1G69A

Thiamin phosphate synthase
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
226
structure length
226
Chain Sequence
HGIRMTRISREMMKELLSVYFIMGSNNTKADPVTVVQKALKGGATLYQFREKGGDALTGEARIKFAEKAQAACREAGVPFIVNDDVELALNLKADGIHIGQEDANAKEVRAAIGDMILGVAAHTMSEVKQAEEDGADYVGLGPIYPTETKKDTRAVQGVSLIEAVRRQGISIPIVGIGGITIDNAAPVIQAGADGVSMISAISQAEDPESAARKFREEIQTYKTGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural characterization of the enzyme-substrate, enzyme-intermediate, and enzyme-product complexes of thiamin phosphate synthase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIAMIN PHOSPHATE SYNTHASE
molecule tags Transferase
source organism Bacillus subtilis
total genus 79
structure length 226
sequence length 226
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2000-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1g69A00
3W1NA 3FA5A 1IIHA 2D73A 3C56A 4EWND 5FF4A 3WK0A 3HBLA 4JICA 3NGJA 4O8RA 3DZ1A 1D9EA 5E93A 1TTPA 4NVTA 4BWLC 4BWLA 2Z6IA 2ZZ6A 3E49A 1JJKA 5G1YA 2G96A 8TIMA 1X1OA 5HINA 5D33A 4OV9A 4K8EA 2J88A 2JKAA 5HULA 4IMCA 3E12A 2Z1BA 1Q45A 3IGSA 4MIMA 3PBWA 1G6CA 3GR8A 2H8XA 3IIVA 3HQ1A 3LCXA 3QJAA 2YXGA 1GOXA 1EP2A 1JRBA 4ADSA 1DVJA 1KBIA 3FFSA 3N14A 1TV8A 3FKRA 5G2IA 3WJXA 3QFEA 1VGAA 3KFTA 2VENA 4ZL1A 1KFKA 4PC8A 3TK7A 5CPNA 4LTSA 1H50A 2RH9A 3DXIA 3MP5A 3PB2A 2Z6JA 4DBEA 1WOAA 1VLIA 4UFLA 5DN1A 2Y63A 1VLWA 1FWSA 2ZA1A 5KZEA 2C16A 1V5XA 1Z44A 1EP1A 1M7PA 3S1XA 3P7YA 2WSRA 1QCWA 3W6YA 2E68A 1F74A 1M5WA 3S5OA 3TMLA 2ALDA 1BWKA 3CEUA 4GRSA 3LLDA 1D3HA 3MMTA 4N9CA 3BO9A 2HSAA 1B57A 2G5WA 2BTMA 3C0JA 3IIOA 1IXOA 1FWWA 4A3UA 3NZ1A 2EPHA 1TMHA 1XL9A 5CPMA 4DQWA 4KKXA 3W85A 5D05A 4HN4A 2A21A 1VCGA 1GQNA 3INPA 2I9EA 1JUBA 1K3UA 2C18A 3EX4A 4IOTA 5EKYA 3KAOA 4G1KA 1EPXA 1ML1A 1SFLA 1HTIA 1MEWA 2YPIA 3UZJA 4AXKA 1A5CA 1H60A 4J9JA 3DFSA 3UPBA 3C52A 4PA8A 1SPQA 4HPJA 4QQ3A 3RLUA 3SI9A 2V2HA 4P2VA 1ALDA 3PBYA 2R91A 1FDYA 3TNOA 1XUUA 1T96A 3DFTA 2OZ0A 1VR6A 2A7NA 3EB2A 3MYOA 1O5KA 1A5SA 2GVGA 3VKJA 3IVUA 4N2YA 3STFA 1IIGA 4Z1AA 3S1WA 1VZWA 4WOQA 4FNQA 3GDRA 1DJNA 1X7FA 3FJLA 2Z0IA 1A5AA 2CLFA 2OX1A 2QCHA 5LHEA 4FNUA 2PRHA 2NUXA 1OFDA 1GYNA 1SO5A 3W07A 2YW3A 4NJHA 5D2YA 3NQVA 2CW6A 1OX5A 2H3DA 1YDNA 1QO2A 3CU2A 1OFPA 2QDGA 3R8RA 1U83A 3DFNA 5J5RA 4Q32A 3HGRA 3TCEA 4E2BA 5HNRA 4UTKA 1LLZA 2Y6ZA 4UC5A 3VE9A 5C5YA 1C9DA 1YTKA 3W7QA 4RZ4A 2A2IA 4K7VA 1TJPA 1WYIA 2Y62A 4ZZ9A 3P60A 3TR2A 1JCXA 1OFRA 3PUDA 1RQHA 4WXZA 4RJEA 1UUMA 3OG3A 4N9DA 1UBSA 5K4XA 2ZDRA 2QJHA 2CLKA 4POCA 1KFBA 3SW6A 1EWDA 1OX6A 4IMEA 3VFLA 1P0KA 3UZ5A 1D3GA 4HSOA 3M1ZA 3FYOA 3L0NA 4UXDA 5LZLA 1C29A 2YYUA 1EB3A 4RKAA 2Y85A 1JQXA 4UTIA 1SQ7A 4AHPA 1H7OA 4FNSA 4EVZA 3A22A 4TMBA 3JS3A 1VS1A 3O07A 1SW0A 3T4CA 1TIMA 4A2SA 1VHCA 5MHBA 5I3KA 3B0PA 2CFFA 3MI3A 2V5LA 4ADUA 4ZMGA 5F4XA 1TTIA 2YW4A 4I7WA 4IMGA 4Z1CA 3DI0A 4O16A 1LBMA 4NJKA 1IXPA 1KTBA 1CX9A 3EXTA 1NF0A 3P5ZA 1QR7A 3W7LA 1SUXA 3IVSA 2E6DA 1KFEA 3STCA 4LVFA 3BPWA 2X1UA 4JNMA 3G3MA 3S42A 2BLEA 2VXNA 1TPEA 1Y0EA 2ZZ2A 1W3NA 1TRIA 1VH7A 3TSDA 3GR7A 1KFCA 2HS8A 4FHAA 5G4EA 2ZZ7A 1ZFJA 3GAYA 3QPZA 3TA6A 3KOFA 1KLYA 4GE8A 2OT1A 4KWVA 1SO6A 5EA9A 1H62A 5FF3A 4ZQRA 1KLZA 1EUAA 3O6CA 3N9SA 2V0TA 5AHMA 2YDAA 2V30A 1TTQA 1UCWA 2ZCGA 3DH7A 3NPXA 1FXPA 3RNDA 1LTDA 3B0VC 4O14A 2X16A 2C3ZA 3U2OA 5IM51 2X1TA 3NQCA 2ZRYA 1VHNA 4LVDA 1WDWA 3N2MA 2QCDA 3VE7A 4RZ6A 3TC6A 2VEIA 3P67A 5KZDA 2NX3A 1HG3A 2QCGA 2GJLA 5D32A 2DZXA 2NWRA 4O10A 1Q6LA 3LBMA 3DFQA 5HR6A 2H6RA 4M7TA 1I2RA 4WY0A 4BF9A 4IGHA 4TX9A 2VFFA 5FEWA 4U4MA 1L6SA 3LCGA 3G1VA 1KM1A 4IX2A 4K36A 2FB3A 4PL2A 5DY3A 2RKXA 4FF7A 3W7JA 4N02A 2NUWA 3LHVA 3HF3A 3P62A 4LC6A 1LOQA 4MKNA 2PE4A 4MVAA 4LS1A 3V1PA 4HKPA 3SSJA 4QISA 2A1YA 3DAQA 3TW7A 2ISSA 2PRMA 3SIZA 2YR1A 4XZ9A 2DZVA 3KVMA 1BWLA 4Z0SA 3PUEA 1WOBA 1W5NA 4NZJA 2YX0A 2ZZ5A 3TIMA 3TFCA 4IJBA 4I9AA 2XN0A 1ONRA 2BXVA 1DQWA 1QPOA 1M7OA 2ZTKA 1JCYA 1EP3A 1B9BA 2E1DA 2EF9A 3HMJG 1TTJA 4N6EA 4NXKA 1PV8A 5G2HA 3WJZA 3R13A 3W9ZA 2HMCA 1I2PA 3B0UX 3QC3A 2YYTA 3PM6A 1QPNA 4JTSA 3GXTA 5DLCA 4FX8A 1TV5A 3DFPA 1AK5A 5FI8A 3UWUA 4K39A 3DENA 2VFGA 3LXBA 3GK0A 1ZENA 3PVFA 4FNPA 4EIVA 5CSRA 3O6DA 5AC7A 3BLEA 1Z41A 1HL2A 3CB8A 1G7VA 4CCDA 4NXSA 4K6AA 1DHPA 1L6WA 2IQTA 4TIMA 3TSMA 1KW1A 4UFHA 3IEBA 5CZSA 3L5LA 5D09A 2P1FA 5G4WA 1OG0A 3TH6A 1S5VA 4JS3A 1JQVA 1I45A 3DGRA 1OF6A 2Y61A 4R34A 1TRDA 1PE1A 1K03A 2A6NA 4LS0A 1WV2A 4WQ6A 1QDSA 2DU2A 2QAPA 2VELA 1GWJA 1YTEA 3SGUA 4FNRA 3QSTA 2GPTA 3UD6A 3C4UA 2DZUA 3ZR4A 2G95A 2V5BA 2J27A 4YLWA 2AAMA 3VCRA 1R2SA 1TYGA 3WK3A 4MZ8A 3W7MA 1DJQA 1DKWA 1QPRA 2JKPA 3HGSA 1FWTA 1KM5A 3P8IA 3KRUA 5AHNA 3ATYA 2ZA2A 1GJPA 2Y7FA 3MBDA 5KINA 4AH7A 4H4IA 2RDWA 3N73A 5CPOA 1GTEA 3RMJA 2YFNA 3LCLA 1UJPA 3NQ8A 4E2DA 3M5XA 3N19B 1K02A 3I68A 3F4NA 4XTIA 1YXDA 4PH6A 3OVQA 2OT0A 3LHYA 3LCIA 2Q8LA 3NAVA 3OEXA 3W83A 2O7SA 3W1UA 4UMCA 2FFCA 2PURA 5F2LA 3TAOA 4Z0JA 5BMXA 3W7OA 4N4QA 2KZHA 3M0ZA 2GQ9A 3GDKA 4DF1A 3HB9A 5BMWA 1WXJA 1ADOA 3TW6A 4MJMA 5LSMA 2WJZA 4M5PA 1I4NA 3MW7A 3LBCA 3QMRA 2X1SA 5DCDA 2BSLA 1OK6A 3SR7A 1NF7A 2RDTA 5KSWA 3LHUA 1H7NA 3PWAA 1KM2A 3UYCA 3KX6A 1KM0A 4CCEA 4O1BA 5I3FA 1H51A 2YFOA 3QEZA 3MI2A 3KXQA 1YLVA 2NZLA 3GIYA 3UWWA 1ICQA 5E0KA 5AHFA 3NQ6A 1ZAIA 2Y7EA 5LHFA 3R2GA 3L9CA 5DXXA 1W56A 4EOUA 3RK8A 3LCWA 4QITA 4Q4KA 4JN6A 1A53A 4AHOA 2BX7A 4NZFA 3TKFA 2Q3OA 3HO8A 1LM1A 4CNNA 5LNWA 3CWOX 1FCUA 5EMUA 1W3TA 3MYPA 3L66A 1G4TA 1VYPX 4Y9AA 4PL1A 3THAA 3CHVA 2JBMA 3E9AA 5HUOA 4AMAA 1GG0A 3L0KA 4DPPA 3H55A 1JCNA 3BK0A 2DZWA 4MPQA 3EXRA 1CI1A 3S5ZA 1OVDA 1G4SA 5D38A 2EAWA 1RD5A 2G97A 3BG5A 3WK2A 3PG8A 4JGDA 1G4PA 1GVSA 2ZQ0A 3EX1A 4N9EA 1P4CA 2NX1A 3W76A 2VEMA 4TMCA 4BK9A 4OT7A 3DFOA 3S5NA 2QCFA 3F4WA 3HPSA 4OQVA 2C6QA 3R12A 1TPDA 4UTHA 3MI6A 5FF7A 2Y70A 4MUZA 5DY2A 3KVJA 1PVNA 1I2QA 3W1XA 3LCHA 3BV4A 5LNRA 1UB3A 6ALDA 2HS6A 3HIJA 2QDHA 2FTPA 3T55A 3HOJA 3P5YA 4B5NA 1RPXA 2NXHA 1TV7A 1GVOA 2A7RA 2WNNA 3O05A 1H7XA 3QMSA 4A21A 3QQ0A 3W7KA 3N9RA 4HIBA 2CZDA 1WQ5A 4JTJA 1OYCA 1LRNA 2DJXA 1E51A 1N55A 1X1ZA 1TPUA 4AF0B 4C1LA 5EYWA 4BR1A 4FO4A 1FCBA 4TU1A 1DBTA 2TPSA 3W86A 2ISVA 5LNSA 3Q37A 3DKLA 2ZZ4A 2J9YA 4LV9A 2QCCA 1JUEA 5K9CA 1QMLA 4NX5A 3IRDA 4DPQA 2TYSA 3QW3A 1UUOA 1G7UA 4FEZA 2NXIA 3EWZA 3UWQA 3B06A 2QJIA 3E0IA 4JXCA 5C6MA 2CLIA 1W5QA 1RQEA 3FIGA 5DBTA 5L6UA 3EX3A 4L4MA 3TC7A 2EKCA 5F4WA 3C8FA 1EUNA 1QNVA 4OBTA 3LB0A 4BFAA 1OFEA 1NSJA 3NM1A 5C54A 1P5BA 1LDCA 4ZQOA 1THFD 4JYEA 3B03A 4TR9A 4FIRA 2C15A 5TBOA 3W72A 1SZEA 1T99A 2OCZA 3B8DA 1ME8A 3L21A 5D37A 4JTIA 3PF3A 1JR1A 2ABBA 3CM4A 3TE9A 4ORMA 1BTMA 2QUUA 3IGXA 3GDLA 1M6JA 3W1LA 4HNNA 4YMZA 1LROA 3W7DA 1B4EA 3N3MA 1QPQA 3FKKA 2GVLA 3G1HA 4QIUA 5F2IA 4AWUA 3ATZA 5T26A 3TXVA 1XM3A 4ML9A 3W1RA 1RV8A 1OFBA 3NNTA 4S2BA 3LTPA 4E38A 1H1YA 3YPIA 5CKSA 1NEYA 1HUVA 1QOPA 1R30A 4OHQA 4FXSA 1F05A 3PB0A 4XKYA 1H63A 2AGKA 3PBVA 2WO5A 1GEQA 5ABTA 1K8YA 2FLIA 1GVFA 3EX6A 3B05A 5AYXA 4FB7A 3TQVA 3TV8A 3NL5A 3O63A 3CLMA 1K8XA 3O06A 4UTTC 5CZJA 4UTTA 3KHJA 3SJ3A 5C55A 4CCCA 3FOKA 3G1YA 4JEQA 4FIQA 1ZJIA 2ZRZA 1XXXA 4HSNA 4WZHA 2ATMA 3LLFA 1EA0A 5DBUA 3DI1A 1I8JA 1N7KA 3CWNA 5LGZA 1LP6A 4AAJA 2GUUA 5D03A 2QCEA 4K8HA 4GNJA 2I14A 4JD4A 3M44A 4KWWA 1VYSX 4RXGA 1QFEA 5FEPA 1G67A 3NR0A 2BWGA 3A24A 4MLRA 3MP4A 5G2WA 2E6YA 4GUIA 3NQGA 3S1VA 5FEZA 1NFBA 2E6AA 1C8VA 4QAIA 4WX2A 1FY6A 3W7IA 3UQNA 3TU9A 4IPIA 2X1RA 3QSRA 3RLVA 1K7FA 1RZMA 5HWNA 4ONVA 2DZTA 1P0NA 2EGZA 4ICNA 2B0MA 4UMAA 1DV7A 4JYFA 3G8EA 3G8RA 4M6VA 2V81A 5KZMA 1OABA 3W1AA 3RF9A 2VOMA 3UY7A 3LRKA 1H7RA 3TSBA 2NLIA 3USBA 3NL6A 5H2ZA 2NXGA 4H6KA 1G4EA 4JDYA 1XBVA 1EWEA 1F7BA 3M5YA 1H5YA 1W3IA 4JTUA 5CPLA 2RHGA 1SSDA 2VFEA 3NPWA 1AW5A 5D2VA 3GNNA 4MY1A 3GLCA 4AWTA 1F6KA 1VYRA 3NQ7A 5I3GA 1TB3A 3STEA 4HHPA 5E1QA 4MLJA 1KM4A 1JCJA 1YTDA 1XC4A 3GZ3A 4UFJA 4R33A 1AL8A 3C2FA 1V7YA 3W1QA 1XFBA 1HFBA 3E96A 3M16A 1T8XA 3I7RA 1NVMA 3BLFA 2OMAA 3W22A 2JKEA 4WXYA 3TJLA 3W73A 1UASA 5AFDA 2E09A 5L9FA 1XI3A 1PHQA 4WOZA 1DOSA 2B7QA 3MO7A 4O0KA 4IQLA 2HTMA 2E77A 2CLHA 5DELA 1OK4A 3LTSA 2Q8ZA 1QO5A 4DF0A 2YGYA 3EWXA 3RFAA 1K8ZA 3GKAA 1DORA 1TO3A 2FDSA 1BKSA 1PCWA 3W7RA 2WPBA 2W79A 2J6XA 4D2JA 5TIMA 1FCVA 3ANYA 2Y7DA 1HO4A 4XWUA 3HPXA 3W74A 4JX4A 1LLWA 3W7NA 3P80A 5K2ZA 2ABAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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