1F76 | Genus

Total Genus 121

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	121
sequence length	336
structure length	336
Chain Sequence	MYYPFVRKALFQLDPERAHEFTFQQLRRITGTPFEALVRQKVPAKPVNCMGLTFKNPLGLAAGLDKDGECIDALGAMGFGSIEIGTVTPRPQPGNDKPRLFRLVDAEGLINRMGFNNLGVDNLVENVKKAHYDGVLGINIGKNKDTPVEQGKDDYLICMEKIYAYAGYIAINISSPNTPGLRTLQYGEALDDLLTAIKNKQNDLQAMHHKYVPIAVKIAPDLSEEELIQVADSLVRHNIDGVIATNTTLDRSLVQGMKNCDQTGGLSGRPLQLKSTEIIRRLSLELNGRLPIIGVGGIDSVIAAREKIAAGASLVQIYSGFIFKGPPLIKEIVTHI

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	E. coli Dihydroorotate Dehydrogenase Reveals Structural and Functional Distinction between different classes of dihydroorotate dehydrogenases pubmed doi rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (quinone)
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Escherichia coli
total genus	121
structure length	336
sequence length	336
chains with identical sequence	B, D, E
ec nomenclature	ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date	2000-06-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1f76A00

3PAJA 2OJPA 4FNQA 3M5VA 1JCLA 3GKFA 3GNNA 4YCPA 4ZQRA 1SFJA 4P2VA 4GUFA 1SZFA 4HT3A 3S6DA 3LXCA 3TQVA 2Q8ZA 4K6AA 1FX6A 3LTPA 3IGSA 2G96A 1KLZA 3CPRA 4N9CA 3KX6A 2C3ZA 1VRDA 3QW4B 4YL2A 1EA0A 3FA5A 3FKRA 2Y89A 3HGOA 3W86A 4RCXA 1SQ7A 3NVTA 1KM3A 5DXXA 3LXAA 2QJHA 3HPZA 2CZDA 2JGYA 3B0UX 4QIUA 2ZFAA 3W23A 5AYZA 1KTCA 2Z0IA 3LGEA 3EEGA 4Z1AA 2ISSA 1VCVA 1YLVA 4DBEA 4AB4A 4L4MA 3NQVA 3TNOA 2GPTA 1EUNA 3P82A 4AF0A 1OHLA 1L6YA 2YR1A 4K7YA 3AJXA 1J4EA 2FQIA 1KFBA 3EWZA 4M6PA 3WJYA 3WJZA 4MZYA 2C13A 3QMRA 1OFEA 2CLLA 3RU6A 1AL8A 1QNVA 3MBDA 3W7MA 1S5VA 4RK8A 4NXKA 1ONRA 3VI2A 4XTDA 3W73A 2RHGA 4UCGA 1JRCA 4O1CA 2Y7GA 4GNJA 1HG3A 1KM6A 2CLKA 3NQ6A 2NX9A 5KINA 3P62A 3W1AA 1TPWA 3B4UA 1F6PA 3IVUA 2E1DA 1KFKA 4LUIA 1OYBA 3NQDA 5F4XA 1K8YA 1TPB1 3LBCA 3N73A 3ELFA 3W71A 1F05A 4O14A 4AXKA 1KBJA 1AW2A 3SZ8A 2BWGA 3K30A 3S1VA 3N3MA 4JTKA 4UTHA 2H3BA 4GRSA 2EPHA 1R46A 4FXSA 3W2KA 3E9AA 1WQ5A 4GUIA 5GVJA 3P67A 2YGYA 3PBUA 3M5XA 2CZ5A 1FCVA 5K3VA 4ORMA 3FS2A 1I2QA 1ICPA 2A4AA 3MYPA 2XFWA 2GVLA 1YDNA 4O52A 3OG3A 3LM7A 3G1DA 3HPXA 1H7XA 2YZRA 4WOZA 1LOLA 4KFPA 3LXBA 3S5YA 4JS3A 3NR0A 3ATYA 4UR8A 1HO4A 1XKYA 3PC0A 3L68A 1Y0EA 3O6CA 4O0ZA 4DF1A 1LLZA 2YFNA 3C4UA 5C2XA 3DI1A 4QISA 3MP3A 2R8WA 2BLEA 2QCFA 6TIMA 3BLIA 5F2GA 3KXQA 2J9YA 3NM1A 4JXCA 1T96A 1Q6OA 4M5PA 2DU2A 2ZRXA 4IJBA 4O8RA 2VELA 3UY8A 5E93A 2QUUA 1M5WA 3CT7A 2JK2A 5G2HA 2CW6A 2NX1A 1RZMA 4E0CA 4MY9A 3W1QA 4H6KA 4EVZA 3M16A 1KV8A 2H8ZA 3PB0A 3KRSA 5CPNA 3P60A 5F2IA 3LI1A 2ISVA 4JTJA 4NNCA 5K7JA 2WO5A 5L9FA 3W7RA 3W22A 1N55A 4PCFA 1GZGA 5G5IA 4JIQA 3JS3A 4Z1CA 3TU9A 2OX1A 1IXNA 2P1FA 3KRZA 1QDSA 3W7GA 2ZZ1A 1XM3A 4LVAA 3EWXA 1Q3NA 1JCNA 4YWIA 1PV8A 2I1OA 2DZWA 3T44A 4Y90A 5BOOA 1OFQA 2EHHA 4GUHA 4I7UA 2C15A 2A0NA 1WOBA 1X7FA 3W1RA 1AL7A 3M43A 3M5ZA 4PODA 1ZCOA 3T40A 5G2WA 1ZAJA 5G1TA 1K7FA 1WXJA 1QMLA 2ZZ6A 1KBIA 3T78A 3M9YA 2V0TA 1KTNA 2NXGA 3MI6A 5H91A 4OE7A 5EBUA 1IF2A 4MY1A 1JCMP 5G2IA 2DORA 4O57A 1WYIA 3FJLA 2QUVA 1XBXA 3IGXA 4JYEA 4QM1A 2KZHA 1E51A 3T4CA 4Z0JA 4GXMA 2B0MA 1GVQA 4TX9A 3M0ZA 5C5YA 1VQTA 3FOKA 2J9ZA 3PULA 4LVFA 1TRIA 4XBSA 1VC4A 1K7XA 3GDLA 4TMBA 2ZRYA 3NM3A 1Z48A 2ALDA 5KZEA 2PRMA 3RLUA 4CLMA 3FEMA 3O6DA 2BZNA 4MYXA 4UTIA 4Q4KA 3W76A 3DENA 2X1RA 1Z41A 1YPFA 2VFGA 1XUUA 3MHFA 4ZVJA 5AB3A 3JR2A 3BVJA 2ZZ4A 4LV4A 1KM5A 1L2UA 3HIJA 4DO6A 3GDTA 1FWRA 3I7SA 1F6KA 3EWYA 3KVJA 5KTLA 3GXPA 5MHBA 2NV2A 4Z1BA 3CB8A 4X9SA 1CX9A 5D38A 5J5RA 2W79A 3HB9A 2QCDA 3QQ0A 4XKYA 4ZQNA 4UFMA 3L0KA 1GG0A 3LTSA 4UFHA 2VFDA 3G8RA 1R2RA 3BARA 4LRTA 3NPXA 4RJEA 1TB3A 1XBYA 3NAVA 3S8HA 3IIPA 5AYYA 4U4MA 2Z1BA 4HN4A 3EWBX 3HGJA 5FEXA 4K8HA 1EX5A 5LNUA 2QCHA 2OT0A 3RMJA 2CLHA 4S1FA 3I6RA 1HTIA 3WJXA 3ABQA 4AWSA 1GPWA 4Q32A 2ZA1A 1QPNA 2C18A 3W87A 1YYAA 2NZLA 3I68A 4JDBA 1T8XA 4BI5A 1TPC1 4I9AA 1FXPA 3NQGA 2Y7FA 2XN0A 2NUWA 1SZEA 2I14A 1WBJA 1TV5A 2CZFA 3BW3A 4UFLA 2QDHA 1TPDA 1SPQA 1SR9A 1PHWA 2H3DA 3O06A 4FIRA 4IXHA 1M7OA 4IOTA 4RV8A 1ME9A 2FDSA 2TYSA 3LBMA 3M44A 1W5PA 3UYCA 4JN6A 4O18A 2QEZA 4DF0A 1JVNA 3G18A 5L6UA 2FLIA 3L0NA 1GVFA 4UTMA 5FEPA 1GOXA 4FF7A 1OG0A 3R2GA 3LCGA 1TV8A 3MI2A 1IXQA 4K36A 4QQ3A 3A9IA 1R2TA 1YDVA 3BPWA 3PBVA 3W7JA 5A8GA 3H55A 2B7OA 2QCMA 4I7WA 3G3DA 2NWSA 3F03K 3GX9A 2ZZ7A 1KTBA 4H3DA 3S5OA 3WK3A 2O7SA 3ABSA 1SO6A 3W74A 3M6YA 3PVFA 3TAKA 2Y7EA 1WDWA 3MHGA 3IIVA 4IMFA 2NX3A 1FDJA 1LROA 4WY0B 1SW0A 5IM51 4JTGA 4LVDA 2NV1A 5F1UA 3DAQA 3BLFA 3TV8A 3W1LA 3M7WA 4NVTA 2QJGA 3PUEA 5K9DA 2C19A 1A5SA 2NXHA 4MYAA 3STFA 3NZ1A 2FFCA 3QW3A 3W70A 5D2VA 3W7KA 1BWKA 1WX0A 3LLFA 3NPVA 4KFOA 3E12A 4UFIA 3TKFA 3N9RA 4HSNA 3NOEA 3NEVA 3P81A 2CLIA 4MJZA 3UWVA 3PR2A 1RQBA 3NQMA 4BI6A 1SW7A 3N34A 5D09A 2HS8A 3GXNA 1LTDA 2VXNA 3DU0A 3EXSA 2CLFA 3DH7A 2ZZ2A 3DFSA 4WX2A 1JCYA 3C6CA 3I7RA 1UB3A 2ZZ5A 2A5HA 2WNNA 1Z42A 2VEIA 4LW7A 1O5KA 3QFEA 1A5AA 2YX0A 4FX7A 1G7UA 4WZHA 3PUDA 1W37A 1YPIA 2B7NA 2WJZA 2YYTA 3C2RA 4NJKA 5FESA 1ICSA 2CZEA 1VLWA 3N14A 1IIGA 3W83A 1OYCA 5LKYA 3R12A 2IQTA 3KAOA 2B4GA 3PBWA 1UJPA 4A29A 3TE9A 2X2GA 5AC6A 5C54A 3KVKA 4ICNA 5DCDA 5I3KA 5EA9A 1VYRA 1ZAIA 5CZ0A 2DZPA 2GQAA 3LHVA 3S5NA 5I3HA 4WD0A 1GJPA 1H5YA 1OF8A 2E6YA 4S2BA 3VNDA 4HNUA 5AC8A 3C56A 2YYUA 3PS7A 3G1FA 1KM1A 5AHNA 1FCUA 4PL1A 2QAPA 1R2SA 3LHWA 5DBUA 5EY5A 3KVMA 1RQEA 1RVGA 4A2RA 1TO3A 5LNRA 2DZUA 3GDKA 1RD5A 4FX6M 4FEZA 2G95A 3CU2A 1OX6A 1Q45A 1DKWA 4TO8A 1SSDA 4ADSA 4J9JA 1YXDA 4M7SA 3QH2A 4LV9A 3SY5A 5HWMA 3SW6A 1G4TA 1KM4A 1VH7A 1PE1A 3UWZA 3UWQA 5CKSA 1Q6RA 3BW2A 4XZ9A 4HPJA 3LCHA 3THQA 3QZEA 3BG9A 3FYPA 3NQ7A 4O4VA 3IIXA 1B9BA 5AHMA 3W7NA 1DL3A 5D02A 4UMAA 3CHVA 4O17A 4MZ8A 3SGUA 1N8FA 2QCLA 4ONVA 2QCGA 2WSQA 3HF3A 1NVMA 4LRSA 3GYEA 4JTFA 3L5AA 3IIOA 3P61A 3PBYA 4YLWA 2VEMA 4D2JA 4K8EA 4QNEA 1I2OA 3TC7A 4DO5A 4E2DA 1TTJA 2A2IA 4WY0F 1O94A 3NZRA 5KITA 1RQHA 3L67A 4LUJA 4JNMA 4NUWA 1TREA 4BWLA 5DY3A 3BK0A 3QC3A 3EWWA 3B06A 3VE9A 5D04C 4AH7A 1O5XA 3TK7A 3A21A 3IV3A 1DORA 3DKLA 1FDZA 2YW4A 3LV5A 4N4QA 1F2JA 3UXDA 2RH9A 1KFLA 2Z2UA 3W1NA 3DFTA 5HMSA 1H60A 5FI8A 4O19A 1XCFA 4N4PA 1P4CA 4WOQA 4IX2A 3G0UA 4UIOA 1K03A 3RF9A 3ABOA 4GE8A 1G6CA 1IGSA 2PE4A 5AFDA 2X30A 3TR2A 3ABRA 4NU7A 3TXZA 4E38A 1NFBA 1XDMA 1UUMA 3BO9A 3G3MA 2C6QA 2FJKA 2VEKA 1ZNNA 1OK6A 5FEWA 1ML1A 5K9CA 4FNTA 2BTMA 3C8FA 5IBXC 4O53A 3MHUA 3O15A 4KFNA 4ZZ9A 2JKPA 1OFOA 1TTPA 2Y85A 3UY7A 4AF0B 3W1UA 3W2MA 4S2CA 1GVOA 3TMQA 4K39A 3BW4A 3W75A 3FJ6A 1GEQA 3SECA 1GTEA 2E5DA 4P61A 2NWRA 5D05A 5K2ZA 4JDYA 3TIMA 1EUAA 1XXXA 2AGKA 2Y7DA 5U4NA 2WOQA 3SR7A 3ZWTA 4M6VA 3HPSA 6ALDA 4N9BA 2FB3A 2FPTA 5G1YA 2TMDA 2YW3A 1VHNA 4TMCA 3C2EA 2V2DA 5I3FA 1FCQA 4QITA 2BX7A 1QAPA 3GDRA 4KWVA 2HSAA 2TSYA 3W7PA 4EF8A 1LRQA 3RNDA 4MLRA 2EAWA 3W6YA 3PF3A 4H4IA 4A21A 1PCKA 3A5FA 1S3HA 3VKJA 3TJXA 4QNWA 1P0KA 3TCEA 3B05A 3Q94A 1AMKA 3W9ZA 3FLUA 5LGXA 4DPQA 2QCCA 3UWUA 3W1MA 2WPBA 2NXIA 1OYAA 1TQXA 2DZXA 2H8XA 4X2RA 3QMTA 2CLEA 1W0MA 1YXCA 3EKZA 4MY8A 2ISWA 4NZFA 2YXGA 4UR7A 1VHCA 3RFAA 3TSDA 5HWJA 1XI3A 1DOSA 4QJ1A 3L5MA 2A7PA 2GVJA 2A6LA 5TBOA 1G7VA 3HQ1A 3SSJA 1QPOA 5HULA 2ZRUA 3CC1A 4O10A 4PH6A 1OFBA 3PB2A 2RDUA 1NF7A 2RKXA 3A24A 3EWUA 1GQNA 1OFDA 4Z1DA 2EKCA 3B0VC 3U2OA 4RLIA 4DEFA 1DQXA 2FIQA 3PUOA 1CW2A 3VFLA 2PRLA 4FXRA 5DCBA 4DXVA 3KRUA 2WSRA 1H7RA 2Y61A 1JQVA 2Y88A 4MKNA 2P10A 1GYLA 3INPA 4UTWC 3OBKA 5LNSA 4HNTA 1SUXA 4BF9A 5HNRA 2W6RA 1B3OA 4O13A 5BW6A 3HGRA 5AOUA 1KM2A 1M6JA 4UTTC 4QAIA 4JICA 3L9CA 3QM3A 5F4WA 1XBVA 1HO1A 2JKEA 1F5ZA 2FPYA 3IIZA 1T99A 4O11A 5LHFA 5DELA 4LS2A 1D3GA 3O8AA 3GIYA 3WK2A 4JYDA 3DFPA 3R8RA 3TAOA 2Q3OA 1JQXA 1DV7A 1A5BA 4LC6A 4WQ6A 1U5JA 3EB2A 4O1BA 1HUVA 3A5VA 4FHAA 4UNKA 2I9EA 2DJLA 4IQLA 4M6QA 4BK9A 3G22A 3LLDA 4LWWA 1H50A 1VPXA 2DZVA 3MI3A 4LU0A 4ML9A 3L5LA 1DJQA 2ATSA 3LHYA 5HR7A 3QRHA 3M5YA 4MIMA 2BSLA 2QAFA 4DPPA 3TJLA 1XUZA 3NQCA 1H51A 1SO4A 1X8FA 1ZFJA 1GTHA 1ME7A 1EP1A 1LBMA 4UMCA 1H7WA 5BRBA 4FNPA 2C14A 3UPBA 1O95A 1DHPA 3W7CA 3C2OA 3PY2A 4JYFA 1VCGA 1OJXA 2ATMA 1JCJA 1UUOA 3S1XA 3B8DA 4IPJA 4N2YA 2V30A 4AHOA 1OABA 3IVTA 3STGA 1Q6QA 2ZCGA 4G1KA 5G4EA 1V5XA 3PSWA 5LZLA 4R53A 3OHIA 1SZGA 3Q2DA 3THAA 1VCFA 4UNLA 2GJNA 1YXYA 4O50A 4UMBA 4TU1A 4X22A 2ZA3A 3NO5A 1WV2A 2J6XA 4IUOA 3O05A 5C6MA 4NNBA 5KZMA 1GWJA 4RR4A 3UZ5A 1SO5A 1YTEA 3N2MA 4WUIA 1K02A 1NEYA 3DI0A 3D0CA 1D3HA 3L65A 2V5LA 4GWEA 1SZNA 4CQAA 2V5BA 4Z08A 4I7VA 4ZQOA 2R91A 3ZWSA 1XBZA 3N19B 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1F76A

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