1EX5A

Fructose 1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVAPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASESLFISNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A conserved glutamate residue exhibits multifunctional catalytic roles in D-fructose-1,6-bisphosphate aldolases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FRUCTOSE 1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE
molecule tags Lyase
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 121
structure length 363
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2000-04-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1ex5A00
2CZ5A 4RCXA 2WO5A 3SJ3A 4NNCA 1QPQA 3LLFA 1H61A 3NYZA 2QCLA 1YTEA 2A4AA 3W2KA 1FX6A 1X7FA 3KX6A 3FJ6A 4X2RA 2QUVA 3CB8A 3TV8A 4XTDA 4PL1A 3NEVA 1Q6OA 4O1DA 3Q2DA 1CI1A 4NJKA 1TIMA 1KTCA 3UWWA 3PUOA 2OCZA 4UTKA 3FKKA 2GUUA 2A85A 1SW0A 3WK2A 1IIGA 2GQ8A 4BF9A 2R8WA 3ANYA 3DU0A 2QF7A 3LRKA 3C4UA 3P7YA 5LNRA 3TMLA 6TIMA 4YLWA 2OMAA 3SW6A 3UD6A 5FEZA 1RPXA 2FLIA 1K8XA 3A24A 3W6YA 4O19A 1U83A 4ALDA 4EF8A 1LLWA 5LZLA 3W75A 1KFCA 2G97A 1GTHA 3TC7A 5CGQA 2VENA 2Y62A 2ZA1A 4LS2A 5LNSA 3M47A 4MY9A 4OBTA 1OX4A 3E96A 4N4PA 3W7RA 2VC6A 3FLUA 1AG1O 3S8HA 2FB3A 4OWGA 2QJHA 3RU6A 5D04C 2V2CA 3R12A 2KZHA 1QDSA 4NZJA 1FDZA 4IXXA 1WOBA 4AHPA 4OHQA 3GR7A 1NF0A 1G7UA 1VLIA 1VCGA 3GNDA 2GVLA 3AO0A 3PS7A 3CM4A 1Z42A 1VCVA 2VFEA 3BV4A 5DCEA 2J9YA 4JGDA 4PA8A 1K7XA 5C2XA 1AK5A 4Y8FA 4ADUA 4RR4A 1KFLA 3W7LA 3RLUA 3MI3A 3G1XA 3BG3A 1GZGA 3CTLA 4LS0A 5I3HA 4XTIA 4O1BA 1IXOA 1XCFA 4UTIA 1SO5A 4X3ZA 4NVTA 1EP3A 4ZMGA 3KRZA 1FWSA 3C2OA 1GG0A 2P1FA 3N2MA 3LI1A 3P82A 4L4MA 4OQVA 3KVJA 4PEKA 3P81A 1T0OA 3NR0A 4MY8A 4MYAA 1HO4A 1IXNA 3IIOA 5EKYA 2V81A 4EOUA 1UUMA 1W0MA 1S5VA 4ZL1A 3ABSA 4UR8A 3P8IA 3NQ8A 2JK2A 1L6YA 5L6UA 3V75A 1JUEA 2E6FA 3B8DA 1LORA 5AHIA 3LBCA 3GR8A 3B03A 1WV2A 3PVFA 3MMTA 4EVZA 3QFEA 1TREA 4O0KA 4PFMA 2B0MA 1E51A 1IXQA 1DQWA 3BPWA 5CZ0A 3VCRA 2A6LA 4ML9A 2FJKA 3W3OA 5AFDA 4HHPA 3P84A 4DF0A 1WBJA 1KA9F 1IF2A 1M7OA 1P1XA 4KWWA 3JS3A 3OIXA 4WY0F 2CLIA 3N2XA 3DI0A 4D2JA 3M5VA 1DJQA 3UWUA 2NZLA 3MBDA 2ZA3A 3BGJA 3P61A 1F7BA 1VR6A 4NZFA 2EF9A 1SUXA 2FIQA 3DFPA 1LDCA 3G3DA 3ZFHA 3QEZA 3GX9A 5C54A 3W7JA 3W2LA 2Q3RA 2ZRYA 2GJLA 3W2JA 1GVFA 4I7WA 1K3UA 3I7SA 2V30A 4AEOA 5CPNA 1P0KA 5K3VA 3TAKA 4LNYA 1LTDA 3NQVA 2G5WA 5EPDA 4HKPA 2WV8A 3DFNA 3LTYA 1PCKA 3NO5A 3W7PA 1QPRA 2ZZ1A 4CQAA 4AF0A 2WJZA 2VXNA 3PR2A 3HQ1A 3L65A 3G3MA 4QAIA 5HNRA 1HL2A 1A50A 4WUIA 3N34A 3G18A 1UBSA 3PBWA 4O14A 1X8FA 3MP4A 3SY5A 4UTLA 4MZ8A 4M6QA 4M5PA 5HINA 2H8XA 1MSSA 2TSYA 2IQTA 4FNQA 4HSOA 2D73A 3O15A 3WJWA 1ZFJA 4JX5A 5IBXA 3U8GA 5H2ZA 3LB0A 1G67A 4FNRA 4W9TA 2ABAA 2AAMA 2C13A 2E6AA 1LBMA 1VH7A 3S1XA 1W1ZA 3FYOA 3UPWA 3W1UA 3B0PA 1TTPA 4MLJA 1KFEA 4WY0A 5CPOA 2GJNA 1LLZA 3LV6A 4XBKA 3CIWA 1DORA 1L6SA 3NQEA 3O07A 2EPHA 1NVMA 1ZENA 1B3OA 3EWUA 1YTKA 3GDMA 1W5QA 4WX2A 3LI0A 1BTMA 4S2BA 2NXHA 3GZ3A 1KTBA 3M43A 1PIIA 3G0SA 3C6CA 3LHWA 3O6DA 3ABRA 4NNBA 3C2VA 1O4UA 1TTQA 4YXGA 3HO8A 3S0CA 1I2PA 4JTJA 2JGYA 4MJZA 4Z1CA 4UNLA 2QKFA 4A21A 3ABQA 1H51A 2XN2A 2ZTKA 4BWLA 3TCEA 3LCLA 1R46A 1ZAIA 5DBTA 4IMDA 5F1UA 2OX1A 2QCHA 1K8ZA 1SZEA 3HB9A 4Z1BA 4C1LA 4BK9A 2V2HA 2BLEA 3W7EA 1NEYA 3W2MA 3HG5A 3ZWSA 2CLOA 3EWBX 3JRKA 3CT7A 4GE8A 2G95A 1BEUA 4AVFA 1AL7A 3GVGA 3BK0A 1QPOA 2RFGA 3LOTA 5H91A 3CHVA 4ZQMA 4A29A 3UY7A 4N9CA 1IIHA 4JICA 3QSTA 3CLMA 2ISVA 3WJYA 1HO1A 2V82A 2Z2UA 3G1YA 2NUWA 1QO5A 1SW7A 4O1CA 4JIQA 3MI6A 3E49A 1H7NA 3W70A 2QCDA 1RQEA 3I7RA 5HUOA 3PBUA 1TTIA 4OV4A 3GIYA 4NJIA 3LCFA 4TR9A 4RZ4A 2PE4A 1CX9A 3P62A 3U2OA 1AL8A 3SZ8A 4UTJA 1W54A 2A6NA 1D3HA 1OFAA 5D32A 4UFMA 1TQXA 4R7JA 4JYDA 1FUYA 1KV5A 4YL2A 2J24A 4UTTA 2B7OA 1O5KA 5AYXA 2NWSA 3W2NA 2YW3A 3G22A 1J4EA 4ZQOA 1LP6A 2ISWA 4O57A 5AB3A 1ZAJA 2ATMA 5TIMA 2NX1A 3P74A 4MIMA 2X16A 3JR2A 1AW2A 2WNNA 4UR7A 2LLEA 4IQLA 5D2YA 2VEMA 5IM51 5FF4A 5G4EA 3W7CA 4CCEA 5K9CA 5FI8A 2QDHA 3I65A 1QWGA 3I68A 3S5YA 1WYIA 3GAYA 3W1PA 1LCOA 1R2SA 2NLIA 5G2IA 2WSRA 3TSBA 1GQNA 5D05A 1MZHA 3C2RA 2YCEA 3NOEA 4NU7A 4OE7A 2H3DA 3V1PA 5F2GA 2G96A 5AHMA 3QMTA 3W87A 1F5ZA 1TRIA 3DBPA 4UIOA 1M5WA 1GT8A 2ZRXA 5G5IA 5AYZA 4MFEA 1R47A 1WX0A 3T40A 3S42A 5I3JA 3FFSA 4M19A 5F1VA 2PCQA 4YWIA 4FNUA 4LUJA 1H5YA 4FXRA 2A1YA 1X6UA 2ZA2A 2O7QA 3E9AA 3ATYA 3NPXA 3L9CA 3BG5A 3GLCA 1XUZA 4P61A 5AYYA 4FF7A 4QISA 5TQLA 3HPXA 3R8RA 1GPWA 2PC4A 4Y6GA 1DHPA 3IV3A 1PCWA 2Y7FA 4JX4A 2YZRA 1BWKA 3TR2A 3HMJG 1IGSA 3C56A 5U4NA 1EP1A 3TW7A 3NPUA 4JEQA 3VE9A 3W07A 1KLYA 4NQ1A 4KFNA 1ZNNA 5F4XA 5GVJA 2O7SA 3GXTA 4Z1AA 1V7YA 4G1KA 4WQ6A 2XFWA 1XUUA 2C16A 2V0TA 2CU0A 2DZTA 1OFRA 3TMQA 2QCNA 3DFOA 3NAVA 4O4VA 1JULA 2B7QA 1JUBA 1VHCA 4LY8A 2BTMA 4N9BA 3W22A 4XKYB 3LGEA 4IMCA 3OHIA 1LOQA 4QIUA 3W83A 3L2IA 4JN6A 4GUIA 1EUNA 1M7PA 1RZMA 5DBUA 3H55A 1ZALA 2ZZ7A 3W2UA 4ORMA 4IOTA 2JKAA 3QJAA 2NWRA 1L2UA 3UY8A 3EX2A 3W7NA 3ATZA 3OA3A 1H1YA 4DO4A 2ZRVA 2TMDA 3HG4A 1B4EA 4MVAA 1N55A 4ZQCA 4IUOA 1S5TA 3EXRA 4EF9A 1KM4A 2JKPA 4POCA 2YFNA 1SZNA 2VFIA 3OVPA 5F2IA 5KZDA 3MWAA 2TRSA 4WXZA 2VFDA 3E02A 3M41A 3SIZA 4JTTA 4H3DA 3HPZA 3PBYA 2YPIA 3QF0A 5T26A 4BI5A 3MYOA 1N7KA 5CKSA 2E5BA 3FKRA 5HQEA 4LV4A 3UXDA 1QOPA 3GDTA 1KBIA 1UB3A 1A5AA 4I9AA 4O28A 1NFBA 5LNVA 2E5CA 4UNKA 1I45A 3OG3A 5AC6A 1Z41A 1X1ZA 1KV8A 4NXSA 1XBXA 2QAPA 5FF2A 2OZ0A 3PULA 2C3ZA 2DJLA 3P5ZA 4ZQRA 4GC4A 3DFSA 3DHFA 1XC4A 3N19B 5K4XA 2RDTA 5LGXA 2OJPA 4O50A 4JYFA 1G4SA 4O15A 4JDBA 4JD4A 3IVTA 2Z6IA 4FB7A 2ZQ0A 3MP3A 4JXCA 3GDRA 4MPQA 2A7RA 1GWJA 4MOZA 1UCWA 3Q37A 4LVAA 1KFBA 4MLRA 2C15A 3UWVA 4NX5A 5J5RA 3S1WA 3LCXA 1AMKA 1W37A 2Q3OA 2ZRUA 1XBVA 3QPYA 3QZEA 2UV8G 1LYXA 4LC6A 1T8XA 4CCCA 4RLIA 5AHFA 1B4KA 1PVNA 3L21A 1YTDA 5DCDA 2GPTA 3HPSA 4PC8A 3A5FA 5F2LA 3TKFA 1O5XA 4JIPA 2C14A 1KM1A 4JTUA 4KFPA 2VFGA 3W7QA 4WOZA 3NM3A 3G24A 4FNSA 1ONRA 2BWGA 1H62A 1HTIA 3EWWA 3KVLA 1TPWA 3EXTA 1TO3A 3SI9A 1R2TA 4NT0A 4WOQA 1L6WA 1F76A 4IX2A 3EX1A 1VYRA 1G4PA 4AXKA 1W5OA 7TIMA 3DKLA 3DH7A 3WK0A 3LBMA 4FO4A 1EUAA 3TJLA 3T78A 1YPFA 3LHTA 1TRDA 1JRBA 3G8RA 4M6PA 4O18A 1JRCA 5CSRA 1JCXA 5KMYA 4UMBA 2BX7A 2X1RA 2BZNA 4IMEA 3T55A 3TAOA 2DZPA 3P60A 5ABTA 2YSWA 2CLKA 2QR6A 3IEBA 3STGA 4BR1A 5I3IA 1KTNA 3L68A 6ALDA 2PRHA 1EP2A 3D0CA 1P5BA 4ONVA 5E0KA 4R33A 5SWUA 3IGUA 1H7XA 1H7WA 4R53A 5FEXA 3B06A 1ICSA 5J5DA 5BMXA 3MBFA 3BLEA 4JTHA 1ME9A 1FXPA 1OK4A 4UFJA 1QAPA 5F2MA 3QRHA 3FA5A 2DP3A 5HMSA 4UTUA 4IXHA 3LRLA 1P4CA 3TW6A 2H3BA 1FDYA 1YDOA 3BVJA 1G6CA 4HIBA 2VFHA 2YGYA 4UMCA 2EAWA 5DCBA 3GDKA 3GNNA 3BLIA 3R5EA 1A5BA 4Q33A 4KKXA 1W8SA 2RHGA 4GXMA 1JCYA 3KRSA 3M9YA 4HPJA 1TYGA 1SSGA 3IIVA 2PRLA 4M7SA 3C2EA 5G2HA 2QCEA 4RK8A 3P8JA 1TTJA 3TE9A 3ELFA 3TJXA 2H6RA 3TQ0A 3L0KA 3M16A 1NF7A 5FF3A 3A5VA 1PHQA 2Y89A 4DF2A 2RKXA 2R91A 2Y61A 1R30A 2I14A 3BW2A 1VYPX 3SFKA 2VKZG 2Y85A 3FOKA 3N73A 1ML1A 2ZZ5A 2FDSA 1PE1A 1YDVA 4GUHA 4TMCA 3W1MA 3ABOA 4FHAA 1RD5A 3NNTA 4NJJA 4LOCA 1EWEA 3C61A 3LV5A 4ZQPA 4RXFA 3TQKA 1WA3A 2PRMA 3NL6A 4N6FA 4R34A 3W1RA 5KSWA 4S2CA 3PUDA 3LX9A 3YPIA 4DO5A 1DQXA 1B9BA 3KFTA 1YXDA 1KM0A 4UCGA 2Y7EA 2GQAA 1F2JA 4NXKA 4DXVA 3G0UA 1GYLA 3NGJA 1G7VA 4LUIA 3DENA 4O12A 1L9WA 3FJLA 1U5JA 2I1OA 1HFBA 3IGSA 3B04A 1OF6A 4RXGA 2ALDA 4JYEA 2CLFA 3EX6A 3MUXA 2JKEA 1YLVA 3A9IA 1H1ZA 1SZFA 5FF7A 3KVKA 4GFSA 4IWWA 1ZY9A 4JNMA 4K8EA 4XWUA 4ADSA 1F6PA 3PWAA 3M1ZA 5LSMA 1ZHAA 3L66A 2WQPA 2GVJA 3IGXA 3EEGA 4UFHA 2AGKA 3O8AA 1FWTA 1K7EA 4N6EA 3TNOA 1DBTA 5I3GA 4QQ3A 1EIXA 5FEPA 1OFPA 1ZAHA 1F74A 2YFOA 3G1FA 3U6WA 2FPTA 3SSJA 1Y0EA 3S5OA 2B7NA 4YCPA 1OYAA 4RZ6A 1TPDA 2OT0A 3T44A 4MJMA 4IPJA 4LTSA 4O0ZA 2FPYA 4ORIA 3W7IA 1TPVA 3BW4A 4UC5A 3EKLA 1XKYA 4PCFA 2E09A 3W1AA 4PTNA 3W1XA 2B7PA 4K7YA 3G1SA 4JX6A 3NZ1A 3LCHA 1EA0A 1GVOA 4LVBA 2J6XA 3DAQA 2DZSA 5CPLA 3G1AA 1NSJA 4S1FA 3O1NA 4MFDA 3LHVA 1UASA 2E6YA 4NX0A 3USBA 2WKJA 3OEXA 5AC8A 3BLFA 4HNVA 1TMHA 3TXVA 1TV7A 5DY3A 3M5ZA 1VJIA 1D9EA 4E2DA 1TQJA 4OT7A 3W7OA 4AAJA 5KITA 3P5YA 4GWEA 5DELA 3PY2A 4QITA 2X1UA 4RJEA 4Z08A 5D02A 5HULA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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