1GHSA

The three-dimensional structures of two plant beta-glucan endohydrolases with distinct substrate specificities
Total Genus 100

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
306
structure length
306
Chain Sequence
IGVCYGVIGNNLPSRSDVVQLYRSKGINGMRIYFADGQALSALRNSGIGLILDIGNDQLANIAASTSNAASWVQNNVRPYYPAVNIKYIAAGNEVQGGATQSILPAMRNLNAALSAAGLGAIKVSTSIRFDEVANSFPPSAGVFKNAYMTDVARLLASTGAPLLANVYPYFAYRDNPGSISLNYATFQPGTTVRDQNNGLTYTSLFDAMVDAVYAALEKAGAPAVKVVVSESGWPSAGGFAASAGNARTYNQGLINHVGGGTPKKREALETYIFAMFNENQKTGDATERSFGLFNPDKSPAYNIQF
5010015020025030030025020015010050
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH1 (15-25)S1 (2-4)S2 (29-32)EMPTYS11 (227-232)S13 (275-277)TIV1 (9-12)TIV9 (279-282)O1 (34-36)TII1 (43-46)S3 (49-53)S5 (123-129)S8 (163-166)TVIa1 (80-83)3H1 (56-58)S4 (85-93)AH3 (59-64)AH4 (66-77)AH5 (103-117)TI2 (78-81)TI1 (77-80)TIV2 (81-84)TIV4 (92-95)3H2 (98-102)TI3 (119-122)AH6 (147-159)3H3 (130-132)S6 (133-134)S7 (143-144)3H4 (139-141)TIV6 (136-139)TIV8 (195-198)AH9 (205-220)AH7 (169-176)TII2 (239-242)TIV7 (176-179)TI4 (177-180)AH8 (182-186)S10 (201-202)S9 (193-194)TI6 (222-225)S12 (271-273)AH10 (244-256)3H5 (258-260)TVIII2 (263-266)TI7 (262-265)S14 (292-295)3H6 (286-289)TIV10 (300-303)S15 (299-300)TI8 (295-298)AH2 (37-43)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Hordeum vulgare
publication title Three-dimensional structures of two plant beta-glucan endohydrolases with distinct substrate specificities.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 1,3-BETA-GLUCANASE
total genus 100
structure length 306
sequence length 306
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.39: Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase.
pdb deposition date 1993-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00332 Glyco_hydro_17 Glycosyl hydrolases family 17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ghsA00
3II1A 4H8UA 3VMPA 1CENA 4OBRA 3UG3A 3ARYA 2FH6A 1E71M 1OGSA 3UCQA 2QPSA 1K9FA 2J8GA 3THDA 3ZR5A 2J7HA 3VGHA 2CYGA 1IV8A 3GXDA 4LQ1A 2VURA 4PMVA 4HOZA 1V0KA 1JF6A 4GZEA 3CHEA 2WPGA 5C71A 1NH6A 3CZGA 2OWXA 4AIOA 3MANA 2YOCA 3MMUA 4J3TA 3VU2A 5IFTA 1Q6GA 3LPFA 3A47A 1B3XA 2PB1A 1V6XA 1F4HA 2ZXAA 4AD1A 2ESCA 3UEQA 4D72A 4PTXA 5CLWA 3EDJA 3GH7A 4HZ6A 2ZUVA 4W7UA 3VKKA 3SCPA 2FHCA 2DIJA 2WCAA 3WDPP 2GVYA 4GQRA 3VGEA 3WEZA 5M5DA 3K46A 1UWTA 3BSHA 1UWIA 1JZ5A 4U5IA 4J3XA 1JD9A 2ZUUA 3ALFA 2WB5A 2FHBA 4IPLA 2MANA 4KH2A 8A3HA 4WIWA 4AISA 4AW7A 1LG2A 4KRTA 1KGUA 3VX0A 4KWUA 4FF5A 4JFWA 4CU7A 4AEFA 4W8LA 1OD0A 3RM4A 1FA2A 3AQUA 4AZGA 1BAGA 3SCWA 3BAYA 3PHAA 1CGXA 1H11A 1KBKA 5ABGA 3W82A 3EDKA 3B8SA 3NIYA 3GH4A 5ABEA 1UZ1A 1PX4A 1SR0A 1FP8A 3WNKA 1JAEA 4TOQA 3EDDA 3VIGA 3OZOA 1HJWA 4B3KA 4PMXA 1QHOA 4D1JA 2WVVA 3UESA 2CNCA 2OYKA 3MV01 5CPQA 3WF4A 3WDHA 2G4FA 1W1PA 3WL1A 1BFNA 1LL4A 4UNIA 3UR7A 1VB9A 2GK1A 3L4UA 6CGTA 3PTKA 1I75A 2Y5EA 1HXJA 4CCEA 3G6MA 3MS8A 4ACYA 3CHCA 3O6AA 1DP0A 3IAPA 4UOJA 4ACZB 3CZ8A 1QHPA 1LQ0A 1W1YA 4RE3A 2BFGA 1QBBA 1WZAA 4QLKA 1WZKA 5E09A 2EPKX 3RM9A 3DHUA 1NOFA 2OSXA 2YIHA 3NSMA 4WLCA 4HPHA 1X1NA 5ABFA 1EXPA 3M7SA 2ZUMA 3VO0A 1JXJA 3VD5A 2DH3A 3W53A 1JZ3A 2XYLA 2WC4A 1OD8A 2FGZA 4UFKA 2WZEA 2WKLA 4F79A 4M81A 2XFFA 3L2LA 3WBAA 2EPLX 4J3UA 1V03A 1FHDA 3GXMA 4PTVA 2WK2A 4U33A 4W5UA 3AMGA 4BZYA 3AXXA 4B3LA 1MVYA 4H8HA 3ZIZA 2YL9A 3RJYA 3EMZA 5A8PA 2Y2WA 2VI0A 1JFXA 3TTQA 5A95A 3ZM8A 5HBFA 1TA3B 3A4AA 1JYNA 4Z2KA 2E9BA 1J10A 1V08A 3W26A 1XH0A 1GUVA 4F9JA 4QCFA 1BVZA 3SIMA 2XUCA 2C7FA 2W66A 3VINA 5A2CA 4P7NA 1CXKA 4ATLA 3ARSA 3AZRA 2WSPA 3AHVA 2PC8A 4QCEA 1XYZA 3CUGA 1J0YA 4PMYA 1HNYA 2BY3A 1XRVA 1WAWA 4HTYA 3VUPA 4YHEA 1L0PA 1YHTA 5JBEA 3FAWA 5DFAA 1GQKA 2A3HA 3WQ6A 2XGBA 1IT0A 1MW3A 4U3AA 1PZ2A 4JL2A 1GOMA 4DWSD 2QMJA 3WMSA 2XVNA 3AFBA 1XCWA 2CHNA 1W3KA 2JALA 4D6CA 2X0YA 1MQPA 3I3EA 3AZTA 2E0PA 2W67A 1JGIA 4JZ5A 1DEDA 3WUBA 4C7FA 4ZE4A 1QNOA 1KWGA 3MUZ1 2UY5A 2IXUA 1J9YA 1WDPA 3N17A 1I1XA 5CG0A 3POCA 1CLVA 1M03A 3L2MA 3W24A 3SUUA 2XVPA 4MDPA 1R8LA 4CVWA 3BLPX 2D2OA 2VL4A 1LWHA 1W2VA 1XYFA 3SCNA 4W8BA 4UQBA 1H09A 1CYGA 1KFWA 3NCOA 4P8XA 1UKPA 1KBBA 1VAHA 4H7VA 3CUHA 2PWFA 3W29A 1H1NA 4KGLA 4HMCA 5I78A 5A1AA 4LPCA 2D1ZA 5I0DA 1EH9A 2W63A 5ABHA 4E2OA 1EQCA 1E40A 2E40A 3DHPA 4J3VA 2GJXB 2YDRA 4UOQA 5GQBA 1AQ0A 3U7BA 1VJSA 3FN9A 4PN2A 2OWWA 5DT7A 1LF1A 3SCTA 2IUZA 3AMLA 5FL1A 3EBVA 1GQJA 1HVXA 2VZSA 1UG6A 4PSPA 4PTMA 3IAQA 5HXMA 4WJXA 4UQ9A 4XUYA 4BA0A 4WSJA 3L4WA 1HKKA 2DSKA 4DM2A 2ZIDA 1S46A 1VRXA 2J7CA 3N13A 1MQQA 1BVNP 2O9OA 3CMGA 5JBFA 2O9PA 4M82A 5DMYA 1B3ZA 5BRQA 2WW5A 3PZ9A 4CD8A 1CXLA 1XGZA 4PBGA 4UFJA 2BHUA 3CUJA 1OBAA 1W9PA 3AIVA 2WCSA 2J7FA 5AYIA 2JIWA 1NWTA 1UUQA 3BAIA 1EDQA 2PI6A 1K9DA 3SEPA 3ARQA 1I1WA 1CGYA 1K6AA 4U31A 4E4PA 4JKMA 3AHTA 5EBAA 2YA2A 2BVDA 1OWQA 1MW1A 2Y24A 1QI5A 3BAJA 4UCFA 1UKQA 3CZJA 1E9LA 1A47A 1ISWA 4TVDA 4MJ2A 5A6BA 4WSKA 5E0FA 3VM5A 1QW9A 3KZSA 1HKMA 2VT0A 1KGWA 4LYPA 2YBTA 1ZBCA 1QI3A 1E1EA 2VJXA 1E0VA 5TD4A 4J3SA 5CJ5A 3RM8A 1NP0A 1HX0A 3GXIA 1OSEA 1E6XM 5D9NA 4J7RA 2F2HA 2ZX7A 1KGXA 3VIMA 1UD5A 3WBEA 1HKIA 1JYWA 4TXEA 1KCKA 4YN5A 2DH2A 1CDGA 1XHGA 2WKGA 5A6KA 2XVKA 5I6SA 4BQ3A 4RE4A 2JEQA 3ARWA 1JDDA 1PIFA 4AZHA 3SUTA 3ZR6A 1PIGA 4R5EA 2W5FA 3FAXA 2VQUA 1MW2A 5FCZA 2W62A 3VX1A 4CD7A 3CGTA 1E72M 4ML4A 2G8ZA 1OT1A 1B3YA 5E9AA 4UTFA 3IANA 4CGTA 4U5KA 3AI0A 3WFLA 2CBJA 3WUFA 1UD3A 4AMCA 3DECA 1VJZA 3AMCA 2WVUA 6TAAA 4TUFA 3WD1A 1CXHA 3GH5A 2OLHA 3KEHA 4F66A 2DT1A 1QNRA 9CGTA 3K4AA 3KL3A 4YPJA 3ZSTA 3CO4A 4AD3A 3ARRA 1ITCA 3KL5A 3RO8A 3W4RA 1E5NA 2E8ZA 4M56A 1O6IA 3AHZA 1H0GA 3EMQA 1JZ8A 1GORA 4HZ8A 3PZVA 3WN6A 2UY4A 1Q6EA 1MXGA 4H41A 4CN1A 3N15A 1PPIA 3CPUA 3WDRA 3B9AA 1GW1A 2VRQA 2G41A 1VF8A 2YLAA 4CUCA 1KXVA 1PX8A 3TA9A 1UZ4A 4HU0A 2GJXA 2YDQA 2G3MA 2NSXA 5I23A 1KWKA 4D6IA 3POHA 2OSWA 3ZMRA 3CZLA 2UWFA 3WNMA 1PX3A 4X9YA 2ZUWA 3WY1A 1V0NA 4IISA 1CGWA 3AXHA 4A3HA 5CLTA 5I77A 1ISVA 3WFZA 1V3LA 1TR1A 5A8OA 3T09A 2GK1B 3UR8A 3IK2A 1MYRA 4NF7A 3WNNA 5E6ZA 3SCUA 1BLIA 1GOOA 1B31A 2X09A 3ZQ9A 1DWJM 1B30A 4PMRA 2J7GA 4Z2GA 3AS2A 3GM8A 5BWFA 4OOUA 3PZQA 3TTSA 2CPUA 5JUVA 1TZ7A 2WHMA 4P7QA 5GNXA 3OLIA 4A3YA 5ABFB 3KL0A 4QAWA 5A2BA 4AD5A 1XH1A 5D9MA 3RCNA 2CITA 2YKKA 4W89A 1JD7A 4D6DA 1WDQA 2XGIA 4MAZA 4D6HA 4CN4A 3FHAA 3E1F1 5KEZA 3WF3A 4F8XA 1WO2A 2DQXA 1J01A 5LA2A 3ZJKA 3HJEA 2OYMA 4MB3A 2VVSA 2XFRA 3F5KA 1HVQA 3AHYA 5EFFA 3RILA 1R86A 1M53A 2Z1KA 5AYBA 3AS0A 4EANA 3VGBA 1PAMA 1LWJA 1SFSA 3AZSA 2WANA 3OB8A 5M3WA 2AMGA 2W92A 1AQMA 1FH7A 3HMCA 1B3WA 2XWEA 1FH8A 1E6NA 4OKDA 1EA9C 2WWCA 4R27A 1TG7A 1H4PA 2Q8XA 4PMOA 3N1AA 3CIVA 1BYDA 1V3MA 1CBGA 2CCRA 2ZXQA 1E4MM 4ATWA 3EMCA 5BXTA 2W61A 4UFMA 2G3IA 4AC1X 1J0ZA 4CD5A 1Q6FA 1UR4A 3VDHA 2YL5A 4Z2HA 1BF2A 1HP4A 4JCMA 3WEMA 3T0BA 1UWQA 1JI1A 3QHMA 1DTUA 3LPPA 3NSXA 1H0IA 1JG9A 1R87A 4JFUA 2GJPA 1ESWA 1UD2A 2J7EA 1NOWA 1CEOA 3N12A 1HKJA 1ZB5A 4B16A 2GJRA 2Y8KA 4OUEA 5IFPA 3AOFA 3TOPA 2RGMA 8CGTA 1W2PA 2DT0A 2DSZA 1WDSA 5DF0A 4JKLA 3CHDA 4M80A 2V5CA 2HISA 2CERA 3VNYA 2WZHA 4ZEPA 3SCOA 5I2UA 3WUEA 5A6BD 1XSIA 1XH2A 3AIRA 2WAGA 2VTFA 1W91A 5HDRA 2J8FA 2VX5A 3IJ7A 3A4XA 3WQ4A 4M29A 3ECQA 4C7DA 1UKSA 2E9LA 1U2YA 3M6DA 1WNOA 2D23A 4HA3A 3WNOA 2CETA 1XCXA 1C91A 5A6MA 3NYDA 7CGTA 2WM0A 2WCGA 2X0HA 1QI0A 3ZJ7A 2AAAA 1ZBWA 4E8CA 1OGGA 3WIJA 2ZWZA 1H41A 1UR8A 2ZXBA 4P8VA 3OBAA 4JKKA 2BVTA 3K4DA 2IXVA 3VPLA 1MFUA 2YA1A 3W27A 1KXQA 1W3LA 2VCCA 3AJ7A 1O7AA 2VCBA 3VILA 1TMQA 4GINA 4HA1A 4CU6A 2EPMX 2E9MA 4P7OA 1WZLA 1UR9A 2WMHA 2XHYA 3MMWA 4AZIA 5AC4A 1KXHA 1QI2A 4C7GA 3PZIA 4JIEA 4S3KA 1UOKA 5A6AA 2DPEA 4GI8A 1UKOA 4PMQA 3AYSA 1QNSA 2EO7A 1W9BM 2ZWYA 1EOMA 5FKYA 4AIEA 1B1YA 3PZNA 2XM1A 2CBUA 4PMDA 2WMGA 1VEMA 2WC7A 3K8MA 3VVGA 4TVUA 4UFIA 4P8UA 4FK9A 2G3JA 3FHQA 2JF6A 1E6SM 3O9NA 1GONA 2J7BA 1U33A 4HPGA 1C7TA 3HU7A 1V02A 3PN8A 4GQQA 1YQ2A 1HJSA 5HPOA 2TAAA 3G6LA 3OA5A 2QPUA 4JHZA 2DSUA 5JBDA 4DM1A 2YL6A 4M24A 2FDMA 3WUGA 3UG4A 3WD3A 1UD6A 1G9HA 1JNEA 2VZOA 4MNMA 3CH9A 1B90A 4W88A 4QLJA 4UR9A 1M7XA 3BLKA 3GNPA 3LMYA 3VDBA 4PYSA 1OT2A 1OB0A 1UHVA 2GUYA 3T08A 3OLEA 3DYMA 5ECUA 5JIWA 3BGAA 4FLOA 2VR5A 4J28A 1EIBA 4EE9A 4BCEA 2ZUNA 1ITXA 1V0LA 2XJ7A 1KB3A 4Z2JA 4UOZA 1Y7VA 4PRWA 1EDGA 4KGJA 2EJ1A 1XD1A 1BYBA 1JZ6A 4W85A 3BCDA 3B9DA 3THCA 4WK9A 2WLZA 1V0MA 2XFYA 3VTRA 4LX4A 2FHFA 2PWDA 1VBUA 2EBNA 2FGLA 2YDSA 5HPCA 1VENA 1JYXA 4GZJA 3OZPA 3VDCA 4GI9A 3WEOA 2JIEA 1W9UA 2WZIA 2W4XA 3ALGA 3AS1A 3WQVA 1RP9A 4W84A 3VIHA 1C8XA 1TCMA 1BGAA 1UD4A 2GDUA 1HJUA 1NWRA 1JIBA 2J62A 3W28A 3RMEA 1H3GA 5GNYA 3NJ3A 2CXGA 3AIUA 3HN3A 1OCQA 4MTVA 1W9VA 1V6UA 1SMDA 3L4ZA 1F4AA 1PZ3A 3ZSSA 2A3BA 5DO8A 4MPKA 1XV8A 1QOXA 1B2YA 4L4PA 1MFVA 3TP4A 1E6ZA 5CGTA 1K9EA 1HT6A 2D3NA 5DEZA 3ZT7A 3ZOAA 2VUYA 2EPOA 5HNNA 2J79A 4D71A 3NSNA 3QOKA 2WWDA 4N0RA 1BQCA 1J12A 3CUIA 5BCAA 4UQCA 5BXRA 5IHSA 4MB5A 2EQDA 4DUVA 1E3ZA 2Z1SA 3AS3A 2CESA 3VM7A 1GOIA 1JZ4A 3FNDA 1CTNA 2X8RA 1W3HA 1E0XA 1V6WA 3BAXA 1GJWA 3QHNA 1WE5A 3ARVA 2QHAA 2DSWA 3D3AA 3BMVA 1RH9A 2DSVA 4AIUA 1UD8A 4M1RA 3MU7A 4HP5A 1BTCA 4AEEA 3VD4A 4FMVA 3SCRA 2YA0A 4NSBA 2F61A 3GBEA 2ZX6A 1JFHA 1LLOA 1OM0A 1SMAA 3W38A 5FIPA 1NM9A 1VFFA 3WD0A 4V28A 1W32A 3PTQA 4PUDA 1UKTA 5A6LA 4NRRA 5A6SA 5A2AA 2WBKA 3KE0A 1LL6A 4U2YA 4MB1A 4NRSA 4GPNA 1PBGA 3SURA 5A8QA 2BV9A 3S6TA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3II1 A;  4H8U A;  3VMP A;  1CEN A;  4OBR A;  3UG3 A;  3ARY A;  2FH6 A;  1E71 M;  1OGS A;  3UCQ A;  2QPS A;  1K9F A;  2J8G A;  3THD A;  3ZR5 A;  2J7H A;  3VGH A;  2CYG A;  1IV8 A;  3GXD A;  4LQ1 A;  2VUR A;  4PMV A;  4HOZ A;  1V0K A;  1JF6 A;  4GZE A;  3CHE A;  2WPG A;  5C71 A;  1NH6 A;  3CZG A;  2OWX A;  4AIO A;  3MAN A;  2YOC A;  3MMU A;  4J3T A;  3VU2 A;  5IFT A;  1Q6G A;  3LPF A;  3A47 A;  1B3X A;  2PB1 A;  1V6X A;  1F4H A;  2ZXA A;  4AD1 A;  2ESC A;  3UEQ A;  4D72 A;  4PTX A;  5CLW A;  3EDJ A;  3GH7 A;  4HZ6 A;  2ZUV A;  4W7U A;  3VKK A;  3SCP A;  2FHC A;  2DIJ A;  2WCA A;  3WDP P;  2GVY A;  4GQR A;  3VGE A;  3WEZ A;  5M5D A;  3K46 A;  1UWT A;  3BSH A;  1UWI A;  1JZ5 A;  4U5I A;  4J3X A;  1JD9 A;  2ZUU A;  3ALF A;  2WB5 A;  2FHB A;  4IPL A;  2MAN A;  4KH2 A;  8A3H A;  4WIW A;  4AIS A;  4AW7 A;  1LG2 A;  4KRT A;  1KGU A;  3VX0 A;  4KWU A;  4FF5 A;  4JFW A;  4CU7 A;  4AEF A;  4W8L A;  1OD0 A;  3RM4 A;  1FA2 A;  3AQU A;  4AZG A;  1BAG A;  3SCW A;  3BAY A;  3PHA A;  1CGX A;  1H11 A;  1KBK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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