1F6KA

Crystal structure analysis of n-acetylneuraminate lyase from haemophilus influenzae: crystal form ii
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
MRDLKGIFSALLVSFNEDGTINEKGLRQIIRHNIDKMKVDGLYVGGSTGENFMLSTEEKKEIFRIAKDEAKDQIALIAQVGSVNLKEAVELGKYATELGYDCLSAVTPFYYKFSFPEIKHYYDTIIAETGSNMIVYSIPFLTGVNMGIEQFGELYKNPKVLGVKFTAGDFYLLERLKKAYPNHLIWAGFDEMMLPAASLGVDGAIGSTFNVNGVRARQIFELTKAGKLKEALEIQHVTNDLIEGILANGLYLTIKELLKLEGVDAGYCREPMTSKATAEQVAKAKDLKAKFLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Active site modulation in the N-acetylneuraminate lyase sub-family as revealed by the structure of the inhibitor-complexed Haemophilus influenzae enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-ACETYLNEURAMINATE LYASE
molecule tags Lyase
source organism Haemophilus influenzae
total genus 120
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.1.3.3: N-acetylneuraminate lyase.
pdb deposition date 2000-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1f6kA00
1JVNA 4GUIA 2QCEA 5AB3A 4HT3A 3LDVA 1ICSA 1H5YA 1X7FA 2CZFA 3HPSA 2NV2A 2YR1A 3G3DA 2Z6IA 3EKZA 1K02A 5BW6A 1ZALA 4M7SA 3TAKA 1JCLA 1H62A 4LV4A 5KZEA 5AHMA 1DQWA 4HNNA 4KFNA 4YLWA 1G7UA 1I8JA 1UB3A 3W1LA 2Y70A 1SO5A 1W5PA 4Z0SA 4MJMA 3DGRA 3L21A 1I2OA 4JYDA 4JYFA 3W75A 2PCQA 2GJLA 4YCPA 6TIMA 3OVPA 1SO6A 3U6WA 4Y9AA 2GJNA 2ZA1A 1GQNA 4UTLA 4UTJA 1X8FA 2YX0A 3LTSA 4DBEA 3N34A 3F1QA 1SW7A 5D2TA 5HNRA 1F76A 4O54A 1P5BA 2FTPA 3PUOA 5AC7A 5D02A 1A5CA 3KRZA 4DO5A 4DELA 5DN1A 2VEPA 1RQEA 2QJIA 2OT1A 1EP1A 4AAJA 1OJXA 5FEXA 3W1UA 5EL1A 3RFAA 4QNEA 3GNNA 1UASA 2VEIA 5G4EA 1W5QA 5CZSA 5AYYA 1VCVA 1VYPX 3G1VA 1RR2A 3IEBA 1TPC1 4JR5A 1B57A 5LGXA 5LNWA 1NSJA 3HGJA 1BKSA 3MUXA 2Y61A 3G0SA 1E51A 3D0CA 1IF2A 1KFCA 2EKCA 3W7CA 5BOOA 3TSMA 3BW2A 2FB3A 3GVGA 2EGZA 3L0NA 2YGYA 4H3DA 3GNDA 3MP3A 4U28A 4ZQOA 3DKLA 1FQ0A 1UCWA 5F2GA 1JUEA 3EX4A 4AHPA 5HMSA 2FFCA 3YPIA 2ZZ5A 3G1HA 4UFMA 1TYGA 1LP6A 4JEQA 5U4NA 1OFPA 4N9CA 2A7RA 3M7WA 3TAOA 3QSTA 3E9AA 3W1TA 5D09A 5BRBA 3O63A 1OFRA 2NX3A 1W37A 2ZTKA 3CLMA 3P61A 2HTMA 3QSRA 3DKJA 1EWEA 3M6YA 4UTKA 4GWEA 2R94A 4WY0F 1YPFA 3B0VC 4FNQA 4JIQA 4TMBA 1EWDA 4ZQRA 5DXYA 2OZ0A 3MJYA 4BWLC 3QW4B 2W0UA 1OFDA 4GE8A 3ZFHA 1CX9A 1W8SA 1JRBA 5KZMA 5FI8A 3QPZA 4KFPA 3A21A 4JX6A 1W0MA 3PULA 2YCEA 4K8EA 5DCBA 5EBUA 1DVJA 1VR6A 1O95A 1IGSA 1G7VA 4DQWA 4G1KA 3BG9A 3NVTA 5EA9A 1GG1A 2V9DA 1F6KA 4RZ6A 5HINA 1XL9A 4QSHA 4IX2A 3TC7A 2TRSA 1ME7A 1DV7A 1TPWA 1LBMA 3PAJA 1HO1A 2YFNA 4FNRA 3EKLA 3W1QA 4O11A 4PODA 1Z48A 1IXPA 1LOSA 4MFDA 4K37A 2A1YA 4WXZA 3PB0A 2H90A 3SZ8A 4UFKA 4BI5A 1RD5A 3H53A 3U2OA 5H2ZA 1LYXA 5LHEA 3OHIA 3CTLA 4I7WA 1YADA 1KFBA 3W7MA 2X1RA 4PTNA 5K9DA 1KW1A 2Y85A 1G69A 2HSAA 2YDAA 3QC3A 2G97A 4D2JA 1OX4B 4JDBA 3UWYA 4Y96A 3MYOA 5D2WA 1I2RA 1KV8A 4FO4A 2ISSA 1KTNA 3ZWSA 1M7OA 4GXMA 4Z1DA 4QNWA 2C0AA 2O7SA 4OV4A 3TMQA 4MYXA 3LCFA 2C19A 1I45A 2ALDA 5KMYA 5IBXA 2QCGA 3P8IA 1G4TA 3FOKA 1B4EA 1EP3A 2JKPA 3QH2A 1W3NA 3W7GA 1UUMA 1Q45A 3IV3A 3W7DA 2E68A 3O07A 4K39A 3MO7A 4UTTC 1SSGA 1D9EA 2V2DA 3WJWA 1EB3A 1TPUA 4FNTA 4JNMA 2V5BA 4GUJA 2VELA 3TQ0A 1G6CA 4LOCA 2PURA 1MEIA 4JY9A 3LOTA 2LLEA 2J9ZA 2Y7GA 4MY8A 1OFEA 4MJZA 3O06A 3OBKA 5K9CA 3DAQA 3E0IA 5DY2A 1ZAJA 1ICQA 3LV6A 4XTDA 4RJEA 4O18A 4ADTA 3NQGA 1WXJA 4EOUA 4OWGA 4MIMA 3CEUA 3G24A 5FESA 4UR7A 5KTLA 1N55A 3MHFA 3TXZA 3NA8A 1FDZA 1H61A 1UUOA 3L0KA 3IVSA 1DHPA 1LLZA 2A0NA 2ZRUA 4NNAA 4Y6GA 5I3IA 3C6CA 1XUZA 3NM1A 3B8DA 3W85A 3ZWTA 1SO3A 3NR0A 2HS6A 2JKEA 1QPNA 3HG2A 2WNZA 3PS7A 4UFLA 3MHGA 3R89A 4HPXA 4UFIA 5BNKA 4IGHA 3OA3A 2GQ9A 3TA6A 5I3HA 4H6KA 3G8EA 4O12A 1H7RA 1XXXA 4X3ZA 4M5PA 1JUBA 3BW4A 2OMAA 3CWOX 1KM1A 3P80A 3TMLA 3W1MA 4KKXA 4AHOA 5K2ZA 1OF8A 4RCXA 3DXIA 4ZZ9A 1FCVA 2Q3OA 3W23A 1TPEA 5F4WA 5I3GA 4IMFA 2PC4A 4O17A 3DI1A 1VCFA 3EWZA 4MZ1A 3ZS4A 3VE7A 1TTIA 5EMUA 3TUUA 4B5NA 3SGZA 3C2EA 3FFSA 3E02A 1OFQA 3HGOA 4JTIA 5A5WA 5HR6A 4MLRA 4A2SA 3CT7A 5AYZA 1KFJA 4ZL1A 2CLKA 1LRQA 3V1PA 3S5NA 1GVFA 2QF7A 1FXPA 4TX9A 3TQVA 1G4PA 2CWNA 3LXBA 4WUIA 3W1XA 3PSWA 3BV4A 3W7PA 1P0KA 1YLVA 4FXSA 4DBDA 5DELA 4NX5A 1M7PA 4PH6A 1A5SA 4ADSA 2QCNA 4AEOA 1BWKA 4BR1A 4WY0A 2GVGA 3CB8A 1M6JA 1TRDA 2VC6A 2NV1A 2CLLA 3I65A 3NAVA 2A6NA 3L5LA 1TV7A 1S3HA 3WJXA 3B06A 3HG5A 4NZFA 4BWLA 1XBYA 3PG9A 3PUDA 3GXTA 3B4UA 3L9CA 3Q58A 2I9EA 2X1TA 3C52A 3DZ1A 2H6RA 3MHUA 1EUNA 3IGXA 1LLWA 2EAWA 1FX6A 3PVFA 1SQ7A 3FJ6A 2V30A 3F03K 3LBCA 3PF3A 3QRHA 5LNRA 1OX6A 3NDOA 2E5CA 1VYRA 2Y62A 3UQNA 2VFDA 4M6VA 2X30A 4AVFA 3L68A 4LU0A 5AC6A 5F2IA 3HOJA 1Q6LA 5CPMA 3W7RA 3C0JA 1TMHA 4Z1CA 5LSMA 1N7KA 3C56A 4LY8A 3G1YA 1WBJA 3M16A 4JICA 4N2YA 2P10A 2TYSA 2QDHA 3GK0A 5J5DA 1SU5A 5C6MA 1GWJA 1XBVA 1SZGA 4HIBA 2CZEA 3W87A 4Y90A 1PCKA 3NPUA 3L0GA 4N02A 4N6FA 1W31A 3O6YX 5FEWA 2CLFA 3SI9A 1ME8A 3NQ6A 4JGDA 4OHQA 1YXDA 5G5IA 3VFLA 4A3UA 1F74A 2C18A 1W5NA 4FXRA 3MI6A 3IGSA 3T40A 1FBAA 1W1ZA 1M5WA 4FNUA 5D05A 3T78A 4LS2A 1TTPA 3DFOA 2V5LA 1BTMA 3NZ1A 4NVTA 1NF7A 4XBKA 1G4SA 2Y7FA 1AK5A 3UXAA 4HHPA 3RK8A 3HMJG 3NEVA 1D3HA 4QM1A 1GVOA 4P2VA 4UUIA 1WQ5A 3OG3A 3W1RA 2Z6JA 3FYPA 1H50A 1FWSA 3IGUA 5IBXC 3C4UA 2H8ZA 5G1TA 3TQKA 1ZFJA 2VXNA 1T0OA 3CU2A 3LLFA 5TQLA 2FPTA 3W7IA 5AHFA 4MOZA 4K6AA 3W71A 1Z44A 3NPVA 3SECA 2J24A 1JRCA 2E5DA 1JQXA 3ATZA 3DI0A 4OGZA 1VLWA 2CU0A 4DO6A 1XI3A 1WX0A 3W2KA 1BEUA 1K3UA 2JGQA 1XCFA 1I2NA 2QCFA 3BLIA 3DFSA 4MVAA 5F2MA 1B4KA 4IMCA 1CW2A 1H7XA 1FWTA 4KWVA 3GLCA 5LGZA 4IPJA 2FDSA 1SZFA 3NQEA 4UTIA 5K3VA 2ZA3A 2NZLA 3IIXA 1R2SA 1EIXA 3S1WA 3EX3A 4N9DA 1GEQA 2QCMA 3S0CA 3S42A 4LW7A 3W76A 2E77A 2NX1A 2ZRZA 4E2DA 2Y89A 1KM5A 3WFAA 4O0KA 4TMCA 1KM4A 2NXHA 1LROA 3B04A 4TU1A 5FF0A 3IIVA 3NQVA 3UYCA 4LVGA 4AWSA 3LBMA 3M1ZA 1FWWA 2A85A 3KHJA 2JK2A 1TSIA 3TKFA 3QFEA 3MWAA 3STGA 2QCLA 5TIMA 3CEPA 4IWWA 3WK3A 5AYXA 4X9SA 3M44A 2C1HA 3L66A 4RKAA 2D73A 3SR7A 3SW6A 5MHBA 1A5BA 2DZXA 1GTEA 3GYEA 5D33A 3GAKA 5HUOA 5D2VA 3HGSA 1LBLA 3QQ1A 1J5TA 5AOUA 3Q94A 5HJLA 3S5OA 2QAFA 3OVQA 2GPTA 3LXAA 3VI2A 3NQ7A 1KTBA 2J9YA 2A21A 2NXIA 3A5VA 4OE7A 4WY0B 1ALDA 1JCJA 4C1KA 1FCBA 2BZNA 3P67A 4BI7A 5AHLA 2KZHA 3W22A 2WKJA 1Q6RA 2VFHA 2UV8G 3LHVA 5AFDA 3LI0A 2Y88A 3VCRA 4XZ9A 1K7FA 1LOLA 1OFBA 1ZJIA 3WK2A 2C16A 4N9BA 1PS9A 3HBLA 2Y7EA 3PBVA 4YXGA 3G3MA 4HKPA 1G4EA 3PR2A 4WZHA 3UWUA 5E0KA 3UY7A 4Y8FA 1U5JA 4LV9A 3S1VA 4QISA 3P7YA 2FPYA 3QM3A 2WNQA 1QO2A 4ZQNA 2ZZ6A 5FF3A 1F05A 4AH7A 1MEHA 3UWQA 2PRHA 2ZZ7A 3G1FA 4IXHA 3N14A 3S1UA 3DFPA 2ZZ2A 1RPXA 1YYAA 1KM2A 1SR9A 1YPIA 1YDNA 3GX9A 3MMTA 3CQ0A 4NJGA 5D32A 3PBWA 1LRNA 5A8GA 3NOEA 1OYAA 2CZ5A 4WJEA 2EPHA 3N2XA 4I7VA 1FY6A 1HFBA 1TREA 4WOQA 1CI1A 1TIMA 3RNDA 1TPVA 3CPRA 3E49A 4IQLA 4R7JA 1AMKA 2TPSA 3N9RA 1DJQA 3DHFA 3S5YA 2DJXA 1F5ZA 3G0UA 3EWBX 3LTPA 1L6WA 2Y6ZA 3UPBA 5D04C 1EUAA 1KBIA 4GUFA 3A24A 1MSSA 3TC6A 5FF4A 4FX8A 4Z1AA 3LHYA 3DFNA 4LVAA 5SWUA 4Q33A 3KAOA 5G2WA 3MI2A 2C14A 4OT7A 1PHWA 3HIJA 4GJ1A 3GDLA 1SW0A 2HMCA 4JN6A 4WX2A 3BARA 4IXXA 5CPLA 3NPXA 4EIVA 4ZQMA 1H7PA 4UFHA 4NJHA 4CQ9A 4KWWA 3STCA 4UTHA 2QJGA 4E2BA 2BLEA 4LT9A 2I14A 2Z0IA 3NQDA 2FIQA 4JTUA 4XKYA 2GQAA 1EP2A 4AMAA 1A53A 5CPNA 2R91A 2BTMA 3PC0A 3UPWA 1SZNA 2YSWA 2J88A 4ZQPA 4WD0A 2P0OA 1LM1A 3MW7A 3SGUA 1VYSX 3RMJA 5LKYA 1YXCA 5C5YA 4UIOA 1X1OA 4X2RA 1QFEA 2J27A 3C8FA 3B03A 4CCCA 3EWYA 4JIPA 3LHUA 1K8YA 4PCFA 4S1FA 1KM0A 4DF0A 3QYQA 1HTIA 2VEKA 3TIMA 4CLMA 3EB2A 3W83A 2WJZA 2RDTA 4EWND 2VFFA 2ZRYA 3GKFA 2TSYA 2PRLA 1OX5A 3G1DA 3W7JA 8TIMA 2Y63A 3IIZA 1ZENA 3GR7A 5GVJA 3W7OA 1YDOA 4N4PA 4IOTA 4GRSA 1ICPA 4P61A 5KZDA 1GVSA 4FEZA 3LCGA 2XN0A 1OFOA 2VFIA 1VCGA 2Q3RA 1F6PA 3TSBA 5K4ZA 3GAYA 4A2RA 3M0ZA 3THAA 4HNTA 3QMTA 4QQ3A 2FJKA 4YCOA 3ELFA 1THFD 1WBHA 1RZMA 3GXPA 4MLJA 1TQJA 5CZJA 3ATYA 3BG3A 5G2HA 4UNLA 3TW7A 4RLIA 1R2TA 1GVRA 5E93A 1TPH1 3F4NA 3GKAA 4CNNA 3NNTA 4U4MA 3O1NA 3UNDA 1EEPA 3FEMA 4K36A 2I1OA 2W79A 3BLEA 2VFGA 1L6YA 4FX6M 4FIRA 4LS0A 2B7QA 4PEKA 4RR4A 3PY2A 4DXVA 5L6UA 2NUXA 4NZJA 3W1NA 4JD4A 3W3OA 2RKXA 6ALDA 3W2LA 2WV8A 3T7VA 2RFGA 1Z42A 3MP4A 1GT8A 3DU0A 1VC4A 1Q3NA 2NLIA 4JTGA 4XUGA 3KVLA 1Q6QA 4ORMA 2CLHA 1YTKA 4AXKA 2G96A 4IPIA 2YXGA 5I3FA 2B4GA 2XFWA 1XKYA 1FWRA 4R33A 2Z1BA 3TW6A 4PFMA 2RDWA 1AG1O 1KBJA 2B7PA 2CFFA 1RVGA 1LCOA 1XUUA 3TJXA 3N2MA 3Q37A 3TFXA 4O52A 3RLVA 1WOAA 4OV9A 4FF7A 3NXFA 3NPWA 1JCYA 3TROA 2QKFA 3DH7A 1ADOA 1FXQA 3I6RA 2ZDRA 2Q8LA 3W7HA 2G95A 1A5AA 3W2JA 1SW3A 5HULA 1QOPA 1R30A 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 2ABA A;  1QDS A;  3C2V A;  3GB6 A;  4FX7 A;  4JXC A;  1H7N A;  3HB9 A;  3N3M A;  1PCW A;  1YDV A;  1IIG A;  1H60 A;  1EPX A;  1KTC A;  2ZRV A;  4L4L A;  3TE9 A;  4JY8 A;  1TCD A;  2RH9 A;  2YYT A;  3USB A;  5BMW A;  4JTF A;  4GFS A;  2VEN A;  2Z2U A;  4JTH A;  1VPX A;  3KXQ A;  2ZRW A;  4NX0 A;  2DZU A;  5T26 A;  3P82 A;  4TO8 A;  2AGK A;  1SO4 A;  3MP5 A;  1R47 A;  4AF0 B;  3P60 A;  5DY3 A;  1JCM P;  1WOB A;  5F4X A;  1L9W A;  1W5M A;  3W86 A;  4NNC A;  1W5O A;  1OYB A;  1YTE A;  1OK6 A;  1IXQ A;  2BSL A;  1LBF A;  1QO5 A;  2ZBT A;  5EYW A;  1K7X A;  4HSN A;  3HPZ A;  4AWT A;  3TXV A;  1C8V A;  1LRT A;  1WAU A;  4IME A;  3EWU A;  2WQP A;  1C29 A;  1JJK A;  1W54 A;  1K7E A;  4POC A;  4ZVJ A;  2QUV A;  1FWN A;  1OF6 A;  3DHD A;  1GTH A;  4K7V A;  3I7Q A;  1NFB A;  3STF A;  1JCN A;  3LRK A;  4E38 A;  2W6R A;  1SFL A;  3MBD A;  3W7E A;  2BX7 A;  4XBS A;  1VHN A;  4NU7 A;  4UTT A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4GUI A;  4HP5 A;  3DEQ A;  4L6O A;  3LDV A;  4QLK A;  3PJU A;  1UOZ A;  3GXF A;  3WG6 A;  3EKZ A;  1K02 A;  1WZA A;  2BB0 A;  1JL8 A;  1H62 A;  1OT2 A;  2YL9 A;  4YLW A;  1I8J A;  4JOM A;  3VFC A;  3W1L A;  4GI8 A;  1W5P A;  3BLD A;  4GYP C;  4PMO A;  1AFS A;  3W75 A;  4JYD A;  3VVG A;  2PCQ A;  4ACZ A;  3POC A;  1XII A;  3OVP A;  2XM1 A;  2GJN A;  3IAP A;  1X8F A;  3F1Q A;  5D2T A;  3SQM A;  4EPE C;  2Y4S A;  3ID7 A;  1Y5W A;  4O54 A;  3RM9 A;  1P5B A;  2FTP A;  5D02 A;  4DO5 A;  4HSH A;  4CVU A;  4AZC B;  1MMF A;  2I16 A;  4DWS C;  4AZI A;  1EDG A;  3GNN A;  2VEI A;  2VZV A;  3QV6 A;  1V6V A;  5CZS A;  3CQK A;  1RR2 A;  2BOF X;  1V0L A;  1GOR A;  1QHO A;  4P7O A;  4PN2 A;  3CNY A;  2Y61 A;  3DFY A;  3PUG A;  1JD7 A;  3W7C A;  3U2E A;  1BYA A;  3B9E A;  3W25 A;  3WBX A;  3OLG A;  2FB3 A;  3II1 A;  3GVG A;  4JFU A;  3L0N A;  5RUB A;  1BQC A;  1FP8 A;  1JPK A;  1JUE A;  4AHP A;  2DSK A;  1RCQ A;  2PLJ A;  4DJE C;  3HFT A;  3CHC A;  5BWA A;  3MAN A;  3RM4 A;  4UFM A;  4ROQ A;  4I8Y A;  3GIP A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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