1GOOA

Thermostable xylanase i from thermoascus aurantiacus - cryocooled glycerol complex
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
EAAQSVDQLIKARGKVYFGVATDQNRLTTGKNAAIIQADFGQVTPENSMKWDATEPSQGNFNFAGADYLVNWAQQNGKLIRGHTLVWHSQLPSWVSSITDKNTLTNVMKNHITTLMTRYKGKIRAWDVVNEAFNEDGSLRQTVFLNVIGEDYIPIAFQTARAADPNAKLYINDYNLDSASYPKTQAIVNRVKQWRAAGVPIDGIGSQTHLSAGQGAGVLQALPLLASAGTPEVAITELDVAGASPTDYVNVVNACLNVQSCVGITVWGVADPDSWRASTTPLLFDGNFNPKPAYNAIVQDLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Substrate Specificity and Subsite Mobility in T. Aurantiacus Xylanase 10A
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-XYLANASE
molecule tags Hydrolase
total genus 122
structure length 302
sequence length 302
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2001-10-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1gooA00
3IANA 3WDIA 1U33A 2XVPA 3AIEA 1C8YA 4AYSA 1JZ3A 4H7VA 3W26A 3VGEA 1XSJA 3ZJ8A 2GJRA 3L2MA 1UYQA 5ABHA 1UZ4A 3RILA 3T2QA 5A6SA 4GINA 2YDSA 3FY1A 4QLJA 2A3AA 1GOOA 2G3IA 3VDAA 1IZKA 2ZX9A 1CEOA 4M24A 2RGMA 2XG9A 5A6MA 5BROA 3TA9A 2PWHA 4JIEA 4X0NA 3MUY1 5GNYA 2C8NA 2W92A 3I3DA 4CCDA 2BY3A 4QLLA 1US3A 4EKJA 4D6GA 1BTCA 1H11A 4JKLA 1UWUA 2VX7A 4X0VA 2DSZA 1CENA 2YL8A 1FH8A 5A8OA 1FA2A 1I75A 1SR0A 3WEZA 2YA0A 3VILA 3ARWA 4PUEA 1G0CA 4AZ7A 1OGGA 3MMDA 2ZX6A 4W87A 5A8MA 1V6UA 4W5ZA 2WBKA 4KGJA 4PMVA 1OBAA 3BAYA 5FKYA 1E73M 4W7UA 5A3HA 3VGBA 2DSUA 2E0PA 2NT0A 1C7TA 1Q6CA 4XZWA 2WCGA 2WMIA 4RE4A 3WDRA 5C70A 1GONA 2W67A 1HL9A 2CESA 4D6EA 1WPCA 1PJ9A 5ABGA 3ZT7A 4E2OA 4J3UA 1PZ3A 4AW7A 4AZ5A 4DWSC 1M53A 1H1NA 2V5CA 3AMGA 3GDBA 3W6LA 4CU8A 5DT7A 1BGGA 3AROA 5DT5A 3EDKA 3SUWA 3PTMA 5AC5A 3CH9A 3VVGA 3U5YA 2BVTA 3DHPA 4Z2IA 1PEZA 5JBEA 3EDDA 5I79A 2WSKA 1E15A 1JXKA 2XJ7A 5A6JA 1HVQA 1LQ0A 1GQLA 5FD0A 1H41A 3WF1A 1CDGA 3PBGA 3N11A 4ATLA 1UH3A 3WD3A 3AHTA 2BY2A 2X2YA 1K6AA 2AOSA 3EMQA 4AIOA 1QI4A 3WL0A 2CBUA 1BQCA 4TVUA 4AD1A 2OYKA 7A3HA 5HNNA 5DFAA 1E70M 3RM4A 4HP5A 2VQUA 3VGDA 4RE3A 1CBGA 2J25A 1E56A 1KGXA 3OBAA 4TVCA 2WC4A 3MMWA 1AVAA 4UQDA 5AYBA 2WMKA 4JFTA 1XGZA 3CHFA 4MNJA 2VX6A 3PTQA 3LMYA 3WNMA 1E6NA 1CGYA 3KEHA 3AMCA 2XWEA 1HVXA 3W0KA 5I3DA 2WMHA 4GI6A 2VZVA 3HN3A 4P8WA 2VRJA 3RJXA 1W9DM 1WZLA 2GJPA 4D6JA 1UZ1A 2WHMA 2O9OA 4IM4A 3FNDA 4XX6A 1J01A 2F8QA 2YL9A 3L2LA 1ESWA 1J0ZA 3WL1A 1ISZA 3CHDA 1JGIA 1W9UA 1KGUA 4B15A 4WKHA 3WNOA 1V6VA 4W88A 1NOFA 3W38A 1JF6A 3CZJA 2J78A 1MW0A 4JFUA 5HBFA 4LQ1A 5CSYA 2DH2A 2YA2A 3OZOA 4LX4A 1VFFA 1L8NA 3UR8A 1JIBA 3ARYA 2VT0A 5EB8A 3S2CA 2F2HA 3FAXA 1GNXA 4TTGA 4WSJA 5C8BB 3OIHA 4UFIA 4LYQA 1WB0A 5CXPA 5F7UA 1OM0A 3FXYA 3VD3A 1UWQA 2W63A 4BA0A 1VEOA 1GQIA 4EANA 2XGBA 2ZX5A 2VVNA 2GK1B 3AJ7A 3W81A 3VDHA 1KGWA 4CD8A 3L4TA 4JZ5A 3AFBA 3W25A 1WCGA 5ABFA 2XSBA 1B2YA 1PPIA 1ITCA 4AD2A 3TOPA 1LL6A 2E4TA 1J0JA 1MW1A 3CUFA 4DUWA 2FH8A 1V0MA 3E1F1 3UESA 3GXIA 1TMQA 4MTVA 3WFLA 4XUYA 3ZJ6A 1D7FA 2VQTA 5A6KA 1F4HA 2JEQA 3AIBA 1EGZA 3PZIA 4LYPA 1EDTA 1XC6A 1H0IA 1LJYA 2JIWA 5CJ5A 4KRUA 3W27A 1EHNA 4KRTA 3AS1A 1V02A 4J7RA 5M17A 4ZXLA 4F9DA 1NP2A 4PMYA 1W32A 2DSKA 3OLGA 2GUYA 1SYTA 2EJ1A 2WLZA 4HU8A 3EDFA 1BVZA 1UQYA 2WAGA 3CHEA 3WD1A 4HPGA 4J3WA 4TVDA 1XV8A 3VDBA 2XFFA 4MB5A 2D22A 2W61A 4D6CA 3WQVA 4H41A 2J7HA 4Q7NA 4GI9A 1W1TA 1XRVA 3DYOA 2OSXA 2CEQA 4FMVA 1C90A 2VZTA 4F79A 5BXTA 8CGTA 1L0PA 3W24A 4TTUA 5I2UA 4W5UA 4PRWA 5EMYA 1UKSA 5A8PA 1JI2A 1UKTA 3SCVA 1XYFA 1R7OA 2YBTA 4PMZA 5CGMA 1R87A 1SFSA 3PZMA 3RJYA 1VAHA 4CU6A 5A6AA 1TCMA 4RL3A 2G3MA 1DWJM 1KQYA 3CHCA 1JZ8A 4PYSA 2J7GA 3AICA 1E5NA 3BCDA 2ZOXA 4KH2A 1E71M 1HL8A 3KE0A 5JUVA 3A4WA 3TP4A 4M80A 3HU7A 1LG1A 4TXEA 4CUCA 3ARUA 3VIPA 1H49A 4E8DA 3T08A 4J3XA 4UZUA 1J0KA 1C93A 4QCFA 4MB1A 3AHYA 4KMQA 3O2LA 3GNRA 4TX6A 1H09A 2VRKA 1WDSA 1PAMA 1CGWA 3ALFA 2XVGA 3WH8A 4J3SA 2YLAA 1TA3A 2ZWZA 2DQXA 1WO2A 2EO7A 1KBKA 1J9YA 4R5EA 4GQQA 3B9DA 2BVDA 1JYVA 3UEQA 4QP0A 2G41A 4IISA 3VIOA 3CMJA 1CXFA 4XV0A 4A4AA 4HOXA 5I0DA 3A4AA 1TE1A 3VUPA 1VFOA 1XH1A 2AMGA 4JKMA 2XFRA 3B9EA 4UTFA 1JI1A 1VFMA 3AZRA 2VCAA 4ZE5A 5BYWA 2WANA 3PN8A 1NWRA 4P8UA 1TZ7A 5GQBA 1CPUA 1HJWA 1TVPA 2JIEA 4BQ3A 5M3WA 3GH5A 3A3HA 3SCSA 2CBIA 2WSPA 4W93A 2FHFA 1UD3A 2CKRA 5HPOA 1MVYA 3U7BA 1KQZA 4PN2A 3K8MA 1UG6A 4Z2KA 3I3BA 4D6IA 1VEPA 4YHGA 1CXEA 3VIMA 1ZU8A 1TA3B 4UCFA 4BF7A 4Z2GA 2WMFA 2XFYA 4UOJA 2J79A 3B9AA 1V3MA 2BV9A 5FL1A 1QNSA 5GNXA 2YDRA 1ISWA 3PZUA 3VIIA 3D5HA 5A2AA 1IT0A 4LPCA 1W1VA 3WN6A 1M03A 2J8FA 1W2PA 1W9PA 2A3CA 3M6DA 2MANA 4NSBA 3ARRA 1NWUA 4U5KA 3WH7A 1V08A 1LWJA 2ZICA 1HJSA 5FCZA 3DC0A 1FHDA 5BXRA 3VGFA 2VTFA 3EDJA 4PTVA 5D8WA 4P8XA 3CIVA 3UERA 2PBGA 1R86A 4MADA 3ZJKA 1MFVA 4GIAA 3FN9A 3RDKA 1E72M 1YHTA 4W7VA 1I1XA 3GH7A 4MAVA 1J18A 1WDPA 4OBRA 1YQ2A 4JCLA 1JG9A 1C3FA 1BF2A 2CYGA 1QOXA 1E9LA 1E0VA 1J11A 1NM9A 1JF5A 2X05A 2D20A 2E8YA 5E0FA 1D3CA 4H8HA 2WWDA 1EQPA 1XHGA 1E1FA 3BAWA 1JFHA 1KXVA 3WQ6A 4PCSA 3AMLA 2VZUA 2BHZA 4C7GA 5CLWA 1CGTA 2WK2A 5CPSA 3N12A 5HDRA 4ACYA 3II1A 1HKJA 3EYPA 2GDVA 1QBAA 3OLDA 4BQ5A 2BHUA 5A6LA 3AMKA 1JDCA 2UY5A 3RO8A 3ZT6A 3MUIA 4W7WA 1F4AA 3AIVA 3SEPA 1CGXA 1KBBA 3L4YA 2EBNA 1JL8A 4N42A 3VD7A 1KXHA 4M1RA 1VRXA 3LPOA 4LXFA 1ZB5A 2WCSA 5A94A 1UD4A 1GOQA 5KEZA 3ZIZA 4AIUA 4JFSA 3AHXA 4PMXA 1DHKA 3CZEA 3L4UA 1BYCA 3AZSA 3MO4A 3VD4A 2O9RA 1G01A 3FHAA 2CXGA 3MKKA 4AEFA 2ZXQA 3ZJ7A 4FK9A 4CN4A 5E09A 1EXPA 2WZEA 2E3ZA 2WVVB 3THDA 2WMJA 1HJQA 1O6IA 4AD3A 1O7AA 3WNKA 5IHRA 1JNDA 1MQRA 4OBSA 3VINA 2BS9A 3APGA 4Y7EA 4FLQA 4D1JA 1JDDA 2VUYA 4HMCA 5FL0A 1KCKA 1FHLA 5A6BD 3WBEA 1OIMA 5A2CA 4JFVA 1TR1A 1ISVA 3A47A 3SURA 4GO8A 1OINA 1AQHA 4A3HA 2VURA 4HOZA 4JHZA 1FOBA 4ZXOA 1UUQA 5JIPA 1BYDA 2CBJA 1JYNA 4D1IA 2EPNA 3WQWA 4W8BA 2ZWYA 2X0YA 3CO4A 4J27A 1VJSA 3AZTA 2OSYA 3VO0A 2C0HA 1W3HA 3SUSA 1ZJBA 1R7AA 1UA7A 4OJYA 4WK9A 2V3FA 2V5DA 3SCNA 4MNLA 4M8UA 3WEMA 3VMNA 3A6OA 5D9MA 4CD6A 1Q4NX 2ZUNA 5CZKA 5M5DA 2J7EA 1MW2A 2BY1A 3KL5A 1V0KA 4F66A 3GBDA 1UR0A 2CBVA 1B31A 3O9NA 1A47A 4TOQA 1B9ZA 3BXWA 1A3HA 1Q6DA 4YPJA 4AD0A 4AISA 1BLIA 1E55A 1W9VA 3ARQA 1ODZA 2WPGA 5I6SA 1X1NA 3ZSTA 1QI3A 1WAWA 2WW5A 1AQMA 4F9JA 1ZBKA 4B9YA 2AAAA 3N17A 3N18A 3U57A 4GKLA 1B0IA 3WQ4A 1UR9A 2XHYA 4GQRA 1HKMA 3EBVA 2RGLA 3K4DA 4L4OA 1QNOA 1W2VA 1RP9A 1JYWA 3ZT5A 5E0CA 5E6YA 2X09A 3OLIA 1DWHM 3QR3A 2VC9A 1CIUA 2WXDM 3T09A 1HJVA 5KZ6A 1TG7A 2VZSA 1GHRA 1ZBCA 1HJUA 5A69A 2GFTA 3AXHA 3WUFA 2GDUA 1VENA 4QDMA 4M56A 2J7FA 2O92A 1LG2A 3ZSSA 3RM8A 4YHEA 4W86A 3WF2A 4ATWA 1NOWA 2DEPA 3KZSA 1M01A 1CZ1A 2GK1A 5FIPA 2UY4A 2VR4A 1BYAA 1VF8A 3W6MA 5D8ZA 3K1DA 3W82A 4HZ6A 4C7DA 2FHBA 3AI0A 5AC4A 3UG5A 4CD5A 5JIWA 2E9MA 1EA9C 2J75A 2WBGA 1BG9A 2E40A 1JZ5A 4P7LA 3MUAA 2D23A 3WH5A 1B3YA 2EQDA 1CWYA 3SUUA 1NP0A 1GOWA 6CGTA 1NQ6A 2VI0A 1UH2A 3KL3A 4GZEA 4BQ2A 4UQAA 1VBRA 1V3HA 1BSIA 3WDJA 3BLKA 4HA1A 2IUZA 3EMZA 2D2OA 3PZVA 3ARZA 3DECA 1VIWA 2NT1A 1MW3A 1QNQA 1E6PA 3D3AA 3BH4A 3MMUA 2QLYA 3WD4A 5DEZA 3WDQA 4E4PA 3UETA 3ZR6A 5BXPA 4Z2LA 3AIWA 2A3HA 4U2YA 4KWUA 3RIKA 1UWRA 2D0FA 3SCTA 5ABEA 1FH7A 2G3NA 1CNVA 2QPUA 4DUXA 2E8ZA 4HA3A 3F5LA 3BAJA 4AZGA 1E4LA 4PSPA 2YL6A 2DH3A 3CZGA 1JD7A 2V38A 3WH6A 1Q6GA 1GJUA 4ACZA 4AIEA 2UY2A 3ZO9A 4BQ4A 2DT1A 2EEXA 1XH0A 2D24A 4MJ4A 4CD7A 2CHOA 2DPEA 2VOTA 2WM0A 5D4YA 3VU2A 3BMWA 4NI3A 3F5KA 4CU7A 5A6BA 2XVLA 5DMYA 1UD6A 3MS8A 4JKKA 1E6SM 3O6AA 1JZ2A 3GXDA 3WNPA 1PX3A 1GHSA 1ZJAA 3MSDA 1CECA 2PBOA 3TTYA 2PWGA 4DWSB 1G9HA 4ZE4A 3TTQA 1JZ4A 4MAZA 1W91A 3POCA 2VO5A 1WDRA 3VPLA 4PMOA 5A95A 3GH4A 1GPFA 1C7SA 1WDQA 4UZSA 1OD8A 3RCNA 4CCCA 5TD4A 3N13A 4PTMA 3MSGA 2J7BA 3VX1A 5BWFA 2WKGA 1HX0A 4MDPA 4ACZB 1V3IA 2G4FA 1WKYA 2UWFA 3DYPA 4HA4A 1UR2A 1PBGA 1VFUA 3OG2A 3GTNA 4J3TA 1EIBA 2BVYA 3M07A 3T0AA 4Z2JA 2CPUA 1LL7A 1HF6A 3WD0A 1NARA 1QVBA 1K9FA 1RPKA 1CGVA 1C8QA 1UWTA 3W37A 2QPSA 3L4ZA 5BRPA 3ALGA 1E6ZA 2A3BA 2QHAA 4PBGA 1PX4A 2XM1A 1DWIM 1H0GA 3POHA 4FLOA 3WUEA 2J77A 2EPMX 1UHVA 3CTTA 4PCTA 1E5JA 4PTXA 1CXHA 4GZJA 5LA0A 2WHKA 3AS3A 2CITA 4TUFA 3OB8A 1KXTA 2YDQA 3JUGA 3GZAA 4P7RA 1GOIA 1V6WA 2WVTA 4EK7A 2NW0A 4AZ6A 2YA1A 3NSNA 4J28A 5GPRA 4D72A 4UNIA 3VNYA 3CPUA 4OKDA 4C7FA 1JAKA 1E0XA 1GVYA 4W85A 4LYRA 3ARSA 1CXKA 2XPKA 2Y4SA 2VZOA 1BHGA 2YJQA 3MANA 1GQJA 3BSGA 3N1AA 1W1PA 4MJ2A 1FFRA 1TFVA 2C7FA 1CLVA 4H8VA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3IAN A;  3WDI A;  1U33 A;  2XVP A;  3AIE A;  1C8Y A;  4AYS A;  1JZ3 A;  4H7V A;  3W26 A;  3VGE A;  1XSJ A;  3ZJ8 A;  2GJR A;  3L2M A;  1UYQ A;  5ABH A;  1UZ4 A;  3RIL A;  3T2Q A;  5A6S A;  4GIN A;  2YDS A;  3FY1 A;  4QLJ A;  2A3A A;  1GOO A;  2G3I A;  3VDA A;  1IZK A;  2ZX9 A;  1CEO A;  4M24 A;  2RGM A;  2XG9 A;  5A6M A;  5BRO A;  3TA9 A;  2PWH A;  4JIE A;  4X0N A;  3MUY 1;  5GNY A;  2C8N A;  2W92 A;  3I3D A;  4CCD A;  2BY3 A;  4QLL A;  1US3 A;  4EKJ A;  4D6G A;  1BTC A;  1H11 A;  4JKL A;  1UWU A;  2VX7 A;  4X0V A;  2DSZ A;  1CEN A;  2YL8 A;  1FH8 A;  5A8O A;  1FA2 A;  1I75 A;  1SR0 A;  3WEZ A;  2YA0 A;  3VIL A;  3ARW A;  4PUE A;  1G0C A;  4AZ7 A;  1OGG A;  3MMD A;  2ZX6 A;  4W87 A;  5A8M A;  1V6U A;  4W5Z A;  2WBK A;  4KGJ A;  4PMV A;  1OBA A;  3BAY A;  5FKY A;  1E73 M;  4W7U A;  5A3H A;  3VGB A;  2DSU A;  2E0P A;  2NT0 A;  1C7T A;  1Q6C A;  4XZW A;  2WCG A;  2WMI A;  4RE4 A;  3WDR A;  5C70 A;  1GON A;  2W67 A;  1HL9 A;  2CES A;  4D6E A;  1WPC A;  1PJ9 A;  5ABG A;  3ZT7 A;  4E2O A;  4J3U A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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