1GOKA

Thermostable xylanase i from thermoascus aurantiacus- crystal form ii
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
EAAQSVDQLIKARGKVYFGVATDQNRLTTGKNAAIIQADFGQVTPENSMKWDATEPSQGNFNFAGADYLVNWAQQNGKLIRGHTLVWHSQLPSWVSSITDKNTLTNVMKNHITTLMTRYKGKIRAWDVVNEAFNEDGSLRQTVFLNVIGEDYIPIAFQTARAADPNAKLYINDYNLDSASYPKTQAIVNRVKQWRAAGVPIDGIGSQTHLSAGQGAGVLQALPLLASAGTPEVAITELDVAGASPTDYVNVVNACLNVQSCVGITVWGVADPDSWRASTTPLLFDGNFNPKPAYNAIVQDLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
publication title Substrate Specificity and Subsite Mobility in T. Aurantiacus Xylanase 10A
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-XYLANASE
total genus 127
structure length 302
sequence length 302
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2001-10-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1gokA00
4URIA 5ABGA 2PBGA 1JYVA 1W9PA 4B15A 3PN8A 4PEEA 2W5FA 4HP5A 2GVYA 2Z1KA 4AEFA 2J25A 3T2QA 3BSHA 5BXPA 5A95A 1HKMA 2WMIB 1NWRA 1V0MA 1NM9A 2J74A 3NSXA 2VVSA 5AYIA 3N1AA 1UG6A 3CHCA 4W7WA 3W38A 2JIEA 5I79A 3T09A 1HJSA 1WB0A 3W26A 4Q22A 8CGTA 2WC7A 3DYMA 3WQVA 3ZMRA 1B3WA 4J27A 1OT2A 3RM4A 3NIYA 4CU6A 1IZKA 3PBGA 1CNVA 2NT1A 3GH7A 3AMCA 4PMNA 1LLOA 2O9TA 3RO8A 2XHYA 1JD9A 5DF0A 3WEOA 1E70M 1ZBKA 2UY3A 2VRKA 1NWTA 3GTNA 3WL0A 2XVNA 1W1TA 3UG4A 1W2PA 4HMEA 2CBUA 2FHFA 4HPHA 2F2HA 3L4UA 1UD3A 4D6EA 5E0CA 3NCOA 3D3AA 3S2CA 3RM9A 2DT3A 4CD4A 2NSXA 4W8BA 2WC4A 2VRJA 3ZSTA 1A3HA 3AFBA 1BFNA 1Z32X 4UFMA 3L2MA 1B3VA 2VR4A 3IAQA 4F9DA 2CITA 3WH5A 1KGXA 1PX3A 1DWHM 4J3SA 1HKIA 2XM2A 2EQDA 4QAWA 1J10A 4YPJA 1C7TA 2E9BA 1EA9C 1J9YA 1VF8A 3ARXA 2EJ1A 1IT0A 1V3KA 4JHZA 1JL8A 5E09A 3OZOA 3W28A 1B31A 2OSXA 4NI3A 1GNXA 1AQHA 4UQAA 3D5HA 3RCNA 2BXZA 2VX4A 4M1RA 2X0YA 4PSRA 2VVNA 4DWSD 1LL7A 4PCTA 1MW1A 2XIBA 2X1IA 2W91A 3OA5A 2GJRA 3AMKA 5A8QA 3WD4A 2E3ZA 2WVTA 3EDEA 1HIZA 3B9AA 1UWIA 2NT0A 4W88A 2O9OA 3VIFA 5ABFB 4Y7EA 1GONA 3WD3A 2WLZA 1TA3B 3WFLA 1VBUA 5LA1A 4H8UA 3L4VA 1EHAA 2F61A 3GH5A 4BA0A 3BAWA 5AY7A 1E4MM 1HJQA 3CUIA 3AZTA 3WH9A 1WZKA 5D9PA 4W5UA 1UHVA 2RGMA 3WD1A 2O9PA 1E6RA 1QOXA 4NRRA 3VNYA 4AZCA 4HZ7A 1CXEA 5FIPA 1CGWA 4QCFA 3L4XA 5CXPA 4CD5A 1QI4A 2XFFA 1KR1A 2WPGA 3VOCA 1FP8A 3ZM8A 5CGTA 1VFOA 1E56A 1UD8A 2ZXAA 4WF7A 1BYDA 2CERA 4Z2LA 1B0IA 1HN1A 3I3BA 2BXYA 3BAIA 5IFPA 3SCRA 3AIEA 1JI1A 3G6LA 3AS1A 4GI6A 1GVYA 1UR4A 3SCOA 3ZR5A 1QVBA 2WMGA 3NSMA 2O92A 1GZJA 3FY1A 1MQQA 2V5CA 4PRWA 3VIHA 4Q7NA 4KRUA 1HP5A 5DT7A 1BYAA 1K6AA 2EPMX 2VQTA 5CJ5A 3T0AA 3U7BA 3NUKA 1W1VA 4AWEA 4CN1A 2D23A 2BY0A 2JFEX 2DGAA 2DSKA 2WC3A 1NH6A 2EEXA 4KRTA 3N11A 4MAZA 1KQYA 3WIJA 3AZSA 5BXSA 4M82A 2QF8A 1PIGA 2WMFA 3KWXA 4DUVA 3AS0A 1C8YA 3MUY1 4M29A 3N04A 3ARPA 4H8HA 3N9KA 4MTVA 1E71M 3VD4A 1MYRA 2E8YA 3BLKA 1GHSA 4FLOA 4YHEA 1AMYA 4IUGA 1BVZA 1JXJA 3SURA 1KXHA 1FFQA 1M53A 1I1WA 5DO8A 4JIEA 3KE0A 2XJ7A 4HOZA 3GNPA 3FAWA 3J7HA 5D4YA 2VUYA 1W91A 2WWCA 5CPSA 1JAKA 3K1DA 1UR9A 3A47A 3MV11 1QHPA 1W9BM 4JCLA 1VAHA 3FHAA 3GNOA 3WMCA 2AMGA 3AXIA 3OG2A 3AHXA 4L4OA 3BLPX 2UY5A 1C7SA 2VZOA 5BROA 2BVDA 4CD7A 1DWIM 2J7FA 3KL0A 4CN6A 4K68A 5BXRA 4AZHA 1WDPA 2WKLA 3OIHA 1QI5A 1VRXA 2FDMA 3FHQA 4WLCA 1K9EA 2EPNA 3PZVA 1KBKA 2ZX6A 5EBAA 5BRPA 1XC6A 1EQCA 4Z2IA 2WWDA 3AQUA 4XUYA 3VMPA 1ISYA 3A4WA 1JIBA 1MW3A 4UOZA 1PJ9A 1HJXA 3ARVA 2G3JA 3AISA 3FNDA 3RDKA 2IXUA 1KWGA 2Y24A 1X6LA 3AJ7A 1JFHA 3K4DA 3U7VA 1V02A 1HKJA 3DHUA 3UETA 3I3EA 1JZ8A 3F5JA 3VIPA 6A3HA 1ZS2A 1GQJA 4AD2A 1CEOA 3VIGA 1C8XA 2HISA 5IFTA 3CTTA 4V27A 1V6UA 3MMDA 2BY2A 3DYOA 1XCXA 2X09A 4U5IA 1BAGA 3N18A 4W86A 1CZ1A 4D6CA 1MW2A 2D3NA 1HX0A 4OBSA 3SCQA 3WQ5A 1AVAA 4UZUA 4ZFMA 3WN6A 4GQRA 3BAJA 4AIOA 3WQ8A 4MB1A 4CKQA 1JYWA 4JFTA 4MAVA 2B31A 4HMDA 3A4AA 3ECQA 4UZSA 3WSUA 3WNMA 4TUFA 3RJXA 7CGTA 3A6OA 2E8ZA 2E0PA 1B9ZA 4AXNA 4PN2A 2CIPA 4R27A 1SR0A 1BLIA 4C7FA 1AQ0A 4AD0A 3BAXA 2ESCA 2BY1A 3DYPA 1G9HA 2XGBA 3VIKA 2XVGA 4D1JA 4A4AA 4W93A 1SMDA 2OYKA 3WDJA 3BCFA 2G8ZA 3L4WA 1D7FA 2FHBA 1TUXA 5DT5A 3WDPP 1HT6A 1ESWA 2J8FA 2WMIA 3WKZA 5A1AA 4H04A 3N12A 1VBRA 1ODZA 3F5LA 4L4PA 3O2LA 3BXWA 1DWGM 1PBGA 6TAAA 2ZUUA 1VFMA 4UCFA 1B30A 2FH8A 3AICA 4WIWA 3VMNA 1QNQA 4JHOA 1XCWA 3E1F1 1FH7A 3CUFA 1WKYA 2ZUTA 1CDGA 1V6YA 1FH9A 4M80A 1UQYA 2VZUA 4W5ZA 4HA3A 1KCKA 3GXFA 3VIOA 4GO8A 2ZOXA 1G1YA 3IK2A 4HA4A 1KWKA 5I5RA 5DMYA 1HJWA 2GK1B 1QBBA 4PMRA 4CGTA 2ZXBA 4P7NA 1GQKA 2J47A 4AD1A 2FHCA 1GVIA 3SCTA 3MANA 3MSGA 3GBEA 4UOJA 2GFTA 4J7RA 5M03A 3ARQA 3VPLA 1KXVA 4MNLA 1GOKA 3SUUA 3VM5A 1AQMA 5CPQA 3DC0A 3GXMA 3WUFA 4GO9A 2PWGA 1QW8A 3B9DA 1KFWA 3BC9A 4CCEA 1ISXA 1HKKA 5HBFA 4ML4A 3T08A 3AS2A 3PZQA 4LYQA 4TVDA 2W61A 4RL3A 3AOFA 3CBWA 3HN3A 2VTFA 4E8CA 4CUCA 4HPGA 5A2AA 4LX4A 2G41A 1TCMA 2EBNA 4TX8A 3WF1A 4CD6A 1CGTA 1BGGA 3WQ6A 1BVNP 3CZJA 2VOTA 3EDKA 4ATLA 4W7VA 2QHAA 1HJVA 2OWWA 4E2OA 4JKMA 1O7AA 2D24A 1PAMA 5CSUA 3VD5A 1PZ3A 3M6DA 1UWQA 3T0DA 3POHA 3RJYA 1Q4NX 8A3HA 1E4NA 1FHLA 3TTOA 1RP9A 3AIQA 1MXDA 4AW7A 2W4XA 5ABFA 1VB9A 1TA3A 1JD7A 2XVKA 5HNNA 2VJXA 1PX4A 3WEZA 4OZOA 2DSUA 4AEEA 2XPKA 3WF0A 1C92A 3PZTA 2YOCA 1GOIA 4MNKA 1K9TA 1N82A 2V38A 3QHOA 2WW5A 1ECEA 3VD9A 3SCNA 3SUWA 4JL1A 3DHPA 1E9LA 2GUYA 1CXLA 1E6ZA 1UWSA 5E0FA 4UTFA 4KMQA 4NF7A 3RIKA 3WQ4A 3WEMA 5JIWA 1CENA 2XIIA 2XFRA 2VQUA 4PMOA 4AYSA 4ATDA 2WB5A 4PMUA 1G5AA 1CXIA 3W0KA 1OT1A 5GNXA 4PMDA 4J3XA 4JFUA 1QPKA 3OGSA 1WZAA 4PTMA 1CXHA 1W3JA 2VR5A 1XHGA 2WCAA 2CHNA 3VIIA 2QV4A 3A3HA 3VINA 1YQ2A 5CLTA 1K9FA 4NRSA 5HPOA 1EGZA 3RPMA 1UWTA 1GHRA 2MANA 1B3ZA 2XUCA 1BSIA 3GBDA 3F4VA 1XV8A 1NWSA 5A69A 1JG9A 2Y8KA 4DM1A 2E4TA 2YBUA 5BRQA 2W67A 4E8DA 1DEDA 2DH2A 3WD0A 3ZT7A 2XVPA 4ZXOA 2ZE0A 4D1IA 3ZOAA 3EBVA 1DP0A 1U30A 1IZJA 2WMJA 3AIWA 1H1NA 1C3FA 3M07A 3IJ7A 4UQDA 3U57A 4OOZA 2W63A 2WHJA 2D0FA 1XSJA 4PTWA 4FK9A 4EANA 1J0ZA 1V6WA 4HMCA 3ZJ7A 5A6SA 1JF6A 4PBGA 2WMKA 1MQPA 3KL3A 3QGVA 4GZEA 1E3ZA 1UYQA 1UH3A 4XB3A 1HF6A 1FOBA 1X1NA 1OIFA 1E43A 1UH4A 1V6VA 1GORA 4OIFA 1E5NA 2CBJA 2OSWA 4JFVA 4QLKA 2AOSA 4WKHA 1ISZA 2VC9A 3WDHA 2BHUA 4UFJA 4M81A 2WVSA 3CO4A 1UD6A 1OB0A 2A3HA 3K8KA 1HL8A 3OBAA 4M24A 3AZRA 1US2A 3WFZA 3ALGA 2VCBA 3O9NA 3PZMA 1J0KA 2DPEA 4U33A 2J8GA 2GJXB 2QLYA 1XYFA 2PWFA 3O6AA 3MUIA 2Q8XA 4RE4A 3IJ9A 1FH8A 2WLYA 1JAEA 3AMGA 2VI0A 2XSAA 1TE1A 1U33A 4U3CA 5M17A 3MUZ1 1R85A 2CETA 2WAGA 2XGIA 3T2OA 4PUEA 3TA9A 1WAWA 1H5VA 1LWHA 1DWFM 4Z2KA 2D0HA 2WYSA 2VZVA 2X05A 5ABHA 4EE9A 4R5EA 4JAWA 2EXOA 4WJXA 2D2OA 2WVVB 4W8LA 4EKJA 3VDCA 4FLSA 1XRVA 1BTCA 1ISVA 4AY1A 1KBBA 4PTXA 4DWSA 3BH4A 2BV9A 1OWQA 4MJ2A 1ODUA 1ZBVA 1VEPA 1UD4A 1VJZA 1OBAA 4RE3A 1ITCA 4MB3A 4B3LA 2DQXA 3L2LA 4GPNA 4OBRA 2ZUVA 4BF7A 1UKQA 5EMYA 2BVTA 3CGTA 2DH3A 4HOXA 1H0IA 2XWDA 3GYCA 5A6AA 1UQZA 1NQ6A 4OUEA 5D9MA 2WZIA 3RILA 1GOMA 3AMLA 4UQCA 3ZJKA 1V3JA 2C0HA 4WKAA 4P8VA 2CNCA 4OJYA 5HDRA 2CEQA 3UCQA 7TAAA 1M04A 4MB4A 1E5JA 4N0RA 3T0BA 1W3KA 5DFAA 1EHNA 4GXPA 1HJUA 4AZIA 1J0YA 3A4XA 3CUJA 2VCCA 3JUGA 3PZGA 4U2YA 1BYCA 2C7FA 2J77A 3WNLA 1DHKA 2WXDM 2ZICA 4HA1A 1G01A 3LMYA 4D6GA 1GOWA 3QOKA 1OM0A 4P7OA 1J12A 5GNZA 1GQLA 1WNOA 1X6NA 3VX1A 3PZNA 4GI8A 4W84A 3U5YA 2BHZA 2OYMA 1WO2A 4IPNB 4W8AA 3VD7A 4B16A 1OGSA 1V03A 2UY2A 2XG9A 1QI0A 1CLXA 3GM8A 2WNWA 5A8PA 1XH1A 5A6JA 1UD2A 1JZ5A 4D6IA 3N17A 5HPCA 4ZE4A 3W53A 1MFVA 4TVCA 4Z2GA 1RD6A 1LL4A 3ARZA 3VIMA 5I24A 3ARRA 3BAKA 3VD3A 1H2JA 3AROA 1OIMA 4HZ8A 2W62A 1FFRA 2GK1A 1KXTA 3GH4A 1VJSA 3EDFA 1WDRA 4PMXA 4TOQA 5LA2A 4OOUA 1R7OA 1CGYA 1V3MA 1E0XA 1JZ4A 1J0IA 2WSPA 3AHVA 3AIVA 2OWCA 2J4GA 3SCWA 1EDGA 2QPUA 1E40A 2ZUWA 2WBKA 3TP4A 4B9ZA 2AAAA 1UKTA 4P7QA 5IDIA 1KGUA 2ZX8A 1EDQA 3VDBA 3OB8A 2PI6A 2CXGA 5C8BB 2GDUA 4GZIA 1E4LA 3EDJA 2PC8A 2E9MA 3NDZA 4GI9A 1QHOA 3AIBA 2PB1A 1VEMA 3AMDA 3CZEA 1MVYA 4UQBA 2IUZA 4U2ZA 3M7SA 1LL6A 3QHMA 2ZWZA 1H49A 3II1A 3B9EA 3I3DA 1EOKA 4HZ6A 3ZJ8A 2CBVA 4P8WA 3AHZA 4C7GA 5IHRA 1NOFA 2XSBA 2YA2A 1ZB5A 1OCQA 4UFHA 4BZYA 3NJ3A 2D20A 3SCPA 2WANA 1O6IA 2UY4A 3MU7A 4JKKA 5CG0A 5FCZA 3CZLA 4J3WA 4QLJA 2VNCA 1NOWA 1M03A 4FMVA 1XD0A 4Z2JA 4D72A 1UZ4A 4N42A 2PBOA 5JBEA 1CWYA 3OLGA 4IISA 1C8QA 3W37A 3MUAA 3WY1A 2W66A 3AHYA 1DWAM 1VFUA 2VRQA 3K4AA 4KGLA 1BQCA 2YA1A 3FN9A 4XX6A 2FGLA 4MNMA 5AC5A 5D8ZA 3W29A 2DSZA 1PIFA 3LPPA 2DEPA 4FLQA 2BFGA 3S6TA 3WD2A 2DDXA 4D6JA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4URI A;  5ABG A;  2PBG A;  1JYV A;  1W9P A;  4B15 A;  3PN8 A;  4PEE A;  2W5F A;  4HP5 A;  2GVY A;  2Z1K A;  4AEF A;  2J25 A;  3T2Q A;  3BSH A;  5BXP A;  5A95 A;  1HKM A;  2WMI B;  1NWR A;  1V0M A;  1NM9 A;  2J74 A;  3NSX A;  2VVS A;  5AYI A;  3N1A A;  1UG6 A;  3CHC A;  4W7W A;  3W38 A;  2JIE A;  5I79 A;  3T09 A;  1HJS A;  1WB0 A;  3W26 A;  4Q22 A;  8CGT A;  2WC7 A;  3DYM A;  3WQV A;  3ZMR A;  1B3W A;  4J27 A;  1OT2 A;  3RM4 A;  3NIY A;  4CU6 A;  1IZK A;  3PBG A;  1CNV A;  2NT1 A;  3GH7 A;  3AMC A;  4PMN A;  1LLO A;  2O9T A;  3RO8 A;  2XHY A;  1JD9 A;  5DF0 A;  3WEO A;  1E70 M;  1ZBK A;  2UY3 A;  2VRK A;  1NWT A;  3GTN A;  3WL0 A;  2XVN A;  1W1T A;  3UG4 A;  1W2P A;  4HME A;  2CBU A;  2FHF A;  4HPH A;  2F2H A;  3L4U A;  1UD3 A;  4D6E A;  5E0C A;  3NCO A;  3D3A A;  3S2C A;  3RM9 A;  2DT3 A;  4CD4 A;  2NSX A;  4W8B A;  2WC4 A;  2VRJ A;  3ZST A;  1A3H A;  3AFB A;  1BFN A;  1Z32 X;  4UFM A;  3L2M A;  1B3V A;  2VR4 A;  3IAQ A;  4F9D A;  2CIT A;  3WH5 A;  1KGX A;  1PX3 A;  1DWH M;  4J3S A;  1HKI A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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