1H4P | Genus

Total Genus 154

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	154
sequence length	408
structure length	408
Chain Sequence	YYDYDHGSLGEPIRGVNIGGWLLLEPYITPSLFEAFRTNDDNDEGIPVDEYHFCQYLGKDLAKSRLQSHWSTFYQEQDFANIASQGFNLVRIPIGYWAFQILDDDPYVSGLQESYLDQAIGWARNNSLKVWVDLHGAAGSQNGFDNSGLRDSYKFLEDSNLAVTINVLNYILKKYSAEEYLDIVIGIELINEPLGPVLDMDKMKNDYLAPAYEYLRNNIKSDQVIIIHDAFQPYNYWDDFMTENDGYWGVTIDHHHYQVFASDQLERSIDEHIKVACEWGTGVLNESHWIVCGEFAAALTDCIKWLNSVGFGARYDGSWVNGDQTSSYIGSCANNDDIAYWSDERKENTRRYVEAQLDAFEMRGGWIIWCYKTESSLEWDAQRLMFNGLFPQPLTDRKYPNQCGTISN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	The Er Protein Folding Sensor Udp-Glucose Glycoprotein:Glucosyltransferase Modifies Substrates Distant to Local Changes in Glycoprotein Conformation. pubmed doi rcsb
molecule keywords	GLUCAN 1,3-BETA-GLUCOSIDASE I/II
molecule tags	Hydrolase
source organism	Saccharomyces cerevisiae
total genus	154
structure length	408
sequence length	408
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.58: Glucan 1,3-beta-glucosidase.
pdb deposition date	2001-05-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1h4pA00

3OGRA 1DEDA 2G3IA 3AZTA 2VZUA 3NCOA 4B16A 2GJXA 2V3GA 2OSYA 2J7CA 3AIVA 1QNSA 5LA1A 1ISZA 1HT6A 1OGBA 3UG5A 1ISVA 1WDSA 3CZGA 1EXPA 3AS2A 3AIBA 3DHPA 3FN9A 5FIPA 4UFLA 4W7UA 4TTUA 4XZBA 2E8ZA 3VD9A 4QCFA 1KB3A 4PMXA 5A2BA 4W7VA 4CKQA 4JFVA 4HOZA 2J7DA 4UOJA 1BTCA 4ATWA 1W9BM 2D23A 1FP9A 4CD4A 1E6ZA 3VX0A 4LYQA 2XVPA 2CESA 4W84A 2XG9A 3SUSA 3WENA 2ZXBA 3O9NA 5EMYA 3WNMA 1TUXA 7A3HA 2WMFA 1UR2A 9CGTA 2WM0A 5A8NA 2E8YA 4PTVA 4AZGA 2BHUA 1W3KA 2DH2A 1PZ3A 1E5JA 1UR4A 2GK1B 3BMWA 2X05A 3BH4A 2W63A 2CNCA 3W81A 4MAVA 1KXHA 4UFHA 1V3HA 1KBBA 1JI1A 2VX5A 4R27A 4U3CA 2XVGA 3T08A 3U5YA 2EO7A 2GDVA 4AD0A 2XM2A 2YBTA 2BFGA 3CUFA 2WWDA 4W93A 3VM7A 1JXKA 3L4ZA 2G3NA 2YOCA 5A6BD 1NWRA 1UKQA 3ZM8A 2WVTA 1WO2A 4H8HA 3ZT6A 1UZ1A 4D6GA 4W88A 4ATLA 1OM0A 2AOSA 3ZSTA 1ZBCA 1JZ5A 4CD5A 2VR5A 3W25A 3TP4A 2WKLA 3MU7A 2OWWA 4ZENA 3A47A 2WHKA 1X6NA 1W32A 1ECEA 3IJ7A 5D8ZA 4JCMA 1K9TA 1TVNA 4RE2A 2O9RA 4Z2KA 6CGTA 2VVSA 1OWQA 5JIWA 4ACYA 3GXFA 1WZLA 4JHOA 5HOSA 5LA0A 3BGAA 3WDQA 2D1ZA 1CXFA 5E0FA 3VNZA 3QHOA 1AMYA 2QPSA 2VZOA 1BYCA 1VRXA 3OGVA 3GNRA 5BRQA 4AY1A 4HOXA 1OSEA 1PJ9A 1QW8A 1HVQA 3K46A 2PWFA 5D9NA 3WKZA 1ZBWA 3LPFA 1G0CA 3POCA 3KWXA 1WKYA 3ZR5A 1C93A 3MV11 3EBVA 3WDPP 3PZNA 1GQLA 2XSBA 4DWSA 1UR8A 5HDRA 3ARXA 3RM4A 3SCQA 3WF4A 1VFUA 1MW3A 3EMCA 1EH9A 1HL8A 3ALGA 1XCWA 2F2HA 4GI8A 1C8YA 1JZ2A 2WB5A 3E1F1 2PF0A 4W8LA 3KZSA 4D6CA 1LG1A 2E0PA 4CN1A 1R87A 3RIKA 5ECUA 3FY1A 4PCTA 1Q6DA 2EBNA 1JDDA 5M3WA 3L2MA 1E6SM 4P8UA 1CNVA 2WW5A 3UR7A 1E1FA 1BGAA 4PMUA 2J79A 1TVPA 1KR1A 5ABGA 1WZKA 3IAPA 3W26A 1U30A 3AI0A 2YDQA 1CGUA 1VEOA 3BLPX 1RPKA 2YLLA 3AYSA 2Y2WA 4WJXA 2Y4SA 1X6LA 1OBAA 1QNOA 4F9JA 1OD8A 1UWIA 5EBAA 2VURA 4P8XA 2VJXA 1NP2A 1Z32X 3SURA 1GQKA 1CGWA 4XV0A 3GXMA 1R85A 1SMAA 4MADA 4LGXA 1UD3A 1W1PA 4AISA 2CHOA 1TR1A 5A94A 2JALA 1E56A 1BYBA 2FDMA 2WSKA 4PSRA 4PMQA 3W6MA 5BRPA 1KWKA 3OZOA 4UNIA 2VTFA 3MUZ1 3OLDA 1GQIA 1I75A 5HBFA 5DFAA 2WMKA 2VCCA 1TE1A 1OIFA 1CXEA 4AD3A 3ZOAA 1E4LA 2CBIA 4QP0A 1LQ0A 4Z2LA 5E9AA 2WMIB 1UD4A 5A95A 1DWAM 1UD6A 3ARSA 6TAAA 1V6VA 1JYVA 2W91A 1R86A 4BQ3A 3WH6A 2GK1A 4AZ7A 4CVUA 4TXEA 1JGIA 1D3CA 5I77A 1LL4A 3HMCA 1FFQA 5IHSA 2WC4A 2NW0A 2BXZA 3UEQA 1HXJA 4J3VA 3CPUA 3N04A 4OBRA 2XPKA 4AZ6A 3VGFA 2YBUA 2GJXB 3M46A 4QDMA 1PX3A 1Q6EA 2A3BA 3WEOA 2VX6A 3BXWA 3N15A 1PX4A 1KXTA 1HJUA 4TX6A 1E70M 1MYRA 1Y7VA 1DHKA 1HJXA 4AZHA 1ODUA 2D22A 2DT1A 1GJWA 4YHGA 3L4VA 3RM9A 4D1JA 1GOWA 3VIOA 2Y24A 2A3AA 3F4VA 4PUDA 3AMKA 1V3LA 4C7DA 1GNXA 1B90A 1E9LA 1EIBA 2V3DA 3OG2A 4HP5A 4UQ9A 2JF6A 4NSBA 4PTWA 5BXPA 2XFYA 3WQWA 1QI2A 1HX0A 5BCAA 2VNCA 3THCA 3SUVA 3VTRA 4JIEA 2VX7A 3WUBA 2WCSA 5DT5A 1CWYA 1IZJA 5I6SA 1PIGA 3RMEA 1ZBKA 4TTGA 3VIPA 1E3XA 5EB8A 4F8XA 1CLXA 1DWGM 1W9VA 1K9EA 2E3ZA 5CJ5A 3II1A 4HZ8A 1V6XA 3WF2A 3QGVA 2EPNA 1QHOA 1JAEA 1MW0A 4YPJA 2WMHA 3CH9A 5FL1A 1PX8A 1GUVA 5A6LA 1YQ2A 2D0HA 1UR1A 4M8UA 3D5HA 3VM5A 1E4IA 4S3KA 1EGZA 2E4TA 4H8UA 5HPOA 4JL2A 5A8QA 1AVAA 3OZPA 3PZ9A 4J7RA 3NSMA 1OINA 4U31A 4YN5A 3VD4A 4D6HA 1KCKA 1J0HA 2G41A 2OSWA 4LYPA 3J7HA 2Y8VA 5D9OA 2IXUA 3QR3A 1EQCA 1OIMA 3AYRA 1NP0A 3PZQA 1CTNA 1M04A 6A3HA 1LJYA 2J8FA 4BQ2A 2EEXA 4QLLA 1KR0A 2CETA 4XB3A 1JF6A 4E4PA 4U5IA 3FHQA 4BF7A 4PMVA 1UQZA 3SEPA 4TUFA 1SYTA 1ISWA 4DM1A 2IUZA 5C70A 3W4RA 2OYKA 2GFTA 1ZB5A 2OYMA 4AZBA 1UKOA 1D2KA 4UOQA 3AHYA 2VZTA 5EFDA 3PZGA 3B9AA 1NQ6A 2J4GA 4D1IA 1H11A 4W8BA 4WKAA 1DP0A 1ZL1A 3ARZA 4PMRA 3RILA 2PI6A 5I0DA 3VDBA 3D3AA 4GI9A 1E71M 1BFNA 1V02E 3K8LA 1UOKA 2MANA 3CZJA 1WAWA 2ZWZA 2GVYA 3WBEA 2JEQA 3NDYA 1NARA 5FD0A 1BPLB 2DT0A 1JNDA 4LQ1A 3FXYA 4NF7A 4AD2A 5IFPA 1QNRA 5KZ6A 2W5FA 3AIEA 3PZIA 1VJSA 1H0IA 3AISA 4U2YA 3ZT5A 1US3A 1VAHA 4HU0A 4MTVA 1V03A 1KQZA 2D24A 1V3MA 1W9UA 5LA2A 4PUEA 3AICA 3MV01 4JL1A 3KL3A 3TOPA 3KEHA 2WVVB 4FK9A 1MW1A 3QHMA 3A4XA 3IK2A 1O7AA 4CD6A 4Z2HA 4Z2GA 3WUEA 2ZUVA 1W2VA 4KGLA 5DT7A 4AIEA 4D6IA 2WMIA 4EANA 3N12A 4U33A 2D20A 1QI0A 3VNYA 3L4UA 5M17A 5GNYA 3RPMA 3W38A 1XD1A 2RGLA 1V3JA 4OOUA 1H3GA 4E8CA 1UD8A 3U7VA 1V6UA 1G9HA 1F4HA 1QPKA 3ARWA 2CITA 4IUGA 3WQVA 3OB8A 4FLQA 2YA0A 5AY7A 1GZJA 2XWDA 2W67A 4PMOA 1E6XM 3RDKA 2J7HA 3L4TA 2V3FA 4JAWA 1XHGA 2W62A 3VMPA 4RE3A 1HIZA 2ZX5A 3MUIA 3U5UA 3HU7A 2O9OA 4LYRA 2ZE0A 4P8WA 3W82A 3WF0A 5ABFB 3WNOA 3MS8A 4JFWA 4W8AA 3AMCA 2BHYA 2JE8A 5D9MA 4V28A 5GQBA 1LF1A 2WNWA 3VMOA 3SUWA 1HKIA 2YDSA 3AHTA 1J0ZA 3VU2A 3BCFA 4H8VA 2YJQA 5A6BA 3HN3A 3AIWA 3IAQA 3WY1A 1B3XA 1M03A 4TVUA 1W9DM 2D2OA 4J3UA 1RP8A 3NJ3A 2AMGA 1GQJA 2QHAA 3TTSA 3VGBA 2G3JA 2WBGA 5IFTA 3POHA 4OUEA 1V0MA 1JZ8A 3TA9A 4QCEA 1Q6GA 3LPOA 3CO4A 3UERA 1CENA 4FLRA 1HKMA 2IXVA 1JNEA 4L4PA 1LL6A 4WKFA 4JKKA 3VOCA 3SIMA 2D3NA 1HKJA 4U3AA 3VIGA 4P7LA 1LL7A 1ZBVA 1V0KA 4M29A 4D6FA 3CUIA 3HJEA 1BYAA 1J0IA 2V3EA 4UQAA 1HNYA 2YA2A 4S3JA 3I3DA 3AXIA 3FHAA 4CU6A 1KWGA 1JZ7A 1V6WA 4V2XA 3WNKA 1B30A 3QOKA 5I79A 3KE0A 2CHNA 1QNQA 1B3WA 3APGA 2V38A 2XYLA 2WCGA 1ESWA 3MUAA 3I3EA 2VL4A 4M80A 3CUHA 4GPNA 1E6RA 1FA2A 3CZLA 1XH2A 3W53A 1ZS2A 2C0HA 1M7XA 1PBGA 1UKTA 3WD0A 2WC3A 1I1XA 1XSIA 2OWXA 4TOQA 4HMCA 4MDPA 1HF6A 4ZXLA 2XVKA 4GINA 1NWSA 1CGTA 1H4PA 2V5CA 4JHZA 4UQDA 1TA3B 4PN2A 4D6DA 1MFUA 2UY3A 5CG0A 1V02A 2UY4A 1Q6FA 5CGMA 1ODZA 4P7RA 3AJ7A 2JEPA 5A69A 2ZWYA 3PTQA 1BG9A 4H7VA 1G1YA 3PBGA 3ARVA 1W1TA 2ZX9A 1BVZA 2DSWA 4AD1A 3AQUA 1G5AA 1E0XA 3T0BA 5FCZA 2VMFA 1KCLA 5E0CA 1GOMA 3VDCA 1J10A 4TVCA 3FAWA 3WEMA 2J7FA 3NUKA 3BAIA 3F5KA 3SCNA 3UG4A 2ZOXA 4OOZA 1NM9A 1JDCA 1JFXA 4MNMA 2UY2A 2GDUA 1UWTA 3PTKA 1E1EA 1KGUA 2X2YA 1EQPA 5IDIA 2J75A 7CGTA 3ZIZA 3AHVA 1MVYA 1FHDA 1WP6A 1GOKA 1GOIA 2WK2A 5GNXA 2WVVA 3TTYA 2FH6A 4MJ2A 3WL0A 3AIQA 2X0HA 1H49A 2X09A 3SCWA 2JIEA 2WVSA 4QFUA 4X0VA 2PBGA 1CBGA 4W5ZA 1K6AA 3EMQA 1HL9A 1JL8A 1OB0A 5GPRA 3SCPA 2YL5A 5ABHA 1CGXA 1UYQA 3N17A 2VVNA 1MQRA 2V5DA 4IPLA 1MXDA 4W89A 4DUXA 2E9MA 5GNZA 3PN8A 2ZUTA 4P8VA 2YLAA 5CLTA 5AYBA 1CEOA 3CHFA 4A3YA 1L8NA 3WNLA 2CBVA 1H1NA 2ZX7A 2FGZA 4UFJA 3WF1A 2HVMA 2BVDA 3EDFA 2OWCA 5ABFA 3SCTA 1ZJAA 2J74A 4CCDA 1WDPA 1E6PA 2VO5A 5TD4A 1G94A 4HPGA 4GO9A 4ACZB 3CHDA 3WDJA 1HJVA 4WKHA 2ZXQA 5KEZA 2X1IA 2YA1A 1CPUA 4PEEA 1B3VA 2J77A 3W28A 2ZUUA 3CMGA 2BXYA 1UKPA 2DSZA 1YHTA 1MQQA 4JZ5A 4J3WA 1H41A 2YL9A 3SCSA 1IZKA 4U5KA 1FH8A 3W29A 3AHZA 3L2LA 3VILA 4PYSA 1AQ0A 1E4MM 1E43A 3CZEA 1NH6A 4CN6A 1HP5A 3GM8A 3WELA 1UWRA 3SCOA 3ZMRA 3CHEA 1NWUA 1C7SA 2WCAA 2PWEA 4NI3A 1TZ7A 1KGWA 5I24A 5E6YA 4ZE5A 3T2QA 5FL0A 4F79A 5LYRA 1J0JA 2W66A 5DF0A 2BS9A 3AMDA 3OIHA 4M81A 2W92A 4OIFA 3LPPA 3EMZA 1EDTA 4TX8A 2WSPA 1AQMA 1CGVA 1XCXA 3AXXA 1QI5A 1BF2A 3I3BA 5A6SA 4UCFA 1LWJA 2A3HA 4WF7A 3L4XA 3WMBA 5JBEA 4AD4A 2XTKA 2ZXAA 4W7WA 2O92A 4M1RA 1UWSA 3MMUA 5A6MA 2XIBA 1E55A 4UFKA 2BHZA 1PAMA 4PTXA 2Z1SA 3ARTA 5FOOA 1ZU8A 2OYLA 2J25A 3AIUA 3WQ6A 4HPHA 1MWOA 3MMWA 4EKJA 2WZHA 3GBEA 3GTNA 1W9XA 4A3HA 3AXHA 2VRJA 2NSXA 4N42A 1XH0A 3ZJ7A 3WUGA 4FF5A 4UZSA 5A6KA 4HA1A 3OBAA 3K4AA 2BVYA 1WPCA 5IXEA 1A47A 4A4AA 1K9DA 2BNJA 2EPKX 4FLSA 3WMSA 3UETA 3FW6A 2PWGA 2GJPA 1DWJM 4QLKA 1RH9A 5M03A 4CUCA 2GSJA 1MFVA 4JFUA 1TA3A 4B9ZA 2VZVA 2X0YA 2EPLX 2ZX8A 2ZUMA 2EQDA 1XD0A 1RD6A 2ZXDA 1MXGA 1OT2A 4HU8A 2CKSA 1WNOA 3WD3A 3GH4A 4AW7A 1V08A 4B3KA 2QMJA 1JI2A 2ESCA 8CGTA 2CXGA 3CGTA 3WUFA 1VBUA 1B9ZA 3WD2A 3TTQA 4PMYA 1Q6CA 3WF3A 1XH1A 2J8GA 1PZ2A 3DYMA 3WFLA 4UTFA 5I78A 4PRWA 3SCUA 5CZKA 3ZQ9A 1EOMA 1TG7A 3AOFA 3MO4A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1H4PA

Total Genus

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Chain Sequence

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