1F74A

Crystal structure analysis of n-acetylneuraminate lyase from haemophilus influenzae: crystal form ii complexed with 4-deoxy-sialic acid
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
MRDLKGIFSALLVSFNEDGTINEKGLRQIIRHNIDKMKVDGLYVGGSTGENFMLSTEEKKEIFRIAKDEAKDQIALIAQVGSVNLKEAVELGKYATELGYDCLSAVTPFYYKFSFPEIKHYYDTIIAETGSNMIVYSIPFLTGVNMGIEQFGELYKNPKVLGVKFTAGDFYLLERLKKAYPNHLIWAGFDEMMLPAASLGVDGAIGSTFNVNGVRARQIFELTKAGKLKEALEIQHVTNDLIEGILANGLYLTIKELLKLEGVDAGYCREPMTSKATAEQVAKAKDLKAKFLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Active site modulation in the N-acetylneuraminate lyase sub-family as revealed by the structure of the inhibitor-complexed Haemophilus influenzae enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-ACETYL-NEURAMINATE LYASE
molecule tags Lyase
source organism Haemophilus influenzae
total genus 125
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.1.3.3: N-acetylneuraminate lyase.
pdb deposition date 2000-06-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1f74A00
5LNWA 4O57A 4ALDA 5EKYA 2DZPA 4UFIA 1SW0A 1AW2A 4YLWA 4ZQMA 3EX4A 3W2UA 3BW3A 5HWJA 4FB7A 2C6QA 2Y63A 1KTCA 2CLLA 3TK7A 2WNZA 3MI2A 1EA0A 3W7NA 1MEWA 3TSBA 4CQ8A 3LM7A 1GYNA 3LTYA 3PS7A 4DPQA 3P82A 1VGAA 5AC6A 4CLMA 3LERA 1U5JA 4D2JA 2CU0A 3TW7A 1FCBA 2ZTJA 4O19A 5CZTA 1GTHA 3O6CA 4LRSA 3EWBX 1RQBA 2CLMA 1QOPA 5EA9A 1GZGA 4JTLA 2C18A 4DO6A 1H60A 2E6YA 3TC7A 5HMSA 3NGJA 2FPYA 3PVFA 1KBIA 4M7TA 1TPWA 1ZALA 2E1DA 1TQJA 3GZ3A 3GX9A 2E5BA 5HNRA 2GOUA 2PRMA 1CW2A 2C3ZA 1BWKA 1W8SA 3QEZA 3HF3A 2DZXA 4HNTA 4JNMA 1WOBA 4MVAA 5G4WA 4JD4A 5LNSA 2QCHA 3E12A 3QH2A 4LC6A 1WBHA 5KZEA 2EPHA 2ZDRA 4OBTA 2GJNA 5F4SA 3IIPA 1E51A 3HGSA 1LOSA 1ZY9A 5BRBA 1IXQA 5U7SA 2ZRZA 4UFMA 3I65A 1TTPA 1DJNA 3NL2A 3N9RA 4FXRA 4K7VA 3SY5A 5AHNA 3R12A 3DHFA 3DFTA 3FOKA 3KVLA 3W7CA 4CQ9A 5LGZA 3G8RA 3LCHA 3GIYA 4QAIA 3QZEA 1MEHA 5D2TA 1F7BA 2GQ9A 1ZAIA 2DZUA 4QM1A 1W3TA 4EVZA 2FLIA 1SO3A 3M16A 3NQ8A 5DY2A 1SZGA 4GC4A 3SECA 3TQ0A 3A21A 3LHUA 3L67A 3QPZA 4NJHA 4LOCA 3LB0A 3W7KA 2KZHA 3W07A 3TROA 5CZSA 4J9JA 1FXPA 1W56A 3Q2DA 1HUVA 3EWWA 3BGGA 3M5ZA 2JKAA 1OHLA 3MP4A 3E96A 2B4GA 3W1XA 1R46A 4IMGA 1EP1A 1EWDA 1OX4A 2O7SA 4KFNA 4RX0A 4A3UA 1K8XA 5CZ0A 1F6KA 1TPC1 2W6RA 4GRSA 4JTTA 1ZNNA 4UFLA 3W7JA 3GXNA 1NAL1 3DFPA 1TYGA 1CI1A 3PSWA 2J9ZA 1KM4A 3TW6A 1K3UA 1JCXA 1WV2A 3NR0A 3LRLA 4N6FA 5D03A 1IF2A 3OG3A 3HGOA 1H62A 3L66A 2P0OA 1Z41A 1MO0A 3NVTA 1F76A 3LGEA 3NQCA 1K8YA 3PG9A 1WXJA 1LOQA 4RXFA 5I3KA 4XWUA 2TPSA 2XN1A 3ABOA 3MHUA 1ZAHA 4O8RA 2QUTA 5FEXA 2EF9A 2WO5A 4JDYA 3W7EA 2YDAA 1I2NA 3W7HA 1B3OA 3W7GA 3W1LA 3HGRA 4MJMA 2OT1A 3IVTA 3OBKA 3LCIA 4RKAA 3W1RA 5J5DA 1BWLA 3JR2A 1TV5A 3T44A 1VPXA 1TV8A 4UTKA 3W75A 2P1FA 4JS3A 4PEKA 1AMKA 1WOAA 2R8WA 3TCEA 2P10A 3HPSA 4ADSA 3N14A 1ADOA 4A2SA 1SU5A 5KMYA 3MMTA 4N4QA 3NQ6A 4TMCA 3NZRA 2QCGA 3HO8A 2Z6IA 3DGRA 5G4EA 3VE7A 5F2IA 1JRCA 2YFNA 3W1NA 3IIVA 1LTDA 3VI2A 1JJKA 3W2JA 4HHPA 1VQTA 2IQTA 4AB4A 1YDNA 3G1HA 3USBA 3S0CA 3UXAA 1OYBA 2A7NA 5DXYA 3LX9A 4MY1A 4BI6A 2FJKA 1I45A 2BWGA 3KHJA 2RDWA 4MY8A 3K30A 3GR7A 5TIMA 1WX0A 4IGHA 3L68A 2ZZ4A 3LRKA 3G24A 3G3MA 3TUUA 1OFOA 1GOXA 3BLFA 3C4UA 2V5BA 2NX9A 2VC6A 5DBTA 3UWUA 5F1UA 3LTSA 4LV9A 1FWWA 1NEYA 1XUZA 3N2XA 1PCKA 1QPQA 3QMTA 1LORA 1Z42A 3CTLA 2NX1A 3C3NA 3INPA 5K2ZA 1TRIA 4NXKA 1TRDA 1LDCA 3N2MA 2FIQA 3DKLA 2B0MA 3GDMA 1VR6A 4N6EA 3M5VA 4CNNA 5HR7A 5G1YA 5D05A 4JXCA 1EEPA 3FYOA 2BTMA 2ZRVA 4ZMGA 4UTUA 4OQVA 5I3JA 4DBEA 3QQ1A 1FCUA 4HNNA 5HWMA 1J4EA 3U2OA 5G5IA 4MZ1A 1X7FA 3FKRA 2W0UA 2AAMA 1WQ5A 2JGQA 3NQFA 1I4NA 4Q32A 5DN1A 1GTEA 4N9CA 3I7QA 3NPWA 5HULA 4U4MA 1G6CA 4E2BA 1JULA 2QR6A 2YR1A 3M6YA 3M44A 3HGJA 5F2GA 2ZRXA 1K03A 1MSSA 2DZSA 3EX1A 4BI7A 2QUUA 2YXGA 3UNDA 3QSRA 3WJWA 2V5LA 2AGKA 3NL6A 1JUEA 1OK6A 4RZ4A 2FPTA 3H53A 3G1SA 5KINA 1JCMP 4AWTA 1TPFA 3NYZA 3MHGA 4YCPA 3DBPA 3W1TA 3QPYA 1RD5A 3W22A 3TH6A 3NQDA 4XBSA 3R5EA 4RCXA 4ML9A 4K37A 1LCOA 4DBDA 3C2RA 2CLIA 1KM3A 2CLKA 5AHFA 1P5BA 3WJZA 3W7RA 1WBJA 1W54A 5LZLA 1C8VA 1QO2A 2WKJA 4RK8A 3M0ZA 5GVJA 3DI0A 4N9EA 1OJXA 1IIGA 4DF0A 1N8FA 4JTJA 3NPVA 4LVGA 4ORMA 4AVFA 2E6FA 1U83A 3LBCA 1QR7A 3WJYA 1ICQA 3UWWA 3P8JA 5AOUA 1O95A 2QKFA 1THFD 4LT9A 5G2HA 5AN7A 5TBOA 3EWYA 3MW7A 1VJIA 1ALDA 4UR7A 4Z1BA 4Y6GA 3E49A 4IPIA 3TJLA 3GLCA 3BPWA 1G7UA 3BLEA 4JGDA 2ZRYA 4JX5A 4XKYB 4CNOA 4UTLA 3EB2A 4N4PA 2GVLA 3STEA 1G69A 1C9DA 2ZZ6A 5FF7A 1SO6A 1VYRA 3QJAA 1GVOA 3W7IA 1JCNA 3ELFA 3EX6A 5L9FA 5HJLA 1A5SA 1Q45A 3IGUA 4LS0A 4FHAA 1SFLA 4N9DA 1KV8A 2ATSA 3ZWSA 3MJYA 3RNDA 2CWNA 5A8GA 2X1UA 5EPDA 3TMLA 4P2VA 4EOUA 1QMLA 3PWAA 1OG0A 2CLHA 2XN0A 3VKJA 1CX9A 1LBLA 1AW5A 5SWUA 1FY6A 1ZAJA 2QJGA 3BW4A 1SO4A 4XBKA 2Y7GA 3Q94A 2X2GA 4K39A 4UFKA 3P5ZA 2ZYFA 2EKCA 4UMAA 4WX2A 3W84A 1QO5A 3NL5A 3SGUA 2CFFA 1LLZA 4UNKA 3NQEA 3TDFA 1UCWA 3LCXA 3EKLA 3IGXA 3F4NA 1XKYA 2G5WA 3GAKA 1DHPA 2ZA3A 3CIWA 3MYOA 1HFBA 4LS2A 3QM3A 4DELA 1DQWA 3GDKA 2HSAA 4Z0SA 1J2WA 3GB6A 3CEUA 1T96A 1SZEA 4HKPA 3L9CA 3E02A 2JGYA 2V9DA 3W7PA 1EUNA 3MBFA 4MOZA 1Q6QA 4PC8A 4GUHA 3W7QA 1FWTA 1W5PA 4DO4A 3YPIA 4OT7A 5MHBA 1T0OA 1A5CA 1EIXA 1KFBA 1OF8A 3G1XA 3NPXA 5F4WA 3F03K 3TIMA 4MZYA 1K02A 4UUIA 5LNRA 1X8FA 1SR9A 3C6CA 4EF8A 4WXYA 3SI9A 3HOJA 2YFOA 4BWLA 1XCFA 2C15A 4MLRA 4PH6A 5HQEA 3CT7A 5ABTA 3DFOA 5BOOA 4E38A 2FDSA 3E0IA 2RDTA 1VH7A 4K8EA 4QNEA 1I2RA 3LHYA 1BKSA 4JN6A 3C8FA 1WYIA 1QPNA 1G4TA 3W23A 2ZZ3A 4JDBA 4HN4A 3KVJA 5E93A 1LLWA 3MHFA 3W72A 4ADTA 3W87A 2PURA 3IIZA 3GK0A 5DBUA 3MO7A 2QAPA 1FX6A 1SSDA 3ZS4A 3C2VA 2V8ZA 2NZLA 3UPWA 2OT0A 5EBUA 3QMSA 3W1AA 5IBXC 2DORA 3GNNA 2ZBTA 1WA3A 3BG9A 3PBWA 3C0JA 5LSMA 1EWEA 2Y7DA 1QPOA 4IQLA 4NJKA 2Q3OA 4OGZA 1PHWA 2VEMA 2JKEA 4NZFA 1V7YA 2R91A 3DXIA 3QMRA 4WUIA 4QITA 5CPLA 5C5YA 3PR2A 3AJXA 4FNRA 3THAA 3G18A 3UWQA 4JYFA 2RKXA 1ML1A 3G1DA 4JTUA 4DXVA 3NO5A 5K3VA 3A5VA 3W73A 3C52A 1P0NA 2E09A 3LV5A 4RLIA 2RH9A 2A6LA 4Y8FA 1FDZA 4UNLA 1SO5A 1RPXA 4A22A 1SFJA 4LWWA 3RF9A 1L6WA 3W86A 1KM6A 4X22A 1IXPA 5TQLA 3TQKA 1OX5A 2NUXA 2JKPA 1UUOA 3LLFA 3NZ1A 3RK8A 1AL8A 1D3GA 1LBFA 1ME8A 5H91A 3VNDA 2Z0IA 4FNPA 3OEXA 4MFDA 1GG0A 1F5ZA 2J6XA 4MYAA 5D2XA 4BR1A 3HIJA 1RZMA 3HJZA 2CZ5A 3IIXA 3HG4A 2YZRA 3UZ5A 4H3DA 3UY8A 1H61A 2A85A 2Z6JA 3G0XA 2E6AA 3B0PA 2BZNA 3THQA 3HG2A 5AHEA 4Z0JA 4UTWC 1GG1A 5C2XA 4Z1CA 1VRDA 1R2RA 1P1XA 2YYUA 4I7WA 5D2WA 3PUEA 4HSNA 3SIZA 5BMWA 3W76A 4AF0A 1S5WA 1YTKA 5AYZA 3PC0A 4FNSA 2DU2A 4IX2A 1KBJA 3O16A 2H90A 2X30A 4TR9A 3UQNA 3NQ2A 3QW4B 3O15A 3EX3A 5BNKA 3LDVA 1TO3A 3PBVA 4L4MA 1YTEA 2G96A 1TV7A 1UJPA 4MPQA 3SW6A 2V2HA 3O1NA 3DFSA 3G3DA 5D2YA 3LI0A 4G1KA 2C19A 2VFEA 3GAYA 1LYXA 4GBUA 4MFEA 4JY9A 2ISSA 1FWRA 3GVGA 2VFFA 3GYEA 5D09A 5EYWA 1OFAA 3UYCA 4UIOA 3PF3A 4BFAA 5AC7A 2OJPA 1AG1O 3MI6A 3BK0A 3S1XA 3ABQA 3WK2A 4OV4A 4AAJA 4NU7A 3E9AA 2ISVA 1A5BA 3PBYA 1Q6RA 2WQPA 3ATZA 4O54A 5CPOA 3L5MA 4UMCA 1ZHAA 3UXDA 1B9BA 1KLYA 4BWLC 1IGSA 1PE1A 1K8ZA 3TJXA 5KSWA 6ALDA 1RQHA 4FX7A 4TIMA 1F05A 2X1SA 3KRZA 3OVPA 3W1QA 4GNJA 1OFQA 4O1CA 3MWAA 5E1QA 4ICNA 5CPNA 3UY7A 1O5XA 3GDLA 1LM1A 2ZA1A 2ZRWA 4LVAA 3S8HA 4GUGA 1EP2A 5LHEA 1H51A 2A0NA 1MEIA 4UTHA 4AEOA 4PODA 2QCDB 1YADA 5FEWA 4MZ8A 3O63A 1YDOA 2VFDA 4YWIA 1R30A 5EL1A 1HL2A 4WOZA 2G95A 2ISWA 4BF9A 2WOQA 4O17A 3VE9A 1OABA 1KM5A 3I68A 3KRSA 1H7NA 5CKSA 1F6PA 3S42A 5K9DA 1UB3A 4ZQNA 3LXCA 4B5NA 4IMCA 1SZFA 3I7RA 4AWSA 3HG5A 1O4UA 4Y9AA 1W5QA 4XTDA 1P0KA 2VEKA 4MJZA 3KXQA 1W31A 3G0UA 3UD6A 2YW3A 3C2EA 3Q58A 1XM3A 4X2RA 1JVNA 2AQWA 2JBMA 3LTPA 3QC3A 3CWNA 4HT3A 2ATMA 1S3HA 3NNTA 2RDUA 2WV8A 3O6YX 1GEQA 4KWWA 1TPDA 4JYDA 2V0TA 2C1HA 2QJHA 3WK3A 3IV3A 3R2GA 3DENA 2Y6ZA 3I7SA 1T8XA 5EMUA 1TTJA 3M5XA 1HG3A 5FEZA 1NFBA 3TAOA 2C14A 3W1UA 2A21A 2VXNA 4ZZ9A 3R13A 2NWSA 1X6UA 1JR1A 4NJIA 5FESA 4OU1A 4GUFA 2PC4A 2QCCA 5DCDA 1AL7A 6TIMA 3FYPA 4MIMA 4NZJA 4Q33A 3NPUA 1SW7A 2GQ8A 3P5YA 4XZ9A 2PE4A 2XFWA 3DI1A 1TPVA 1JUBA 1DQXA 3N9SA 1GJPA 4LV4A 4X9SA 4O11A 5D30A 4IWWA 5DCEA 1HTIA 4JIPA 1H5YA 2FFCA 3G1FA 3M1ZA 2E68A 5DY3A 2Q3RA 2H8ZA 7TIMA 1SZNA 1R2SA 5F1VA 3TFCA 1KTBA 2Y88A 4O52A 3W85A 3L0KA 1P4CA 5FF3A 4O28A 5LKYA 3PUDA 1XDLA 4HNVA 1ZJIA 3CU2A 3PB0A 1H1ZA 3PM6A 5IM51 3R8RA 4JR5A 1S5VA 3A23A 2I9EA 3LCFA 1M5WA 5D33A 3S6DA 5BMXA 5C6MA 3HB9A 4Z1DA 3TXZA 5D2VA 2C13A 1TJPA 5KITA 1TJRA 1Z48A 2A6NA 4LUJA 4IMFA 2NLIA 5HINA 4R33A 1XL9A 4GUJA 1EB3A 3L0GA 4R53A 1IXNA 1UASA 3DH7A 3W71A 2DZTA 1A5AA 3T7VA 4ONVA 5CSRA 3LHTA 4BI5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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