1EPXA

Crystal structure analysis of aldolase from l. mexicana
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
357
structure length
357
Chain Sequence
MSRVTVLQSQLPAYNRLKTPYESELIATVKKLTTPGKGLLAADESIGSCTKRFQPIGLSNTEEHRRQYRALMLEAEGFEQYISGVILHDETVGQKASNGQTFPEYLTARGVVPGIKTDMGLCPLLEGAEGEQMTEGLDGYVKRASAYYKKGCRFCKWRNVYKIQNGTVSESAVRFNAETLARYAILSQMSGLVPIVEPEVMIDGKHDIDTCQRVSEHVWREVVAALQRHGVIWEGCLLKPNMVVPGAESGKTAAPEQVAHYTVMTLARTMPAMLPGVMFLSGGLSEVQASEYLNAINNSPLPRPYFLSFSYARALQSSALKAWGGKESGLAAGRRAFLHRARMNSMAQLGKYKRSDD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
source organism Leishmania mexicana
publication title Structures of type 2 peroxisomal targeting signals in two trypanosomatid aldolases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE
total genus 144
structure length 357
sequence length 357
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2000-03-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1epxA00
4MZYA 2E6FA 3M0ZA 1M5WA 1GVRA 3NAVA 1AK5A 5HNRA 1SFLA 3EX4A 1XBYA 1IXQA 2QEZA 3QRHA 1W5PA 5G1TA 1THFD 5LNVA 2DZWA 3ZFHA 1W5MA 3PB0A 1V7YA 2QCGA 4QM1A 3EWUA 3QM3A 4LV9A 6ALDA 1Y0EA 3HG4A 2B0MA 4O11A 3GDMA 1VHCA 1XUZA 3HGSA 4LV4A 2Q8LA 1SZNA 3C61A 1ZAHA 5IM51 3BW2A 3UZJA 2HS8A 3W84A 4A3UA 3NQ7A 1J5TA 4GBUA 4O0KA 5D33A 4FHAA 3KRUA 2ZZ7A 1A5AA 3OEXA 4O28A 5C54A 1D9EA 1W5NA 2A7NA 1KBIA 2DP3A 3HG3A 1VRDA 2TMDA 1XUUA 4UTTA 1EP3A 5K9XA 1OX5A 2YDAA 1D3HA 5HINA 1SW3A 5HUOA 1L6SA 4I7UA 4Z1AA 4UTKA 4RX0A 1KM0A 1ZCOA 3VI2A 1UUOA 1S5WA 2Z6JA 3TE9A 1PHWA 3NO5A 1FDYA 1KFJA 4I7WA 4BWLA 1G4TA 3TCEA 3S5YA 1KM3A 3UWQA 1YTKA 3BGGA 5KZEA 4MOZA 5TBOA 4DQWA 3DU0A 3M6YA 4BF9A 2OJPA 4N02A 4CNPA 3W2MA 3RNDA 3WK2A 1R2SA 1QO5A 1YDVA 4UTJA 1RQHA 4L4LA 1DKWA 3LLDA 2DZUA 3P5YA 4WY0F 4CQ8A 3NQEA 4O10A 3BO9A 3BG9A 3RMJA 3LCWA 2V5BA 1I4NA 5AN7A 4HN4A 2YYUA 3DKJA 2WSRA 1TPDA 3P8JA 3MWAA 3N2MA 4RV8A 2E5BA 1KM4A 1SO6A 3I7SA 1OABA 3WJXA 2PURA 3QSTA 3R13A 3DFOA 2JGQA 3LCFA 1GQNA 4JTTA 3MHUA 4MY8A 3A24A 2AAMA 3FKKA 1GVSA 4YCPA 5F1UA 2V0TA 4UFKA 3TA6A 4GUFA 2ZRVA 1K03A 4JTFA 2NX3A 3QH2A 4WJEA 2ZFAA 3B06A 4CCDA 4NUWA 3GYEA 3PAJA 4YMZA 1QPOA 1R47A 3B05A 5KZMA 1TREA 1LRQA 3CTLA 5F1VA 1PHQA 3LM7A 5G2HA 4HNVA 4Y96A 2ISVA 1XI3A 5K7JA 2OCZA 5CPLA 5DN1A 3SSJA 3IVUA 3CB8A 3O06A 4DO5A 1JUKA 1VQTA 5T26A 4JTLA 1FCQA 2ZQ0A 1TSIA 1KLZA 3JR2A 3ABRA 3MHFA 3VFLA 4N6EA 1OX4B 1SO4A 3W1RA 4UR7A 1O4UA 3JRKA 2TPSA 4WD0A 1GTEA 1UUMA 3P67A 3W07A 3ZWTA 1KTBA 3L67A 4OBTA 2GJNA 2H90A 4JYEA 3W7NA 1T96A 5G5IA 4QIUA 1VH7A 5IBXC 4R34A 1CW2A 3T78A 2YYTA 1GWJA 3WK0A 3F4WA 3DFPA 1X7FA 1HTIA 4HNTA 3GAKA 1ALDA 4DF0A 4ZZ9A 1NEYA 4J9JA 2RDWA 2ZZ6A 3TK7A 2A21A 1BTMA 3MUXA 2BWGA 2VEMA 3CWNA 3NL2A 2EKCA 1G4EA 4KFOA 1X8FA 4P61A 4XTDA 2X2GA 1XXXA 1SZFA 5DXXA 2NUWA 1DOSA 4ONVA 3NZRA 1YXYA 5LGXA 3TNOA 4HNUA 3UNDA 1Z41A 1SFJA 5LKYA 3BW4A 3GDLA 1DBTA 1QPNA 4Z08A 1NFBA 1O60A 3CEPA 5E0KA 3ELFA 2VOMA 2EAWA 2Y61A 4E38A 3MMTA 3USBA 3LB0A 3LCHA 2Q8ZA 2DZSA 3QEZA 3QQ0A 4PC8A 5C2XA 1EA0A 2CW6A 4MFDA 2VC6A 4NXKA 1LBMA 3G3DA 3S42A 2Q3RA 1QAPA 3TU9A 1PCWA 2WQPA 5I3FA 2ZZ1A 1B4KA 3K30A 5K4ZA 4JTKA 3UPBA 3VKJA 3B8DA 4RKAA 1QCWA 1OK4A 1LLZA 1PL9A 3KVLA 3I6RA 3C4UA 4MKNA 1XFBA 3TQVA 1YYAA 2TYSA 4HSOA 3OVQA 1JULA 2WKJA 2QCEA 3W1TA 4XBKA 4LUJA 1DL3A 4N4QA 1DQXA 2CZFA 3PSVA 3EKLA 1YDNA 3CT7A 1H50A 1SW7A 3E12A 3UZ5A 4DBEA 1UB3A 3BV4A 4NQ1A 4N9EA 3LOTA 5K2ZA 1O5KA 5CGQA 3SGZA 1M6JA 1W37A 4LTSA 1ICQA 3OHIA 2NX1A 3W7QA 5AC7A 3P82A 1LBLA 1K7EA 1Q6QA 4EVZA 3KRZA 2CLHA 1PVNA 1RQBA 2ALDA 1I2NA 1DV7A 2A6LA 4IQLA 1ZAJA 3TIMA 3I65A 2WPBA 2EGZA 5E93A 2P10A 1MEIA 1C8VA 1SW0A 4ZQPA 1VS1A 2VFDA 2CZEA 5D37A 1GG0A 2DZVA 2FJKA 1JQXA 1VYRA 4FNQA 5F2GA 2QCDA 3ANYA 3G0UA 2WSQA 3TW6A 3S9YA 2Y63A 2NUYA 1PCKA 2E6DA 1ZALA 4FX6M 3W7LA 2RDTA 1W56A 1TYGA 4FIQA 3IEBA 2P0OA 2B4GA 3CIWA 3G8EA 2JBMA 2E77A 4DXVA 3FIGA 2ISWA 2G97A 1SZEA 4K37A 1RV8A 1RPXA 3W7DA 1G69A 3N73A 4X3ZA 4GRSA 2B7PA 4FNRA 1EEPA 1EPXA 3N19B 1WQ5A 2X16A 4OQVA 3PF3A 4QNWA 2VENA 2PRMA 2E68A 2C16A 1XDMA 2C19A 4N6FA 4DELA 3L0GA 1P0KA 3DHDA 4Y8FA 2DZPA 3MBDA 3OVPA 4NVTA 3SGUA 2DZTA 5K3VA 4LRTA 3KVJA 1XBVA 5I3HA 1W3TA 2FPYA 3G3MA 2FFCA 1FWNA 1I8JA 3NQGA 3C2FA 4I7VA 4CCCA 3TSDA 1TTJA 2OT0A 3O15A 1GG1A 1IIHA 5F2LA 1YTDA 3E49A 2IQTA 4IPIA 4MYXA 4K8HA 5AYXA 2CLEA 3IGXA 4ADTA 2Y88A 3L66A 4UTUA 4ZQNA 4ADSA 3LI0A 4CQAA 4MY9A 4N2YA 4N4PA 1FXPA 4MZ8A 4LC6A 2TRSA 4DO6A 1VCFA 2J9ZA 2FTPA 4UTIA 1UCWA 2QUTA 3NGJA 1VPXA 4MLRA 1TV8A 3STEA 3S8HA 3IIXA 3E96A 4UFHA 2JGYA 1AL8A 3O6DA 3DI1A 4M7SA 1E51A 4AVFA 2X1TA 3R2GA 1LOSA 1OF8A 4EF9A 1KLYA 4L4MA 2V81A 2I14A 3ABQA 3G0XA 3M44A 3HGRA 4JX6A 4M6PA 1LROA 4Z0JA 4LVGA 3SZ8A 3HPSA 1DHPA 3DI0A 5BOOA 4JDBA 2R94A 2DU2A 4G1KA 4O54A 4AHOA 3UWVA 3W74A 2PRHA 1L6WA 5AOUA 3W22A 2HMCA 3G0SA 3CHVA 3EKZA 4RK8A 4QITA 3EX1A 2YFNA 3TUUA 1ZHAA 4WXZA 2VFIA 3SJ3A 4MLJA 5FF7A 5FF0A 4JN6A 4S2CA 4ZVJA 3BLIA 3NYZA 4AHQA 3MI2A 1HG3A 4NJIA 3LX9A 2GQ9A 5F2IA 3ATYA 4UTMA 3GLCA 4K38A 3PUEA 4M5PA 5D2TA 3M5YA 5CG7A 4HSNA 1VCVA 4K7YA 3LCXA 4Z1BA 2ABBA 5IBXA 4KWVA 2QKFA 1BWKA 1EP2A 4IX0A 5FEWA 1U5JA 3P84A 1AL7A 3LBCA 3R12A 3DHFA 2ZRWA 2A7RA 1JCYA 1Z48A 2QR6A 4QNEA 2QJIA 3QPYA 4FXSA 1OVDA 1ZJIA 3FYPA 1GTHA 5FF3A 5GVJA 3OG3A 2V9DA 1TPVA 3G1SA 5BNKA 3STGA 5CPOA 4U28A 3EWZA 3SR7A 3EEGA 4RR4A 3PSWA 2NX9A 2ZCGA 4YLWA 3GVGA 3W1MA 3JS3A 4NNAA 3HBLA 1IGSA 1KA9F 4GWEA 3M5ZA 4KFPA 1OYCA 1NSJA 2JKAA 1X1OA 1JJKA 5BRBA 2VFEA 4JTSA 1OFEA 4JY9A 4FXRA 2VFGA 4K6AA 1NAL1 3O63A 4OV9A 2FPTA 4JTHA 4LS2A 1C29A 1W54A 3EB2A 4IMDA 3W76A 3A5FA 4JIQA 4MY1A 1L6YA 3SI9A 3FLUA 3W7EA 1OFQA 1S3HA 4W9TA 1ML1A 4IOTA 3KRSA 3L5MA 4O1DA 4UXDA 5C6MA 1QNVA 4AXKA 3UQNA 4LNYA 2R8WA 3WJSA 4HIBA 3Q37A 3O6CA 4UFLA 1TB3A 3W88A 3P7YA 1T0OA 1FDJA 2VKZG 4RZ4A 3G24A 2YR1A 1TPUA 1IXOA 1A50A 1OFPA 4NNCA 1FWSA 1JQVA 3CLMA 4LT9A 3UD6A 1OJXA 1XKYA 2YW4A 3I68A 4WXYA 4UUIA 3WJZA 1WV2A 1EUNA 2HS6A 3G1HA 5AHLA 4DPQA 3QSRA 3UPWA 3W73A 4OGZA 5HQEA 4XUGA 4MUZA 3VNDA 3TV8A 1N8FA 1HO1A 1TPFA 3CM4A 4PA8A 2GQ8A 5F4SA 1EB3A 4UFIA 3PG9A 1VLIA 1YXCA 3N14A 3M7WA 2WJZA 3UY7A 2DJXA 2E09A 4JYDA 2NV1A 3P60A 1Q45A 2A5HA 2YCEA 1LLWA 2E6YA 1AW5A 5KTLA 3G1FA 3L21A 3LDVA 1SSGA 4PTNA 1ZFJA 3QFEA 3ABSA 1KFLA 2ZRZA 4IGHA 2Q3OA 1JVNA 2YX0A 4PFMA 4R33A 5EKYA 3Q58A 5D09A 4JTEA 5AC8A 4JTJA 3GK0A 2WNNA 4K36A 4OWGA 3NQDA 2X1UA 1SR9A 4GNJA 3HG5A 2ZYFA 1F05A 3L68A 2V2HA 1QOPA 3KFTA 5DY2A 2QCDB 1IIGA 2DZXA 3B03A 8TIMA 3O8AA 5EYWA 3GXPA 3TJLA 3ABOA 4H3DA 2RKXA 1PS9A 2OZ0A 1TPH1 2DORA 2NZLA 3GB6A 3NVTA 1W5OA 4TR9A 5LSMA 1KFKA 2B7OA 5G2WA 3HF3A 4EOUA 1EWEA 1FCBA 3W2NA 3M43A 4ZQRA 4RCXA 5U4NA 4O1CA 4O8RA 3HB9A 3VE9A 5I3KA 5HR7A 1B9BA 3DBPA 4PCFA 4O14A 5H2ZA 2GVGA 4JGDA 5DY3A 3SFKA 3N3MA 1DVJA 3GNDA 1B3OA 4MJMA 4MYAA 4Z0SA 4JD4A 2ZTKA 3W2UA 4H4IA 2C6QA 3C2RA 3O6YX 4A2RA 3M41A 3FFSA 3DZ1A 1KM5A 3NQ6A 1ONRA 2PCQA 1I2OA 3RLVA 1TPC1 1MEWA 2H8ZA 3BK0A 3CU2A 1YLVA 1KBJA 1OFAA 3G1XA 3EWBX 3NQ2A 5FI8A 1CX9A 3GXTA 1BWLA 4GUJA 3ZR4A 3UXAA 2FQIA 2LLEA 2X30A 4ML9A 2A2IA 3P74A 1TPWA 1ZAIA 1QWGA 5A8GA 2WO5A 5F4XA 2B7NA 2I9EA 2KZHA 2YFOA 4N9BA 2EPHA 3CQ0A 3W1QA 1R2TA 2H3DA 3P61A 4YWIA 1TO3A 5FF2A 5DBTA 1A5BA 3UXDA 2WSYA 5U7SA 3S1XA 1V5XA 4O52A 3HG2A 4LS1A 1F6PA 4WOZA 3IGUA 1OHLA 4IMGA 1HUVA 1RVGA 2P1FA 2AQWA 2A6NA 1O5XA 3LTYA 3G18A 1H1YA 3PS7A 5EPDA 1FQ0A 2Y85A 2O7SA 3GZ3A 5BMWA 3AJXA 3W75A 5C5YA 1I2PA 3LXBA 2XFWA 3P80A 4HPXA 2J27A 3M5VA 2GOUA 3P8IA 4UNLA 4FB7A 4AAJA 3FJLA 3NDOA 3W1NA 3B04A 1DQWA 3HGJA 3BW3A 1A53A 2FB2A 3PBUA 4DO4A 3GKFA 4CNNA 5TQLA 4O12A 4UC5A 1H7XA 1CI1A 1VC4A 3W7IA 3W85A 3C2VA 3L5LA 4Z1DA 4ICNA 1OFRA 3M16A 1ICSA 3LHTA 4FNPA 2HTMA 1AW2A 2QCLA 4TX9A 1O94A 5AHMA 3OVRA 4FO4A 1PIIA 2JKEA 2J88A 1VR6A 5D04C 1WBHA 3FS2A 1FBAA 5DELA 2G5WA 3D0CA 3HO8A 4Y90A 1TTIA 5D32A 5EMUA 1ICPA 3TKFA 3W87A 1WYIA 3A9IA 4FNSA 5CZTA 4M7TA 5AHEA 3EX3A 2QAFA 3W6YA 3ATZA 1QO2A 4S2BA 5G4WA 3TAKA 2C13A 2TSYA 3U8GA 2Y62A 4K8EA 5CZSA 1FWWA 5KZDA 2FIQA 4N9DA 3LV6A 4QJ1A 4B5NA 1ZNNA 3PY2A 3BLEA 2Z2UA 4UCGA 2Z6IA 3NEVA 1OFDA 4BI7A 2QUVA 1H7RA 4Y6GA 4LW7A 4TMBA 4LVAA 3ZWSA 5HULA 2JKPA 4GXMA 4IPJA 1B57A 1K7FA 4K39A 1OG0A 4AWUA 4O4WA 1I45A 2YW3A 3W83A 5HWMA 1F74A 4AB4A 3NQ8A 1XBZA 3OBKA 5L6UA 1G7VA 1H1ZA 2H3BA 5D2XA 3W86A 3TR2A 1BKSA 3A5VA 3W70A 2EF9A 4NJGA 5FESA 1FDZA 3TMLA 3PR2A 5I3IA 2A85A 3T7VA 3AO0A 3WK3A 1A5CA 3QMTA 3QW4B 3W72A 5KMYA 1ZY9A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4TOQ A;  1CEC A;  1DJY A;  5I3D A;  3ABS A;  1KFL A;  2Q3O A;  4PMN A;  4MWA D;  5DAN A;  1PZ0 A;  3GK0 A;  3I3E A;  4OWG A;  3ZSS A;  2PDL A;  3B97 A;  1DXE A;  1TWD A;  2NQL A;  3F2B A;  1V03 A;  3KFT A;  4EXA A;  3VIN A;  1BF6 A;  4D8Z A;  3GXP A;  3VKK A;  2NZL A;  4TR9 A;  4HQV A;  3EA1 A;  2ACS A;  5G2W A;  5FJU A;  3W2N A;  1VBU A;  4RCX A;  5HK4 A;  1JXK A;  4DYK A;  4GME A;  2OZT A;  3LU2 A;  3WX7 A;  4Y9O A;  3LSB A;  2DFA A;  2IKG A;  3COT A;  4O14 A;  5H2Z A;  3SCO A;  1TV2 A;  3KP1 A;  3L4V A;  3N3M A;  3UG5 A;  3GND A;  4LSB A;  2OG9 A;  4MYA A;  2VZV A;  3K4A A;  4JN8 A;  3GTH A;  3O6Y X;  4IFO A;  2IPW A;  3LMY A;  3FFS A;  4MM1 A;  3DZ1 A;  1KM5 A;  5CCZ A;  4CCZ A;  1ONR A;  2PCQ A;  1I2O A;  3RLV A;  1J10 A;  1TPC 1;  1O5Q A;  1MEW A;  3BK0 A;  2VEF A;  1YLV A;  1KBJ A;  2QV5 A;  3S5S A;  2O4Q A;  4K3Z A;  5EFF A;  3R11 A;  1SM9 A;  4PMZ A;  3JU2 A;  1S2W A;  2VR2 A;  4S3D A;  1JYX A;  4YVV A;  1QT1 A;  3UXA A;  2X30 A;  3KOX A;  4ML9 A;  3FV9 A;  3WMB A;  2XUC A;  1QWG A; 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