1EPXA

Crystal structure analysis of aldolase from l. mexicana
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
357
structure length
357
Chain Sequence
MSRVTVLQSQLPAYNRLKTPYESELIATVKKLTTPGKGLLAADESIGSCTKRFQPIGLSNTEEHRRQYRALMLEAEGFEQYISGVILHDETVGQKASNGQTFPEYLTARGVVPGIKTDMGLCPLLEGAEGEQMTEGLDGYVKRASAYYKKGCRFCKWRNVYKIQNGTVSESAVRFNAETLARYAILSQMSGLVPIVEPEVMIDGKHDIDTCQRVSEHVWREVVAALQRHGVIWEGCLLKPNMVVPGAESGKTAAPEQVAHYTVMTLARTMPAMLPGVMFLSGGLSEVQASEYLNAINNSPLPRPYFLSFSYARALQSSALKAWGGKESGLAAGRRAFLHRARMNSMAQLGKYKRSDD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of type 2 peroxisomal targeting signals in two trypanosomatid aldolases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE
molecule tags Lyase
source organism Leishmania mexicana
total genus 144
structure length 357
sequence length 357
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2000-03-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1epxA00
2WPBA 3QC3A 2ZZ5A 1W5PA 1Z41A 1NEYA 4UMBA 5LSMA 4FNPA 3DU0A 4C1LA 2RDUA 3LHTA 4UTMA 1K3UA 4ONVA 1K03A 1QDSA 4AWTA 4E38A 1JUBA 3W7OA 4CQ9A 2RDTA 1OF8A 3BO9A 3HO8A 5LGXA 1TTQA 2DJXA 2JKPA 2V5BA 4DO4A 2G96A 4Y90A 3NVTA 1TMHA 3IGUA 4FB7A 4MYXA 3NEVA 4UNLA 2NUWA 2R91A 4MIMA 3LCWA 1TPC1 1S5VA 1JCYA 3M5ZA 4PFMA 4DBDA 4XTDA 5ABTA 3L21A 1JUKA 4Z08A 5G2IA 4NNAA 3R13A 3H54A 3TSMA 1GVOA 4HPXA 1LBFA 3S0CA 1LRTA 1PE1A 3UY8A 2E5DA 1QR7A 5FF7A 3M6YA 3N9RA 4CQ8A 1W5QA 4KKXA 2WQPA 3O15A 2Y7FA 1QOQA 2ATMA 3L5AA 2F84A 3O16A 5G2WA 3LCXA 4A3UA 2PRHA 3KXQA 5G2HA 3LB0A 5K9CA 1LRQA 4FXRA 1LM1A 3TQVA 1B4KA 3E9AA 3W2MA 3F03K 4ZZ9A 2DZWA 1EP1A 5EBUA 2JBMA 4FO4A 5FEZA 2B7NA 3W7MA 2TRSA 1KTNA 4JTLA 3MYPA 4MPQA 3LCGA 2W6RA 4A29A 1P1XA 4QQ3A 3DI1A 3DH7A 4XKYA 2BSLA 5D38A 1U5JA 3BG3A 4O11A 3WK0A 4AF0B 3UXDA 3DHDA 2QF7A 3PUEA 1JRBA 1YXYA 2BTMA 1TYGA 1TPH1 4JXCA 2G97A 2PC4A 4LVAA 2A6LA 4NJIA 4XZ9A 3W84A 3BK0A 4BK9A 3THQA 5AYYA 4MYAA 4KFPA 1JCXA 3TMQA 3NAVA 1TQXA 2VFFA 1H7OA 5KSWA 4AHOA 3MP5A 3GDLA 4X9SA 2DJLA 4ZMGA 4FX6M 3ATYA 4L4LA 4GFSA 4ZL1A 2ZDRA 1OK6A 1VH7A 4PCFA 3W1UA 4HPJA 1XBYA 2AQWA 1LOQA 1HG3A 1T99A 3KVJA 3W2JA 3QW4B 3LHWA 2WV8A 3L65A 1R2RA 2P0OA 3LHVA 4FX8A 1DKWA 5I3HA 2DORA 1H63A 3SR7A 1RVGA 3SZ8A 1W31A 4Z0SA 4WOQA 4Z1AA 4FNUA 1VCFA 4RR4A 2Y62A 3HGJA 4N4QA 2ISVA 1LBMA 5DBUA 4OBTA 1A50A 5DXYA 3W1NA 1F74A 2ABBA 3W7RA 3LLDA 4LVGA 4JDBA 2YYTA 1QPNA 1JULA 1S5TA 2B7PA 1A5CA 5D33A 3HJZA 1XDLA 2ZQ0A 2GVLA 1ME8A 4IXXA 3OVPA 4CCDA 2ZTKA 4QITA 2DZSA 3IEBA 3CC1A 3W87A 4DF1A 2Y7DA 2OMAA 2ZRZA 4IQLA 1A5SA 3FEMA 4K7YA 5DY2A 4CNOA 1O4UA 4DO5A 6ALDA 3HF3A 3EWYA 4OV4A 3PM6A 2I1OA 1BKSA 4UTHA 4JIQA 4KFNA 4RXFA 4RKAA 4O1BA 1X1ZA 3M9YA 2WSYA 1WOBA 3P74A 4I9AA 3STCA 2NX1A 5AC6A 3W1PA 4NX0A 2OX1A 3QW3A 3QM3A 2YX0A 4JTEA 2A6NA 4AXKA 1NVMA 3GNDA 5D09A 1IIGA 2H8XA 4MVAA 3CIXA 3BPWA 4ZQMA 1G4TA 3LHZA 3IVSA 5F4XA 2I9EA 5G4EA 3MYOA 1HUVA 5HR7A 4X2RA 1J5TA 4Z1BA 4N4PA 1DL3A 3ABQA 2DZVA 3P5ZA 3NZ1A 3CEUA 4O0ZA 1UBSA 2WOQA 1P0NA 1VHNA 4CCEA 3NL5A 4NU7A 4MFEA 4HNUA 1KM1A 3U6WA 3NQ6A 5TQLA 2QCGA 5D30A 5D2YA 5BNKA 2Q8ZA 3EWZA 3KX6A 4M7TA 1KLYA 1ZY9A 2JGQA 2F7FA 3Q2DA 4DPPA 1YXDA 3QPYA 3S1WA 1RQHA 1D9EA 1NF0A 4UTLA 1TPFA 4H3DA 1E51A 3W2NA 4AWSA 3TSDA 4JS3A 3BG9A 3UWVA 2YFOA 3FYOA 2VFHA 3P84A 4FEZA 5J5DA 5I3JA 4O16A 3C2EA 2CLKA 3T78A 3U8GA 3DENA 5AN7A 1JUEA 4JX5A 3TX9A 1JCNA 1JCJA 4IMFA 3S1UA 4BWLC 1MZHA 3STGA 2UV8G 3O63A 1EWDA 1QPQA 3SJ3A 4A22A 7TIMA 1QPOA 2PRMA 3C4UA 3OVQA 2D73A 4MZ8A 1PV8A 4WXZA 2Y85A 5EYWA 3MUXA 4CNNA 1YPIA 3WFAA 3EWBX 5KZDA 4O13A 1QMLA 3LOTA 3GIYA 1XDMA 4O8RA 1OK4A 2NLIA 3MO7A 3W73A 2GJNA 1ICQA 3JR2A 5KZEA 1YDOA 4O4WA 5LZLA 3M7WA 2J24A 4KFOA 4IXHA 1W0MA 4AVFA 2C19A 2QJHA 1H7RA 3O05A 3WK3A 1FCUA 2YDAA 3W1XA 3GDKA 2QCDB 3FJ6A 5DELA 4DXVA 3WK2A 4XBSA 5KMYA 2ZA1A 4N9CA 4HKPA 3QF0A 5D32A 4HNTA 3G18A 3N34A 4GBUA 3G0SA 3GXNA 2YW3A 2H6RA 4A2SA 4ZQCA 2J27A 3W70A 4FNQA 3P7YA 3STFA 1DOSA 3ZR4A 3ELFA 1TRDA 3DZ1A 3W7JA 3RFAA 3TV8A 4LVFA 5FF3A 3G1DA 3DGRA 1L2UA 3TROA 5HINA 2E1DA 5FI8A 3VE7A 3L5LA 3VE9A 2QUTA 2FDSA 2X1SA 1EEPA 3O06A 1G4EA 2X30A 3STEA 3BW3A 2J9ZA 3QFEA 4JDYA 3SSJA 1ONRA 3GVGA 8TIMA 1GG0A 4LWWA 2WKJA 3QJAA 2VEMA 4M6PA 1F6KA 5A5WA 5GVJA 4E2DA 1C29A 3LRMA 1JQXA 4LVDA 2WSRA 2CW6A 3W23A 3F4WA 3W85A 4O18A 1DJQA 1VS1A 3PBWA 5C6MA 5C5YA 4IX0A 1FDJA 5CPOA 3CWNA 1PHQA 3L0GA 2YCEA 3TK7A 1T8XA 3RLUA 4DELA 5MHBA 3PBYA 2QAPA 1TPB1 4GUIA 1FUYA 2ZBTA 4MKNA 2Z6IA 4RK8A 2X16A 3NM1A 3TMLA 3YPIA 3UWQA 1V7YA 3SW6A 4NZJA 3T40A 1OFDA 4O19A 4IUOA 3TH6A 4JTKA 1R46A 2P10A 2AGKA 3SECA 4LW7A 1Q6OA 1M5WA 4JTJA 4MFDA 2QUVA 1NAL1 5D2WA 1RD5A 1AL7A 2JGYA 3QPZA 1FXQA 5DY3A 1X1OA 4GRSA 4TMCA 3GDTA 1MEWA 1THFD 5CG7A 3SIZA 4KWWA 4JYFA 2ZZ2A 4LV4A 1GVRA 1L6WA 4NUWA 4JX6A 1YTKA 3EB2A 1KBIA 2C1HA 1XCFA 2DP3A 2EPHA 2NV2A 2NXIA 3CPRA 1KM3A 4S1FA 1GPWA 2PE4A 3HPZA 3UPWA 1UCWA 4BWLA 2VFDA 5I3FA 4Z1CA 1H61A 1LTDA 3NO5A 1TPUA 1EX5A 4OT7A 1GTEA 1FDYA 4MY8A 3BGGA 2V81A 3E49A 1SW7A 1A53A 2X2GA 5HJLA 4LC8A 1H62A 4O1AA 4O17A 3GX9A 5LNSA 3SGUA 2H3BA 1F6PA 3C8FA 3N3MA 3NNTA 3GKAA 2HSAA 1W56A 1T0OA 1SZFA 1C8VA 3HGRA 1FQ0A 1XC4A 4GNJA 3C2OA 4AEOA 1O94A 1F5ZA 3W72A 2VEPA 3W1QA 1WQ5A 4JTSA 3S5NA 3W1LA 3A5FA 5F2MA 2GVGA 3NR0A 4XQ6A 1XBVA 1G7UA 2Y70A 2GPTA 5E0KA 1QPRA 1B4EA 2HS8A 1KFKA 3NQ7A 4N9DA 1KM0A 2X1TA 3TA6A 4LUJA 4HHPA 1CW2A 3OVRA 3BVJA 1K8XA 3PBUA 2R8WA 2QCNA 1TTJA 5LNWA 1JVNA 4P2VA 2Y7GA 5CPMA 1FCBA 3TCEA 1O5KA 4UTKA 2OJPA 3EWWA 4RX0A 1OFOA 4AAJA 2RH9A 3P8IA 1B57A 3BARA 4LV9A 4R34A 4DF2A 3P67A 4OQVA 1R2SA 1YTEA 5EKYA 3M5XA 1RZMA 2G5WA 3FS2A 1UUOA 3VCRA 1VCVA 1SW3A 1IXNA 3PBVA 3S5ZA 1TJRA 2Y61A 3NL6A 1G6CA 3G1VA 2WNZA 1FBAA 1OFRA 4K8EA 3I7RA 5H91A 1TPWA 2YYUA 3G1YA 3RLVA 4MY1A 1SO3A 3AO0A 1KFBA 4DF0A 3LGEA 3OG3A 4LS1A 1UASA 4O15A 1W37A 1N8FA 2YR1A 3NZRA 1QO2A 4Z0JA 3A24A 4BFAA 4ICNA 1Z42A 2ZYFA 5T26A 2B0MA 2QJIA 5D2VA 3LCHA 3L2IA 4M5PA 5HWNA 5FEPA 1W3NA 1WYIA 3B4UA 3KVLA 4O0KA 1SR9A 2A0NA 3BLIA 4JN6A 3BLEA 5LNUA 3W6YA 3W74A 3L0NA 4IX2A 3EX2A 4UTWA 2ZRVA 1GVQA 1SUXA 3M16A 4IMEA 1P4CA 3LXAA 1OFBA 4NJKA 1Q6LA 3EX6A 4O53A 1DQXA 3P60A 2E09A 3M47A 4K37A 4LRSA 2NV1A 3WK1A 1F73A 3UQNA 2GVJA 3ZWTA 3RU6A 4PEKA 3GR8A 1I2PA 2H3DA 3C2VA 1SO5A 1Q6RA 4AF0A 5AB3A 5EPDA 3MI6A 1TJPA 3TUUA 1HFBA 1LROA 3G3DA 3A22A 1G4SA 4ZQOA 3DFQA 1XM3A 3HGOA 3TQKA 3F4NA 1DBTA 3C2RA 3S9YA 1TSIA 3Q58A 5AHEA 4LS0A 3QSRA 3NQVA 3QMRA 5F1UA 3L66A 2OZ0A 2ABAA 4OGZA 3TC6A 2TPSA 4LNYA 4AMAA 4EIVA 3GDRA 1LBLA 4JICA 3W7NA 5DCEA 2XN1A 1G4PA 2J9XA 4HNNA 1K7XA 2I14A 2QAFA 3P61A 5HR6A 3B0PA 3S1VA 2ZRXA 3W7IA 2ZZ3A 2C3ZA 2BXVA 2TMDA 1VLWA 1W1ZA 2ZZ4A 3S6DA 4S2BA 1TPEA 1VJIA 5F2IA 5CZJA 3T7VA 4LT9A 5AYXA 2GQ9A 1I8JA 3MP4A 2CLLA 3UWWA 2FB2A 4AHPA 1ME7A 4IMDA 5HUPA 2NUXA 1G7VA 5C55A 4N9BA 5G1YA 3C61A 2ZZ1A 2WJZA 3TIMA 5E1QA 5BMXA 3MI2A 1L6YA 3PSVA 3C52A 3S1XA 2C14A 4R33A 1SQ7A 3G1AA 2YW4A 3NPUA 4MOZA 1OF6A 3C0JA 1RR2A 3TJXA 4RXGA 4E2BA 1F2JA 5IBXA 2Y88A 3PAJA 5D03A 1VYRA 3W76A 4JTUA 3CTLA 4K38A 1K02A 1EP3A 2FB3A 1GVSA 2V2CA 2CZDA 4O10A 1XI3A 4FNRA 1H7XA 3NL3A 1ICPA 1VR6A 3M41A 1OFEA 1OG0A 4UUIA 5FESA 2HTMA 4ZQPA 3G24A 2NX9A 2ISWA 1PVNA 2Q8LA 1LYXA 2CLEA 2QKFA 2NWSA 4JNMA 3NQ2A 2E6AA 5LNRA 3CHVA 2A5HA 1D3HA 4LC6A 2R94A 3FA5A 3G3MA 5C54A 3NQAA 4NNCA 3TXVA 3W7EA 4GE8A 4FHAA 3HG2A 3DFNA 3UD6A 5F2GA 4POCA 2Z6JA 3IIVA 5D04C 5HUOA 2DZUA 2CLIA 1OYAA 3IVUA 4FIRA 4WZHA 4EF8A 3TAKA 2WSQA 2NZLA 1S5WA 3W2LA 2BZNA 2YPIA 3IGXA 1EUNA 4DPQA 2QR6A 2QUUA 2FIQA 2ZA3A 2VELA 1R30A 1FWTA 4NT0A 3UPBA 2FLIA 3HGSA 2NX3A 4TO8A 3VI2A 3L9CA 1CI1A 1J2WA 1DQWA 1JJKA 1FY6A 5F4SA 3O6DA 3M0ZA 4DEFA 1OX5A 3TAOA 3H53A 4Y6GA 4A21A 3I6RA 5FF4A 5G1TA 3OEXA 1QWGA 4AB4A 4K39A 4CQAA 3TJLA 3A9IA 1EUAA 1BTMA 4L4MA 4JY8A 4JEQA 1FWNA 3GZ3A 4IWWA 5TBOA 3PB2A 1HO1A 5KZMA 3WJXA 5CSRA 4C1KA 1GTHA 2C13A 4D2JA 1OVDA 5CKSA 3UZ5A 3IIXA 3OHIA 4OE7A 4ALDA 5C2XA 5BOOA 2Z0IA 1XBZA 1LZOA 1SZNA 1Q3NA 1LOLA 1FDZA 3FYPA 4UC5A 3KRSA 1M7OA 1O5XA 4I7UA 1JCMP 4H4IA 1LLZA 3MBFA 1W5MA 4UMAA 3W75A 3L5MA 1EIXA 1P0KA 2H90A 2QCDA 4UFHA 3TDFA 5HNRA 4MJZA 2NWRA 4WY0F 1VYPX 4U28A 4CCCA 1FXPA 4LVBA 5LKYA 1JRCA 2FPTA 3U2OA 3M5YA 1W3IA 4O57A 4EOUA 2QEZA 2ATSA 2EKCA 4YXGA 1YDVA 3CIWA 3E96A 3MHFA 3UZJA 1W5OA 1LORA 1IF2A 1ZENA 2V9DA 4K8HA 2ZZ6A 4YLWA 1PCWA 2BWGA 3DFTA 3HG5A 4NQ1A 3DFPA 5CZ0A 6TIMA 3NPXA 5HWJA 3LX9A 4WY0A 5AYZA 1AW5A 2H8ZA 2X1RA 1YTDA 4J9JA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2WPB A;  4YHG A;  1W5P A;  3VGH A;  1XIE A;  4UMB A;  5LSM A;  4FNP A;  5AVN A;  2PDG A;  1K3U A;  4ONV A;  3H4W A;  1QDS A;  3KCL A;  1JUB A;  4CQ9 A;  4F0S A;  2RDT A;  4HCH A;  1YPX A;  4NZ4 A;  3OA5 A;  2AQV A;  2G96 A;  3NJ3 A;  4FB7 A;  5M2F X;  5DAN A;  2R91 A;  4Q4R A;  4QXI A;  4FP1 A;  1TUF A;  1WXY A;  4HZ6 A;  2CZV A;  3VD9 A;  1F6Y A;  3GNO A;  1KNW A;  3QHO A;  3FAX A;  3UJF A;  1RUS A;  3H54 A;  3VOC A;  2EKG A;  3KOZ A;  2H9A B;  3S0C A;  3EA1 A;  3P14 A;  1H5V A;  2GDQ A;  3ARY A;  2WQP A;  2Y7F A;  1OC5 A;  1SMA A;  3L5A A;  4QBX A;  5G2W A;  4A3U A;  3KXQ A;  3OW1 A;  5G2H A;  1XH1 A;  1JIB A;  3IUH A;  1GVE A;  3E9A A;  3W2M A;  3VM7 A;  1ADD A;  1EP1 A;  2KX9 A;  2JBM A;  3LSC A;  4FO4 A;  4H41 A;  1ISW A;  2TRS A;  4PMQ A;  1H49 A;  4HA1 A;  4IQD A;  4JTL A;  5BU9 A;  1F8M A;  2IXV A;  3IAQ A;  1E6N A;  3VFC A;  2BDQ A;  3MMD A;  1YXY A;  4GPN A;  4H9V A;  1N8W A;  3TLL A;  4AFY A;  1UD2 A;  3KBW A;  3TR9 A;  2D0F A;  3BK0 A;  3NAV A;  1TQX A;  3ZT5 A;  2FVM A;  2VZV A; 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 4X2R A;  1TMQ A;  4FOJ A;  4AZI A;  1C93 A;  4PFH A;  3ZJ7 A;  3CEU A;  1P0N A;  3N04 A;  4LEF A;  4MWA B;  2BOD X;  5D2Y A;  3SQS A;  3VIO A;  1KLY A;  3LYE A;  4OOZ A;  3A3W A;  7XIM A;  3EDF A;  4AST A;  3W2N A;  4S39 A;  2BG5 A;  1VJZ A;  2VFH A;  4XAG A;  4Z2G A;  1VB9 A;  2V3D A;  5J5D A;  3VZY A;  5I3J A;  1BYA A;  4DXX A;  3C2E A;  1E6S M;  3U8G A;  1QT1 A;  3URQ A;  1XQK A;  4RE2 A;  1A5L C;  2O9O A;  1JCJ A;  4BWL C;  3S1U A;  1MZH A;  1EWD A;  1W9D M;  2I17 A;  1QPQ A;  4J35 A;  3SJ3 A;  2WXD M;  4S3D A;  3ITC A;  4JKK A;  2D73 A;  4MZ8 A;  2Y85 A;  4CNN A;  3BJS A;  3RR4 A;  5IXE A;  4O13 A;  1QML A;  1XDM A;  3GIY A;  3EMQ A;  1OK4 A;  3W73 A;  2IUZ A;  1DWF M;  1ICQ A;  1DJI A;  2R1M A;  3FA4 A;  1PKY A;  3RJX A;  1A0E A;  5TAO A;  2J24 A;  1UD5 A;  1W0M A;  2C19 A;  3C5Q A;  1PTA A;  4ZOC A;  1Q5M A;  1NFG A;  3WDJ A;  1NDV A;  4JIE A;  1ZBV A;  1WE5 A;  2PDN A;  4U5K A;  7ODC A;  5KMY A;  2ZA1 A;  4HU4 A;  4C1N A;  4HNT A;  2AKM A;  2XYL A;  3G0S A;  3IAR A;  1YRR A;  5BOE A; 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