1G6CA

Thiamin phosphate synthase
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
226
structure length
226
Chain Sequence
HGIRMTRISREMMKELLSVYFIMGSNNTKADPVTVVQKALKGGATLYQFREKGGDALTGEARIKFAEKAQAACREAGVPFIVNDDVELALNLKADGIHIGQEDANAKEVRAAIGDMILGVAAHTMSEVKQAEEDGADYVGLGPIYPTETKKDTRAVQGVSLIEAVRRQGISIPIVGIGGITIDNAAPVIQAGADGVSMISAISQAEDPESAARKFREEIQTYKTGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Bacillus subtilis
publication title Structural characterization of the enzyme-substrate, enzyme-intermediate, and enzyme-product complexes of thiamin phosphate synthase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIAMIN PHOSPHATE SYNTHASE
total genus 80
structure length 226
sequence length 226
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2000-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1g6cA00
1TYGA 4PFMA 4JD4A 1LYXA 1SO5A 1I45A 4LW7A 1TJPA 3P5YA 5LHEA 3LGEA 5HUOA 4JTFA 1NEYA 3GXPA 3TA6A 4IMGA 5I3KA 4XWUA 3QRHA 3LHWA 1GZGA 4NXKA 2GUUA 1QDSA 5K9DA 1EPXA 3M16A 1VLWA 2VOMA 1KTNA 3PBWA 2CLKA 3LHVA 1DQXA 1TO3A 2FDSA 1ME7A 1KFJA 2NV2A 1GPWA 3BW3A 3TAKA 4A22A 1LLWA 3USBA 2PURA 4POCA 2DJXA 3FA5A 4UMCA 2VEIA 2FPVA 1G4TA 3CU2A 1CW2A 5AYZA 2CW6A 2WNQA 2A5HA 1A5AA 3ABOA 3HG5A 3NQ6A 3W07A 3G0SA 3NO5A 4WXZA 3M44A 1OF6A 1GYNA 3L65A 1IIGA 2H3DA 3BO9A 4Q33A 4IOTA 4IX2A 3DAQA 3GNNA 1TJRA 3WJXA 1KLYA 3GDTA 2Y85A 3TMLA 1QPQA 4QAIA 1YDNA 3LTPA 2QAFA 2FB3A 1BWKA 1KM4A 2A0NA 1ICSA 1N55A 3GXTA 3KFTA 5D38A 3TX9A 1VR6A 3LCFA 1BTMA 4O53A 2NUWA 1DL3A 3BW2A 5U4NA 4HIBA 4JTTA 4TMBA 1YYAA 4UR7A 5EA9A 3C2RA 3C0JA 4OE7A 3F4NA 4Y90A 5K3VA 4ADUA 3NVTA 3W86A 4JTJA 2NLIA 4K7VA 2H6RA 4JDBA 1FY6A 5IM51 1SPQA 3NZRA 3SGUA 2DJLA 3FLUA 1VHNA 3NOEA 4FNTA 1WA3A 2ZRUA 4EF9A 1GEQA 3ABSA 1D9EA 5ABTA 4ORIA 3HG3A 1HFBA 1VJIA 4PL2A 4JR5A 2ZYFA 3HBLA 3QJAA 4NZJA 5KZDA 5K4ZA 1JCYA 4PEKA 1R2RA 4ZZ9A 4OHQA 3NM1A 3QFEA 3G1AA 1HL2A 3O07A 4R53A 5D2VA 5KZMA 1OX6A 1NSJA 4RR4A 3T4CA 3IV3A 1MEWA 2DZWA 3FYPA 3W74A 3M41A 1LTDA 5DLCA 3I7RA 1LORA 1FDYA 4FNSA 5DCDA 1K8XA 1FDJA 1FQ0A 1H61A 1I2OA 3B03A 3S8HA 3O1NA 5F4XA 4LT9A 1NVMA 1SW3A 4CQ8A 3MI3A 1P0KA 1D3HA 1A5CA 2B7QA 3QPZA 4GUJA 1TTQA 3F4WA 4JTSA 4O14A 1X8FA 5CSRA 1I2PA 1TV8A 1ML1A 2OMAA 2A21A 5FF2A 1GTEA 1XCFA 4GNJA 4UIOA 4ZL1A 1JUBA 4WQ6A 2EGZA 4RCXA 4UTUA 4UTTA 5BOOA 1HO1A 1K7FA 3PUEA 1XDLA 5I3GA 1B4EA 3INPA 3IVUA 3W7PA 1Q6QA 2YCEA 3UD6A 4HKPA 3W1NA 4TX9A 2A85A 1TREA 1D3GA 4QNWA 3PBVA 3A5VA 3THQA 2V5BA 3SFKA 4LV4A 3GZ3A 1VYSX 4S2BA 3LHZA 3TFXA 2GQAA 2OX1A 2QCFA 3AJXA 4JS3A 1G4PA 3W23A 1DORA 1MSSA 4DPPA 3ZWSA 4UCGA 5AFDA 3NL6A 2C19A 2ZRZA 5KZEA 1JCJA 4Q32A 2VELA 3R5EA 4O0ZA 4MFDA 1LOLA 2X1SA 3G3DA 2E77A 4JTEA 2FPTA 4UXDA 2QCNA 4O0KA 4ALDA 1UB3A 1PV8A 3BW4A 1Z41A 3ZS4A 4QM1A 1JCNA 3W22A 5HWNA 3VFLA 5AC8A 4J9JA 1TPC1 4O1BA 1P4CA 5LNRA 4QNEA 2FFCA 2E5DA 4K38A 1XUUA 3L66A 5HQEA 4ZMGA 4TMCA 1YXYA 1K7XA 3L9CA 2V30A 3MI2A 1GVSA 3G0XA 4R33A 3GVGA 1FDZA 3S1XA 1FCVA 3WJZA 3S5NA 4OWGA 4O16A 2X1TA 3TC7A 3E96A 4OQVA 2Y89A 4MJMA 1M6JA 4XTIA 4WD0A 1KFLA 4LTSA 5D32A 2X2GA 1V5XA 1KM2A 2ATMA 4DELA 1O5XA 3VE9A 4JGDA 3W6YA 3MMTA 1LP6A 3TQVA 3BK0A 1F74A 1AL8A 3TIMA 1WYIA 1RR2A 4MLJA 1MXSA 1WV2A 1W5MA 4I7VA 3OA3A 2TMDA 3LRMA 4R7JA 3L0NA 4KKXA 2JGYA 3UWZA 3CEUA 3TQ0A 3S6DA 3W7CA 2VFFA 4GJ1A 1G6CA 1QNVA 3OG3A 3UQNA 2XN0A 4UNLA 1W5PA 1X1ZA 4AEOA 1BEUA 3LDVA 1JRCA 3W2LA 2WV8A 2E6DA 3LCWA 5CZTA 1SFLA 3MP3A 3RFAA 5C6MA 4C1LA 2Q3OA 3WK1A 3IGXA 4PH6A 4PA8A 4WUIA 3NXFA 3G1SA 2ABAA 2QCLA 1ZAIA 1DJQA 1OG0A 3PUDA 4O1AA 4JTKA 3LTSA 1M7PA 3P8JA 4B5NA 3CWNA 3KRSA 1TPB1 4FNQA 3O63A 3QEZA 2ISSA 3P74A 4P2VA 4WXYA 1XUZA 3LI1A 3LI0A 3LB0A 2NUYA 4I9AA 4NJKA 2ZBTA 1VYPX 1T8XA 4CCCA 4DPQA 5DXYA 2E5CA 1YXDA 4ZQMA 4KFNA 3SJ3A 5CGQA 2QCDB 4N9CA 3NQEA 2GVGA 4FX7A 4ZQPA 4U28A 5EBUA 2ZZ2A 3G1XA 4YL2A 2I14A 4HPJA 4JTIA 4TR9A 5DBTA 1J2WA 1U5JA 3KRUA 2HS8A 1UCWA 4UC5A 4UR8A 3G8RA 4X3ZA 1PHWA 3G1VA 3GX9A 2BLEA 1O95A 3BG3A 3NYZA 2QCDA 4UTIA 2Z6JA 4A2SA 5G4WA 4HT3A 3SR7A 3UXDA 3MHUA 1K02A 4O15A 1DV7A 2BTMA 3UWQA 3N2XA 3GKFA 4PTNA 4AHQA 1XBYA 2QJIA 3LCHA 1PIIA 3PM6A 4E2DA 3WJWA 4GBUA 1AK5A 2ZZ4A 3C2FA 2Q8ZA 1LM1A 3W76A 3MBFA 3NQFA 2B0MA 3G0UA 4XQ6A 3STEA 2ISVA 2ZA1A 2E68A 2C14A 3W87A 3QZEA 1O94A 2QCHA 3W1AA 3TC6A 3NG3A 1TCDA 1F7BA 3RNDA 1WBHA 3E9AA 3QPYA 5J5RA 1TTPA 3ANYA 1FBAA 3FS2A 4ADTA 1VHCA 1DVJA 2QJHA 4JYFA 1BKSA 3B0UX 3UWUA 2ALDA 2CLLA 3S1VA 3IIZA 3FKRA 3LTYA 2EAWA 2EF9A 3IIXA 3TFCA 3DENA 3NPXA 1RPXA 3GDKA 3UXAA 4UTTC 1W54A 5I3HA 5D2WA 1XC4A 3EX1A 5HWMA 3W9ZA 2Z0IA 2QR6A 3NGJA 3KVLA 4ADSA 2CZDA 3DH7A 4WY0F 5EL1A 2E6AA 4N6EA 1FWRA 1F73A 4N9DA 4FX6M 4KWWA 3C2EA 1W1ZA 2V0TA 5A8GA 2YXGA 1VCVA 4JEQA 2WSYA 4LVDA 3W7GA 3G1YA 3OVQA 3BVJA 2GVJA 3R12A 3PB0A 4Z1BA 2X16A 4O11A 1C29A 2V9DA 1AW1A 5DXXA 1A50A 1DJNA 1K03A 4IPJA 3P80A 5K9CA 1TTJA 2PRHA 4FEZA 2BX7A 3SECA 1W0MA 3GIYA 3LBMA 4RX0A 1SZFA 5CG7A 3B4UA 1KFKA 3W2NA 3TK7A 4BI5A 3VKJA 4CCEA 1U83A 2BXVA 1VGAA 2CLFA 3P61A 5DELA 2AGKA 2HSAA 4AH7A 4HSOA 2V2DA 3EKLA 3W83A 1TSIA 2PE4A 3GB6A 4UTMA 4UTKA 2QF7A 1Y0EA 3W7NA 1XBXA 2W6RA 4UUIA 3KX6A 4O54A 2HS6A 1W5OA 4RK8A 1PL9A 2X30A 5E93A 5G1YA 2R14A 3W7JA 3W1UA 3CIWA 1WDWA 2JKAA 1IXOA 1G4EA 5F4SA 4MJZA 1LDCA 1TV7A 1N8FA 4XBSA 4XUGA 2ZTJA 8TIMA 4Y8FA 2J9XA 3UWYA 3H53A 3DKLA 3B06A 4NJJA 3TSMA 2CLMA 1TTIA 3HOJA 3D0CA 1G69A 2V5LA 2O7SA 2PRLA 2DP3A 3NQVA 4CQ9A 4IMFA 3ZR4A 1I2RA 3NQDA 5HMSA 4N9EA 4GUFA 1EWEA 4IMCA 3HPZA 2WNZA 1ZY9A 3W7KA 2J24A 1T0OA 2FPYA 1YPFA 3EXSA 4IX0A 4H4IA 1IGSA 2GJLA 2RDWA 4MYAA 1KA9F 1KTCA 1LBLA 5CPOA 1OFPA 3DFQA 3M1ZA 2HMCA 3IIVA 3C6CA 1B3OA 3HG2A 3BARA 1I2NA 2E6YA 5BRBA 2PC4A 5G4EA 2C6QA 3W7HA 1WQ5A 4DBDA 1DKWA 5C55A 3FEMA 6ALDA 1CX9A 1JCLA 1DOSA 3BG5A 1VCGA 4FXRA 1N7KA 1OFQA 2VFIA 2GOUA 4UTLA 1J5TA 1HUVA 2YSWA 3LOTA 2JGQA 4MKNA 3VCRA 4N9BA 1RVGA 3SI9A 1NF0A 3W72A 1MZHA 1GYLA 4Z1DA 3G24A 1ZENA 2ABBA 1H7OA 3CLMA 1WBJA 4X2RA 1RD5A 3OVRA 1UUOA 3EXTA 1OABA 1W56A 2P0OA 2FJKA 5D33A 1H1YA 2OT1A 3CPRA 5AOUA 3CHVA 4QQ3A 2CU0A 1A5SA 4DO5A 2H90A 5D09A 5K4XA 1ZNNA 1HO4A 1S3HA 3IRDA 2WJZA 1W3TA 4K8EA 3THAA 4C1KA 3TAOA 5SWUA 5J5DA 5FEZA 1X6UA 3TQKA 4YCOA 3MP4A 3QM3A 3W7RA 2YR1A 1NAL1 1FWNA 1OHLA 2YX0A 4YLWA 1L9WA 4LC8A 5CPNA 5FF3A 4LUJA 1AMKA 1I2QA 3TDFA 3KVJA 1P5BA 2QUTA 3KXQA 1PCKA 4QISA 1KW1A 3EEGA 1TPVA 3MYPA 1DQWA 2QCCA 3L68A 1JUKA 1I8JA 4E38A 1YTDA 3I68A 4FHAA 1JRBA 2VC6A 2AQWA 1YADA 2VKZG 4XZ9A 5HINA 2E6FA 2HTMA 2TSYA 2ZZ7A 3FJ6A 1LZOA 4K8HA 3QMRA 3QC3A 4JX5A 3KAOA 2ZZ6A 3PG9A 4GXMA 3T55A 2NXGA 2VENA 1EX5A 2QCGA 2JBMA 5H2ZA 1JCMP 4AWUA 4HHPA 3N19B 3FIGA 3TR2A 3LERA 3NL2A 4O12A 4ZQOA 1LRTA 4HSNA 3BGJA 2R91A 3HO8A 3DKJA 1JUEA 1OFOA 2Y7EA 3VNDA 5L9FA 4JTUA 3EX2A 1SO3A 2A7PA 2PCQA 2I1OA 2Y61A 4FIQA 3W85A 3W1TA 4M6PA 3L2IA 3GDLA 3I65A 3QSTA 5EMUA 4LU0A 3F03K 4O4VA 4K6AA 2NX3A 1YLVA 1E51A 1JULA 3S5ZA 4NU7A 4S2CA 5G1TA 3U6WA 2CFFA 4MVAA 3V75A 1RV8A 3U8GA 1P0NA 1RQBA 1CI1A 3CIXA 4RV8A 2RDTA 4BWLA 4MOZA 4JX6A 3M5XA 5D04C 1KFCA 2E5BA 4KWVA 4Z0JA 4LRTA 1X1OA 3MUXA 3Q2DA 1GWJA 1TQJA 5AC6A 4ONVA 4QITA 3G3MA 1W3IA 5D2TA 2AAMA 2ZCGA 1IXNA 2CZ5A 4K7YA 1KLZA 4NX5A 4Q4KA 1SU5A 2YW3A 2OT0A 1JQVA 3KHJA 1W31A 2Z1BA 3NR0A 3U2OA 4YXGA 4WOZA 4IQLA 1SUXA 4DXVA 3Q58A 1VPXA 3DI1A 1HTIA 3H55A 1ME9A 3STGA 1FWSA 3T78A 3OBKA 4NQ1A 3UWWA 4GUHA 1WX0A 1ZAHA 4A2RA 4DQWA 1RZMA 1TRIA 2O7QA 4GC4A 3NQ2A 5F2MA 3W7MA 2NXHA 1J4EA 4IMEA 4MZ8A 3N14A 1QOQA 3W75A 5FF7A 1ZCOA 4AF0B 2V2CA 1XM3A 4AWSA 4FNPA 3K30A 2CLEA 1LROA 1QPNA 4M5PA 2ISWA 3CC1A 1T96A 1IXPA 1JQXA 4PODA 4LC6A 2XFWA 4O10A 4X9SA 1S5TA 3PUOA 4O57A 5F1VA 4BFAA 4K39A 1L2UA 3NQMA 3S5YA 3L5MA 3EWXA 2ZA3A 4RZ6A 3ELFA 2B7OA 1TIMA 4AXKA 2ATSA 1W5QA 3NL5A 4HNUA 3G1DA 5D37A 4Y6GA 2YDAA 3HIJA 4FNUA 6TIMA 3PBUA 3KVKA 3EXRA 1JVNA 3DFTA 4WY0B 4IXXA 3KRZA 5BW6A 1ZFJA 3O6DA 5LZLA 1SW0A 2V8ZA 4RZ4A 5D05A 1FCQA 1EEPA 3CTLA 7TIMA 1OK4A 5AB3A 4LS2A 5C5YA 3PSWA 1YXCA 1H5YA 5LHFA 1YPIA 4ICNA 1IXQA 5KITA 1LCOA 2YYTA 5TQLA 3WJSA 5BMWA 4AVFA 4CNPA 5LGXA 3NPWA 1KM0A 4Y96A 1OFBA 5T26A 1F6PA 1ONRA 4GUGA 4MUZA 3I6RA 3A23A 2DU2A 1K7EA 5DY3A 1RQEA 3NDOA 4LY8A 2ZZ3A 3EWUA 4ZQNA 2Y7GA 3F1QA 4CQAA 3TMQA 1OK6A 2G97A 3MHGA 4NVTA 4AB4A 1JJKA 3EWBX 3BPWA 2B7PA 5D03A 2WQPA 4ZVJA 3RLVA 3C52A 2KZHA 3EWYA 4JX4A 4UMAA 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 2LLE A;  3A21 A;  1GG0 A;  3W7I A;  3RMJ A;  3TH6 A;  3QYQ A;  1Q3N A;  2PRM A;  4Y9A A;  3NA8 A;  4EF8 A;  4RLI A;  3P81 A;  3PG8 A;  4MLR A;  5D30 A;  4H3D A;  5EKY A;  1KV5 A;  1OYC A;  1MO0 A;  4EIV A;  3CT7 A;  2B4G A;  1OYA A;  3M9Y A;  4LVA A;  1OFD A;  4MZY A;  2FTP A;  1VS1 A;  2C3Z A;  3HQ1 A;  2W0U A;  2X1R A;  1SO6 A;  2QJG A;  3CEP A;  3EWW A;  1O5K A;  4DBE A;  1DBT A;  2NX9 A;  1R2T A;  3M6Y A;  3P84 A;  2RKX A;  1QPR A;  4N2Y A;  3DI0 A;  4Z1A A;  3R89 A;  4IUO A;  3SIZ A;  4BI6 A;  3A22 A;  1P1X A;  1F5Z A;  1ME8 A;  2C13 A;  4N4P A;  1B4K A;  3LRK A;  1Q45 A;  2J9Y A;  4M6V A;  4FB7 A;  3UWV A;  1H7X A;  2DOR A;  1K8Y A;  2YW4 A;  1GG1 A;  1LBF A;  2QAP A;  5KSW A;  1F05 A;  4OT7 A;  3E49 A;  4O8R A;  3DGR A;  4HNT A;  1R46 A;  2Q8L A;  3HGR A;  3S42 A;  3MO7 A;  3GDR A;  4NJI A;  4BWL C;  1AG1 O;  3W71 A;  1Q6L A;  2YGY A;  4NNB A;  1BWL A;  2ZDR A;  3R2G A;  4GRS A;  4O17 A;  4XKY B;  2WO5 A;  4MY8 A;  1H62 A;  1H7P A;  4GE8 A;  5I3F A;  2P1F A;  3JR2 A;  1B9B A;  4L4M A;  1H50 A;  4M19 A;  4TU1 A;  3M5V A;  2CZF A;  1TRD A;  1R47 A;  1ZAJ A;  2QDG A;  3N2M A;  3A9I A;  2E1D A;  1IIH A;  1VYR A;  4Z08 A;  3B04 A;  1V7Y A;  4XKY A;  3O16 A;  5EY5 A;  5GVJ A;  4XBK A;  5C2X A;  2OCZ A;  2ZRV A;  3NQA A;  2RFG A;  1T99 A;  1PE1 A;  4JTH A;  1FCB A;  5CKS A;  4LRS A;  3JS3 A;  3IIP A;  2QUV A;  4O1C A;  2R8W A;  4O50 A;  1UAS A;  2WNN A;  5AHM A;  3CWO X;  2BWG A;  2RHG A;  5LGZ A;  1H63 A;  3ZFH A;  2EHH A;  3HMJ G;  5LNV A;  1KV8 A;  1FX6 A;  5L6U A;  5KTL A;  3W1Q A;  1L6S A;  3LHU A;  3C2V A;  1W3N A;  3KOF A;  3FFS A;  3DXI A;  3AO0 A;  5EYW A;  4JYD A;  3ABQ A;  4LVB A;  1VLI A;  3FYO A;  5HJL A;  4WX2 A;  1K8Z A;  5D2X A;  4QSH A;  3LHT A;  4UFH A;  5BNK A;  3TSB A;  3B0V C;  3HPX A;  3T40 A;  1KBI A;  1NF7 A;  3LCG A;  1QFE A;  2H8X A;  2BZN A;  4LVG A;  2A6L A;  3TUU A;  3MWA A;  2Z6I A;  2A4A A;  5LSM A;  2V81 A;  3G1F A;  3ATY A;  1PCW A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1Q2R A;  3CWH A;  4CNU A;  3E3H A;  3G6M A;  4LW7 A;  4C6Q A;  4M1R A;  3LGE A;  4GKT A;  3UGV A;  3T2P A;  4IMG A;  3KL3 A;  4XWU A;  3K4W A;  3QRH A;  3E0W A;  2NW0 A;  1GZG A;  1BF6 A;  1QDS A;  1EPX A;  3T42 A;  3M16 A;  3FST A;  3LHV A;  4ZB2 A;  2FDS A;  1ZS2 A;  3JU2 A;  2VDH A;  3DUG A;  3BW3 A;  3TAK A;  4X0N A;  2PUR A;  3GFY A;  4U5I A;  5JIP A;  4Z2J A;  4J28 A;  2BV9 A;  4UMC A;  2GDQ A;  2FPV A;  1ECQ A;  1G4T A;  1SM9 A;  4S3E A;  1GHS A;  4HJF A;  1O7A A;  3ORW A;  3MTW A;  3IGH X;  5EMK A;  1IEI A;  4B5T A;  3G0S A;  1LLO A;  1V6Y A;  1LG2 A;  2H3D A;  4ZOA A;  3BO9 A;  3FJN A;  3AIB A;  4IOT A;  3DAQ A;  3GNN A;  3WJX A;  1KLY A;  3GDT A;  1OCJ A;  3BQ6 A;  3KE0 A;  4QAI A;  1QPQ A;  1BWK A;  2XIN A;  3CZE A;  4KF1 A;  1Y65 A;  4O53 A;  3ARW A;  3LNP A;  2V67 A;  4JTT A;  3QY8 A;  5EA9 A;  4HA4 A;  1CXK A;  1UW9 A;  4ADU A;  3OGS A;  4HHM A;  3W86 A;  2CWX A;  4AG0 A;  2NLI A;  4JCM A;  1FY6 A;  3U57 A;  3AMG A;  1SPQ A;  4E6M A;  1O12 A;  2C71 A;  3FX4 A;  4U33 A;  2BAS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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