1EQCA

Exo-b-(1,3)-glucanase from candida albicans in complex with castanospermine at 1.85 a
Total Genus 151
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
151
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
AWDYDNNVIRGVNLGGWFVLEPYMTPSLFEPFQNGNDQSGVPVDEYHWTQTLGKEAALRILQKHWSTWITEQDFKQISNLGLNFVRIPIGYWAFQLLDNDPYVQGQVQYLEKALGWARKNNIRVWIDLHGAPGSQNGFDNSGLRDSYNFQNGDNTQVTLNVLNTIFKKYGGNEYSDVVIGIELLNEPLGPVLNMDKLKQFFLDGYNSLRQTGSVTPVIIHDAFQVFGYWNNFLTVAEGQWNVVVDHHHYQVFSGGELSRNINDHISVACNWGWDAKKESHWNVAGEWSAALTDCAKWLNGVNRGARYEGAYDNAPYIGSCQPLLDISQWSDEHKTDTRRYIEAQLDAFEYTGGWVFWSWKTENAPEWSFQTLTYNGLFPQPVTDRQFPNQCGFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structure of the exo-beta-(1,3)-glucanase from Candida albicans in native and bound forms: relationship between a pocket and groove in family 5 glycosyl hydrolases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords EXO-(B)-(1,3)-GLUCANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Candida albicans
total genus 151
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 3.2.1.58: Glucan 1,3-beta-glucosidase.
pdb deposition date 2000-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1eqcA00
5HPOA 1G1YA 3WDIA 5M3WA 2W91A 4HP5A 1R8LA 3ARYA 3M46A 2Z1SA 2WB5A 4CKQA 2W62A 2QMJA 3WDHA 3SIMA 3IJ8A 1I1XA 2JF6A 3BC9A 1HKJA 3EBVA 1UKPA 2JEQA 4LYQA 2J25A 1CBGA 1JDDA 2VC9A 1PX4A 2CESA 3QHMA 4PTWA 3CLWA 4CUCA 3VD5A 2V38A 3T09A 5KEZA 1M7XA 4HTYA 4TX8A 3TTYA 5BCAA 3IAPA 4D1IA 3PZOA 2F8QA 4WKFA 1R87A 1NOUA 1XRVA 1WE5A 1KGXA 1J0YA 3SEPA 4EE9A 4EKJA 3UESA 1E5JA 2WC4A 1B3VA 1E1FA 3MMUA 3CTTA 5A69A 4YN5A 4TTGA 1F4HA 1GORA 2W66A 2PWFA 5M03A 3A4XA 2PF0A 3B8SA 1OCQA 2CBUA 3ALGA 2AOSA 2CHOA 4D6CA 1AQ0A 3VX1A 3VOCA 2UWFA 2Y2WA 1OT1A 1ISWA 4JFVA 1UWSA 1BAGA 3L4VA 2FHBA 3GH7A 3W37A 3CMGA 1QI2A 1NOFA 4AZ6A 1M04A 1AMYA 1G94A 1EQCA 4UTFA 3VD7A 1TFVA 4R27A 1BGGA 1HP5A 4W88A 1VIWA 3ALFA 3ZSSA 3ZOAA 1J10A 3ECQA 4UR9A 1BTCA 1EDTA 3WH8A 4ZE5A 4A4AA 3THCA 4AEEA 1W9PA 3CZKA 4FK9A 4PMOA 1UWIA 4JZ5A 4B15A 4UZUA 3AROA 1LG1A 1UKSA 4B16A 2PWEA 4LYPA 2ZX6A 3DC0A 3WMBA 6A3HA 3G6MA 4HZ8A 1ECEA 1VFUA 3WY1A 4B3LA 4OUEA 3FW6A 1M01A 4MADA 3E1F1 1FHLA 4A3YA 3BCDA 2YA0A 4J3XA 3UCQA 1ISVA 4F66A 2ZUTA 5FD0A 2D3NA 2XIIA 1ZBWA 1EQPA 3CZLA 3WENA 1Q4NX 5DFAA 4UQBA 3AIVA 1EO5A 1NWTA 4WSJA 1JZ3A 4MAVA 1G0CA 2VQUA 3WBAA 3AMLA 4AZCB 1C7TA 5DEZA 3T2OA 2W67A 3K4AA 1XD1A 2X05A 4CCEA 5I23A 2ZUVA 1UH3A 2GFTA 1B3XA 5ABHA 2AMGA 5ABEA 1U30A 3IANA 4PBGA 1JIBA 1BSIA 4HOWA 2QF8A 3BH4A 4U3AA 4W84A 3J7HA 3L4TA 4U31A 3WMSA 3ARZA 5CLWA 1PAMA 4MNJA 4AZCA 3SCUA 1CTNA 2WVVB 4AZ7A 1ZBKA 3N11A 5A8MA 1L0PA 2D1ZA 1E4MM 3WNMA 1UZ4A 4URIA 3BSGA 3K8LA 2NW0A 1FH8A 1UKQA 3M7SA 4PUDA 4JCLA 4W86A 4OBRA 5A8NA 5DO8A 2FH6A 2YJQA 3AS0A 4A3HA 1C91A 4JCMA 3SCOA 1X6LA 4WIWA 3VM7A 1DWFM 1BYCA 3AFBA 1FA2A 3WH6A 1KWKA 2WVVA 4GO9A 3RDKA 2E0PA 1WZLA 3AIQA 1BG4A 2Y4SA 4QLKA 4AIOA 4QFUA 4N42A 3AHTA 3RIKA 1JZ8A 3AIWA 2X09A 1OBAA 2V3GA 1VBRA 3AHVA 2XPKA 1E56A 4W8BA 6TAAA 3ZSTA 3NIYA 2J7HA 2OYLA 1QHPA 1JZ2A 3QHOA 2J7FA 2GVYA 1US3A 1JZ4A 1J0JA 4CCDA 4KGJA 3M07A 2OLHA 1CEOA 3PZIA 4JFWA 3VIFA 4D6DA 4J3WA 4PTXA 1CLVA 2CETA 2YDQA 1GOIA 1SFSA 2XFRA 5AY7A 3WN6A 3T2PA 5A8OA 1SYTA 5A6AA 2IUZA 3RJYA 2BHZA 2Q8XA 1J18A 1CGXA 4UQAA 5A3HA 1US2A 1V3LA 4QLJA 2D24A 4HMDA 4PTVA 3W82A 1V6UA 1J9YA 2OSYA 3AZSA 4K68A 1WDQA 2PWHA 6CGTA 3OZOA 3SCPA 3THDA 1A47A 1IV8A 1DHKA 3WQ8A 2QMKA 1GONA 1W3LA 3WQ4A 2ESCA 5IXEA 4ZXOA 4HU0A 3IK2A 1KB3A 4DUWA 1E4IA 3DHPA 1LWJA 3RM4A 1GJWA 1NH6A 4ATLA 2D0GA 2PI6A 2VTFA 3IJ9A 5CPQA 1J12A 2VVNA 1DWAM 4HPHA 1MW2A 5IFPA 1OGBA 1WNOA 3PZVA 2GDUA 5BROA 3UR8A 1AVAA 2QHAA 4TTUA 2EPNA 4JAWA 2DH2A 5D9MA 3SCRA 3VUPA 1TUXA 4HZ7A 3KL5A 2J78A 1UD3A 3UG5A 2EBNA 1CZ1A 1ZS2A 4HMCA 3NUKA 2EO7A 4AD2A 4BS0A 1JD9A 1CXHA 3LPOA 3U5YA 3U7BA 2QPUA 4QCFA 3ZM8A 4J28A 3T0DA 1QNRA 3AICA 3GH5A 1DTUA 3VIMA 3ARRA 3SUWA 1W9BM 5CLTA 4PTMA 3AIBA 4DUXA 2J7DA 3WQVA 4M56A 2OSXA 1NP2A 3VILA 3L4UA 1GQJA 1AQMA 2YIHA 1C8XA 2CNCA 4DM1A 4GI6A 4V28A 4W8LA 2E3ZA 3N17A 1ZU8A 3WELA 3CZJA 1V3KA 4P7LA 3ARTA 1XYFA 3AI0A 5C71A 1V0NA 4X9YA 1XGZA 1W91A 4V2XA 3WKZA 3OZPA 3CHCA 1W32A 3VGBA 3GNOA 1LWHA 3N1AA 1VFMA 3SCTA 4PEEA 2W5FA 3ZJKA 3NSMA 2D0FA 1E6QM 1ZB5A 1E5NA 3O9NA 4MAZA 4GI8A 1UD2A 1LJYA 4TXEA 4WLCA 2DH3A 2VZTA 3W81A 2BY2A 1CIUA 3VTRA 3K4DA 4IISA 1W9UA 4S3KA 2JALA 1E9LA 4Q22A 4W5UA 3HMCA 3AIRA 3GYCA 2ZWYA 1UR4A 3VDHA 4IPNB 3SCNA 1CXFA 4GZIA 2E9BA 2XTKA 1F4AA 1TVPA 1UA3A 1NWRA 3BMWA 1E6SM 2J77A 3VKKA 1E43A 2JEPA 2XVKA 4JHZA 4B9ZA 3W6LA 2GJPA 1RH9A 5A94A 3RCNA 2XWDA 1UKTA 3BLPX 4H41A 2VZOA 2UY2A 1EHAA 4ZE4A 1K9TA 4MB1A 1BYBA 3WFZA 1GJUA 3AISA 4GZEA 2WLZA 3AQUA 2BVYA 2WKGA 5JIPA 3WNPA 1WB0A 2CERA 4AZIA 5I5RA 3N12A 2V3DA 4P8UA 2ZUWA 4CN1A 1PJ9A 1E0WA 4MNKA 2O92A 2JIWA 1E15A 3I3DA 3BSHA 1W9DM 4W7WA 4UOQA 1PEZA 1W1YA 4WKAA 1BFNA 2G41A 2WC7A 2WMHA 4PMNA 3WNKA 2GDVA 2WHJA 4U3CA 1W9XA 1D7FA 4FLOA 1GCYA 1HXJA 3UR7A 1UD6A 2JFEX 2RGMA 2WHMA 2J7EA 2BNJA 3BAYA 1W1VA 4AZGA 5JBEA 2VZUA 4BQ4A 1B2YA 3NCOA 3FAWA 5E0FA 1C8QA 1CXLA 3OB8A 3GZAA 2VMFA 4UQEA 3MSGA 3QHNA 4GPNA 1EA9C 3WD3A 3BAIA 1OGSA 1EOMA 1ISYA 1XV8A 1BPLB 2EQDA 2ZX8A 1MYRA 1EHNA 3FHQA 4BQ5A 3AIEA 4NZCA 4KMQA 1ZJBA 2UY5A 1D3CA 2V5DA 3M6DA 1GZJA 4RE3A 3PZTA 1V02A 1HKMA 4E8CA 5IDIA 3PZ9A 4QCEA 5GQBA 5FL1A 4J7RA 4U2YA 2J74A 2V3FA 4AIUA 1OIMA 4MJ4A 3GXFA 2DSZA 4UCFA 2BY0A 4GQRA 1VEOA 4HZ6A 1H4PA 2HISA 2VX4A 4E2OA 3EDFA 2BXZA 3WUGA 4TVDA 5JIWA 4WJXA 2XG9A 2J4GA 3FNDA 1GQKA 1CECA 4FMVA 2QV4A 3S2CA 2V3EA 1JYWA 1HL8A 3VO0A 5DF0A 2XVGA 3CMJA 1H41A 1V6WA 3RM9A 3MV01 5D9OA 4AWEA 1E6NA 2ZXBA 1CGVA 5A2AA 3W53A 1JF6A 3K46A 2E4TA 4C7DA 3NDZA 3UEQA 4MDOA 4EANA 1BVZA 4HOXA 3VNZA 4D6EA 1V3JA 3BCFA 4P8XA 3VIOA 5E0CA 3AS3A 3N18A 5M5DA 4M24A 5C8BB 1M53A 3WD1A 1CYGA 1NQ6A 1WZAA 1J01A 2CYGA 1UWQA 1H11A 3AZRA 1TCMA 3ZJ7A 3CZ8A 3OIHA 4JFTA 2EJ1A 1UWTA 1LL6A 2A3EA 1MXDA 3VU2A 4MNMA 5JBDA 1UQZA 3WF2A 4IM4A 4OZOA 2WZIA 1ITXA 5FCZA 3DYPA 3GDBA 1JFHA 3WQ6A 2O9TA 3VVGA 4UFIA 3ZJ6A 3ZT5A 2ZE0A 4LYRA 2A3BA 3EDEA 1UA7A 3CHDA 1BYDA 5BXTA 1K9EA 3WDQA 4CCCA 5LYRA 3AOFA 4MB5A 1JZ7A 1UOKA 3ARVA 3ARQA 3GXDA 1VAHA 3MSDA 4PMXA 4W87A 4M81A 1H3GA 3U57A 1GPFA 4AY1A 4CVUA 2WWDA 2YLLA 4FF5A 4M1RA 3T2QA 1BF2A 3AXIA 2WMGA 3QOKA 2DT0A 3VINA 1HVXA 1V3HA 4PMYA 2DDXA 1NOWA 1Q6CA 2DIJA 1XSIA 5I79A 1KQZA 4S3JA 1CGYA 2VQTA 3SUVA 4L4OA 4OKDA 4XV0A 1W9VA 3QR3A 1C93A 1PZ3A 2YL9A 3K1DA 2YKKA 3N15A 2WXDM 3WEMA 1JL8A 4E8DA 1TG7A 4D6IA 3SUTA 5CPTA 1E73M 4LPCA 2VR4A 4CU6A 1HL9A 2PBOA 2EPLX 3BAWA 2CEQA 1MW1A 3KWXA 1GOOA 3OLIA 2E40A 3A4AA 3EMZA 5AYIA 4HMEA 2FH8A 3SCQA 1UWRA 1B30A 4AISA 1J11A 1AQHA 3QOMA 4XZWA 4AD5A 1B3ZA 5D9NA 1K9DA 2YLAA 1UD4A 3CUIA 3DECA 1UR0A 1WDPA 3A3HA 2ZXQA 2CIPA 4CVWA 2B31A 1OGGA 1V6XA 3OLEA 2VL4A 2CPUA 4C7FA 1E55A 3MANA 3PTKA 2DSKA 1IZKA 2X8RA 2VNCA 4WKHA 4TX6A 4D72A 5CG0A 3CUHA 4BZYA 1W2PA 5A6KA 4FLSA 1GNXA 2OSWA 1X6NA 5DT7A 4MNLA 2CITA 4J27A 4DWSD 4QDMA 3WD2A 2X2YA 3EMQA 5DMYA 3F5JA 4DWSB 3ZMRA 1B3YA 1XD0A 2WZEA 1WKYA 2VT0A 2YL8A 3WDJA 1HF6A 3AS2A 5E9AA 1R7AA 1JAEA 3PTMA 2GK1B 5A6MA 1V02E 5BXPA 4D6GA 2A3AA 1KXTA 2WNWA 2YOCA 5CGTA 1PBGA 2FDMA 2JE8A 3SCVA 3ZR5A 2XM1A 1E3ZA 1VBUA 1V3IA 1KBKA 1OIFA 4P7QA 4NRSA 4CN6A 4BA0A 1QNPA 1C92A 3LMYA 4KH2A 3T0AA 1MQRA 4DWSA 1KWGA 1V3MA 2FGZA 2VURA 5CSUA 2JIEA 1KXVA 2GK1A 3VPLA 2HVMA 1HJSA 1J0IA 3PZNA 3GXMA 3SURA 4EK7A 2YDRA 3WUBA 3N04A 4P7RA 2WHKA 4JL1A 5I3DA 1WCGA 1YHTA 2J8GA 3CZEA 2BY3A 3VGEA 3FY1A 2YBTA 1J0KA 4BQ2A 2J62A 1JD7A 3BAKA 5A6LA 3UG4A 2ZIDA 1UD5A 4H04A 3OGRA 3FN9A 4JHOA 3VDAA 4AMCA 4JKKA 2QPSA 4D71A 1O7AA 2O9RA 4E4PA 1MWOA 2WCAA 1JXKA 4J3SA 3L2LA 3WUFA 3ARSA 4ZENA 1QI3A 3MUY1 4UFKA 4N0RA 1B1YA 2V5CA 1QVBA 3WIJA 1FH7A 3VIIA 7TAAA 4UFHA 1WO2A 4PCTA 5ABGA 3VIKA 1UD8A 2VZSA 5A6SA 4W8AA 1BGAA 1B3WA 5BWFA 2IXUA 3PN8A 5D4YA 4PMDA 1H0IA 1OB0A 1ZBCA 2G4FA 1V6YA 1WPCA 4PSRA 3T0BA 1TE1A 3VMOA 2J7BA 3B9EA 4OBSA 4YHEA 2GJXB 2BVTA 1CDGA 2RGLA 4MB4A 5GPRA 5M17A 3AHXA 2XYLA 2WBKA 1UUQA 4MB3A 4DWSC 3W6MA 3SCWA 2ZUNA 1E1EA 3K8MA 1XH2A 3TA9A 3AYRA 2A3HA 3GNPA 2CBIA 2Y8KA 3BLKA 2YDSA 2WKLA 1LQ0A 4CD7A 1GOKA 1V03A 2J47A 2Y5EA 2GJXA 3AXXA 3ZIZA 1ZL1A 5CQ1A 1GHRA 1XSJA 4C7GA 4OOZA 3RJXA 1G01A 2VRQA 3RILA 1GVIA 3NJ3A 3I3EA 1HJVA 2WSPA 2DGAA 3S6TA 1TA3B 2G3MA 1RD6A 3LPGA 1E3XA 5D8WA 1HT6A 2VZVA 2WWCA 3WDPP 1MW0A 2VO5A 2ZX9A 4GKLA 3JUGA 2OYKA 1HX0A 1BQCA 3AIUA 4JFSA 5I77A 2PWDA 1LF1A 1E71M 4H8VA 2ZWZA 1VEMA 2WYSA 2J79A 2PWGA 5GNXA 1TA3A 2D2OA 5EB8A 2GUYA 4Z2LA 4CD8A 5JUVA 1JAKA 9CGTA 4AD0A 1JDAA 4M29A 4M8UA 3RO8A 2WMIB 1XCWA 4H8HA 2BVDA 3BMVA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5HPO A;  1G1Y A;  3WDI A;  5M3W A;  2W91 A;  4HP5 A;  1R8L A;  3ARY A;  3M46 A;  2Z1S A;  2WB5 A;  4CKQ A;  2W62 A;  2QMJ A;  3WDH A;  3SIM A;  3IJ8 A;  1I1X A;  2JF6 A;  3BC9 A;  1HKJ A;  3EBV A;  1UKP A;  2JEQ A;  4LYQ A;  2J25 A;  1CBG A;  1JDD A;  2VC9 A;  1PX4 A;  2CES A;  3QHM A;  4PTW A;  3CLW A;  4CUC A;  3VD5 A;  2V38 A;  3T09 A;  5KEZ A;  1M7X A;  4HTY A;  4TX8 A;  3TTY A;  5BCA A;  3IAP A;  4D1I A;  3PZO A;  2F8Q A;  4WKF A;  1R87 A;  1NOU A;  1XRV A;  1WE5 A;  1KGX A;  1J0Y A;  3SEP A;  4EE9 A;  4EKJ A;  3UES A;  1E5J A;  2WC4 A;  1B3V A;  1E1F A;  3MMU A;  3CTT A;  5A69 A;  4YN5 A;  4TTG A;  1F4H A;  1GOR A;  2W66 A;  2PWF A;  5M03 A;  3A4X A;  2PF0 A;  3B8S A;  1OCQ A;  2CBU A;  3ALG A;  2AOS A;  2CHO A;  4D6C A;  1AQ0 A;  3VX1 A;  3VOC A;  2UWF A;  2Y2W A;  1OT1 A;  1ISW A;  4JFV A;  1UWS A;  1BAG A;  3L4V A;  2FHB A;  3GH7 A;  3W37 A;  3CMG A;  1QI2 A;  1NOF A;  4AZ6 A;  1M04 A;  1AMY A;  1G94 A;  1EQC A;  4UTF A;  3VD7 A;  1TFV A;  4R27 A;  1BGG A;  1HP5 A;  4W88 A;  1VIW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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