1G67A

Thiamin phosphate synthase
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
225
structure length
225
Chain Sequence
GIRMTRISREMMKELLSVYFIMGSNNTKADPVTVVQKALKGGATLYQFREKGGDALTGEARIKFAEKAQAACREAGVPFIVNDDVELALNLKADGIHIGQEDANAKEVRAAIGDMILGVAAHTMSEVKQAEEDGADYVGLGPIYPTETKKDTRAVQGVSLIEAVRRQGISIPIVGIGGITIDNAAPVIQAGADGVSMISAISQAEDPESAARKFREEIQTYKTGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural characterization of the enzyme-substrate, enzyme-intermediate, and enzyme-product complexes of thiamin phosphate synthase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIAMIN PHOSPHATE SYNTHASE
molecule tags Transferase
source organism Bacillus subtilis
total genus 82
structure length 225
sequence length 225
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2000-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1g67A00
4FNQA 1O4UA 2WO5A 3OVQA 3HQ1A 3NVTA 2DZSA 1XL9A 3UWWA 3TC7A 3UWZA 4O0ZA 2W6RA 2J9XA 1G4PA 4ML9A 1R30A 3W22A 1THFD 1FWSA 4OHQA 4S2BA 1W5PA 1JQXA 4RCXA 3EWZA 3MYOA 2DP3A 3TQVA 1FY6A 1AK5A 3P60A 4WY0A 2V0TA 2V30A 2QJHA 3QH2A 3OBKA 1GG0A 2EPHA 1BKSA 1ME9A 3G1AA 1TREA 1EP1A 3NQ6A 4BR1A 3TMLA 5D38A 5F2IA 4UTTC 1NEYA 1SW0A 4CQAA 4CQ8A 1QPQA 4LS0A 4ZQNA 1O5XA 3NA8A 3BK0A 3TSBA 4K8HA 3W1XA 3EX6A 4JX4A 3S9YA 2Q8LA 1YTEA 3C2RA 3UZ5A 2CLKA 3EWBX 1SO6A 4K7VA 4N9DA 3L68A 3PG8A 5CZJA 1JJKA 2F7FA 2OZ0A 4R34A 4DO6A 1QCWA 3DHDA 1P0KA 4XKYA 1ME8A 3KRUA 4BI6A 3W85A 1NF7A 4FXRA 1PE1A 3LCLA 3C2VA 3QZEA 2CWNA 2C3ZA 3LV6A 4HNUA 1D9EA 2FB2A 2ZTJA 4AXKA 2CLFA 3HGOA 1BWKA 3W7EA 3EB2A 4MJZA 2QCFA 4UC5A 1VHNA 3TJXA 1RQHA 2QCLA 3M16A 5AYXA 1VJIA 1M5WA 1G7VA 1LZOA 1SW3A 3LHUA 5LSMA 2J9YA 3AO0A 3BVJA 5CZSA 4UNLA 1MSSA 1YLVA 2Y61A 3CEPA 3W3OA 1K8XA 3NXFA 3R2GA 4UTMA 4TR9A 2ZTKA 4JTLA 2A2IA 3GK0A 3RLVA 3B05A 2H3DA 3S1UA 1G69A 1W37A 1QOQA 5HINA 5LZLA 3ZS4A 3CIXA 1VH7A 2PC4A 1MO0A 1GQNA 4Y90A 3UWVA 5HUOA 3W74A 4YCOA 1I2NA 1S5WA 2X16A 2WNZA 3LM7A 4K38A 5HWJA 3W7JA 2TPSA 4TMCA 3GDRA 4ZQPA 4I7UA 1AW5A 3SI9A 5LNSA 1RQBA 4DELA 5U4NA 2IQTA 3U6WA 2NWSA 3VCRA 4N6FA 3W7IA 1QNVA 2Y63A 1SPQA 3ABOA 4D2JA 3JRKA 3C2FA 3OVRA 3DAQA 4MLJA 3G8RA 2ABBA 4ONVA 3P80A 1XBXA 2NWRA 2CZDA 2E77A 4H6KA 3CLMA 4JY8A 1G7UA 2E5BA 3LB0A 1C8VA 1GYLA 2GJLA 3QPZA 2E5DA 3PB2A 2OX1A 1OFRA 2R14A 4O16A 3NL5A 3S5NA 1L6SA 4MYAA 5HULA 1YDNA 1ZCOA 4FB7A 2VFGA 1UCWA 1FQ0A 1U83A 3RFAA 5DY2A 3MYPA 4LVDA 3SR7A 3LCFA 2B7QA 3G3MA 1HO4A 3STGA 3G1XA 1HFBA 3GKAA 1B4EA 3NOEA 5K4XA 1LOSA 3W1MA 4QQ3A 3RNDA 3GKFA 1K7XA 1EWEA 3MO7A 3NQCA 3PBYA 4K37A 3QM3A 2BZNA 2HTMA 1TTPA 4NJJA 4PFMA 4O1BA 3W1QA 4NX0A 2RHGA 5TQLA 1LRNA 3HB9A 3G1SA 5EY5A 1SQ7A 1X7FA 5F1UA 4N4PA 5C5YA 1M6JA 1WBHA 1ICPA 3W9ZA 2QJGA 3WK0A 2R91A 2HSAA 4U4MA 4N02A 4Y8FA 1OFAA 1ZHAA 1LROA 3TV8A 3MP3A 2NV1A 1K3UA 5AYZA 3RU6A 3NL3A 1ZENA 5EA9A 3L5LA 4Z08A 5CPMA 3G22A 1ZFJA 3ZWSA 1QPOA 2A4AA 5J5DA 2WOQA 3W72A 3G1FA 1C29A 4N4QA 3W7PA 4ORIA 1MEWA 1TO3A 1S5VA 3W7CA 1H61A 1NVMA 5F1VA 1OVDA 4HPJA 1RZMA 2WSQA 2C14A 3LRMA 4LW7A 2VFDA 3A23A 4UFMA 2FPYA 3R8RA 1MXSA 1S5TA 4A2RA 3NL6A 2C13A 3TW6A 2YW3A 4RV8A 3NGJA 2RH9A 3LBMA 3QF0A 3PUOA 4DF2A 4IMCA 3PR2A 3R12A 1EUAA 2ZDRA 1KV5A 2ZA1A 2CZEA 1YXDA 4AB4A 4MY9A 5HMSA 3UWUA 1XKYA 4GUGA 2GQAA 2ZZ1A 3M5ZA 4AH7A 3LGEA 2DU2A 3C56A 3PS7A 2YCEA 4UMBA 2JK2A 1LTDA 4BWLC 1LBFA 2NZLA 2NXGA 5K7JA 3O07A 1QOPA 4ZZ9A 2VELA 3S1WA 5G2HA 3EX1A 2I14A 1GPWA 4IMDA 4KKXA 5D32A 3C2OA 3W88A 3IGXA 2O7SA 2A6NA 4FNPA 2QCCA 2W79A 2YPIA 3QMSA 4OV9A 4FNUA 4B5NA 4M19A 5SWUA 4IGHA 3OVPA 3PWAA 3P5ZA 3SZ8A 3UPWA 4DQWA 3S6DA 4JEQA 2NLIA 1W3IA 3UXAA 3N73A 3QSRA 3S1XA 3QMRA 1H51A 4GBUA 2WNNA 2RKXA 1ZAJA 2ABAA 4K39A 4HNNA 3C3NA 1HG3A 4L4LA 1YTKA 4MKNA 4UFHA 3TQKA 1KM1A 4YWIA 4AHOA 1A50A 3FEMA 4PC8A 4HKPA 1DKWA 4CCEA 2GOUA 3LRLA 3VNDA 3NQ7A 3G1HA 3IVTA 2FPVA 2ZFAA 1OFPA 3LLDA 2YSWA 3FKRA 1TB3A 3ZWTA 3QQ0A 3KVJA 3B8DA 1HO1A 4ZMGA 2FIQA 2JKEA 4MZ1A 3STFA 1TPDA 3G24A 4ADSA 6ALDA 4WX2A 1ME7A 3P62A 1OF6A 5C55A 3KVLA 2YYUA 4O10A 4N9BA 3N2MA 2Y62A 1ZALA 1GTHA 4UTLA 3ZFHA 1JUEA 1JCLA 1KM6A 3GDLA 4K8EA 4WD0A 3I68A 3NQMA 5G4EA 3LCGA 3IVSA 4DPQA 3NR0A 4AF0B 1P5BA 4AWSA 3NZ1A 5J5RA 1YPFA 4JYEA 4IX0A 1TPH1 1XBZA 3PUEA 3KHJA 3M44A 2Z0IA 2J27A 1EIXA 4NX5A 4Q33A 2JKPA 5E93A 3ATZA 3MUXA 2GVJA 4LVGA 4Z1BA 5HUPA 1DQXA 1SUXA 1ONRA 3CU2A 3CIWA 3KX6A 4AEOA 1Z48A 4E2BA 1JVNA 4UTKA 1O5KA 3Q37A 2H6RA 3HBLA 5KZEA 4MPQA 3DI1A 3GNNA 3L9CA 3R5EA 1FCQA 4YLWA 2P10A 3C2EA 4QIUA 1GTEA 5K3VA 4DF0A 5D2TA 2QAPA 5CPOA 1R2RA 3DFPA 2V8ZA 4JYDA 5LHEA 4X22A 3F4NA 1LP6A 1HTIA 2X1UA 4JTEA 2G96A 2O7QA 1XBYA 4M6QA 1JULA 3L5MA 3LLFA 4O50A 3CWOX 5LNVA 1WV2A 4RJEA 1LLWA 3M5XA 4GE8A 3W7DA 2GQ9A 1GT8A 1MEIA 2NV2A 3BG9A 5CSSA 1UBSA 3HG2A 3LCXA 3LHWA 2WQPA 1R2SA 1TTJA 3W2JA 2J6XA 4O52A 3MP5A 1OF8A 2FB3A 1EB3A 4HHPA 5TBOA 4WXZA 5A8GA 3F03K 5DBUA 3I6RA 3W7QA 4Y9AA 3O16A 1I2PA 1AL8A 4ZQOA 1W3TA 3HGRA 3W7OA 3CT7A 2EF9A 3W1TA 3W7LA 4QJ1A 5AHMA 1JCXA 1J4EA 4YL2A 5A5WA 4NVTA 4JTTA 5IBXC 1GZGA 2XFWA 4RX0A 2C6QA 1YYAA 2CLMA 4ICNA 1W8SA 1H62A 4I7WA 5F4WA 1V7YA 4UR7A 3TROA 5KMYA 4LUIA 1WA3A 3CTLA 3MI6A 2CZ5A 5L9FA 2FDSA 4O4WA 2X30A 3M1ZA 3NQEA 2YFNA 5D37A 2QCNA 3HPSA 4MLRA 4JTGA 1OHLA 3W7NA 1OYBA 3NAVA 2ZZ5A 3FA5A 3WFAA 2A85A 2GVGA 1VS1A 3SJ3A 4UFLA 1OX4B 4TU1A 1FWTA 1YXCA 2PRMA 3SW6A 2Y70A 5FI8A 3QMTA 4N9EA 4TX9A 2DZVA 3SIZA 2JGQA 3UYCA 3QW3A 3HJZA 4KWVA 4XTDA 3FKKA 1F73A 4O1CA 1KLZA 3PM6A 3W70A 3U2OA 3C61A 1F05A 3W7HA 1ICQA 5EYWA 3RF9A 2Y89A 3M5YA 1P1XA 1YPIA 1EUNA 4K7YA 1D3GA 3M9YA 1SW7A 1WXJA 4JTIA 4PA8A 1SO3A 5D2YA 3N3MA 3FS2A 3PBVA 1EX5A 1H7WA 4WZHA 1GVOA 4YXGA 2XN1A 3S1VA 3GXNA 4L4MA 4MFDA 2GJNA 3ELFA 4DO4A 2ATSA 1UASA 4RZ4A 4AWUA 1TV8A 3F1QA 3GVGA 4FXSA 5I3JA 1VYSX 3B04A 1PHQA 4MJMA 2VEMA 3PUDA 3W2UA 3QPYA 2PRLA 1FDJA 1TRDA 2OJPA 1M7OA 5F2LA 4IWWA 2CU0A 4DO5A 2ZZ6A 1FWNA 4IOTA 3EX2A 1R2TA 3UXDA 2DJLA 2G97A 4PODA 3BLIA 1VGAA 3P84A 5H91A 4WY0B 5D02A 3STCA 4MVAA 5I3KA 3LHVA 1H7XA 2QDHA 1SFJA 2TRSA 6TIMA 4UTWA 4NNBA 3QC3A 1W54A 2YGYA 4RZ6A 5K9DA 4WXYA 2TSYA 1H63A 3IV3A 1QAPA 5D2WA 3HPZA 2FPTA 4IQLA 3P5YA 3DKJA 4NZJA 3TK7A 3H55A 5LGZA 4NNCA 2X1SA 1ALDA 5D04C 1TJPA 4S2CA 1FDZA 4XKYB 2VKZG 4UIOA 2DZWA 2H8ZA 1LDCA 4NXSA 5T26A 2C15A 4POCA 1K7EA 1JRBA 2XN0A 4X2RA 3G0UA 3P8IA 2X2GA 4UXDA 8TIMA 1KFKA 2VFEA 4MIMA 1PVNA 3L66A 3W2NA 1MZHA 1ICSA 4AAJA 3BW4A 5G2IA 1YDVA 4GUIA 4DBDA 3IIZA 3P81A 1OK4A 3KFTA 2AAMA 1GG1A 3H53A 5KTLA 3TW7A 1CW2A 3LXAA 4LWWA 5BW6A 3GDMA 1X1ZA 1I2RA 5BMXA 1GVQA 3CPRA 4NZFA 1T8XA 1SSGA 4O18A 2Y7FA 4RKAA 3EX3A 1XDLA 3CQ0A 1C9DA 1A5SA 2QAFA 1W31A 2QJIA 2QUTA 1WX0A 4W9TA 4HN4A 4C1KA 2ZQ0A 1AL7A 1I2QA 2CLLA 2EAWA 1VHCA 2C0AA 2V2DA 4WJEA 1F2JA 2C1HA 1IXQA 1ZY9A 2BWGA 1R47A 3DHFA 3NYZA 3PB0A 4JTJA 2RDUA 3OA3A 3TSMA 2E6DA 2ALDA 3BW3A 1R46A 4CLMA 2DZUA 2ZZ4A 4JY9A 2PRHA 1W3NA 1AW1A 3EX4A 3ABQA 3L0GA 4UTJA 4MZ8A 3O6YX 1OYCA 3TC6A 1KA9F 2EHHA 4QSHA 4LC8A 3EWYA 3KXQA 1XUZA 2VFHA 2RDWA 5KITA 3MI2A 1AW2A 2WPBA 1B4KA 2QF7A 4PCFA 2Q8ZA 3L0NA 1IGSA 1FBAA 5CPLA 1TCDA 4P2VA 1X8FA 1T0OA 4FX6M 4UFJA 3UPBA 2C19A 4NNAA 3NQFA 4J9JA 1W5QA 1OX5A 3LTYA 5DCEA 1OABA 2NX3A 1Y0EA 1W5OA 1Q6OA 5CGQA 1LM1A 3S0CA 3T78A 3THQA 3GXTA 3MMTA 3GAKA 5AHLA 1VLIA 3R89A 3UY8A 1B57A 4IMFA 3UQNA 3G1VA 1G4TA 3BGGA 1EWDA 2E09A 5F2MA 3LBCA 3TSDA 3B0PA 5HR7A 2QEZA 2FTPA 1KW1A 3ZR4A 2J9ZA 2ZZ2A 4GUJA 1Q45A 1LOLA 1WYIA 3L5AA 3GIYA 3NDOA 2B7OA 4LVFA 3W76A 5FEPA 3HPXA 2DZXA 1J5TA 3M0ZA 3EKZA 2A7RA 4NUWA 3A22A 4FO4A 1F76A 2Y6ZA 3TX9A 1CI1A 1GVSA 2WKJA 3B0UX 5KSWA 2CZFA 1XUUA 2H90A 3NQ2A 5D2XA 1WBJA 3SFKA 3IGSA 1VZWA 1IXNA 4K6AA 4IPIA 4ALDA 1TPFA 2BXVA 3FIGA 4FNTA 3W07A 2QDGA 4OGZA 5HJLA 3WJXA 3EWXA 2CLEA 1IXOA 1TTQA 2YZRA 3NL2A 1B9BA 1M7PA 1KBIA 1JUKA 3IIXA 4LVAA 2GVLA 5HWMA 2CLHA 4O0KA 3BPWA 3W73A 5EBUA 3TU9A 3CHVA 2B7NA 2RFGA 3TFCA 1TV7A 4EIVA 1QPRA 1Z44A 2ATMA 4Y6GA 5I3FA 1FXQA 1SZEA 3HGJA 1JQVA 4UFKA 4Z1AA 3PC0A 3PG9A 2F84A 5EMUA 3W1UA 4EWND 3IGUA 2CLIA 3L2IA 3Q94A 4JNMA 3E96A 4WY0F 4JD4A 2NXIA 4Z0SA 3W7GA 1JUBA 3MJYA 1LLZA 3VE9A 3LDVA 4UTUA 4O57A 4PEKA 1VC4A 4TO8A 2XN2A 2X1TA 4OV4A 3TXVA 2A6LA 4BFAA 3PF3A 4RLIA 5CG7A 5ABTA 5KZMA 1NF0A 1GOXA 3PAJA 3AJXA 1VYRA 1LCOA 4MOZA 4BI7A 4O1AA 1H7NA 3KVKA 4LV9A 3TAOA 5MHBA 4XUGA 1LBLA 1F7BA 2V9DA 2VC6A 3FLUA 1PCKA 1P4CA 3LCIA 4E2DA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1NDY A;  3S2J A;  3M0L A;  4C6B A;  3HQ1 A;  1W3J A;  4GJI A;  1XYA A;  1G01 A;  4C91 A;  3PWG A;  4OFC A;  3UWZ A;  3HUR A;  3KCL A;  2AOS A;  1OIM A;  3VUS A;  2W6R A;  1E1C B;  1G4P A;  4Y9P A;  3AHX A;  2PDB A;  3W22 A;  1HVQ A;  4S2B A;  1E9L A;  4RCX A;  1XIC A;  2WVU A;  1FY6 A;  1AK5 A;  4WY0 A;  2X0H A;  1RXO B;  1GG0 A;  1PPI A;  1WDQ A;  3ECQ A;  3NQ6 A;  4BR1 A;  1XLC A;  5F2I A;  1NEY A;  5D9O A;  4CQA A;  4CQ8 A;  3BK0 A;  1HJV A;  4B2D A;  3W1X A;  3AMK A;  3S9Y A;  1B9Z A;  4JFU A;  3TWA A;  4K7V A;  3W6M A;  1ZJA A;  3N6Q A;  3RCN A;  4DO6 A;  3PFR A;  2PDC A;  3ES8 A;  2PTY A;  3KRU A;  4QP0 A;  1O6I A;  4PSR A;  5BU9 A;  4FXR A;  1R5Y A;  4AYS A;  1SMA A;  3C2V A;  1JPK A;  1ZBW A;  2C3Z A;  2ZTJ A;  1CNV A;  1AUS L;  4MJZ A;  2QCF A;  4UC5 A;  3WEM A;  1PYF A;  3BGA A;  1XD0 A;  1SW3 A;  5EMY A;  2J9Y A;  1MSS A;  1YLV A;  3CEP A;  3W3O A;  4UTM A;  2I5G A;  3GK0 A;  3B8V A;  3UET A;  1S2V A;  3CLW A;  1VFT A;  1IWB A;  4HCD A;  4MWA E;  3W74 A;  1FWA C;  2WNZ A;  4TV5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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