1HJQA

Structure of two fungal beta-1,4-galactanases: searching for the basis for temperature and ph optimum.
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
332
structure length
332
Chain Sequence
ALQYKGVDWSSVMVEERAGVRYKNVNGQEKPLEYILAENGVNMVRQRVWVNPWDGNYNLDYNIQLARRAKAAGLGLYINFHYSDTWADPAHQTTPAGWPSDINNLAWKLYNYTLDSMNRFADAGIQVDIVSIGNEITQGLLWPLGKTNNWYNIARLLHSAAWGVKDSRLNPKPKIMVHLDNGWNWDTQNWWYTNVLSQGPFEMSDFDMMGVSFYPFYSASATLDSLRRSLNNMVSRWGKEVAVVETNWPTSCPYPRYQFPADVRNVPFSAAGQTQYIQSVANVVSSVSKGVGLFYWEPAWIHNANLGSSCADNTMFTPSGQALSSLSVFHRI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Two Fungal Beta-1,4-Galactanases: Searching for the Basis for Temperature and Ph Optimum
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-1,4-GALACTANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Humicola insolens
total genus 129
structure length 332
sequence length 332
ec nomenclature ec 3.2.1.89: Arabinogalactan endo-beta-1,4-galactanase.
pdb deposition date 2003-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07745 Glyco_hydro_53 Glycosyl hydrolase family 53
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1hjqA00
3AHXA 1TA3A 4PSRA 2JF7A 2BFGA 1ITCA 2Z1SA 5IHRA 2C7FA 3AHTA 1OIMA 4PMOA 4J7RA 4JFTA 1BG4A 3BAYA 2OSXA 2VTFA 4QLJA 3W81A 3AHYA 1CGWA 2WAGA 6A3HA 3AXIA 2WVVA 3L2MA 1CZ1A 2EPMX 2BHUA 4JCLA 3PZQA 1AQMA 2OWWA 3T08A 2GJRA 4BZYA 2XWDA 1CPUA 3AMGA 4BQ3A 1IZKA 1ZL1A 4C7GA 2D2OA 4U33A 3W82A 1H09A 4L4OA 1E6NA 5FL0A 1UD2A 1HJQA 5DF0A 3WNKA 4UCFA 4DWSD 1Q6FA 3ZJ8A 5HPCA 1DEDA 3UR7A 2JF6A 4CN4A 1UR1A 3BAKA 3D5HA 2D22A 1BPLB 3L4WA 3F4VA 5A95A 2HVMA 3W0KA 4WK9A 2AOSA 1D3CA 3WL1A 2WZHA 1AVAA 1ZJAA 4H2CA 4GZEA 4PMQA 4D6DA 1J0YA 4HMDA 4TTUA 2OSWA 2VVSA 2WBKA 4GKLA 4J27A 5FOOA 4W5UA 5D8ZA 3AXXA 2YLLA 4B16A 3IAQA 5HPOA 3ZQ9A 4S3KA 4Y7EA 1E3XA 3BXWA 1KXTA 4GI8A 2AMGA 2ZIDA 3T0BA 2QPSA 5BROA 3ZT7A 4MNKA 3W4RA 1NWTA 3AI0A 4UFIA 4E4PA 1UD6A 3BSHA 3AIBA 3PZVA 1GJUA 2CKRA 4WKAA 1MW2A 2BXZA 4XX6A 1XHGA 2BVTA 2FH6A 1DHKA 4AYSA 5FL1A 3OLEA 2ZXDA 4ACYA 1J10A 1E55A 2PB1A 4P7LA 1CGVA 2WHLA 3CPUA 3E1F1 4NZCA 1LG1A 3SCWA 1BLIA 2WB5A 5I23A 4OZOA 1R8LA 3S2CA 1E1FA 2CCRA 2EO7A 1NM9A 3A4AA 3EDJA 1CEOA 5HBFA 3II1A 1UD5A 3OLDA 3ARUA 2GDVA 1J12A 2XYLA 2XM2A 3VD3A 2JALA 3AZSA 1NH6A 3OLIA 3KL0A 1NOWA 4V27A 4AXNA 1UHVA 2CERA 4WSJA 3OGSA 4M29A 3U57A 1EGZA 2ZE0A 2WMGA 1G5AA 1HVQA 2EBNA 5M17A 4PEEA 3AS2A 1GHSA 1V6XA 4P7NA 5HOSA 3DYOA 4CUCA 1A3HA 1UKPA 4GZIA 2VR5A 2WMHA 4DM2A 4Z2IA 1HNYA 4JCMA 3U7BA 4TUFA 1OGSA 3NJ3A 2Y24A 5JIWA 2D24A 3WD4A 4CD5A 1PPIA 2J7FA 1WAWA 2W5FA 4GZJA 3WUEA 2XGIA 1C91A 2W92A 1TMQA 1US2A 1UR2A 4P7QA 3AHVA 2ZX5A 4QP0A 1D7FA 1QW8A 3W27A 4OKDA 1JZ5A 1UOKA 2PC8A 3CUFA 2PWDA 2J62A 4U5IA 2WHJA 4XV0A 5ABFB 2DH3A 1BYAA 4DM1A 3MANA 3VMOA 3AMDA 3WQ8A 5A2CA 2X2YA 1E73M 1NWUA 5A6SA 3N1AA 1MXGA 3SCQA 4GINA 2YKKA 5HNNA 2E9BA 3K46A 1OT1A 2TAAA 3VO0A 2NT0A 3CZGA 2J47A 5A69A 3MKKA 3DHPA 2ZUWA 1QNSA 3I3DA 2WKLA 4P8UA 5HXMA 3OLGA 1HKIA 6TAAA 3WQ6A 1EIBA 2VMFA 1PIFA 3POCA 3OIHA 1KXVA 3ZIZA 3MUIA 2FHCA 5AY7A 1WDSA 5I79A 4GI6A 2DEPA 3L4VA 4E8CA 1ZBKA 1NOFA 2JEQA 1H0IA 5AYBA 1LWJA 1GQLA 3RIKA 3SUSA 4CU7A 3HJEA 3ZR5A 2PBGA 2XSBA 3PZUA 4UQCA 2XHYA 1GOMA 2VURA 3UR8A 3CLWA 3ZR6A 1ODZA 1OGGA 3WD3A 4C7FA 3KL3A 5C71A 1WKYA 3APGA 3GXDA 5BXSA 5GPRA 3GNRA 1EXPA 1GUVA 2PF0A 1K6AA 3AIWA 2WMFA 5JBFA 1R86A 3AZTA 1E0XA 1UH2A 3MU7A 2X1IA 3NDZA 3MUY1 1ZB5A 1PEZA 1FP9A 1EHAA 1E4MM 1UA3A 1C8XA 3GTNA 1V02A 4CCDA 1J9YA 3W38A 3VTRA 1MYRA 1V0LA 4WF7A 4J3SA 3GZAA 4AD0A 1BYDA 1YHTA 4NRSA 3ARWA 4IM4A 1OCQA 1OD8A 3WQ4A 4QDMA 3WH8A 2DIEA 4FLSA 3WUFA 5CLWA 3T0DA 4Q7NA 3EDKA 2DT0A 4PMVA 5A2AA 1VENA 4MDPA 4MB1A 4AIUA 3WD0A 1W9DM 2XFRA 5BCAA 3VINA 4JKKA 2FGLA 5IHSA 2EEXA 4OJYA 5I3DA 3WH5A 4D1IA 3CHFA 2OYLA 2CHNA 1QI4A 4RE3A 3CUJA 2DSWA 1QI0A 4UQBA 4RE2A 2CEQA 4DUWA 1LWHA 3GXIA 1B3VA 2BS9A 2D0HA 5CLTA 5CGTA 4C7DA 3UERA 1QHOA 4MJ4A 4MB3A 1IZJA 1XGZA 2MANA 4GO8A 3VM7A 5ABHA 5CG0A 1ZBCA 2Y2WA 2Y8VA 1PZ2A 2BXYA 3ZT6A 1PJ9A 3W6LA 4JAWA 3K4DA 2VC9A 3CUGA 2D20A 1GOIA 1HP5A 2WVTA 4AZ6A 3AIEA 1MW1A 1V3IA 1L0PA 2O9TA 2W61A 3CO4A 3RDKA 3WNNA 4K68A 1HKKA 4DUXA 3OZOA 1E6PA 4W86A 3SUUA 1DWFM 1CYGA 1GQIA 1GOOA 4MB4A 1BQCA 5E6YA 1LL4A 1Q6EA 4RL3A 5DT7A 3WMSA 1K9EA 3EMQA 2VZSA 1VFOA 3SCRA 3QOKA 1G94A 5A6JA 2D1ZA 1Q4NX 2PWGA 3WEZA 4CU8A 2OYMA 5A6BA 1TFVA 1J11A 1V6WA 1CNVA 2WVSA 4PUDA 2XVGA 2VVNA 1NQ6A 3HMCA 2J7EA 4AD3A 3W26A 1O7AA 1TVPA 3GYCA 4D1JA 5E70A 3GM8A 2V3GA 2A3BA 2AAAA 2FH8A 2NW0A 2YL8A 2YA2A 3VOCA 3N11A 4TX6A 2WWDA 2GSJA 1V3KA 4JZ5A 2FHBA 5D9OA 4GQRA 3IK2A 1H0GA 2ZX8A 3KWXA 4PTXA 1HP4A 2VCCA 1JDAA 1UWUA 3TONA 2J7DA 1XV8A 1LJYA 3QHMA 1GCYA 1F4AA 3BAJA 3OBAA 3TTSA 2ZX6A 3WBAA 3O2LA 1V3JA 2FGZA 1OBAA 3AYSA 5I77A 1VFMA 5M5DA 4FLQA 3AHZA 1UKQA 3RJYA 2C8NA 2G8ZA 2ESCA 3PHAA 3A4XA 3SCTA 5D4YA 2E0PA 1VF8A 1M03A 3AOFA 5E09A 4B9ZA 2UY3A 1HL9A 3VIFA 5A2BA 3T2QA 5BXPA 4HPGA 1GQKA 4XZWA 5GNXA 5I5RA 1JNDA 1CENA 2E9LA 2VQTA 1UR0A 1MFVA 3IAPA 2ZUTA 4KGJA 4LYRA 1JYVA 3ZT5A 1HJVA 1V3HA 3SIMA 1GJWA 1JDCA 3VX1A 3W28A 3QHOA 2ZXQA 3MMUA 2EJ1A 1B3YA 1QBBA 2VRKA 1G01A 1V6VA 2PWHA 5IDIA 5CGMA 4MNMA 3W6MA 4UQEA 5CZKA 4CN6A 5BWFA 1B9ZA 2XM1A 3MV01 2XWEA 3B8SA 3W25A 2YIHA 3CH9A 4AZCB 4AZGA 4F9JA 4AZHA 1K9FA 1WP6A 1VFUA 5BXRA 1SMDA 1DWAM 5A6LA 3N12A 1BSIA 1E6RA 1FA2A 4JFUA 4D6EA 2YDRA 3WF1A 1HJXA 1OT2A 1IT0A 1V03A 3FN9A 1XH2A 1JXKA 1R87A 2QV4A 5ABGA 4PMUA 3VVGA 2YJQA 1R7AA 3EDFA 5E6ZA 1HXJA 1QW9A 7TAAA 5JBDA 1HJSA 5A3HA 1TE1A 1V3MA 4CD7A 4NSBA 4AISA 2EXOA 2DSVA 5ABEA 3TTYA 1EDTA 3G6LA 2J79A 3VGGA 4PTVA 3WDJA 4U2YA 3SCPA 4HZ8A 2WCSA 1JZ6A 3ARXA 1DWIM 3FNDA 3WH6A 4B3KA 1VEPA 2BY3A 2XFYA 3QGVA 4ATDA 1W9UA 3A3HA 4GPNA 3LPGA 2QPUA 5GNZA 3AS0A 1PX8A 5LYRA 2XG9A 1TUXA 4RE4A 1XRVA 1V0KA 2XJ7A 4JL1A 1E70M 2UY4A 1JYNA 4TX8A 3VU2A 2F8QA 1HKJA 2WCAA 3VGEA 2J75A 2WWCA 4D6HA 1E4IA 2WC4A 1XCXA 4PBGA 4UFJA 4KMQA 1BYCA 2ZWYA 3WDQA 2VRQA 3QR3A 1E5NA 1V6YA 3OZPA 2DQXA 4QLLA 2BY1A 1OGBA 3DHUA 3SCSA 1IV8A 3BLKA 4MB5A 4WKHA 3BSGA 3FY1A 2VZOA 3PZOA 5FKYA 1U30A 1V08A 6CGTA 2OWXA 3WN6A 4CD6A 3ZOAA 4F8XA 5C70A 5JIPA 1XC6A 1W2PA 1Q6CA 2D3LA 5EB8A 4QCEA 4OUEA 1RPKA 1MW0A 2DSZA 5DT5A 3VILA 1CGUA 2YDSA 5DO8A 3S6TA 1W1YA 4X0VA 3WD2A 4FMVA 5JUVA 3K8LA 1SMAA 4P8XA 4F9DA 5GNYA 3L4XA 1MQRA 3CZKA 4W7WA 1E72M 1CXKA 1BF2A 1H11A 1EA9C 3ZSTA 2E4TA 3PZ9A 2OSYA 4AWEA 2D0GA 4BQ5A 3WUBA 4JHOA 5ABFA 2Y4SA 1I1WA 3VIGA 1OINA 2J74A 4YPJA 2X05A 7CGTA 1W3HA 1MQPA 1C3FA 1C7TA 2GK1B 4W84A 4BCEA 4CCCA 1W3KA 5D8WA 5A6AA 1UYQA 1ISWA 4M82A 3CHCA 9CGTA 3CUIA 2VZUA 5CPSA 1JDDA 2UWFA 3NSMA 1K9DA 1E6ZA 3OA5A 3WKZA 1DWGM 1GNXA 4M1RA 3EBVA 1UD8A 2EPKX 3EMCA 1I1XA 2BY2A 1MWOA 1H1NA 4X9YA 1W1PA 2BHYA 2O9OA 2NSXA 4PYSA 1LL7A 3RM4A 5EBAA 3ARQA 1QVBA 5M3WA 3BCDA 1V0MA 2F61A 1AQ0A 5M03A 1MW3A 4DWSC 1M53A 2V3DA 4NI3A 3PZTA 1C92A 4M24A 3OGRA 3CMGA 2XFFA 1JIBA 2X0HA 1XYZA 1JF6A 2W66A 1JZ7A 1PAMA 5I2UA 1LF1A 4HA3A 4U2ZA 3WNMA 1EOKA 4DWSB 2Y8KA 3CZ8A 3CIVA 3RPMA 2WKGA 1NWSA 1FH9A 4Z2LA 4AZBA 2O9RA 1FHLA 1G0CA 1GZJA 1R7OA 3GDBA 4D71A 1MVYA 2VL4A 4AY1A 4JKLA 4A3YA 1GVYA 2ZX9A 1QBAA 1XSKA 1WZKA 3VIPA 4EKJA 3MMDA 1ISVA 2G3MA 4JIEA 3RMEA 3QOMA 1QHZA 3ZM8A 2QHAA 4BQ2A 2WZEA 2Z1KA 3PZMA 3WMBA 1ZS2A 2GVYA 3WUGA 3RILA 5A8OA 4CD4A 4W5ZA 3THDA 4P8VA 1B31A 2CNCA 2Y5EA 1G9HA 4H8VA 4J3VA 4P7RA 3VDHA 2VCAA 5AC5A 1QNRA 4HU8A 1W9PA 1W32A 4PMXA 3UETA 3WDIA 4TOQA 2E3ZA 3BCFA 3HN3A 3POHA 1J18A 2YL6A 3PTQA 5D9PA 1W9BM 4NRRA 3UG3A 1EOMA 1B90A 2W63A 3FHQA 2V3FA 1VAHA 4ML4A 2EPNA 4FLOA 2XSAA 3OGVA 3MO4A 1KXHA 4URIA 4YHEA 4AD1A 1UKOA 3PZGA 2O9PA 4KWUA 1KWGA 1GOWA 2YDQA 3GH5A 4TVDA 3RM8A 1U33A 2WPGA 3MMWA 4FK9A 4H8UA 4B9YA 4N0RA 4AEEA 2WMJA 2HISA 4ZXOA 1CXFA 1PX4A 4ZXLA 4WSKA 2GDUA 4J3TA 2UY2A 1Z32X 2JE8A 1CTNA 4PMRA 5CQ1A 3BAIA 1XYFA 4CN1A 5A6BD 4GIAA 2VT0A 3TTOA 4BF7A 3WQWA 1CECA 4LYPA 1WB0A 5BXTA 3WNPA 3THCA 1QOXA 2WLYA 1WO2A 4EANA 1ZJBA 1MQQA 3U5YA 3CTTA 3CHEA 5I0DA 1VBRA 4PMNA 1J01A 1KQYA 4W8LA 1KGWA 5FIPA 4ACZA 2A3EA 3T2OA 3VIKA 1CLVA 3WIJA 4E2OA 1CXLA 3K8KA 2OLHA 2XVKA 3ECQA 4JHZA 1AQHA 3ARYA 1ITXA 1ISYA 4IPNB 3T0AA 1SFSA 5CXPA 4MPKA 5A8MA 1RD6A 4W7VA 1KR0A 3VPLA 1E43A 2ZWZA 3BGAA 3VMPA 4HZ7A 4KH2A 5CSUA 3GNOA 3ARSA 2WHKA 3L2LA 4IUGA 1EO5A 2J77A 1BVZA 5A8PA 3VUPA 4AZIA 1XD0A 3CUHA 3GNPA 2GJPA 4GXPA 5CSYA 3MS8A 1E4LA 1JAKA 2CBUA 1E1EA 5BRQA 2WHMA 1BFNA 4A4AA 1DWJM 1XSIA 3KEHA 1KBKA 1FHDA 2XTKA 3N15A 1WNOA 3AJ7A 3MUAA 1JD9A 2PWEA 3AIVA 1UA7A 1HF6A 4FF5A 4U31A 4U5KA 1ECEA 1V3LA 2FHFA 2WANA 1QHPA 1ZBVA 4E8DA 3K1DA 2D0FA 3TP4A 2WW5A 3DYPA 3WD1A 1J0KA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AHX A;  1TA3 A;  4PSR A;  2JF7 A;  2BFG A;  1ITC A;  2Z1S A;  5IHR A;  2C7F A;  3AHT A;  1OIM A;  4PMO A;  4J7R A;  4JFT A;  1BG4 A;  3BAY A;  2OSX A;  2VTF A;  4QLJ A;  3W81 A;  3AHY A;  1CGW A;  2WAG A;  6A3H A;  3AXI A;  2WVV A;  3L2M A;  1CZ1 A;  2EPM X;  2BHU A;  4JCL A;  3PZQ A;  1AQM A;  2OWW A;  3T08 A;  2GJR A;  4BZY A;  2XWD A;  1CPU A;  3AMG A;  4BQ3 A;  1IZK A;  1ZL1 A;  4C7G A;  2D2O A;  4U33 A;  3W82 A;  1H09 A;  4L4O A;  1E6N A;  5FL0 A;  1UD2 A;  1HJQ A;  5DF0 A;  3WNK A;  4UCF A;  4DWS D;  1Q6F A;  3ZJ8 A;  5HPC A;  1DED A;  3UR7 A;  2JF6 A;  4CN4 A;  1UR1 A;  3BAK A;  3D5H A;  2D22 A;  1BPL B;  3L4W A;  3F4V A;  5A95 A;  2HVM A;  3W0K A;  4WK9 A;  2AOS A;  1D3C A;  3WL1 A;  2WZH A;  1AVA A;  1ZJA A;  4H2C A;  4GZE A;  4PMQ A;  4D6D A;  1J0Y A;  4HMD A;  4TTU A;  2OSW A;  2VVS A;  2WBK A;  4GKL A;  4J27 A;  5FOO A;  4W5U A;  5D8Z A;  3AXX A;  2YLL A;  4B16 A;  3IAQ A;  5HPO A;  3ZQ9 A;  4S3K A;  4Y7E A;  1E3X A;  3BXW A;  1KXT A;  4GI8 A;  2AMG A;  2ZID A;  3T0B A;  2QPS A;  5BRO A;  3ZT7 A;  4MNK A;  3W4R A;  1NWT A;  3AI0 A;  4UFI A;  4E4P A;  1UD6 A;  3BSH A;  3AIB A;  3PZV A;  1GJU A;  2CKR A;  4WKA A;  1MW2 A;  2BXZ A;  4XX6 A;  1XHG A;  2BVT A;  2FH6 A;  1DHK A;  4AYS A;  5FL1 A;  3OLE A;  2ZXD A;  4ACY A;  1J10 A;  1E55 A;  2PB1 A;  4P7L A;  1CGV A;  2WHL A;  3CPU A;  3E1F 1;  4NZC A;  1LG1 A;  3SCW A;  1BLI A;  2WB5 A;  5I23 A;  4OZO A;  1R8L A;  3S2C A;  1E1F A;  2CCR A;  2EO7 A;  1NM9 A;  3A4A A;  3EDJ A;  1CEO A;  5HBF A;  3II1 A;  1UD5 A;  3OLD A;  3ARU A;  2GDV A;  1J12 A;  2XYL A;  2XM2 A;  3VD3 A;  2JAL A;  3AZS A;  1NH6 A;  3OLI A;  3KL0 A;  1NOW A;  4V27 A;  4AXN A;  1UHV A;  2CER A;  4WSJ A;  3OGS A;  4M29 A;  3U57 A;  1EGZ A;  2ZE0 A;  2WMG A;  1G5A A;  1HVQ A;  2EBN A;  5M17 A;  4PEE A;  3AS2 A;  1GHS A;  1V6X A;  4P7N A;  5HOS A;  3DYO A;  4CUC A;  1A3H A;  1UKP A;  4GZI A;  2VR5 A;  2WMH A;  4DM2 A;  4Z2I A;  1HNY A;  4JCM A;  3U7B A;  4TUF A;  1OGS A;  3NJ3 A;  2Y24 A;  5JIW A;  2D24 A;  3WD4 A;  4CD5 A;  1PPI A;  2J7F A;  1WAW A;  2W5F A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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