1G01A

Alkaline cellulase k catalytic domain
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
357
structure length
357
Chain Sequence
PAGMQAVKSPSEAGALQLVELNGQLTLAGEDGTPVQLRGMSTHGLQWFGEIVNENAFVALSNDWGSNMIRLAMYIGENGYATNPEVKDLVYEGIELAFEHDMYVIVDWHVHAPGDPRADVYSGAYDFFEEIADHYKDHPKNHYIIWELANEPSPNNNGGPGLTNDEKGWEAVKEYAEPIVEMLREKGDNMILVGNPNWSQRPDLSADNPIDAENIMYSVHFYTGSHGASHIGYPEGTPSSERSNVMANVRYALDNGVAVFATEWGTSQANGDGGPYFDEADVWLNFLNKHNISWANWSLTNKNEISGAFTPFELGRTDATDLDPGANQVWAPEELSLSGEYVRARIKGIEYTPIDRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of alkaline cellulase K: insight into the alkaline adaptation of an industrial enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus sp.
total genus 126
structure length 357
sequence length 357
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2000-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1g01A00
2CERA 2W63A 2WANA 1M04A 3VGDA 4BCEA 1B3WA 1MWOA 1GOIA 1QVBA 1HJSA 2CBJA 4P8UA 4MJ4A 2VVNA 1V0MA 4JAWA 3ZO9A 2Y5EA 3TTYA 3GNOA 3MS8A 1UH3A 1J12A 3BMVA 3AIVA 3VIKA 4UTFA 3CMGA 3D3AA 1F4AA 1VRXA 2EPOA 1V3MA 1W32A 3AMGA 4AD0A 3AYSA 1E5JA 3OLDA 2C8NA 4U5KA 2GJXA 1JYNA 1C8YA 1E4MM 1JF5A 1UWRA 3L4UA 1B31A 1BSIA 4CCCA 1WCGA 4J3UA 2FDMA 4H8HA 5JIWA 3PBGA 3GYCA 3VDHA 2EPMX 3K46A 1BYBA 4F9JA 5CLTA 4NRSA 1JDAA 2XVGA 1UZ4A 1X6NA 1GQJA 2YBTA 3PZ9A 1M03A 2WM0A 4L4PA 1PJ9A 4U33A 3WH5A 1OGGA 3VD7A 1GORA 1QI3A 2IXVA 4UQEA 2VCAA 4QLLA 1MVYA 3UEQA 3ZIZA 5A8QA 3MMUA 1VJZA 1GJWA 2WYSA 3K4DA 3AYRA 1FH7A 5A6MA 5M5DA 3N11A 2ZUUA 4MNMA 5DMYA 4KWUA 2WBKA 3PZUA 1J11A 2J4GA 3J7HA 3L4WA 1B3VA 4UFKA 3MV01 2OWWA 4AD2A 1OINA 4ML4A 2FHBA 2TAAA 4EK7A 4X0NA 2J7CA 3RO8A 5A8OA 4D6GA 5IFPA 1WZKA 3PZOA 1CPUA 1QNPA 2WWCA 3MKKA 4C7DA 3AS0A 1J01A 1MW0A 4PTWA 2D1ZA 1CZ1A 1OIFA 1VIWA 2ZX8A 1EHNA 2VR4A 1DHKA 1ECEA 4AZ7A 5A94A 5HPOA 2XPKA 3AIBA 1H2JA 4GQRA 1BG4A 1GQLA 4D6EA 3CUHA 1OB0A 3VDCA 3A4WA 1R7OA 4OKDA 2WNWA 5M03A 5D8ZA 4FLSA 3CTTA 1I1WA 1TA3A 3BXWA 4W84A 2GDVA 3OBAA 2WBGA 4W7UA 5DF0A 3AS1A 7TAAA 4HOZA 1WKYA 3I3DA 2XGIA 4TOQA 2YL8A 3AMCA 1CXEA 1UZ1A 2WCSA 4CD7A 2OWCA 3MUZ1 3W53A 1MFVA 2WSPA 2D24A 4PCSA 3JUGA 5HDRA 3SUUA 3U5UA 3W4RA 3ZR5A 4AWEA 5CZKA 1DWIM 2FGZA 4L4OA 2A3HA 2EXOA 1L8NA 4D6CA 1NWSA 5DT5A 1B90A 1OT1A 2BNJA 2YDSA 4P7OA 4AIOA 3WBEA 2WHKA 3UG4A 3ZM8A 1MXGA 1V6XA 3FAWA 3POHA 2FH6A 4IPNB 3L4TA 3T0AA 4LPCA 3QGVA 3IJ9A 1TR1A 3KL5A 1KBKA 3HMCA 1LF1A 4BQ4A 2XG9A 4WIWA 3THDA 4EANA 1E6ZA 2V3EA 1QNRA 3ARUA 3VIHA 5GNXA 3VMOA 3SUVA 1I75A 3W29A 2CBVA 1QBBA 3BH4A 1PPIA 4AYSA 1UR4A 4DUXA 3VGGA 2GK1A 1UWUA 1C90A 2F61A 3AZRA 4GI9A 3N1AA 1OGBA 4WJXA 1H41A 5I79A 3SURA 3WQ5A 1ISWA 1JFXA 3ZT5A 1WNOA 3ARXA 1LWJA 4QCEA 6TAAA 2WHMA 1Q6FA 1XGZA 1KCKA 3OLEA 4XZWA 4PEEA 1ISZA 3WQ6A 2VL4A 4JFVA 2GK1B 3CPUA 2XIIA 3ZT7A 1HN1A 1HIZA 1HVXA 2G3NA 3EDJA 2QPSA 4HMEA 5D9NA 3WQVA 4DM1A 1CIUA 5A6JA 1B3XA 4CVWA 3WQ8A 3AHVA 1UKPA 2WVVB 1SFSA 4ATDA 2JF7A 4Z2HA 1E0VA 1CDGA 3MV11 1JAEA 2GVYA 1BLIA 4IPLA 2FHFA 3QHOA 1AQMA 1B2YA 2WVUA 2BXYA 3BCDA 1UYQA 2D0HA 4RE2A 1MXDA 5IFTA 1Z32X 1JNEA 2BS9A 4M82A 4DUWA 2JIWA 5LA2A 2ZXDA 2XFYA 3AOFA 3GZAA 2XSBA 3GDBA 1XD0A 3NDYA 5D4YA 4PMRA 2DDXA 1PZ3A 3EYPA 1SMAA 3VX1A 5JIPA 1H0GA 4D72A 2OSXA 3GNRA 4LX4A 1E3XA 4J3VA 2XWEA 2W4XA 1BAGA 1KB3A 4R5EA 5I23A 4D6HA 1FH9A 3A4XA 1LG2A 1UG6A 1I1XA 1ISYA 4CN4A 4QLKA 2X2YA 3SCWA 2QF8A 1HKJA 4HZ8A 3BCFA 4WKHA 4AEFA 3VDBA 1J0IA 5KZ6A 5BRQA 3CZ8A 4JZ5A 4CGTA 5BXPA 3W37A 1V6WA 3AIQA 4EE9A 3AHYA 1BGAA 5CPQA 2XM1A 1Y7VA 2V3GA 4OIFA 1MFUA 2XVLA 3OGRA 2YBUA 1GOKA 3CUFA 2WVSA 5A2AA 2VX6A 1VFUA 1UUQA 1FHLA 1UQYA 2WK2A 1V0NA 3OZPA 4RE3A 1B3ZA 2VQUA 2FGLA 4GI6A 2WMGA 2J7HA 2WC3A 5BROA 1O7AA 2A3EA 2G8ZA 2J25A 5A6BD 1JXJA 4UFHA 1E72M 3QOMA 3IAQA 5HNNA 3OGVA 1XSJA 2BY2A 2D23A 2WZIA 3W26A 1AVAA 3ALFA 2D22A 3M46A 1E3ZA 3EDFA 1W9PA 2O9PA 1K9TA 2WWDA 1HKKA 2Y2WA 3W81A 3W0KA 1WE5A 3AHXA 3OLIA 2OYKA 5LA1A 2UY3A 5HPCA 4PMQA 1NQ6A 1E0WA 2VNCA 2WC7A 4H2CA 4M56A 2BVTA 1VB9A 4CD6A 4D6FA 3PZMA 4M80A 4U3CA 2PWEA 2DSKA 3KL0A 4FLOA 4PMNA 4AZCB 4HA3A 6A3HA 9CGTA 1XSIA 3WF1A 4X9YA 5FD0A 1CXIA 4CN1A 1WZLA 5DEZA 4AD5A 4P7QA 2HISA 1CGYA 4M1RA 3IK2A 3MUAA 3VILA 4UQCA 3W27A 1TMQA 4UNIA 3VNYA 4BA0A 8A3HA 1UWQA 5I2UA 1GQIA 3RPMA 1Q6GA 4HA1A 2J75A 3O9NA 1HJXA 2FHCA 2O9TA 1J0HA 4AZ5A 3IAPA 3K8LA 4DM2A 3CHEA 1TZ7A 1E0XA 2J7EA 2VX5A 5I3DA 2Z1KA 5IHRA 2BVYA 2C7FA 2B31A 4ACZA 1C8QA 2IUZA 3BLKA 2MANA 3RM8A 1MW1A 4J27A 3BAYA 3FXYA 3PZNA 1JYWA 3RJXA 3B9DA 1LJYA 3AXIA 2XVNA 1XC6A 3TA9A 4B3LA 1QI2A 2XFRA 3O6AA 4KRUA 1O6IA 1TG7A 2ZUSA 3CZGA 4D1IA 2DPEA 2WMJA 4E4PA 1V3KA 4W8BA 5EFDA 2JFEX 4R27A 4F9DA 3SEPA 1JXKA 2Y4SA 1E73M 1PIGA 1V02A 1RP9A 4HP5A 3WD0A 3GM8A 2WMIB 4TVUA 4UFJA 5CSUA 4C7FA 4H41A 3CUJA 3QOKA 4HMCA 3K1DA 4CU7A 3LPGA 1EDTA 2X05A 5E6ZA 4TTGA 1JZ2A 2RGMA 4P7RA 3L4VA 1D7FA 1QOXA 4W8AA 4Z2KA 3CBWA 1ZJBA 1UWIA 4OBSA 1IT0A 4FLQA 2PB1A 2OYMA 1VBUA 1F4HA 1KWKA 1DWGM 1GVIA 3TTQA 2D3LA 2DH2A 1SMDA 1GHSA 1CGVA 1QPKA 1PZ2A 2QLYA 3WF0A 2XHYA 1VFMA 5CQ1A 1GPFA 3VDAA 2XM2A 3ZSSA 4JKKA 2EQDA 2J74A 1HKIA 3NUKA 1OT2A 1JGIA 3T09A 2GFTA 2X8RA 3SCRA 4ZEPA 5FOOA 4PSRA 3QR3A 1WB0A 3M7SA 4OBRA 2VX4A 4IM4A 3ZJKA 2EPNA 1SR0A 3KEHA 1KGXA 5IHSA 2XSAA 4PBGA 4PMUA 4GXPA 4AZBA 4CD4A 1E15A 1PAMA 1V6VA 1QW9A 1CLXA 2G3JA 3BAKA 3SCOA 3DHUA 4N0RA 1B0IA 1N82A 3K8MA 4KRTA 4IISA 1W2PA 2E4TA 1C91A 3CUGA 4JFSA 1GQKA 2XVKA 1NM9A 2VURA 5A2CA 1UR0A 2VX7A 1AQ0A 3FAXA 4Y7EA 1WZAA 1RD6A 4S3JA 3UG3A 2E40A 2DT1A 1BQCA 3DYOA 1B1YA 1FP8A 2Y8KA 4C7GA 3GBDA 1HKMA 4CN6A 3U57A 4DUVA 2ZUTA 3MMDA 4UOJA 2J8FA 4KGJA 4W86A 2ZXAA 1HL9A 1H1NA 1J0ZA 4X0VA 2PBOA 2WVTA 3MUY1 4MB5A 4ZXLA 1US3A 2YL6A 3WMSA 4NZCA 5EB8A 4W87A 4UCFA 1OM0A 1UKTA 3BSHA 4W85A 4W93A 4YN5A 4JFTA 4QLJA 1OSEA 5EFFA 3RM4A 3AXHA 1TCMA 3IJ8A 2JEQA 3T2QA 1DWAM 1FHDA 5BRPA 4CUCA 1ZBWA 1EH9A 4LYQA 3ALGA 4AD3A 2Q8XA 3WL1A 2CYGA 1R87A 1V02E 1NWUA 1HJUA 3EDKA 2X0HA 3UR8A 2FH8A 4AMCA 1OD0A 3WFZA 1HVQA 1K9DA 2YA2A 4LYRA 4WSJA 1XYZA 2OSWA 4B9ZA 1HF6A 4GZIA 3KZSA 5TD4A 3T0DA 1M01A 2YIHA 1XRVA 2PWDA 2YJQA 1QI5A 4NRRA 2GJPA 4DWSC 3VKKA 1CGTA 2X1IA 1E43A 1JAKA 1JNDA 1QHOA 4OOZA 4V28A 4JHOA 4NF7A 1JG9A 2UY5A 4JL1A 3WUFA 2PWFA 3AQUA 4J3XA 5ABEA 3WF2A 1QNSA 2CITA 1QBAA 2WHJA 4LXFA 1HL8A 3LPPA 3WQ4A 3ZJ8A 1X1NA 5JBFA 4IUGA 4LYPA 3WNPA 1U33A 5ECUA 2W92A 2CHNA 2GSJA 5C71A 1M53A 1FFRA 3BMWA 3N18A 4AZ6A 2EJ1A 3RCNA 3WEOA 1C93A 3GH5A 5CPSA 1DEDA 1JZ6A 1W1PA 2ZICA 2DSUA 3M6DA 4JIEA 4J28A 3RMEA 1M7XA 1V0KA 4AD4A 2JIEA 3AMKA 2W66A 1NARA 3ZR6A 1UD8A 2YLLA 3VVGA 1OWQA 1OCQA 3RM9A 5E9AA 2VRQA 4EKJA 3W6MA 3F5JA 3PTKA 1R86A 1ZJAA 2WKGA 4MNJA 1G1YA 5A6LA 1UWSA 4MJ2A 2G4FA 2VQTA 1US2A 2EO7A 5I6SA 1CXFA 3B9EA 4HZ6A 1E6NA 5ABHA 3NSNA 2VZOA 3HJEA 3UR7A 1KBBA 1HJVA 1PBGA 7CGTA 2XJ7A 3AI0A 4ACYA 4Z2GA 4BQ2A 2EPLX 1D2KA 4UZUA 5CG0A 5A6AA 1D3CA 1XD1A 1HXJA 4PMDA 5HOSA 2C0HA 3ARRA 3CZEA 2QPUA 1C8XA 5IXEA 2CNCA 3OIHA 2WVVA 1XV8A 1JYVA 4HZ7A 2V5CA 1IZJA 1L0PA 3RIKA 1Q6CA 3QHMA 2GDUA 2DGAA 1UA3A 2DT2A 1G9HA 2EBNA 3VGEA 5E70A 1ZL1A 1CXKA 2CBIA 1E4LA 4JHZA 4GINA 1J0JA 2ZIDA 5CPTA 3I3EA 3L4XA 3WNMA 2D20A 3CIVA 2OWXA 2YKKA 1W3LA 3LPFA 4CD5A 2CIPA 3PZTA 5DT7A 3W38A 2VRKA 1LL6A 2CKSA 5EBAA 1ZU8A 1BYAA 1V3IA 1NOWA 1FFQA 3GXFA 2VZSA 5AC5A 2GUYA 3N9KA 3FHQA 1UD3A 3PZGA 4P7NA 4AISA 3VIGA 3B9AA 2W61A 1BHGA 3WDPP 2VRJA 2BY0A 3GNPA 1CXLA 2WB5A 1UR9A 4W89A 4P8VA 3WSUA 1CLVA 5GPRA 2BHYA 3L2MA 3L2LA 2CPUA 1EDQA 3NYDA 1NP2A 2W62A 3O2LA 2ZWYA 3WL0A 3AMLA 4YPJA 2WLYA 4W5UA 3IANA 3FNDA 1OBAA 6CGTA 4FMVA 4KGLA 2PBGA 2PF0A 4JFUA 3WBAA 5AY7A 5LA0A 1W3KA 2UY4A 2ZE0A 1UR8A 1VEMA 1JD7A 1W9VA 3L4YA 3ARVA 2V5DA 3VM5A 4MAVA 2DT3A 3OGSA 3VU2A 1WPCA 5D9MA 2JALA 3BGAA 4Z2JA 4NI3A 4UFLA 4PMOA 4UQAA 3W6LA 3T08A 1DWFM 1LG1A 1BYCA 1EOMA 1LWHA 2O9OA 2XFFA 1JZ7A 4GO8A 1UKQA 4AEEA 1E70M 4AC1X 1RH9A 2E8ZA 1JD9A 4BZYA 4JCMA 1Q6DA 3KL3A 3AROA 3SIMA 5A6BA 4MDOA 1EQCA 2WLZA 3WNOA 2XIBA 1UOKA 1TVPA 4WSKA 3VMPA 3RDKA 1UD4A 1PX3A 4B16A 3CMJA 2NSXA 5I5RA 2VC9A 3SCUA 2J78A 5D8WA 5CGTA 1NWRA 2J77A 1HX0A 3CHDA 2JE8A 3NCOA 1GCYA 1YHTA 3GXMA 4AZCA 2G3IA 1J10A 4GI8A 2WPGA 3VM7A 1GZJA 3WMBA 4NSBA 4AIUA 3L4ZA 3A6OA 3WY1A 4MB3A 1W3HA 3G6MA 4QAWA 1HJQA 3LMYA 4PMZA 4PUDA 5A8MA 1SYTA 4AW7A 1UR1A 2F8QA 3GH4A 1HNYA 2Y24A 3WEMA 3SUTA 2VR5A 2VVSA 4UQ9A 1K9FA 1ZB5A 3VOCA 1WDRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2CER A;  2W63 A;  2WAN A;  1M04 A;  3VGD A;  4BCE A;  1B3W A;  1MWO A;  1GOI A;  1QVB A;  1HJS A;  2CBJ A;  4P8U A;  4MJ4 A;  2VVN A;  1V0M A;  4JAW A;  3ZO9 A;  2Y5E A;  3TTY A;  3GNO A;  3MS8 A;  1UH3 A;  1J12 A;  3BMV A;  3AIV A;  3VIK A;  4UTF A;  3CMG A;  3D3A A;  1F4A A;  1VRX A;  2EPO A;  1V3M A;  1W32 A;  3AMG A;  4AD0 A;  3AYS A;  1E5J A;  3OLD A;  2C8N A;  4U5K A;  2GJX A;  1JYN A;  1C8Y A;  1E4M M;  1JF5 A;  1UWR A;  3L4U A;  1B31 A;  1BSI A;  4CCC A;  1WCG A;  4J3U A;  2FDM A;  4H8H A;  5JIW A;  3PBG A;  3GYC A;  3VDH A;  2EPM X;  3K46 A;  1BYB A;  4F9J A;  5CLT A;  4NRS A;  1JDA A;  2XVG A;  1UZ4 A;  1X6N A;  1GQJ A;  2YBT A;  3PZ9 A;  1M03 A;  2WM0 A;  4L4P A;  1PJ9 A;  4U33 A;  3WH5 A;  1OGG A;  3VD7 A;  1GOR A;  1QI3 A;  2IXV A;  4UQE A;  2VCA A;  4QLL A;  1MVY A;  3UEQ A;  3ZIZ A;  5A8Q A;  3MMU A;  1VJZ A;  1GJW A;  2WYS A;  3K4D A;  3AYR A;  1FH7 A;  5A6M A;  5M5D A;  3N11 A;  2ZUU A;  4MNM A;  5DMY A;  4KWU A;  2WBK A;  3PZU A;  1J11 A;  2J4G A;  3J7H A;  3L4W A;  1B3V A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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