1F7BA

Crystal structure analysis of n-acetylneuraminate lyase from haemophilus influenzae: crystal form ii in complex with 4-oxo-sialic acid
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
MRDLKGIFSALLVSFNEDGTINEKGLRQIIRHNIDKMKVDGLYVGGSTGENFMLSTEEKKEIFRIAKDEAKDQIALIAQVGSVNLKEAVELGKYATELGYDCLSAVTPFYYKFSFPEIKHYYDTIIAETGSNMIVYSIPFLTGVNMGIEQFGELYKNPKVLGVKFTAGDFYLLERLKKAYPNHLIWAGFDEMMLPAASLGVDGAIGSTFNVNGVRARQIFELTKAGKLKEALEIQHVTNDLIEGILANGLYLTIKELLKLEGVDAGYCREPMTSKATAEQVAKAKDLKAKFLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Active site modulation in the N-acetylneuraminate lyase sub-family as revealed by the structure of the inhibitor-complexed Haemophilus influenzae enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-ACETYL-NEURAMINATE LYASE
molecule tags Lyase
source organism Haemophilus influenzae
total genus 127
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.1.3.3: N-acetylneuraminate lyase.
pdb deposition date 2000-06-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1f7bA00
1XI3A 1TV7A 1FDYA 1W54A 2HS6A 2CZDA 4UTWA 3C2EA 1PVNA 3PBVA 1S5VA 3UWWA 1QPRA 4O1CA 4PH6A 3FJLA 3W7NA 2FFCA 5F2GA 3LCWA 3W2MA 4LU0A 1SSGA 3A22A 5D2VA 1MEWA 1KFJA 3U8GA 4N4PA 3EWBX 1RQBA 5AHLA 3EX3A 5FF3A 3TQVA 2R14A 1JCXA 4M6QA 1SUXA 1F6KA 3NPVA 2CZFA 1H7XA 2X1RA 3H55A 3PY2A 3T7VA 5CZJA 1D3HA 5CG7A 3EKLA 1KV8A 3T4CA 3MP4A 4TMBA 5DELA 2GQAA 3C8FA 1PV8A 4MY9A 1HFBA 4HT3A 1QOPA 3GIYA 3TQKA 1K8ZA 2XN0A 3LB0A 1GJPA 3LBMA 4YMZA 1W5OA 2XN2A 3DZ1A 1W0MA 2V5LA 3PF3A 3C4UA 4IMGA 5LGXA 5FF7A 3QQ1A 2WOQA 2P1FA 3G1FA 4UFIA 4UUIA 3N34A 1MEHA 3PG8A 4QITA 4LY8A 1F74A 3HPZA 2VENA 2NV1A 5HULA 3DFSA 1VCGA 1ZAHA 1I2RA 4JYDA 3BARA 4NUWA 2PRMA 2ZCGA 2HS8A 3MYPA 1Z42A 3QPZA 2IQTA 5LNRA 2DZWA 4LV9A 2QCMA 3QM3A 1H7OA 3W76A 1L9WA 2ZA3A 5DBUA 3T55A 1KBIA 1X7FA 3KRSA 4HPXA 3M5VA 3SGUA 2NXGA 3TDFA 4CCDA 4HNTA 3OVPA 3NPWA 4LRSA 3OG3A 1UB3A 5D2TA 1YLVA 1PIIA 4N02A 2JBMA 3BVJA 3TC6A 5D32A 3P82A 4O28A 5E1QA 4Z08A 4D2JA 5KINA 1HTIA 1LBFA 3NPUA 4IWWA 1ME7A 1PL9A 3TJLA 1OYCA 1G4TA 2A7RA 3Q94A 4I9AA 3L5AA 4K7YA 2QAFA 2O7SA 4M6VA 3TFCA 5CZSA 1OK4A 2QUVA 4FNUA 2ZTJA 4WX2A 3W1NA 5C6MA 1O95A 1B4EA 5D2YA 4WOQA 1R2RA 2DZSA 1WXJA 2Y70A 2JKAA 4UC5A 1LLZA 1PE1A 3W1UA 2ZQ0A 4O4WA 2GUUA 2V81A 4BK9A 1KFCA 3DI1A 5AB3A 3HGSA 4ZQOA 4FF7A 1EP3A 1E51A 2X2GA 5DCBA 2R8WA 3E12A 5DBTA 4JXCA 4R34A 1FCVA 1LLWA 3AO0A 3P80A 1TYGA 2QDHA 5HUOA 3ATYA 3DFPA 5HWNA 1SR9A 3HG5A 3N19B 4I7WA 2QKFA 4S1FA 1N8FA 1GWJA 1SW7A 1TQJA 1JRBA 2C15A 4Y90A 4HIBA 1NEYA 3IV3A 4P2VA 1W3TA 4JD4A 3N9RA 3WJZA 1WAUA 1B9BA 4MY8A 2H3DA 2I14A 2TPSA 1P0KA 2CLMA 1EWDA 5DCEA 5G1TA 1LZOA 5HQEA 4RX0A 3G1YA 3NQ7A 3NXFA 1YTKA 2Z0IA 3NQ6A 2JGQA 1XUZA 1X1OA 5BW6A 3L0NA 3STGA 1NF0A 1Y0EA 4CQ8A 2ISVA 1S3HA 4K39A 2F84A 5FEWA 1HUVA 1EA0A 2BTMA 3MJYA 3MI2A 1SPQA 2X1UA 5DN1A 2PURA 2BLEA 3TSDA 3LHTA 3W9ZA 4N9DA 4NU7A 3H53A 2NUXA 5AYZA 1QNVA 3E96A 3PBYA 3HOJA 1K8YA 4L4MA 3KFTA 3TK7A 1VS1A 1I2PA 3W22A 2RKXA 3ZR4A 2NWRA 1IIHA 3KOFA 3GAYA 1OF8A 3MHGA 1QO2A 3OBKA 2B7QA 1SQ7A 4LRTA 5U4NA 5AFDA 3LCXA 3FKRA 4JIPA 2DZPA 2HSAA 2LLEA 4GUIA 3W1XA 3NG3A 2V2DA 2ZZ6A 4NX5A 1G67A 5AHIA 1VGAA 3P62A 3CQ0A 4UMBA 5D2WA 2E5DA 5EPDA 3TIMA 4HHPA 5T26A 5DY3A 4AWUA 4DEFA 3PB0A 4ZQNA 3UY7A 1C29A 3TMQA 3B04A 2OJPA 4XKYA 2YXGA 4LT9A 1W3NA 2ZDRA 3LI1A 1ICSA 5D33A 5CKSA 1B4KA 1VYSX 1DJNA 2I9EA 4M6PA 1ZAJA 5BNKA 3FKKA 1O5XA 4BF9A 3KVLA 3TAOA 4N4QA 2P10A 2YW3A 4LVFA 4LVAA 1G69A 3NM3A 3MBDA 2ALDA 4NXKA 1J4EA 4CQAA 3H54A 1UCWA 5AHNA 5CPLA 5HWMA 3G1SA 2ZZ3A 1QDSA 4CLMA 2WJZA 3PS7A 3HMJG 3UYCA 3W1QA 4XTIA 3BK0A 4BI6A 1AK5A 2QEZA 3NPXA 1ONRA 2A4AA 5FESA 3EWYA 3TJXA 5LHEA 2Y85A 3C0JA 1JCMP 5AN7A 1VCFA 3NQVA 2A6LA 1D3GA 2Z2UA 5DY2A 4WD0A 3HGRA 1SFJA 1LBLA 1TPWA 2DU2A 4FXRA 2ZRZA 4FNTA 2RDWA 3SW6A 1KLZA 2NUYA 1ADOA 2EHHA 3GDLA 1A50A 1FCBA 4PL2A 4YWIA 3SGZA 2A2IA 3STCA 3UNDA 3UQNA 2ZZ2A 5BOOA 5EYWA 2CWNA 4LVGA 1GEQA 1OFOA 2O7QA 1GTEA 4FX7A 3TKFA 3TC7A 4TIMA 1V7YA 4IUOA 4IMDA 3LI0A 1O94A 4HNVA 3N9SA 4X9SA 3SJ3A 5TQLA 4H4IA 2WNNA 3WJSA 4A21A 5D04C 2NX1A 1H63A 3TW6A 3GNNA 1LOSA 2WNQA 1X8FA 4KWWA 1HO1A 3L67A 1JQVA 3N2MA 1XM3A 3C2FA 3KVMA 2WQPA 4WY0F 5E93A 4AF0A 3OIXA 1HL2A 3LHUA 3VFLA 3IIOA 3W7JA 1PHWA 1FDJA 2NX9A 3NL5A 3PVFA 3QC3A 1M6JA 2E77A 5LHFA 3P67A 1RZMA 2A21A 3RLUA 1YDOA 5HR7A 1TJPA 4HKPA 1EIXA 3W7PA 3KXQA 5G4EA 1TV5A 2EKCA 3W7RA 5EBUA 3PUEA 2Y62A 2FJKA 3QRHA 3UWUA 4TX9A 3HG3A 1H62A 1GQNA 4FO4A 5CPOA 4QQ3A 5DLCA 4JY9A 4LUJA 1IIGA 3BGJA 4JS3A 1Z48A 3QJAA 4JNMA 4Z1AA 5C2XA 1A5AA 3EEGA 1R2TA 2TMDA 3IIPA 1LYXA 3F03K 3NQ2A 2GOUA 3GDTA 3F1QA 1LRQA 4P61A 1ZAIA 4K36A 5G2HA 3W71A 5A5WA 3KX6A 1QPOA 3AJXA 4CNOA 3M0ZA 3TQ0A 5CZTA 2V82A 2FLIA 3MI6A 3NQAA 2WSYA 1WA3A 3O15A 3SR7A 5AC6A 2GPTA 4O0ZA 1H60A 3A23A 3Q2DA 4AAJA 3DHFA 1KA9F 3LHWA 1OFBA 3HBLA 3W2JA 1XBVA 1QPQA 4Y6GA 5LGZA 3CTLA 1SFLA 2ABAA 4NVTA 4UTIA 4ZVJA 3O6CA 1QPNA 2QUTA 3E02A 5K2ZA 4XTDA 1KM4A 4E0CA 5E0KA 1OFEA 4AHOA 3BW4A 2QAPA 3HJZA 1OYBA 3G1DA 4MLJA 4OWGA 3ABQA 3MHFA 1VPXA 5G1YA 4JEQA 4O11A 1DHPA 5J5DA 3G8EA 1ZJIA 3I6RA 3E9AA 3DHDA 4GE8A 4OBTA 1OX5A 5F2LA 1GT8A 3FA5A 4IXHA 5FEPA 1JUKA 1VCVA 1J5TA 2W79A 1W37A 4DO4A 3LERA 4NJKA 3GR7A 3DI0A 3LHYA 4MVAA 3C52A 5F2IA 3L21A 2QJIA 3HGJA 4RR4A 1JCYA 1H7WA 1OJXA 1OX4A 1TRIA 1TREA 2ZZ4A 3MWAA 1TIMA 1KFLA 1TQXA 4WUIA 1SZFA 5F4SA 4LVDA 4AF0B 3JRKA 4DQWA 3W73A 5KITA 1IGSA 5HNRA 3ELFA 3MO7A 5F4XA 2V9DA 3G3DA 1LRNA 2GQ9A 4MIMA 4WY0A 1LTDA 3M43A 2Y7GA 4RZ5A 3I7QA 5F2MA 1A53A 4A3UA 4GWEA 1O4UA 3CC1A 3TSBA 2EF9A 3QPYA 4XZ9A 2CLFA 2JK2A 1K8XA 3TH6A 3T78A 2GVJA 2DJLA 1BWLA 4WOZA 5DCDA 3QF0A 2Q3RA 4OGZA 1XXXA 5K7JA 2VOMA 4IX0A 4X2RA 4MJMA 3P74A 5MHBA 3TROA 3M1ZA 1Q3NA 1EB3A 2Q8ZA 2R91A 4OU1A 3LLDA 3O07A 1HO4A 3UD6A 3HPXA 1F5ZA 2QCDB 2OZ0A 3VE7A 2QCFA 5F4WA 3W87A 3W84A 3O6DA 3EWZA 4K6AA 2H8ZA 1UBSA 3LLFA 4O13A 2EAWA 4OV4A 5ABTA 2A7PA 4YL2A 3MI3A 4UTJA 3DBPA 4M19A 1K7XA 1R30A 2J9XA 2E5CA 3HG2A 2FPTA 1ICQA 1KTBA 1RD5A 5D30A 1SW3A 1WV2A 2V0TA 5SWUA 1X1ZA 4JTGA 3LBCA 3PR2A 4A2SA 2RFGA 4E38A 4MUZA 1S5WA 1RQHA 3Q58A 1ALDA 4Q4KA 1KTNA 3QW3A 5HUPA 5FEXA 2QJGA 3CIWA 3SIZA 4IQLA 2Y63A 2ZRYA 3M5YA 2WKJA 4GBUA 2NXIA 2KZHA 3LXAA 4YCOA 3NVTA 3S8HA 3BG3A 4K8EA 1FDZA 2DJXA 4ALDA 3B03A 6TIMA 3L9CA 3FEMA 3IEBA 3LX9A 5K4ZA 3LTPA 1TV8A 3M6YA 2VFIA 3MP3A 5D37A 2C16A 3PSWA 3L0KA 4FNSA 3EWXA 1OX4B 5D2XA 3TR2A 4RZ6A 1TPDA 2CLKA 5FF2A 3MYOA 1AW2A 1PS9A 2OX1A 4UTLA 2ZBTA 4MFEA 4MPQA 5H2ZA 2J9ZA 3B8DA 4TO8A 1F6PA 4O18A 2A6NA 4JICA 4WY0B 1XBYA 4W9TA 4PC8A 1RV8A 3T40A 3BG9A 4NZFA 4ZZ9A 1JR1A 1QCWA 3CM4A 3TU9A 1FUYA 4Z1DA 1TJRA 3W7GA 1EP1A 4JX4A 3W7OA 4RV8A 4NJIA 2GJLA 2C0AA 3R5EA 3NZ1A 4AEOA 1JUBA 4GUGA 1BTMA 1W5NA 5IBXC 4TR9A 3NAVA 4XBKA 3TNOA 2VXNA 1H7NA 1H7RA 4L4LA 2NUWA 5C5YA 1O5KA 4NQ1A 2AAMA 2TSYA 2E6AA 2NXHA 1R46A 2QCLA 4C1LA 5BMWA 3TW7A 2VKZG 5LZLA 1FXQA 4O1AA 1BEUA 3CEUA 4UNLA 3ATZA 3KRUA 2Y88A 2R94A 3EX1A 3LRMA 1FWNA 1FCUA 3QMSA 4RXFA 3WJWA 2ZA2A 4DELA 3IIZA 1NVMA 1YXDA 1TRDA 5G5IA 5DXYA 1GVSA 5K3VA 2Y7DA 1F2JA 4O54A 3VNDA 1PCWA 5IM51 3LM7A 2E5BA 4NT0A 4QIUA 1P1XA 3DFTA 1IXNA 3DU0A 4CCEA 1SZEA 3UWVA 1BWKA 2C18A 1C9DA 1PHQA 3W1MA 4OQVA 2YGYA 3E0IA 4LC8A 5A8GA 2OCZA 1XDMA 3M41A 3KVKA 1I2NA 3G1HA 3N2XA 3DFNA 2A7NA 4JTKA 3M5ZA 4O50A 5U7SA 3O63A 1FQ0A 2Q3OA 3SSJA 3S9YA 3S42A 1OFPA 4IGHA 4NNBA 3L65A 5H91A 1KW1A 3W1AA 1MXSA 1NAL1 2EGZA 4JDBA 3B05A 5EY5A 1M5WA 3MMTA 1OFQA 2J24A 1W5QA 1QFEA 4MZ1A 3WK1A 3Q37A 5HWJA 3LCIA 3FS2A 1OX6A 4JTEA 3T44A 1DOSA 3ABOA 3OA3A 5D03A 1JULA 3TE9A 3EX2A 3F4WA 1TTIA 4IPJA 3IIVA 3NA8A 4PTNA 3M7WA 4AH7A 4GUHA 3W83A 5FEZA 2QUUA 4K7VA 4OE7A 1TPUA 2VFDA 1TPC1 1FXPA 1VLIA 5CSRA 4XBSA 3F4NA 3O8AA 4LWWA 4ZQRA 3EXTA 5LNVA 2VFHA 1QR7A 2V30A 1LROA 1SO4A 1SZGA 3R2GA 3LXBA 3HPSA 2DZVA 5LNUA 3P8IA 3WK2A 3QMTA 3W70A 1LRTA 3TMLA 3G0UA 3BG5A 2AGKA 2RDTA 4PCFA 2ZZ1A 3QSRA 3N3MA 3K30A 3C6CA 3PUOA 4WXZA 1DBTA 3RU6A 1GOXA 4LVBA 5GVJA 1KFKA 5G2IA 4UTUA 1OK6A 1FX6A 3G24A 3S5OA 3B0UX 2NX3A 4U28A 4O17A 2VFFA 4BR1A 2E6FA 4O15A 1VYRA 4J9JA 4DBEA 1AMKA 1QMLA 5G4WA 4TMCA 1N7KA 1EP2A 5AYXA 4Q33A 3W3OA 2ZRWA 3A9IA 1XCFA 1VR6A 5CPNA 1DL3A 2CU0A 4O16A 3W2UA 5HJLA 1FWSA 1A5CA 4O1DA 3JS3A 4FNPA 3OVQA 3HGOA 1QO5A 3NL2A 2W0UA 5LSMA 4UR7A 3P84A 1F76A 1W31A 4IMEA 4Z0JA 3RLVA 1NSJA 1G7UA 3DXIA 3M9YA 4DF2A 3ABSA 3PC0A 2ZZ5A 2X16A 1VRDA 4O12A 1AL8A 4LS0A 5BMXA 4E2BA 3IIXA 3B4UA 1F7BA 3R89A 3BPWA 2DZUA 4MYAA 4BFAA 2TRSA 3SFKA 1MO0A 1O60A 3U6WA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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