1GPWA

Structural evidence for ammonia tunneling across the (beta/alpha)8 barrel of the imidazole glycerol phosphate synthase bienzyme complex.
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
253
structure length
253
Chain Sequence
MLAKRIIACLNVKDGRVVKGTNFENLRDSGDPVELGKFYSEIGIDELVFLDITASVEKRKTMLELVEKVAEQIDIPFTVGGGIHDFETASELILRGADKVSINTAAVENPSLITQIAQTFGSQAVVVAIDAKRVDGEFMVFTYSGKKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEILLTSIDRDGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIASGGAGKMEHFLEAFLAGADAALAASVFHFREIDVRELKEYLKKHGVNVRLEGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase/transferase
source organism Thermotoga maritima
publication title Structural Evidence for Ammonia Tunneling Across the (Beta Alpha)(8) Barrel of the Imidazole Glycerol Phosphate Synthase Bienzyme Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HISF PROTEIN
total genus 86
structure length 253
sequence length 253
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 4.3.2.10: Imidazole glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2001-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1gpwA00
1UCWA 2Y7FA 4OV4A 4UTWA 2QCEA 1EWDA 3RF9A 1R47A 3T44A 1SFJA 5ABTA 2J9XA 1ONRA 5AYYA 1H1ZA 1RV8A 3NM1A 4NNBA 3EEGA 4UCGA 5T26A 1JCXA 4JTFA 2C3ZA 3P80A 4RCXA 2FTPA 4O8RA 3RLUA 1H61A 3TUUA 1GTHA 4WD0A 3W88A 1OFDA 3FJLA 2I14A 2V5LA 2X1RA 3DFSA 3A9IA 3O07A 2X1SA 2QUVA 1W5NA 5DELA 1QDSA 3G3DA 1KA9F 5G5IA 5AHEA 2WOQA 1EP1A 3H54A 3QPYA 5K9DA 2B7QA 1XCFA 3M5ZA 5EPDA 2J9YA 3RK8A 4O28A 3NQ6A 3DZ1A 1JQVA 3SR7A 3KVMA 3S5OA 2ZYFA 2PRHA 2R8WA 3PVFA 3NQCA 2DORA 2X1UA 4N9EA 4IX0A 1KBIA 4CNNA 4MJZA 2A1YA 1TO3A 1GJPA 2HS6A 5EYWA 3UXAA 5SWUA 1J2WA 3W1LA 2E1DA 5LHEA 2ZRVA 1WV2A 3LHWA 4Z08A 3BO9A 4X9SA 4LOCA 5EKYA 4O0ZA 4N6FA 1ZHAA 2OZ0A 3EWWA 1EB3A 3STEA 3N3MA 1OX4A 1EA0A 1EX5A 5G1TA 1PHQA 3KX6A 2GQ9A 5TBOA 1PCKA 4I7VA 4O1BA 4GUGA 5EA9A 3NAVA 2NX9A 3HGRA 4Z0SA 1RQBA 2JBMA 5D2XA 2DU2A 1FCBA 1K02A 5AC8A 3LB0A 2VC6A 1H7XA 3GX9A 3LXBA 3HJZA 3ZR4A 4JY8A 3DI0A 1G4EA 1LP6A 3TQ0A 4U4MA 3E0IA 3E96A 3SSJA 1Q45A 3SW6A 1B4EA 1FY6A 4XQ6A 3HF3A 4LWWA 1JULA 3NXFA 2QCNA 2YSWA 2YYTA 5LNSA 4ZQMA 3HG4A 2V0TA 3W7CA 4LS0A 4QM1A 3EX6A 5AC7A 3O6CA 3WK0A 4UTLA 3PWAA 2WSYA 3Q58A 3CLMA 4UMAA 1SUXA 2JGQA 1KM4A 5I3GA 4DF2A 1OFOA 3C4UA 4FB7A 3GR8A 1OK4A 5KINA 4E2DA 2ZRXA 3WJYA 3C2OA 2EPHA 3WJZA 2NUXA 5AFDA 3G1DA 4M7TA 1TPVA 4AF0A 1LM1A 2A7RA 3GDMA 5LNWA 1XC4A 2QAFA 1NEYA 3UY7A 4L4MA 3FS2A 4AB4A 1QR7A 4R34A 6TIMA 2RKXA 3IGXA 3UQNA 2E09A 3GB6A 3LTSA 4CQAA 1VS1A 3I7RA 4A22A 5D02A 1SO6A 4AAJA 5D2VA 3TE9A 3OVRA 5EMUA 1YXYA 4O0KA 1D3HA 4UUIA 5D33A 4AHOA 4HHPA 1O5KA 1RQEA 3V1PA 1XUZA 2H3BA 1YTKA 5BMWA 1LOLA 2Y85A 3PUEA 1KTBA 2VEPA 4A21A 1TJRA 3QZEA 2G97A 2YW3A 3NDOA 1VCGA 1VCVA 4MLRA 3PULA 3L0KA 2DZSA 4AF0B 3CWNA 1L9WA 3DU0A 4JS3A 3MP4A 3G1FA 5I3IA 3GVGA 5FF3A 5C2XA 3S1XA 4AHPA 3IV3A 1Q6OA 3QF0A 3W83A 3W2KA 2E77A 1M5WA 1QO2A 4N4PA 2FQIA 4ZZ9A 4KFNA 2XN1A 1ADOA 2GUUA 4OBTA 1GOXA 2VENA 4K6AA 1EPXA 1H5YA 3W7NA 2QCGA 3O8AA 3VFLA 5LNVA 3LERA 2A0NA 1OFBA 5D03A 5G1YA 1EP3A 2JKEA 2NXGA 4CCDA 2GVGA 2V5BA 4FNPA 3MYPA 1F5ZA 3TFCA 4LUJA 2KZHA 4O16A 3UWWA 3W1MA 2EKCA 4HSOA 4ICNA 2Z0IA 3E49A 2ZA3A 2VFEA 4JYEA 1EP2A 1FWWA 3NPVA 5K4XA 2YDAA 2TMDA 4M6VA 1LBLA 3G1SA 3STFA 4O12A 3EXRA 1QPRA 2ZZ3A 2OX1A 1SW0A 1XL9A 1G7VA 1MZHA 4RR4A 3MHUA 5IBXA 3NQ7A 3EX3A 1W5PA 2W79A 2B0MA 1JCYA 4BI5A 3RU6A 1OFQA 3GDKA 1GVOA 5DY3A 1IXQA 4PCFA 1CI1A 3W1QA 5G2HA 1RQHA 1K8ZA 1LBFA 5LNUA 5C55A 2EAWA 4NJGA 4FHAA 3MHFA 1PL9A 4WY0B 3TNOA 3O16A 1GVFA 3BV4A 4LC8A 5D2YA 2Y7EA 2Y88A 3O6DA 3KRUA 1OFRA 3R2GA 4WX2A 1W56A 4MJMA 1DBTA 3TW7A 3N34A 3LHTA 3C2FA 3PB0A 1HFBA 5K9CA 1FBAA 1FXPA 4EVZA 4WXYA 3W71A 4WY0F 3WK3A 2X30A 4AEOA 4QIUA 1FDJA 4LV9A 3TKFA 3RNDA 1PHWA 3TW6A 3A5FA 5CSSA 1AL7A 1JUEA 4JDBA 3UZJA 3W2UA 3HIJA 1H7WA 5BMXA 2A6LA 5U7SA 3LLDA 1F7BA 3G8RA 3NZRA 1YXDA 3QQ1A 2R94A 4HN4A 4RXFA 3Q94A 2FDSA 3P7YA 4AVFA 4NX0A 4JTSA 4QJ1A 1C8VA 2CZFA 1OX6A 3G8EA 3C3NA 2Y63A 2I1OA 5DCBA 1D9EA 4MIMA 1W31A 4NT0A 3ZFHA 2CLHA 3BLEA 3E9AA 1XBXA 4BR1A 1N7KA 3TFXA 3IVTA 4CQ9A 5BOOA 1BWLA 1G6CA 2O7SA 2PC4A 3P5YA 1K8XA 4HT3A 4M5PA 4QISA 2ZRYA 3O15A 1VH7A 4IQLA 4B5NA 4YCPA 3DBPA 4HPXA 2IQTA 5F1UA 1LROA 4R53A 1VPXA 5AN7A 4O53A 4KWVA 2EHHA 3C2RA 3SIZA 4PC8A 1UASA 1TPB1 3V75A 1IF2A 1T0OA 2VFGA 3QSRA 3AO0A 3NPWA 4IWWA 3QMSA 2QEZA 3TJLA 5CPMA 1SW3A 4O1CA 5A8GA 2O7QA 2HSAA 3P84A 1LORA 1AW5A 4FXSA 4E38A 3L0GA 1YADA 1OYBA 4EIVA 2V8ZA 1ME9A 3W74A 2C0AA 3W1UA 3TSDA 3OG3A 3IGUA 3UYCA 1XDLA 3VI2A 2DJLA 3G22A 3NQVA 1P5BA 1FUYA 3PG9A 2ZA1A 3MI6A 3L0NA 4ML9A 3P5ZA 5KZMA 2JGYA 2X2GA 3W7PA 3VE7A 3TH6A 4N6EA 1WOBA 1HG3A 1JCNA 4AXKA 1VHCA 1OJXA 3PM6A 4JD4A 4AWUA 5AHNA 4LC6A 2GOUA 3W72A 4HNVA 3WK2A 2VELA 4WZHA 1BEUA 5HULA 3W07A 3EKZA 3W7LA 2BXVA 3L66A 3YPIA 4ZVJA 1PIIA 3M16A 4HNTA 3MWAA 1X1ZA 4LVDA 4GUIA 4LT9A 4PFMA 1TV5A 1RD5A 3HMJG 3GLCA 5F2GA 3W7GA 4TMCA 2Q8ZA 3DFOA 4DF0A 1M7PA 1K8YA 4ZQNA 3KAOA 3O05A 5H2ZA 3IIPA 1HO1A 4NJIA 1B9BA 3ABRA 2WO5A 3L2IA 3TSBA 2V81A 4UNKA 2A7NA 1TTJA 3MJYA 3QEZA 3W1XA 1K7FA 4WUIA 3W2NA 2WV8A 3RMJA 3A24A 5CKSA 2DZVA 4YMZA 1SPQA 5HWNA 1ZAHA 4X2RA 3EWZA 3LXAA 2ISWA 3W75A 2G95A 4LRTA 2Y89A 1H7RA 4K8HA 4MVAA 3EX1A 3PR2A 2ZZ2A 5AHIA 5FEXA 3QJAA 5HR6A 4JX5A 3HG2A 4TO8A 3GNDA 3UWUA 3M43A 4UFKA 5F2LA 4FX8A 5HNRA 3O6YX 3M47A 1SW7A 2E6DA 5FEWA 3KXQA 3TR2A 2DJXA 3W70A 1OF6A 1C29A 3MUXA 2Q8LA 3STGA 3KRSA 5C5YA 4M6PA 7TIMA 4XWUA 2E6AA 3G0SA 2JKAA 3TJXA 3W7EA 1Z41A 2ISVA 1L6SA 4O11A 3PBVA 3S1UA 1VYPX 2ZCGA 2ZFAA 2VEMA 3CU2A 1WYIA 1AK5A 3FYPA 1VC4A 3W7QA 2ZDRA 1WDWA 3NQ8A 2OJPA 1DORA 4UXDA 3NQMA 4UFIA 4D2JA 4PA8A 1FCVA 2YFOA 1THFD 5HR7A 4QSHA 2FLIA 4HNUA 5CZJA 1TSIA 3S1VA 5I3HA 4N2YA 4XBSA 1W5OA 4NXKA 1LOQA 3Q37A 3C61A 3TX9A 1QPQA 2WQPA 1TPC1 3W73A 4DF1A 3FFSA 1A53A 2DZTA 3DH7A 2TRSA 4PTNA 3PB2A 4JEQA 4ADSA 5F4XA 3WJWA 3M5VA 3I7QA 3NVTA 4ORMA 1U5JA 4RLIA 4S2CA 4UMCA 1A5SA 3M7WA 4OWGA 1Z44A 4NJKA 4OV9A 3PBUA 2NUWA 4I7WA 1VGAA 1JJKA 3M5XA 3C2EA 4FX7A 1I2RA 4XTIA 3TQKA 4UTWC 2CLEA 1FWRA 4UFLA 1AG1O 1WBHA 5K4ZA 4JTEA 3IIOA 5LKYA 1JCLA 3QMRA 1F74A 1JQXA 3TC7A 4MZYA 3CPRA 5G2WA 1B57A 3SJ3A 4YXGA 4CCCA 1G7UA 4UTUA 1WQ5A 3R8RA 3R5EA 1Q6QA 4Z1BA 4Y8FA 1Z42A 3THAA 5L9FA 3TSMA 5I3FA 1QFEA 4RK8A 4IJBA 1TB3A 5BNKA 4ZQRA 4UTJA 2VFIA 3M41A 2C6QA 2C14A 2J24A 1OF8A 3DXIA 4K7VA 1TV7A 4GUFA 5LNRA 3HGOA 3LTYA 3GIYA 4NVTA 3QM3A 3CTLA 1TYGA 3FLUA 3PSWA 1LDCA 2BX7A 4LV4A 1H7OA 3W87A 3I7SA 3NA8A 1TTPA 2HTMA 2QDGA 3CIWA 3FEMA 3T55A 2PE4A 4Y6GA 3MBFA 2ZZ7A 1A5CA 1TPH1 1AW2A 4RZ5A 4DQWA 4MY1A 4RZ4A 4G1KA 1KFEA 3KVKA 4ADTA 1NSJA 2D73A 2TPSA 1HUVA 4JYDA 2FFCA 4FNRA 4R33A 3VNDA 3IEBA 2Q3OA 1EUAA 1FWSA 2AGKA 1DQXA 3T4CA 4KFOA 2DZWA 3H55A 1W0MA 2B4GA 4U28A 5CG7A 1RR2A 2R91A 1AMKA 4TU1A 2YXGA 1I2PA 3EKLA 3P74A 3S6DA 4IGHA 1K7XA 3W7OA 3L21A 4XBKA 1GYNA 1H50A 3C52A 4OQVA 4DO6A 1O5XA 3PC0A 3IVSA 2A7PA 4IXXA 3W7MA 1I45A 5KZDA 4OHQA 3TU9A 2CLMA 3HGJA 2NX3A 3F4WA 4JTUA 5LSMA 2RDUA 4C1KA 4KKXA 3SECA 4AH7A 4Z1DA 3W2MA 4BF9A 2H6RA 4O17A 3S0CA 4LY8A 3W23A 2QDHA 2V2DA 3WFAA 3UWVA 1FCQA 1PV8A 1V5XA 5DBTA 3M5YA 3B4UA 3GYEA 2NV2A 3CQ0A 5E0KA 3U2OA 1TPUA 4NNCA 1NFBA 4LVBA 5LGXA 5K7JA 4X22A 1JUBA 1K3UA 3KVLA 3LCFA 4JTIA 1TPWA 1OFPA 4HNNA 2ZBTA 3DFQA 1KFCA 3EWUA 1W3IA 3W84A 1QAPA 4O1AA 3S42A 3K30A 5K3VA 3FOKA 1YTDA 2QJHA 5D30A 1S5WA 4WY0A 4UNLA 3QH2A 3WJSA 1H7PA 1G4SA 2VFFA 3N19B 3NQDA 4WQ6A 5D32A 2PCQA 2NX1A 3TXVA 4MFEA 2FB3A 2H3DA 4RJEA 1KM6A 3T78A 1BTMA 2CFFA 4OT7A 4S1FA 1OABA 4WJEA 4FIRA 3HQ1A 1DQWA 4JIPA 3S5YA 4PODA 3DAQA 5F4SA 1VJIA 4XTDA 3LCWA 3W1TA 3NL5A 2G5WA 1ZCOA 4O57A 1LOSA 2CLFA 3MP3A 1KM0A 2DP3A 4FNQA 1WOAA 3OIXA 3ATYA 3HO8A 4OGZA 4RV8A 1DJNA 1CW2A 4UTTA 4K39A 3W1PA 3BLFA 2ZRWA 4ALDA 5LZLA 4FX6M 2XN0A 5CPNA 2FPTA 4MOZA 4YWIA 3QRHA 1VYSX 5HQEA 4TR9A 4EF8A 2R14A 1TPDA 3OA3A 3NG3A 5U4NA 2GVJA 3STCA 1YYAA 4UIOA 4N02A 3LRMA 3GAKA 4LTSA 3U6WA 1TTQA 4ZQOA 2BSLA 4M7SA 3DHFA 1PVNA 1FWTA 2P0OA 5C6MA 4K38A 4BWLC 5D2WA 2QKFA 1OYCA 3DENA 3MI3A 3N2XA 1JCMP 3W85A 4UFMA 2J27A 4QNWA 2A2IA 3HPSA 4DO5A 1JCJA 3UPBA 1GVSA 2VKZG 1VR6A 3ZWSA 3NEVA 3PY2A 3MI2A 1F76A 1ZAIA 4L4LA 1JVNA 3L5MA 3NOEA 5IBXC 3C56A 3N73A 4RX0A 3MMTA 4MZ1A 1QPOA 4S2BA 3EX4A 2NXHA 1KFJA 8TIMA 3KHJA 1T8XA 2TYSA 4NZFA 4IUOA 2FPVA 1AW1A 1YPFA 3ATZA 3W3OA 2F84A 1DKWA 1GVQA 1W54A 3S1WA 3UNDA 3EWBX 4NNAA 3W7HA 1QOPA 1J4EA 4GUJA 3TMQA 3TIMA 4DEFA 5F2MA 4IOTA 3G3MA 1LRNA 4Y96A 2E6FA 3THQA 1P0NA 2WNNA 3I6RA 3PUOA 5H91A 3Q2DA 4O4VA 1X6UA 1UB3A 2E6YA 2A4AA 2OCZA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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