1EUNA

Structure of 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase from escherichia coli
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
213
structure length
213
Chain Sequence
MKNWKTSAESILTTGPVVPVIVVKKLEHAVPMAKALVAGGVRVLEVTLRTECAVDAIRAIAKEVPEAIVGAGTVLNPQQLAEVTEAGAQFAISPGLTEPLLKAATEGTIPLIPGISTVSELMLGMDYGLKEFKFFPAEANGGVKALQAIAGPFSQVRFCPTGGISPANYRDYLALKSVLCIGGSWLVPADALEAGDYDRITKLAREAVEGAKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Covalent intermediate trapped in 2-keto-3-deoxy-6- phosphogluconate (KDPG) aldolase structure at 1.95-A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords KDPG ALDOLASE
molecule tags Lyase
total genus 70
structure length 213
sequence length 213
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 4.1.2.14: 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate aldolase.
pdb deposition date 2000-04-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01081 Aldolase KDPG and KHG aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1eunA00
3SGZA 1I2QA 2FTPA 2GUUA 4D2JA 1YPIA 1FXPA 1Q45A 4AH7A 1FDJA 3SGUA 2J9YA 3L65A 4UTHA 3ABOA 3NVTA 3TFCA 3KRSA 2Y70A 3IIOA 4NJKA 1SSGA 4Y96A 3TXVA 3PC0A 3KRUA 1JVNA 2YSWA 1ZJIA 4UR7A 1LZOA 1OX5A 2X16A 4LS0A 3W7EA 1IXQA 4UXDA 1TPFA 1T99A 4DF0A 5I3FA 3IGXA 1SO3A 1K7XA 2AAMA 5I3JA 3W2KA 2QJHA 3W75A 3W1NA 4MZ1A 1J2WA 4X3ZA 1TPDA 2YYUA 5K2ZA 3W7IA 3LHZA 4MJMA 1TPWA 1QO5A 5G2IA 1F73A 4RXGA 4FIQA 2WQPA 1SQ7A 3EWXA 4ZZ9A 2FQIA 4O1BA 4K38A 1OYBA 3QQ0A 4NVTA 3W2MA 1WBJA 2ZA2A 2E6FA 1GG1A 3GDRA 5KZDA 2LLEA 2RH9A 3MP4A 2NUYA 1V7YA 1S5WA 3O15A 3W76A 2CZEA 2NX3A 2QDGA 4HSNA 2JK2A 4U28A 5DY3A 5EPDA 3SIZA 3E0IA 5D2YA 4O10A 2GPTA 1DV7A 4I9AA 3M9YA 5HWNA 3GZ3A 3WFAA 4MZ8A 3QSTA 2X2GA 4UNLA 3THQA 4TU1A 5C55A 5CKSA 3DFOA 3EX4A 4E0CA 5J5DA 4JEQA 4NXKA 4NNCA 3TQVA 4JR5A 3HBLA 4GFSA 3NQ8A 3R89A 3CLMA 4DO5A 3IRDA 3QMTA 3C2RA 2A85A 1UBSA 3UPWA 4O54A 3NYZA 3P8JA 2I14A 4O12A 2Z6JA 4ICNA 1OX4A 3NQMA 3CIXA 3PS7A 5LNSA 4MY8A 2TPSA 3IEBA 3CEUA 3G24A 4AVFA 1TIMA 4K37A 1J4EA 3K30A 3C2EA 3G1AA 2QCMA 3JS3A 3NO5A 3QF0A 4H3DA 1EA0A 5MHBA 4FX8A 3E9AA 3HIJA 3S5OA 3G18A 4XKYB 1K3UA 2Z0IA 3DI1A 1SZNA 5BMXA 1VLIA 1OFDA 3GR7A 1SZEA 2ZRUA 2FFCA 5HULA 3SECA 3A21A 4IMFA 4ALDA 4XTDA 5LNWA 4HPXA 1H50A 4JS3A 4YWIA 1QPOA 2Z6IA 1W54A 3LTSA 3PUOA 5CZSA 4CQ8A 4Z1CA 1F5ZA 4JXCA 4LS1A 3W2LA 2BX7A 1VJIA 4O17A 3HG4A 2C16A 3LCHA 1TRDA 3MHGA 3IVTA 1TTPA 2E6DA 1OX6A 4IQLA 4QISA 2V2HA 3HPZA 5D09A 1IF2A 2VFEA 1OG0A 1GT8A 2Y85A 2A1YA 4AHOA 3G0UA 4N4QA 1ZENA 1LROA 3LTPA 2Y7GA 4DF1A 5KINA 3G1DA 4XTIA 1KFJA 4JTLA 1NF0A 2ZZ6A 1YLVA 1X1ZA 5LKYA 3WK0A 4H6KA 1FWWA 1PIIA 2BXVA 4NU7A 5TBOA 4O50A 4QIUA 2CLMA 1OK6A 4LWWA 1M7PA 3M5YA 5D38A 3TAKA 3BG9A 3CWNA 4OBTA 2E5CA 2YR1A 3W7KA 1GWJA 1TQJA 4QITA 4LVDA 5D2TA 1EP3A 4GUHA 4N4PA 3FA5A 1XFBA 4OV4A 3S42A 3STGA 4TO8A 1FDYA 4AEOA 2C14A 1PHQA 5H2ZA 5FF7A 2ISVA 4WY0F 2ZBTA 3C4UA 3GKFA 4FX6M 3TSDA 1DVJA 4JTHA 5C2XA 4GE8A 4JX6A 1GQNA 4RR4A 3C6CA 3W7QA 4AAJA 3W07A 3N2MA 2WJZA 4HNTA 3G1SA 2X30A 4Z0JA 5FESA 3GAKA 4EOUA 4GJ1A 2VFFA 4O52A 3W72A 2ZFAA 3QW4B 2QCLA 2YX0A 4DO4A 4KWWA 2FPYA 4MIMA 3BK0A 3NQEA 2H3DA 3DFPA 4CCCA 4DEFA 3GVGA 3RLVA 3BW2A 3LI0A 3TQKA 3CTLA 2GVGA 2E09A 1TJPA 2ZZ5A 1EUNA 1NF7A 1Z44A 2V2CA 2TRSA 4WD0A 4UFKA 1W56A 2B7QA 5L9FA 3TSMA 5E1QA 3G0XA 1EP1A 1VYRA 3USBA 3BARA 4K39A 1L6SA 3SR7A 2C13A 1GZGA 2V9DA 4FXRA 3UXAA 4O0KA 4LOCA 1EX5A 1KFEA 3UZ5A 1ZY9A 5U7SA 2FIQA 1V5XA 1CW2A 3FFSA 1FWNA 1SPQA 4HPJA 3TKFA 2ZZ2A 2GQ8A 3DI0A 5D03A 1B57A 3C8FA 1SSDA 3NQGA 3NDOA 4GRSA 5DELA 1SO6A 3ZR4A 1TRIA 4WJEA 3R13A 4Q33A 2E5DA 3UY7A 3NQVA 2ZZ4A 3HG5A 5AOUA 4A2SA 3P60A 1RVGA 3EKLA 2QF7A 3GDTA 4OU1A 1UB3A 5D30A 4N9BA 3OEXA 1P0KA 4FB7A 3OVRA 3U8GA 2OT1A 1WX0A 3TJXA 4EF8A 3O6CA 2V0TA 4ZMGA 4X2RA 3R8RA 1GVOA 1JCYA 2NLIA 1OYCA 3G1FA 1LRQA 1YPFA 2ABBA 2YW3A 3PB0A 1JJKA 3IVUA 5D37A 3W88A 3PSWA 3PSVA 2G97A 3W70A 1LBLA 2VEKA 4XKYA 1I8JA 3HG3A 2PRLA 3P5YA 4LC8A 3O6DA 4LV9A 3GLCA 1C29A 3L67A 3W71A 4WUIA 4AWUA 3PBUA 1P0NA 3EXSA 4CCDA 4UMCA 1WDWA 3INPA 3T4CA 3SFKA 3P62A 5F4XA 1VHCA 3LLDA 3NQ6A 3O07A 1VHNA 2DJXA 3L68A 3FYPA 3C3NA 2B7NA 4HHPA 3NQAA 1W5MA 3W22A 5I3GA 3QEZA 5CZ0A 3O8AA 4M6VA 3M47A 3Q58A 3L0NA 1N8FA 1WQ5A 4Z1AA 1TPEA 1OABA 1XBZA 2F7FA 3GKAA 1XBYA 2KZHA 2ZTJA 1FXQA 3UWUA 4BF9A 3HPSA 2QUTA 1ONRA 4M6PA 2TSYA 3KFTA 1G7UA 1L9WA 3LCGA 3IIVA 3P80A 1W1ZA 3H55A 2NXHA 5LNVA 4JYFA 3Q94A 4LVGA 2QCFA 5FF3A 4Y6GA 4AMAA 3JR2A 3DBPA 4O13A 1H7RA 3FJLA 5TQLA 1TPUA 3I7RA 3WK1A 3TA6A 4GC4A 2DZWA 4IMEA 3ZWSA 3NL2A 3NPWA 5HNRA 3G8RA 3NQDA 1LTDA 1KM4A 4NT0A 3W1XA 4AWTA 4M19A 3HO8A 5FEWA 2J6XA 1KTNA 5AYYA 2OX1A 4HNUA 1PE1A 2WNQA 2AQWA 3HB9A 3PAJA 3UYCA 4LUJA 4Z1DA 4RLIA 1H7OA 5DCDA 3I65A 2IQTA 4UC5A 2QCNA 2BLEA 4O4WA 3IIXA 4JD4A 3LX9A 5CPOA 3HMJG 4Z08A 3GNNA 5CGQA 3QPZA 5U4NA 3CWOX 2QR6A 3R2GA 3LCIA 1S5VA 4S2BA 5EKYA 2H8XA 2ZYFA 1YDVA 3ZFHA 1SFLA 3UWVA 1B3OA 3ZWTA 1WA3A 2GJNA 1K02A 2QCCA 3QJAA 1VC4A 1TB3A 1VCVA 1O60A 5DN1A 4M7SA 4A29A 3W7GA 3MI6A 4RXFA 1R47A 3QMSA 3FKKA 4MLRA 2E77A 2R8WA 4JY9A 4N9DA 3YPIA 3P61A 2ISSA 3GXTA 5L6UA 3MI3A 5A5WA 3QYQA 1B4KA 1SW0A 3TH6A 4DQWA 1GVRA 3EWZA 5F1UA 3B0PA 4MPQA 4L4LA 3MI2A 1QMLA 2ZZ1A 3I7QA 1RQEA 4IPIA 3VKJA 3PVFA 5J5RA 2Y7FA 5FF4A 1F05A 3LM7A 1X8FA 4MY1A 3N19B 2YW4A 3CB8A 4LV4A 3QSRA 4AHQA 2CW6A 4ZVJA 2UV8G 2FLIA 3BV4A 1JQVA 2CLEA 2VC6A 1UASA 2PRHA 5TIMA 4Y9AA 2O7QA 4DPQA 2A2IA 4H4IA 3N9RA 2R94A 2PURA 5KZMA 1FCQA 3QPYA 3W7OA 2VEPA 1YXDA 3T55A 1OJXA 3RFAA 3S8HA 3D0CA 1VLWA 4QM1A 1PL9A 5AN7A 4OV9A 4E38A 1YXYA 1K7FA 3PF3A 4J9JA 4R7JA 1KM6A 3PWAA 3TC7A 1QPRA 1L6WA 2BZNA 3W7MA 5CZJA 2Q8LA 1QOQA 2OCZA 4JYEA 4YCOA 2RHGA 1QPQA 3I6RA 3LCXA 3W9ZA 1KBIA 1K7EA 3B04A 3PUDA 1NVMA 2Y88A 5LNRA 5CPMA 1FBAA 1AK5A 3HGJA 3KHJA 4O57A 1NAL1 4A21A 1OFBA 1EWDA 3M43A 1O95A 4UTIA 3STFA 2NWRA 2HMCA 3H53A 1D9EA 1G67A 4YMZA 4CQ9A 4ZQMA 2J9ZA 1VRDA 5K3VA 1OFRA 2GVJA 2RKXA 1W5PA 5HJLA 1OF8A 3WK3A 1JCXA 1FY6A 1FDZA 4XBKA 4Y90A 4MJZA 2QUUA 3TJLA 1FCUA 5BMWA 3EX1A 2A6LA 3VE9A 2PC4A 4K8HA 1XKYA 5G5IA 3HGRA 4A22A 5F2MA 4NJGA 3QM3A 2QCEA 3LV5A 1K8YA 4A3UA 4YL2A 1MEWA 3NA8A 4GBUA 1H7NA 5KITA 4TIMA 1L2UA 5EA9A 3TUUA 4XQ6A 2V81A 3S5YA 3U2OA 3VE7A 1TYGA 5AC7A 2NX1A 4N2YA 3VCRA 2FDSA 2X1UA 2ZZ3A 1P5BA 4UNKA 1H7WA 3GK0A 4NNBA 4FNQA 3DFTA 1LOSA 2VOMA 3H54A 4X22A 3DFSA 3NM1A 4N6EA 1XUUA 3NM3A 3W23A 4TX9A 5LGXA 1TTIA 3UY8A 4KWVA 2ATSA 3LTYA 1EP2A 3P74A 3GYEA 4HSOA 1VYPX 4JX5A 4HIBA 2A5HA 3BO9A 3P8IA 1SU5A 1OHLA 2ATMA 3C2FA 3AO0A 4JDBA 3GX9A 2VXNA 3OHIA 5G1YA 4QJ1A 2TYSA 3C61A 2J88A 3S1VA 3C56A 1TV5A 5K9DA 3TX9A 2QJIA 3MBFA 4PEKA 2VFGA 1M5WA 1ZHAA 3IGSA 1XDLA 1GVFA 4JTFA 4C1KA 5K4XA 4AXKA 1ZALA 3VNDA 1LM1A 4LW7A 3KVLA 1DQXA 1YTKA 3M5ZA 1SO4A 3M44A 5EY5A 3IGUA 3LXBA 1LLWA 3CQ0A 1ZFJA 4M7TA 3M7WA 3TCEA 1JCMP 3DFNA 1ALDA 1SZGA 1DQWA 2E68A 5AHNA 5LZLA 4O14A 3W2JA 2V8ZA 3MBDA 4ZQRA 3DZ1A 5LHFA 3TR2A 2WPBA 1OYAA 4NJHA 1NSJA 3CM4A 4A2RA 4NNAA 1W8SA 1Z48A 1OK4A 4ORIA 2O7SA 4WY0B 1AL8A 1AL7A 4YXGA 3WJYA 3EX3A 2CFFA 4BWLA 5BRBA 3S9YA 1KW1A 3M41A 1FWRA 2DJLA 1U83A 2PCQA 1TV7A 3CIWA 1TPC1 3Q2DA 3R5EA 2X1RA 4PFMA 4RCXA 1G6CA 2QCGA 3LRLA 1H61A 1Z42A 2BSLA 4OHQA 5I3KA 3P5ZA 2FPTA 1QAPA 4TR9A 4PODA 3G3DA 2OT0A 1PHWA 1VZWA 3A24A 3EB2A 3O16A 5FEXA 5FF2A 3TMQA 1B9BA 4UMBA 1VCFA 1E51A 3N34A 1A5CA 3E49A 4OWGA 1I2PA 1P1XA 3S1UA 2DZVA 4JTTA 4TMBA 3TDFA 3B0VC 1VCGA 1LRTA 1TPB1 4JX4A 1BEUA 4PC8A 4IX2A 5I3HA 4NUWA 1JRCA 4N9EA 3OVPA 3G0SA 1HTIA 5KSWA 4FEZA 1FWTA 4CNPA 1JCLA 3FIGA 3LRKA 1TPVA 2EF9A 4FO4A 2Y63A 5K9CA 2RFGA 4WXZA 2V5LA 3B03A 1GEQA 1H62A 4GUFA 1N7KA 3L0KA 2QCHA 3S6DA 1JCJA 4AWSA 4O8RA 3NPVA 1YDNA 1KV5A 1XXXA 3O05A 4PL2A 3S5ZA 4NX5A 2YFNA 5ABTA 2XN2A 1O5XA 3MO7A 3MP3A 3NQ7A 3CC1A 1ICPA 4UTWA 5KMYA 5K4ZA 3TFXA 4OQVA 4Z0SA 3F4WA 3KOFA 1KFCA 3LCLA 4W9TA 1RD5A 1ICQA 4QNEA 2JKEA 1DL3A 1EPXA 1L6YA 5AHFA 3S1XA 2ZTKA 4I7WA 2C6QA 1H1YA 3E02A 3ELFA 4UTTA 3GDLA 3EWYA 2VENA 3HF3A 2A7PA 2CLFA 1DBTA 3W3OA 3NQCA 1TMHA 4O0ZA 1YTEA 3LERA 1H63A 1IGSA 1UCWA 4NZFA 4EWND 1LCOA 4MLJA 2VEMA 2CLOA 2ZA1A 5AFDA 5K9XA 2HS6A 3LHVA 1A5AA 4K7VA 2B4GA 3O6YX 3NXFA 1K03A 4ADSA 4GXMA 1RQHA 5SWUA 1YTDA 4GWEA 3MMTA 4WOQA 3GXNA 3TW7A 3U6WA 3CEPA 4M5PA 4QSHA 5D05A 3B8DA 4JTEA 5EMUA 3W1QA 1X1OA 3T44A 3KAOA 3FS2A 1LOQA 5HWJA 3G1XA 4LVAA 5D32A 3IV3A 1QOPA 2DP3A 2GJLA 1AW5A 4R53A 4DBEA 3N14A 2V2DA 4Y8FA 1OFOA 1VPXA 2ZRWA 3TAOA 3TW6A 3G1VA 3M16A 2YGYA 1W3TA 4ZQCA 3TSBA 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 3SI9 A;  3WJZ A;  1EEP A;  4O53 A;  2YCE A;  3BVJ A;  5HUO A;  2A7R A;  2Q3R A;  4FNP A;  3NEV A;  3TXZ A;  3NPX A;  3BGG A;  5DLC A;  5LNU A;  3NOE A;  1XBV A;  1KV8 A;  3MP5 A;  3S5N A;  4IMG A;  2ZZ7 A;  3DU0 A;  2BTM A;  4NXS A;  1SUX A;  2F84 A;  4GUG A;  1EWE A;  3A22 A;  2A6N A;  1FQ0 A;  1XDM A;  2HSA A;  5AYX A;  3W1L A;  1R2R A;  1BWK A;  1JQX A;  3TRO A;  5C6M A;  1KM3 A;  3TML A;  5CSR A;  7TIM A;  2NXI A;  3CPR A;  1H51 A;  4UTM A;  5D33 A;  3PM6 A;  1KBJ A;  1JUL A;  3MW7 A;  3LXC A;  3I7S A;  1TSI A;  5IM5 1;  1A53 A;  3M5X A;  4UIO A;  4K6A A;  5G4W A;  3EX6 A;  4UFJ A;  1HL2 A;  1KFL A;  1GYL A;  4AB4 A;  1MZH A;  1I2N A;  2AGK A;  4LU0 A;  3BW3 A;  3L9C A;  4R33 A;  2CWN A;  2Y62 A;  4XZ9 A;  1S3H A;  3LHW A;  5GVJ A;  3TU9 A;  5HMS A;  3E12 A;  3HGO A;  4FIR A;  4DEL A;  2FJK A;  3NZR A;  3TV8 A;  2DZX A;  3KVM A;  1UUM A;  4ONV A;  3PY2 A;  3W84 A;  3LBC A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1JDA A;  3SGZ A;  1FXP A;  2PU1 A;  3STP A;  3ZOA A;  1FDJ A;  3SGU A;  2J9Y A;  3L65 A;  3ABO A;  3N3T A;  4I9T A;  3TFC A;  3KRS A;  2PTZ A;  3IIO A;  1SSG A;  3KS6 A;  4WDU A;  3LPP A;  3KRU A;  2CLP A;  1JND A;  3SIM A;  1T41 A;  4LS0 A;  4UXD A;  4HYR A;  2O9R A;  2VL4 A;  4DF0 A;  3IUD A;  5FJU A;  5I3J A;  2QJH A;  1Z8A A;  4MZ1 A;  3QHN A;  1EDG A;  4HZ7 A;  4X3Z A;  3IAC A;  3WQC A;  4HNO A;  1CPU A;  1X1N A;  5BRQ A;  3LHZ A;  3T0A A;  3E5B A;  3NOY A;  2PBG A;  4RXG A;  3VKC A;  1GCY A;  4K38 A;  3H2O A;  3QQ0 A;  1UZD A;  4NVT A;  3W2M A;  1EA9 C;  3GDR A;  3HQO A;  2WNW A;  4DRS A;  2NUY A;  2CZE A;  2NX3 A;  5IRP A;  2QDG A;  3CMG A;  4DUW A;  5C2C A;  3EYP A;  3SIZ A;  1M7J A;  5D2Y A;  4O10 A;  2PWV A;  3GZ3 A;  2G8Z A;  4F9D A;  2X2G A;  1G0C A;  3CB3 A;  2VD8 A;  1TX2 A;  5CPS A;  1EQC A;  2NT0 A;  4JEQ A;  2XSX A;  2OQH A;  4NXK A;  3TQV A;  4JR5 A;  2VVN A;  2WW5 A;  1YNP A;  3IRD A;  3QMT A;  1UBS A;  4C6F A;  5IDZ A;  1PDY A;  4OBR A;  1JAE A;  3M46 A;  5ABH A;  5E5C A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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