1HJSA

Structure of two fungal beta-1,4-galactanases: searching for the basis for temperature and ph optimum.
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
332
structure length
332
Chain Sequence
ALTYRGVDWSSVVVEERAGVSYKNTNGNAQPLENILAANGVNTVRQRVWVNPADGNYNLDYNIAIAKRAKAAGLGVYIDFHYSDTWADPAHQTMPAGWPSDIDNLSWKLYNYTLDAANKLQNAGIQPTIVSIGNEIRAGLLWPTGRTENWANIARLLHSAAWGIKDSSLSPKPKIMIHLDNGWDWGTQNWWYTNVLKQGTLELSDFDMMGVSFYPFYSSSATLSALKSSLDNMAKTWNKEIAVVETNWPISCPNPRYSFPSDVKNIPFSPEGQTTFITNVANIVSSVSRGVGLFYWEPAWIHNANLGSSCADNTMFSQSGQALSSLSVFQRI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Two Fungal Beta-1,4-Galactanases: Searching for the Basis for Temperature and Ph Optimum
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-1,4-GALACTANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Thielavia heterothallica
total genus 132
structure length 332
sequence length 332
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.89: Arabinogalactan endo-beta-1,4-galactanase.
pdb deposition date 2003-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07745 Glyco_hydro_53 Glycosyl hydrolase family 53
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1hjsA00
4WKAA 3UG3A 3PZQA 3L4ZA 5A6BA 4P7LA 2XVKA 1UR8A 3CHFA 4P8VA 5KEZA 1A3HA 2WXDM 2EPKX 1YHTA 4FMVA 4PN2A 1I75A 5GNZA 4CN1A 3TTOA 3FXYA 4M24A 3AZRA 3S2CA 4Z2GA 1W2VA 1UD8A 4HU8A 2C0HA 4IM4A 4LQ1A 2E40A 5FCZA 1TG7A 4TX8A 4ATLA 3SCSA 4AMCA 1MVYA 2XHYA 4PMXA 1H3GA 4QAWA 2J79A 2E4TA 4J3UA 2IXUA 1KQYA 3AHYA 4UFLA 3GXDA 4CN6A 1UR9A 4TXEA 2J8GA 4PCTA 3VD4A 1MWOA 1UD2A 1I1WA 3OB8A 3VTRA 3OA5A 3SEPA 3MSDA 2RGMA 3CUFA 5I79A 4W88A 3MKKA 3QR3A 1RD6A 4HMCA 4ACYA 4J3TA 2G3MA 3L4VA 3DYMA 4BQ4A 5IFPA 3GZAA 1E4MM 1BAGA 1B0IA 1H0IA 1XGZA 4D1IA 3NYDA 2CBUA 3UCQA 1KGUA 1QW9A 1W9PA 4HZ7A 1IZJA 1QHZA 1OINA 3N1AA 2OYLA 3IJ8A 4NSBA 4X0NA 4D6FA 3WEZA 2YL9A 1JZ3A 2QPUA 2ZWZA 3QHMA 2CHOA 1UG6A 3WH7A 8A3HA 3BAXA 4L4PA 3WF4A 4D72A 1J0IA 1UH2A 1HKJA 4TVUA 2OSYA 1Z32X 2D0FA 3MMWA 2Y4SA 4URIA 1BGAA 2CIPA 1JZ4A 1UA7A 1C7TA 2WW5A 1BYCA 3I3DA 1W1YA 1HJSA 3I3BA 2J7HA 4A4AA 3CO4A 4X9YA 1HJXA 1H5VA 3AHTA 5I77A 4W8LA 1HF6A 4S3JA 2EXOA 4PSRA 1PIFA 1EXPA 1UD6A 1J9YA 1C7SA 1DWAM 3VD3A 1E6ZA 4W5UA 1XD1A 1QOXA 4WK9A 3WF0A 1C91A 1XHGA 1KWGA 1NH6A 2GDUA 4W93A 3O2LA 3WQVA 3CHCA 1PZ2A 1KGXA 1ITCA 5E09A 4ZXOA 3PHAA 4OZOA 1QBAA 2YL6A 2VCBA 2OYKA 4UNIA 1Y7VA 5A6BD 1PAMA 3BCFA 1U33A 1JZ6A 3EMQA 4P7NA 1MW2A 3W25A 3OBAA 1VB9A 3BH4A 2W4XA 4UFMA 1WNOA 1U30A 3KL3A 3TOPA 3TONA 2D3NA 1CGVA 2JF6A 2J7FA 1VIWA 2WZEA 3VU2A 2G3IA 3LPPA 1QI0A 2XYLA 1L8NA 3WH6A 2VOTA 1E55A 1W1VA 1G01A 3DHUA 3ZJ8A 3PBGA 2XSBA 1V6WA 3K46A 4FLRA 2WCSA 1ISYA 4GZEA 1GZJA 2VZOA 4A3HA 3B8SA 5GNXA 1BVNP 3EDEA 2O9PA 3WDHA 3FHQA 3ZIZA 1HL9A 3VGGA 2WSKA 2CHNA 1VFUA 4W7UA 2XIIA 2V3EA 1XH2A 3UR7A 1W3HA 3W6LA 3MMUA 4JCMA 1OBAA 4UFJA 3WNPA 4XB3A 2EPMX 2A3HA 1V6UA 4AD4A 4U3CA 4X0VA 3MV11 3MUY1 4WSKA 4PBGA 1W3JA 2WB5A 2NW0A 1SR0A 1JNDA 2CBVA 4Z2HA 3ZJ7A 3BLPX 1B3WA 1MQRA 3TTYA 1N82A 5LYRA 2VX7A 2DSZA 1JI1A 3VMPA 4AZGA 3CZEA 1WZLA 5ECUA 4P7OA 2J7GA 2XPKA 4UOQA 3VMOA 4JCLA 1EHNA 3WEOA 1BYAA 1VFOA 3VIPA 1V0MA 1E4IA 1W9VA 1OGSA 1B3XA 4QCEA 4OBSA 1LWJA 1WO2A 1MQPA 2VJXA 3QHOA 1GQLA 4Z2LA 4RE3A 4CCCA 2BXZA 4D1JA 1B3ZA 3ZOAA 4TOQA 4HPGA 3AIRA 3SUSA 4BF7A 4QFUA 3W29A 5CG0A 4HOXA 2DQXA 2D2OA 4AXNA 4OIFA 2YDQA 3VDBA 3ZJKA 5DT5A 2ZICA 3SCVA 3VGBA 2F8QA 3PZNA 1FFQA 4Q22A 3ZT5A 3G6LA 5A8QA 4JHZA 2ZWYA 2DSVA 1E6QM 4MADA 1JYXA 1IT0A 2G3NA 1K6AA 2OSXA 2XM1A 2D0GA 1GOQA 2BVTA 2BV9A 1V3MA 2E3ZA 1C8XA 1AQMA 4DUXA 4QLKA 1U2YA 3WF3A 4E4PA 1WE5A 2BY2A 2O9TA 4KMQA 1JAEA 4V27A 4TX6A 3MUIA 1ZJBA 3VGEA 1HL8A 1UR2A 1V03A 3BAKA 4B3KA 5D8WA 3L4UA 1DWJM 2O9RA 1EO7A 4HA3A 1C3FA 5JBDA 3A47A 5BRQA 3IAPA 4GZIA 3WSUA 1UHVA 4YHEA 4U2YA 2F61A 4HOWA 1HNYA 1QNOA 2GJXB 1JFHA 1RPKA 3PTQA 1UKSA 2W61A 3ZT7A 1QNPA 1UZ1A 2CERA 4AY1A 4FLSA 3WF2A 3CZLA 1E43A 3WD1A 4OOUA 3OLEA 5I2UA 3WN6A 3FNDA 4Y7EA 1LL4A 4CD7A 3WKZA 4KH2A 2OWXA 2V5CA 1GNXA 2ZXQA 4PTXA 1E0XA 2ZX8A 5EFDA 4PTVA 2G4FA 3VGFA 1MW1A 3VGHA 4AZ6A 1Q6EA 1EOMA 5KZ6A 1TE1A 4GO9A 1V02A 1WPCA 3WNOA 6TAAA 1KR0A 3N9KA 1QW8A 1LF1A 3PZGA 1JFXA 3KL5A 3VPLA 1CXIA 2WAGA 3SCUA 3N12A 3WL1A 2WLYA 1VFFA 3OGRA 1D2KA 3SCOA 3KE0A 4QLLA 4B16A 4XZBA 5C8BB 2X0HA 3EDKA 1W2PA 1BG9A 3QOMA 4J3WA 1E71M 1WKYA 3WFZA 3ZO9A 2JIEA 5A6SA 5A95A 5A2CA 1KWKA 4B3LA 5E6YA 4JFWA 1BYBA 3WQ8A 4HPHA 3U7VA 4Q7NA 5AYIA 4D6HA 4IPNB 5ABGA 1E56A 2WVVA 1FFRA 2VX6A 1DWFM 4WIWA 5DT7A 2J74A 1KB3A 3KZSA 4KWUA 3IJ9A 2J75A 4H8HA 1L0PA 3GXMA 2V3DA 1UWUA 1MXGA 2HISA 2DT3A 5JUVA 5DMYA 4EAMA 5IFTA 1XSJA 3AICA 1BFNA 3L2MA 1CXKA 4H7VA 4ATWA 2WMKA 3T09A 2W92A 3VD9A 3WQ5A 1EQCA 4F8XA 4AW7A 4NF7A 1LL7A 4E2OA 1W32A 2VRQA 3KL0A 5CPQA 3MUZ1 1E4NA 1MYRA 1ISWA 1CXEA 3TA9A 1E70M 1ODZA 1KXHA 1EA9C 1MFUA 1PEZA 2WM0A 3CZJA 1GOIA 2E8YA 3UEQA 4CU7A 3QOKA 4PSPA 2YBUA 1QI3A 2J78A 1JZ8A 4AC1X 3VUPA 4JL2A 2WVSA 1W3KA 3K4AA 3ZM8A 1PZ3A 1ZJAA 1V0NA 1FH8A 1J0JA 2XM2A 1HP4A 3CIVA 4JKLA 4KGJA 4QP0A 1E15A 4HA1A 5A69A 4WKHA 4PTMA 1OM0A 2NSXA 1ZL1A 4JHOA 3ARWA 5I6SA 2GK1A 2JALA 3VIOA 2VVNA 4OUEA 5A6MA 4AZCA 2DDXA 1V3JA 4NI3A 4ZXLA 5E9AA 4WF7A 4J7RA 3T2OA 1K9FA 3POCA 3PZUA 1KCLA 2Z1SA 3U57A 1KCKA 4DUVA 4PMDA 1C92A 1FP8A 1LG2A 1CECA 1CBGA 1PX4A 1OD8A 2Y5EA 5DFAA 4H8UA 1R85A 2Y2WA 2YA0A 4AZCB 4MTVA 1JZ2A 2XFFA 1CZ1A 1C8QA 5FL1A 1JL8A 4W89A 3A4XA 1E3ZA 1H09A 3CHDA 1W9UA 3PZMA 2WWCA 4W84A 4C7DA 1Q6FA 1E5NA 1KXTA 2VVSA 4J27A 1X1NA 1CXHA 1RH9A 1E0VA 5AC4A 5CSYA 2WCAA 3WY1A 3PZIA 2DT0A 2O9OA 3VIHA 2GJRA 1J0KA 2RGLA 1WAWA 1S46A 1JYVA 2GFTA 2WANA 3AIWA 3BAIA 2YLAA 3EMZA 4CD6A 4KGLA 3WNNA 1TR1A 2ZUNA 2OWCA 2XGIA 3PTKA 1Q6GA 1JNEA 5TD4A 2W5FA 1DWIM 3EDJA 2YLLA 3CGTA 5DEZA 3VDAA 1SMAA 3WUEA 3PZVA 4HZ8A 1ITXA 3AFBA 4F79A 3AS3A 1LL6A 3OLDA 1CGTA 4LX4A 3THCA 4Z2JA 5I78A 4AWEA 2EBNA 5D9NA 1KR1A 2DSUA 2WC4A 3VDHA 2UY2A 1M53A 3WEMA 4MDPA 3VIFA 1FP9A 1BSIA 3NSMA 2W67A 1WP6A 3HU7A 3CH9A 3O9NA 2WVUA 2ZIDA 2PBOA 4GIAA 4WSJA 2VNCA 2PBGA 1JI2A 2WCGA 4TTUA 4PUDA 2FDMA 2B31A 3BCDA 3J7HA 2D20A 2BY0A 4H41A 4MAZA 1JZ5A 3CPUA 4J28A 5A6LA 3EYPA 1PBGA 3FY1A 4UFKA 2WNWA 4D6JA 1JXJA 1JF6A 5EMYA 2GDVA 1JG9A 1Q6CA 1W9DM 5CPTA 1CNVA 2Z1KA 1M03A 3U5UA 3VO0A 1UWQA 1V6VA 3BAJA 1QI2A 4QCFA 2ZXAA 2DEPA 1CPUA 2X05A 5FIPA 3NDYA 3UR8A 3ARZA 4HU0A 5HBFA 1CXLA 3PN8A 3WL0A 1WDQA 4DUWA 2CXGA 2DT2A 1XH1A 1EH9A 3VIIA 3VIMA 3SCTA 4B9YA 1GJWA 4ZFMA 3HJEA 4M81A 3CMJA 2ZE0A 5JIPA 3UETA 3PTMA 2VI0A 3F5JA 1E72M 4PMRA 1B30A 2VR4A 4WLCA 2XJ7A 1QVBA 2QPSA 3RO8A 4AZ5A 4EE9A 5E0CA 3NIYA 4Z2IA 3MMDA 5EB8A 1PX8A 2NT1A 3WF1A 9CGTA 4XUYA 3VILA 4P8XA 3WQ6A 2VRKA 5BXSA 5BCAA 4DWSC 4P7RA 1ISVA 3WUGA 4LPCA 3S6TA 1UZ4A 5D9MA 4GXPA 4CU8A 1GJUA 4HP5A 1KFWA 3MANA 2WHJA 2ZUMA 1BTCA 1G94A 4AZ7A 3GBEA 5M3WA 2CITA 4AD1A 4LGXA 3WUBA 3WMCA 1E5JA 3N18A 2D0HA 3SCWA 1VENA 4E8DA 3CUGA 4YN5A 1E1FA 2E8ZA 1WZKA 4AIOA 2BVDA 4ACZA 3AS2A 2D23A 3AMCA 4J3XA 1V0LA 3RMEA 2VZVA 5BXTA 3LPGA 4U2ZA 1NM9A 4PMVA 1CGXA 2MANA 3BMVA 1E9LA 1D7FA 4MB1A 1UA3A 4H8VA 2W63A 4F9JA 1E6NA 3GNPA 1QI4A 1ISZA 5HNNA 3L4YA 1B3VA 2YA2A 4KRTA 3VD5A 5CSUA 1J12A 2QMKA 1LLOA 4JIEA 4PRWA 3IAQA 3ARXA 7TAAA 2J25A 3RDKA 1VEMA 3ECQA 2WVTA 1ESWA 4MNMA 5BXRA 3AHVA 1XSKA 2CKRA 1Q6DA 1RP9A 1Q4NX 2GUYA 4D6DA 3BC9A 2G3JA 1CENA 3IK2A 4GPNA 4C7FA 3T0BA 3WDRA 3NDZA 3EBVA 5LA1A 3ZQ9A 1E6XM 3ARUA 3AIBA 6A3HA 2WZIA 3BLKA 2W91A 3AHXA 3BSHA 4NRRA 1VJZA 5FD0A 1BF2A 4GQRA 5A1AA 1HIZA 1DTUA 1EGZA 2G41A 1ZBWA 3CMGA 5D9PA 2WMHA 3W27A 2IXVA 2ZX5A 1CWYA 1FHLA 1B9ZA 3II1A 1W1TA 3ARYA 3GDBA 1UD3A 5I24A 3AXHA 1OT2A 1YQ2A 4EK7A 1G0CA 4IUGA 4W85A 2E9MA 3OZPA 2UY3A 4CKQA 3GH5A 3RCNA 3BAYA 1TMQA 4U33A 2ESCA 2OWWA 2WZHA 4UTFA 1EHAA 3AS0A 1GORA 2IUZA 2BFGA 5E6ZA 4UOZA 5ABEA 3WDJA 2V3FA 4M56A 1KBKA 4JKKA 3AMDA 2DPEA 3IANA 1W1PA 3W6MA 3WH5A 2FGZA 1NARA 1UKTA 4AISA 2WMFA 3UG5A 4PMNA 4JL1A 3W4RA 3DC0A 4PTWA 5HDRA 3PZTA 3K8KA 3OG2A 4M1RA 1PPIA 2AOSA 1ZS2A 3WMBA 1B2YA 2ZOXA 3SUVA 1UH4A 1CLXA 3WDQA 4B15A 1BGGA 1EDQA 2Y24A 2VL4A 1OGBA 2DH3A 3AHZA 4MNLA 4UZUA 5CPSA 1H2JA 2E0PA 3ALFA 3VNZA 1JDDA 3ZR5A 4TUFA 4AEEA 4AZIA 4XX6A 1GCYA 2XWDA 1KXQA 4PYSA 5A6KA 4M29A 1JIBA 4P8UA 5A8OA 2YL8A 1KQZA 4OOZA 1TVPA 5IXEA 4MB4A 4N42A 3NSXA 3AXIA 2VTFA 4GINA 2WMGA 1B31A 3M7SA 1XRVA 3PZOA 4W8AA 3ARRA 3WELA 3K8MA 3OGVA 3W26A 2A3CA 1WZMA 1JYNA 3W37A 1CYGA 1UD4A 2FHFA 5JBEA 2XVLA 3SCPA 2VUYA 2J7BA 3UERA 3KEHA 1M04A 2YDSA 4PMYA 1E4LA 2VZTA 3AMKA 1DEDA 3NSNA 1NWRA 4FLQA 1CGYA 3AI0A 4W87A 4BQ3A 2QMJA 1W9BM 3M6DA 3GXFA 2VR5A 1HJWA 4PUEA 1ZBVA 5F7UA 2CBIA 3CUHA 4P7QA 2A3AA 3AMGA 2XTKA 2X1IA 2X2YA 2O92A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4WKA A;  3UG3 A;  3PZQ A;  3L4Z A;  5A6B A;  4P7L A;  2XVK A;  1UR8 A;  3CHF A;  4P8V A;  5KEZ A;  1A3H A;  2WXD M;  2EPK X;  1YHT A;  4FMV A;  4PN2 A;  1I75 A;  5GNZ A;  4CN1 A;  3TTO A;  3FXY A;  4M24 A;  3AZR A;  3S2C A;  4Z2G A;  1W2V A;  1UD8 A;  4HU8 A;  2C0H A;  4IM4 A;  4LQ1 A;  2E40 A;  5FCZ A;  1TG7 A;  4TX8 A;  4ATL A;  3SCS A;  4AMC A;  1MVY A;  2XHY A;  4PMX A;  1H3G A;  4QAW A;  2J79 A;  2E4T A;  4J3U A;  2IXU A;  1KQY A;  3AHY A;  4UFL A;  3GXD A;  4CN6 A;  1UR9 A;  4TXE A;  2J8G A;  4PCT A;  3VD4 A;  1MWO A;  1UD2 A;  1I1W A;  3OB8 A;  3VTR A;  3OA5 A;  3SEP A;  3MSD A;  2RGM A;  3CUF A;  5I79 A;  4W88 A;  3MKK A;  3QR3 A;  1RD6 A;  4HMC A;  4ACY A;  4J3T A;  2G3M A;  3L4V A;  3DYM A;  4BQ4 A;  5IFP A;  3GZA A;  1E4M M;  1BAG A;  1B0I A;  1H0I A;  1XGZ A;  4D1I A;  3NYD A;  2CBU A;  3UCQ A;  1KGU A;  1QW9 A;  1W9P A;  4HZ7 A;  1IZJ A;  1QHZ A;  1OIN A;  3N1A A;  2OYL A;  3IJ8 A;  4NSB A;  4X0N A;  4D6F A;  3WEZ A;  2YL9 A;  1JZ3 A;  2QPU A;  2ZWZ A;  3QHM A;  2CHO A;  1UG6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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