1G01A

Alkaline cellulase k catalytic domain
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
357
structure length
357
Chain Sequence
PAGMQAVKSPSEAGALQLVELNGQLTLAGEDGTPVQLRGMSTHGLQWFGEIVNENAFVALSNDWGSNMIRLAMYIGENGYATNPEVKDLVYEGIELAFEHDMYVIVDWHVHAPGDPRADVYSGAYDFFEEIADHYKDHPKNHYIIWELANEPSPNNNGGPGLTNDEKGWEAVKEYAEPIVEMLREKGDNMILVGNPNWSQRPDLSADNPIDAENIMYSVHFYTGSHGASHIGYPEGTPSSERSNVMANVRYALDNGVAVFATEWGTSQANGDGGPYFDEADVWLNFLNKHNISWANWSLTNKNEISGAFTPFELGRTDATDLDPGANQVWAPEELSLSGEYVRARIKGIEYTPIDRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of alkaline cellulase K: insight into the alkaline adaptation of an industrial enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus sp.
total genus 126
structure length 357
sequence length 357
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2000-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1g01A00
1PEZA 4Z2KA 3CZGA 3VKKA 4GPNA 1TA3B 3PZTA 2DSWA 1UKQA 4M81A 2VQTA 3MV11 4QDMA 4FF5A 1EOKA 1HJQA 1NQ6A 4PCTA 4AEFA 4W5ZA 4H2CA 4QCFA 4EK7A 2ZUWA 3VD4A 5IFTA 1JYNA 2DH3A 4TX8A 1MYRA 1TE1A 1VFUA 3CZJA 4GO8A 4AZHA 5BRQA 3CUFA 5A2CA 3UR7A 1V3HA 4GI9A 1KQZA 4U5KA 3WDJA 2HVMA 5A6LA 4P8XA 1HJWA 3ZT7A 2OLHA 1W1VA 5I5RA 4CU7A 1M04A 1GOIA 3AHTA 1JI2A 1E71M 4MAVA 1PAMA 1BYBA 2W62A 3I3DA 1G01A 2EPNA 4HP5A 2OWCA 3CBWA 3WBAA 1JAEA 3WH5A 4A4AA 3BCFA 2V5CA 3WKZA 3UR8A 1D3CA 2DIEA 1CECA 3WUBA 3RMEA 5E70A 2F2HA 3VIOA 3KE0A 1GVIA 5E9AA 2WC7A 3ZM8A 4AWEA 1NM9A 4PTXA 5JBFA 3VD7A 3W0KA 3AHXA 1KXTA 1JAKA 3VIMA 3WEOA 5E6ZA 2FGLA 4HMEA 2ZX7A 3MANA 3ZJ7A 2XM2A 3L4XA 3GBDA 1XYFA 2WWCA 2X0YA 2PWHA 3ZJ8A 1I75A 4GO9A 4HOXA 3ARQA 1UWRA 4M82A 2RGLA 1IZJA 2WK2A 2EPLX 1VB9A 4Z2JA 1DWJM 2EPKX 1JZ8A 3WUGA 1WZLA 1AQ0A 4CCCA 1UR4A 3AZTA 4LYRA 2VJXA 1UHVA 2DSVA 5D4YA 3EBVA 2WKLA 4R5EA 3O6AA 2JFEX 2WMIB 4LPCA 3PZ9A 1JIBA 2AAAA 1JG9A 2XGBA 3A4WA 1Q6DA 3ECQA 2G3IA 4HZ8A 1VJZA 1E5JA 2A3BA 2GK1A 2JIEA 2JIWA 3RO8A 3BSGA 1JZ4A 5M3WA 5AYIA 1DWIM 3AXIA 1BGGA 2XFFA 1V0KA 3VM5A 3VX1A 2ZXBA 1W2PA 1ZB5A 1V3IA 1R86A 1QI4A 2OYLA 4B3KA 5CG0A 1KGWA 3VIFA 3ZOAA 3W81A 1OCQA 4MDOA 1JZ7A 1UD6A 1R87A 4EE9A 3AICA 3MUIA 1DWAM 3ZO9A 1H4PA 2QV4A 1M01A 3AZRA 3VGDA 4CUCA 4FLRA 4HMCA 3RIKA 3U7BA 1EHAA 1W2VA 2XJ7A 1VJSA 2J7HA 5I77A 5HPCA 1EO5A 3N11A 2A3EA 2QLYA 3NSXA 1UH3A 3NUKA 1CGVA 4D6HA 3IAQA 1E4NA 1E1FA 2BXYA 3NYDA 4CVUA 4QLJA 1SMAA 4UQDA 2XVKA 1WPCA 3LPPA 2ZUUA 4PMVA 1QBAA 1F4AA 1QI3A 4XV0A 3UERA 1HT6A 2VTFA 3L2LA 3MU7A 2GDVA 1KWKA 1VEMA 1EIBA 3MMDA 3D5HA 3MKKA 2W4XA 3ARVA 2GFTA 5A1AA 1BF2A 2UY3A 3VPLA 4P7OA 4MB1A 1FFQA 1E6NA 3W29A 1MFUA 4L4PA 4JKLA 1UKOA 4BQ4A 1W9DM 3AMDA 2YBUA 1W3KA 1QI0A 2XPKA 3WMCA 3ZSSA 1Y7VA 2CCRA 1XCXA 2GJXA 2J8FA 3NCOA 2Z1SA 3IJ8A 4KGJA 3LPGA 4CGTA 2CBUA 4JCLA 2EPMX 4GQRA 3W37A 1NOUA 4H04A 1XSIA 4PSRA 2G41A 1OD0A 3CHDA 1D7FA 4P7RA 3SUVA 5I23A 3EDDA 1XD0A 3F4VA 5BROA 1XCWA 1KXHA 1XV8A 5I0DA 1G94A 1ZBWA 5BXPA 2E9LA 4JIEA 2Z1KA 2DT2A 1SYTA 3VIHA 2JE8A 3WMSA 5IHSA 2WBGA 1XH1A 1UD8A 4QFUA 2E8ZA 1C93A 3W82A 5BXSA 5EFDA 1X6NA 1UH4A 4WKAA 2WVTA 1ZBVA 4HZ7A 4D6EA 1V02A 4NZCA 3RILA 1HP5A 3GH4A 3WDQA 3TOPA 1CNVA 1OM0A 3AROA 3BAYA 1ISVA 2WXDM 2WPGA 3S6TA 4A3YA 3EMCA 1UZ1A 4M29A 3DC0A 5ABEA 3AYRA 2W66A 1UWQA 3WELA 1J18A 5I24A 4C7GA 1HVQA 4AZGA 4MNJA 3QGVA 4EKJA 5LA1A 3DECA 3PHAA 2VRKA 4MDPA 3BH4A 3PTKA 3OA5A 2BXZA 2UWFA 2EQDA 3SEPA 4W86A 1FH9A 1QW9A 2Y4SA 5A95A 4CVWA 1HL8A 3W53A 1ODUA 1BG9A 4ML4A 4OUEA 3CMGA 2C7FA 1ISXA 2XVLA 1LWHA 1O7AA 1B90A 4BZYA 3VD3A 1C91A 1U30A 3MMUA 1OIFA 1V08A 4C7FA 1DP0A 1S46A 2WMGA 3AS0A 1VRXA 4WSKA 2FHBA 3T0AA 1H3GA 4AEEA 2FGZA 4E8DA 1EQPA 1B3WA 4DUXA 1B1YA 3AMGA 5HXMA 4UTFA 4M8UA 1W3HA 3PZNA 5KEZA 1UR9A 2QF8A 2J79A 4J27A 2A3CA 4W7UA 2VURA 3PZOA 5A8QA 4NSBA 4TTUA 4MNKA 1HJSA 1VFFA 3RPMA 3ZJKA 1W9BM 4AISA 4IUGA 2YDQA 1XH2A 1J01A 3OGRA 1K9EA 1E6SM 2V3DA 6CGTA 4FK9A 2YA0A 3N04A 1BAGA 4TVCA 2BVTA 2BFGA 1PIFA 1E6XM 1C92A 2EBNA 4GZIA 4W5UA 2D0GA 4B9YA 4ZXOA 1E6PA 1FA2A 2Y8KA 2E9BA 5A6KA 3K4AA 3AIBA 4F8XA 4UR9A 1LWJA 1K6AA 3T2QA 4MAZA 1E40A 3EYPA 3M7SA 3SCVA 3N1AA 1J0ZA 3CUGA 3CHCA 2ZWYA 2RGMA 1GJWA 4V27A 5HDRA 3VMNA 3ARRA 3EDFA 4OOUA 3ARZA 4Z2LA 1E4LA 3OZPA 1MQQA 3U7VA 2WB5A 2W5FA 2VCCA 1J0JA 3VUPA 3UG4A 5DEZA 2C0HA 1PX8A 4LX4A 1RD6A 1CYGA 1BHGA 4D6CA 5CLWA 3OG2A 4UFHA 3WUEA 1V03A 1WDSA 3U5UA 1QI5A 5GQBA 1GUVA 2Y24A 4ACYA 4BQ2A 1KGUA 2GJXB 5A2AA 2D0FA 4FMVA 4JL1A 4JL2A 3WQ5A 2Y2WA 4W84A 5FCZA 3L4TA 5EBAA 4MB4A 4Q7NA 2WANA 1MQPA 4IISA 2QHAA 3W27A 3L4ZA 1JDAA 3PTMA 4RE2A 2NT0A 4XX6A 4CD4A 2EXOA 4DWSA 1E56A 3OGSA 1VF8A 3WF2A 1EXPA 4MB5A 1ISYA 3WNNA 1WZMA 2W92A 4YN5A 1WDRA 3G6MA 3MS8A 4QP0A 4HOZA 3W24A 1UR0A 2BVYA 3A6OA 4JCMA 1V6UA 2PWGA 5D9OA 3VMPA 2YLAA 3I3BA 4ACZA 1TCMA 2OYMA 3FN9A 2GVYA 4UQAA 2VI0A 1LL7A 1E1EA 5CZKA 4PMNA 1XSKA 2JEPA 2WSPA 4V28A 4J3TA 1NOWA 3LPFA 2UY2A 1CXEA 3BMWA 5FKYA 2G3MA 3WF3A 1KFWA 5BWFA 1B3ZA 1NP2A 1WP6A 2IXVA 2WMHA 3OIHA 1GPFA 3WL0A 1JZ2A 3VIIA 4IPNB 3F5KA 5CSUA 4WJXA 1V6XA 5BXTA 3VNYA 3SIMA 3BSHA 2YA2A 4MB3A 2WZHA 1E43A 5CPQA 3AI0A 3L4WA 2PI6A 3AOFA 3PZVA 2XTKA 2WCAA 1JF6A 4MNMA 3W26A 1OB0A 5I3DA 1CLVA 3MUY1 3IAPA 1W1YA 2WLZA 5ABFA 1V6VA 4PMOA 3TA9A 3WFLA 1ITCA 3ALFA 2XVGA 3TTYA 2J77A 2VC9A 1KCLA 1JYVA 3W28A 1OGGA 1SFSA 2AOSA 4D1IA 3MSDA 1QNPA 3VU2A 3FHAA 2BHUA 1QNRA 2E4TA 4D72A 3K4DA 2W67A 2VX6A 1Z32X 4UFIA 1LG1A 2A3HA 2VVNA 2WLYA 1JF5A 5GPRA 4AZ6A 1GHSA 3D3AA 3AIRA 1UZ4A 2J7CA 4EAMA 3RM8A 5BRPA 1BTCA 4BQ3A 4AXNA 5A8OA 3TP4A 1ECEA 2G3NA 2E8YA 1NWTA 3SUSA 4WK9A 3SCWA 2Q8XA 2ESCA 2F61A 4WF7A 1GOOA 4FLSA 3VILA 1C7TA 1H2JA 2OSWA 3U5YA 2WM0A 2YL5A 3FHQA 3BLKA 3PN8A 1VFOA 4LXFA 4QAWA 2OWWA 1UWTA 2WCSA 4X9YA 5HPOA 1BGAA 4LQ1A 4HTYA 1NOFA 3ZT5A 3AIQA 5DT5A 2ZE0A 3WD1A 1RP8A 1UD3A 3QHMA 3FAXA 1H49A 2BV9A 1FH7A 1EO7A 3WQ4A 3WNKA 3CUJA 5FOOA 3FNDA 1JXJA 1TR1A 4ATWA 2NT1A 3T2OA 2D0HA 2WHJA 2VZUA 4PUDA 2ZUTA 3L4VA 3MUAA 1W9XA 5FL0A 3S2CA 1E72M 1UOKA 5JUVA 2F8QA 2FDMA 2CPUA 1VFMA 3RJXA 4D6IA 1NWRA 2ZUMA 1L8NA 4CCEA 3PZGA 5ECUA 1HKJA 3K46A 3BLPX 1UUQA 1V6YA 4XZBA 2BNJA 1KXVA 1E6ZA 1JD7A 1J10A 3GNPA 1W3LA 2ZX5A 3TTQA 2DSZA 1K9FA 5A8MA 1CGTA 2XVNA 2C8NA 1J0IA 4JZ5A 2VZOA 1X1NA 1E0VA 7TAAA 1U2YA 3CPUA 5A6AA 2WC3A 1JFHA 3DYMA 1RPKA 1GW1A 3RCNA 1HN1A 1E6QM 1UQYA 3AQUA 3GXIA 3O9NA 2E40A 4UZSA 2PBOA 2QPUA 3ZIZA 2YA1A 1DTUA 1E15A 4OBSA 4X0NA 1CGYA 2DDXA 4JFWA 2WVUA 4J3UA 4OKDA 3VGFA 2IXUA 3WDPP 4W8LA 1BLIA 1TFVA 4AW7A 4PMYA 1M53A 3WY1A 2GJPA 4HPHA 5DMYA 2XWDA 2JF6A 3AHZA 1VBRA 2XWEA 3NDZA 4H7VA 7CGTA 4X0VA 3B9EA 1KWGA 5DF0A 2VRJA 1UWIA 5A8NA 1HJUA 3UCQA 1EHNA 1CLXA 1FFRA 4ACZB 3B9DA 3K1DA 1CDGA 2FHCA 3HN3A 3ZJ6A 4MNLA 5ABGA 2BY3A 1GOMA 1V3JA 2WVVB 1WZKA 4WLCA 1BYCA 2GJRA 5GNXA 4F79A 3VVGA 4W85A 1GQJA 5AC4A 2TAAA 1WZAA 3WNOA 4PRWA 5CGMA 3OZOA 4HA1A 2WAGA 1P6WA 1RH9A 1BVNP 3BMVA 3WH7A 3II1A 5M5DA 4J3SA 4M80A 1W9VA 4NRRA 3WDHA 5IDIA 1JI1A 1E4MM 3UG3A 3AHYA 2ZWZA 4PTMA 4E8CA 4UQ9A 1UR8A 3ALGA 5A3HA 4WIWA 1EGZA 5BYWA 2JALA 1E70M 1B2YA 1CXHA 2OSXA 3SUUA 4ATDA 4J3VA 1FP8A 1HL9A 4UZUA 4D6GA 4PTWA 4CD5A 5ABFB 1FOBA 4C7DA 1HF6A 5LA2A 7A3HA 2GUYA 2UY4A 3KEHA 3K8LA 2WYSA 4AMCA 4YPJA 4NRSA 5F7UA 4U31A 1K9TA 2DT1A 3BAIA 2V3FA 3CIVA 4AY1A 3GXDA 4U2ZA 1WCGA 3ZMRA 2XIBA 1PX3A 3WFZA 1TMQA 2NW0A 1KGXA 3N15A 4YHGA 2UY5A 4D6FA 1GVYA 2D24A 4W88A 3VTRA 4PCSA 3WIJA 2VO5A 3TTOA 2DT3A 1U33A 4TTGA 4P8UA 3KL0A 1JZ5A 3WDRA 3AXHA 2ZXDA 6A3HA 1E9LA 1QNQA 5EFFA 1QVBA 4S3JA 1B3VA 3CTTA 1US2A 1LL6A 3THCA 4U3AA 2D20A 1QNSA 1KR1A 5JIWA 4AZBA 3B9AA 4BF7A 3AS3A 2DSUA 5HBFA 2YBTA 3VO0A 4JHZA 1ZL1A 1GORA 3CUIA 3VGEA 1GONA 2D2OA 1QHPA 2EPOA 1JZ3A 5FD0A 1KXQA 3KWXA 5A2BA 3WF4A 3BCDA 4PYSA 1V3LA 4AD3A 4GXPA 1G0CA 1R8LA 3AS2A 3OBAA 2YL6A 1MXGA 4GKLA 1E73M 4ZFMA 2W61A 4H8UA 4P7QA 1HKKA 1H41A 2A3AA 3KL5A 2DGAA 1VIWA 1JD9A 3BXWA 2ZXQA 2VZSA 2DSKA 4AD4A 3SUTA 4GZJA 4WSJA 3TONA 3K8KA 3MMWA 2VL4A 2GK1B 4ATLA 4AIOA 3I3EA 2VX7A 2ZX9A 1V0MA 1JZ6A 3POHA 3QHOA 2CEQA 4KRUA 4AZIA 3AIWA 1VEPA 1JNDA 3ARXA 1MVYA 5E0FA 4TX6A 4IPLA 2Y5EA 2BY2A 3AMKA 3DHPA 2PWDA 2J78A 1HJXA 4MJ4A 1B0IA 3CGTA 1HJVA 3PZQA 2VCAA 1OIMA 4TVUA 2ZX6A 3A47A 1UKSA 3CZLA 2W91A 1WDPA 3PBGA 3CZEA 4UQBA 1E0WA 2PWEA 1UA7A 1R85A 4HU0A 3WQ8A 2OYKA 3WD3A 1TUXA 4UNIA 4TUFA 2O92A 1I1XA 3IJ7A 3MV01 5BCAA 2JEQA 4U3CA 1JNEA 1HXJA 3SCSA 3VINA 3QHNA 3PZMA 1BG4A 3CHEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1PEZ A;  4Z2K A;  3CZG A;  3VKK A;  4GPN A;  1TA3 B;  3PZT A;  2DSW A;  1UKQ A;  4M81 A;  2VQT A;  3MV1 1;  4QDM A;  4FF5 A;  1EOK A;  1HJQ A;  1NQ6 A;  4PCT A;  4AEF A;  4W5Z A;  4H2C A;  4QCF A;  4EK7 A;  2ZUW A;  3VD4 A;  5IFT A;  1JYN A;  2DH3 A;  4TX8 A;  1MYR A;  1TE1 A;  1VFU A;  3CZJ A;  4GO8 A;  4AZH A;  5BRQ A;  3CUF A;  5A2C A;  3UR7 A;  1V3H A;  4GI9 A;  1KQZ A;  4U5K A;  3WDJ A;  2HVM A;  5A6L A;  4P8X A;  1HJW A;  3ZT7 A;  2OLH A;  1W1V A;  5I5R A;  4CU7 A;  1M04 A;  1GOI A;  3AHT A;  1JI2 A;  1E71 M;  4MAV A;  1PAM A;  1BYB A;  2W62 A;  3I3D A;  1G01 A;  2EPN A;  4HP5 A;  2OWC A;  3CBW A;  3WBA A;  1JAE A;  3WH5 A;  4A4A A;  3BCF A;  2V5C A;  3WKZ A;  3UR8 A;  1D3C A;  2DIE A;  1CEC A;  3WUB A;  3RME A;  5E70 A;  2F2H A;  3VIO A;  3KE0 A;  1GVI A;  5E9A A;  2WC7 A;  3ZM8 A;  4AWE A;  1NM9 A;  4PTX A;  5JBF A;  3VD7 A;  3W0K A;  3AHX A;  1KXT A;  1JAK A;  3VIM A;  3WEO A;  5E6Z A;  2FGL A;  4HME A;  2ZX7 A;  3MAN A;  3ZJ7 A;  2XM2 A;  3L4X A;  3GBD A;  1XYF A;  2WWC A;  2X0Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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