1H5VA

Thiopentasaccharide complex of the endoglucanase cel5a from bacillus agaradharens at 1.1 a resolution in the tetragonal crystal form
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
301
structure length
301
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRESA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus agaradhaerens
publication title Atomic Resolution Structure of Endoglucanase Cel5A in Complex with Methyl 4,4II,4III,4Iv-Tetrathio-Alpha-Cellopentoside Highlights the Alternative Binding Modes Targeted by Substrate Mimics
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE 5A
total genus 123
structure length 301
sequence length 301
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2001-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1h5vA00
2XFRA 2W67A 2YOCA 5DT5A 3ZMRA 3VX1A 1E6QM 2J8GA 4UFIA 1C92A 5A8MA 2Z1KA 4WKHA 8A3HA 1LL7A 1PZ2A 3LPFA 1U2YA 1SYTA 3AHXA 4X0VA 3AXHA 1JZ6A 2JEQA 2BNJA 2GJPA 3FAXA 2VVNA 4AIEA 1AQHA 3RDKA 1E4LA 2BHYA 4AWEA 1H3GA 2D0FA 4DUWA 2EQDA 1GW1A 5BXRA 4ZFMA 3AHZA 1DWAM 2ZX7A 4OJYA 3MKKA 2XWEA 1C90A 1FFQA 3VPLA 2W5FA 2XUCA 1LF1A 3D3AA 1KB3A 2AMGA 2PWFA 4AD0A 5A6MA 4J7RA 1OBAA 2JF6A 3U5UA 3FW6A 2YA1A 1OGBA 2Y4SA 5CPTA 2VJXA 5CPSA 1UWUA 5ABEA 4DM1A 3A4AA 3VGFA 3WQWA 1KR1A 1V6YA 2OWCA 2BV9A 1XYFA 5D8ZA 3PZQA 1V3MA 4KRUA 3ARQA 5EBAA 2WHLA 2ZIDA 2QMJA 1FH8A 1VEMA 4CD4A 1E6RA 2PB1A 4WLCA 5BRPA 2XFFA 3OGRA 4AD1A 4F79A 1D3CA 4OOZA 3SEPA 1E73M 3PZUA 3SCVA 4H2CA 4OUEA 4JFWA 3UG3A 4AW7A 5A2AA 1BF2A 4CKQA 1X1NA 5LYRA 3U57A 3VIPA 2OSWA 1UD2A 3DHPA 3VINA 3AS0A 2WVUA 2X0HA 2J62A 1W1TA 3GXMA 3N9KA 4UFHA 4U33A 3ZJKA 3BCDA 1HT6A 5BROA 2WVVA 2E40A 2JIEA 2CERA 3WH7A 1C8XA 3RO8A 1PX3A 1LQ0A 3ZJ7A 4P8UA 4ATDA 2VR5A 3N13A 5F7UA 1B3XA 5BXTA 5BRQA 1VJSA 3F5KA 4IM4A 1WDSA 4AIUA 4AZCA 4RE3A 2WYSA 2IXUA 4FLOA 5GNZA 1J9YA 4W5UA 3GDBA 1UWQA 2CBJA 2WBGA 3WF2A 4J27A 1IZJA 3NDYA 3OBAA 1KXHA 2GDUA 1V0LA 3PZNA 1VJZA 3F5LA 1CXLA 4AZ7A 3T0BA 3WBEA 2F2HA 1CWYA 3CZKA 3AMCA 1GOWA 4CD7A 1JNDA 3K4DA 1KQYA 2WCAA 1BYBA 1HJQA 1K9DA 3CZLA 2CKRA 1MW1A 1ITCA 1EOKA 3VIFA 2ZXDA 1UQYA 4W7VA 5E0FA 1JDAA 3AJ7A 4BQ3A 4PN2A 2O92A 2VL4A 3WEZA 1NP0A 2VOTA 5M5DA 2CYGA 2WWCA 2YDQA 4J3VA 3SCTA 5JIPA 4MB5A 2EJ1A 2PI6A 3W29A 1BLIA 4BF7A 4NZCA 1W1VA 8CGTA 1AMYA 4W88A 2WANA 1CGTA 1CGXA 3AMDA 1H5VA 3BMVA 1CYGA 4OBRA 2UY4A 3VD5A 1UR4A 2CBUA 2XSBA 1CTNA 4LXFA 5IXEA 5A3HA 4PTVA 3VD7A 1KFWA 4Z2LA 2YDSA 1RH9A 4WIWA 4PEEA 3ZR6A 4BCEA 4EE9A 1OM0A 2JIWA 1XRVA 1XCXA 2ZXQA 3AISA 5A8QA 5JUVA 1UWRA 4C7GA 4DM2A 3IK2A 1BYCA 4GPNA 4Q7NA 1BAGA 2XWDA 1LG1A 1V6WA 1QNPA 3A4XA 1W1YA 1CXIA 1OINA 3DYMA 2ZX9A 4PMXA 3ZO9A 2VURA 4GO9A 5DMYA 3B9DA 1R87A 3OLDA 1HXJA 5DF0A 5KZ6A 2VX4A 1E1FA 3DYOA 2PBGA 1NQ6A 2WSKA 1CXFA 1W1PA 3N04A 2YBUA 1P6WA 1KGWA 1QHOA 2UY3A 1BG9A 5FIPA 3OG2A 1XH2A 2O9PA 3CHDA 2AAAA 2DSVA 2WSPA 2WMKA 4PMNA 1UWIA 3AZSA 3W37A 1H49A 2XM2A 2V3FA 3SCNA 1U30A 2FH6A 1OT2A 2E0PA 1FH9A 3ARZA 2WMIB 1E0WA 2GFTA 5FOOA 3FN9A 2XTKA 7A3HA 4LPCA 1PEZA 2YKKA 3BLPX 1CXHA 1GNXA 1I75A 1MFVA 5ABFB 1JYVA 3CTTA 3OZPA 4IPLA 1G0CA 2GSJA 3PN8A 1J0JA 1WE5A 2E9BA 1TUXA 3RCNA 5GNYA 1E70M 3EMZA 3BAWA 1ZBWA 3VGBA 1AQ0A 4UZUA 3MSGA 2J78A 1JAEA 4AZIA 1O6IA 3IJ8A 1WDPA 3AMGA 3MU7A 3AIWA 4CN6A 4D6HA 2W91A 4MNJA 1UZ4A 3L4YA 4A3YA 4AEEA 3BLKA 1VFMA 4TX6A 1LLOA 2V3DA 2W92A 3BAJA 3T2OA 2DQXA 3B9EA 2XGBA 4QP0A 3GBDA 2UY5A 1V08A 4CVWA 2PBOA 2JFEX 1W9VA 4ACYA 2ZOXA 2BHUA 5KEZA 1TVNA 1VFUA 4TVDA 3SCUA 2WKLA 1LG2A 1QI4A 1JI2A 3ARXA 3OA5A 3VMPA 2Z1SA 3OLIA 5A69A 3BXWA 2CXGA 4AZ5A 2GK1B 1J18A 3L4WA 5I6SA 3TTYA 3GM8A 2J7HA 1GVYA 2VQUA 3FNDA 4W7WA 1E1EA 3CMGA 3UEQA 3WBAA 1MW0A 3WNNA 2ZXBA 4AISA 1WZLA 2JALA 2DSZA 2OYKA 4WSKA 1ECEA 1XSIA 3B8SA 1M7XA 1OGSA 4U3AA 5CXPA 1IZKA 3WUGA 4BQ4A 5LA1A 2CBIA 1UA7A 1W2VA 3MSDA 4D6FA 2JF7A 4DUVA 2BFGA 1CGYA 3CLWA 4KGJA 1JXJA 3WKZA 5CGMA 1JI1A 1A3HA 2XIBA 3L4UA 1B3YA 3AXXA 2V3EA 3K8LA 4FLQA 5EFDA 3UESA 4UQDA 4D6JA 4HU8A 3VDBA 1CBGA 1VIWA 5CG0A 3K4AA 4KGLA 1W32A 4X9YA 5IHRA 4IPNB 3CHEA 1B3WA 3W26A 1CIUA 1UOKA 5FKYA 3WEMA 1C91A 3SCOA 3WEOA 5D9NA 1UKQA 3F4VA 4C7FA 4GI6A 4FMVA 4F66A 1GHRA 4L4OA 1CGUA 3VKKA 5I2UA 2J8FA 3AHYA 3EDEA 1UH3A 3VO0A 2GUYA 2XVNA 3PBGA 4GQQA 5AYBA 1JL8A 3FHAA 4CCDA 2O9TA 2PF0A 2FHCA 4W93A 5CLWA 1UR8A 1QNQA 1BVNP 4CUCA 2DIJA 4BZYA 1FA2A 2EEXA 5ECUA 1QHPA 2VC9A 3AYSA 1A47A 1GOKA 2D22A 3MUY1 4BQ2A 1E56A 1EA9C 2F61A 4MAVA 1YHTA 2QLYA 1KR0A 1PBGA 1AQMA 2NSXA 3UG5A 4UCFA 1CXEA 3RJYA 2FGLA 1XH0A 3VX0A 3UR7A 2VR4A 4UR9A 2CITA 5I24A 1E4NA 3GTNA 1UR9A 1XV8A 4CU8A 1WNOA 4D72A 2DT0A 3QHMA 3WL1A 4OZOA 1ISXA 2Y5EA 1JF6A 3EDDA 3WNMA 3SCQA 2BVTA 3W38A 4AIOA 3THCA 1G5AA 3SUSA 5A2CA 1EQPA 3AZTA 4ZE5A 2WPGA 3VNZA 2VT0A 2YLLA 5A8NA 5CJ5A 4UOZA 1UYQA 3AICA 2BHZA 4LYPA 1DWGM 1XCWA 2BVDA 2NT0A 4CCCA 2BY0A 1ZS2A 2UWFA 4XB3A 5A6LA 3VM5A 3SURA 5GQBA 4CD5A 2DSUA 1V3HA 3T2PA 2QPSA 4YPJA 3VIHA 5I5RA 1NWUA 1RP9A 4JKLA 3VD3A 2ZX8A 2Y8KA 3GBEA 3MMDA 3JUGA 4S3JA 1FP9A 5FD0A 1N82A 1OB0A 2WHJA 4OKDA 1VENA 3L4VA 4B3KA 1GOOA 2YJQA 4U31A 4Z2IA 1V03A 5E09A 4D1JA 1PX8A 4EKJA 3PTQA 1CNVA 5A8OA 4IUGA 2X09A 1EGZA 3MV01 3DC0A 4UTFA 4AD4A 2DPEA 3WUEA 1HJUA 3EBVA 3WDIA 1QNRA 2VZOA 5A6SA 3WMSA 5BWFA 2CNCA 4TVCA 3BMWA 3WMCA 1UR1A 4J3WA 2ESCA 1B0IA 4HTYA 4DUXA 1E6ZA 4KMQA 1J0YA 3WD0A 2VZSA 1ZL1A 3FHQA 4KH2A 4GI9A 4GI8A 2HVMA 1V6UA 1HVQA 2BY1A 3SUTA 3O2LA 4MB3A 1PZ3A 4MPKA 1GQLA 3EDJA 2A3AA 1DWJM 1KBKA 2CKSA 1I1WA 2D2OA 3VGHA 5HNNA 5HPOA 1ZJBA 1WDRA 2GJRA 3L2MA 4UQCA 4JZ5A 1GCYA 5CSUA 4DWSA 1ISWA 3VDAA 4JCLA 3NJ3A 2WLYA 1JZ3A 2G3IA 4CU6A 5BXPA 4W84A 3AHTA 2A3EA 3M6DA 2ZUMA 2EBNA 4JKKA 4Z2JA 1Q4NX 3BCFA 4NRRA 1NOWA 2WZEA 2DT2A 4NF7A 1K9FA 3WNKA 2XVLA 4QLLA 3TOPA 4GKLA 3DECA 4JFTA 1JF5A 4N0RA 3QOKA 3MMUA 1C8YA 1O7AA 3PZGA 3VMOA 3VGDA 5A95A 1JG9A 3TTOA 3ZJ6A 2JEPA 3BSGA 4AMCA 2CETA 3KL5A 2WMHA 3W53A 3WDHA 5BXSA 4PMVA 2BVYA 3WF4A 2ZX6A 2DT3A 1DWHM 1LWHA 3NCOA 1OIMA 3I3EA 4ZEPA 2EO7A 1US2A 4D71A 4MAZA 1ZBKA 3WD1A 4DWSD 2XVKA 2YLAA 3LPOA 3W24A 1UD3A 1NH6A 4CVUA 1E5NA 1UH4A 1XGZA 4TTUA 4V27A 4JKMA 3G6LA 3PZIA 4TVUA 1E71M 2A3CA 1H09A 3CBWA 5A8PA 1H0IA 4M29A 4PUDA 1E3XA 2EXOA 3AZRA 1FHLA 1UG6A 2WVTA 1E0XA 1EHNA 5FCZA 4C7DA 3RMEA 3VIMA 5I78A 4ZENA 4MNKA 4GIAA 4E2OA 1R7OA 4FK9A 5JBFA 4XZBA 5E70A 4HOXA 1BYAA 2VZVA 1J11A 2XSAA 4J3XA 2WW5A 5D4YA 2OWWA 1UQZA 4V28A 5IDIA 1E6PA 3A4WA 2J77A 3ZR5A 1QNOA 4UQEA 4MJ4A 3MV11 1XH1A 2D0GA 2XVGA 1E55A 3O6AA 3UERA 4QLKA 3THDA 1V0KA 4TOQA 1HJXA 1V3LA 4ZE4A 4H04A 4F9JA 4RE2A 3TONA 1L8NA 1K9TA 1BSIA 3AXIA 3OGVA 2J79A 3LPGA 2RGMA 1C93A 2V5DA 4H8VA 1B2YA 3L4XA 2VUYA 2G3NA 2CPUA 4PCSA 1CPUA 4R27A 3T08A 4PMUA 4M56A 1IV8A 1HX0A 4U5KA 5C70A 2W62A 4CGTA 5AC5A 1JYNA 4XUYA 3W82A 1UD8A 3ZT6A 2XYLA 3AIUA 1E4MM 4LQ1A 2WAGA 3BC9A 3WQ5A 1M04A 1CGVA 3ZOAA 4DWSC 1W3LA 4PMQA 1QI3A 2XG9A 3APGA 1WB0A 1JD7A 2J7EA 2VCBA 1W3HA 4B3LA 1MYRA 2BXZA 3IAPA 3O9NA 1W3JA 1JD9A 1H2JA 3VGGA 1LWJA 5A94A 2Y2WA 2WBKA 4TTGA 1NM9A 1JZ4A 3MUZ1 1KCLA 1GONA 1HIZA 2DIEA 4HP5A 2VVSA 2G4FA 3T0DA 3OGSA 3W6MA 4P8XA 2V38A 3DHUA 4GXPA 4M81A 3GNOA 4RL3A 1BVZA 1JZ5A 3WH6A 1OSEA 1B30A 4GZIA 1HL9A 4ACZB 1ZBCA 3WFZA 1BQCA 4UOQA 3RJXA 2WMGA 4AD3A 3SCSA 1C3FA 3WDRA 5GPRA 2J75A 4WK9A 3I3DA 4UFMA 1WPCA 2WMFA 2EPNA 3VU2A 3L4ZA 2J7DA 2CIPA 1K9EA 3OB8A 3NSMA 1HL8A 1G94A 2X0YA 3FY1A 2EPOA 1GHSA 1V3KA 4ZXOA 2E9LA 3QOMA 4U2ZA 1J01A 3TTSA 2WWDA 1QI2A 2V3GA 1E6XM 3WNOA 1ZJAA 1JAKA 5HBFA 1J12A 1TMQA 1M01A 1MW2A 2PWHA 1ISZA 1QBBA 4P7QA 3LPPA 5FL0A 4W89A 2FGZA 3UR8A 3W0KA 4V2XA 1UD6A 2O9OA 1HP4A 3CUGA 2WLZA 1WCGA 1J0IA 1FHDA 3PZOA 1G01A 2ZE0A 1BG4A 1PPIA 4UNIA 2EPKX 2WZIA 3VDCA 4TUFA 5ABHA 4WF7A 4Z2GA 5C8BB 1VBRA 2YL6A 2D1ZA 2ZICA 4M80A 4ATLA 4MDPA 3VOCA 1QI5A 1U33A 5DFAA 2Y8VA 3AHVA 3W6LA 1KWKA 1EHAA 3CGTA 1LL6A 1PAMA 1X6LA 1B1YA 2D20A 4K68A 3TTQA 1JNEA 3PHAA 1GJUA 5C71A 1TCMA 4MJ2A 3MO4A 2QV4A 2E9MA 1JIBA 1MFUA 4JHOA 3DYPA 4QCEA 4MB4A 1CXKA 1W9PA 3WQVA 3CUJA 5A6AA 2VRKA 3W27A 4JHZA 3KE0A 4KWUA 1J0KA 2J7BA 4P7LA 3VGEA 1KBBA 1BYDA 2XHYA 1DEDA 4FF5A 2V5CA 3I3BA 2OSYA 4M1RA 2X2YA 2ZUSA 1V02A 4PSPA 3PZVA 1BPLB 2EPMX 3ZM8A 3BAYA 3WUFA 3M46A 2ZUVA 1HN1A 2CCRA 3PTMA 1PIGA 4JCMA 5LA2A 1JYXA 2A3HA 2J7FA 1MQPA 5JBDA 2WHKA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2XFR A;  2W67 A;  2YOC A;  5DT5 A;  3ZMR A;  3VX1 A;  1E6Q M;  2J8G A;  4UFI A;  1C92 A;  5A8M A;  2Z1K A;  4WKH A;  8A3H A;  1LL7 A;  1PZ2 A;  3LPF A;  1U2Y A;  1SYT A;  3AHX A;  4X0V A;  3AXH A;  1JZ6 A;  2JEQ A;  2BNJ A;  2GJP A;  3FAX A;  2VVN A;  4AIE A;  1AQH A;  3RDK A;  1E4L A;  2BHY A;  4AWE A;  1H3G A;  2D0F A;  4DUW A;  2EQD A;  1GW1 A;  5BXR A;  4ZFM A;  3AHZ A;  1DWA M;  2ZX7 A;  4OJY A;  3MKK A;  2XWE A;  1C90 A;  1FFQ A;  3VPL A;  2W5F A;  2XUC A;  1LF1 A;  3D3A A;  1KB3 A;  2AMG A;  2PWF A;  4AD0 A;  5A6M A;  4J7R A;  1OBA A;  2JF6 A;  3U5U A;  3FW6 A;  2YA1 A;  1OGB A;  2Y4S A;  5CPT A;  2VJX A;  5CPS A;  1UWU A;  5ABE A;  4DM1 A;  3A4A A;  3VGF A;  3WQW A;  1KR1 A;  1V6Y A;  2OWC A;  2BV9 A;  1XYF A;  5D8Z A;  3PZQ A;  1V3M A;  4KRU A;  3ARQ A;  5EBA A;  2WHL A;  2ZID A;  2QMJ A;  1FH8 A;  1VEM A;  4CD4 A;  1E6R A;  2PB1 A;  4WLC A;  5BRP A;  2XFF A;  3OGR A;  4AD1 A;  4F79 A;  1D3C A;  4OOZ A;  3SEP A;  1E73 M;  3PZU A;  3SCV A;  4H2C A;  4OUE A;  4JFW A;  3UG3 A;  4AW7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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