1GWJ | Genus

Total Genus 132

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	132
sequence length	374
structure length	374
Chain Sequence	TSFSNPGLFTPLQLGSLSLPNRVIMAPLTRSRTPDSVPGRLQQIYYGQRASAGLIISEATNISPTARGYVYTPGIWTDAQEAGWKGVVEAVHAKGGRIALQLWHVGRVSHELVQPDGQQPVAPSALKAEGAECFVEFEDGTAGLHPTSTPRALETDGIPGIVEDYRQAAQRAKRAGFDMVEVHAANACLPNQFLATGTNRRTDQYGGSIENRARFPLEVVDAVAEVFGPERVGIRLTPFLELFGLTDDEPEAMAFYLAGELDRRGLAYLHFNEPDWIGGDITYPEGFREQMRQRFKGGLIYCGNYDAGRAQARLDDNTADAVAFGRPFIANPDLPERFRLGAALNEPDPSTFYGGAEVGYTDYPFLDNGHDRLG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal Structure of Bacterial Morphinone Reductase and Properties of the C191A Mutant Enzyme. pubmed doi rcsb
molecule keywords	MORPHINONE REDUCTASE
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas putida
total genus	132
structure length	374
sequence length	374
ec nomenclature
pdb deposition date	2002-03-18

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1gwjA00

1RR2A 3C8FA 3GDRA 3R89A 4KWVA 2PRHA 4UMBA 3M47A 1YXDA 1SO5A 5E0KA 1J4EA 3M7WA 4LVDA 1QPNA 4M6QA 4WXYA 1HO1A 2F84A 3NNTA 1SFJA 3W84A 3R13A 5A8GA 3WFAA 4KFPA 1SO6A 1L9WA 1NFBA 1O60A 2NUXA 5DBUA 1XBVA 3IEBA 1VH7A 3BW4A 5LNUA 1ICQA 1WX0A 3PBYA 4LVGA 1D3GA 1C9DA 3I7RA 1VLWA 1VYSX 3LGEA 3F03K 4R33A 4K7YA 2A6LA 4UFIA 1JUBA 4NJIA 5L9FA 1GVSA 4UUIA 4A22A 4UTIA 4DQWA 1A5SA 3MI2A 4GUFA 4JX5A 3LLDA 2E68A 4FNQA 4DO6A 4RXFA 1H7NA 3CHVA 1A50A 2WNZA 4Z0SA 2KZHA 3UWUA 3PBWA 1Z44A 2VFEA 1H63A 4O0ZA 3DFSA 4FEZA 6TIMA 4RV8A 4FX8A 2DP3A 2ZZ1A 5CZTA 2DJLA 3LTYA 5HWNA 4QITA 3W72A 4QQ3A 1YLVA 3G8RA 3W6YA 3M0ZA 3IV3A 3HGOA 1FCQA 3PB0A 4IX0A 1SW7A 3W1NA 3L0NA 4DXVA 4DBEA 5EBUA 1FCUA 2C1HA 5EMUA 3W87A 2H3BA 5K9DA 5FI8A 3AO0A 1L6YA 2QCMA 4LV9A 4UTLA 3NQVA 1XI3A 3TA6A 3CT7A 4XZ9A 4DF1A 1XL9A 3GAYA 3EXSA 4XBKA 1QOPA 2RFGA 5D09A 1DVJA 4H4IA 3L5MA 2J88A 5I3FA 3IGSA 2DJXA 4JTGA 5D05A 1LP6A 3PWAA 4UMAA 3V1PA 2ZYFA 3FKKA 2CZDA 1SZGA 1A5AA 3FS2A 1KM0A 4M5PA 5AC7A 3W2LA 1IIGA 1TCDA 1FUYA 1TPB1 4NVTA 4K36A 3LV5A 2H8ZA 2V81A 1Q45A 2CU0A 3W1MA 2VC6A 3C2OA 3VKJA 4LVFA 3G1HA 1GVFA 3L0GA 3B0VC 3B0UX 1VZWA 3FYOA 1LBFA 1VCFA 3TQVA 5HWMA 2TYSA 3CPRA 3BVJA 2YPIA 3W1TA 3QQ1A 3NZRA 4LUIA 3NGJA 3N19B 1LYXA 1KFLA 4ZL1A 3E02A 1KM3A 2QR6A 2YYTA 1JCYA 3PBUA 3QFEA 3GZ3A 1LOLA 1QDSA 1TMHA 3BLFA 3FA5A 4WJEA 3PY2A 5D2XA 1CI1A 4LOCA 1SO3A 3HGSA 4TIMA 3PSWA 4N9DA 5IBXC 3G1DA 3QW4B 2ZZ5A 3CWOX 2ZRYA 1EP1A 2YDAA 5G2HA 4DO5A 4HSOA 2YCEA 1H7WA 3NYZA 1KFJA 4RK8A 5FEPA 4K39A 4UR8A 2BWGA 3BG9A 1JQXA 4HNNA 1ML1A 3MUXA 4ALDA 3E49A 2QJIA 4Z08A 2FPVA 3EX3A 1T99A 4UFHA 4EVZA 5D2VA 1H1YA 1SUXA 1OX4A 1TTIA 5HINA 4MOZA 3EB2A 4AWUA 4FXSA 5KITA 5DCEA 4O50A 5HULA 2Y7GA 3IIOA 3OIXA 2YFOA 3OG3A 1QO2A 3W7PA 2X1UA 5GVJA 5J5DA 1WOBA 3BLEA 1ONRA 5HUOA 5KZMA 2VFDA 3SJ3A 1XBYA 1TPUA 2BTMA 4EIVA 4HKPA 1G4TA 1QFEA 3DKLA 4N02A 3TCEA 2QCCA 1JRBA 2J27A 4GUIA 1VHCA 1WA3A 1SZFA 2QUTA 4O18A 1AK5A 2Q3RA 2I9EA 1JCMP 5BRBA 3BG3A 1PV8A 4O19A 4UCGA 1UBSA 5AB3A 1W56A 4UFJA 2PURA 2Q3OA 1WXJA 1YDVA 3L21A 3LI0A 2E5CA 5G2IA 3NL3A 2V0TA 3W9ZA 1SZEA 1ME9A 3HPSA 4MKNA 4AMAA 4PEKA 4IPJA 2QAPA 3VFLA 1IXNA 3I68A 3PULA 1XC4A 4GUGA 4OBTA 4UTWC 1YXCA 3NR0A 3CC1A 4FNRA 1Q6OA 3C2EA 3T4CA 1DQWA 1KBIA 4JDBA 4UTHA 5LNVA 4LRSA 1AW5A 3G8EA 4ZQMA 1TV8A 1SU5A 3ABQA 2CLHA 3LCLA 4YWIA 2A85A 1HL2A 2X16A 4AHOA 3M6YA 3H55A 3C61A 1IXOA 3LHZA 4JTHA 1Q6QA 4WY0F 5CKSA 3M16A 1MO0A 2JGYA 1KFKA 1L2UA 3DFTA 3DENA 2O7QA 1GWJA 4N4PA 3GXTA 4O53A 5T26A 3WJYA 1T96A 3DU0A 1GG1A 4FX7A 2V5LA 1ZAIA 3KXQA 2Z6JA 4XKYB 3SGZA 1G4PA 4C1LA 3NXFA 3NM1A 3N2MA 4WD0A 3W83A 3WJZA 3QMRA 4IGHA 3IIVA 1THFD 2HMCA 3ZWTA 4HPJA 3PB2A 3GDTA 2CWNA 4BK9A 3LI1A 3B04A 2WOQA 2Z6IA 4K8EA 4UNLA 5LZLA 4PL1A 1Z41A 3DBPA 3HOJA 2QUVA 2I14A 1OYBA 3CTLA 5IBXA 5G2WA 1X1OA 2ZRXA 2E77A 1XBXA 1KV8A 3W1PA 1OK6A 2JBMA 4RR4A 1B3OA 3LTPA 3HPZA 1OX6A 5HNRA 3A9IA 1H62A 2BXVA 4BR1A 2CLFA 6ALDA 1G7UA 2X1SA 1KLYA 3NDOA 2ZA1A 3PUEA 3PVFA 5G1TA 2E6AA 3A21A 3E12A 3OBKA 4XWUA 5D37A 1EPXA 1RD5A 1W5PA 4MUZA 2DZXA 4Q33A 3GR8A 5AYXA 3TJLA 1S5WA 3O8AA 3UWYA 1UUOA 3NPUA 4ZQNA 3EX1A 3B8DA 4RX0A 3NPWA 3UWZA 4Q32A 1MSSA 1TPC1 3DI1A 2ZZ3A 3JRKA 4JYDA 3PM6A 4MYXA 3STFA 2CLIA 1TRDA 3DFNA 3UZ5A 1TPEA 3S0CA 2V2DA 2J6XA 2VOMA 5LNRA 4WQ6A 5CZSA 4PTNA 3L5AA 4EOUA 4U4MA 4JTLA 4FIRA 3W88A 1F76A 1NF7A 1EIXA 3MP4A 4RCXA 3THAA 3OEXA 4AHPA 1KTNA 2C19A 1TIMA 1S5TA 2A2IA 4FXRA 1YTDA 1M6JA 1TJRA 5L6UA 5TIMA 3KVKA 1SFLA 4E2BA 4O0KA 1E51A 2AGKA 3DI0A 1Z48A 4IMFA 2FQIA 1QO5A 4NNAA 3NQDA 1OFRA 4JIPA 2ATMA 4AWTA 5F1VA 5CPLA 1NVMA 4HNTA 2JGQA 4H3DA 3NG3A 4MVAA 1W1ZA 3B05A 3EWUA 3DAQA 3DHFA 4UTWA 5G4WA 3W7QA 3LLFA 2JK2A 1PS9A 4WUIA 3W7LA 1FBAA 4YLWA 5E1QA 3O06A 3STGA 3N73A 1VRDA 1K7XA 2C18A 2HS8A 3UXAA 1VQTA 5HUPA 1BWLA 3W7EA 4MYAA 4HT3A 1FWRA 2Q8LA 5FF7A 3IGXA 3G24A 1L6SA 3G0UA 1PE1A 2Z2UA 3UYCA 3AJXA 3H53A 5F2MA 1GVRA 2ZRUA 1GTHA 5D04C 4CCEA 1EEPA 3HIJA 4DELA 4DEFA 1BWKA 3B06A 2QEZA 3W22A 1I8JA 3LX9A 3L67A 3TW6A 3MYPA 5H2ZA 3QZEA 3QRHA 3G1VA 3IIZA 2QCHA 3PUDA 3SR7A 4O13A 1H7XA 1VLIA 4LS1A 4UTTC 1DHPA 4NJHA 3T40A 1GVOA 4CQ8A 4MJMA 4TO8A 1W8SA 4LWWA 4E2DA 3M41A 4CCDA 1BKSA 3LCIA 4KFNA 3UY8A 3P80A 3BW2A 5LSMA 2ISSA 3W2JA 4QSHA 3W86A 3PF3A 1MEHA 1GEQA 2BX7A 2G5WA 1F74A 3CB8A 2C13A 4CQAA 2R91A 3LM7A 2YR1A 2NUYA 1H5YA 1YDOA 1W5QA 5HMSA 1GJPA 1TV5A 1L6WA 4PCFA 2NX1A 3NQ7A 5F4WA 3I65A 3PSVA 4N2YA 3HMJG 1XDLA 3BV4A 3DFOA 5DLCA 1B9BA 1ME7A 2B7QA 2J9YA 2VFIA 2P10A 3HQ1A 4MY9A 2D73A 4XTDA 2Q8ZA 1I2QA 3MHFA 4OHQA 4A2RA 2QCNA 4JTIA 3NZ1A 1U5JA 4IXXA 3RF9A 5AHEA 3TAKA 1KM4A 5CG7A 2QUUA 1JCJA 5AC6A 4KFOA 1KBJA 1RZMA 5DCDA 3KHJA 1M7OA 2VFGA 4GBUA 3HG4A 5C2XA 3VNDA 3G3MA 1LOSA 4LT9A 2VKZG 1B57A 2QJHA 3FJ6A 1OFOA 2A7RA 2CZFA 1H7PA 5DELA 3P81A 4JTSA 2ZRZA 2PRMA 3F1QA 3OVRA 2CLEA 3DXIA 3U8GA 1B4EA 3BGGA 4JTEA 2Y89A 1NAL1 3NAVA 1OJXA 3NL2A 1XKYA 2P1FA 4NZFA 1WBHA 1JCXA 3HBLA 4Z1BA 1H60A 2ZBTA 3WK3A 3TMLA 2ATSA 4O57A 4HNVA 1TTPA 2X1TA 3WK2A 1C8VA 2Y62A 3MP5A 5AHFA 3OVPA 4E38A 4NNBA 1VR6A 4LU0A 2YYUA 1WOAA 2GQ8A 3IGUA 3E0IA 4K37A 4LVAA 1SPQA 4NU7A 1JR1A 1P0NA 1HG3A 4JTKA 2GVGA 5KSWA 1ZY9A 2GVJA 2ISVA 3UPWA 1GPWA 3W7HA 3N14A 1VS1A 3IRDA 4UC5A 3MHUA 1XCFA 2NXHA 2W0UA 3M9YA 2QCEA 3TIMA 3C6CA 5IM51 4LNYA 3VE7A 1UCWA 4O10A 3IVSA 4ADUA 2H90A 2V30A 3W7NA 5D2TA 3W2MA 1DQXA 3ZS4A 3C2FA 5LNSA 4A21A 3THQA 2NWSA 4IXHA 4JTJA 4K6AA 3NVTA 4MLRA 3BG5A 3DGRA 1FXPA 3UZJA 4O15A 4MZ8A 4UTTA 1KM2A 2VEMA 1NSJA 3EWYA 4MZYA 4JXCA 5C5YA 5U7SA 2E6FA 4ZQCA 3BW3A 2G95A 5K4XA 3GYEA 1A53A 1W5NA 3LOTA 3ATZA 3LCXA 4LY8A 1V7YA 5FEWA 4ORMA 2XN1A 5AHMA 1WBJA 5K4ZA 3S1VA 3GNDA 3O05A 5CPMA 4O16A 2FTPA 2TRSA 1VJIA 3ABSA 3K30A 5D33A 4IJBA 5DY3A 3BK0A 3HG3A 3M5XA 4XKYA 4AVFA 3FKRA 4OE7A 2ZTJA 5BMWA 1F6KA 4R53A 4PFMA 3LXCA 1IXPA 2B0MA 3BARA 1FXQA 3QM3A 4FHAA 5FEZA 1M7PA 1W3IA 4FB7A 1T8XA 1H1ZA 5HWJA 4Y6GA 2Y7DA 4NJJA 3M5VA 3W7IA 4PH6A 3GB6A 3HPXA 1F05A 3P7YA 1O95A 1ZAJA 4IOTA 4OWGA 1AW2A 4NJKA 1FWTA 5CSSA 5G4EA 4N6FA 1QR7A 4WX2A 1ZJIA 4JICA 4A29A 1SR9A 1YYAA 2OT1A 4UFKA 2F7FA 3I6RA 2GJLA 3OA3A 3FLUA 3LERA 4AHQA 5CZJA 3KRZA 3C4UA 3M44A 1GT8A 3W76A 4RZ4A 4HN4A 3P67A 2OCZA 1VCGA 2JKEA 3GLCA 4MFDA 3HGJA 2GVLA 4TX9A 2RDUA 1VYPX 2EAWA 4M19A 1SO4A 3KVJA 2OJPA 1Q6LA 5AHIA 1UUMA 1R2TA 4DPPA 2DZUA 1JCNA 1MZHA 4UR7A 1PL9A 1JUEA 1JVNA 2V8ZA 5TBOA 3DFPA 3NQFA 2NZLA 1GG0A 2TSYA 4FF7A 1GVQA 3B4UA 3NL5A 1W5OA 3G3DA 2IQTA 3W71A 1ZHAA 5DXXA 5KZDA 3SZ8A 3EX6A 4FNSA 1F73A 3PG8A 2TPSA 3L0KA 2NWRA 3GNNA 3W73A 2FB2A 2R94A 4YL2A 3A22A 2WSQA 1TQXA 5FF4A 3P60A 2QDGA 4LVBA 2C6QA 3A23A 3KX6A 5EL1A 2VXNA 3SGUA 3TX9A 1DBTA 3LTSA 1OX5A 4MJZA 2YFNA 3O1NA 2VEIA 4RZ6A 3W1AA 2NXGA 3ZFHA 1AL8A 1ZALA 2C15A 1G4SA 4MFEA 4W9TA 1GOXA 1FY6A 3STCA 3IIPA 1O4UA 2A21A 2FPYA 3NQ8A 3W7DA 3W1RA 5K7JA 5DCBA 3CIXA 2ZA3A 4JEQA 3YPIA 3KRUA 3W1QA 4WOZA 4UIOA 1WAUA 3DH7A 3S8HA 1NEYA 3QPZA 5U4NA 1AW1A 5F2GA 4YCPA 4IMDA 3EX2A 3LBCA 4JY9A 3P8IA 5KZEA 3TQ0A 4JX6A 3EX4A 3UY7A 1OF8A 3P82A 3P5ZA 1PIIA 4NQ1A 4PA8A 1K8XA 5K2ZA 1ALDA 5E93A 1A5BA 2Y70A 1ICSA 5AOUA 3TSDA 4OGZA 3FJLA 1DJNA 4CNPA 3PUOA 4JN6A 3ABRA 3W7GA 1XM3A 3NQEA 3TKFA 3NQGA 4BI6A 4X2RA 2PC4A 3LCWA 1K7FA 4O1DA 1DJQA 5J5RA 3HF3A 1K7EA 2B7PA 2QJGA 4QAIA 1S3HA 2QCDB 4IMGA 1RQBA 4JGDA 1X1ZA 1KTBA 4N9BA 2QAFA 3CEPA 4HHPA 4LS0A 1H7RA 1KM6A 3Q37A 1DV7A 1G4EA 3W1XA 3L2IA 4JY8A 5AHNA 3LHUA 2H3DA 4MY1A 5F2IA 1KW1A 4N6EA 4NJGA 4AB4A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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