1G0CA

Alkaline cellulase k catalytic domain-cellobiose complex
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
358
structure length
358
Chain Sequence
PAGMQAVKSPSEAGALQLVELNGQLTLAGEDGTPVQLRGMSTHGLQWFGEIVNENAFVALSNDWGSNMIRLAMYIGENGYATNPEVKDLVYEGIELAFEHDMYVIVDWHVHAPGDPRADVYSGAYDFFEEIADHYKDHPKNHYIIWELANEPSPNNNGGPGLTNDEKGWEAVKEYAEPIVEMLREKGDNMILVGNPNWSQRPDLSADNPIDAENIMYSVHFYTGSHGASHIGYPEGTPSSERSNVMANVRYALDNGVAVFATEWGTSQANGDGGPYFDEADVWLNFLNKHNISWANWSLTNKNEISGAFTPFELGRTDATDLDPGANQVWAPEELSLSGEYVRARIKGIEYTPIDRTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of alkaline cellulase K: insight into the alkaline adaptation of an industrial enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus sp.
total genus 127
structure length 358
sequence length 358
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2000-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1g0cA00
1PAMA 2BVTA 3VX1A 3WDHA 4F9DA 3HU7A 3UCQA 2BNJA 2UY2A 4GI9A 4LPCA 4D71A 1KXQA 3CUIA 3AS3A 1DHKA 4MJ2A 1E15A 2PWGA 3WNKA 1LL6A 4HZ8A 1NP2A 1K9FA 3WMCA 4TX6A 1TVPA 2YBTA 2WHLA 4PTVA 3VGDA 4ZENA 3SCRA 3ZJ7A 2FGZA 4CUCA 4W93A 2VUYA 4WKFA 4D1IA 2YLLA 4PSPA 2DSUA 1ZBWA 4ACZB 1E55A 1V3KA 3WY1A 4DWSD 3L4ZA 1W3JA 4D72A 3CTTA 1OM0A 3GXDA 4U2ZA 3WNMA 2PWDA 3L2MA 4LX4A 3GBDA 3UR8A 1NP0A 2D3NA 1JFHA 3SUUA 5IFPA 2FH6A 4PMDA 1SR0A 3GNOA 4U5IA 4RL3A 4EK7A 4F66A 1CWYA 3CHEA 3PZOA 4AEFA 2YDQA 1VJSA 1ESWA 4P7OA 3VINA 2WNWA 3ZO9A 4JKLA 2E8YA 3BLPX 3AIUA 3T2OA 3CMGA 5EB8A 1E0XA 1OINA 3AZTA 2C8NA 3MO4A 5E0FA 3BAJA 4Q22A 2XGIA 3GH7A 4MNKA 4S3KA 3A47A 1W3LA 2D23A 1E6ZA 5D9PA 1MQQA 1Z32X 2PB1A 1JFXA 1TZ7A 1D2KA 3AS2A 2D22A 3NSMA 4X0VA 3NUKA 1JD9A 4OKDA 5FL1A 2ESCA 3CUGA 4YHEA 3SCWA 3AS0A 4Y7EA 4M8UA 2EPNA 1NWSA 5TD4A 3VGBA 5ABFA 3AIVA 3OLEA 3WD1A 5JBEA 1V6YA 4W5UA 2J7GA 3CUHA 3SCPA 4AIUA 4D6HA 3DYOA 1GOWA 1OD0A 5CG0A 3LPFA 2ZUUA 4AZBA 3AZSA 4UQDA 2PWEA 1QNSA 3OBAA 4D6FA 3RO8A 2EEXA 3VD5A 3AMLA 4OUEA 2WMJA 1B3ZA 4U5KA 4NSBA 5I2UA 1O7AA 1ZL1A 4IUGA 2CBVA 4N0RA 2ZX5A 1XSJA 4Z2LA 1M01A 2QF8A 2OYKA 1EQPA 5FCZA 4AD1A 2ZUMA 4QP0A 3WN6A 4UQAA 1LQ0A 4AYSA 4E2OA 2BY3A 2X0YA 2OSWA 2D3LA 4UQ9A 3THCA 2F8QA 7A3HA 3SCQA 3VIPA 3ZM8A 1Q6CA 1EGZA 1MXGA 3ZIZA 3VDCA 1IV8A 1BQCA 2O92A 5A2AA 1EOMA 2GDVA 4J27A 5LA2A 3VIHA 3VM7A 3UESA 1V3MA 3RPMA 4M24A 3UERA 3ZR6A 1JIBA 5JBDA 2J77A 2ZXAA 3CUFA 2BXYA 3VPLA 3PBGA 4PCSA 3II1A 1KQZA 1WB0A 1LG1A 1UKQA 5FD0A 5ABHA 1LWJA 3UETA 1C93A 3FAXA 1FP8A 1VENA 3VIGA 1XV8A 2DDXA 2DIEA 2VX4A 3WH8A 2CIPA 4UCFA 3LMYA 3U5UA 1QI4A 1E6SM 3U5YA 3VX0A 1WDPA 1VF8A 2WSKA 1V6WA 4D6CA 5CQ1A 1LL7A 1KWGA 1QHOA 3LPGA 1ODUA 3BXWA 1JI1A 4Z2KA 2IXUA 3WEZA 2GUYA 4EAMA 1J11A 3CLWA 5A6KA 1ISXA 3O6AA 1US3A 4FF5A 1UD8A 1OB0A 1FA2A 1LWHA 1GPFA 2ZX8A 1W9DM 3WNOA 1ZB5A 3EMZA 5FKYA 3WQ8A 1E4NA 1OIMA 3PZNA 2ZX7A 3F5JA 1H1NA 1PX3A 1JYNA 1V3JA 1X6LA 4JKKA 3WDQA 2D0FA 1C8XA 2XUCA 5I24A 3RM9A 2J62A 4CCEA 1MW3A 1E73M 2J74A 5BRQA 1WO2A 4OIFA 2FHCA 1CDGA 3TTYA 1S46A 3PZTA 3WNPA 3K46A 1EDQA 3I3BA 3AZRA 4E4PA 1I1XA 4P8UA 3SEPA 3F5KA 3AI0A 4BZYA 7CGTA 5HNNA 1AQ0A 1CGWA 1VFMA 2W66A 2GJXB 1JAKA 2DT1A 1Y7VA 2BVDA 3CMJA 3WF1A 1ISVA 3VD9A 2OSXA 1ZBKA 1XH0A 5BXTA 1NQ6A 2HISA 5A6LA 5ECUA 1E4IA 1G9HA 4MNLA 4H04A 4MADA 2Y24A 4WIWA 1NARA 1UWRA 3PHAA 2E9MA 1HJVA 3HN3A 1BTCA 5AYBA 5CSYA 2AOSA 2JEQA 4BQ4A 1LLOA 4UFIA 2WVVB 4QFUA 4D6GA 4HU8A 1WNOA 3AISA 4BQ3A 2EJ1A 2YKKA 2WC3A 2ZX9A 1FHLA 4W85A 3GH5A 1JI2A 4WK9A 2FHFA 3T0AA 1E6QM 4V27A 3S6TA 1UR9A 2XVKA 2JF7A 5BRPA 3AXIA 1PZ3A 4B15A 3CIVA 2O9OA 3LPOA 2NT0A 1B0IA 1GVIA 1EDTA 4W86A 1UQZA 3RM8A 1NOUA 5GNYA 1J10A 3AS1A 3M07A 4PMXA 5C8BB 1E70M 4OZOA 1R7AA 2BV9A 1JAEA 4JHZA 3OLGA 4FLSA 3MV01 2XM1A 5E6ZA 2QMKA 2J79A 1FFRA 1KXHA 1QVBA 2XIBA 2XVLA 2VJXA 3ZMRA 1DWGM 3VMNA 1OGGA 1EDGA 2Y8VA 2VCBA 5BROA 1EA9C 1AVAA 1WPCA 2JIEA 4M82A 1PX8A 1UG6A 1B9ZA 3W81A 1GOIA 4H8HA 2ZICA 5CGMA 1NWUA 2CKSA 4TOQA 2UY5A 1CNVA 2J8FA 3AIWA 4JFUA 1JD7A 5LA1A 4DUWA 3CO4A 4CVUA 2EO7A 4E8DA 2VTFA 3K1DA 1GNXA 2J7FA 3BAIA 3MMDA 1W91A 3VNZA 2VRKA 2G4FA 1AQMA 3ARQA 5A6SA 2CNCA 1FH8A 5BXPA 5LA0A 3POCA 1QNQA 2DT2A 2WCAA 4RE3A 5AY7A 2D0GA 4FLQA 2BFGA 4ML4A 4D1JA 1NOFA 3L4WA 2OWCA 2XVPA 4XV0A 4JFWA 1XYFA 3VGFA 4TTGA 1V3HA 2XFRA 5CZKA 3N18A 1DEDA 3MV11 4WJXA 1E3ZA 2HVMA 2YA0A 5CPSA 3FAWA 4URIA 3W4RA 3POHA 5IFTA 2CERA 1V6XA 4WF7A 1KCKA 3VIIA 5IDIA 4AISA 3APGA 4AZHA 3FHQA 2W61A 4MAVA 3WF2A 3TTQA 4XZWA 1CXHA 4HMDA 4B9YA 4HU0A 4PEEA 3WDPP 1J0KA 3NIYA 4UTFA 1BAGA 2X09A 3I3DA 3NDYA 4AZGA 1W3KA 3FHAA 1GQIA 3AYSA 5I78A 2VI0A 2OWWA 1W3HA 4GINA 2DSZA 1BG4A 1EOKA 1ZJBA 2AMGA 5M17A 5A8NA 1TFVA 5A94A 1C8QA 3VMOA 2WVTA 2E40A 2OWXA 2GK1A 4BS0A 2UWFA 4D6JA 3CZJA 1P6WA 3KL0A 1DWJM 2D2OA 2XWEA 4DUVA 3OZOA 5BXRA 2VZVA 2G8ZA 1E43A 2GJRA 2IUZA 4OBRA 4FMVA 5E9AA 3PTMA 3FY1A 4AW7A 3PTKA 4CD6A 4BA0A 1WZLA 4HOXA 5EBAA 5DMYA 1KXTA 1UR0A 2YBUA 4AY1A 4JIEA 1MW0A 2C7FA 1C3FA 1C90A 5E70A 3N11A 4CN6A 5I0DA 4GXPA 2YLAA 1HT6A 4PMUA 1G5AA 2WHMA 3WMSA 2WANA 4P7NA 1FP9A 4U33A 1J0YA 1J0HA 4NI3A 1HJSA 1UH3A 4JFVA 1PIGA 4XZBA 6TAAA 1UH2A 4TVCA 3WD2A 4DWSB 3GBEA 3WEMA 2EPOA 4MB3A 4UFJA 3VGEA 1EQCA 3AJ7A 1BYAA 3EDKA 2BY1A 1XD1A 2E0PA 2YA1A 1JZ3A 1KQYA 4J3TA 5DF0A 2CCRA 3OGRA 3FN9A 3WQVA 2X8RA 3ALFA 2FDMA 1XHGA 3VKKA 3VIMA 4CKQA 3NCOA 3T0BA 2WYSA 2J7CA 1X1NA 4UFLA 5JIPA 1FFQA 5C70A 4AZ5A 2BVYA 1LF1A 1KFWA 1V08A 5DEZA 5JUVA 5D4YA 1HVQA 2WCGA 3K4DA 4TVUA 3VNYA 1RH9A 1QNOA 1UWUA 2CPUA 3OIHA 5IXEA 4AD0A 4HZ7A 1ZBCA 2YL9A 3D5HA 3ZOAA 1JZ2A 1B1YA 4W84A 2ZE0A 4AZ6A 3J7HA 4RE4A 3S2CA 3SIMA 3GH4A 1TMQA 4GI6A 4PMYA 1B3VA 2GJPA 4GO9A 1QHZA 1H11A 3G6LA 3K8LA 2VNCA 3KE0A 3VTRA 1SFSA 2V3DA 2UY3A 2BHUA 3A4XA 2XYLA 1Q6FA 1E5JA 3A3HA 4ATWA 3W37A 3UG5A 1QI0A 1JF6A 2Y5EA 4CU6A 4QCEA 1BHGA 4PUEA 4UNIA 4W88A 1UD3A 4J3VA 3FNDA 3VMPA 4B9ZA 1UD2A 1E6RA 1GHRA 2WW5A 4S3JA 1VEMA 1CECA 3WQWA 3ZT6A 1MXDA 4GI8A 1BG9A 1MW1A 1XYZA 2VQUA 4AD5A 1VB9A 1W32A 3N17A 3RM4A 3AXXA 4PCTA 4NZCA 3DYPA 4HMEA 3WUEA 2XFFA 2F2HA 2Z1KA 4CD8A 1O6IA 1CLVA 1L0PA 2CBJA 1JZ6A 3EDJA 3GTNA 5BXSA 2DQXA 5A8MA 1MWOA 1JL8A 4CN4A 1V0NA 5DO8A 1FH9A 2E8ZA 8CGTA 3EDEA 1SMAA 2VO5A 4KMQA 4UFHA 3A6OA 3MANA 4QCFA 1PEZA 3WIJA 1KBBA 4PYSA 1NH6A 2ZWYA 4UQBA 5AYIA 1H2JA 4B16A 2XWDA 3DECA 1TA3A 4WSKA 3CH9A 2Y8KA 5GNXA 3AHXA 2WZIA 3AOFA 4MDOA 4P7QA 5D8WA 2WHJA 5A6AA 4GPNA 1E4MM 2CXGA 2DSVA 3WNLA 3OGVA 4P7RA 4GKLA 1V6VA 1KR1A 1R7OA 5KEZA 1CBGA 1GW1A 1KBKA 4BF7A 1PZ2A 4KGLA 4WLCA 2VCAA 2WPGA 3T2QA 4J7RA 1V02A 4HA1A 1QNPA 3VIFA 4C7GA 1GQJA 1JZ7A 9CGTA 1MVYA 2ZUNA 1XH1A 4IPNB 1OT2A 2J75A 4A3YA 3DC0A 3CZEA 3BAKA 3AIBA 1BSIA 3L2LA 1JXJA 3KL3A 3WEOA 2J78A 1QI3A 1CTNA 4MB4A 1GOMA 1UQYA 1G1YA 1UR2A 1CIUA 3M46A 1GJWA 2WKGA 1GOOA 4LGXA 2YJQA 5M03A 2VZUA 3OGSA 4PSRA 2F61A 4B3KA 1XGZA 2GFTA 2X0HA 4W7UA 4GZJA 4PTMA 2WM0A 3GDBA 4XX6A 3SCNA 5E0CA 1W1YA 2CBUA 2CYGA 1VRXA 1MFUA 3ARZA 2VL4A 1QHPA 1JNEA 1U2YA 1U30A 2A3BA 4W89A 3L4VA 5A8QA 3PZGA 1V03A 1GORA 2WC7A 2OLHA 4L4OA 2WCSA 4MB5A 4AZCB 2YDRA 2WVUA 4AD2A 4H8UA 4UFKA 4C7FA 2ZUSA 1SYTA 4IPLA 5M5DA 2WLYA 1WAWA 4LXFA 3M7SA 4AIEA 3WUBA 5E6YA 3SUVA 4UQEA 1KGXA 1UD4A 5FIPA 2X2YA 2G41A 4NRSA 3TTOA 2NSXA 1HJWA 1UKOA 2WMIA 4BCEA 3AIRA 1R86A 1QI5A 4TVDA 5ABEA 2XG9A 2JF6A 3AMDA 1W1TA 4JFSA 4AIOA 4KRUA 3MUAA 1H0IA 4P7LA 4H7VA 1B3XA 4GQQA 1OBAA 3AICA 1DWFM 4GQRA 3W6LA 3ZR5A 3HMCA 1BVZA 5D9MA 2IXVA 2E4TA 4JL1A 4FK9A 5AC4A 2PWFA 4MAZA 4UQCA 1KGUA 4W7VA 4KGJA 3VM5A 3GNPA 3JUGA 5FL0A 2XFYA 4HA4A 1UKPA 4MNJA 4PMQA 2PWHA 1B31A 1EHAA 2EPKX 4EE9A 3CZLA 1UKSA 3EYPA 4ATLA 4HP5A 2TAAA 1CXLA 5HBFA 2WB5A 1XCWA 4ZE5A 1GVYA 3WF0A 2CKRA 4JL2A 3WL1A 1JYWA 1B90A 1US2A 1JYVA 4J3WA 3QHMA 3RDKA 3W38A 3MU7A 3W28A 1HJXA 1HIZA 1RD6A 2WKLA 3SUSA 4CU8A 4ZXOA 3VGGA 1ODZA 4CD7A 1QPKA 2RGMA 4EKJA 3PZUA 1CENA 2B31A 5A69A 2YA2A 1HXJA 1CEOA 1Q6DA 1K9DA 3N04A 1HP4A 2BXZA 3ARUA 1TVNA 2QMJA 5F7UA 4ACZA 1KCLA 3F5LA 5CPQA 1UD5A 2XHYA 3WL0A 5M3WA 2JEPA 5ABFB 4CN1A 3SUTA 1HKMA 2W4XA 1F4HA 5KZ6A 1HVXA 2J47A 1BF2A 1CXFA 2BY0A 3VDAA 3F4VA 4Z2HA 2VT0A 3B9DA 3WBAA 2G3MA 1JXKA 2G3JA 1HL8A 3NSNA 4MJ4A 3ZT7A 3A4WA 2DT3A 2W62A 1I75A 2DT0A 2PBOA 3IANA 3WH7A 1UR8A 2VC9A 2VRQA 2ZWZA 3PZ9A 2VVNA 1G0CA 2D20A 4MPKA 1HF6A 2XSBA 3GM8A 4QLJA 1HNYA 4Z2JA 1CGVA 1CXKA 4ACYA 1Q4NX 4PMZA 1GOKA 5HPOA 1YHTA 2VURA 3EMQA 1ITCA 3OLIA 1BGAA 3ARTA 1CGXA 2VZSA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1PAM A;  2BVT A;  3VX1 A;  3WDH A;  4F9D A;  3HU7 A;  3UCQ A;  2BNJ A;  2UY2 A;  4GI9 A;  4LPC A;  4D71 A;  1KXQ A;  3CUI A;  3AS3 A;  1DHK A;  4MJ2 A;  1E15 A;  2PWG A;  3WNK A;  1LL6 A;  4HZ8 A;  1NP2 A;  1K9F A;  3WMC A;  4TX6 A;  1TVP A;  2YBT A;  2WHL A;  4PTV A;  3VGD A;  4ZEN A;  3SCR A;  3ZJ7 A;  2FGZ A;  4CUC A;  4W93 A;  2VUY A;  4WKF A;  4D1I A;  2YLL A;  4PSP A;  2DSU A;  1ZBW A;  4ACZ B;  1E55 A;  1V3K A;  3WY1 A;  4DWS D;  3L4Z A;  1W3J A;  4D72 A;  3CTT A;  1OM0 A;  3GXD A;  4U2Z A;  3WNM A;  2PWD A;  3L2M A;  4LX4 A;  3GBD A;  3UR8 A;  1NP0 A;  2D3N A;  1JFH A;  3SUU A;  5IFP A;  2FH6 A;  4PMD A;  1SR0 A;  3GNO A;  4U5I A;  4RL3 A;  4EK7 A;  4F66 A;  1CWY A;  3CHE A;  3PZO A;  4AEF A;  2YDQ A;  1VJS A;  1ESW A;  4P7O A;  3VIN A;  2WNW A;  3ZO9 A;  4JKL A;  2E8Y A;  3BLP X;  3AIU A;  3T2O A;  3CMG A;  5EB8 A;  1E0X A;  1OIN A;  3AZT A;  2C8N A;  3MO4 A;  5E0F A;  3BAJ A;  4Q22 A;  2XGI A;  3GH7 A;  4MNK A;  4S3K A;  3A47 A;  1W3L A;  2D23 A;  1E6Z A;  5D9P A;  1MQQ A;  1Z32 X; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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