1I2NA

Crystal structure of escherichia coli transaldolase b mutant n35a
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
TDKLTSLRQYTTVVADTGDIAAMKLYQPQDATTAPSLILNAAQIPEYRKLIDDAVAWAKQQSNDRAQQIVDATDKLAVNIGLEILKLVPGRISTEVDARLSYDTEASIAKAKRLIKLYNDAGISNDRILIKLASTWQGIRAAEQLEKEGINCNLTLLFSFAQARACAEAGVFLISPFVGRILDWYKANTDKKEYAPAEDPGVVSVSEIYQYYKEHGYETVVMGASFRNIGEILELAGCDRLTIAPALLKELAESEGAIERKLSYTGEVKARPARITESEFLWQHNQDPMAVDKLAEGIRKFAIDQEKLEKMIGDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Identification of catalytically important residues in the active site of Escherichia coli transaldolase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
molecule keywords TRANSALDOLASE B
total genus 134
structure length 316
sequence length 316
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2001-02-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1i2nA00
3OBKA 3TMLA 1T99A 4G1KA 4LU0A 4TU1A 1TPUA 3UXDA 2OJPA 3LRMA 1QAPA 1XXXA 1OFEA 2WNQA 5KZDA 3QSRA 1W56A 2VFDA 4KFPA 4QISA 3TKFA 3NNTA 4PA8A 4AHQA 1K7FA 4FEZA 5GVJA 1YPFA 1KV8A 2VENA 1G4SA 3C2EA 4IX0A 4RR4A 2VFIA 5CPLA 5I3FA 2FTPA 5D2WA 2ABBA 2DZTA 3DZ1A 1P1XA 5LSMA 2ZZ2A 4P2VA 2X30A 3PC0A 4YLWA 1PV8A 1JQVA 3PSVA 4IXHA 1DORA 3LTPA 3NQVA 4M7TA 2A7NA 4YXGA 5CKSA 1H7XA 4JTLA 4NXSA 4Q32A 4K37A 2VFGA 3S5ZA 1OX4A 3UWZA 5EA9A 4AHPA 2G5WA 2I9EA 3I7SA 2QUUA 2A4AA 4O1CA 5CZJA 3W2KA 4LS0A 1YXCA 3Q2DA 3TAOA 5E93A 1S5VA 2I14A 4NT0A 3SZ8A 1WYIA 2BWGA 4ZMGA 1OFOA 4RLIA 1I4NA 1OF8A 1TCDA 2GVJA 1U83A 1VYRA 4JGDA 3SGZA 3E49A 3P67A 3W70A 3G3MA 2XN2A 4BF9A 1AL7A 3MWAA 3N19B 5DN1A 5DELA 3IGXA 4GUFA 3UWWA 3KVJA 2YZRA 1PHWA 1OFBA 4MZ8A 4X9SA 4WD0A 2NWSA 3U8GA 1FWTA 3TQKA 4O13A 3EX4A 3STCA 2GJNA 1H51A 1TB3A 1TO3A 2ZYFA 3VI2A 1K3UA 1RD5A 1GG1A 4HNUA 1KLZA 1X7FA 5AC8A 3OG3A 1OHLA 2PRLA 5C54A 2ZRYA 2J9YA 3QEZA 5EY5A 4EIVA 4CCEA 2NXHA 1G4TA 1J5TA 5D05A 5EPDA 1LP6A 3QMRA 3S42A 1T96A 5C6MA 3TFXA 3BPWA 3CWOX 1SW7A 3M1ZA 4LVBA 4RV8A 3R2GA 4JTEA 2V8ZA 4WQ6A 2ZZ4A 1ICQA 5AN7A 4K39A 1W5OA 5TBOA 2ZQ0A 1JCXA 1S3HA 3KXQA 3F1QA 1KM4A 3BGJA 3N9RA 1VCVA 3RNDA 2WJZA 1YTKA 1TYGA 3ZR4A 4IMCA 4O4WA 1A5BA 4NNAA 3GDRA 1OFRA 1O5KA 2TMDA 1KTBA 2B7OA 3HG2A 5AHIA 5EMUA 4FNRA 4YL2A 1FBAA 2B7QA 4MY9A 3C2VA 3UY8A 4H3DA 2FFCA 3E9AA 1KM3A 5D03A 2CWNA 1EP1A 5HWMA 4JD4A 3W1AA 2V2HA 4L4LA 2W0UA 3EX6A 3I7QA 3S1VA 2YW4A 1TPEA 3EWWA 4QSHA 3PM6A 1FCBA 1XDLA 2RHGA 4HNVA 2DZUA 2CZ5A 4MYAA 1UJPA 4LS2A 5LNVA 2C19A 5ABTA 2CLHA 4LUJA 4MZ1A 2C13A 3TH6A 3QF0A 3SIZA 2PC4A 3B03A 3QSTA 3N14A 1B3OA 4X22A 5D2YA 1H1ZA 3GR7A 2QCGA 5EBUA 5FESA 3ABQA 3YPIA 4Z08A 1A53A 5KITA 1NVMA 4LVFA 3UNDA 4DO6A 1QR7A 4LOCA 4N02A 4Z1AA 1S5WA 2NV1A 1Z42A 2CLKA 3BW3A 2NUYA 2YYUA 3E12A 3TUUA 4M6VA 3PVFA 3NXFA 2NUXA 3SGUA 1HFBA 1OYCA 4UTUA 5K9XA 3IIVA 3I65A 4K6AA 1R30A 2EPHA 2VFHA 3W7MA 5K7JA 2NXGA 3DFTA 3U2OA 2EGZA 3G22A 4CNNA 4AB4A 3M6YA 4MOZA 1SU5A 1ZAJA 1KM0A 1M6JA 4IJBA 3KRSA 1RZMA 3NQMA 3WJYA 4H6KA 3DFPA 4JICA 4RZ4A 3MHGA 4GUHA 3TXZA 3T4CA 4DPPA 1ME8A 1LOSA 5MHBA 2G96A 1KFKA 1OFAA 1KM5A 1QWGA 5KZEA 2WSRA 4UCGA 3DGRA 2NX3A 2C18A 3GZ3A 3QJAA 4JTKA 1I2RA 3WJZA 1EB3A 1AMKA 1XBVA 2ATSA 3DKLA 2VEIA 1W3IA 1KLYA 5D32A 4S2CA 1VZWA 4O14A 4QITA 4YMZA 2YYTA 4BWLC 1O95A 4O17A 5HULA 2A7RA 2ZTKA 1AW1A 2BLEA 3FA5A 3FYPA 2BTMA 3O6YX 8TIMA 2WNNA 1XDMA 5D09A 4OT7A 4FX8A 3WK1A 1GPWA 2P0OA 5K2ZA 3HPXA 3LTYA 3HGRA 4JX5A 3LOTA 5AFDA 3TROA 1TMHA 4N6EA 2EAWA 1TPB1 2A1YA 1HUVA 2C6QA 2TRSA 4XBKA 5TIMA 3UYCA 1SO3A 2QAFA 4O28A 4M6PA 4ADUA 3G0UA 1TV8A 1KV5A 5FEXA 3TMQA 2XFWA 4QM1A 1VQTA 1XUUA 1TPWA 4FNUA 3W72A 3C2FA 4DPQA 3TNOA 2V2DA 2OT0A 2X1RA 1QO2A 2TYSA 4LTSA 3LHZA 4OGZA 5F4SA 3C52A 1F6PA 3MYPA 1GYLA 3FIGA 5SWUA 5HNRA 1EP2A 3LCFA 1SZFA 3T7VA 5IBXA 3B0VC 2H3BA 1OK6A 3HQ1A 2QCFA 3TSBA 2ZZ3A 3KHJA 5I3GA 3DFOA 2NZLA 2B0MA 3P8IA 1A5SA 5LHEA 2Y89A 1AG1O 1GQNA 4PH6A 4ONVA 3BLFA 2FPYA 1AK5A 5DXYA 2QCDB 4DF2A 5I3KA 2GQ8A 5I3HA 4JYFA 2QCLA 4JX4A 4E0CA 1W5QA 5HR6A 1DV7A 1AL8A 3FKRA 2WPBA 1M7OA 2DJLA 1F5ZA 1VLWA 4HPJA 3BLEA 1H61A 1IF2A 4ZQMA 2RFGA 5FEWA 3HO8A 4PTNA 4GJ1A 3FS2A 2E5BA 3NDOA 3ABRA 2PE4A 4I7UA 3KVLA 3EX2A 4ZQRA 3MI2A 3L5AA 3W71A 2LLEA 3W7NA 3M41A 1B4KA 3GXTA 4FIQA 1V5XA 2YCEA 3H55A 4UFIA 1J4EA 1GJPA 1QPQA 5DBTA 4S2BA 3O8AA 1TJRA 3EX3A 5D30A 2X16A 2R94A 4K7YA 4HPXA 3W83A 1XBYA 4NNCA 3S1UA 3L0KA 3BARA 1Q6LA 3NQGA 3MW7A 3UD6A 3N2XA 4JR5A 1W31A 1YLVA 2FJKA 4KFNA 4WY0B 3NQDA 5KZMA 5KTLA 3WK3A 4ZZ9A 2J27A 3SW6A 1RQHA 2ZTJA 4S1FA 1ZALA 3G18A 4HN4A 3QPYA 3M5VA 1JRBA 1TQJA 4JTHA 3NGJA 3M5YA 2J9XA 4N6FA 4ML9A 1I45A 3B05A 4DQWA 3PUEA 4EF9A 4UFJA 4UTHA 4IUOA 3LI1A 2GOUA 1FWSA 1L6WA 3MHFA 1WOAA 5BMXA 1QOQA 4R34A 3DBPA 1PCWA 2RDUA 3TU9A 2H3DA 4IQLA 3LX9A 3QW3A 4HNTA 5CGQA 3LCGA 2CLFA 3T40A 1DOSA 3G8RA 4N2YA 3DXIA 4HSNA 1FCQA 3L0NA 1OX5A 1THFD 3TV8A 4K8HA 3B0PA 4UC5A 1UUOA 4E2BA 1UBSA 5LGXA 2X1UA 4K8EA 1TPC1 1XBZA 2CU0A 4O50A 4UTJA 4HKPA 2AAMA 4WY0F 1JUBA 2A0NA 4NZJA 1R2SA 2FIQA 3KRZA 4P61A 3N34A 1W0MA 2HS6A 3HG3A 3PB2A 3MYOA 3QQ0A 4LV4A 3C8FA 1JCJA 4LC6A 1K7EA 1UASA 3S5OA 4CQ8A 1Y0EA 1BEUA 1H63A 1JQXA 2A7PA 5LNUA 3W76A 3OVRA 3C4UA 4O54A 3O15A 4MKNA 4UTWC 1QDSA 3NPVA 2H90A 3W1RA 1H1YA 1TRDA 3GX9A 1IXPA 3WK0A 2HSAA 3WJSA 5LNRA 4UTLA 5LHFA 4FB7A 2NWRA 1KTCA 2OCZA 5AHNA 1EEPA 3EKZA 2CZDA 1OX4B 3G0XA 4Y90A 5D37A 4NUWA 1S5TA 3PF3A 4BK9A 2Y62A 1LRNA 3NQEA 1LDCA 4N9DA 1X8FA 4ADTA 3ABOA 3FJLA 1TPH1 5AHFA 3B06A 1OYAA 5J5RA 3S1WA 4ALDA 2RH9A 1FXQA 1O94A 2Y7DA 1JUKA 2GPTA 4RXFA 4QAIA 4Z0JA 2A6NA 5AHEA 5F1VA 4M7SA 1G4PA 3LM7A 3LGEA 4OV9A 4O52A 3W7OA 4E38A 1W5NA 5H2ZA 4A21A 1QPNA 4OE7A 1GVQA 4I7VA 2JKEA 3IVUA 3LHVA 4UNLA 3M9YA 5U7SA 1TSIA 1W5MA 2FB3A 2Q3OA 3MP4A 3IGUA 2V5LA 3Q37A 1FWWA 1FQ0A 3IV3A 3HPSA 3B0UX 1KBJA 3RF9A 3S1XA 3C3NA 4CNPA 4MZYA 2TSYA 1O60A 5U4NA 4FNTA 2A6LA 1EX5A 1ICPA 5H91A 1OFDA 3CIWA 3IVTA 3GB6A 3PBVA 2H8XA 1DJQA 3BLIA 3MP3A 3F03K 2J9ZA 4KWWA 3L21A 3W1LA 5K4ZA 1K02A 4R33A 3SFKA 3TSDA 2Y63A 1MEIA 4NJGA 5CPMA 1XCFA 3ZS4A 1OFQA 3NPWA 1C9DA 1TTQA 2Q8ZA 3DKJA 3IGSA 5D02A 3PULA 2IQTA 3PWAA 4LWWA 1SZNA 3TSMA 2JKPA 5LGZA 1H7NA 1K8XA 3VCRA 2YFOA 4UFHA 5G5IA 3TFCA 3LHTA 3DFQA 4JXCA 3JS3A 2AGKA 2WNZA 3NQ2A 4N4PA 3KFTA 1A50A 2QF7A 3IIZA 3W1UA 4UTTA 1X6UA 4MLRA 3PG8A 1JRCA 4O0KA 2ZZ7A 2HMCA 1OJXA 4LVDA 1TV7A 4OHQA 1CW2A 1L6YA 5HWJA 4WOZA 3LHYA 4KKXA 3F4NA 1K7XA 3G1XA 1P5BA 1KTNA 1XBXA 4DO4A 1XKYA 4PFMA 3S6DA 1NAL1 2WKJA 4WZHA 5G2IA 3EWXA 3SI9A 4OU1A 4XKYA 2DP3A 1Q3NA 1ZAIA 4ZQCA 4RZ5A 1F7BA 5F4XA 4RX0A 2QCHA 1L6SA 3N3MA 2YPIA 3FLUA 3HMJG 3W07A 3GIYA 3W1MA 1AW5A 1LTDA 4FNQA 2Q3RA 4NX5A 2VXNA 5HQEA 3O07A 4JDBA 4EVZA 2CLMA 2E5DA 3L68A 1LRTA 2W6RA 3M47A 1OFPA 4O19A 1TPFA 2C1HA 3CC1A 3TA6A 3O05A 4FO4A 1JUEA 3THAA 1YYAA 2RDTA 2H6RA 3CB8A 4ORIA 3MBDA 3L9CA 3RK8A 3A24A 3LXAA 3W2NA 2JGYA 5HJLA 4TMCA 1DBTA 4EWND 1OK4A 1IXNA 4PEKA 1EUNA 1SZEA 3FKKA 2NX9A 1N55A 3LXCA 4TX9A 4N9BA 3TK7A 4UIOA 4UNKA 3NAVA 1EWDA 3RFAA 3KAOA 4GNJA 2A5HA 1SO4A 3EB2A 3NVTA 3GNDA 3DHDA 1LZOA 3M43A 1XI3A 5DBUA 4YWIA 4RKAA 5BMWA 2QUTA 3I7RA 3M16A 1SPQA 1JCLA 1FCUA 1KM1A 3L5MA 3W7GA 3VNDA 6ALDA 1ZCOA 4NNBA 5HINA 1KW1A 1GG0A 5A5WA 4ZL1A 3NQ6A 1QPRA 3MBFA 4K38A 1I2NA 2YX0A 1F05A 5D2TA 4FXSA 4MLJA 4POCA 1J2WA 1ZENA 3PBWA 4UFLA 2BZNA 1VYSX 2QCMA 5FEPA 1MSSA 3WJXA 3ATYA 3LXBA 4RZ6A 1HTIA 2NV2A 3T44A 3P80A 5FF0A 4O1BA 1F2JA 1FWNA 3GDTA 1GVSA 2CZEA 1LBLA 3PR2A 2FB2A 2G97A 1HL2A 3DI0A 3CWNA 3L65A 1A5CA 4ZVJA 3O6CA 3P82A 4QQ3A 2YFNA 1FDZA 3VKJA 4LV9A 4XZ9A 2P10A 3LV6A 5CZTA 4UR7A 1A5AA 1OABA 3KVMA 3NQFA 5CSRA 1PS9A 2O7QA 3QFEA 3C2OA 1YTDA 3NR0A 2Y85A 4LY8A 3UZJA 1GTEA 3C61A 4GFSA 4UTMA 2ZA1A 3DH7A 3HIJA 2G95A 3TXVA 3BV4A 4Z1CA 5AYZA 3MI3A 1NSJA 1YXYA 3P5YA 2JKAA 3FFSA 3O6DA 2FLIA 3NEVA 2Y88A 4J9JA 1X1ZA 1W8SA 5CZSA 1TTJA 4ADSA 1JR1A 5D2XA 2NLIA 3UPWA 5AYXA 5CSSA 2ZFAA 1WXJA 1SO5A 3R12A 1SO6A 4FIRA 3BO9A 1JJKA 3V75A 5KMYA 4MVAA 4NQ1A 4Z1DA 3G1AA 2BXVA 1ME9A 4DEFA 5HWNA 4CCDA 3TQVA 3UPBA 3QM3A 1W54A 4N9CA 1VJIA 3NM3A 3CM4A 1EP3A 4UMCA 5KSWA 5HR7A 3HG5A 2C0AA 2E5CA 3P8JA 4AHOA 3EX1A 3GLCA 4LUIA 4WUIA 4JTIA 2BX7A 3HBLA 4OQVA 1QNVA 4WJEA 3BG9A 3H53A 1KFBA 1VHCA 3LHWA 4MPQA 2E6YA 4BI6A 2QAPA 1RQBA 3O1NA 4DXVA 2X1TA 4CNOA 4IGHA 1LLZA 4O15A 3USBA 2J24A 4PCFA 1XL9A 4JS3A 3HG4A 4JTTA 5DCBA 2Z1BA 5HUOA 1FDYA 3PUOA 2VEKA 2ZRUA 3W23A 4GBUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GH4 A;  2DSZ A;  4G1K A;  3AHZ A;  1WDD A;  3M0H A;  1XXX A;  2HXT A;  2WNQ A;  2VFD A;  4RZB A;  4KFP A;  3I10 A;  4QIS A;  3ARZ A;  4AHQ A;  1KWG A;  4FEZ A;  5GVJ A;  1YPF A;  1KC7 A;  1PB0 A;  2ZC8 A;  1UHV A;  1VFM A;  1G4S A;  3C2E A;  4EE9 A;  2VFI A;  2FGZ A;  2FTP A;  4F40 A;  4GCA A;  2ABB A;  4IT1 A;  1C92 A;  4JTD A;  2ZZ2 A;  4P2V A;  5FD0 A;  3OJG A;  4P8X A;  3PSV A;  4YXG A;  3GXM A;  1DWH M;  4NXS A;  2OQH A;  1BRL A;  1VB9 A;  3RCY A;  2QPS A;  1J0J A;  2PDM A;  1XLD A;  4O1C A;  4S3A A;  3WH5 A;  2FZN A;  3KZS A;  3VD5 A;  2CER A;  2I14 A;  4NT0 A;  1WYI A;  2BWG A;  3JVA A;  3NVD A;  1UD4 A;  4JGD A;  3SGZ A;  3E49 A;  1JAE A;  2GWN A;  3W70 A;  1P48 A;  1KXQ A;  1H0G A;  1AL7 A;  2L5H A;  5DEL A;  3UWW A;  2ZWY A;  3GIP A;  4X9S A;  2NWS A;  1FWT A;  4FPS A;  4AY1 A;  2GJN A;  1H51 A;  3WFZ A;  1JXK A;  1WXZ A;  2E4T A;  2HRO A;  5HNT A;  1OHL A;  4B90 A;  2KX9 A;  4EIV A;  2NXH A;  1G4T A;  1J5T A;  3S42 A;  3UCC A;  1LP6 A;  3TQP A;  2Z28 A;  3TFX A;  1YX1 A;  4UB9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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