1HTIA

Crystal structure of recombinant human triosephosphate isomerase at 2.8 angstroms resolution. triosephosphate isomerase related human genetic disorders and comparison with the trypanosomal enzyme
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
APSRKFFVGGNWKMNGRKQSLGELIGTLNAAKVPADTEVVCAPPTAYIDFARQKLDPKIAVAAQNCYKVTNGAFTGEISPGMIKDCGATWVVLGHSERRHVFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKVIADNVKDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLRGWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of recombinant human triosephosphate isomerase at 2.8 A resolution. Triosephosphate isomerase-related human genetic disorders and comparison with the trypanosomal enzyme.
pubmed rcsb
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
molecule tags Isomerase(intramolecular oxidoreductase)
source organism Homo sapiens
total genus 87
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.3.3: Methylglyoxal synthase.
pdb deposition date 1994-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1htiA00
1JUEA 4EF9A 5KZMA 1W5QA 4O13A 1Y0EA 2JGQA 1KTCA 1KM4A 4YWIA 1I2QA 5D2YA 3B03A 1L6YA 1W54A 1UUMA 2RDUA 2PRMA 1FCUA 4DF0A 2QR6A 1Q6QA 3UWVA 4LVBA 4LRTA 3W6YA 3Q94A 4QNEA 2P1FA 4NNCA 2FIQA 1W31A 2EHHA 1T8XA 2VELA 3TSBA 4UMCA 4ADSA 3TH6A 3W2JA 1R2TA 3A5VA 2NV1A 4NZJA 2XN1A 2CLIA 1ZAIA 2FFCA 1G6CA 1GTEA 2CLMA 2CLKA 4UFJA 2WQPA 1KFEA 4WXZA 3NQFA 4M7SA 3U8GA 1HFBA 3R13A 2YDAA 4GUFA 3W72A 1L6WA 3PS7A 4YMZA 5E0KA 5EYWA 1OYBA 4K6AA 4HIBA 2GQAA 1B57A 2CLEA 2C1HA 4MOZA 3GKFA 4K39A 3M44A 1BTMA 1UB3A 1I45A 4LNYA 2A85A 4FHAA 1J2WA 3LV5A 3P80A 3RMJA 2G96A 5J5RA 1JULA 5DN1A 3FLUA 3S1WA 4JYDA 4ML9A 5J5DA 4EVZA 2FPVA 4OBTA 5D09A 2V2CA 4YLWA 2YFNA 4GWEA 3HGSA 2ZA1A 1O5KA 1KFBA 3IIZA 2BTMA 2XFWA 5A8GA 1BWKA 3S5ZA 3C4UA 1G4SA 5AYZA 4FEZA 3ABQA 2QCHA 4MKNA 2WV8A 4AHOA 3UWZA 2QKFA 3M0ZA 1AMKA 5DY2A 1VYRA 3FKRA 1TPB1 4C1KA 1W0MA 3NXFA 3EWZA 4M7TA 3L9CA 4TR9A 1KM0A 4FX7A 4OT7A 5BNKA 3W7QA 1DKWA 1VR6A 1OX4B 3W86A 2PCQA 1G69A 2FDSA 3NDOA 1K8YA 3M16A 3MP5A 1LDCA 3OG3A 4UFHA 3W84A 1PCWA 5GVJA 2TRSA 2OCZA 3K30A 3STEA 3YPIA 4OU1A 3IEBA 1EX5A 3QMRA 1TJPA 3BLFA 3W1NA 3L68A 1LLWA 2B7NA 4N9DA 3G8EA 1IGSA 2A2IA 5FF4A 3LX9A 2ISWA 2AGKA 4JEQA 3O05A 4I7WA 3W7RA 1BWLA 3M5YA 4FIRA 1JCMP 5EA9A 2ZA3A 5D03A 3W88A 4E0CA 3BARA 1RR2A 4JX4A 2Z0IA 4WOQA 3PC0A 4RR4A 3C3NA 2DJLA 5CZSA 3UWQA 5CPOA 3WK2A 3P5YA 4X3ZA 1F6KA 3Q37A 3A24A 3DI0A 2CZEA 3M5XA 3N73A 3G18A 1F5ZA 1XM3A 2ISVA 4JNMA 2ATMA 5AN7A 3C2VA 3UPWA 3USBA 3P82A 5D2WA 1RQHA 3IVUA 1XL9A 1OVDA 5BMWA 3FKKA 1GYNA 1TO3A 3W1MA 3QSRA 4UTIA 4FX8A 3O63A 2Y62A 4MPQA 1NF7A 3F4NA 3SSJA 1DBTA 3TC7A 1XBZA 5DCDA 1FDYA 4XQ6A 2YPIA 2WOQA 1UJPA 3M6YA 2E5CA 3GIYA 3VNDA 1GVQA 3LBMA 4LV4A 2CZ5A 5IBXA 4PA8A 1W5MA 1NF0A 4K8HA 2YZRA 4UCGA 1G67A 3S8HA 2J9XA 1VRDA 4KFNA 1TQXA 3NL2A 1RD5A 1F7BA 3M47A 2J88A 3CTLA 3W7NA 1R46A 3CIWA 4IMEA 4Z1DA 4O1DA 4UMAA 4XTDA 3IVTA 3NNTA 2OMAA 3I7SA 2DORA 3W1UA 2D73A 3IRDA 3LI1A 1SFJA 3T7VA 2H90A 3W23A 1W56A 5AC7A 1UASA 4IUOA 5FF2A 2NUYA 1L6SA 3DI1A 1OYCA 4FNSA 3IIVA 1S5TA 2JGYA 3QQ1A 3ABOA 3NPXA 4MFDA 4NX5A 1LM1A 4Q33A 2C19A 4I9AA 1GWJA 4N4QA 2A0NA 5G2WA 4GUIA 1F76A 2CZDA 2QCDA 3NPVA 2H6RA 4O28A 4JS3A 1ME8A 2C3ZA 2QCLA 3I7RA 5DCEA 2H8ZA 3TDFA 1LTDA 4JTGA 3I6RA 1PV8A 1XFBA 1VHNA 1T96A 4GRSA 4U4MA 4BWLA 1OX6A 3P84A 5DXXA 3HB9A 4NXKA 5I3KA 2CLFA 3N2MA 3W7CA 1YTDA 3W1TA 2YR1A 3R12A 4UFLA 3HMJG 1KM2A 1W3IA 3S1XA 2O7SA 5AYYA 2WNNA 3VKJA 5G5IA 3DU0A 2Y61A 4PCFA 1H1YA 2QJIA 5F4SA 2WNZA 1MEHA 5I3FA 3FYPA 2GUUA 3PG8A 2VEIA 2I14A 3N9SA 1A5BA 5BW6A 4I7VA 5LNWA 1HO4A 3EXSA 1MO0A 5C2XA 1G4PA 1QPOA 5CZTA 1W5NA 3IIPA 3PBUA 1KM6A 4KFOA 1IIHA 4AAJA 1RQEA 3JS3A 3PY2A 1VS1A 1YTEA 2JKEA 3ELFA 1AW5A 1FWSA 5H91A 5I3GA 3RLVA 4BI7A 3NQ8A 2WO5A 3NAVA 1SZEA 3EX6A 4HNTA 1W1ZA 2GJNA 3ATZA 1K03A 2QJHA 5HWMA 2ZA2A 2EKCA 2GVLA 1ZCOA 3KAOA 2VC6A 4PC8A 1SZNA 1YDNA 5C55A 3QPZA 3VE9A 4S2BA 1AK5A 1JRCA 1GVOA 4UTWC 1TTJA 3EEGA 3ZWTA 5HMSA 4O14A 4S1FA 1QWGA 1ICQA 3GK0A 3W7JA 3HO8A 4GJ1A 1DQWA 1TPC1 2A7NA 2BXVA 1A5CA 1YADA 4GBUA 1VCGA 1T0OA 3GNNA 4EWND 2WJZA 1XXXA 1YLVA 1IIGA 4ADUA 3IIOA 5KZEA 5LHEA 1WX0A 3QC3A 4MLJA 3CU2A 3P62A 2Z2UA 1YTKA 4O1CA 4LTSA 1H7WA 5DLCA 3W1XA 4LVAA 4KFPA 3W2NA 4LVGA 2ZRYA 3DAQA 4O18A 2ZFAA 3O6YX 3W85A 1NVMA 1TMHA 1ZNNA 4LRSA 4UTKA 1EP3A 4K38A 3GAKA 1OABA 1YDOA 3NQDA 2NWSA 2QCNA 2ZCGA 3E12A 3MJYA 1OK4A 3W7KA 4JICA 3NPWA 2QCFA 3KHJA 3O07A 1JJKA 4O4WA 4O10A 3W2MA 2VKZG 5TBOA 3UXAA 3HGOA 3O6CA 4O16A 3THAA 1FCBA 1ZALA 4LW7A 3G1AA 4OWGA 3TMLA 4WQ6A 1JCXA 2NLIA 1JCYA 2ATSA 3PAJA 3E0IA 1WBJA 5G4WA 4ZQMA 3TR2A 3EWBX 4IMDA 5HINA 1TREA 4BK9A 4IX2A 4LVFA 2VENA 5LNUA 3LLFA 4TU1A 3W76A 5HQEA 2RKXA 3DBPA 4H3DA 4HPXA 3G0UA 5D2TA 1LROA 3F03K 8TIMA 4IQLA 1PCKA 4YCPA 4Q32A 1VC4A 2YXGA 2X30A 1EWEA 2J24A 1ONRA 3QEZA 3MBDA 4OGZA 2ZRVA 5F2MA 1PE1A 1TPFA 5KINA 4OHQA 3W7GA 1P5BA 3LI0A 2TYSA 4H6KA 5D30A 2JKPA 1SO3A 4E38A 4PODA 1RV8A 3QMTA 4KKXA 4J9JA 1OX5A 3LLDA 3IGUA 3LXCA 3R8RA 5EPDA 1SZGA 4Y8FA 2QEZA 2NUWA 2QCEA 3NL5A 4QQ3A 5AHNA 3BW3A 5AOUA 4C1LA 3EX4A 4JYFA 2G5WA 3FJ6A 3QRHA 1K02A 3OVRA 2A7RA 3SIZA 4DO5A 5T26A 5L6UA 3MO7A 4DPPA 3UZJA 1G7UA 1QDSA 1S5VA 3BGJA 2X16A 4CNPA 1CW2A 1TPEA 4ORIA 5D33A 3OBKA 5FEWA 3B05A 3QQ0A 1SO4A 2GQ9A 2NV2A 4AEOA 2Y85A 3H54A 4XTIA 3TSMA 2VFDA 1P4CA 2FB2A 4G1KA 2YGYA 5EMUA 2ZZ6A 1VZWA 3O1NA 3PULA 4O50A 4WY0A 4ICNA 3LCFA 3TUUA 3P67A 1X8FA 3KX6A 4N6FA 3O15A 1XUUA 2NWRA 2ZRZA 5K3VA 1EA0A 5EBUA 2FTPA 2BX7A 3O16A 5LGZA 3QMSA 1B4EA 2VFGA 3HJZA 2VXNA 4O8RA 3U6WA 1GTHA 3T55A 2PRHA 2ISSA 1VLWA 3FFSA 1WBHA 4RKAA 3QFEA 4P61A 3UQNA 1PS9A 2O7QA 3PBYA 2VEKA 4A2RA 3PUOA 3GDLA 1VYPX 1MZHA 2DJXA 3NL3A 5HR7A 4OV9A 2FPYA 3NQEA 1IXQA 1NSJA 4XBKA 1ZY9A 3W2UA 1KLYA 2ZTKA 3EWUA 3LCHA 3SW6A 4JTJA 3TQVA 1LRTA 3LGEA 4O11A 5LHFA 3WJXA 5D38A 1LORA 4K7YA 4IWWA 3TQ0A 2V2DA 2ALDA 1LLZA 2Q3RA 4UUIA 3C52A 1OYAA 1R2SA 3O6DA 3WJZA 1JQXA 1G4EA 3VCRA 3SGUA 3BVJA 3FA5A 4AB4A 3TNOA 4DF1A 3DXIA 4KWWA 4QAIA 3C0JA 1O5XA 3M5ZA 1VGAA 4Y6GA 2LLEA 1A53A 4DO4A 4IOTA 2DZUA 4JD4A 5AB3A 5CSSA 1LCOA 4GNJA 1M5WA 4EIVA 2HSAA 1J4EA 4QNWA 2PRLA 4IJBA 1G7VA 1KFKA 2NUXA 3P81A 1KV5A 4ZVJA 1TTPA 4LWWA 4FB7A 1OHLA 2NX3A 4JYEA 1GYLA 2HTMA 3R5EA 1TYGA 4NJKA 2CLOA 4UTWA 3MYPA 4H4IA 3DHDA 3LCLA 3TW6A 1M6JA 4XZ9A 1OFRA 3LHTA 2F84A 3PF3A 4XUGA 1X1OA 4A21A 2QDGA 3NQMA 3C6CA 3UWYA 3PG9A 4LS1A 1OFBA 1JVNA 2BZNA 4DQWA 1LRNA 5C54A 1E51A 4JDYA 4UTHA 1JQVA 3C2FA 1CX9A 1ML1A 3F1QA 5TIMA 1QOPA 1ZJIA 4IMGA 3KVMA 3TXVA 3FEMA 4UTLA 4N2YA 1D3GA 5LNSA 3GXTA 3LV6A 3GDMA 4JTUA 2DZWA 1XBVA 3VI2A 1TTQA 5C5YA 1QMLA 3OA3A 4QISA 3GXPA 3TAOA 1TPWA 2QJGA 1EP2A 3CB8A 4JY8A 3W2KA 5LKYA 1X1ZA 3BW4A 4GUJA 4M6PA 3TV8A 5K9DA 4E2DA 4XWUA 3W73A 4O52A 3L67A 5FI8A 1FXQA 3GXNA 3W9ZA 1KLZA 1W5PA 3DGRA 3ABRA 1DOSA 2NZLA 3G1FA 3S1VA 3U2OA 1FDZA 2QAPA 3F4WA 3E96A 3Q58A 1TCDA 3P61A 2A4AA 4MYAA 3HG2A 3G1SA 4HKPA 2B7OA 4AF0B 4WUIA 4UFMA 4X9SA 2WSYA 1WOAA 1SZFA 3NG3A 3W1RA 2ZQ0A 3BG9A 2DU2A 1FCVA 4HSNA 2QF7A 4D2JA 3BO9A 1LBFA 3NOEA 2Y6ZA 4NNBA 1JUBA 3OIXA 3UPBA 1OX4A 1YXCA 2TSYA 4DF2A 3THQA 2C15A 4TMCA 4N02A 3A23A 4WD0A 3N14A 5I3JA 5AHIA 1K7XA 1K8ZA 3LHWA 2H3DA 1ADOA 1ZAJA 4JTLA 2YYTA 4EF8A 1RPXA 3NVTA 3ZR4A 4DXVA 4K37A 1ME9A 3L5AA 2ZZ3A 3EXRA 1DJNA 3N19B 5FEPA 4AWSA 5AHMA 2Y63A 2DZXA 5HWJA 1F73A 3P7YA 5LSMA 5F4XA 3W75A 1TIMA 2G95A 2B7PA 1EP1A 1TRIA 4NJHA 3HPSA 4WXYA 3DFTA 4A29A 1KTBA 1KBIA 4JIPA 3H55A 3W87A 3I7QA 5DBUA 5D05A 3PR2A 4X22A 1XUZA 1A5SA 3CPRA 3NO5A 1GT8A 1UBSA 2NX9A 2Y88A 3NQCA 4UXDA 3A22A 2ZDRA 1SUXA 4JN6A 3KVKA 4TMBA 2H3BA 3VE7A 2E5DA 1OFQA 5DBTA 3S0CA 4FNRA 1C29A 1QPNA 3DFNA 2J9YA 3GNDA 2Z6IA 4KWVA 3DFSA 5CKSA 3A21A 4Y96A 3GZ3A 1FXPA 1K3UA 1KV8A 2R14A 3KVLA 2R94A 1QOQA 1ICPA 1D9EA 5D04C 3RFAA 1P0KA 2WNQA 4IPJA 2OT1A 3H53A 3MHGA 4RCXA 3C56A 1WDWA 2V5LA 1OFOA 3IGXA 2A6LA 3M41A 1WV2A 3CM4A 4WX2A 3HQ1A 4L4LA 3SECA 4BI6A 2E6YA 3TKFA 4FO4A 4UTUA 3C8FA 1Q6OA 1IF2A 2Y7EA 5KZDA 4UFKA 4R7JA 1IXOA 1M7OA 2EGZA 2V0TA 7TIMA 5EL1A 4Z1CA 1FQ0A 3E49A 4O1AA 4O57A 4CCCA 1EB3A 3LCXA 1NAL1 3SR7A 3B0UX 2J9ZA 3G0SA 1P0NA 3HIJA 3L2IA 4O12A 3W83A 3GKAA 1TV5A 4ZQPA 4DELA 4JTIA 3LOTA 3G1YA 1KFCA 2YX0A 4BFAA 3WJSA 4Z0SA 3LRMA 3TQKA 2HS6A 3WK0A 3WJYA 4AH7A 3QPYA 4RLIA 3CQ0A 3BV4A 4HNNA 3GDKA 3W3OA 1X7FA 5K9XA 1OG0A 3LCIA 5K4XA 4ALDA 3B06A 4DO6A 4IMFA 2Y7DA 3OEXA 6TIMA 1EIXA 2F7FA 4LC6A 1OFEA 3QW4B 1JCLA 4IMCA 3KXQA 1L2UA 2BLEA 2FJKA 2E1DA 3DFQA 3LERA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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