1G4TA

Thiamin phosphate synthase
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
226
structure length
226
Chain Sequence
HGIRMTRISREMMKELLSVYFIMGSNNTKADPVTVVQKALKGGATLYQFREKGGDALTGEARIKFAEKAQAACREAGVPFIVNDDVELALNLKADGIHIGQEDANAKEVRAAIGDMILGVSAHTMSEVKQAEEDGADYVGLGPIYPTETKKDTRAVQGVSLIEAVRRQGISIPIVGIGGITIDNAAPVIQAGADGVSMISAISQAEDPESAARKFREEIQTYKTGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Bacillus subtilis
publication title Structural characterization of the enzyme-substrate, enzyme-intermediate, and enzyme-product complexes of thiamin phosphate synthase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIAMIN PHOSPHATE SYNTHASE
total genus 80
structure length 226
sequence length 226
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2000-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1g4tA00
4DELA 1RV8A 5H2ZA 3QC3A 3LHZA 4NVTA 4LRTA 3S1XA 1SZEA 4QIUA 3V75A 3W85A 1KTCA 2EF9A 2TYSA 4YXGA 3G0XA 2X1SA 2WNQA 5AC7A 1QAPA 4Z1CA 1DVJA 2PRLA 3CHVA 3PG9A 4XTIA 4U4MA 4MFDA 1ADOA 2FDSA 4WZHA 2CFFA 3DU0A 3DI0A 3W1TA 3OEXA 1DBTA 1EB3A 2X1UA 1SO6A 3PULA 3ELFA 1EP1A 4UTWA 1JVNA 5KTLA 1ZAHA 5CZJA 4WOZA 2NXIA 4O13A 2ZZ6A 1RR2A 4FEZA 4IMEA 4UUIA 2RH9A 4R33A 3QEZA 4GE8A 1V5XA 4BR1A 1TPDA 1LM1A 5BOOA 4M6PA 2BXVA 2E6FA 5HULA 5G4WA 5D02A 1F76A 3DKLA 3W70A 1D3GA 1Z41A 5AHEA 4ADUA 4TX9A 1GG1A 3O8AA 3DFTA 3G0UA 1H7OA 2DZTA 4R34A 1JJKA 4UFKA 3LHVA 3MHUA 3TQKA 3SW6A 3T78A 4RZ4A 1FXQA 2IQTA 4E38A 1CW2A 3T44A 4JTHA 5EMUA 2ZZ7A 3G1HA 4NT0A 3G8EA 4S2CA 2X30A 2ZZ2A 3IVTA 4GC4A 3GAYA 2YZRA 3PBUA 2JK2A 1S5VA 1KM4A 3DFSA 4Z08A 2D73A 4UNLA 4UR8A 1YADA 4LS0A 4A21A 1QPRA 4JICA 3LXAA 1FDZA 3NQVA 4M19A 5HWJA 3L5AA 1IXPA 5D05A 2H8ZA 3CT7A 5AHFA 5D2WA 3SIZA 4N6FA 2J27A 2DZXA 5T26A 4FXSA 3QJAA 1VH7A 4NNCA 3SGUA 4N6EA 3KRUA 3KVMA 3N19B 2WSRA 2QEZA 1EP3A 3STGA 4O11A 4BI5A 2FB2A 2A21A 3Q94A 3G1AA 3OVQA 3NA8A 3L65A 1J4EA 3NG3A 4QISA 2DZSA 1JRBA 3TCEA 4JTGA 3EXRA 4O0ZA 3A22A 5E1QA 4E2DA 3W1NA 4N02A 3W84A 1ZAIA 4MZ8A 3A9IA 1TPWA 2VEMA 3G1DA 1LORA 2ISVA 1X6UA 4LNYA 5KZMA 3UWZA 3FJLA 2ZRUA 4WY0B 5D32A 5HWMA 3L66A 2QCDB 5AC8A 1OX5A 2VXNA 1KFJA 2O7SA 3QMRA 3P67A 2HTMA 3I7SA 3O07A 2HS8A 3NZ1A 1IXQA 1UB3A 3LCHA 3AO0A 4IUOA 3CEUA 3ANYA 3TJLA 1K7XA 2FTPA 4X22A 2Y6ZA 1TV8A 3BV4A 4JDYA 1GJPA 2XN0A 1H50A 4UMBA 4ZQOA 2WO5A 3L21A 2I14A 2YW3A 3BGJA 5FF3A 4UFLA 3O63A 5K9CA 3FFSA 3P61A 2J9XA 1KFLA 1QWGA 1WV2A 1UUOA 1HFBA 1JQXA 1DQWA 1RD5A 4BI6A 1L2UA 1KM3A 3F1QA 3GKAA 3KRSA 4HNVA 1YTDA 2OMAA 2Q8ZA 3W86A 2Z2UA 2E6AA 1G7UA 3O6YX 3HG5A 4NZFA 1MEIA 1QCWA 2VELA 1LOLA 1UUMA 3NQ7A 3TR2A 3L0NA 4UFJA 3BW3A 3S1WA 2GQ8A 3TUUA 2EPHA 2CZEA 1MZHA 3LTSA 4QNWA 4GNJA 4NNBA 2VFFA 3HGRA 3WK2A 1S5WA 1T8XA 3C52A 4JD4A 4LWWA 5TIMA 2A0NA 4YCPA 4MYXA 4MZYA 1IIGA 2ZBTA 3QFEA 5LHFA 3W1UA 3NM1A 5AYXA 2R91A 1DQXA 3RK8A 1VRDA 1TV7A 2PRMA 2ZZ3A 4FIQA 3INPA 3NXFA 2CLOA 3W2MA 3W7JA 2QCNA 5D03A 4AH7A 1EUNA 4HSOA 2E09A 3MBFA 3M9YA 5GVJA 4QQ3A 2QF7A 4AHQA 4BWLC 4R7JA 4RXFA 1XKYA 2PCQA 3BPWA 5F2IA 1A5CA 4WUIA 2ZRYA 3FJ6A 4O0KA 3NAVA 5K2ZA 1R2SA 2CLIA 1Q6RA 3VI2A 1JCJA 4Q32A 4CCEA 4M7SA 1F05A 2QCHA 3L0GA 1AG1O 2Y70A 1OFQA 4LW7A 1KFCA 1HO4A 3FYPA 3QSTA 1PE1A 3LB0A 3QPZA 3NL2A 2Z1BA 4MYAA 3GX9A 5J5RA 2ZA1A 1VZWA 4N4QA 2RDWA 2JKEA 4ORMA 4IX0A 1P4CA 3TV8A 3W7IA 2WQPA 4ZVJA 4JTLA 1KLZA 1Q6LA 3O6DA 1LTDA 4QJ1A 1SU5A 5EYWA 5FEZA 1WAUA 1VHCA 1ME7A 3W7GA 5DY3A 3QH2A 1I4NA 4UTIA 3W1PA 5FF0A 3THQA 1FCVA 4O15A 1OYAA 2NUYA 3W7DA 3SY5A 1SW0A 4UTMA 3LHYA 1GVQA 1TPH1 2Y7EA 2VEPA 4LS2A 3UXDA 3W83A 3TIMA 4Q4KA 4BWLA 1YLVA 3OHIA 3PY2A 3O05A 4O12A 4ADTA 1TTPA 3GVGA 3C2VA 3EX2A 2G95A 3IEBA 1SZNA 2LLEA 5C54A 2G96A 3VE7A 4DO5A 4FHAA 3PWAA 3WJYA 5EBUA 2CZDA 2GQAA 4O10A 2J9YA 3HGSA 1TMHA 3CM4A 3QPYA 5K4XA 3GK0A 3G0SA 2QAFA 4ZQNA 5G2HA 2CW6A 3IIZA 4PTNA 2CLLA 5MHBA 3TKFA 1SO5A 3TSDA 1B9BA 3GZ3A 3OVPA 4DO4A 3I7RA 3W2LA 3UWQA 1TPB1 1K7EA 4A2SA 1O95A 4CNNA 6ALDA 3MO7A 4K37A 3PM6A 5I3JA 3P8IA 3W2UA 1FDJA 7TIMA 1R46A 4A22A 1XC4A 4FNRA 4WOQA 2ZTKA 4XKYB 3NGJA 3L68A 1O94A 1ZNNA 2A7PA 3TJXA 1NF0A 3EX4A 2A7RA 4NNAA 3UXAA 2HS6A 4K38A 2NX9A 2Z6IA 4G1KA 1PL9A 2KZHA 3LOTA 3STFA 1S5TA 1QPOA 4O1BA 2CZ5A 4JIQA 3CPRA 1I2RA 1W0MA 5HJLA 4X2RA 4FX6M 3P82A 1TTJA 3AJXA 5LNRA 1OFDA 2NXGA 3M0ZA 4JGDA 2C14A 3GXNA 4O1CA 4JN6A 3V1PA 2QUUA 4IOTA 3E96A 3G1VA 5DELA 4Y8FA 3LX9A 4HPJA 4PODA 3F4NA 3H54A 3LM7A 5F2MA 1F7BA 1WBHA 4OWGA 5KSWA 1VYPX 1XM3A 1A50A 3ZWSA 1MSSA 3HG3A 3T40A 1SR9A 5CSSA 2QAPA 4N9CA 4LC6A 4ONVA 3NL6A 4CNOA 3WK0A 1D3HA 2TMDA 2GVJA 2CZFA 2HMCA 1TV5A 1IIHA 4O18A 1ALDA 3TW7A 4JTKA 3C0JA 1AMKA 2H3BA 3BGGA 2NWSA 3KAOA 1SSDA 1O60A 2DZUA 2GPTA 1GEQA 3MMTA 1DHPA 5FF7A 3TXZA 5LNSA 3HJZA 3MBDA 3IVUA 3RMJA 1F74A 3W73A 1I2NA 4UCGA 1A5AA 1V7YA 3C2OA 3JRKA 2ISSA 3I7QA 5G2WA 5G2IA 2J88A 2R8WA 5CPNA 3BW4A 1SW3A 3I65A 2NZLA 3E9AA 3LLFA 4JIPA 1SO3A 2B7OA 4MZ1A 3N2XA 5CG7A 4YCOA 1P0KA 1WX0A 1M6JA 1G7VA 3T55A 1EX5A 3F4WA 4LRSA 2FQIA 3EWUA 3MHFA 3P60A 3TXVA 3NPUA 4YL2A 5J5DA 4WX2A 4AF0A 2Z6JA 4O19A 4JXCA 4O52A 1MXSA 4DF1A 2V9DA 1ME8A 3SZ8A 3G3DA 1SQ7A 1T0OA 4BI7A 1H7XA 1Q6OA 4O14A 1GWJA 1B4EA 1OFPA 3SECA 1H1YA 2VEKA 4JTJA 1LOQA 3EKLA 3BVJA 3W7NA 2Z0IA 3IV3A 2NX1A 1VPXA 1I45A 4FO4A 3USBA 2QUTA 3QM3A 3TE9A 2YR1A 4KKXA 4MY8A 4LTSA 3GR7A 4HNNA 4I9AA 2E77A 2W79A 4LT9A 3PUEA 1QO2A 3EWBX 1U5JA 2E68A 1F6PA 2GJNA 4AHOA 3M43A 1K8YA 1KV5A 1PIIA 5H91A 4GJ1A 3S5OA 2QUVA 2PE4A 1OVDA 1O5XA 2E6DA 3BO9A 3UQNA 2A2IA 3VNDA 1XDLA 4M7TA 4FNUA 4EVZA 2H8XA 3NNTA 4ZQMA 3BK0A 3DBPA 1FCUA 5F4WA 4O4WA 3UZ5A 3KVLA 2TRSA 3SR7A 4X3ZA 4X9SA 3LHUA 2RHGA 3DH7A 2PC4A 1WBJA 4IGHA 5CZ0A 4JX5A 2H6RA 2JKAA 3L0KA 4JEQA 3W07A 5LHEA 4NJIA 2CLFA 2AAMA 5CPMA 5BMXA 5FEXA 4TIMA 1OABA 4CCCA 5G4EA 2HSAA 2X16A 3P5YA 5LSMA 1OFAA 3PBVA 1YDOA 1LZOA 2CWNA 3LGEA 4LVGA 3M16A 3TMLA 3NQFA 5HUOA 1X1ZA 3FKKA 2NXHA 3EKZA 3PC0A 2V2HA 3O15A 5AYZA 3W72A 3W7RA 1GQNA 3GLCA 4XQ6A 5KINA 1FCQA 4FNQA 2YGYA 4O1DA 4PL1A 4OV4A 1RVGA 3LHWA 3N9RA 3P62A 4O57A 2X2GA 1W37A 1GYLA 2OJPA 3IVSA 4RXGA 5DN1A 1FXPA 1MEHA 1OYCA 3U8GA 3W22A 3PS7A 1SUXA 5FF4A 1PHWA 4MJZA 4I7UA 1GTEA 1AK5A 5FF2A 3ABQA 3UWYA 4CNPA 3GXPA 3FLUA 4EF8A 3FKRA 3G1XA 3KVKA 3TQVA 2V0TA 1G4PA 1T99A 3TSBA 3GDTA 1W5PA 2V2CA 3W7QA 3PUDA 1YXYA 2V5BA 4IMCA 1IGSA 3EX6A 1R30A 2VOMA 1C9DA 4JY8A 5L9FA 1KBIA 3TW6A 3MWAA 5ABTA 4OU1A 3Q58A 4N2YA 3KVJA 1WDWA 1FX6A 2QKFA 4GUFA 5K9DA 3W71A 3PF3A 1LBMA 2VFIA 3NR0A 3VE9A 3LI0A 2QJGA 3PSVA 4HHPA 4YLWA 5EA9A 1JCMP 5I3HA 4UIOA 3LCWA 2QJHA 1K8ZA 5D2TA 4Z0JA 1O4UA 4NUWA 3HG4A 1GZGA 5HINA 4TO8A 3W7CA 1LLWA 3B03A 3MUXA 3N2MA 1KTBA 3NZRA 5LKYA 1UJPA 3E49A 3WK3A 1G4SA 1YDNA 1VCVA 4UMAA 3UWUA 1QOQA 3C4UA 4Y90A 1N8FA 1JCXA 1W54A 5C55A 4UTKA 1LP6A 3HPZA 3L5LA 5HNRA 3HF3A 2F84A 1QPQA 4J9JA 4IMGA 4MKNA 2ZRVA 1BEUA 2PURA 5HUPA 4AF0B 3E12A 3ABSA 2GOUA 1FY6A 5CGQA 3R8RA 2JGQA 3OIXA 3G24A 1H1ZA 3HB9A 3DAQA 4JX6A 1OJXA 3LV6A 3PB2A 4UFHA 4UTTC 1M7PA 1E51A 3LERA 4HT3A 2H90A 1H60A 4UXDA 1HUVA 1VYSX 1ZCOA 4RV8A 3HPSA 4YWIA 3PB0A 4MY1A 1FCBA 1L6YA 1R2RA 3UNDA 1TQXA 3DFPA 4UNKA 5CSRA 5FEPA 3EWYA 1FWNA 3KHJA 4CQ9A 4NJJA 2XFWA 4PEKA 1TYGA 1SPQA 1MO0A 1TPVA 4Z1DA 3SI9A 1EA0A 2A85A 4XTDA 2CU0A 4MIMA 3FYOA 3NEVA 4MPQA 3PUOA 3YPIA 2Y7FA 5L6UA 1DJQA 4AAJA 5EPDA 1FBAA 1GYNA 3W2JA 2BWGA 1H51A 3LV5A 2Q3RA 1Q6QA 3SFKA 3EB2A 3F03K 2WPBA 2QCGA 1LLZA 4UFIA 1I2OA 2YCEA 4AVFA 3HIJA 3M5YA 2J6XA 1BWKA 2DZWA 2W0UA 3TDFA 5AC6A 5I3GA 5EY5A 4NJKA 5EL1A 1F5ZA 3ABOA 3NDOA 4Y9AA 4ZQCA 4B5NA 1KM2A 2C6QA 2Y85A 3B05A 3B0UX 3C8FA 4NX0A 3P7YA 1PHQA 5G1TA 4OHQA 4KFNA 3ATZA 1GVOA 1LDCA 4IXHA 3I6RA 3QMTA 1W3IA 4UTTA 3P81A 3KFTA 3NQMA 3DFOA 2YDAA 3EEGA 4NXSA 4LOCA 2E5CA 4XWUA 3DKJA 4K36A 1AL7A 1NFBA 4LVAA 3W7EA 2C3ZA 5FESA 3LCFA 1YPFA 4JTSA 3W7KA 1TB3A 4H3DA 3BARA 3IIOA 3NOEA 2ZTJA 4FXRA 3CQ0A 1JCNA 1XBVA 1LRTA 4ZMGA 4LVBA 1DORA 2FB3A 3LBMA 5K4ZA 2AGKA 2V82A 3UYCA 3FIGA 2FPYA 2GQ9A 1SZGA 1W3NA 4UTHA 4ZZ9A 3DI1A 4JX4A 4E2BA 3NQCA 4O16A 2CLEA 3CLMA 3W6YA 3UD6A 1YXDA 3W1MA 3ZFHA 1ZALA 2TPSA 3G1FA 1TRIA 3ATYA 3OA3A 4GUHA 2EKCA 2VC6A 1ZJIA 1B4KA 5G1YA 3FEMA 2R14A 5D2XA 1K7FA 3BG5A 1OHLA 4I7VA 1OK6A 2B4GA 3WFAA 2I1OA 4A3UA 1GOXA 4IPJA 5BMWA 1H7WA 4DEFA 4HKPA 3SJ3A 5F4XA 4UTUA 1GTHA 4NU7A 1ICQA 4JTUA 2P1FA 3W7PA 4P61A 4OE7A 1QOPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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