3VI2A 2Q3OA 2QUVA 1PL9A 2NV2A 4H6KA 7TIMA 1I2RA 5KZMA 3EXTA 5LGZA 1GVOA 5K4XA 3DFNA 1QPRA 1Q6LA 2A7PA 1NAL1 1P1XA 3L0NA 4RXGA 1MSSA 3ELFA 5FEPA 1JUEA 1MO0A 3TQKA 1OX6A 2Z2UA 4D2JA 4UTMA 3W1XA 3SGZA 4ALDA 4JTFA 3UY7A 1XUUA 1KFCA 2QCDA 5G5IA 1EUAA 4K8HA 5ABTA 5IM51 4R53A 2JGQA 2QUUA 3W7QA 3W3OA 1TPH1 1BTMA 2E5BA 1LRQA 5F4XA 2TPSA 1GEQA 4UTTC 2AAMA 3SR7A 2NLIA 5AC6A 3NAVA 2YFOA 3W1AA 3MO7A 1THFD 3DAQA 3MHGA 2E5CA 4WJEA 5CZTA 2JGYA 3N3MA 2H8ZA 1KFBA 1EEPA 4HPJA 1O94A 2WQPA 4LV9A 4UFHA 1O5XA 2A5HA 2ALDA 4FXRA 4JTGA 1MZHA 3MI6A 2LLEA 2B7PA 5LNVA 1YADA 2E77A 3LCGA 1O4UA 4AWTA 4FNQA 2P0OA 3G1YA 5HNRA 3KVKA 3E12A 4O57A 1KFJA 3MYPA 2EAWA 3OA3A 4PL1A 1G4TA 1B4KA 3STEA 5AC7A 1LLZA 4O52A 4JTHA 5I3JA 4NX5A 3A21A 4UTTA 3A5VA 4FNUA 4FNRA 1GG0A 3R8RA 1MEWA 3TXZA 5D2WA 1UCWA 1A5SA 5DELA 2ZDRA 3DZ1A 3W7LA 3IIOA 2TRSA 4IX0A 2FB2A 3TKFA 1FWWA 1KM3A 3HGOA 3NQEA 4DPPA 5H91A 2ZZ6A 3Q58A 2CFFA 3GVGA 4OU1A 2IQTA 3KOFA 5D30A 3SFKA 4BI7A 4GXMA 5LHFA 5D2VA 4UFKA 4MFDA 5CPMA 3IGXA 3S9YA 4O1CA 2C15A 4JD4A 3FLUA 4XTDA 3QEZA 3C3NA 4DF2A 2YYTA 4LVFA 4TIMA 4B5NA 3KFTA 3A5FA 2VOMA 3HG4A 3W83A 1YXDA 4O1DA 4Z08A 1VHNA 2QCNA 3IGSA 5TBOA 4DO4A 2VFGA 1SZEA 2W79A 4IOTA 1VJIA 2NWSA 4MPQA 2ZA1A 3IVTA 1XCFA 3NQ7A 4O54A 3UXDA 4KFOA 1JQVA 3TW6A 2F84A 1VYSX 5LZLA 5D02A 3N9SA 1J5TA 3QRHA 1RPXA 1FWRA 1H5YA 1QAPA 3BW3A 3QSTA 4Y9AA 1N55A 4JTIA 3TJLA 3W9ZA 2XN2A 3G0XA 1TJPA 4ADSA 1IGSA 5K9XA 2O7SA 3G1AA 4GUFA 3W7KA 3GYEA 4JN6A 4XTIA 3W84A 1YDNA 3G3DA 3ZS4A 3GZ3A 3W1RA 4AEOA 1JUBA 5LHEA 3L0GA 3EKZA 3C52A 4RR4A 3S1UA 3S1WA 3GDKA 1ALDA 1GOXA 1W5MA 2C0AA 3BVJA 3PC0A 3EB2A 1IIGA 3PVFA 5G4EA 1EUNA 3TJXA 4HN4A 3DI0A 3UWVA 2H3BA 4O1BA 5AC8A 1AW5A 2GVLA 3TSMA 1H7WA 3TAKA 4HNUA 1W5PA 3THAA 3NA8A 3RFAA 1T99A 4CQ8A 4MYXA 4WY0B 4XWUA 5BOOA 4ADTA 1FQ0A 3N73A 1X8FA 1JCLA 2J9ZA 2A85A 3NZRA 3W1MA 4E38A 3OVQA 2VFHA 1FCVA 3A23A 1KM4A 2GQ9A 4JR5A 4AXKA 1K3UA 4NJKA 3TCEA 3TQVA 1TMHA 4UNKA 3EWWA 2GJNA 2NUYA 3MI2A 3SY5A 4ADUA 4GFSA 4CCEA 1KV5A 3SSJA 4HT3A 2V2DA 3B4UA 4R33A 2B4GA 1X1ZA 3W7DA 4QM1A 1GTHA 2TYSA 4GWEA 3QZEA 1RV8A 4HKPA 4NX0A 5FF2A 4QISA 2QAPA 3EKLA 4Y6GA 2ZTKA 3GKAA 1NSJA 1G6CA 3OBKA 1YYAA 1IF2A 5DN1A 1O60A 2Y62A 2A0NA 5LNRA 5EPDA 3VKJA 3NGJA 1K03A 2RFGA 1TV5A 2VEMA 5AN7A 3W75A 2ZZ1A 1K7XA 3DFPA 1ZAJA 3NYZA 1W0MA 3TE9A 4FNPA 3D0CA 1QOQA 3TXVA 4PA8A 3M6YA 1K8YA 3NQFA 4DO5A 2BSLA 4NJGA 2A4AA 4JIPA 3LRKA 3LBCA 1TV7A 3P7YA 4RZ4A 2R8WA 3KVMA 4LUIA 4CNNA 1OFAA 3C56A 3E49A 2E09A 4KKXA 3NQVA 3GAKA 1P0KA 4LVGA 1HO4A 3P8JA 3OIXA 1MEHA 3LLFA 2J24A 3ZFHA 4N9EA 4JS3A 3G1SA 1E51A 3KRZA 4EOUA 1P4CA 4N9DA 3LHWA 2I9EA 5BW6A 5G2WA 1J4EA 1HTIA 3KRUA 4MVAA 1EPXA 3ABQA 4H3DA 3NL5A 5SWUA 3MWAA 2Z6IA 1W54A 4QJ1A 5F4WA 3SECA 1KM2A 4FNTA 4XZ9A 4S2CA 2FIQA 3CHVA 1GVSA 3W07A 2GQAA 1A5BA 4OV9A 3FJLA 4RKAA 4PH6A 1KBIA 2V2HA 3VE9A 2QCDB 2ZYFA 1K02A 5LNWA 4Q33A 1JCXA 2GVGA 1VC4A 4ONVA 3S0CA 1G4SA 3PULA 3EWYA 2QCMA 1ICQA 1X6UA 1WX0A 2V2CA 4NZJA 3RMJA 3WK3A 2GJLA 3G1VA 1OFBA 3LRMA 5CGQA 1DJNA 1F2JA 2R94A 3MI3A 3DFSA 4ZQNA 1DORA 3F4WA 5I3HA 3UYCA 1FCBA 1YLVA 1EWEA 2DU2A 1VYRA 3L67A 3W7RA 1R2TA 3GR7A 1D3GA 3HPXA 5K4ZA 2QCLA 3IIPA 2Q3RA 2JBMA 1EA0A 1G7UA 3V75A 5MHBA 4KFPA 3NG3A 3W74A 1H51A 3UWWA 1G4EA 1KM0A 3WK1A 1KTCA 1H1ZA 3L5LA 2C6QA 2X1SA 1H62A 4DF1A 3NPVA 2XN1A 1HL2A 3DGRA 4UFJA 5HUPA 4X3ZA 5D05A 3W1PA 3T78A 2B7OA 2HS8A 3TC7A 1TB3A 1Z42A 5AFDA 1LBFA 3N14A 3QJAA 2A6LA 2Y61A 3LB0A 2RHGA 1L2UA 4RK8A 4E2BA 3ABOA 5FF4A 2G96A 1H7PA 4GC4A 3PBWA 4BR1A 2JKPA 4AVFA 1CW2A 2UV8G 3GIYA 4AMAA 4OE7A 3LTSA 4UXDA 1F5ZA 3UPWA 3H55A 4Q4KA 5A8GA 3DFOA 4Y8FA 4JTLA 4GE8A 3YPIA 4RZ6A 4L4LA 4O17A 2GOUA 3W7GA 4C1LA 3G1HA 4M6PA 1VYPX 3FKRA 3OEXA 3P61A 3HOJA 3DKJA 5FEZA 3IV3A 3CU2A 3W73A 3TR2A 2RDUA 3LHVA 4NXSA 1XDLA 2Q8ZA 3HPSA 3GKFA 3W1NA 3NR0A 4JTKA 1D9EA 3B0UX 3I7QA 5F2MA 2V81A 3W71A 3W2NA 4TR9A 2TMDA 5U4NA 1SSDA 4MZ1A 2OT1A 3LOTA 3NPUA 3JS3A 3M1ZA 3U2OA 4NXKA 2HSAA 3S1XA 2V0TA 1JCYA 3L66A 3S6DA 3TFCA 3I65A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1EP2A

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