1FWRA

Crystal structure of kdpg aldolase double mutant k133q/t161k
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
213
structure length
213
Chain Sequence
MKNWKTSAESILTTGPVVPVIVVKKLEHAVPMAKALVAGGVRVLEVTLRTECAVDAIRAIAKEVPEAIVGAGTVLNPQQLAEVTEAGAQFAISPGLTEPLLKAATEGTIPLIPGISTVSELMLGMDYGLKEFQFFPAEANGGVKALQAIAGPFSQVRFCPKGGISPANYRDYLALKSVLCIGGSWLVPADALEAGDYDRITKLAREAVEGAKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
publication title Directed evolution of a new catalytic site in 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase from Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
molecule keywords KDPG ALDOLASE
total genus 71
structure length 213
sequence length 213
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 4.1.2.14: 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate aldolase.
pdb deposition date 2000-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01081 Aldolase KDPG and KHG aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1fwrA00
4HSOA 1OFOA 1YXDA 4L4MA 4N4QA 1EUAA 5CSSA 1GWJA 2CLIA 3PVFA 3UYCA 2Z6JA 3GDTA 4O13A 1F05A 2ZTKA 2H6RA 2ZRUA 5E93A 1P4CA 3LM7A 3W84A 2NX9A 5DY3A 4YL2A 3QQ1A 2QAPA 3D0CA 5AHMA 1KBJA 3PBWA 4M6PA 3KFTA 1GG1A 2VEIA 3NQ7A 4FF7A 3R2GA 3INPA 3W7DA 3U8GA 2I1OA 1PS9A 1ZENA 1FWRA 3HGOA 4CNPA 3P62A 2WNNA 3PG8A 1DHPA 4O17A 3QFEA 1LCOA 4NU7A 5F1UA 4LVAA 3TKFA 3MI3A 3CIWA 4UMCA 4UTHA 5I3KA 3JS3A 4DO6A 5D32A 4I7UA 3S5NA 5F2LA 5L6UA 3UZ5A 4UR8A 5G5IA 4JYEA 1QOQA 3ZS4A 4YLWA 5LHFA 4QNEA 3EKLA 1VRDA 4RCXA 3TE9A 1LROA 1LRTA 3M5VA 1YTEA 3M6YA 4NXKA 2F84A 1YADA 1Z48A 1C8VA 1MZHA 5FF7A 5CKSA 2AGKA 3MO7A 3QSTA 8TIMA 2Z2UA 4JGDA 2PCQA 4LC8A 3KOFA 2PRHA 3F4WA 3FJLA 3PBVA 3LCHA 4JD4A 3H53A 2NX1A 5CZTA 2AAMA 3C52A 1X1ZA 3KRZA 4ADTA 4FIQA 2PC4A 3W6YA 3NAVA 1XM3A 3S1WA 1KFBA 2CU0A 1DJNA 4G1KA 3MHFA 1DV7A 2J24A 3NM1A 4K36A 3G1VA 3G0XA 2Q3OA 1EX5A 4IOTA 1RPXA 1O5KA 3A21A 4AHOA 2CZ5A 3GX9A 3NL6A 4AAJA 3C56A 3QSRA 4UTTC 3Q2DA 3NZ1A 2C13A 1TRIA 1MEWA 1D9EA 1H7PA 1SSGA 3FOKA 4GUHA 4PA8A 2X1TA 1IXPA 5AHLA 4DBEA 2YPIA 4ORIA 2OZ0A 2VC6A 4WUIA 3RFAA 3SI9A 2YW4A 4PC8A 3O07A 4RKAA 2Z0IA 3F1QA 3UWWA 1B57A 1IIHA 3S9YA 4QIUA 5LNWA 4QNWA 5LNVA 4UC5A 5D2XA 5AC8A 4R7JA 1SFJA 4DEFA 3BG3A 3W7HA 4MZYA 4Y6GA 3IIZA 1YXYA 4O0KA 4PTNA 3KVJA 3RF9A 4TR9A 1OK6A 1GQNA 4BWLA 4P61A 2YGYA 4O8RA 3W22A 2Z6IA 2HS6A 5J5DA 3UWQA 4MFEA 3MP4A 5G4WA 3NQ6A 4O0ZA 2QCDA 3ZWSA 4DO5A 4UTMA 4BI5A 4MJMA 4GFSA 3LBMA 4BI7A 2BXVA 4A2SA 1VJIA 3EXSA 4Y96A 2YSWA 3UQNA 1O95A 1SFLA 3P80A 4QQ3A 3G3MA 1EWDA 4BI6A 4WOQA 2ISVA 3I7RA 1WX0A 1KTNA 3DZ1A 1K03A 2CFFA 3LRMA 5D38A 4XQ6A 1KM5A 1S5VA 3RNDA 4Q32A 2P10A 3E02A 3IVUA 1G4EA 3LCGA 3IIVA 1W5PA 3DKLA 3MUXA 5FEXA 4IJBA 3E9AA 3S1XA 1K8YA 3UWVA 4BWLC 3LTSA 1BWLA 3A24A 4HPXA 2IQTA 3NQFA 1W31A 5I3FA 2NXHA 1MXSA 3CIXA 3DXIA 2ABAA 3RMJA 5C55A 3QEZA 2CLLA 4IMDA 1O4UA 1IXNA 2R94A 4LRSA 1GYLA 1OYCA 1Q45A 3F4NA 4AB4A 2F7FA 3UZJA 5G2IA 2XN0A 4IX2A 1OX4A 1UB3A 5C6MA 1Q6QA 1QPRA 4UTLA 4CCDA 4DF2A 2BX7A 4RV8A 4AH7A 1TPWA 3NQMA 4N9BA 2B7OA 3THQA 4YXGA 4ZVJA 3W7KA 1FDJA 2VFEA 4O1CA 3CPRA 1JCYA 3O16A 4RK8A 3N2MA 2VENA 2Y7DA 2WNZA 2JKPA 4JY8A 1X8FA 3G22A 4JTTA 4O11A 2LLEA 3DFTA 4JTUA 2V2CA 2GOUA 5DCDA 5D2VA 4HNUA 5FF3A 5J5RA 1BTMA 1RV8A 5IM51 3G8RA 5D04C 3UWYA 3GB6A 5A5WA 1DJQA 1L6YA 3E49A 2A7NA 3W7QA 3QYQA 4KFPA 3TDFA 3NXFA 4LRTA 1KM0A 3UY8A 3TH6A 3LXAA 2NUXA 5F4XA 4WD0A 1WV2A 1SUXA 2ZRVA 2VFGA 4RLIA 1KV5A 4ORMA 3HF3A 3P61A 2GVGA 3N73A 2ZA1A 3DFSA 3JR2A 3FLUA 3R8RA 3ZFHA 5HUPA 4CQ8A 3N9RA 4ZQMA 4MY1A 5EPDA 3WK3A 1ONRA 4CNNA 4WXZA 4XBKA 5AOUA 4NUWA 3LXCA 1FY6A 5DY2A 3P84A 2QJIA 4MFDA 4TMCA 1YLVA 3PF3A 4X22A 3EKZA 3H55A 3LCIA 1H7OA 4LU0A 3W88A 2ZZ4A 3KVKA 3TQ0A 5AHNA 1LLWA 1OHLA 2VXNA 4ZQRA 3W2LA 1VCGA 4EVZA 3C2EA 4HN4A 3ATYA 3F03K 2DJXA 4Z0JA 1GVFA 4IMFA 1FCBA 3FJ6A 3MHUA 4RZ6A 4X3ZA 1XC4A 3CM4A 3QH2A 3FYPA 3GKAA 3VE7A 1I45A 4MY8A 3L21A 3TSMA 3LTYA 4M6QA 1RQEA 3TFCA 2C0AA 3TC6A 4JY9A 3T7VA 3SGUA 2QCFA 1GTHA 1X1OA 3KRUA 4MZ8A 4FO4A 3N14A 3P60A 2JKEA 5KSWA 1EEPA 2QF7A 2V2HA 4O16A 3C2FA 3GLCA 1QFEA 3DHFA 1GZGA 2OCZA 1QR7A 1KFEA 3EB2A 4A3UA 4LV4A 1XUZA 4FX8A 5A8GA 1SZGA 5DBUA 3DI0A 3G3DA 1XBYA 2Q8ZA 3L0GA 1R2TA 2NLIA 3A22A 4RR4A 3TQKA 4AHPA 1K7FA 2QKFA 3FS2A 3A5FA 1Q3NA 1LTDA 1HO1A 1DVJA 4UUIA 4R33A 1KTCA 1WXJA 3O6DA 4FXRA 5F4WA 3HIJA 2CLMA 3NNTA 4K7VA 3BARA 3W7LA 3GKFA 1QO2A 3ZWTA 2J9XA 3EX6A 2FPVA 3CTLA 2W6RA 2JGQA 1TPVA 1PCWA 1B4KA 1W3IA 3EXTA 5LSMA 1AW1A 2R14A 2G95A 3Q58A 1W5OA 3DFOA 3QZEA 4XKYA 3CB8A 2PE4A 4QISA 4LVGA 1TB3A 2PRLA 3BW3A 1TJPA 2ZRXA 1X7FA 3CLMA 4I9AA 4AHQA 3QM3A 3MYOA 1QPOA 4ZMGA 1WBHA 3NQ8A 4WJEA 4N6EA 1H7NA 3KXQA 4NJJA 3VFLA 5D05A 3PUDA 4HNNA 1FXPA 3BG5A 3T55A 1UUMA 3W7RA 3G1YA 5K2ZA 3TROA 1HL2A 4NVTA 4OV9A 3I65A 3OVRA 4HSNA 4UNKA 1PL9A 1KM6A 4O1AA 4EIVA 1IGSA 5C54A 1EB3A 1DOSA 3RLUA 3TUUA 3R89A 5IBXC 2ZRZA 2C6QA 3GIYA 2Q8LA 2QUUA 2YFOA 4HKPA 2FJKA 3TX9A 3O6CA 4CQAA 1TPB1 4IWWA 3NQCA 4MYAA 3A5VA 5HWJA 2EHHA 1ALDA 3W1PA 3G0UA 2ZCGA 3NZRA 1QPQA 4FEZA 4A2RA 4O50A 3MP5A 4K8HA 1XDLA 2QCNA 1M7OA 4N2YA 1NAL1 4A21A 5HWMA 3KVLA 3NPUA 5F2MA 3TIMA 3W1TA 2E1DA 3EXRA 3GNDA 3QMSA 2B4GA 4O4WA 4ZQCA 4S1FA 4FXSA 3W2JA 3M0ZA 1LBMA 2BWGA 2CLEA 1LRQA 1NFBA 3IEBA 1VCFA 2DZUA 2NZLA 3SIZA 3LLDA 3QPYA 4I7WA 1OJXA 1U83A 5HUOA 1MSSA 4GBUA 2CZFA 1GT8A 3SW6A 2C3ZA 3HG2A 2FTPA 3PG9A 1SR9A 2Y89A 3BLIA 3T4CA 4ALDA 5LGZA 1Q6OA 3HQ1A 4FNPA 4O15A 1CX9A 1YXCA 3W23A 3W3OA 1ZFJA 3OIXA 3O6YX 1JJKA 1AW2A 1J2WA 3LHUA 4M7TA 3W07A 1XDMA 4IPJA 1PHWA 1XBVA 1Z42A 2YFNA 1CI1A 3TJXA 5HQEA 1S5WA 3STFA 4MZ1A 2ZFAA 3W1UA 2QCHA 1SO4A 1QAPA 3W7MA 5D2WA 3W1NA 4S2BA 1DL3A 4OWGA 2ZQ0A 3LCWA 3NA8A 1OYBA 2G96A 2ZTJA 3QPZA 2Y7GA 5LHEA 2AQWA 4FIRA 2A4AA 3MMTA 5EL1A 2GUUA 5F2GA 5K4XA 5D02A 5HR6A 1CW2A 3ELFA 1FDZA 1SQ7A 3IGXA 4RZ4A 2FQIA 3NDOA 5FEPA 1D3HA 3LX9A 1LYXA 3LV6A 1UBSA 3L5AA 4LT9A 2WJZA 4JTJA 4OQVA 4N02A 2OT1A 4NX0A 3B05A 5HJLA 2CLOA 3NQGA 3PC0A 4ML9A 2Y62A 3PBYA 3WJSA 1ZAHA 2DZPA 2J27A 1H61A 3YPIA 5I3IA 1PE1A 1KM4A 3MYPA 4KKXA 4E2BA 1GJPA 5AHEA 3G1HA 3FA5A 4FNQA 2ZDRA 5AFDA 3L2IA 4OGZA 3PSWA 4O10A 3CWNA 4UTTA 1VS1A 4FNRA 1FWWA 5LGXA 3TAOA 2EKCA 1KFCA 2E68A 2JKAA 5KZDA 1H51A 1OFEA 2CLFA 1A5CA 3GR7A 5T26A 4DQWA 3SR7A 1T96A 4K6AA 3G24A 2WO5A 1IXOA 1NEYA 3NM3A 3DENA 5G2WA 2Y6ZA 4JEQA 3QMRA 4N4PA 4LS1A 3ANYA 1W56A 3LI0A 4ZZ9A 1ICPA 1RQBA 1JUBA 4JTEA 1N7KA 3W7JA 4TMBA 2QCGA 1FX6A 1GVOA 1YDVA 1IXQA 1JCLA 1D3GA 3NOEA 1KW1A 4FHAA 2QCEA 2YYTA 3V75A 3WJWA 1F7BA 4DXVA 3AO0A 3E0IA 1TSIA 2H90A 3OVPA 2YYUA 4JTKA 3BPWA 4I7VA 1A50A 2A5HA 1ME9A 4AEOA 3OEXA 3MI6A 5EY5A 4MPQA 4XWUA 3CWOX 4IMGA 4YMZA 4FX6M 3GVGA 3CU2A 4D2JA 3EEGA 2RHGA 3LHWA 4E0CA 4LV9A 2E5CA 2WKJA 3W75A 4NNBA 3CQ0A 3P67A 1EWEA 1JCXA 1EP3A 2HTMA 1K7XA 2QCMA 4IQLA 2FPTA 4Q4KA 5LNUA 2V5LA 1S5TA 5K9XA 4M19A 5D2YA 4C1LA 2VEKA 1TTJA 1VC4A 3IIPA 3LTPA 3UNDA 4XTDA 5H91A 5BOOA 3NPVA 3S42A 3P82A 3W7NA 3BG9A 3MJYA 3C2OA 5DCBA 4TU1A 3W1RA 1N8FA 1EP1A 4GXMA 3W1XA 1W3NA 2A6NA 4OT7A 2YR1A 1A53A 3HB9A 1TIMA 4OV4A 1AL7A 1I4NA 2EGZA 4LS0A 5KITA 3LLFA 4O1BA 1OYAA 2ZZ5A 2FB3A 2ISSA 2CWNA 4FNTA 4MVAA 5DELA 2YW3A 4FNSA 1Y0EA 4ADSA 1KFKA 1GVSA 3HO8A 3BV4A 3WK0A 3HG4A 4LWWA 4N6FA 3U2OA 4WXYA 3NO5A 3NQVA 3LI1A 4WY0F 1OFDA 3SY5A 2YX0A 1QCWA 1O60A 3S1VA 3M7WA 1EUNA 3N9SA 2V30A 2C14A 3EWZA 4WY0B 1BKSA 4IPIA 2HS8A 1W3TA 3TAKA 4C1KA 4NQ1A 4MKNA 4BF9A 4RZ5A 4MIMA 4GJ1A 1XFBA 3CC1A 1WYIA 3W87A 4UTUA 4FNUA 2E6YA 4S2CA 2QUTA 3WJZA 3B03A 4JTLA 4OHQA 4Q33A 4N9DA 3G1AA 5CZ0A 4JYFA 1TJRA 3S1UA 3QW3A 2V81A 3C2VA 3L67A 1FXQA 1MO0A 3FFSA 1OABA 1XCFA 4RXGA 4JN6A 2H8XA 1TMHA 3CEPA 2JGYA 3ABQA 3W9ZA 4LW7A 5TBOA 1F5ZA 1VGAA 2YZRA 2XFWA 4O14A 2QJGA 1PV8A 3BK0A 3FIGA 5AB3A 3TXZA 4UFKA 3CT7A 3CHVA 2WPBA 5G2HA 2DZSA 2EF9A 2FIQA 2Z1BA 2YCEA 1ZNNA 2EPHA 2PURA 3LXBA 1TPFA 5K4ZA 2RDUA 3QF0A 2RFGA 3WK2A 3OHIA 5HR7A 1DORA 2ZRWA 3FKKA 1LBLA 1KM1A 4O4VA 3W85A 1W37A 2NV1A 2ZZ7A 4DF0A 1JUEA 5CPNA 1JCNA 3OG3A 4ADUA 1ZHAA 2WSQA 3PS7A 3RU6A 1KTBA 1G4SA 3L0KA 1KA9F 1JUKA 5CSRA 3S5OA 3G18A 2R8WA 2H8ZA 4FB7A 1PVNA 3P8IA 5DXYA 5C2XA 3BLFA 1DQWA 3WJXA 4YWIA 1ICSA 3ABSA 1WOBA 3KVMA 4M5PA 3SSJA 1I2NA 3NG3A 2GVJA 1OK4A 5GVJA 1G4TA 4H6KA 3NPWA 4ZQOA 3TU9A 1SZEA 1ADOA 4P2VA 2NXIA 3ATZA 3IRDA 4NJKA 3TJLA 1HO4A 2DZWA 4E38A 3A23A 3GDLA 2B7PA 3JRKA 5SWUA 3STEA 2XN1A 2ZBTA 3GDMA 1QMLA 2PRMA 1GVQA 3K30A 1ZAIA 5U7SA 5F2IA 1HG3A 3B4UA 2Y7EA 3L65A 1OX4B 2OT0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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