1GORA

Thermostable xylanase i from thermoascus aurantiacus - xylobiose complex at 100 k
Total Genus 122

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
EAAQSVDQLIKARGKVYFGVATDQNRLTTGKNAAIIQADFGQVTPENSMKWDATEPSQGNFNFAGADYLVNWAQQNGKLIRGHTLVWHSQLPSWVSSITDKNTLTNVMKNHITTLMTRYKGKIRAWDVVNEAFNEDGSLRQTVFLNVIGEDYIPIAFQTARAADPNAKLYINDYNLDSASYPKTQAIVNRVKQWRAAGVPIDGIGSQTHLSAGQGAGVLQALPLLASAGTPEVAITELDVAGASPTDYVNVVNACLNVQSCVGITVWGVADPDSWRASTTPLLFDGNFNPKPAYNAIVQDLQ
5010015020025030030025020015010050
020406080100120Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH3 (31-39)TVIII1 (2-5)AH1 (6-13)S1 (17-22)EMPTYTI5 (258-261)AH2 (24-28)AH5 (63-76)S2 (42-45)S3 (79-82)TI1 (47-50)TIV1 (45-48)TIV2 (88-91)AH4 (51-54)TVIII2 (55-58)AH6 (93-97)AH7 (101-119)TIV3 (120-123)TII2 (119-122)AH9 (151-163)TI3 (164-167)S4 (125-130)TIV4 (129-132)S5 (168-173)TI2 (134-137)TI4 (178-181)AH10 (182-197)O1 (140-142)AH8 (143-148)TIV5 (148-151)O2 (199-201)S7 (209-210)TII3 (211-214)AH12 (245-257)AH11 (214-227)S8 (232-240)TIV8 (274-277)TII4 (240-243)3H2 (277-279)S9 (261-266)O3 (266-268)S11 (289-290)AH13 (292-301)TII1 (57-60)S6 (203-206)3H1 (271-273)S10 (284-285)TI6 (285-288)TVIII3 (84-87)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
publication title Substrate Specificity and Subsite Mobility in T. Aurantiacus Xylanase 10A
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-XYLANASE
total genus 122
structure length 302
sequence length 302
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2001-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1gorA00
1RD6A 2WKGA 3THDA 4HMCA 4QP0A 2YLLA 4W85A 4JL2A 1KGUA 4TXEA 2MANA 2JF7A 5CPQA 1JL8A 1B3YA 3GTNA 3RMEA 2Y4SA 5I2UA 2ZIDA 1KB3A 3EDDA 4NI3A 3A4AA 2D0HA 1E1FA 2YKKA 3ARXA 5GQBA 5A6AA 3T09A 4DWSC 3VM7A 4KWUA 4E8CA 1LWHA 3W53A 2WB5A 1E4IA 1MFVA 1H5VA 2BHZA 4P7RA 3WDRA 3WF4A 5LA0A 4YHGA 3AZSA 2NSXA 5LYRA 4AEEA 3AFBA 1GVYA 2YOCA 3WDQA 1US2A 3TTYA 4Z2HA 5DT7A 1G0CA 2O9PA 2DSWA 3RILA 3G6LA 4ZEPA 1FFRA 3GDBA 3AMLA 3PHAA 3TTQA 4AD2A 2BVDA 2WBGA 3EMCA 1JF6A 1BVNP 3WF2A 1UH3A 5CQ1A 1UA7A 2A3BA 3W81A 1GPFA 1EDQA 4HU0A 1HXJA 1VEOA 1EOKA 1WDSA 2DIEA 4W88A 5DF0A 2XM1A 1HKKA 2J4GA 2Y24A 4KGLA 5I24A 3ZM8A 1VIWA 4LPCA 5A8QA 7CGTA 2WCGA 3PZTA 3APGA 5CGTA 4GXPA 3SCQA 4CD5A 2VT0A 3VIGA 3DYOA 2D1ZA 2NT0A 4OBSA 3VILA 4C7GA 2PF0A 1KR1A 3VX0A 4KH2A 1VFUA 3ARTA 1R7AA 2JIWA 1QI5A 3VD4A 3RCNA 4BS0A 1CXIA 2X8RA 3B8SA 1R86A 1QI4A 3VNYA 4GKLA 1V0KA 2WVVB 1H11A 5IHSA 2EQDA 3L4WA 3PZMA 5GNXA 4LGXA 5GNYA 1E43A 3OGSA 1CENA 2ZX5A 3B9EA 4HZ8A 2YA2A 2GVYA 1EDTA 3I3EA 3BMWA 3K4DA 2IXUA 2XYLA 1I75A 4KGJA 2G3IA 5AYIA 5BYWA 2WHMA 3LMYA 1PIFA 3WQVA 2X0YA 4P7LA 3OGRA 1UKPA 1HN1A 4K68A 3VINA 5A8OA 4OBRA 2WWDA 1TUXA 4D6JA 4PMXA 2Y2WA 3A4WA 4MB3A 3K8KA 4P7NA 1LG1A 1VBUA 2WSKA 1A47A 3NIYA 4CN4A 5I3DA 5D8ZA 1I1WA 1KR0A 3M6DA 4QLLA 3SCTA 1EA9C 3VNZA 3AS1A 1UKTA 2BHYA 2YDRA 4J27A 1K9DA 4YN5A 1JFHA 2FGLA 1DTUA 3IAPA 4MNMA 1EIBA 1LL4A 2GUYA 3MSGA 4CCCA 4CD8A 1XCWA 2BVYA 5E6ZA 4N42A 3UG5A 1ZL1A 3RM9A 1B3XA 2VX7A 1XH1A 3BLPX 3VD7A 3LPGA 1XC6A 5D4YA 3CGTA 3W0KA 5LA2A 5C70A 4JHZA 1R8LA 1XH2A 3VD9A 3ZSSA 3W82A 3WUEA 1PX4A 5CSYA 4UFIA 3ALFA 3MMUA 2BHUA 1JXKA 4QLJA 1O7AA 3MUZ1 1VFFA 3AHZA 1WZAA 1HJQA 4Z2JA 1C90A 2CBUA 2XPKA 2PWDA 3AROA 4GO9A 4UOZA 1E73M 4YPJA 2Z1SA 1NARA 3E1F1 2OSWA 2J47A 3CH9A 1UUQA 3T08A 5ABEA 3AYRA 1E6QM 1W9VA 3EYPA 1HP5A 4AC1X 2DT2A 3VIPA 4FF5A 1OGSA 3VD5A 3AXIA 5KZ6A 3VGGA 5HDRA 1QW8A 1U30A 3ZT7A 4BA0A 3WDIA 1BG9A 1BG4A 3AJ7A 4LXFA 2XGBA 1J0IA 1WDQA 4WF7A 2CPUA 3SCUA 1HJXA 1XH0A 1OGGA 2GK1B 4NRRA 4EE9A 4AW7A 4DUWA 4H2CA 1UR9A 1CYGA 4UCFA 3VUPA 4D6IA 1UKQA 3M7SA 4PYSA 3BLKA 1UD5A 4Z2KA 2VZSA 1Y7VA 1LQ0A 3FW6A 3TOPA 3WH6A 1G94A 1M04A 1SR0A 2XG9A 4PMNA 2YBTA 3ALGA 1QBAA 2XM2A 5M03A 3GH4A 3OGVA 3WF3A 1BGAA 2AAAA 2EO7A 1TA3A 2DT3A 3F5JA 2OWXA 3ZO9A 1AQ0A 4MNLA 5HPCA 4IISA 3WMSA 4EANA 1UWTA 2VZUA 2FHBA 3WBEA 1AMYA 1CECA 4ACZA 3KEHA 3CIVA 1J11A 5A1AA 1DEDA 1NM9A 4BCEA 4BQ4A 3L4XA 1EOMA 1KQYA 3F4VA 1V6WA 1WE5A 1C93A 1J0JA 1ODZA 5AYBA 3SUTA 1AQMA 2WZEA 5CLTA 3T2OA 3T0BA 2CESA 1LWJA 5A95A 2QMJA 1FP8A 1I1XA 4JFWA 1GHSA 2VCCA 3N15A 3VMPA 3ZMRA 3BAWA 1JZ8A 2D2OA 2D3LA 1ZBVA 2WC7A 3L4ZA 1K6AA 3CZEA 4PTWA 1EH9A 3SUUA 3RPMA 1V3MA 1UD8A 8A3HA 3MMWA 2J75A 3VGEA 1HF6A 1MVYA 1D2KA 7A3HA 1CXEA 2WBKA 3WNKA 3AHYA 3POCA 1KWGA 2FDMA 3KE0A 2GJXB 1GOOA 2GJRA 3IAQA 2OSYA 2W5FA 1E6PA 5FOOA 1UA3A 1MW1A 2WZIA 4M8UA 1W32A 4JFSA 4QFUA 2ZX6A 3AZTA 5DFAA 2VRJA 4P8UA 1J18A 1UD2A 2ZUUA 2PB1A 4C7FA 5A3HA 3VKKA 3SUWA 5D9NA 1GUVA 3WY1A 1UG6A 1DWJM 2XIBA 2ZXAA 1UD6A 3AS2A 2VZOA 4UQCA 4B9ZA 4PN2A 2W91A 3S6TA 3GM8A 3GBDA 1J01A 1QNRA 1GOIA 3W28A 4FLRA 4PCTA 1W3LA 3W38A 3WD0A 2BY1A 2E9MA 2J78A 2BFGA 1X6LA 1CEOA 3ZT5A 2W66A 3CTTA 1GJUA 1ISXA 3GXFA 4P7QA 4W93A 2J25A 3SCNA 4J3XA 4W8AA 3WQ5A 1DWAM 1CXFA 4OUEA 3ARQA 3M07A 2YDQA 4J3WA 1XYZA 3BSHA 4RE4A 3AIWA 4PRWA 5FCZA 3U7BA 3KL0A 2DSKA 1KGXA 3W6LA 5D9OA 4RE3A 2Y8VA 1W9DM 2PC8A 1W3HA 3WH9A 3ZJ7A 3L2MA 3MS8A 4M81A 3WQWA 3W37A 4PMRA 1JYNA 1C8YA 3W6MA 5CPTA 5JIPA 1O6IA 2VC9A 3NSXA 5FL0A 3WQ4A 1OIMA 4MDOA 3BMVA 1QBBA 3MUIA 1H41A 2VMFA 4ATLA 5HNNA 2XVPA 1W3KA 3AZRA 2F2HA 2WHKA 3FHAA 4B3LA 3RJYA 2IUZA 2RGMA 4HA1A 2XFFA 3VIFA 1W9BM 4WSKA 2WHLA 3VDAA 4ZE4A 3VMOA 2ZUTA 1QNOA 4IUGA 4PCSA 4IPLA 3ARZA 1WCGA 2D0GA 2J7GA 1V3LA 3DHUA 3ECQA 3IJ8A 4MB4A 5ECUA 4L4PA 1V0NA 1PJ9A 3PZGA 3VGBA 1CNVA 1QVBA 3D3AA 4W5UA 4YHEA 4CCDA 1JAEA 1PAMA 4UZSA 2UY2A 3CUIA 1C91A 4WKHA 8CGTA 4M29A 1MYRA 4HOWA 3UG3A 1BGGA 3RM8A 1CGUA 3T0AA 1E6XM 4FK9A 4UFHA 1TVNA 3WNNA 1XHGA 2V5DA 1UD3A 4ZENA 1K9TA 2DH2A 4LYQA 1QHZA 3CZGA 3OZPA 1W2VA 1IT0A 1UH2A 5IHRA 3TA9A 3PZIA 5I5RA 5M3WA 1OBAA 5FL1A 4MTVA 1W1VA 1W9XA 2WXDM 3BAXA 1QNPA 4HU8A 2TAAA 2ZXQA 1UQZA 3NJ3A 4J7RA 2VVNA 2J62A 3CMGA 3WBAA 2DSZA 4MAVA 4HMEA 1CLXA 1E9LA 3WH5A 3QGVA 4PMQA 5DO8A 3VPLA 2XHYA 2XWEA 2WCSA 2VNCA 4F8XA 2WVSA 1MW3A 3NCOA 3RDKA 5JBFA 2WCAA 1WAWA 2J77A 2XFYA 3OBAA 3IJ7A 1JD7A 1H3GA 4UFMA 1E0VA 1HL9A 4TVDA 1UR0A 5M17A 1UZ1A 4PMUA 3MUY1 1V02E 4TX6A 3EDEA 3FAXA 2PWHA 3TP4A 4UQ9A 2X2YA 5HBFA 5I6SA 5DT5A 3U7VA 3VDBA 4F66A 4UOJA 1US3A 1UD4A 2J7FA 5C8BB 4XUYA 3THCA 4B9YA 2D3NA 2CBIA 4HOXA 5E70A 3ARVA 2IXVA 3IK2A 3PTQA 2PBOA 3ZR6A 4GO8A 1EQCA 1GQLA 2CHOA 4OOZA 1FH9A 3N04A 4W86A 3WNLA 4W84A 4FMVA 5FD0A 1E72M 1CGXA 4RE2A 5KEZA 4UFKA 2VCAA 3RJXA 4DUVA 4QDMA 2QMKA 4ZXLA 3ZSTA 2AMGA 1L0PA 4M80A 3MANA 4JFUA 2VURA 1OT1A 3FNDA 5FKYA 3L2LA 1Q6EA 3WIJA 4TVCA 3A6OA 3BCFA 5BRPA 1D7FA 4BF7A 3OLIA 5D9PA 3ZR5A 2VJXA 3WFZA 4CN1A 5EFFA 5BXTA 1NWTA 3WNOA 3GBEA 4CVUA 3KL3A 2HISA 2X0HA 3NDZA 2QPUA 4H04A 9CGTA 2CITA 4D6DA 4H8VA 4TX8A 1GQIA 2DPEA 5E9AA 4D6GA 1W3JA 2X09A 3AXXA 2VOTA 3CUJA 1JF5A 1TA3B 2E4TA 3PZOA 1JZ2A 3PZNA 4JKKA 2DEPA 2PBGA 2PWGA 1WPCA 3ZT6A 2PWEA 5CSUA 2VR5A 1U33A 4MPKA 3AS0A 1TZ7A 4ACZB 5TD4A 4CGTA 1FA2A 2W63A 4ACYA 4URIA 2JF6A 4MDPA 4GZEA 5E0FA 3UETA 1ITCA 4CD4A 2WYSA 4AZ5A 1W9PA 1KCLA 2Z1KA 1JZ5A 1QHOA 1JYVA 5F7UA 5JBEA 1PX8A 1PEZA 1U2YA 1UYQA 1W1PA 2JFEX 2UY4A 5AC4A 4TUFA 1JXJA 1WKYA 2G3MA 2O92A 4U2ZA 4MJ4A 3AYSA 1E4NA 1CXLA 3VOCA 2FH6A 1W9UA 1K9EA 1XV8A 1NP0A 4LQ1A 4GQRA 3VIIA 1KQZA 1ITXA 1V08A 1HNYA 3OB8A 1GOQA 3RM4A 2QPSA 2VQUA 1SYTA 1F4HA 2VRQA 2J79A 1TVPA 3HN3A 4A3YA 3OLGA 1V3HA 1ESWA 1LG2A 4X9YA 2WC4A 1ISVA 3SIMA 2E40A 3F5KA 2OWCA 2Y5EA 1FH7A 4AZCA 4JIEA 5CG0A 4U3AA 3CZJA 1OWQA 1BTCA 3VIOA 4P7OA 4GPNA 2YDSA 3BAJA 3KWXA 1VFMA 3TTSA 5A6BD 1JZ6A 3MU7A 2WZHA 4UFJA 1J9YA 2X1IA 3AOFA 2A3AA 2DGAA 3W29A 4EAMA 2JE8A 5I79A 3WSUA 5ABHA 5M5DA 1PX3A 3FN9A 1FH8A 3WFLA 4CUCA 1IV8A 1W91A 1GQKA 3EBVA 4HA3A 1WZLA 1Q6DA 3BXWA 1ISZA 1Q6CA 4IPNB 3SUSA 5IFPA 1JNEA 5ABGA 3KL5A 3WN6A 4PMZA 2VCBA 4PMVA 3WL0A 1MQQA 3PN8A 3VIMA 4U31A 2E8YA 5A6LA 1TR1A 4AZ6A 2GSJA 2WVUA 2J8FA 3EDKA 2VX5A 1XSKA 3CZ8A 2CEQA 1B1YA 4NF7A 1F4AA 3L4YA 1VB9A 5DEZA 3AICA 1KBKA 4KRTA 4PUDA 3M46A 4CU6A 5CGMA 1CGTA 1GOMA 3FAWA 1C92A 1UWSA 3AISA 1RP9A 1JD9A 2ZUWA 2ZUVA 3J7HA 3SCOA 4PTVA 2WMIA 4FLOA 3UR8A 4GINA 3O2LA 1FFQA 1V3KA 1S46A 1W1YA 1JYWA 2OSXA 1QPKA 3CUHA 4Z2LA 4JFTA 2GJPA 1KFWA 2J7EA 1TE1A 1BYAA 1HIZA 6CGTA 4CU8A 1JFXA 1NWRA 4NRSA 1BF2A 3N13A 2FH8A 4WSJA 4AWEA 4A4AA 1H0IA 1JZ7A 1B30A 1GORA 1E71M 2O9TA 5EMYA 4S3JA 3WKZA 4GZIA 4J28A 3WNPA 1MWOA 3ZJKA 4U3CA 4W7VA 4GQQA 1GJWA 1CZ1A 3F5LA 1UWIA 2ZX7A 4FLSA 2W92A 4JAWA 1JNDA 4HA4A 1VRXA 3IJ9A 1MQRA 2WW5A 5A6BA 1E55A 1UKOA 3AIQA 1MFUA 5LA1A 3N11A 3VMNA 1TCMA 1BYDA 3NUKA 4MAZA 2WMFA 1KXHA 3VGHA 3A4XA 1ECEA 1VBRA 4MNJA 2VO5A 3NSNA 3PTKA 4MADA 3W26A 2ZUSA 3K8LA 5ABFA 4FLQA 4H7VA 1E3ZA 1CXKA 3WH7A 1XCXA 4PMYA 5IFTA 2EEXA 4W87A 3QOKA 1HT6A 2ZE0A 2BS9A 4AD5A 4PSRA 4UNIA 5D9MA 4HP5A 5A8MA 1CGWA 1ODUA 2E8ZA 2NW0A 4WK9A 3W25A 3QR3A 5CZKA 3PTMA 4P8XA 1Q6GA 3AI0A 1B31A 1SMAA 2XUCA 1BLIA 4Y7EA 3AS3A 4JCMA 1OD8A 1LL7A 4W7WA 1JDCA 2YL6A 4D6CA 1WO2A 4HZ6A 5GNZA 2CHNA 1NWUA 5C71A 3PZQA 5BROA 1UR4A 1JG9A 4H41A 4Q7NA 4X0VA 1M03A 2Q8XA 4R5EA 3AIBA 4L4OA 7TAAA 2V5CA 3BC9A 1BPLB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1RD6 A;  2WKG A;  3THD A;  4HMC A;  4QP0 A;  2YLL A;  4W85 A;  4JL2 A;  1KGU A;  4TXE A;  2MAN A;  2JF7 A;  5CPQ A;  1JL8 A;  1B3Y A;  3GTN A;  3RME A;  2Y4S A;  5I2U A;  2ZID A;  1KB3 A;  3EDD A;  4NI3 A;  3A4A A;  2D0H A;  1E1F A;  2YKK A;  3ARX A;  5GQB A;  5A6A A;  3T09 A;  4DWS C;  3VM7 A;  4KWU A;  4E8C A;  1LWH A;  3W53 A;  2WB5 A;  1E4I A;  1MFV A;  1H5V A;  2BHZ A;  4P7R A;  3WDR A;  3WF4 A;  5LA0 A;  4YHG A;  3AZS A;  2NSX A;  5LYR A;  4AEE A;  3AFB A;  1GVY A;  2YOC A;  3WDQ A;  1US2 A;  3TTY A;  4Z2H A;  5DT7 A;  1G0C A;  2O9P A;  2DSW A;  3RIL A;  3G6L A;  4ZEP A;  1FFR A;  3GDB A;  3AML A;  3PHA A;  3TTQ A;  4AD2 A;  2BVD A;  2WBG A;  3EMC A;  1JF6 A;  1BVN P;  3WF2 A;  1UH3 A;  5CQ1 A;  1UA7 A;  2A3B A;  3W81 A;  1GPF A;  1EDQ A;  4HU0 A;  1HXJ A;  1VEO A;  1EOK A;  1WDS A;  2DIE A;  4W88 A;  5DF0 A;  2XM1 A;  1HKK A;  2J4G A;  2Y24 A;  4KGL A;  5I24 A;  3ZM8 A;  1VIW A;  4LPC A;  5A8Q A;  7CGT A;  2WCG A;  3PZT A;  3APG A;  5CGT A;  4GXP A;  3SCQ A;  4CD5 A;  2VT0 A;  3VIG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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