1GHSA

The three-dimensional structures of two plant beta-glucan endohydrolases with distinct substrate specificities
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
306
structure length
306
Chain Sequence
IGVCYGVIGNNLPSRSDVVQLYRSKGINGMRIYFADGQALSALRNSGIGLILDIGNDQLANIAASTSNAASWVQNNVRPYYPAVNIKYIAAGNEVQGGATQSILPAMRNLNAALSAAGLGAIKVSTSIRFDEVANSFPPSAGVFKNAYMTDVARLLASTGAPLLANVYPYFAYRDNPGSISLNYATFQPGTTVRDQNNGLTYTSLFDAMVDAVYAALEKAGAPAVKVVVSESGWPSAGGFAASAGNARTYNQGLINHVGGGTPKKREALETYIFAMFNENQKTGDATERSFGLFNPDKSPAYNIQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Three-dimensional structures of two plant beta-glucan endohydrolases with distinct substrate specificities.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 1,3-BETA-GLUCANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Hordeum vulgare
total genus 100
structure length 306
sequence length 306
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.39: Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase.
pdb deposition date 1993-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00332 Glyco_hydro_17 Glycosyl hydrolases family 17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ghsA00
4QAWA 4HPHA 3WBEA 5KZ6A 4PTVA 4CU6A 4DUVA 4JFTA 2ZUVA 2J62A 1WDQA 2BXYA 2JALA 5BXSA 1JZ2A 2IXVA 4AD4A 1TUXA 3NCOA 4F9DA 5I23A 1EHNA 3W81A 1JGIA 5GNXA 1I1WA 1C93A 4W85A 4WK9A 3WD1A 1M03A 4TVDA 4EK7A 3TTSA 4F8XA 2YKKA 4WJXA 3KZSA 1KB3A 3WQ8A 2DSVA 4H8HA 2GVYA 3SCRA 2WCSA 4MJ4A 4HMDA 4FLSA 2WMJA 1DP0A 3BAXA 1KR0A 5A6KA 3AZRA 1CXEA 2O9OA 2C8NA 4XB3A 2VRJA 2YL9A 4X0NA 1UWSA 3GZAA 1E5NA 4XZWA 1U2YA 1UD6A 4GQQA 1XD0A 1V6XA 3SCVA 1Q6EA 4M1RA 3RDKA 1L0PA 4W7VA 4J28A 1GQKA 6A3HA 1E6QM 4ZE5A 5CGTA 1ZS2A 1TR1A 1UR2A 4A4AA 3I3BA 1JZ7A 3WFZA 1WDSA 4U5KA 1D2KA 3M7SA 1S46A 2AMGA 5DF0A 3ZSTA 2DT2A 1QW8A 2DSZA 3QOKA 3TOPA 4ATDA 5IHRA 4P8UA 1XSJA 2WVVA 4CU8A 2VRQA 1GQIA 1B3ZA 4GO9A 2Y24A 3PZMA 4QP0A 1E56A 1LLOA 7CGTA 3POCA 2O9PA 5HPOA 1UR4A 3IJ8A 4DUWA 1W1PA 4UOJA 3WDHA 2WMKA 5AYIA 3SCQA 4KH2A 3CUIA 2D1ZA 2NT1A 4PBGA 3B9EA 3BAYA 1GQJA 3AMKA 2CNCA 1JF5A 1SR0A 4QCFA 2BVDA 2C7FA 1JDCA 4Q22A 2V5CA 1J18A 3EYPA 2DIEA 3AS0A 3EDDA 2WVVB 5D9PA 3WH8A 2VX7A 3MU7A 3K46A 2FGZA 1WZMA 1WDPA 5HNNA 3AOFA 3WQ5A 2VL4A 2PBGA 3GXIA 3L4UA 1TFVA 4PMUA 1TG7A 2BS9A 2OYKA 1X1NA 1UG6A 4JL1A 3VM7A 3CZKA 1QHOA 2EBNA 2YL5A 2OWCA 5A2CA 1V6YA 3GH4A 3KL5A 4MB4A 3WH7A 3A4AA 2CITA 2DH2A 1GVYA 3WD4A 4QLLA 5HOSA 2W5FA 1UKSA 1MW1A 5ABHA 3DYMA 5D9OA 1OT1A 1TVPA 3QR3A 2YOCA 4JL2A 3M6DA 1E6RA 1O7AA 3FN9A 4W8LA 1XRVA 2FH8A 1TE1A 4GINA 3W29A 5I3DA 4HPGA 5LYRA 1W9DM 2WC7A 1CDGA 1MFVA 2OWXA 4E4PA 1IT0A 4AZBA 4D6GA 3AHXA 2VRKA 3AIRA 5FKYA 4W7UA 4B3KA 1KGXA 2BY0A 3BCDA 4AZCB 3F5KA 1QI2A 4JFVA 4HOWA 2BVTA 2WMGA 1VENA 1JZ3A 4P7OA 4JFUA 2CKSA 3GH7A 4TX6A 2VQUA 2XSBA 4MDOA 5BWFA 3PZTA 4EE9A 2Y2WA 4AWEA 3LMYA 3UG5A 3VIHA 1W32A 2J74A 3CUJA 4OBSA 4PMXA 3DHUA 3FY1A 1WO2A 2WNWA 5GPRA 5I0DA 3K4DA 2DT0A 4MDPA 3JUGA 5BXPA 3OGRA 2EPLX 2ZX8A 5C71A 3ARWA 2JIEA 1JAKA 1I75A 3SUWA 5A6BD 5I5RA 3PZ9A 1B31A 4UFLA 5JIPA 4V2XA 3O9NA 4UQCA 2JF7A 1Q4NX 3VD7A 3WF1A 3KL3A 1W9PA 3AFBA 3WY1A 2ZIDA 4RE4A 3SURA 4IPNB 2VX5A 2WCAA 2WM0A 4KMQA 3VIIA 3AZTA 1J0IA 4JKKA 1OM0A 3L4VA 1SFSA 1BVZA 4UOZA 3SCSA 1CXHA 3RJXA 2VTFA 2WLZA 3VDAA 3CMGA 3WDQA 8CGTA 4AD5A 2ZUMA 4TVUA 2CHNA 3AROA 1VJZA 4UQ9A 7TAAA 1XV8A 1FP9A 1E55A 1OWQA 4UFHA 4BQ2A 2CESA 4HU8A 3ARSA 3GNOA 1B3VA 2G4FA 2XM2A 1HL9A 1QOXA 1R87A 1TMQA 3IAPA 4IUGA 3EMCA 4AEEA 1J0YA 1VEOA 3BMWA 1ZB5A 4GI6A 4J27A 2Y5EA 4L4OA 3FAWA 2XVPA 4W93A 2E0PA 1VRXA 2O92A 3NSXA 2CEQA 4GXPA 1NWRA 3IJ7A 3D3AA 5AC5A 2XYLA 2OYLA 2C0HA 1VEMA 3IANA 3LPPA 1GPFA 3II1A 1K9FA 1C8QA 2YDQA 3BCFA 1EIBA 3PZIA 3QOMA 2J8GA 1WZAA 2VURA 1SMDA 3SCOA 4QDMA 4D6FA 4AZ6A 3WF3A 2WC4A 2QV4A 3L4WA 2W4XA 2XUCA 3KE0A 4FK9A 5E0CA 3AS3A 3OLEA 1E4IA 1DWGM 4K68A 1H11A 3AQUA 5DO8A 4H8UA 1E0VA 2XFYA 1HKMA 2J75A 1OB0A 3RM4A 4Z2HA 3QGVA 2TAAA 5A6MA 1PJ9A 1E0XA 3VPLA 1DWHM 2WYSA 4PCTA 3VIGA 4U2YA 1HJXA 4ACYA 5BXTA 3G6MA 1MW3A 4YHEA 4GZIA 1QI4A 1BF2A 1ZBWA 1W9XA 4HOZA 4P8WA 4D72A 4M56A 4OJYA 2NW0A 1MW0A 1QI0A 4XZBA 1W9UA 2CBUA 2WVTA 2YIHA 2VOTA 2CYGA 5A69A 1MVYA 4Z2JA 1TCMA 5A8MA 4JAWA 5IFPA 3WQ4A 3VD9A 3WQWA 3WDJA 1W9VA 3AISA 2QF8A 4IPLA 3CZJA 3VOCA 1M53A 1JZ4A 1WAWA 3VX1A 2BV9A 2ZUUA 4R27A 3A47A 2DSUA 1BHGA 4MNLA 3CHEA 4OOZA 3ZJ7A 2MANA 5AY7A 3WDRA 3PZUA 1XH1A 1WZLA 4WKAA 3RM8A 4H2CA 2DQXA 1NWSA 4M24A 2XG9A 2BXZA 1BTCA 2PI6A 2WSPA 4JKMA 4NF7A 1BYAA 4IM4A 3POHA 2WXDM 1M7XA 5AC4A 1LQ0A 3AHYA 2WBKA 5I79A 1VFOA 3VD5A 2DDXA 1NWTA 1E0WA 1WDRA 4PRWA 3VGFA 1PBGA 1V02E 2ZX5A 5KEZA 2CERA 3MSGA 3OGVA 2QMJA 5C70A 4CN1A 1N82A 3SCWA 3ARQA 3N11A 1E40A 3U57A 1WCGA 5JBEA 1E4NA 4Z2GA 2D0HA 1F4HA 3OLDA 2W91A 1FHDA 1UKOA 3CO4A 2J4GA 4UCFA 4OZOA 9CGTA 4UFIA 3OLGA 5HPCA 4PMZA 1J10A 5HDRA 2W62A 1HVXA 4NRRA 5HBFA 3AYRA 3TTQA 1E6XM 2J25A 5A2AA 3W6MA 1HIZA 1V0MA 3WBAA 2X0HA 5M17A 1H4PA 2EQDA 5FIPA 2G8ZA 4EKJA 3ZMRA 1E1FA 3WELA 2VUYA 3U7VA 3WEZA 5EBAA 2YDRA 2CCRA 3TTOA 3CLWA 1BVNP 4RL3A 3U5UA 5CZKA 4PTWA 1OSEA 1RP9A 2G3IA 3CUHA 3MS8A 1DTUA 4PUDA 3FNDA 2G41A 1B3XA 1E5JA 2W67A 3VIKA 4V28A 1ISWA 5GNYA 1AQHA 3ARTA 4MTVA 4BS0A 1BAGA 2VX6A 2WZIA 3SCUA 3AXXA 4AZIA 4V27A 2XPKA 1HF6A 5LA1A 4TTGA 2PB1A 2W61A 2QPUA 5D9MA 2WKGA 2FGLA 4OOUA 2DGAA 1U30A 2X0YA 1MXGA 3MMDA 4A3HA 1D7FA 3BLKA 3WUGA 5E0FA 3GTNA 4WKFA 1J0JA 4X9YA 1SMAA 2Z1SA 3HJEA 1FA2A 4GQRA 1CECA 1EDTA 4PN2A 1IZJA 5TD4A 2DH3A 2EEXA 1R85A 3K8KA 3CTTA 3OZOA 1G9HA 2BVYA 5I24A 3B9DA 1KGUA 3HMCA 4ZFMA 3AS2A 3VU2A 3WIJA 3VDHA 2ZXDA 1UWRA 4JKLA 4N42A 2JIWA 1VAHA 4URIA 4MB1A 3W25A 2A3CA 3AIEA 1G01A 1WNOA 1WE5A 4ZENA 4U31A 3BMVA 1BSIA 2EPOA 8A3HA 3OA5A 2VZVA 2VZOA 3MANA 4E8CA 1H0IA 2QMKA 4B9YA 3M07A 3WNKA 5A8OA 1G5AA 5CPSA 4AZGA 1CXFA 2X1IA 3WEMA 4PCSA 5M03A 1H0GA 1Z32X 1GJWA 3GXFA 2FHFA 4D6CA 1JDDA 3W28A 4CGTA 2V3GA 1IZKA 1U33A 4W8BA 3VM5A 3DC0A 3L2LA 3SCTA 2BY1A 2BY3A 1HL8A 1JG9A 1W1TA 5LA0A 1RP8A 3B9AA 1FP8A 2QHAA 1XCWA 3AXIA 5HXMA 3L4YA 3OGSA 2AOSA 3GYCA 5DEZA 4AIOA 1KCKA 3FHAA 2CPUA 1ZU8A 2EJ1A 1B1YA 2Q8XA 5D8WA 2EO7A 1JL8A 3GXMA 5BROA 2YDSA 2VZTA 1W9BM 1MWOA 2J78A 2XGIA 3ARXA 2CIPA 1UR0A 1VEPA 3N18A 3LPOA 2PBOA 1EOKA 1GJUA 1X6LA 4UOQA 4E8DA 2Y8VA 2XWEA 2D24A 2WC3A 4S3KA 1OD0A 1P6WA 5A94A 4KWUA 4Y7EA 3FW6A 4B9ZA 3THCA 1XCXA 4MPKA 3WEOA 1Q6FA 3AIUA 2DT1A 3S6TA 1C8YA 1W3JA 4WKHA 2VVNA 4MNMA 5I2UA 1ISZA 1BGGA 1L8NA 4RE3A 4E2OA 4P7NA 3WQVA 2CXGA 1E70M 3WNMA 1HP4A 3FHQA 4D6JA 3CZ8A 2VT0A 5E70A 4AC1X 1UWUA 4Z2LA 4MAZA 3EMQA 1UH4A 3BAJA 3TTYA 2XFFA 4AXNA 1WZKA 1KFWA 3ZJ8A 3WENA 4W5UA 1HKIA 3SEPA 2D0FA 3DHPA 4UQDA 3QHMA 1OGGA 5F7UA 4GI9A 4CN4A 5JIWA 3WMBA 4TX8A 4BQ3A 4HOXA 4AW7A 3PZNA 3CHCA 3N04A 3MMWA 3L4TA 3KEHA 1HKKA 2QLYA 5BRQA 2VMFA 4H04A 4FF5A 3VIJA 1B9ZA 1PPIA 4TXEA 1JIBA 2O9TA 2PWEA 3DYPA 1QBBA 4JIEA 3TONA 4CCEA 2J7HA 4GZJA 6TAAA 4J3WA 2E8YA 5JBFA 3PTQA 5E6YA 2ESCA 3PN8A 3W4RA 4JFSA 5CJ5A 4H7VA 3AXHA 1W1VA 3WUFA 1G94A 4CD8A 2GJPA 2PWFA 5D8ZA 2D20A 4U3CA 1HT6A 4BQ5A 1H49A 1EA9C 1JI1A 2XIBA 4PSRA 3K4AA 4UZSA 1JD7A 1OCQA 3K1DA 1NARA 4N0RA 3CUGA 4OKDA 4AMCA 1NP0A 1RD6A 4P8VA 2PWDA 5A8PA 5GQBA 2WZHA 3AHZA 4CCCA 4H41A 1UR9A 3GBDA 2OYMA 4CUCA 2XTKA 2WB5A 1QNPA 1ISYA 1V6UA 2J7BA 1V3JA 3AHTA 4M80A 4HA4A 4J3VA 3WF4A 1CENA 2YL6A 3SUVA 2WBGA 5FOOA 3T2OA 2YBUA 3EBVA 3WH5A 1QVBA 5DMYA 3AIVA 4BQ4A 3N9KA 4PMYA 1MFUA 1UH2A 1EO5A 4AD2A 4D6IA 3RILA 1J01A 1ZBCA 3LPFA 2NT0A 1PEZA 3OB8A 4AZ7A 1UHVA 4P7LA 2WHLA 2ZUTA 1UZ1A 3HN3A 2JEPA 3FXYA 1ZJBA 3GNPA 3OIHA 3CPUA 1ESWA 3BAWA 1KQZA 3VO0A 3SUSA 2ZUWA 1HJUA 2CHOA 1CXLA 1JZ6A 2WWCA 4S3JA 1OT2A 2VZSA 3B8SA 2FHCA 3W53A 4BA0A 3WKZA 1JAEA 2D22A 2XIIA 5E6ZA 3NSNA 3CZLA 4CKQA 1JYWA 1UYQA 2XM1A 2DSKA 2UY2A 1CGXA 1B2YA 1E71M 3BLPX 3KL0A 3PTKA 4GI8A 4XX6A 5LA2A 3GNRA 4D6DA 1JD9A 2XVKA 3BAIA 4AEFA 3ZJ6A 4MB5A 2X09A 5ABFA 2PWGA 4AD0A 4Z2IA 4PYSA 4HP5A 1UD4A 1ZL1A 4WIWA 3DECA 3ZSSA 3MKKA 2VQTA 4MNKA 3N1AA 3VD4A 3K8LA 4J3XA 4UQAA 2BNJA 2OLHA 4HU0A 1FHLA 1V3IA 2GUYA 2VVSA 1SYTA 1B30A 3T0AA 2Y4SA 2XWDA 4F79A 5EB8A 3N13A 2A3BA 1KXHA 2EPKX 3WL0A 2DEPA 1BG4A 4RE2A 4WSJA 4ZXOA 1EDQA 4CD7A 1LJYA 1JNEA 1GONA 3BSGA 3ARYA 4CD4A 5ABFB 2WMFA 3PZQA 3T2PA 1OD8A 1CNVA 1CEOA 2XSAA 1LWJA 1HP5A 4UTFA 1FH8A 1OBAA 2D0GA 1W91A 4BF7A 3WH6A 4FLRA 2XHYA 1XH2A 1Q6GA 5IFTA 4B3LA 2E3ZA 4W89A 1KR1A 4AIUA 1XSIA 3VIFA 2WMHA 1US2A 4P7RA 3UERA 1DEDA 4OBRA 1W3HA 4U3AA 5CQ1A 1K9EA 3ZT6A 1C7TA 3U5YA 4BCEA 3CZEA 4PMOA 1JYVA 5A95A 3PBGA 1EO7A 1VB9A 2ZWYA 4EAMA 1UD2A 5IXEA 3EDFA 1CLVA 1ODZA 1WP6A 2W92A 3EMZA 4M81A 2ZXQA 3ZIZA 1UWQA 2YL8A 3L2MA 1X6NA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4QAW A;  4HPH A;  3WBE A;  5KZ6 A;  4PTV A;  4CU6 A;  4DUV A;  4JFT A;  2ZUV A;  2J62 A;  1WDQ A;  2BXY A;  2JAL A;  5BXS A;  1JZ2 A;  2IXV A;  4AD4 A;  1TUX A;  3NCO A;  4F9D A;  5I23 A;  1EHN A;  3W81 A;  1JGI A;  5GNX A;  1I1W A;  1C93 A;  4W85 A;  4WK9 A;  3WD1 A;  1M03 A;  4TVD A;  4EK7 A;  3TTS A;  4F8X A;  2YKK A;  4WJX A;  3KZS A;  1KB3 A;  3WQ8 A;  2DSV A;  4H8H A;  2GVY A;  3SCR A;  2WCS A;  4MJ4 A;  4HMD A;  4FLS A;  2WMJ A;  1DP0 A;  3BAX A;  1KR0 A;  5A6K A;  3AZR A;  1CXE A;  2O9O A;  2C8N A;  4XB3 A;  2VRJ A;  2YL9 A;  4X0N A;  1UWS A;  3GZA A;  1E5N A;  4XZW A;  1U2Y A;  1UD6 A;  4GQQ A;  1XD0 A;  1V6X A;  3SCV A;  1Q6E A;  4M1R A;  3RDK A;  1L0P A;  4W7V A;  4J28 A;  1GQK A;  6A3H A;  1E6Q M;  4ZE5 A;  5CGT A;  1ZS2 A;  1TR1 A;  1UR2 A;  4A4A A;  3I3B A;  1JZ7 A;  3WFZ A;  1WDS A;  4U5K A;  1D2K A;  3M7S A;  1S46 A;  2AMG A;  5DF0 A;  3ZST A;  2DT2 A;  1QW8 A;  2DSZ A;  3QOK A;  3TOP A;  4ATD A;  5IHR A;  4P8U A;  1XSJ A;  2WVV A;  4CU8 A;  2VRQ A;  1GQI A;  1B3Z A;  4GO9 A; 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