1H5VA

Thiopentasaccharide complex of the endoglucanase cel5a from bacillus agaradharens at 1.1 a resolution in the tetragonal crystal form
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
301
structure length
301
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRESA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus agaradhaerens
publication title Atomic Resolution Structure of Endoglucanase Cel5A in Complex with Methyl 4,4II,4III,4Iv-Tetrathio-Alpha-Cellopentoside Highlights the Alternative Binding Modes Targeted by Substrate Mimics
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE 5A
total genus 123
structure length 301
sequence length 301
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2001-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1h5vA00
1GORA 1W32A 2WMJA 5HDRA 2EQDA 1TUXA 3W0KA 3PZIA 3VKKA 4C7DA 3N13A 1E0WA 1ZB5A 3WMCA 1V0LA 1O7AA 3A4AA 3FNDA 4JKLA 2V5DA 3UG4A 1BF2A 1PZ2A 3MUIA 4Z2KA 2WMIA 1RP9A 1LL4A 3AICA 5IXEA 1E3XA 5D4YA 1UG6A 1CXHA 3LPGA 3PTQA 1AQHA 3WF3A 4M8UA 2J78A 3W24A 3BLPX 3W53A 1WNOA 4MB4A 1HJXA 1HJSA 2X8RA 2WC4A 2ZIDA 4HA4A 3FXYA 3B9EA 3CZLA 2FGLA 3O9NA 4BQ3A 1LL7A 1KQZA 1MVYA 2DT0A 3VD7A 1B3VA 1B3WA 2E8YA 3T08A 2NSXA 2VVSA 3WBEA 4B9YA 1V0KA 2BS9A 4GZJA 3OGSA 4PTWA 3BXWA 2E4TA 4HU8A 1NM9A 1HJUA 1WDQA 2VCBA 3ECQA 5CPTA 5ABHA 3WEZA 1K9EA 5F7UA 3G6LA 4OOUA 4N0RA 3AFBA 3OG2A 3GYCA 4UQEA 3ZJ8A 3ZOAA 1V08A 4CD5A 3M46A 2A3EA 5CPSA 1HT6A 4UCFA 3VGHA 3L4ZA 1VAHA 4W5ZA 3WDIA 1CGXA 3TOPA 2ZX6A 1XYZA 2PWGA 2YBUA 2JFEX 4EE9A 1GHRA 2DQXA 1PIGA 5KEZA 1K6AA 3UEQA 3AHXA 2D0FA 4CCDA 4UFHA 3RILA 4CCCA 1TE1A 3WDRA 1NARA 1TVPA 4D6EA 2YIHA 1EH9A 2CHOA 3SUSA 4LYRA 4CCEA 1MYRA 2WBGA 1V03A 3G6MA 4C7FA 1XSJA 3ZMRA 4PMUA 4HMCA 4PTVA 2QMKA 1UD5A 1CPUA 2XVGA 3OZOA 1SMAA 1WDSA 2WNWA 1E56A 1Q6FA 4ATDA 3RJXA 1J9YA 3WNOA 1E3ZA 1NWRA 4U31A 1RP8A 3SCSA 4NRSA 2VO5A 1H0GA 1ZBVA 3CHFA 1H1NA 1VBUA 3PZGA 3W26A 3TTOA 5A6AA 3CUIA 3A47A 2J8FA 2XHYA 2BY2A 1ZBKA 4ZENA 1C8YA 4JFUA 1FH7A 5EFFA 3UG5A 3AYRA 2WLYA 3CTTA 1E6NA 4ZXLA 1W1YA 3SIMA 4AIEA 3T09A 1G0CA 1J0IA 1XD0A 3WF2A 1UA3A 2V3GA 1W9DM 1BG4A 5HPOA 1XGZA 4JAWA 5A8NA 2WWCA 1VFMA 1BPLB 3TA9A 1QI4A 5E70A 2E9LA 1BSIA 4PMOA 3ARZA 3GNOA 2JEQA 3VILA 4M24A 2YL6A 4S3JA 1JI2A 1WDRA 3WH9A 4AZ7A 1E5NA 7CGTA 2QMJA 4YPJA 3AROA 1G1YA 4QFUA 1G01A 3IAPA 1ZS2A 4E4PA 4MJ2A 1QI2A 4D1JA 2O9OA 3W81A 1UHVA 3AMCA 1DWIM 4TTUA 3KZSA 1EGZA 1CYGA 4FLQA 4KRTA 4MDPA 1CWYA 1EDQA 1GQJA 2WVUA 2XM2A 2UY2A 3L2LA 2D1ZA 2CBUA 3WD3A 3WUFA 2BY1A 2D2OA 4J27A 4LPCA 2VQTA 1OWQA 1W3KA 3EDKA 1UZ4A 1M01A 1A47A 1S46A 1W3JA 4J3UA 2C7FA 3TTSA 1BLIA 1GQKA 5CSUA 3VIIA 4KH2A 3MUAA 5KZ6A 3F5KA 2VZVA 5A6SA 1E6QM 4JL2A 1JGIA 3QHMA 4M1RA 3SCQA 2WMIB 4QCEA 5ABGA 1ZBWA 4PSPA 4YHGA 2X1IA 3ARWA 3VIHA 2VMFA 3CHDA 5M17A 1R86A 4JKKA 5HXMA 4DM1A 4ZEPA 3AMKA 2PWHA 1UZ1A 2EBNA 3BMVA 4AMCA 1C8QA 3PN8A 3UETA 3RCNA 3WQ4A 1UWUA 1HKJA 3QR3A 3SUUA 3SCWA 1GZJA 5JBDA 1CXLA 2WMGA 5CLWA 1MXGA 2XIIA 2XGIA 1IV8A 4PMRA 3ZJKA 3K4AA 2EXOA 3WQ8A 2XYLA 3HJEA 2CEQA 1ODZA 3AMDA 2VNCA 2W4XA 4M80A 4J28A 3MANA 3B9AA 5AC5A 3GXDA 2W61A 4DUXA 1CGVA 4PMYA 1JXJA 2F8QA 1V3HA 1CENA 1UKQA 1V3KA 2PF0A 3OLIA 1VEMA 3EMCA 3II1A 3GM8A 3VIPA 1L0PA 4UR9A 4AIUA 1W1PA 4GO8A 4TVDA 1ISXA 3PZVA 2Y8VA 2YL9A 3VINA 2ZICA 1DWHM 1PPIA 1XSIA 1HL9A 5AYIA 2XVPA 1R87A 1NOFA 3CPUA 2ESCA 4H8UA 1C7TA 3K46A 2VX4A 4AZCA 3TP4A 1KXHA 2CIPA 4ZE4A 3RMEA 5D8WA 1BHGA 5D9OA 3WELA 4AISA 4IPNB 4P7OA 3VDBA 2Q8XA 4JFTA 4Z2JA 4LX4A 1PBGA 4ACYA 3WD4A 4GQRA 5FD0A 3VX1A 5CLTA 1G5AA 3PTMA 2J47A 2ZXQA 3PZNA 1GNXA 1PAMA 1U30A 4GPNA 4MB5A 4GO9A 4W84A 3I3DA 1UD4A 2J7GA 2E0PA 5I0DA 5CGTA 3F4VA 2BFGA 4W5UA 1Q4NX 1UR9A 1W9XA 1V02E 2J74A 3AHZA 3CZKA 2OWCA 5I24A 2W66A 1KQYA 1UOKA 3BAKA 3WDJA 3SCUA 5GQBA 1UH4A 4RE4A 4UNIA 4DM2A 1Q6DA 3CUJA 3RM8A 1IZKA 2J8GA 5DF0A 4OKDA 3AZRA 1UD8A 1U2YA 1XCWA 4XZWA 3WFLA 3SEPA 3WL0A 5BXSA 1FFQA 4CD8A 2WC3A 1C92A 4TXEA 3NDYA 4BF7A 2OLHA 4KMQA 1KXTA 2JF6A 2J79A 1CNVA 4AWEA 1PZ3A 3SCRA 4BQ2A 4NRRA 5GNXA 2VZUA 4LYQA 1QNOA 4D6CA 1SFSA 3KWXA 3OB8A 1QHZA 3WNPA 1WZMA 3ZJ6A 4HPGA 2WXDM 4MJ4A 1J10A 1HIZA 3THCA 2G4FA 1IT0A 4CGTA 2WM0A 1H3GA 2WMHA 5EFDA 4D71A 3GBDA 4DWSA 5IFTA 2CCRA 2AAAA 1BG9A 5BXTA 1E71M 1GVIA 3NYDA 3UESA 2XM1A 4HZ7A 4MPKA 3VD3A 3RJYA 4HP5A 4HOZA 2ZOXA 2E40A 3VMPA 2Y5EA 2VOTA 1ODUA 1TFVA 2GDUA 2BNJA 1YHTA 1JDCA 1OGSA 1EHNA 5M03A 2ZUNA 1PJ9A 1B0IA 3SCOA 1GOKA 1V02A 3K8LA 2TAAA 1B3YA 5A95A 4W7WA 1OIMA 4MNJA 2FH8A 1E43A 1JZ5A 2CHNA 1GOWA 2EPLX 2VR5A 5I23A 3B8SA 5CZKA 3AXIA 1UWSA 2Z1SA 4D6GA 1H4PA 2BY3A 4NF7A 4CU8A 2VTFA 2WHKA 5GNZA 4L4OA 4MTVA 3GXFA 3GH5A 2WHLA 3L4WA 4Y7EA 2YOCA 1PEZA 4X0VA 1HJQA 4FMVA 4Z2LA 1QW9A 2VCCA 2VZSA 3CMJA 3EDFA 1JL8A 4PTMA 2G3JA 2WZEA 1P6WA 2C8NA 4M82A 2EJ1A 2XVKA 1FH9A 1NP0A 3UG3A 1LG2A 3DYMA 4R5EA 1KWGA 1MW3A 2WCGA 2DSWA 4DWSC 3WL1A 2EPNA 3L4UA 1QBBA 2FH6A 2PI6A 5BRPA 4V27A 1E1FA 5A94A 3PZQA 4CD6A 5CJ5A 4TOQA 2DGAA 4K68A 1ZJAA 3GDBA 1TA3A 4TTGA 4J7RA 3W4RA 1FHDA 2W92A 3ALFA 1V6XA 5JUVA 4BZYA 3A4WA 3IJ7A 1JD9A 3E1F1 1IZJA 3BCDA 2XVNA 4QCFA 3W25A 3MO4A 2VR4A 2FDMA 2XWEA 4DWSD 2VX7A 1HJWA 1AVAA 2DSVA 2ZX8A 4V2XA 4AZCB 7TAAA 4LXFA 1HX0A 2CPUA 4PMVA 4JIEA 1JZ4A 1B1YA 1W9BM 1XSKA 4AEEA 2YBTA 3W29A 1UUQA 1XH2A 3OLDA 4ATLA 3SCPA 4BCEA 3NCOA 3MUZ1 2D3LA 3WD2A 1XRVA 3EMQA 4D6FA 4WSKA 3W82A 2DT1A 3VNZA 4A4AA 4FLSA 3L4YA 1E15A 4WLCA 2GDVA 2WMKA 3EDDA 2ZX9A 2ZUSA 4DUVA 5JBEA 4JFVA 1CXKA 3WQ6A 1I1WA 1CGTA 1E6RA 4W7VA 1H5VA 2WB5A 5A6LA 8A3HA 2AOSA 2QHAA 3DYOA 1OBAA 4JHZA 4MNKA 1FA2A 5CQ1A 5M3WA 1TZ7A 3WY1A 1DTUA 2VI0A 4MB1A 1E4LA 4TX6A 5HBFA 3AXXA 2Y2WA 6A3HA 3UERA 1G9HA 3VIFA 4AD3A 1M53A 4GZIA 1JYVA 3VGEA 1OT2A 4PTXA 4HTYA 1J0YA 2WVVA 1CXEA 1JFHA 1NQ6A 4F79A 4B16A 1EOKA 1W2PA 3WF4A 1K9DA 2YJQA 4UFMA 4AZGA 3O6AA 3CMGA 2VRJA 3VMOA 4AD0A 1FFRA 1VJZA 4WK9A 1E40A 3N11A 4E2OA 2JIEA 4W89A 4UOQA 1BTCA 4PUDA 2BVYA 5HOSA 1HXJA 1Q6CA 3U5UA 3CHCA 4B3KA 3AS0A 1OGGA 3T2OA 2CERA 1QNRA 4DWSB 3AS1A 4PYSA 2YDSA 2WANA 3EDEA 3U57A 4E8DA 1B90A 4P7LA 1B30A 4P8VA 1V6YA 1KGUA 4V28A 4ACZA 1C7SA 5D9MA 4AD5A 3WH5A 1J01A 3VMNA 4IM4A 1EO5A 1E6SM 1VEOA 3PZUA 2BY0A 3CUGA 1V3IA 1W9PA 2X05A 1JYNA 2J7EA 4J3XA 2GJRA 5A2AA 1ZU8A 3WNMA 4F9JA 2VC9A 2ZE0A 4HOXA 2XJ7A 4QLJA 4W88A 1WZLA 3AIRA 2CBIA 1BQCA 3MSDA 4H7VA 1E4NA 2EPMX 3WEMA 5AY7A 2V3EA 1NH6A 2VQUA 3GNPA 5ECUA 3ZT5A 4CD7A 1FH8A 4PEEA 2OWWA 1VENA 4PRWA 1E72M 1VF8A 4MADA 3WDPP 3VD5A 4JZ5A 4IPLA 3WIJA 4PMXA 5JIPA 3OIHA 3VTRA 1GCYA 4F9DA 4LQ1A 1FP9A 1X6NA 2Y4SA 2BXYA 2EPKX 5DEZA 3ARTA 3WBAA 1KCKA 1BYBA 2DSKA 1R7AA 1MQPA 3I3EA 4AW7A 1JNDA 5DMYA 4UFIA 4Z2HA 3F5JA 2XWDA 3N17A 1JYXA 4CKQA 4PSRA 2Z1KA 4U3CA 4EK7A 1TA3B 1HN1A 5CGMA 4HMEA 4GZEA 2MANA 4D6HA 1XD1A 2ZUVA 1GJWA 2PWFA 4F8XA 1QNQA 3POCA 2Y8KA 1UKSA 2XFFA 3MMUA 1MW1A 1H2JA 1HKIA 5ABEA 3W38A 3VM5A 5FKYA 1OGBA 3WD0A 4AC1X 1MFVA 3VVGA 3FHQA 2OYMA 2JEPA 1E9LA 3T2PA 3L4XA 4UQAA 4UFLA 3AZSA 2ZUUA 1GQIA 4EKJA 3MV01 1SYTA 1HNYA 3SUWA 4MAVA 1HP5A 2RGMA 1XHGA 2DSUA 3WN6A 2YA1A 3ZM8A 3LPOA 1UKTA 1LJYA 2WZHA 1UR2A 2PBOA 4H41A 2ZUTA 3AS2A 2J7DA 5C71A 1TR1A 3MS8A 5TD4A 3RO8A 2VVNA 1W2VA 1CGWA 1ITXA 2A3AA 5BWFA 4HPHA 4UZUA 2YDRA 2XGBA 3WQ5A 2GSJA 3WMSA 3A3HA 4M81A 2GJXA 1V6UA 2O92A 4UQBA 5CG0A 3VIGA 3OBAA 3CZGA 3BH4A 5IHRA 3WDHA 3GTNA 3FAXA 3VM7A 2G41A 4UFJA 3FN9A 4W8AA 4B9ZA 2CESA 3L4VA 1KXQA 1MXDA 4HZ8A 1KGXA 2PWEA 3ZR6A 2GFTA 3AIQA 1OIFA 3VX0A 3S6TA 1WB0A 2CKSA 2X0YA 2WVVB 3MSGA 3T0BA 5I2UA 4OZOA 2YKKA 2XPKA 1UD2A 1JDAA 6TAAA 3VD9A 4FF5A 3D3AA 4RE3A 3IANA 4M29A 3WNNA 3EBVA 1V0NA 3BCFA 3TTYA 1J11A 1WPCA 3ZIZA 3KL3A 4CVWA 2YLLA 4U33A 4W7UA 1UWRA 4FLOA 3WQVA 5AYBA 2W91A 1KFWA 1Z32X 1OB0A 2DT3A 1NWUA 3THDA 3RDKA 3MU7A 1OD0A 3FHAA 2CYGA 1EHAA 1JAEA 2VX6A 1GONA 4YN5A 3A6OA 4P7NA 4WF7A 1MQRA 4ACZB 4U3AA 3W37A 1TCMA 5M5DA 1W9UA 4X0NA 5JIWA 3RIKA 4NI3A 2NW0A 2WSPA 3ARRA 1M7XA 2EO7A 2W67A 2W5FA 5HNNA 4W87A 3OGVA 4AD2A 3VU2A 1SR0A 1JIBA 4FLRA 1ZJBA 4JCMA 1GOOA 2CETA 2XG9A 5A1AA 2W63A 3BC9A 2QV4A 3IAQA 1KXVA 1HKMA 1R7OA 4HA3A 2WSKA 1GVYA 4OBSA 1JD7A 2D0HA 2JE8A 2B31A 2F61A 1KGWA 2ZX5A 3PZ9A 3K4DA 1UH3A 2FHCA 2DH2A 1DWAM 1M03A 1QPKA 3N12A 2G3IA 2V5CA 4EAMA 4CU6A 3RPMA 4CD4A 3QGVA 5A69A 3DYPA 4WIWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GOR A;  1W32 A;  2WMJ A;  5HDR A;  2EQD A;  1TUX A;  3W0K A;  3PZI A;  3VKK A;  4C7D A;  3N13 A;  1E0W A;  1ZB5 A;  3WMC A;  1V0L A;  1O7A A;  3A4A A;  3FND A;  4JKL A;  2V5D A;  3UG4 A;  1BF2 A;  1PZ2 A;  3MUI A;  4Z2K A;  2WMI A;  1RP9 A;  1LL4 A;  3AIC A;  5IXE A;  1E3X A;  5D4Y A;  1UG6 A;  1CXH A;  3LPG A;  3PTQ A;  1AQH A;  3WF3 A;  4M8U A;  2J78 A;  3W24 A;  3BLP X;  3W53 A;  1WNO A;  4MB4 A;  1HJX A;  1HJS A;  2X8R A;  2WC4 A;  2ZID A;  4HA4 A;  3FXY A;  3B9E A;  3CZL A;  2FGL A;  3O9N A;  4BQ3 A;  1LL7 A;  1KQZ A;  1MVY A;  2DT0 A;  3VD7 A;  1B3V A;  1B3W A;  2E8Y A;  3T08 A;  2NSX A;  2VVS A;  3WBE A;  4B9Y A;  1V0K A;  2BS9 A;  4GZJ A;  3OGS A;  4PTW A;  3BXW A;  2E4T A;  4HU8 A;  1NM9 A;  1HJU A;  1WDQ A;  2VCB A;  3ECQ A;  5CPT A;  5ABH A;  3WEZ A;  1K9E A;  5F7U A;  3G6L A;  4OOU A;  4N0R A;  3AFB A;  3OG2 A;  3GYC A;  4UQE A;  3ZJ8 A;  3ZOA A;  1V08 A;  4CD5 A;  3M46 A;  2A3E A;  5CPS A;  1HT6 A;  4UCF A;  3VGH A;  3L4Z A;  1VAH A;  4W5Z A;  3WDI A;  1CGX A;  3TOP A;  2ZX6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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