1HTIA

Crystal structure of recombinant human triosephosphate isomerase at 2.8 angstroms resolution. triosephosphate isomerase related human genetic disorders and comparison with the trypanosomal enzyme
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
APSRKFFVGGNWKMNGRKQSLGELIGTLNAAKVPADTEVVCAPPTAYIDFARQKLDPKIAVAAQNCYKVTNGAFTGEISPGMIKDCGATWVVLGHSERRHVFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKVIADNVKDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLRGWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of recombinant human triosephosphate isomerase at 2.8 A resolution. Triosephosphate isomerase-related human genetic disorders and comparison with the trypanosomal enzyme.
pubmed rcsb
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
molecule tags Isomerase(intramolecular oxidoreductase)
source organism Homo sapiens
total genus 87
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.3.3: Methylglyoxal synthase.
pdb deposition date 1994-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1htiA00
3HPXA 3PBUA 4PODA 1A5SA 1RQEA 1K03A 3SSJA 1FWTA 2NX3A 2QUTA 1QPOA 3A23A 1Z44A 5BMWA 3KRUA 5KINA 4BI7A 1AW2A 1RV8A 1QFEA 3U2OA 3NQAA 2VXNA 1J5TA 4JIQA 5DCEA 3DU0A 3INPA 3PF3A 5I3JA 4EWND 1TPEA 3LDVA 2NV2A 3SJ3A 3DENA 3W23A 3MO7A 2TYSA 4O52A 1PCWA 4CQAA 2QAPA 4O18A 4LVDA 1SFJA 4FEZA 5D2WA 3I65A 5LHEA 4QITA 4IX2A 1XBYA 1AW5A 3GYEA 3W7JA 5G4EA 2O7QA 4ONVA 4CNPA 3OHIA 4ZL1A 1ICPA 3W1PA 1DVJA 5HUPA 1MEWA 1IIHA 1EPXA 5FF2A 1AMKA 5LGZA 1Q6RA 5DY3A 3TSDA 2A2IA 5AHIA 3U8GA 3HGOA 5DCBA 2A0NA 3PUDA 1D3GA 4YCOA 1FWSA 1JCJA 4A3UA 4JY9A 1C29A 2ZA3A 3HG4A 3PBYA 3EWUA 3BK0A 5I3HA 1H60A 3O6DA 1MSSA 3BG5A 4JYEA 5IBXC 1BWKA 1X8FA 3V1PA 2Y7EA 5HQEA 3IV3A 2VEPA 3NL2A 4N6EA 1T99A 1OVDA 2G95A 1LRTA 3RLVA 5K9DA 1K8XA 3GAKA 3N3MA 3WJYA 2G5WA 3KVLA 3PG9A 3TXZA 3D0CA 1X7FA 1KM4A 2E6DA 3DBPA 1LRQA 3LHVA 2XFWA 2NUXA 5F2LA 1FCVA 4S2BA 3G8RA 2DZSA 3TDFA 1JCMP 4XBSA 5G2HA 1TTQA 5TIMA 3WK1A 3G1XA 1SZFA 4NJGA 5AC7A 8TIMA 3NPUA 1MEIA 4NJKA 4B5NA 4UTJA 3EKZA 1UBSA 4RV8A 1L2UA 2FTPA 4YLWA 1KM0A 3TNOA 1XBVA 1JULA 1AL8A 4FO4A 3MHGA 3ATZA 3NDOA 1YDNA 1MEHA 4GE8A 2CZDA 1TRIA 5D37A 2E09A 3W7KA 3ANYA 4IQLA 2QUVA 4WXYA 4CNNA 3PWAA 4JXCA 3KHJA 3M6YA 1GEQA 3GAYA 3P67A 4NNAA 3LRMA 2WSQA 3TXVA 2H8ZA 1U83A 3DFTA 3B06A 4MJZA 2J9XA 1OFEA 4UTHA 1RQBA 2X1SA 3P80A 3OG3A 3LI1A 3MP3A 3W2NA 3GDTA 2DZTA 4J9JA 5D2YA 1L6SA 2ZA1A 4LNYA 5DLCA 2TMDA 4LVGA 2PURA 3MJYA 1K8ZA 1KBJA 4TX9A 3USBA 3RU6A 2ZZ3A 1E51A 4M7TA 4UFJA 4PH6A 3B0PA 3ZWTA 5EMUA 5BMXA 4JEQA 2WO5A 3P60A 1GJPA 1O4UA 1G67A 1TPDA 4M6QA 4D2JA 1OABA 1VZWA 3NAVA 3S5YA 3W6YA 3A22A 4QIUA 5U4NA 1TTJA 3LCHA 1KM6A 4UTTC 2NXHA 2H90A 1F05A 1TPC1 1B4EA 3GLCA 3SW6A 4CCEA 5K4XA 1C8VA 1NSJA 3W2MA 1KFJA 3VI2A 3TH6A 3L9CA 4RX0A 1GQNA 1M7OA 3LCIA 4AF0B 1S3HA 2WQPA 2GQ8A 2C18A 5F2MA 3UWVA 4UIOA 3ABQA 3QF0A 2ISWA 3P82A 4UTWA 3FS2A 2WPBA 1IXNA 4JTHA 1H63A 2QDHA 4IPJA 1HUVA 3CTLA 3NZ1A 1AG1O 2ZRXA 3M5ZA 2EF9A 2EKCA 1Y0EA 1YPIA 5D2VA 5HR7A 2A21A 1SO3A 3NQVA 2NX9A 2CFFA 4O0ZA 1OFPA 1SW3A 2VENA 3IGXA 1EUAA 2BX7A 4R53A 5CPOA 1FBAA 4FHAA 4PL2A 2X2GA 3LLDA 3KAOA 1XBZA 4XTDA 3UQNA 1ME7A 3NPWA 5F4XA 1ML1A 4AXKA 3L67A 1VGAA 3V75A 1DORA 3GR7A 3WJZA 5D09A 5MHBA 1IF2A 1PL9A 1YADA 3LCGA 4RXFA 1KFLA 4BF9A 2Z2UA 4E0CA 2RDWA 1A5CA 2TPSA 3UPWA 5FEWA 4AAJA 1JUBA 1TQJA 1GTEA 3B4UA 4I9AA 4O1AA 3DH7A 3SI9A 2DZUA 3KXQA 1HTIA 1OF6A 3CWNA 3IVUA 2FJKA 5H91A 5G5IA 4MY9A 3T4CA 1QDSA 3M5VA 3T78A 4K8HA 5CSRA 4XWUA 3M9YA 3E96A 4PC8A 1YDVA 4GUJA 1UASA 1YYAA 4C1LA 5FEXA 3A5FA 3EX3A 4HIBA 4K7VA 4TO8A 4N02A 1OYCA 2P0OA 4A2SA 2WNNA 1IXOA 3WFAA 2QJGA 3KX6A 3M5XA 4EIVA 1H7RA 4O54A 3GZ3A 3OVQA 3MP4A 3LXAA 1WOBA 4RCXA 3YPIA 1W8SA 1Q45A 1VH7A 5BW6A 2QUUA 3IEBA 3M0ZA 3A9IA 5DXXA 3NXFA 3AO0A 4NNBA 1PS9A 5FEPA 4JTUA 4UR8A 5CPMA 2QCFA 2XN2A 4O10A 4JTGA 3QQ0A 4E38A 4GWEA 4LS2A 1LROA 5G2IA 2J88A 2GVJA 4Y6GA 1I2OA 1P5BA 1RVGA 2VOMA 5LNRA 3HMJG 3O05A 4PFMA 4JX4A 3PS7A 3C56A 1JRBA 5EY5A 4LTSA 2B4GA 2WJZA 2WKJA 4LVFA 1NFBA 1WX0A 2R14A 2I9EA 4PL1A 1P4CA 1VJIA 4OQVA 3BV4A 1ZJIA 5LNVA 1BEUA 1SO6A 4N4PA 1O60A 4Y90A 2X1UA 3G0XA 5CZJA 5D38A 5DBTA 5G1YA 1BTMA 2YFOA 4MVAA 5H2ZA 5LGXA 4MYAA 3JS3A 4WOQA 1EB3A 2CLHA 2ZZ1A 3NQEA 2ZRVA 3W7HA 3C2FA 4MIMA 1GZGA 2YSWA 4JYFA 2E6YA 5C2XA 3EWBX 1ZAHA 2ZZ6A 4UMCA 1H7PA 1RD5A 1TYGA 3S6DA 3O8AA 4AWSA 2RH9A 1TPB1 3CIWA 3SGZA 3W7OA 2Z0IA 2QEZA 2WOQA 3S1XA 4YXGA 4NJJA 3JR2A 4GC4A 3VNDA 3SZ8A 4WY0B 2OT0A 4RZ6A 2AQWA 1LM1A 3MMTA 4L4LA 1THFD 1T0OA 1XXXA 3LM7A 1AW1A 4Z0JA 1F2JA 3WJXA 5E0KA 2ATSA 3MWAA 3P5ZA 1EA0A 2HS8A 4DF1A 1ZY9A 2C14A 2EAWA 1EUNA 4IOTA 2Y85A 4UTLA 4Y9AA 1KTCA 4RXGA 1TPWA 4BR1A 1MZHA 1RZMA 4QISA 3I7SA 3OIXA 4OHQA 2WV8A 3QMTA 3N19B 3HIJA 1GPWA 4O14A 3IGSA 2ZZ5A 1PCKA 3MUXA 3CEPA 3U6WA 5AYYA 2A7NA 4K38A 4HNUA 4NZJA 4DELA 1J2WA 2OZ0A 3A5VA 4ZQOA 1VQTA 1G7UA 1VCFA 2Y61A 3W73A 1RQHA 2YXGA 3QW4B 3QRHA 1BKSA 2QCHA 1WAUA 5CZSA 1F6PA 4LS0A 4A22A 2NXIA 3GDLA 2QJHA 3E0IA 4K39A 4FXSA 2PRMA 3H55A 4LVBA 4GJ1A 3L66A 3LHYA 1NF0A 2DZPA 3P81A 1OX4A 5DELA 1I2RA 1O5XA 1S5TA 3O63A 5DCDA 4NJIA 1XCFA 2YYTA 3NQGA 1SW0A 3TROA 1K7FA 4BI6A 2YPIA 3DFNA 3M7WA 5BRBA 3BVJA 1PHQA 1SR9A 4UNKA 1OFAA 1LRNA 4N9EA 3TQKA 3LB0A 3HO8A 1KFKA 4KFNA 2V5BA 4HNNA 3CQ0A 1FY6A 2Z6JA 2PE4A 1XM3A 2E68A 1WQ5A 1R47A 2WNQA 1PVNA 2BWGA 1XUUA 3ELFA 1TQXA 2VC6A 1V5XA 3NPVA 3QMSA 3HG5A 3DZ1A 5DY2A 2TRSA 3IIVA 1KFBA 4JX5A 3QYQA 1ME9A 1VHCA 3G1AA 3IIXA 4EVZA 4CQ9A 4HKPA 3F03K 4EOUA 3NQ2A 4JICA 3QW3A 1OYBA 1OHLA 2QCMA 3DI0A 4CNOA 4CQ8A 3W22A 1QOPA 3SFKA 2V81A 2V2DA 3EWXA 4RK8A 3NL6A 3NQDA 3W1MA 2QF7A 1KV8A 5I3GA 1R46A 1VHNA 4R33A 3G1YA 3PUOA 3O6CA 2V9DA 1UB3A 3CPRA 4JYDA 2HMCA 1ADOA 4JTKA 5DBUA 3VKJA 3B0UX 3E49A 3R2GA 4ZQMA 1TV8A 2ZQ0A 2JKPA 4N9BA 1QNVA 4BWLA 2OT1A 5KZEA 3W88A 1Z41A 4KWVA 2GJLA 3W86A 4WY0F 3VE7A 4DF2A 3O1NA 2NUYA 3L5MA 4LC8A 3R12A 4FNUA 2P1FA 3ZR4A 5LSMA 3W2JA 3LCXA 2ATMA 2NWRA 2ABBA 3OBKA 5K2ZA 1KLZA 2Y7FA 3M47A 2VEMA 3LCFA 3W70A 2FFCA 2Q8ZA 3E02A 1BWLA 4HHPA 3Q58A 5BOOA 3PR2A 3G1DA 1H62A 4IJBA 2J27A 2FB2A 1KM3A 1M6JA 3S5OA 2CLLA 1KM5A 2FPTA 3GXTA 1FWRA 2FDSA 1QPQA 2P10A 1TV5A 4O0KA 4M6PA 3L0NA 2GUUA 1K3UA 4HNTA 4TU1A 1TO3A 1ZENA 4MFEA 3L65A 4JTLA 4NQ1A 3NQ8A 4PTNA 3N2XA 4NZFA 4FB7A 3C3NA 3C2OA 4X22A 4UC5A 1PE1A 5L9FA 4DBDA 1SSGA 3OEXA 1V7YA 2ZA2A 4WX2A 3EEGA 5A8GA 3MHFA 1KFEA 4IGHA 1F7BA 3PAJA 5SWUA 2QCLA 2ZZ7A 4JDYA 2C0AA 5CZTA 3FEMA 1WYIA 3OA3A 2Y88A 3W1LA 3G0SA 4IMDA 5D30A 3TX9A 3CIXA 1DOSA 2DU2A 3SY5A 3ZFHA 2QDGA 3LTPA 1EWEA 1KW1A 3KRSA 1ALDA 3W7PA 1IGSA 1KLYA 3G1FA 4PCFA 4POCA 1J4EA 5FF4A 4OT7A 2YR1A 2E5BA 1XFBA 3W7RA 1JR1A 4O28A 1FDZA 2ZRYA 2JK2A 1LTDA 2TSYA 5FF3A 3QMRA 1FDYA 2Y70A 2J24A 3LX9A 1JCYA 2WSRA 4Z0SA 3PSWA 1OG0A 4OV9A 1W3TA 1F74A 2KZHA 5CG7A 1JVNA 5E1QA 3FLUA 4NX5A 1W0MA 4UFHA 4GUHA 3QH2A 2QAFA 4IMCA 4NU7A 3S8HA 3BGGA 1XDMA 4N6FA 3IGUA 5FF0A 4N9CA 2HTMA 3PB2A 3H54A 1GTHA 2JBMA 1ZNNA 4O19A 1YTEA 2GJNA 2ZYFA 1QPNA 1GG0A 3A21A 3MHUA 4FNQA 5KTLA 3Q2DA 3S1VA 3DHDA 2B7QA 2C6QA 4JR5A 4YWIA 3TKFA 4AWTA 4KWWA 3LERA 1W5OA 1YXYA 1W54A 3W83A 1W3IA 2ZZ2A 4LT9A 3UWWA 4NT0A 3RF9A 3C61A 4GXMA 1I2QA 4XZ9A 3NZRA 4MKNA 1NAL1 3PVFA 3M41A 1L6YA 1A5BA 2Y62A 1ZAJA 2PC4A 3TFCA 1JRCA 3TAKA 1WBHA 1N7KA 3FKRA 2B7NA 4MZ8A 3QFEA 3FFSA 2HSAA 3G0UA 1KTNA 3LLFA 3CU2A 3IIPA 1R30A 4QSHA 4ADTA 1XL9A 1H51A 5LHFA 1W31A 1VR6A 2D73A 4XKYA 1X1OA 3UWQA 2A6NA 3CEUA 5AHLA 3O07A 1F5ZA 2DP3A 2VFFA 1DQWA 4U28A 4HSNA 3LCLA 4LV9A 2H3DA 2NUWA 2V2CA 4G1KA 1VLIA 3TW7A 4KKXA 2H8XA 1TPH1 4OBTA 2V0TA 3EXRA 5K9XA 4GUFA 3MW7A 5LZLA 2A85A 2R91A 3TSBA 1SZEA 2PRHA 4GNJA 2ISVA 3UWZA 1A50A 1K7EA 3DHFA 4ZMGA 3HGSA 1W5QA 1TIMA 5D2XA 1TREA 3FKKA 1VYRA 2XN0A 1TV7A 3CM4A 2A6LA 4H4IA 5IM51 1WA3A 1NVMA 4HN4A 4QM1A 1SW7A 3GDRA 4O50A 4RZ5A 1FWNA 5HNRA 3P84A 5DN1A 3THQA 1EEPA 2ABAA 1K02A 4FXRA 1WBJA 3P8JA 1S5VA 2I14A 1LP6A 1I45A 4MLJA 3WJWA 1JQXA 1PV8A 4Z1DA 3M16A 3LHUA 1KA9F 4YCPA 4LUIA 1ONRA 3TW6A 5HJLA 1G4SA 1G7VA 1X1ZA 5AB3A 5K9CA 3Q37A 4O4VA 4BFAA 4X2RA 1B4KA 1FDJA 4RJEA 4HSOA 4WY0A 4KFOA 4MY8A 4YMZA 3UD6A 4DO6A 1KM1A 4GFSA 3P61A 2PRLA 1MXSA 2YCEA 3W7DA 2VFIA 4JTTA 2C15A 4X9SA 3VE9A 3NQMA 3TA6A 2B0MA 1O95A 3W1QA 1KTBA 3C4UA 2G97A 2YFNA 4QJ1A 4FNRA 1IXQA 3P7YA 1F76A 1EP1A 1H7OA 1DL3A 1LDCA 3ATYA 1H7WA 1IIGA 3PBWA 4K7YA 1EP3A 1MO0A 4ADUA 4IUOA 1NF7A 1B57A 6ALDA 4E2DA 5FI8A 1W5PA 3DAQA 1I8JA 2C3ZA 3W2LA 3BW3A 5D02A 6TIMA 1ICSA 1TPUA 1LLZA 5BNKA 4HT3A 5G1TA 3KVKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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