1FDJA

Fructose 1,6-bisphosphate aldolase from rabbit liver
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
AHRFPALTPEQKKELSDIAQRIVANGKGILAADESVGTMGNRLQRIKVENSEENRRQFREILFTVDNSINQSIGGVILFHETLYQKDSQGKLFRNILKEKGIVVGIKLDQGGAPLAGTNKETTIQGLDGLSERCAQYKKDGVDFGKWRAVLRIADQCPSSLAIQENANTLARYASICQQNGLVPIVEPEVIPDGDHDLEHCQYVTEKVLAAVYKALNDHHVYLEGTLLKPNMVTAGHACTKKYTPEQVAMATVTALHRTVPAAVPGICFLSGGMSEEDATLNLNAINLCPLPKPWKLSFSYGRALQASALAAWGGKAENKKATQEAFMKRAVVNCQAAKGQYVHTGSSGAASTQSLFTASYTY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Reaction intermediates of Rabbit liver D-fructose 1,6-bisphosphate Aldolase
rcsb
molecule keywords FRUCTOSE 1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE
molecule tags Lyase
total genus 131
structure length 363
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2000-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1fdjA00
5HWNA 1EA0A 3TSMA 5HR7A 3RF9A 4IUOA 1JQXA 2VXNA 1VH7A 1TSIA 3SI9A 1IIGA 2C3ZA 2E5DA 3FJLA 3DU0A 5A5WA 2CW6A 3M47A 1BKSA 5DLCA 5CZ0A 4RR4A 2OJPA 2FIQA 1AMKA 5LGZA 2C16A 4HKPA 1FY6A 2NX1A 2YSWA 4QNEA 2ZA3A 1OJXA 3W74A 1B4KA 1LRQA 4JYFA 4OQVA 3P60A 3LRLA 3TMLA 5F1UA 1JUBA 4BK9A 1DJNA 2OMAA 3HGRA 4XBSA 3RNDA 4FX6M 3DXIA 1FCQA 4O52A 1LOQA 3IVUA 3E0IA 4GC4A 2NV1A 3W1QA 1WV2A 2BSLA 1D3HA 1YXDA 3GAYA 5CSRA 4RX0A 1VC4A 2QCDA 2DU2A 2QJHA 4OBTA 2EGZA 1IIHA 3O63A 3T55A 2V9DA 1LBFA 4LV9A 1XFBA 2CFFA 1P1XA 4QIUA 1MEIA 2JK2A 2VFFA 4IMEA 5IBXC 1IGSA 4O4VA 5EBUA 3R13A 3IRDA 1OFBA 4H4IA 4GBUA 5AC6A 3NNTA 1AG1O 5FI8A 3I7QA 3TC6A 3W72A 1OVDA 3HBLA 1HO1A 3N19B 3PBYA 4I7UA 4JR5A 3T7VA 1TYGA 2EHHA 4R53A 3LHWA 3EX2A 3GLCA 4DXVA 1G4SA 4YLWA 4BI6A 2JGYA 4FNPA 1B3OA 5FF4A 3U8GA 5G2HA 4OWGA 1K8ZA 4Y8FA 4EWND 1N55A 1DQXA 1X6UA 1UJPA 3UWWA 3NQ8A 3WJZA 2V2DA 1GG1A 3U2OA 1YYAA 3GNNA 2J9ZA 3W7RA 4IXHA 1TRIA 3L65A 1JR1A 2Y88A 4M7SA 3S42A 1FDZA 2ATSA 3B06A 1UCWA 3C2VA 4JIPA 4KFNA 2Y89A 3HG4A 3BLFA 4MLJA 1K03A 4HNNA 2QEZA 3MP4A 3BGGA 3OIXA 3DH7A 4O10A 4FXRA 2VEMA 3LOTA 4XWUA 2FPYA 3R89A 2JKPA 3BGJA 4JDYA 3TXVA 2GPTA 1VQTA 2DZSA 4O15A 5KTLA 1WDWA 3TFCA 2HSAA 4WY0B 3LTSA 4JY9A 3UWZA 4ADTA 2CU0A 1O95A 3QW3A 2ABAA 3DHFA 3EEGA 4JYDA 2HS6A 5BMXA 4GUIA 3GXTA 1G6CA 1N7KA 5DBTA 4Q33A 1F73A 3BW2A 1H7PA 5EYWA 1SFLA 3SJ3A 1K7XA 4PCFA 3VKJA 1VLWA 3N3MA 3NA8A 4A21A 4NX5A 1SO3A 1V5XA 3LCGA 3E02A 5KSWA 4LC6A 2AAMA 4TR9A 3NXFA 4ZQNA 4UC5A 1YDOA 5AHFA 1JVNA 1EP1A 1PV8A 3CC1A 4I7VA 2FJKA 3ATYA 3DFPA 1YXYA 3DBPA 4E2BA 2CLLA 3C56A 5CPNA 4Z1CA 3C2RA 3KX6A 4NVTA 5CPOA 2NWSA 3N2XA 4JTLA 4K8EA 4NZJA 5F1VA 1G4EA 4DF0A 3TSDA 2R91A 3G1HA 3KFTA 1VYPX 3NPUA 1N8FA 2RKXA 3OG3A 3HJZA 4RCXA 4LV4A 4UMBA 3W7MA 4S1FA 1JUEA 1TTPA 2ZA2A 3HO8A 5HQEA 3G8EA 4NUWA 1SZNA 4UXDA 2A85A 4O1CA 4K37A 3W2JA 3UQNA 3I7RA 3NG3A 3KRZA 4LS2A 5AYXA 4JNMA 3DKLA 1H62A 1FWRA 1OHLA 1CW2A 4Q4KA 4JICA 1W5PA 1GYNA 3EXSA 3KOFA 3TQ0A 1QPNA 3RU6A 4DO5A 1XUUA 3BK0A 1MZHA 3TAOA 2QCMA 3NL5A 2VFIA 5EMUA 4N9CA 4CNPA 3DI1A 1SW3A 3UY7A 2NZLA 5LHFA 4XQ6A 3DI0A 1JCMP 1R46A 3HOJA 2BLEA 1GJPA 1OK4A 4UTLA 4O4WA 5IM51 1OFPA 1ZCOA 3NEVA 4UFJA 2W6RA 5GVJA 1TPWA 4PTNA 4YCPA 3S9YA 1GWJA 5TQLA 1EUNA 3EX6A 3HG5A 4N2YA 3G18A 3MHGA 2FB3A 4XKYA 4NJKA 3V75A 1FWTA 4JTEA 3GK0A 1JCNA 3TQVA 4CNOA 5LZLA 3M5XA 1L6WA 4NQ1A 4QJ1A 4A22A 3GB6A 2B7QA 3O6YX 1VR6A 3W70A 3A5VA 5U4NA 1Z41A 4OHQA 2J9XA 2ZRVA 5G2IA 3G1DA 3W7EA 3PVFA 2WO5A 3LTPA 1TPEA 4UR8A 5E93A 5F4WA 1NFBA 1PCWA 3FIGA 3ABRA 1H7XA 3BW3A 1ICQA 5AB3A 2CLOA 4XTDA 1GVQA 4IOTA 4KKXA 5SWUA 2V5BA 3WK3A 2QAFA 1VZWA 5D04C 5K9CA 1TTQA 1Z48A 2DZUA 4K7YA 5CGQA 1EWEA 3MHFA 2ZTKA 4LVAA 3L9CA 4JGDA 4YL2A 3CM4A 3F03K 3W1TA 3EWBX 4H3DA 1C29A 5U7SA 1SSGA 1WX0A 4UIOA 2QUVA 3AJXA 2Y70A 1F7BA 3WFAA 3M44A 1ME7A 4OV9A 5C6MA 1KM0A 1JJKA 3B0PA 1TV5A 4Z08A 3W7DA 3CEPA 1WYIA 3PG8A 3B8DA 2AQWA 1EP3A 3HGOA 3NL2A 4S2CA 4O1AA 1TPB1 2ZZ5A 2W79A 4HT3A 2ZZ3A 2HMCA 4MY1A 3OVQA 4O50A 1WOAA 4CLMA 2Q8LA 4QM1A 1UUMA 1Q6OA 2H8ZA 3QF0A 3G1AA 2A21A 1GVSA 5FEXA 1NAL1 4LOCA 2UV8G 4WQ6A 2R14A 2QCFA 1ZAHA 7TIMA 4GE8A 3S5OA 1H5YA 3W2UA 4EF9A 2VOMA 3QMSA 4NJJA 1OK6A 1LBLA 1G67A 1VCFA 5I3KA 2E6YA 1Z42A 1P5BA 3KVKA 3UNDA 4OE7A 1F5ZA 4CQ8A 1K7FA 1LBMA 1P0NA 1KFEA 2B7PA 4QSHA 3QQ1A 1ZENA 4U4MA 3MJYA 3PWAA 3EKLA 4Z1DA 2C0AA 3P82A 1LZOA 1RVGA 1KV5A 3TW7A 2B0MA 2ISVA 3LHYA 4U28A 3W07A 4IMDA 3PUOA 1K7EA 1CI1A 2NX3A 3KRUA 3TDFA 2C13A 3UZ5A 2E6AA 3C8FA 1ZHAA 3GDRA 2DP3A 4GUFA 3L21A 1IXPA 2FTPA 3NQ7A 5BNKA 1BTMA 4O19A 3FYPA 4IJBA 2A2IA 2YDAA 1J5TA 3E9AA 2VFEA 5G5IA 3WJSA 1RD5A 5EL1A 2VFGA 2QR6A 4UTUA 3Q2DA 1OG0A 2X16A 3G1SA 4ZQPA 5FF2A 1SFJA 3M16A 3LB0A 1O5XA 4WOZA 3BG9A 2J27A 3C3NA 3IIVA 5EA9A 3FFSA 1GT8A 4K8HA 5FESA 1Q6QA 4R7JA 1KFKA 3LLDA 4XZ9A 4UMAA 4LRSA 4O11A 1FDYA 1JUKA 3L0KA 1OFRA 5HWMA 3TV8A 4NJIA 1JRCA 3NQGA 5G1YA 3LCFA 1ZY9A 2QDHA 1TREA 1X7FA 1W31A 3LBCA 1P4CA 2DZTA 1Q45A 4GRSA 4EVZA 2CLMA 3TW6A 1QDSA 3TMQA 1OYBA 1I45A 1OFDA 1SO6A 3CPRA 1TTIA 3GDMA 4QNWA 1TPC1 4XBKA 2C19A 3QSTA 1GYLA 2QJGA 4FNQA 1QMLA 5AYZA 3QW4B 1KTBA 3JS3A 4UNKA 2NXHA 1TB3A 1KLZA 4Y96A 1OFQA 4LWWA 2NWRA 2J88A 4I9AA 4CQ9A 1EUAA 5AHLA 4AB4A 1TV7A 2KZHA 1F6PA 3A21A 1GVFA 4UR7A 3GKFA 3SW6A 4NNAA 3BO9A 2YR1A 3Q37A 1S5TA 5CG7A 1VCVA 1I8JA 3WJYA 3M1ZA 3TR2A 1XXXA 1JRBA 4UFMA 2ZRZA 4LY8A 3W7OA 3PY2A 4AAJA 4ZMGA 3EXTA 3E49A 5HJLA 5HUPA 3QZEA 4M19A 5HINA 3I68A 2RDUA 4LRTA 2QCLA 3R2GA 1QCWA 3QPYA 4L4MA 2Z6IA 1DVJA 3C61A 4JS3A 4BWLA 3FEMA 4AF0A 3JR2A 3LXAA 3PR2A 2E09A 1D9EA 3BLIA 2VEIA 1W5QA 4NNCA 3G1XA 4AHPA 3QJAA 4RKAA 1O4UA 1SUXA 4RZ5A 4AVFA 1XBZA 5DELA 4NJGA 1FCBA 3MP5A 3S0CA 4MPQA 4Y6GA 3BG3A 4HSOA 3H53A 2YX0A 2PCQA 5LKYA 2P1FA 4N4PA 1GG0A 1SU5A 3TC7A 3P62A 3W1MA 1C8VA 4QISA 3S8HA 4GFSA 3EX1A 4KWWA 2RHGA 3ZS4A 1LYXA 5K4XA 4O13A 3GX9A 2GJNA 2IQTA 1R2TA 3UWUA 3KVLA 4JX4A 3NQAA 4MOZA 1TCDA 3C52A 2VKZG 5LNSA 5DCBA 1YTKA 2QUTA 1VGAA 2H8XA 5K4ZA 4BF9A 5CZSA 2A7PA 3B0UX 4AHOA 4YMZA 2PURA 2V82A 3N73A 1V7YA 3BLEA 3ABQA 2RDTA 4PC8A 4HIBA 1EEPA 1EX5A 1GTEA 1KM1A 4MY9A 2GJLA 2E68A 3KXQA 2E77A 3L67A 4CCDA 4IWWA 4LVBA 3VE7A 1GTHA 4IMFA 5AOUA 4P61A 3VNDA 1IXQA 1W1ZA 1NSJA 4B5NA 1DQWA 4ZQCA 2ZZ4A 4FXSA 1PE1A 4GWEA 1XBYA 3PBWA 4PA8A 1X1ZA 3NQFA 1NF7A 3TE9A 1T99A 4BI5A 2ZFAA 4GJ1A 2YYTA 1I2QA 2J24A 3W1RA 1LRNA 1X8FA 1E51A 1HL2A 1GVOA 4UNLA 4ORMA 4UTTA 5AC8A 2GVJA 4D2JA 3LCIA 5AHMA 4M5PA 1WBJA 4FB7A 4DBDA 1W37A 3I6RA 5D2WA 2GVLA 3S5ZA 1VLIA 4MY8A 3UPWA 3ZWSA 2QUUA 4MZ8A 1H1ZA 1MSSA 1GEQA 3TU9A 2JGQA 3O06A 1F74A 2HS8A 2Y61A 4IPIA 2RDWA 1H61A 2JBMA 3P67A 3QC3A 2ZRUA 4GUJA 1W0MA 3PB2A 2I14A 3MI3A 5L6UA 1NEYA 3GKAA 3EWYA 4JTKA 1PHQA 1PS9A 1TQXA 3SR7A 1QOQA 1KV8A 1HTIA 4UCGA 5KZEA 2WNZA 2NUWA 4AWUA 5DY3A 1LROA 1DOSA 1KBJA 4LUJA 4DBEA 4O12A 2BZNA 5FEWA 3LHVA 3GDKA 1M5WA 3FYOA 2GQ9A 2H3DA 5D37A 3O15A 3IIOA 3TK7A 1NF0A 1W3NA 4IPJA 4UTWA 3NQVA 1O60A 1UUOA 4WXZA 4H6KA 3G22A 1XUZA 1TPUA 5DBUA 3F1QA 4UFHA 3S5YA 3M7WA 3D0CA 1ZALA 2CWNA 5ABTA 3P5YA 2ZBTA 3TAKA 3U6WA 3FA5A 3M43A 5K3VA 3BV4A 5FEPA 1CX9A 4AXKA 1A5SA 4GUGA 1S3HA 4DO6A 2C14A 2R8WA 3CU2A 1PHWA 1K8XA 4FF7A 1KM4A 2G5WA 3MI6A 4I7WA 3UY8A 1W5OA 1XBVA 3LI1A 2Z6JA 1RZMA 2YFNA 1DJQA 1OX6A 3L0NA 5G4EA 3MBDA 1F6KA 3EX3A 2ZA1A 4KFOA 4N9BA 5CKSA 4JTJA 3PM6A 1K8YA 1WBHA 1BWKA 1I4NA 3W9ZA 3O6DA 1YPIA 3ABSA 5EY5A 4K36A 3FKKA 2ZYFA 1WXJA 3GDLA 1Y0EA 1JCYA 3WK0A 4HNVA 3Q94A 3S6DA 1HG3A 2BX7A 2WSRA 3GXNA 2EKCA 3P61A 1LORA 3LCWA 3ZR4A 3W3OA 1S5WA 4WUIA 4XTIA 2QCCA 2QCGA 5DXYA 1VYSX 3GXPA 4ADSA 4HN4A 5LNWA 1U5JA 3W83A 4O1DA 4O1BA 1F05A 1AW1A 3NYZA 4UTHA 1XDLA 1Q3NA 2RH9A 2CZEA 3C2EA 3W7GA 2X1TA 5K9DA 1OYCA 4X3ZA 1YTDA 3LM7A 1VPXA 4A29A 2ZTJA 4M6PA 1OYAA 1K02A 3P8IA 5CSSA 2C18A 1WA3A 1VJIA 2NUYA 4AF0B 5TBOA 3LTYA 1WOBA 3C0JA 5A8GA 1TV8A 5CPLA 3EKZA 1KFLA 3W84A 3A9IA 1JQVA 1M7OA 1LLZA 1MEHA 1M6JA 3LHTA 1DORA 5C54A 3W7JA 2VEKA 2ISWA 2QCDB 4DPPA 1TTJA 4PL2A 3MI2A 1C9DA 4NXKA 4O53A 4BFAA 4Y90A 4FIRA 5E1QA 3G0XA 3W1LA 5CZTA 3HIJA 1W56A 4R34A 4JYEA 1SZGA 2E5BA 4WX2A 3N14A 4CQAA 3CWOX 5DCDA 2V8ZA 5D09A 5DXXA 5LNRA 3WJXA 2WQPA 2X1SA 1FWSA 4WJEA 3NAVA 2F7FA 3NL3A 2LLEA 3W2MA 2GVGA 1KM2A 1TPDA 1W3IA 4ZQMA 1RV8A 1XKYA 2WSYA 5EPDA 4JY8A 4PODA 2DJLA 5F4XA 3STCA 3BW4A 5BOOA 3W1XA 3LDVA 2ABBA 2ZZ2A 3L68A 1ZAIA 4Z1BA 4ZZ9A 1NVMA 4BI7A 5IBXA 5K7JA 2QCEA 1KM5A 1LP6A 1QAPA 3EX4A 4N9EA 2V81A 3WK2A 1R47A 2ZZ1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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