1H4PA

Crystal structure of exo-1,3-beta glucanse from saccharomyces cerevisiae
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
408
structure length
408
Chain Sequence
YYDYDHGSLGEPIRGVNIGGWLLLEPYITPSLFEAFRTNDDNDEGIPVDEYHFCQYLGKDLAKSRLQSHWSTFYQEQDFANIASQGFNLVRIPIGYWAFQILDDDPYVSGLQESYLDQAIGWARNNSLKVWVDLHGAAGSQNGFDNSGLRDSYKFLEDSNLAVTINVLNYILKKYSAEEYLDIVIGIELINEPLGPVLDMDKMKNDYLAPAYEYLRNNIKSDQVIIIHDAFQPYNYWDDFMTENDGYWGVTIDHHHYQVFASDQLERSIDEHIKVACEWGTGVLNESHWIVCGEFAAALTDCIKWLNSVGFGARYDGSWVNGDQTSSYIGSCANNDDIAYWSDERKENTRRYVEAQLDAFEMRGGWIIWCYKTESSLEWDAQRLMFNGLFPQPLTDRKYPNQCGTISN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The Er Protein Folding Sensor Udp-Glucose Glycoprotein:Glucosyltransferase Modifies Substrates Distant to Local Changes in Glycoprotein Conformation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUCAN 1,3-BETA-GLUCOSIDASE I/II
molecule tags Hydrolase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 154
structure length 408
sequence length 408
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.58: Glucan 1,3-beta-glucosidase.
pdb deposition date 2001-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1h4pA00
1C8XA 1UKSA 3VPLA 1QNOA 4M24A 5C71A 1QI5A 5HPOA 1W2VA 3M7SA 3MUAA 3IK2A 1OD0A 4W7WA 3WDHA 4C7DA 4YHGA 1ISWA 3WH9A 9CGTA 1HL8A 1NQ6A 4UFMA 1C7SA 3W6MA 1CGXA 3MS8A 2CESA 1JFHA 2J7CA 1XGZA 3WF0A 3WNKA 1E6XM 4JKLA 2ZUUA 3VM5A 3AHXA 5A2BA 1ITXA 5M03A 2VZUA 3WDRA 1UG6A 1DWHM 2A3CA 1PIGA 1BYCA 1BVNP 4PMUA 3EDFA 1M01A 3AIBA 2J47A 2JALA 3UEQA 2ZUVA 4BZYA 2WXDM 3MO4A 1B3XA 3K4DA 4TX8A 3CZ8A 5FD0A 4Q7NA 3OZPA 3GNRA 3L4ZA 1UH2A 3NDYA 2J25A 2VX6A 1RP8A 4CU7A 5E6YA 3BAXA 3VMPA 3AHZA 1R86A 3FHAA 5A2AA 1QNQA 3PTMA 1ITCA 1UH4A 1R7AA 4ZEPA 1E9LA 3K46A 3BAJA 1B31A 4B9ZA 3KL0A 3RCNA 2XPKA 2ESCA 3BAYA 4M56A 2GVYA 4J3WA 2WWDA 5FKYA 1GOIA 3W25A 3ARUA 5A3HA 3W37A 4A3HA 4PMYA 2X05A 2X0HA 3W26A 3HN3A 2GJRA 2QPUA 3WEOA 1E3XA 1KGXA 2DSKA 4HP5A 4AD5A 1J10A 5I3DA 1IZKA 4E8DA 4GINA 4HPGA 1KBBA 1VEOA 2EO7A 3APGA 3WMCA 1B2YA 1HKKA 1E6SM 2WM0A 1QHPA 2GDUA 3GH4A 2OWCA 1EDQA 2RGLA 5LA0A 1AMYA 2A3EA 1QI4A 3L4WA 1HVQA 4HMCA 2WMIB 5EMYA 1SR0A 2PWDA 3U7BA 3WENA 5E0FA 4WF7A 3VD7A 1C92A 1Q6DA 1UWQA 4CD8A 4XV0A 5A6JA 1C8QA 3CHEA 2GFTA 2F61A 1AVAA 2V3FA 3AIVA 2XVKA 4D72A 2WHJA 3ARSA 3OLGA 4D6CA 1Y7VA 4CD4A 2XIBA 2BVDA 5EB8A 3N13A 5CQ1A 4HZ6A 4FLOA 1HJXA 1ZBKA 3MANA 5E70A 5LA1A 4D6GA 1DWAM 2OYLA 3VD5A 2JFEX 1BG4A 1JYNA 4B16A 1QPKA 4P8XA 1KGWA 2AAAA 2IXUA 1W1TA 2UY5A 3ZM8A 3IJ9A 3T0BA 2XSBA 3A4WA 1LG1A 1GOWA 1OIFA 2NT1A 3VIGA 5D8ZA 1LWHA 3FNDA 1EOKA 1GZJA 2XFYA 3GH7A 3TTYA 4MB3A 1B0IA 1QW8A 1ODUA 4ZENA 1V3IA 1LL6A 1JI2A 2MANA 2FHFA 4AXNA 3N18A 1BF2A 1OT1A 3AOFA 4GQQA 3HMCA 1JXJA 1JF5A 3W81A 4JHZA 2V3DA 4HZ7A 3KL5A 4EK7A 3AIUA 3WF2A 1UWUA 4KWUA 1Q4NX 1E15A 1HKJA 1CZ1A 2YJQA 3QR3A 1UQZA 1CGWA 4AD1A 3AZSA 2J8GA 4D1JA 1FH9A 4PMQA 2WANA 1E0XA 5D8WA 4V2XA 3RM8A 1HIZA 4FMVA 2Y4SA 2PB1A 3L2LA 5C70A 1HXJA 3W4RA 1QBAA 1WAWA 3VINA 2YBUA 1W9BM 2FHBA 3EDKA 1W9UA 2J78A 1G9HA 2YLAA 4AC1X 3W6LA 2ZX5A 4FLSA 1GHRA 4IPLA 3WUFA 1BVZA 1G01A 2W63A 4B3LA 5EBAA 2WSKA 3F5JA 2OSXA 5DFAA 3WBEA 3VGBA 2ZWZA 3RMEA 1TMQA 1MFVA 5D4YA 3UR8A 3S6TA 3AS3A 4GXPA 2JF6A 4HA1A 3AMDA 1MXDA 2WVSA 4NRSA 2WAGA 2TAAA 5AC4A 2OLHA 4PCSA 3WDIA 1E55A 5AYBA 3VD3A 1ZL1A 1CWYA 3NCOA 5BRQA 4WSKA 3PZOA 2IUZA 1WNOA 4MADA 1V3KA 1GJWA 2DEPA 3FN9A 2FGZA 4MNLA 1XC6A 3CZKA 3UG4A 2BNJA 1C91A 1LLOA 3GDBA 4ZXLA 2CYGA 1NWUA 3GNPA 4OJYA 4UOJA 1GUVA 3ZJ6A 3PZMA 1RP9A 1V3MA 2Z1KA 3A6OA 2B31A 3L2MA 4HA4A 3QGVA 3WEMA 2ZX7A 1JZ4A 4M80A 5D9PA 4PTVA 3VIHA 1EA9C 4JKKA 4W93A 5DMYA 1QW9A 1EO5A 1H2JA 1NH6A 2F8QA 1MVYA 2DH3A 4IPNB 1H11A 2GSJA 1NWRA 1TVPA 1TCMA 3WH6A 1D2KA 3WY1A 3ARQA 3VO0A 1UH3A 1ISZA 3CIVA 3NDZA 3GNOA 2XTKA 3ZR5A 3VX1A 3CZEA 4GZJA 4AIOA 5FL1A 3D5HA 4GZEA 4ACZB 2Q8XA 5D9MA 1MQQA 2WZEA 5BYWA 3PZTA 3S2CA 4QLKA 5CXPA 2ZX6A 1ISVA 4JCMA 4PRWA 1HJWA 2Y8KA 3WF3A 1WKYA 2WMGA 2VRQA 3N04A 2VX5A 2J77A 3CPUA 4D6IA 2V5DA 4TXEA 4AMCA 1JNEA 3SCTA 3EDJA 1X6LA 5DT5A 1SFSA 4IM4A 1UA7A 2CPUA 1K9FA 3DECA 4PUDA 4UFHA 3AISA 4AZ5A 1FP9A 4Z2KA 1H41A 6A3HA 5ABFA 4CGTA 3WMBA 4HA3A 3WD3A 2XWDA 3F4VA 4M81A 4AY1A 3PN8A 2D1ZA 2YDSA 1KCLA 1V3JA 4AZGA 2WBKA 2PI6A 2G3MA 3OZOA 3WQ6A 2VURA 1UHVA 3VDHA 1VEPA 3MUIA 3WNNA 4DWSA 1H09A 2QHAA 1CGTA 1B30A 3DYOA 5A6KA 3O6AA 2VO5A 3T09A 1V02A 5JBEA 2A3HA 3WNPA 3VMOA 3B8SA 4W8BA 1DWJM 4RE4A 1WPCA 4RE2A 3RIKA 4D6FA 1KR1A 1DEDA 4M82A 1S46A 1XYFA 3EBVA 1D3CA 3VIIA 2EPLX 1BSIA 1NWTA 3ARZA 4P7RA 3ZSTA 3VGGA 3CUGA 5DF0A 4W89A 1PX4A 1UD3A 2YIHA 4CN1A 1W2PA 2JF7A 3UR7A 1FFQA 1FHDA 3AHVA 4GI8A 1LJYA 2GK1B 2CXGA 3L4XA 3PZGA 1K6AA 3W38A 2ZUWA 5BROA 4Z2LA 2WNWA 4ATWA 1JF6A 1MW3A 1XD0A 1JGIA 1KBKA 4U3AA 2WVUA 1QOXA 3VVGA 3OB8A 2WMJA 4IISA 2VVSA 1V3LA 3WDQA 4EE9A 1X6NA 2CEQA 2GUYA 4JL1A 1XHGA 1QNPA 4A3YA 5A69A 1GW1A 4B15A 4QCEA 4U5IA 4BQ3A 4E2OA 4TVCA 1LL7A 4AD2A 2HISA 2V3EA 4W88A 3BLPX 4UCFA 1QHOA 4X0NA 1O6IA 1XCWA 2XGBA 1Q6GA 4D6HA 1V02E 4HMDA 2CETA 3G6MA 2CITA 1V0KA 2YL6A 3CUIA 1W1PA 1Z32X 1HJSA 1UYQA 3SCVA 3OA5A 1NWSA 1W9PA 3MMWA 1V3HA 2HVMA 4V27A 2WVVB 2FH8A 3MSGA 1J0ZA 1TG7A 3AS1A 3A4AA 4UOQA 1R8LA 4W8AA 3UERA 1CYGA 3ARWA 1BGAA 2G4FA 1KWGA 1CLVA 3EMZA 4RE3A 1JNDA 4AZCA 5FOOA 3I3DA 1KQYA 1JD7A 3CZGA 2WHLA 1CPUA 3GH5A 3EMQA 4GO9A 3IJ7A 2VCBA 4F9JA 4PUEA 2YA0A 1EIBA 1UD2A 1LL4A 1J0IA 4DWSC 2XWEA 3U57A 1DP0A 3VDCA 1BYDA 1DWIM 3GYCA 2EPKX 4AZHA 4CN6A 3CBWA 1ECEA 4WSJA 3OLDA 1E5NA 1UOKA 3QOMA 4PSPA 1GONA 3DHUA 4UFKA 4CCCA 1JZ7A 1ISXA 1UD4A 2VQUA 3B9DA 1Q6FA 3ARVA 2WC3A 3OGVA 3WDJA 2YBTA 2BS9A 3E1F1 4CU6A 2BY1A 1W1VA 1TA3B 2VRKA 4L4PA 1CEOA 1NOUA 2VR4A 1FHLA 1GOMA 4GIAA 4CCDA 3KWXA 4TUFA 2FDMA 4LXFA 5CLWA 3VIMA 1GJUA 3QHNA 4BS0A 2QF8A 3J7HA 4EANA 3LPPA 4M8UA 1FH7A 3EMCA 4HZ8A 1GVIA 1PX3A 1GQIA 1UR0A 3ALGA 4U3CA 3AZRA 1B90A 4WKAA 1R7OA 2CBVA 3NSMA 2BY0A 1XSJA 1CGVA 3ZJKA 2E3ZA 4D6JA 1OD8A 3T2OA 1UWRA 4K68A 4UNIA 3M46A 3ZJ7A 1JZ6A 2D0HA 1PPIA 4ATDA 2CBJA 2YL8A 3CZJA 1GQKA 3AMCA 4F66A 4JFTA 4PMRA 1J0KA 4MNKA 2VRJA 5CPQA 3FAXA 1MQPA 1UUQA 4U5KA 4X9YA 2DSZA 2XHYA 5JBDA 2FHCA 4S3KA 1I75A 1Q6EA 3PZVA 1MXGA 1H0IA 3WFZA 1QVBA 1FA2A 3AMGA 4C7GA 5A6BA 1J0YA 3PZNA 2XFRA 4LYRA 4KMQA 4DUVA 4MJ2A 1K9EA 2W92A 1E6ZA 1BTCA 1YHTA 2E9LA 5HBFA 3K4AA 1QI3A 5HPCA 1AQMA 3ZT6A 3VILA 1IZJA 2D2OA 1DWFM 2ZICA 5ABGA 4XZBA 4M1RA 2EJ1A 3PZQA 3AXHA 1D7FA 4TVUA 2DT3A 1V6WA 3U5UA 4MNJA 1X1NA 3OLIA 4H2CA 5KZ6A 2XVPA 1E4IA 3SCNA 3PHAA 2VR5A 5CGTA 1CECA 2WHMA 4OBSA 5A8PA 3EDEA 4MB1A 2Y2WA 3O9NA 3WH7A 1WE5A 3JUGA 4HOWA 1JAEA 3ZMRA 2BXZA 3VGDA 1OM0A 1ZBVA 3N12A 2XM2A 3FHQA 5TD4A 2OYMA 3F5KA 1CXKA 4YHEA 5FL0A 1ZJBA 1HX0A 1UR9A 3VX0A 1VBUA 2D23A 1WDRA 5I0DA 1B3ZA 4Z2JA 3A3HA 3BGAA 1GVYA 1QNSA 1JYVA 4AEEA 1R87A 3BSGA 1KGUA 3BSHA 3BC9A 4MPKA 5CSYA 1PBGA 1UR4A 2W61A 4UQAA 2DDXA 1H49A 3N11A 1OWQA 4JFUA 2X0YA 2J7EA 5BRPA 4YN5A 1E71M 1EDGA 2DSWA 5ABEA 5JUVA 2CHOA 1K9DA 5A8NA 1LQ0A 1JI1A 2X2YA 4KRTA 4JFSA 5BXTA 2WCSA 1BLIA 4P7OA 1FFRA 1HNYA 3GXDA 5E09A 3WN6A 1VJSA 3I3EA 1EOMA 3ZQ9A 4UTFA 1PEZA 3NIYA 3CH9A 2WMIA 1TFVA 3HU7A 5A8QA 1MQRA 4B9YA 2NSXA 3A47A 3G6LA 1F4HA 2OSYA 1XSIA 1W3KA 5FIPA 1NOWA 4HU0A 2VMFA 2OWXA 3CUJA 2CKRA 4JFWA 3AMKA 1KWKA 4UQ9A 3BAKA 5GNYA 1MWOA 2V3GA 1AQ0A 3N17A 1OB0A 4E4PA 3AIQA 1UA3A 5AY7A 4NSBA 1B3WA 2WC7A 5IFPA 3WSUA 2ZUSA 2GJXB 4QLJA 4GKLA 5C8BB 3ARPA 3SCPA 3PZIA 4UFIA 5I23A 2WLYA 4B3KA 3AJ7A 2GDVA 3FY1A 2W67A 3DYPA 2XSAA 2O9TA 2J7BA 4LQ1A 2WMFA 4J3XA 4FF5A 3WD0A 5GQBA 2JE8A 4P7LA 1JZ2A 2ZUTA 1XD1A 3GXIA 5A2CA 3TA9A 3VIFA 2BVTA 3AI0A 4YPJA 1VAHA 5A94A 3CUHA 4BF7A 4U31A 1CGYA 2VL4A 5BXRA 4CVWA 3DYMA 1F4AA 3W24A 1EQCA 3VDAA 5I6SA 1VFOA 1V0LA 4J28A 2C0HA 1VFFA 4FLRA 2X8RA 5ABHA 1QI0A 2BHZA 1K9TA 2EPOA 4MAVA 5ECUA 1DTUA 5CPSA 3GXFA 4V28A 3IJ8A 3WL0A 3RDKA 2WC4A 5GNXA 3T08A 2BXYA 1CENA 1FOBA 5M5DA 1VEMA 1JD9A 3LPFA 3GXMA 4F9DA 3IAQA 3UETA 2O9RA 2X1IA 1JIBA 4WIWA 3D3AA 4KH2A 2J62A 4LPCA 2Y24A 3RM9A 3WH5A 2DPEA 3F5LA 4OZOA 4H7VA 2J4GA 1UKQA 3GBDA 1KFWA 3CMGA 4UZSA 2CIPA 4Z2HA 1J01A 4CVUA 1HP4A 1QI2A 3MUZ1 1E73M 2CNCA 2DT1A 2PWFA 4P8VA 1JXKA 1VBRA 5IDIA 3PBGA 1US2A 2OSWA 3WL1A 4D6EA 1WCGA 2CCRA 3ZT7A 4CD5A 2VT0A 1U30A 3BAIA 2VJXA 2XVGA 2XVNA 1MFUA 1W3HA 3WBAA 3WF1A 4HOZA 3K8LA 2WB5A 3NUKA 4CD7A 3VIKA 1HF6A 4PTMA 3CHFA 2O92A 3MSDA 1VRXA 3RILA 4W8LA 1GQJA 2XGIA 3NJ3A 4AEFA 1XYZA 5IHSA 4LX4A 2YL9A 1TZ7A 4LYPA 3AXIA 4JCLA 1OINA 3LMYA 1TVNA 3WUBA 4UQBA 3LPGA 5DO8A 1KR0A 1NARA 1UWTA 2D3LA 4M29A 3UG5A 4Q22A 1HP5A 2AMGA 1CLXA 6TAAA 1XH2A 1JFXA 1UZ4A 4EAMA 1ZBWA 3B9EA 3WD1A 5CPTA 4D1IA 3CHDA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1C8X A;  1UKS A;  3VPL A;  1QNO A;  4M24 A;  5C71 A;  1QI5 A;  5HPO A;  1W2V A;  3M7S A;  3MUA A;  3IK2 A;  1OD0 A;  4W7W A;  3WDH A;  4C7D A;  4YHG A;  1ISW A;  3WH9 A;  9CGT A;  1HL8 A;  1NQ6 A;  4UFM A;  1C7S A;  3W6M A;  1CGX A;  3MS8 A;  2CES A;  1JFH A;  2J7C A;  1XGZ A;  3WF0 A;  3WNK A;  1E6X M;  4JKL A;  2ZUU A;  3VM5 A;  3AHX A;  5A2B A;  1ITX A;  5M03 A;  2VZU A;  3WDR A;  1UG6 A;  1DWH M;  2A3C A;  1PIG A;  1BYC A;  1BVN P;  4PMU A;  3EDF A;  1M01 A;  3AIB A;  2J47 A;  2JAL A;  3UEQ A;  2ZUV A;  4BZY A;  2WXD M;  3MO4 A;  1B3X A;  3K4D A;  4TX8 A;  3CZ8 A;  5FD0 A;  4Q7N A;  3OZP A;  3GNR A;  3L4Z A;  1UH2 A;  3NDY A;  2J25 A;  2VX6 A;  1RP8 A;  4CU7 A;  5E6Y A;  3BAX A;  3VMP A;  3AHZ A;  1R86 A;  3FHA A;  5A2A A;  1QNQ A;  3PTM A;  1ITC A;  1UH4 A;  1R7A A;  4ZEP A;  1E9L A;  3K46 A;  3BAJ A;  1B31 A;  4B9Z A;  3KL0 A;  3RCN A;  2XPK A;  2ESC A;  3BAY A;  4M56 A;  2GVY A;  4J3W A;  2WWD A;  5FKY A;  1GOI A;  3W25 A;  3ARU A;  5A3H A;  3W37 A;  4A3H A;  4PMY A;  2X05 A;  2X0H A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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