1EPXA

Crystal structure analysis of aldolase from l. mexicana
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
357
structure length
357
Chain Sequence
MSRVTVLQSQLPAYNRLKTPYESELIATVKKLTTPGKGLLAADESIGSCTKRFQPIGLSNTEEHRRQYRALMLEAEGFEQYISGVILHDETVGQKASNGQTFPEYLTARGVVPGIKTDMGLCPLLEGAEGEQMTEGLDGYVKRASAYYKKGCRFCKWRNVYKIQNGTVSESAVRFNAETLARYAILSQMSGLVPIVEPEVMIDGKHDIDTCQRVSEHVWREVVAALQRHGVIWEGCLLKPNMVVPGAESGKTAAPEQVAHYTVMTLARTMPAMLPGVMFLSGGLSEVQASEYLNAINNSPLPRPYFLSFSYARALQSSALKAWGGKESGLAAGRRAFLHRARMNSMAQLGKYKRSDD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of type 2 peroxisomal targeting signals in two trypanosomatid aldolases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE
molecule tags Lyase
source organism Leishmania mexicana
total genus 144
structure length 357
sequence length 357
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2000-03-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1epxA00
1ME9A 2H8XA 4RZ4A 3SY5A 4UMBA 3G1FA 4NZJA 5I3GA 1VLIA 1VZWA 3W1XA 3BGGA 3IIVA 4UMAA 4WXZA 4DBEA 4OWGA 2YSWA 3STEA 4ORMA 1WAUA 1EUAA 2ZBTA 4MJZA 1G4SA 1QOQA 1H1ZA 1OFDA 2PCQA 4DF2A 3B03A 4UFIA 1OX6A 3TDFA 3S1VA 5KZDA 2OZ0A 2QJHA 1QDSA 4LTSA 4WY0A 1QPNA 4QISA 2Y6ZA 3Q94A 1GYNA 1U83A 1RQHA 3KVKA 2RFGA 3W7QA 1KLYA 3G1HA 3TSBA 1KLZA 1VH7A 3PSVA 3DKLA 2G97A 4DELA 3O06A 1K7XA 4LNYA 4N4QA 5HQEA 1VLWA 5TBOA 4HNVA 2BXVA 1FCVA 4IUOA 3DHDA 4FHAA 1GTEA 3FKRA 4QQ3A 2ZRXA 4IX0A 2FIQA 1H61A 2E6AA 3W72A 1I8JA 3LGEA 3FA5A 3GDTA 4Z08A 4BI6A 2ZRWA 1KTNA 3CTLA 3UZ5A 5FI8A 3HPXA 1AW2A 3W2JA 3DBPA 1F2JA 3GYEA 1FQ0A 3DENA 3TXZA 3L21A 1X6UA 1DOSA 5EPDA 4PL2A 1H7OA 4FIQA 5LNRA 2DJLA 2QCFA 3ABOA 3WJYA 4PA8A 4I9AA 1Q6RA 2YW3A 1OK4A 2WQPA 3W07A 3C4UA 3MHUA 5FF7A 1LORA 2C13A 4BR1A 1MEWA 3Q37A 4XKYA 1W1ZA 1G7VA 1EWEA 1FX6A 5D32A 5DELA 4IMCA 4IQLA 4ZQRA 2Q3OA 1OK6A 4UC5A 4JTFA 2HS8A 4LY8A 3IIOA 3EXSA 1OX4A 5CPNA 3W7KA 3TQ0A 3CIWA 3VCRA 4MLRA 1A5CA 1M7OA 3DFNA 4S2CA 4BWLC 2DZWA 2YFOA 5A8GA 1NEYA 1GVOA 2QUUA 3ZS4A 3S0CA 4LVAA 1YDNA 5AFDA 2CLEA 3HO8A 4I7VA 1JRCA 4H3DA 3TQKA 1MEHA 1YPFA 4AWSA 2YYTA 1QFEA 2YDAA 1IXQA 2BLEA 4NNCA 2HTMA 3QSTA 3LOTA 4M6VA 3DAQA 4UTWA 1HFBA 3NPWA 3NA8A 3QQ0A 1WBJA 3GZ3A 1RQBA 3SW6A 3HB9A 4WY0F 3TSDA 1G6CA 2QEZA 4JICA 1AL7A 1KFCA 3FKKA 5BW6A 4KWVA 2GQ8A 4EF8A 1HL2A 1VCVA 4JTIA 3O63A 5LNSA 2RKXA 4AXKA 1AW5A 3DFQA 5AB3A 2QCHA 2WJZA 3PAJA 1LBFA 5CKSA 1IF2A 1ALDA 5D30A 4K6AA 3TW7A 4JIQA 2J88A 4KWWA 3S1WA 1PCKA 4ICNA 2A7NA 4LS0A 5K9CA 2DORA 4XQ6A 3RMJA 1LRQA 3L0GA 3TV8A 2C0AA 1P0KA 5EMUA 1XL9A 3QYQA 1DJQA 3QF0A 2QAPA 3GK0A 1FWSA 5AHLA 4JX6A 4RX0A 3W23A 3KRUA 1WOBA 3BO9A 2ALDA 4K39A 2ABAA 4E2BA 1LCOA 3TAKA 1OYAA 1VJIA 3B0PA 3TR2A 4CQAA 2VEMA 3THQA 1OFRA 1SU5A 1H7WA 1RD5A 3FOKA 2ZA2A 4Z0JA 2NXHA 5AHIA 2QDGA 1LOSA 4RXFA 2I14A 3QM3A 1VQTA 5E1QA 3V1PA 1KBIA 2QJGA 2FB2A 3GDKA 5IBXA 3OEXA 3L5LA 2FPYA 1GVSA 3LM7A 3M5YA 5I3JA 1KM6A 3BLEA 4JIPA 4RZ5A 8TIMA 3ABRA 4O0KA 1R47A 2F7FA 4HNTA 5AHEA 2FQIA 3M43A 3MJYA 3P74A 1TPDA 4JD4A 5F2GA 4UMCA 3FJ6A 3DI1A 3UQNA 1FDZA 1TB3A 3LLDA 3NPUA 2W79A 3VI2A 3BG9A 2E1DA 1TPUA 3HG2A 5KINA 3RFAA 1F6PA 3STGA 2P10A 3MI2A 3OVRA 4ADSA 4MZ1A 3OIXA 3W7JA 1ADOA 1W8SA 3FEMA 2WKJA 3E0IA 4QSHA 3UYCA 1KV5A 3EWYA 4RKAA 3N14A 1K3UA 4UR8A 3NZ1A 1VYRA 3S5YA 3GAKA 4MKNA 2C3ZA 3W71A 3KRZA 1F74A 1Q6QA 2A7PA 2YGYA 4N9CA 1VYSX 3HQ1A 1CI1A 3MYPA 3T44A 2WOQA 1S5VA 1F73A 1WXJA 3P82A 5C2XA 3O16A 4NJIA 4JTSA 1B4EA 3GDRA 5LSMA 1O5XA 3G1XA 2R94A 1QCWA 2CZEA 5FESA 1FCUA 3LI0A 1JUBA 1LBLA 1KV8A 1KTCA 4UR7A 5HUPA 1KTBA 2QCDA 2V5BA 3HPSA 4LUIA 4KKXA 3W83A 2YCEA 1OFPA 2R14A 4GBUA 3H54A 3GR8A 1UUOA 2RDWA 1P5BA 1VGAA 3NPXA 5D04C 5F2IA 1VR6A 4DO4A 2QCLA 3W7OA 1OFBA 3L0NA 3W2MA 1LRNA 2W6RA 4Z0SA 2WV8A 5SWUA 2J6XA 3IRDA 2Y63A 1SW3A 4JYFA 4O4VA 4GUHA 1G4PA 1TREA 4HSOA 3CLMA 3EX3A 3PC0A 2HS6A 1OG0A 1Z42A 1QO5A 1RQEA 3NQDA 5DY3A 4LC8A 1EWDA 1DVJA 4KFOA 1MSSA 2QJIA 3CHVA 2CWNA 4PEKA 3FLUA 4S1FA 4UTHA 4HN4A 4Q4KA 3LERA 1PL9A 2C16A 2E5DA 2GJLA 4K38A 4LS2A 4TIMA 2WSRA 4UTIA 1TJRA 4FXRA 4UTWC 2CFFA 4JN6A 1BKSA 3W74A 4XWUA 2V82A 3LRLA 2Y7GA 3EXRA 4OHQA 3BARA 3BW3A 1OYBA 3S42A 3PULA 1MXSA 3CWOX 2GUUA 3EXTA 3ZWTA 1F7BA 3C2RA 2Z6IA 3T40A 1H63A 2E68A 1FUYA 3QQ1A 1PCWA 4UCGA 5FEWA 4UTMA 1VS1A 3L2IA 2W0UA 1HG3A 3LTPA 3G0SA 4NXSA 4HIBA 4ADUA 1OX4B 3G1AA 4PH6A 3NM1A 2C18A 3P60A 3CM4A 5HMSA 4O8RA 2DZTA 3HGSA 4CNNA 5C5YA 5HNRA 4NJJA 3PR2A 5D2VA 3OBKA 2FLIA 3NPVA 5KITA 1XBYA 1TO3A 1HUVA 3M44A 1GVRA 1GTHA 4CNPA 1UCWA 1EP1A 4MFDA 3QPZA 3FJLA 4UTLA 4LW7A 3DGRA 4B5NA 1PV8A 1H60A 5D33A 1JQXA 3ZWSA 1GT8A 1SO5A 1VYPX 3BGJA 4IPJA 3SZ8A 1IIHA 2CLLA 1DL3A 1XDLA 2GQAA 1FBAA 1WYIA 2ATSA 1PE1A 1LP6A 1BTMA 2H8ZA 1ICPA 2DZSA 4N4PA 2XFWA 3IVTA 1GVQA 2J9XA 1KM1A 4UNLA 4MZYA 2Z6JA 3RK8A 2J27A 1EX5A 4OQVA 4ORIA 3E9AA 5I3HA 4JDYA 5K9XA 1JUKA 1K8ZA 2AAMA 3NZRA 3W1PA 2Z1BA 1ML1A 3TJXA 1ZNNA 1LOLA 1FWWA 3QC3A 2H3DA 3CWNA 3M1ZA 4NVTA 3I7RA 5CSRA 1NF0A 5K3VA 3KRSA 4ZVJA 1DBTA 4O52A 3NR0A 4GUJA 1THFD 1XBXA 2ABBA 1WBHA 2H6RA 4Z1CA 5J5DA 2C15A 4NZFA 4UUIA 5E93A 1JR1A 5L9FA 2TMDA 3MYOA 3PBYA 4DPQA 3TU9A 2ZZ2A 3LCGA 3DFOA 2Z2UA 1R2RA 4NJHA 3PM6A 1TPVA 2C19A 4N6EA 1FCBA 1RV8A 3GNDA 1J2WA 5KZEA 5D2TA 4O28A 3QRHA 1OJXA 5LKYA 3P62A 3W2KA 5AOUA 4OU1A 3TUUA 2A7RA 4NJGA 4GUFA 1UJPA 1OF8A 2CZ5A 3B05A 3M9YA 4GJ1A 4JGDA 2JBMA 1T96A 5CPMA 3N9RA 3N2XA 1XKYA 4MUZA 3DH7A 4C1LA 5CGQA 4LRTA 1S3HA 1W5NA 1QAPA 4O10A 4ZQNA 4IMGA 3W1NA 4DF0A 3LCFA 4Z1DA 4EWND 3UWUA 2OCZA 3I7SA 5DCBA 1SFLA 3O8AA 4RXGA 3KVLA 1NVMA 1GJPA 3HG5A 4CQ8A 5EBUA 2VOMA 3UPBA 1I2PA 1TRIA 3TC6A 4N9BA 5DCDA 3G18A 2NV1A 2KZHA 2Y7DA 3LCIA 1AL8A 3LHUA 2NUXA 1A5BA 1DQWA 4UFLA 1I2NA 4O16A 2WNZA 4CLMA 5KZMA 1G7UA 5LGXA 3BLFA 4UTUA 3PB0A 3HBLA 5DY2A 2YYUA 3EWXA 1LOQA 1NSJA 3NOEA 3STFA 1P0NA 2Y61A 2QCEA 4Y90A 3W1LA 4O11A 4U4MA 3P67A 3QMRA 4M6QA 3S5OA 5BOOA 1A5SA 1TQXA 3I65A 3IVSA 1SO3A 1HTIA 3SR7A 2E5BA 4RJEA 4TMBA 1I45A 3G8RA 4MFEA 1WV2A 5HWMA 3HIJA 2ZQ0A 3H53A 1I2QA 3R13A 5D09A 5CZJA 3QW3A 1F6KA 2QCDB 3P5ZA 5G4WA 4O15A 4PC8A 1JUEA 4QNEA 3W1RA 2A85A 2JKEA 4LVGA 2JKPA 1A5AA 3F1QA 3FFSA 4MYAA 2JGQA 1D9EA 4LS1A 3WJXA 1GOXA 1KFEA 4PCFA 1KFLA 3LBMA 3EWUA 5D05A 4PFMA 2D73A 3NL6A 5FEPA 2DZPA 4JTJA 3CC1A 4ZQPA 4A29A 2PC4A 5D02A 4L4LA 4E2DA 1DQXA 4K37A 2A1YA 4P61A 1X1ZA 3G1SA 4QAIA 1K02A 3GKFA 4R34A 4YL2A 1I4NA 2JGYA 2ISVA 4ZQCA 1VPXA 3MUXA 3MWAA 3LTYA 3RU6A 4FNTA 4YWIA 4OE7A 4UFMA 1W5MA 3N9SA 3TW6A 4GFSA 5EYWA 3EX6A 5AHFA 4H6KA 2XN0A 4WUIA 1WX0A 3R5EA 2TYSA 3U6WA 1W5PA 1SW7A 3ABQA 3NL2A 1TTPA 2EAWA 2Q8ZA 4OT7A 5U4NA 4HT3A 2YPIA 4JY8A 2X2GA 3PB2A 1U5JA 1K8XA 4Z1AA 2C6QA 2B7OA 1L6WA 1N8FA 1VRDA 2Y85A 1R2TA 3M0ZA 3W7PA 3W9ZA 3NQFA 2P0OA 1W0MA 1W56A 2B7PA 4NNAA 4FX8A 5I3IA 3HOJA 1OF6A 1SUXA 1O4UA 4LT9A 5AHMA 5K2ZA 3M16A 3WFAA 2PRMA 3IVUA 4QITA 2E5CA 4DPPA 1YXCA 3W7HA 2BTMA 4DO5A 1VCGA 4UFKA 3TK7A 2E6DA 1FCQA 1QOPA 3FYOA 3NO5A 3W7DA 1T99A 4CQ9A 3GXPA 3IIPA 2ZA1A 4N2YA 4AH7A 2RDUA 5BRBA 4C1KA 3NNTA 1YADA 1UBSA 3SGZA 1JRBA 2I9EA 3VFLA 4CCEA 3W1UA 1KM4A 1SO6A 1L9WA 1KM3A 1CX9A 1Q45A 1FY6A 5EA9A 2G5WA 4QJ1A 2HSAA 3NQMA 4UTTC 3IGXA 4JDBA 1E51A 2V9DA 3NQCA 2X1SA 6ALDA 2DJXA 5H91A 3UD6A 4I7UA 1W3TA 2Y70A 5D2XA 3CEUA 4MY8A 3W84A 4NJKA 2ZRZA 3GIYA 3WK0A 1OFEA 1YTEA 1YXDA 4DBDA 4IXXA 2FB3A 3A21A 2TSYA 1XI3A 2QCCA 1LZOA 3OHIA 3L67A 3SFKA 5HUOA 2CLHA 3RNDA 2X16A 2RDTA 4JEQA 4AMAA 3HGOA 4MPQA 1GQNA 1WDWA 2JKAA 3NQ7A 1F05A 1ZAHA 3M5VA 1FWNA 4AHQA 1TCDA 3CEPA 4LV4A 3SSJA 1XXXA 2CU0A 2ZA3A 4O50A 2WPBA 3C2EA 3M41A 3UWZA 3S1XA 4POCA 1ZALA 4OGZA 5FEXA 5CG7A 5D2YA 1TPWA 1W5QA 3T7VA 3DFPA 3R12A 2FPTA 4FXSA 4JS3A 4YXGA 1XDMA 3KOFA 4LVBA 1XBVA 1TPEA 1Z44A 4TMCA 5F1VA 1OX5A 3LHZA 3GDLA 2A21A 3QMSA 3TCEA 4O1DA 2VEPA 1IGSA 3P5YA 4XBKA 4FF7A 3BVJA 3G3MA 3TFCA 2A5HA 2Y89A 1SZFA 3M5ZA 1L2UA 4ZL1A 1ME8A 3LV6A 5LGZA 3NQAA 3NAVA 3UPWA 3ANYA 3TA6A 1TTQA 3RF9A 4GXMA 2NWSA 4IMDA 5GVJA 4M6PA 1LLZA 5HJLA 3D0CA 1O94A 2EGZA 3L5AA 3W75A 4JTHA 1N55A 5CPLA 3JS3A 1EA0A 3BG5A 3S6DA 3CPRA 5AYXA 2ZDRA 3WJWA 1G4EA 1ZHAA 4MVAA 3QSRA 4IOTA 4YCPA 2V2HA 4WY0B 1Q6OA 3W22A 4JR5A 3HJZA 4JTGA 2WNNA 3C0JA 2X30A 2ATMA 1HO1A 3PG8A 1BEUA 4FO4A 1IXNA 5T26A 1OHLA 2BX7A 1DHPA 3LHTA 2QUVA 3N2MA 4GUIA 1ZY9A 2ZTJA 2PRHA 2PURA 1K7EA 2OJPA 5DBTA 3GNNA 5FEZA 1TPFA 5FF0A 4O17A 5F2MA 4WOZA 2X1RA 3OVQA 3USBA 3W87A 1SPQA 3S1UA 3CB8A 3LB0A 1QPOA 3N3MA 4FX6M 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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