1EZWA

Structure of coenzyme f420 dependent tetrahydromethanopterin reductase from methanopyrus kandleri
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
347
structure length
347
Chain Sequence
AEVSFGIELLPDDKPTKIAHLIKVAEDNGFEYAWICDHYNNYSYMGVLTLAAVITSKIKLGPGITNPYTRHPLITASNIATLDWISGGRAIIGMGPGDKATFDKMGLPFPCKIPIWNPEAEDEVGPATAIREVKEVIYQYLEGGPVEYEGKYVKTGTADVKARSIQGSDIPFYMGAQGPIMLKTAGEIANGVLVNASNPKDFEVAVPKIEEGAKEAGRSLDEIDVAAYTCFSIDKDEDKAIEATKIVVAFIVMGSPDVVLERHGIDTEKAEQIAEAIGKGDFGTAIGLVDEDMIEAFSIAGDPDTVVDKIEELLKAGVTQVVVGSPIGPDKEKAIELVGQEVIPHFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
publication title Structure of coenzyme F(420) dependent methylenetetrahydromethanopterin reductase from two methanogenic archaea.
pubmed doi rcsb
molecule keywords COENZYME F420-DEPENDENT N5,N10-METHYLENETETRAHYDROMETHANOPTE
total genus 128
structure length 347
sequence length 347
ec nomenclature ec 1.5.98.2: 5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase.
pdb deposition date 2000-05-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00296 Bac_luciferase Luciferase-like monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.30 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Luciferase-like domain 1ezwA00
3B9NA 1EZWA 3FGCB 1RHCA 4US5D 4UWMA 5DQPA 5AECA 1XKJA 1F07A 1BSLA 3RAOA 3C8NA 2I7GA 2B81A 3B4YA 1LUCA 1NQKA 1M41A 1BRLA 5LXEA 1NFPA 1Z69A 3SDOA 3FGCA 1FVPA 4J2PA 1LUCB 1YW1A 3B9OA 1TVLA 1BRLB 4US5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZEPA 4IIEA 3B9NA 4QE5A 2IS7A 2ACQA 1LBLA 1TV2A 2F61A 4NZ1A 3UP8A 1W1IE 4IPLA 1H11A 4LAUA 7XIMA 3LTSA 3EYPA 4GC3A 1UOZA 4JY9A 3TQVA 3AIQA 4TVUA 3AS1A 1RBLA 1Y8BA 1H4PA 1JRCA 1PZ2A 3ZLGA 1CDGA 1XYBA 3EWWA 1V93A 3O6AA 4AYGA 3W1LA 3L66A 4GC4A 3AMLA 5D05A 1V77A 5IFPA 1KFLA 1GG1A 3W02A 4ZSUA 3W72A 2DEPA 3GVGA 1HTIA 1P0BA 4NVTA 1OSEA 2OLSA 3ZJKA 4PULA 2FMOA 4MOZA 3RGTA 3MDWA 3FKKA 1OM0A 3K13A 3V5OA 4WOQA 1BWLA 1R7OA 5J5RA 3GXTA 4TMBA 4E4FA 1SPQA 1CYGA 1XLLA 4DJFD 3WNPA 1H1YA 1NSJA 1CZ1A 1PEZA 5HMEA 1J0HA 1OYAA 2JF7A 4Z2IA 1UZDA 3B0PA 4JQAA 4X2RA 2WZHA 2J13A 1DJHA 1JJKA 1IWPA 4GCXA 5AC7A 3HQ1A 5CGMA 3C5QA 2HK0A 5AC4A 1EF3A 3MPGA 4QAWA 3VIKA 2A7NA 3S2NA 1F05A 5AVHA 4XAGA 1EZ2A 1MRQA 4B90A 4QG6A 1TV5A 3VKDA 4QDMA 3PWIA 4JR5A 4DPPA 3FAXA 4H41A 4NX0A 1DEDA 1N55A 1IR1A 4BA0A 3MI3A 4S3BA 4Y9NA 4RDZA 1Q63A 3NZPA 4ZOCA 2BP1A 4H9YA 3VIIA 5FL0A 2P76A 1UKTA 3F4NA 3WSUA 3NEHA 1FWFC 4NUWA 2H90A 4JDBA 1T7LA 3QF0A 4DAFA 3R89A 1VP5A 4PCNA 3VIGA 4J5NA 1Y5VA 1AK5A 4CNOA 5FCZA 3PR2A 4M82A 3QOMA 4LYRA 1QW7A 4O1AA 3USZA 3KL3A 3HFYA 3U2ZA 3N2BA 2HXTA 2GYIA 4LVFA 3URQA 2C1IA 3AJ7A 3Q67A 5HWMA 4HTBA 5EB8A 4MY9A 1B3WA 4UNKA 3E2VA 1XFCA 2VRKA 1HL8A 4LJ3A 3LCXA 3VGHA 2FVMA 2QQ6A 5K4XA 2XH7A 2QV5A 1BWVA 1L0PA 5HNUA 4Y7EA 3OHMB 1QNVA 2GVEA 3LCFA 4JBRA 4R27A 3K30A 1L9WA 1UB3A 4WVXA 3AS0A 3BZGA 3QW3A 3SGZA 1KFWA 4LVAA 4QEHA 1Q2RA 2OYKA 1TTIA 3QSRA 3SJNA 3T2OA 2WMJA 3TA6A 1XIMA 1LCOA 1LT8A 3KOZA 2EKGA 3UD6A 3AZRA 4K6AA 5LGXA 4CCZA 1IXNA 4Q8QA 3MCOA 1YADA 3SJ3A 1D8CA 4YCPA 1NDYA 1NP2A 3FSTA 4UTTA 2YL6A 1QASA 3NO5A 3MBFA 2YPIA 4LUSB 2QULA 1UBSA 1XL9A 2WVSA 1NARA 3W85A 2YZRA 2WMHA 3A64A 2DIKA 2PDWA 5D4YA 4A35A 3UJEA 4WDXA 3CV1A 2O7SA 2I9UA 3BTNA 4ATLA 1M3UA 4UTTC 2BOGX 3MB9A 4JFWA 4BEUA 1VS1A 1KB3A 4DUXA 1BSLA 2WVTA 4AYSA 3NWRA 3M5VA 3FJ6A 4G1NA 4R53A 1EJVC 1P43A 3BXWA 4QLJA 2WQDA 3PUEA 5JH1A 2YLLA 3NDOA 3W84A 1IT7A 4P8VA 3AALA 1RCXB 3WLQA 1TMHA 3MI2A 3FLUA 1DQWA 1A5BA 1HP5A 3QYQA 3GHSA 1FWIC 1R3YA 1XLFA 5LIUX 4TMCA 3KDNA 4ASTA 3RR1A 3GNNA 4AVOA 5HK4A 4Q8MA 1ZLPA 1E4NA 3IGXA 1J79A 3DGBA 1E40A 5GJNA 4MGGA 4GX9A 1BSIA 2XZ7A 1YNPA 3RU6A 3DFYA 1K02A 4FLOA 1D8WA 2OODA 4LY4A 1PCKA 4UOZA 1XJBA 2RUSA 2FJUB 4DJEA 2XISA 2A7PA 4JTKA 3I10A 4AZBA 4R33A 1F3XA 2XYLA 1MQPA 5LKYA 1YIXA 1IF2A 4WKAA 1V51A 5AY7A 4LUSA 4IL0A 1REQB 3WUBA 2P0IA 4PUEA 4Z0JA 1GOXA 2QVNA 4AY1A 2J9ZA 3QBUA 4AF0B 1LZOA 3HOJA 5AZ0A 3V36A 1BHGA 3W1MA 1H41A 1FDJA 4PGLA 3R12A 2W9MA 3GC4A 4K38A 2ZZ2A 3M07A 4PTXA 3N15A 3SSZA 2CYGA 5DELA 3GDRA 4C90A 3OGRA 2BASA 2XM1A 1V6WA 4GABA 4IGSA 4Q4RA 3UNDA 4HNUA 6REQB 1G6CA 2DV0A 3FX4A 5K9DA 3V16A 1JDAA 3VNLA 1GWJA 1W2PA 3HZ3A 1CI1A 4MB5A 4JFTA 3BL3A 1UWIA 4NXSA 2WMFA 2DT1A 3R11A 4C7DA 1MQQA 3D46A 4N4QA 1IR2A 3K4DA 3LMYA 2YL5A 4PEEA 1JZ8A 3QTGA 1Z6KA 2CPUA 2OEKA 3USBA 1DTNA 4LALA 1HZYA 3SIMA 3VIFA 2V63A 3OLDA 4U5KA 4H6QA 1Z32X 3I6TA 2DSVA 1CEOA 4BR1A 1TRDA 5E9XA 4GOAA 3L12A 4ICCX 1VENA 2E9LA 2FDSA 3PULA 4LF1A 2WBKA 4G1KA 3TXVA 4YVXA 1M04A 1DP0A 3VIPA 2X2YA 1UPMB 2CBVA 3C2EA 1Q7MA 3FHAA 4C1KA 4XV0A 5FJOA 3AZTA 1T96A 2XIIA 3NURA 1XISA 2CHNA 3T7VA 4B91A 2EHHA 2Y63A 2D2GA 3LPOA 3A13A 3AMKA 1JPDX 1REQA 4Q6JA 1SZRA 1Z69A 1OFPA 3W37A 4IXHA 1LUCB 4GUIA 2R1KA 4AF0A 2OT0A 4CD5A 4LV4A 3PB2A 3EXTA 2GWGA 3W7PA 3KTSA 5FJUA 2J66A 4XWUA 3HMJG 2YDQA 1IEXA 3WEOA 1W31A 3LHTA 3SZ8A 6REQA 3FY1A 3MCNA 4M5PA 2WSPA 2EF9A 1JG9A 3DYPA 4KEZA 4ECLA 1RLDA 5A2BA 3LCGA 4PTNA 2G3MA 3NM3A 3NZ1A 3GIQA 3MO7A 2O4MA 5FA5A 1PAMA 3AYTA 3RO6A 4WY0F 3TW9A 1D7KA 3BSMA 3BOLA 2O0TA 4H7VA 2BHZA 4M24A 1GQIA 2Y62A 2GVGA 1RHCA 1Q85A 4P7OA 5CGTA 4YVVA 3T81A 2JGQA 4CD7A 1H7OA 1UUOA 2C13A 2F6UA 3OW1A 2G3FA 3RM4A 5JBDA 4U10A 2EPNA 5DY3A 4HKPA 3UJSA 4AD3A 1OX6A 3MP4A 3WQCA 1ONWA 2ZKMX 2W5FA 1S39A 1VFFA 1P1MA 1SJDA 1F4AA 3XISA 1UZHA 3ARVA 4LBSA 4U4MA 5AYZA 3OYZA 4AEEA 1QPNA 1YPIA 3APGA 5GPRA 2CWNA 1B3XA 2GJPA 1LUCA 3L2MA 1FP8A 3CQ0A 2IPJA 1JL8A 1C9DA 3DN5A 1WCGA 4PMOA 2ZRUA 1OCBA 3BMXA 3GTFA 4DJED 3BSGA 2X1RA 5CPTA 2VELA 1JFHA 3P8JA 1AG1O 4XZIA 3L0NA 1S2WA 1UH3A 3TTEA 1PS9A 2IQDA 4QSFA 1OFEA 3LHWA 2V5KA 2ZYFA 3EKGA 3M64A 1QMLA 2CZVA 3M44A 5F4WA 4CQCA 3IS4A 1W3NA 4V2XA 1TR1A 3VILA 4WSKA 1RVGA 3E0VA 3FS2A 3MYOA 3VCCA 2DJXA 1AW1A 1UR4A 4X3ZA 1LYXA 4UTLA 3DBPA 3R8RA 3M0ZA 3ZJ6A 4OT7A 3V0TA 5IXEA 3WQFA 3WBAA 5D33A 3IGUA 3QW4B 3L21A 4YPJA 3NOYA 2OO0A 3HPFA 2ONEA 5JVLA 4HOWA 2W0UA 1E72M 1VPYA 1VIWA 1D3CA 2PDPA 3MWCA 3QFEA 2YDSA 5FEXA 2Y89A 3ZT7A 1UD5A 4CN6A 4GVHA 4CNUA 1P6CA 4X22A 4JKMA 5DBTA 3QR1A 2FZNA 4UC5A 2YB4A 3V0SA 5BYWA 2NWSA 4Z1YA 3ONCA 1RY8A 4OKDA 3KFTA 3P81A 2DW7A 2BY3A 5C9RA 5CPNA 4H19A 4XSLA 4GXMA 2YA0A 5I6SA 1W5NA 4LVGA 4YS1A 1HKKA 5HMFA 3VKCA 2WJEA 3W7IA 2BXVA 3RYSA 5HPOA 1AD1A 3QKEA 1NU5A 4AEFA 1I2RA 3LHZA 4P7LA 2B7PA 4F0LA 4DJDC 2XWEA 1BQGA 4F40A 5AHLA 4JN8A 2PWGA 3TJXA 1AL7A 3MA8A 4A21A 3LK6A 1X39A 3AISA 3THQA 1S5NA 3LZ5A 4BI7A 1WB0A 4S3DA 1W1TA 5A8PA 5G1TA 3GNXA 4NASA 2CU0A 4HP5A 2WKGA 2BG5A 1J0ZA 1WXYA 3QPYA 2NUWA 1GNXA 2GGGA 4O16A 4DUVA 1T99A 3VE9A 4LCQA 1TR9A 1VBJA 6TAAA 4AMAA 2EJ1A 3L0GA 1GZ1A 1KBJA 2QYGA 1LG1A 4F8XA 4D2JA 2BHUA 1GEQA 2QZRA 5TD4A 4D6JA 3R0UA 1BYCA 2A3LA 4AQLA 5M5DA 3SN0A 1SUXA 1ZSXA 1QWKA 1E1EA 4WGXA 1IZCA 5BXRA 4RX0A 3WDHA 1TYGA 1W56A 3TEVA 2ABBA 4DZIA 1RSCA 3GXPA 1XPGA 1J0KA 3O0FA 3TN4A 2PUZA 4DZAA 3LM7A 5BW6A 5CH9A 3QV9A 3A21A 2D0FA 1SO6A 2VHLA 1XYMA 3BGAA 3REQB 3SURA 1C9WA 5DCEA 1R2RA 4ADSA 2VEFA 1UR3M 2YL9A 2JIEA 4KPLA 1I2NA 3M0IA 3KZPA 1PIIA 3CPGA 2GQ8A 3UGRA 2Z1WA 3MWAA 4R3UA 1GVSA 1XIBA 1Z9AA 1KFCA 5MF5A 1N7KA 1R2TA 2GVYA 1ITQA 3VIOA 2C0HA 1JCXA 2GJNA 4NAFB 3EA1A 3TKFA 2XN1A 3WKZA 4CU6A 3G24A 4CQ8A 3DFQA 3WD3A 4M56A 1JD9A 4R7WA 4ZFMA 2D2OA 2Q3OA 2VC6A 2HNEA 1E71M 4HYWA 4QTGA 4AMCA 3KL0A 4Y8EA 4HOXA 3RR4A 1VBRA 4AZHA 3AOFA 4Q4PA 1QHPA 3TA9A 3OO2A 2NV2A 3ITLA 1OABA 1MXDA 1M1BA 4HK5A 1FXPA 3K8MA 2PEVA 4PCSA 1U5HA 3WH7A 4OTKA 2D2HA 4GYJA 3S5YA 4H2CA 2OYLA 4UOQA 4JIIX 3O3RA 3NVTA 4GY7A 3BMVA 4FF5A 1PKMA 2O7QA 2VWTA 1XSJA 1A5AA 1TTPA 1WZMA 1J96A 3URBA 2E9BA 4TO8A 2CNCA 3GXMA 3GFXA 4NHVA 2OB3A 5CC3A 3UVAA 1I9CB 1RR2A 1G67A 4ZE5A 2CLHA 4IG2B 3OQEA 1TWIA 1EJXC 4Y9PA 5DXYA 1GG0A 3REQA 1B90A 1YMYA 3A3WA 2QKFA 3TONA 1XM3A 1CXFA 3N04A 4GJ1A 2VMFA 2TRSA 2WSYA 1UKSA 3P6LA 5CBIA 1XH2A 1XCWA 1X8FA 1AMKA 4JXCA 4IICA 1BYDA 3SI9A 3URAA 3DESA 3WQDA 5CBJA 3QHNA 1QNRA 2WZMA 3ONBA 4JICA 3NTYA 1G4SA 2WPBA 4NAFA 1PTGA 3WLKX 3AZSA 3RJYA 3QRHA 5D04C 2OPJA 4N6FA 3E96A 3HG4A 4GE8A 4AZIA 3UGVA 4C1NB 3DECA 3CBWA 5G4EA 3TDFA 3WZ0E 2IKHA 1C8QA 3R1ZA 4CNTA 4YTRA 2NQ5A 4MWAD 3L4YA 2OX1A 5CPOA 3MMDA 1KM1A 2Y4SA 2ZUWA 4O28A 1V3KA 2YDAA 4JHZA 1XRTA 4ZQRA 3U2CA 3Q45A 5BXPA 4MPKA 1NELA 1TREA 3E3HA 3NCOA 3P2VA 1VBUA 1NF7A 4IIBA 4QSHA 1KV8A 4DX3A 3PS7A 5BRBA 5BXSA 4JL2A 3SCNA 4R5EA 4IZGA 5I3JA 4J2MA 4W7WA 4GIAA 1JCYA 1LTDA 4AXKA 3V0UA 3VKAA 4RZ4A 1CGUA 4L7ZA 4UMAA 3VZYA 4EF8A 3NGFA 1V02A 4WJXA 1U22A 2EBNA 2PP0A 4I9JA 3DDMA 3L67A 3OHIA 2R14A 4IG2A 4GFSA 2Z2AA 4U5IA 1W3KA 5LHEA 3UJ2A 4BF7A 3PPHA 2W91A 4DLMA 4WJ8A 1KGXA 4QP0A 3LRKA 2HBXA 1DQXA 5C2XA 4JKKA 1TPDA 2E67A 4H7ZA 1SO5A 2VDGA 5BOOA 4TVCA 1TPWA 3KHDA 4WKFA 1ME8A 4MNLA 3W1RA 2OXNA 1FP9A 1TG7A 4LCRA 3RM8A 4QLKA 4Q7BA 2HS6A 1K1DA 2P88A 4P61A 3I3EA 3VMPA 2XH2A 1X6LA 1X6NA 5U4NA 1W3JA 4WDTA 2FHCA 1TX2A 3UVIA 1NFBA 2PDCA 4YTUA 3WCZA 3BLIA 4C1NA 3IJ6A 4S1FA 4I5UA 3K4AA 1DPMA 3E9AA 4O11A 4GO9A 3A5VA 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