1G67A

Thiamin phosphate synthase
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
225
structure length
225
Chain Sequence
GIRMTRISREMMKELLSVYFIMGSNNTKADPVTVVQKALKGGATLYQFREKGGDALTGEARIKFAEKAQAACREAGVPFIVNDDVELALNLKADGIHIGQEDANAKEVRAAIGDMILGVAAHTMSEVKQAEEDGADYVGLGPIYPTETKKDTRAVQGVSLIEAVRRQGISIPIVGIGGITIDNAAPVIQAGADGVSMISAISQAEDPESAARKFREEIQTYKTGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Bacillus subtilis
publication title Structural characterization of the enzyme-substrate, enzyme-intermediate, and enzyme-product complexes of thiamin phosphate synthase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIAMIN PHOSPHATE SYNTHASE
total genus 82
structure length 225
sequence length 225
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2000-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1g67A00
4HIBA 1KV5A 2O7QA 5DBTA 3W73A 1BTMA 1H51A 2OT0A 2C1HA 3LCHA 4FNPA 3W7PA 2DZUA 3C3NA 2Y7DA 2JGYA 5A5WA 1LP6A 2J24A 2FQIA 3GAYA 2WKJA 5I3IA 4NUWA 1GQNA 4O19A 1WOBA 1RPXA 3G24A 5HWJA 3BW4A 3LCXA 4GJ1A 5DCEA 4CQ9A 3E0IA 4QSHA 2G96A 4I7VA 1TPFA 5F4SA 1ZAHA 3NYZA 5KZMA 1P4CA 1S5TA 4PH6A 1I2OA 1G4SA 1VPXA 4BI7A 1WA3A 4UFMA 2NV1A 2JKEA 3T4CA 1EX5A 2ISVA 5HUOA 1QDSA 3W7CA 3W1RA 5EA9A 3C56A 4O50A 3M47A 2WV8A 4WXZA 2C16A 3LM7A 3GX9A 4MYXA 5HWMA 3N2MA 3QFEA 1I2PA 2AGKA 1RQEA 2Z6JA 3PSVA 4I7WA 5AYZA 2WNNA 3QF0A 4LUJA 3DZ1A 3KRSA 4JDYA 3W7JA 1K8YA 2QCHA 3OVPA 1ZJIA 3O07A 3TNOA 2Y7FA 1QNVA 2VELA 1QWGA 4HPXA 1S5VA 1NF0A 1P1XA 1TJRA 3NQCA 4AXKA 2C3ZA 3RMJA 4O16A 3TSBA 2ZZ3A 5DCBA 2E1DA 3IIZA 4EIVA 2QCFA 1KM3A 4O53A 3A21A 3NQ6A 2JBMA 1ADOA 3GKFA 1W5QA 4IMGA 4Y9AA 3NPUA 3S6DA 3N34A 4ADSA 2V2HA 4YCPA 3WFAA 1B4KA 2JKAA 1DQWA 3GYEA 2VXNA 3C2VA 1O95A 2FPVA 4OT7A 2CLKA 3R8RA 1UCWA 4XBKA 3NQVA 1GT8A 3TQVA 3IV3A 2VFGA 2VFEA 2OCZA 5EPDA 1Z41A 1OX4B 3FFSA 3LTYA 4IPJA 2BZNA 4JIPA 3TW7A 1TRIA 4MZ1A 4OU1A 3W3OA 2WOQA 4S1FA 3N9SA 4LS2A 5K3VA 4JTKA 4BF9A 3I7RA 2FB2A 1GWJA 5LSMA 3DFNA 3EWWA 4ML9A 1V5XA 3RLUA 3A23A 4UR8A 3NPWA 4UFIA 5D2YA 1TQJA 1SW3A 3H54A 4QJ1A 4OQVA 3W7IA 2QCMA 3TC7A 3FJ6A 3DKLA 3G1XA 3QC3A 4AWUA 2A6NA 1H50A 2I9EA 4IJBA 4MIMA 3UY8A 1IIHA 4OHQA 4DO6A 2E5CA 3UWQA 5IBXC 4M7TA 2A7RA 4PFMA 5F1VA 2FPYA 1JCJA 3CIWA 2EHHA 3IGSA 1W56A 1FCUA 3LLDA 2JK2A 1OFQA 3KVLA 3M5XA 3S1UA 1KM1A 3FKRA 4OV4A 4MKNA 5C5YA 3BARA 2ZRYA 3NL5A 4GE8A 4WQ6A 1YXDA 1WYIA 1B4EA 1ZALA 4O8RA 3M1ZA 1ICPA 1B9BA 2QAPA 5FEXA 2ZA3A 3PY2A 1VJIA 1TCDA 4XKYB 5G2WA 4JN6A 4ADUA 4WY0B 1O94A 3BW3A 3GDKA 3W2KA 3EKZA 4H3DA 2EF9A 1FWNA 1KM2A 1F05A 1FX6A 2YZRA 3DENA 3STFA 1H1YA 3P67A 4LNYA 4WJEA 4ZQCA 3AO0A 3LGEA 1EP1A 3QRHA 3EX1A 1TO3A 2VFHA 3QM3A 5HR7A 1KA9F 3E02A 5IM51 4GUHA 3F03K 4K7YA 4ZQPA 3SFKA 1VH7A 4JY8A 4UCGA 4UTIA 5K9DA 4NZJA 2YFNA 3MP4A 3P5YA 2KZHA 1LOQA 3DXIA 3PS7A 2RDTA 3TMLA 4ICNA 3WK2A 1OYAA 3BG9A 3I6RA 5BW6A 3P62A 5AHIA 3CPRA 2VFFA 3W7LA 3PC0A 4O11A 3BW2A 3TXZA 3GR7A 1G6CA 5FEWA 3EWZA 3OA3A 2I1OA 1FCQA 6TIMA 4E2BA 4Z08A 3RLVA 4LRSA 1OFOA 4W9TA 1VLWA 3U2OA 2YGYA 2Q8ZA 4HPJA 1S5WA 2DJXA 4YWIA 1TPWA 2QUUA 2W79A 1G7VA 2FFCA 2NWRA 4LS1A 2ZA2A 2QKFA 3CEUA 1EIXA 3SIZA 3B4UA 4PTNA 3SECA 3GK0A 3NDOA 2ABBA 4NNCA 2NLIA 1IXOA 4AF0B 3C2OA 2ATSA 3W2NA 3TIMA 2CU0A 1JCMP 1M6JA 1QPQA 4LWWA 2FPTA 4OE7A 4XUGA 1TPDA 4AWTA 2DU2A 3QJAA 3W2LA 2CLFA 3M5YA 5CZSA 2QDHA 3EX6A 3PUDA 4GNJA 1FBAA 4POCA 1QO5A 2OJPA 2PURA 1H7NA 2ISWA 5DXXA 3FOKA 3RNDA 3TSDA 3ATYA 4LC6A 2ZZ7A 3STEA 2A2IA 4WY0F 2J9YA 6ALDA 2QCCA 4JX6A 2QEZA 3NM1A 1K7FA 4LV4A 2V8ZA 4KWWA 3HGSA 4JTLA 2DZXA 3W71A 3G1AA 3OIXA 4GUIA 3CWNA 2EPHA 3WJYA 1YTKA 1R46A 4KFNA 1PCKA 4HT3A 1XDMA 4UTWA 5CPLA 3HG2A 1A5AA 3BV4A 4LVBA 3OVQA 4AMAA 3MP3A 1IXNA 4ZMGA 3G1YA 3ABRA 4N02A 5G5IA 1X8FA 3FYPA 1IGSA 2GVJA 1M7OA 1P0NA 2VKZG 5K4ZA 1JRBA 5KITA 3JRKA 3UNDA 1OFDA 4DPPA 1A53A 3PM6A 3LCWA 3DGRA 3GDLA 1TTQA 3UXAA 1GVOA 2CZ5A 5H2ZA 3B8DA 4O1CA 3W07A 3TA6A 5KINA 2A4AA 1XC4A 3I7QA 1F6PA 1FWRA 3HGJA 1FWTA 5K9XA 1RD5A 4X22A 3L9CA 3EXTA 2Y7GA 5I3KA 3UPWA 3TDFA 1QCWA 4KWVA 3TFXA 3EXRA 2ZRXA 4MOZA 1GJPA 4NXKA 4RXFA 3PUOA 3LCGA 3M43A 3W1XA 3PBYA 2TPSA 1GVRA 1KM4A 1X1ZA 1YADA 1TPEA 3ABSA 1VYSX 2F7FA 3W23A 4BWLC 5SWUA 3DHDA 5LNRA 1G67A 2OX1A 4M7SA 4IGHA 3E9AA 3OBKA 3HF3A 2WSYA 4XTDA 1OHLA 3NR0A 4UC5A 2QAFA 3G3DA 2O7SA 5D05A 1QPRA 1O5XA 1MSSA 4JNMA 4HNNA 2RH9A 1YPIA 3M7WA 2FTPA 1O5KA 1GOXA 5BMWA 3TQ0A 5F2IA 4FX8A 3W1PA 4IMEA 4FX7A 3LHUA 3O6CA 3G8EA 3W7EA 1NSJA 3IIVA 3M16A 3ZWTA 3WJZA 4MZ8A 2DORA 4RKAA 3HOJA 1G69A 4H6KA 2X1UA 3BK0A 4FIRA 3TX9A 1TJPA 4P2VA 5F2GA 2P1FA 3S5NA 2WNZA 4QAIA 1RVGA 1T0OA 3LHVA 1M5WA 1OX5A 1PIIA 1BWLA 2BXVA 1JJKA 3NQEA 2C0AA 3SY5A 3MI2A 4LVFA 1XKYA 4UTLA 5D2XA 3FA5A 4GFSA 1LBLA 3S42A 3ANYA 5KMYA 1XUUA 2YYUA 3KX6A 4O1DA 3MBDA 4CCCA 5HJLA 4BI6A 2PRMA 5AC6A 3OEXA 3QW3A 2J6XA 4N9DA 1EWDA 3S5ZA 1VZWA 3GR8A 1EP3A 2ZRWA 2AAMA 1GG0A 1OFAA 2ZRUA 2NX1A 1HFBA 4FNTA 4YL2A 1QOQA 1VHCA 3UWYA 4Z1AA 1SFJA 4WX2A 2XFWA 1LBFA 1G4EA 3JR2A 3TMQA 4OWGA 5CPMA 3EX4A 4JTJA 3U6WA 4CNOA 5L9FA 3G8RA 1KFCA 2F84A 3LTSA 5I3GA 2W6RA 2HS8A 2ZTKA 1OK4A 4UMCA 3UD6A 1AW1A 1I45A 3EB2A 1FCBA 3MI3A 3FLUA 1H7RA 3LRKA 4NXSA 3GNDA 1QR7A 2ABAA 4MYAA 1H60A 1I4NA 3S5OA 4JTHA 3R2GA 3PVFA 1AK5A 2VFIA 3OVRA 5C55A 2GQ8A 3IGXA 4JD4A 4A2SA 5BOOA 1WV2A 1BWKA 1PVNA 2WPBA 3S1VA 3HO8A 4FXRA 2Y62A 1VS1A 1KM5A 2PRLA 1G4PA 1WBHA 3W74A 2ZRVA 3A9IA 4E2DA 4K8HA 2DZWA 5CZ0A 4JTFA 1L6WA 4ONVA 1OG0A 5CZJA 1H7OA 5I3JA 5K2ZA 4JICA 3CEPA 3G0UA 3IVSA 2OMAA 3W7QA 2J88A 3NQDA 4FHAA 2ZCGA 2ZZ6A 2Q8LA 3TJXA 4WOZA 2CLEA 2GJLA 3GAKA 3W85A 3SW6A 1C8VA 1QAPA 1PHWA 3CLMA 1R47A 1XBYA 2DZPA 2G5WA 4TMCA 5AYXA 3AJXA 2PE4A 4N9CA 4DPQA 1D9EA 1L2UA 2ZZ1A 4M6VA 2NXGA 1I2NA 4JYEA 2CFFA 2ZZ5A 3ZWSA 3TXVA 3W76A 1XI3A 1RQBA 2C6QA 2H90A 2EAWA 1MXSA 3G18A 1JULA 3IIXA 3P84A 3LBMA 4IUOA 4TR9A 4JDBA 3NNTA 3G1VA 3O1NA 4JYFA 4O52A 5G2IA 1QFEA 1JVNA 4JTSA 4PL1A 1XBZA 5FEPA 3Q37A 3QMRA 2E6YA 3LRLA 1ALDA 3NA8A 3IIOA 2BSLA 3KOFA 1EUAA 1DL3A 4ZQOA 5CSRA 1KTCA 1A5CA 1UB3A 3TSMA 5HULA 4CQAA 4WXYA 1LCOA 3GNNA 1ZAJA 2ZQ0A 5DN1A 1F74A 1IXPA 5CPOA 4QIUA 3EWUA 2DZSA 3PWAA 3NL3A 1SU5A 4U4MA 2CLLA 4D2JA 1EWEA 3TK7A 4AAJA 2H3BA 4MLJA 4NJJA 1SZFA 4A21A 2E5BA 4JS3A 3A22A 4FB7A 1CW2A 3W1NA 2PCQA 3GVGA 4O4WA 2QF7A 2VFDA 1KLZA 3NOEA 2H8ZA 5TQLA 3L65A 5E93A 1DHPA 3HB9A 4X3ZA 3P74A 2J27A 5G1TA 5G4EA 4AVFA 4AHQA 1KTBA 3RFAA 3VE7A 1IXQA 2B7QA 5D32A 1YYAA 2BX7A 3O15A 1JUKA 1W5NA 2NWSA 3M44A 1K7EA 1OJXA 3LCLA 1K8XA 1XBXA 3QSRA 3IIPA 2WSRA 3OHIA 1ZAIA 1FWSA 3QH2A 5AHFA 5KTLA 4H4IA 2TRSA 1SO6A 5KZDA 4UTMA 2QDGA 5FF2A 5LZLA 1LLWA 1YTDA 4LU0A 4LVAA 1LBMA 1TYGA 1UUOA 3VNDA 3W84A 2Y6ZA 1LOSA 4NJHA 4XTIA 1XL9A 3HG4A 4GBUA 4CNPA 3INPA 1ML1A 4JTIA 3UWZA 3I7SA 3N3MA 4WOQA 4R33A 5AHLA 2CZDA 3PULA 1PHQA 4MLRA 3LB0A 1VYRA 1Y0EA 1VC4A 2VEIA 4BI5A 1UUMA 5FF0A 3W87A 2Y89A 4Q32A 4DBDA 3S8HA 1OFPA 1FDJA 3B0UX 1W0MA 3B0PA 2V81A 3NL2A 1N8FA 1VYPX 4RZ6A 3S5YA 4UTTA 1W3IA 4GXMA 1VCGA 2E5DA 3W2UA 3ELFA 3CC1A 4K38A 3LI0A 4BK9A 1H62A 1SFLA 2V82A 3G1HA 1MEHA 1W8SA 2GPTA 3FIGA 5LNVA 3BPWA 3TUUA 1XCFA 4RCXA 3M9YA 4JYDA 3MHFA 2OT1A 2OZ0A 2V5BA 3F4NA 4RZ4A 1HO1A 4PA8A 1KV8A 4HSOA 2ZA1A 1TREA 1YLVA 4EVZA 4Y8FA 3TQKA 1PE1A 2ATMA 3NPVA 2X1SA 4QM1A 5LHFA 1F7BA 3HG3A 1TTPA 4AEOA 1TTIA 4UIOA 3W86A 2GOUA 1H7PA 1RR2A 1EB3A 2HMCA 3ZR4A 5AC7A 3U8GA 2IQTA 2RKXA 3MBFA 1SO4A 3LI1A 3IEBA 1I8JA 1W54A 1LZOA 2VENA 1W31A 3CTLA 4UTJA 1GEQA 1Q6LA 5DY3A 5D03A 4L4LA 3STGA 3VFLA 3LHYA 2BLEA 3LHZA 3L5MA 5DY2A 1VLIA 1YXCA 2XN1A 1N7KA 4BFAA 4UXDA 5D2WA 1W37A 5AYYA 1WX0A 3CIXA 3DU0A 1TB3A 3LERA 5HINA 4QNWA 4FNSA 2PC4A 7TIMA 3NO5A 3W6YA 1K02A 1OYBA 5HUPA 1F76A 3BG5A 1Z42A 2NUXA 2ZFAA 2B4GA 3C61A 3QSTA 4O15A 1WBJA 1EEPA 3LDVA 4JXCA 3PBUA 4N6FA 3LHWA 1ZCOA 2NV2A 3N9RA 1XDLA 1HTIA 3C6CA 3L67A 3TFCA 1NEYA 4PC8A 3C8FA 3DI1A 5HWNA 4GC4A 1SZGA 1OYCA 2CLMA 1DVJA 3BLEA 1MEWA 1AMKA 1TPVA 1O4UA 3RK8A 2W0UA 3BLIA 3NQ2A 4EOUA 2RHGA 1EP2A 4K37A 3NGJA 1SQ7A 3W1MA 5K9CA 1Z48A 4MJZA 4O28A 1ICSA 2Y61A 1TSIA 2Y7EA 4QITA 4DXVA 3HPSA 3LXCA 4N9EA 5DBUA 4Z1DA 3CHVA 2DZVA 4XQ6A 3DH7A 1LRQA 1JCLA 5A8GA 5CZTA 1JCNA 4RR4A 1WDWA 2NUWA 3KAOA 1U83A 3TKFA 3WJWA 3P7YA 3CWOX 1I2QA 5LNUA 4EWND 3P5ZA 3LXAA 5C2XA 4X2RA 4LY8A 3GXNA 1NF7A 1LRTA 4JX4A 4HHPA 4O0ZA 1PL9A 1FQ0A 1LOLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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