1F7BA

Crystal structure analysis of n-acetylneuraminate lyase from haemophilus influenzae: crystal form ii in complex with 4-oxo-sialic acid
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
MRDLKGIFSALLVSFNEDGTINEKGLRQIIRHNIDKMKVDGLYVGGSTGENFMLSTEEKKEIFRIAKDEAKDQIALIAQVGSVNLKEAVELGKYATELGYDCLSAVTPFYYKFSFPEIKHYYDTIIAETGSNMIVYSIPFLTGVNMGIEQFGELYKNPKVLGVKFTAGDFYLLERLKKAYPNHLIWAGFDEMMLPAASLGVDGAIGSTFNVNGVRARQIFELTKAGKLKEALEIQHVTNDLIEGILANGLYLTIKELLKLEGVDAGYCREPMTSKATAEQVAKAKDLKAKFLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Haemophilus influenzae
publication title Active site modulation in the N-acetylneuraminate lyase sub-family as revealed by the structure of the inhibitor-complexed Haemophilus influenzae enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-ACETYL-NEURAMINATE LYASE
total genus 127
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.1.3.3: N-acetylneuraminate lyase.
pdb deposition date 2000-06-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1f7bA00
3FA5A 3TJLA 1XBVA 3VFLA 1QOQA 2V2CA 4JGDA 4CNPA 1UASA 2JBMA 3HGSA 4GUFA 5EBUA 3WJSA 2QF7A 3HGJA 4OE7A 4FNUA 2QCNA 4YMZA 3RK8A 3TMQA 5K9XA 4GJ1A 3BK0A 3PUDA 3CM4A 4IPIA 4UFHA 4ADSA 3O6CA 4PODA 1TPB1 2X1UA 3NPVA 2AQWA 3DFSA 1PV8A 2E6FA 1SW3A 4O50A 3TFCA 4O17A 2ABBA 3HOJA 2EHHA 4JS3A 4ZQMA 3TA6A 2V9DA 4FB7A 1QDSA 1H51A 1FDJA 1GG1A 2YXGA 2YGYA 3WJXA 2ISSA 4MLRA 4IPJA 1V5XA 1JRBA 3BLIA 4WXZA 3T4CA 2A2IA 3P60A 1GYNA 2YW4A 4DO4A 2ZZ2A 3UZJA 5DCEA 2YW3A 3MYOA 4CCDA 2Z6JA 4K36A 2XFWA 1OHLA 1OFBA 3OVPA 1MEWA 2E6DA 5HUPA 1YADA 1KV5A 3IIOA 2B7QA 2GPTA 3GYEA 1OX5A 3P8JA 5GVJA 3CC1A 4WX2A 1LZOA 5FEPA 4FX8A 3MHGA 3P84A 1QPNA 4U28A 4FNRA 3BLEA 1W54A 4LC6A 4AHPA 3H55A 2C0AA 4RCXA 2CLFA 3W75A 3QYQA 1SZFA 1O4UA 4XTDA 1G4SA 1KM6A 3UPWA 3W1LA 4Q4KA 3CU2A 1L6WA 1H50A 4HPXA 1KFLA 2RDUA 4CNOA 4LC8A 1KFCA 4BWLC 3TQ0A 2DP3A 3TSMA 1HG3A 1M5WA 1YDVA 1EIXA 4PL1A 1R30A 1GZGA 5EPDA 2W0UA 1S5TA 3UWQA 3GR8A 1A5BA 3DI0A 2Y89A 4XBSA 3LTPA 2WSRA 3PY2A 3W2JA 1THFD 3NQ2A 1I45A 3FKRA 3W7JA 5AHFA 1XI3A 1W5QA 3DFOA 1YDOA 1HO4A 1QAPA 2AGKA 3UQNA 3HGOA 4EVZA 1RZMA 1DL3A 4KKXA 5KINA 3N2XA 4NNCA 3VNDA 3G1FA 5DLCA 3S1UA 1FXPA 4LU0A 4PA8A 3G3MA 3W1PA 3QEZA 5D2YA 2H8ZA 3QM3A 2FIQA 4NX5A 2ZRWA 3M47A 1NAL1 4UMAA 4H6KA 1W5OA 3RNDA 3DXIA 2Q8LA 1JCJA 1T99A 1GG0A 1QR7A 1YPIA 3QC3A 3L0KA 4LVFA 3UZ5A 4O14A 4BK9A 2WOQA 4Z1AA 1XDMA 3SR7A 3TR2A 5AHIA 3TXVA 1M7PA 1TYGA 4LS0A 3UWVA 1FXQA 4UTJA 3GDLA 3W2NA 2FLIA 5DBUA 4UTTC 4DO5A 4MJZA 4ZVJA 3WFAA 2V2HA 4N4PA 2I1OA 2W79A 2WJZA 3GXTA 3ABOA 2H6RA 1IF2A 1LRTA 1ZNNA 1LRNA 1OVDA 4O16A 2CZ5A 3U6WA 3PB2A 5D2XA 5I3JA 2ZRUA 1D9EA 2HMCA 3TFXA 3LLDA 4WXYA 3MP5A 5SWUA 3B8DA 2X30A 1F76A 4WOZA 3WJWA 1BEUA 3QJAA 4IWWA 4O19A 2QJGA 4XBKA 3ANYA 1WOBA 2C15A 5DBTA 1Q6LA 3MJYA 4IXHA 3ABQA 4QNEA 4BFAA 1EUAA 1Z48A 3NA8A 5LNUA 4ADUA 2QUTA 4K37A 3OHIA 2P1FA 1WAUA 3HG5A 3DHDA 3S1VA 1X7FA 4IMGA 3W3OA 3O05A 3HGRA 3W7HA 3LXCA 5CPNA 1GEQA 3G0UA 4OV9A 3V1PA 3SFKA 3W86A 2H8XA 1XBYA 3LBCA 4MVAA 2E5CA 1CI1A 4QNWA 1A5AA 3G1AA 5D02A 3STEA 3UXDA 4ZL1A 1SW7A 1BWLA 3H53A 4AXKA 2C13A 3R5EA 1O94A 2C3ZA 1ZAIA 3P80A 4FF7A 1LCOA 1RQHA 2A0NA 1IXPA 1GVQA 2ZA1A 3NDOA 1W5NA 1FWTA 2QCLA 3L5MA 3TE9A 1XCFA 4K8EA 4NNBA 1EX5A 1GJPA 3DBPA 5TQLA 4JTTA 2C18A 5LNRA 3BW3A 5G2WA 2QCGA 5KZEA 3P5YA 3L21A 3MO7A 1C8VA 2OT0A 3HJZA 2A85A 4NXSA 4LVBA 2H90A 4QISA 2GOUA 5DN1A 3D0CA 2B4GA 1TTJA 3PR2A 3SSJA 1M6JA 3KRSA 1Q6RA 1OABA 1S5WA 5G2IA 2BX7A 1K8YA 2GQ9A 4K7YA 5CPLA 5CZ0A 2DZUA 4UTIA 2CLOA 2QKFA 3FOKA 5FF0A 1L6YA 1OFOA 1A53A 3W83A 3CT7A 3WK0A 4N9EA 4YWIA 2FB3A 3PB0A 3M16A 2NX3A 3E12A 5CGQA 2NWRA 1W0MA 3S8HA 1S3HA 2CW6A 5F2LA 2Y6ZA 3PF3A 3OG3A 4JYFA 5AYYA 1SUXA 1TPC1 3HO8A 1FUYA 3BVJA 1IGSA 1UUOA 4GXMA 5KMYA 3S1WA 4WD0A 3UY8A 3S9YA 1LRQA 3C2EA 2ZTKA 3LCHA 2X1RA 3NQGA 3W1NA 2V5LA 4IUOA 3HPXA 3THQA 2CLLA 1W3IA 3U8GA 4O13A 4UTWC 3TC7A 2TYSA 4MFEA 3G1YA 4M6VA 1DBTA 3L9CA 5IM51 1PHWA 1C9DA 2VFHA 4MUZA 1X8FA 2C6QA 1GOXA 4UTHA 3G24A 2F7FA 2QCCA 3PM6A 3W6YA 1XUZA 4DBEA 5U4NA 1MO0A 4PC8A 4RKAA 5AHEA 1XBZA 1H61A 5CZJA 2JGQA 3W76A 2VFGA 1VCFA 4A2SA 2XN0A 2Y85A 3QW3A 4UFJA 2QDHA 1S5VA 1K8ZA 2J88A 1BWKA 3GXPA 3BG9A 1ZHAA 3TV8A 1LBFA 3PWAA 5D04C 1ZAHA 3CHVA 3I7QA 3O16A 2NUWA 1KTBA 3TSBA 1DVJA 4IGHA 2TSYA 3EWXA 4ZMGA 1XM3A 3IVTA 4ALDA 1RVGA 5HWNA 5L9FA 3E96A 3CTLA 3C56A 1MSSA 3MP4A 5FEZA 1DJNA 3ZR4A 1QOPA 1K7FA 1TTQA 3A23A 3NGJA 2B7NA 4S1FA 3GXNA 3RU6A 1KM4A 3NVTA 2X1SA 5HMSA 3NL6A 3RFAA 3UPBA 3GDKA 3M5ZA 2FPVA 3IVSA 2TRSA 2A7PA 2ATMA 1ADOA 1DQXA 3EXSA 3BO9A 1W1ZA 3TXZA 3UYCA 1KTNA 4LVAA 1LDCA 2QCEA 3BG5A 4GFSA 2P10A 4S2BA 5G2HA 3M41A 3W22A 1F73A 4GUJA 1LM1A 3HBLA 3LCWA 1U83A 3WJZA 1LOLA 2BLEA 4RXFA 3WJYA 2VENA 5HINA 1LTDA 2RHGA 4TO8A 4QITA 4LNYA 3EX1A 1KM2A 4Z1CA 2X2GA 2FQIA 4FEZA 4OQVA 3W2UA 2WNZA 4M6QA 2CLKA 5LNVA 4XKYA 1XFBA 3SI9A 2CLMA 3TDFA 5D09A 3NL5A 4HNTA 1Y0EA 2VXNA 2VELA 2A7RA 1GTEA 3QMTA 3LCFA 3R2GA 3C2FA 4JX4A 2VEIA 3Q37A 1ME8A 3DENA 2F84A 2DZXA 3KVLA 3A22A 4QQ3A 1X6UA 2J24A 2NLIA 1O95A 1OFEA 4JTEA 1KM3A 2OCZA 5HWJA 3I68A 5F4SA 4RXGA 3CPRA 2QEZA 3FJLA 3W88A 4P2VA 1J5TA 1F6KA 1SZNA 4DPQA 3SGUA 4WY0F 3M6YA 1SW0A 2ZRXA 5FEWA 5EL1A 1VLIA 2QAPA 3KFTA 3MYPA 3JRKA 1FDZA 4AEOA 2DJLA 3NM3A 1P4CA 3OIXA 3NL3A 3S1XA 4JXCA 2UV8G 1F05A 3ELFA 1N7KA 2Q8ZA 3W2KA 3HQ1A 2FPYA 3LRLA 1KM5A 4LRSA 3CQ0A 3F4WA 3EEGA 2CZEA 3LRKA 5BRBA 5D30A 5I3KA 3QQ0A 5DY3A 1K03A 4NX0A 1K8XA 4HNNA 1JVNA 5T26A 3BG3A 3CIXA 3CWOX 4N2YA 4FIRA 3P67A 3A24A 2QAFA 5F1VA 1JUEA 1YTDA 2VEMA 3KX6A 5CZSA 5LZLA 2Z6IA 4JTUA 2V0TA 2WPBA 1G6CA 3L2IA 1XBXA 4FXSA 3LCGA 3KRZA 4JTGA 1NEYA 3MP3A 3S5ZA 1D3HA 1TO3A 3NAVA 3W7NA 3OBKA 4I7VA 5KZDA 1OG0A 3F1QA 4C1LA 4XZ9A 3SECA 1K3UA 1LYXA 1K7EA 3OVRA 1ZAJA 5C5YA 1VGAA 3W1UA 3N73A 3R89A 4PFMA 3W1AA 3MI2A 1ME9A 4IQLA 5C54A 4YCOA 3G22A 3U2OA 5A8GA 3TROA 4NNAA 5BW6A 1F2JA 3DGRA 2ZRVA 2A4AA 3EX6A 4W9TA 1B4KA 2XN1A 1YPFA 1YXYA 2JKAA 1J4EA 1TPVA 3G3DA 1PHQA 2ZRYA 3G8EA 1LOSA 3QFEA 4O0KA 2LLEA 4JTIA 1TV8A 4K8HA 2KZHA 4DF2A 3VCRA 1H7WA 2EGZA 3C2RA 1JCYA 4N9BA 3C2OA 1FCUA 1M7OA 1QCWA 1NFBA 4MY9A 4RK8A 3RLVA 3T40A 2YFOA 1LP6A 4O4VA 4LOCA 2O7QA 3E9AA 3B06A 4EOUA 3Q2DA 1H1YA 4I9AA 4LTSA 1DQWA 1VRDA 3R13A 2BXVA 2BSLA 5F1UA 1QMLA 3LI0A 5AC6A 5CG7A 4ZQCA 4AVFA 2A7NA 4NJKA 2G5WA 1K02A 2Y63A 5HR6A 1A50A 1IXNA 2Q3OA 1TTIA 3S42A 3TAOA 2VFIA 3LHZA 2FFCA 1OFDA 2V5BA 2GJLA 3BGJA 4A29A 3W7IA 1PIIA 4IMEA 2ABAA 4WJEA 2OX1A 3LV6A 1OK6A 1SO4A 2XN2A 2ZYFA 3P62A 4N9DA 2EF9A 4NJJA 3LCLA 4NU7A 4YL2A 4FNSA 1VJIA 4WUIA 3VI2A 1CW2A 3IRDA 4PTNA 3M7WA 5DXXA 3SGZA 3TU9A 1OF6A 5DY2A 4FNQA 1DOSA 5D2WA 1FY6A 2NXGA 4MZ1A 2YYUA 3W7MA 3JS3A 1I2QA 5FEXA 4LS1A 5LHEA 3W7GA 2OJPA 1AW1A 2ZA2A 3P61A 4Y6GA 1VCGA 3HIJA 4DELA 3LV5A 1UBSA 2V8ZA 4TMBA 3NQVA 3M44A 3GDMA 2VFDA 2Y7DA 5TBOA 3MUXA 3C3NA 1R46A 3B0VC 3TH6A 3C61A 3TMLA 5C6MA 4K39A 3GR7A 2WV8A 1SO5A 3HB9A 3EWBX 5LGZA 3BPWA 2ZRZA 3DU0A 3L0NA 5K9DA 1TV7A 3NG3A 4IX2A 6TIMA 4K7VA 4CQ9A 1VYRA 1FQ0A 3DI1A 1H5YA 2CFFA 4GRSA 3TSDA 2QCDB 2V82A 4WOQA 1FBAA 5F2GA 1C29A 5G1TA 1JQXA 2RDWA 4AAJA 3G1SA 4GWEA 3DKLA 1O60A 4DBDA 5I3IA 4JX5A 4FIQA 4NJIA 1KTCA 5DELA 3AJXA 1JCNA 2QUUA 3LHWA 2E09A 4MZ8A 3MW7A 4NUWA 3O06A 4UR7A 4JDYA 3GNDA 4HSOA 3GLCA 3IGSA 4DXVA 1HFBA 3W1XA 1ZFJA 3RF9A 3N2MA 2A6LA 4QM1A 5HJLA 4MY1A 1TB3A 2DU2A 3MI3A 3NO5A 1KLZA 1VHNA 1TQJA 3PBYA 3DZ1A 4GUGA 1O5XA 3DHFA 5AHMA 1B3OA 4MYXA 1UCWA 4A21A 3I7RA 4WZHA 2JKEA 4M7TA 2DZTA 5BOOA 2E6AA 3W70A 3S5NA 4O1BA 1SFJA 4JIPA 4X2RA 4AWUA 1WBJA 4Q32A 4HNVA 1L9WA 4BF9A 3QRHA 4O1AA 1EEPA 3T78A 2P0OA 3QMRA 2ZZ6A 5KSWA 3MHFA 1W5MA 4K38A 1KFJA 5HULA 4Z1BA 3W87A 4AWSA 1ALDA 1B9BA 4GC4A 4MY8A 1SU5A 3QPZA 2GUUA 1JCLA 2JGYA 3EWYA 2D73A 3Q94A 2CU0A 2R8WA 2QDGA 3W84A 3STCA 1QFEA 1QPRA 1H7NA 4HIBA 4OWGA 1SSGA 1KW1A 4FX6M 4I7WA 5EY5A 1QO5A 4JTJA 3BV4A 5K4ZA 3VE9A 1LORA 3G18A 2ZFAA 4JEQA 4ZQNA 1JUBA 2WO5A 2NWSA 5F2MA 1QO2A 1R2SA 3FS2A 4RZ6A 4UFLA 1GQNA 3TUUA 3S6DA 1PL9A 2V2DA 1UUMA 5F2IA 2PRLA 3M0ZA 4EF8A 1XUUA 4G1KA 3LDVA 4UR8A 5KZMA 3PSWA 3TK7A 3PS7A 3W1TA 1PS9A 4IMCA 2V81A 4M6PA 4TMCA 2GQ8A 2Y7EA 4UUIA 3TNOA 4MFDA 4XKYB 2WQPA 3LB0A 2Z2UA 1IIGA 4IX0A 1SFLA 1TPWA 3C8FA 3CWNA 4KFPA 4BI7A 3GDRA 3UNDA 2AAMA 2JK2A 5HUOA 5ABTA 2EPHA 3CB8A 1TCDA 3TX9A 1G7VA 2E77A 1RD5A 3E02A 3IGUA 3CIWA 2G96A 4JN6A 4AF0B 2C1HA 1SSDA 2TPSA 2PURA 4N6FA 3S0CA 3W9ZA 4ORMA 1W3TA 4HNUA 1LLWA 4O0ZA 3SZ8A 2YZRA 3LHVA 3HPSA 1HUVA 3NL2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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